https://proteopedia.org/api.php?action=feedcontributions&feedformat=atom&user=Fatima+M+HameedProteopedia - User contributions [en]2026-09-23T04:20:00ZUser contributionsMediaWiki 1.43.8https://proteopedia.org/index.php?title=Cytochrome_C_(arabic)&diff=3554946Cytochrome C (arabic)2022-05-01T22:53:02Z<p>Fatima M Hameed: </p>
<hr />
<div>==<center>'''سيتوكروم سي البشري '''</center>==<br />
<p dir='rtl'><br />
<br />
.سيتوكروم سي عبارة عن زلال صغير (الوزن الجزيئي حوالي 1200 دالتون ) وهو بروتين محفوظ للغاية عبر مجموعة من الأنواع ، موجود في النباتات والحيوانات والعديد من الكائنات أحادية الخلية<br />
<br />
يرتبط هذا البروتين بمجموعة [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D9%87%D9%8A%D9%85 هيم] وبمركزها توجد ذرة حديد، وهو بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات وبعملية الاستموات (موت الخلايا المبرمج)<br />
</p><br />
<StructureSection load='1J3S' size='340' side='left' caption=' سيتوكروم سي البشري (PDB code [[1j3s]])' scene='89/898985/Cytochrome_c_basic/19'><br />
==<div style="text-align: right;"> المقدمة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي عبارة عن بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات، والتي هي العملية الأخيرة في عملية <br />
[https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D9%86%D9%81%D8%B3_%D8%AE%D9%84%D9%88%D9%8A التنفس الخلوي]<br />
. عملية التنفس الخلوي تقسم الى 3 أقسام مركزية: [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D8%AD%D9%84%D9%84_%D8%A7%D9%84%D8%AC%D9%84%D9%88%D9%83%D9%88%D8%B2 جليكوليزا ] (التي تحدث في السيتوبلازما)، [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AF%D9%88%D8%B1%D8%A9_%D8%AD%D9%85%D8%B6_%D8%A7%D9%84%D8%B3%D8%AA%D8%B1%D9%8A%D9%83 دورة كريبس] (تحدث في المساحة الداخلية للميتوكوندريا) وسلسلة نقل الالكترونات التي تحدث داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. <br />
<br />
.بنقل الالكترونات لجزيئات أخرى ملامسة لها، وهكذا يتم تشكيل سلسلة من البروتينات حاملة الإلكترونات FADH2 و NADH في سلسلة نقل الالكترونات تقوم الجزيئات المختزلة بدورة كريبس مثل<br />
.يتم استيعاب الإلكترونات في نهاية الأمر بواسطة الأكسجين ويؤدي هذا الاتحاد الى انتاج الماء<br />
نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة ، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا<br />
بواسطة منحدر التركيز الناتج في أيونات الهيدروجين يتم دفع عمل البروتين ATP سنتاز من أجل انتاج ATP. [https://davidson.weizmann.ac.il/ar/online/maagarmada/atp-%D8%B3%D9%8A%D9%86%D8%AB%D8%A7%D8%B2-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AD%D8%B1%D9%83-%D8%A7%D9%84%D8%AC%D8%B2%D9%8A%D8%A6%D9%8A%D9%91-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AA%D9%83%D8%A7%D9%85%D9%84 ATP] هو جزيء غنيّ بالطّاقة، يحتوي على مجموعة من الأدينوساين وثلاث مجموعات من الفوسفور المرتبطة به. يؤدّي التحلّل المائيّ لمجموعة الفوسفور الثالثة إلى إطلاق طاقة تسمح للجسم بتنشيط العديد من الإنزيمات والعمليات الموجودة فيه. يقوم الجسم بإنتاج الATP في الميتوكوندريا في جميع الأوقات وذلك من الاجل الحفاظ على نسبة عالية من الATP داخل الخلية وبالتالي فان نقل الالكترونات وإنتاج منحدر تراكيز لأيونات الهيدروجين تعتبر عملية رئيسية من اجل وجود سليم للخلية.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة1 (قوموا بالوقف على الصورة بالفأرة من أجل اظهار الشرح)<br />
</p><br />
[[Image:Electron_transport_chain_cytochrome_c.jpg|border|center|600px|نرى في الصورة سلسلة نقل الالكترونات – نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا. هذا النقل فعال (يحتاج الى طاقة) وهو عكس منحدر التركيز. تراكم ايونات الهيدروجين في الفراغ بين غشائي الخلية يمكن من دخول الهيدروجين بشكل غير فعال من اجل انتاج جزيء ATP .]]<br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
هنا توجد 3 مقاطع فيديو:<br />
<br><br />
[https://youtu.be/3YTPOIcj6lw סרטון] حول عملية نقل الإلكترون في الميتوكوندريا.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/LQmTKxI4Wn4 סרטון] فيديو يشرح العملية من زاوية أوسع.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/YZsJ-8TenYw סרטון] فيديو عن انحدار التراكيز مع التركيز على ATP سينثاز.<br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> المبنى الجزيئي </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي ينتمي لعائلة البروتين باسم all-α proteins والتي تتميز بوجود <scene name='89/898985/Secondary_structure/4'>المبنى الثنائي</scene> لولب ألفا. كل بروتين ينتمي لهذه المجموعة يحتوي أيضا على مجموعة هيم واحدة أو أكثر.<br />
<br><br />
<scene name='89/898985/Hem_c/2'>HEME C</scene> – مجموعة هيم عبارة عن مركب عضوي يتم انتاجه في النخاع العظمي والكبد. والهيم هو جزء من البروتينات التي تقوم بوظائف متعددة في الجسم. ان فعالية مجموعة هيم تنبع من قدرة ذرة الحديد على ربط جزيئات صغيرة (مثل الاكسجين) وأيضا على قدرتها لأكسدة واختزال مركبات أخرى (ان تعطي الكترونات او ان تستقبل الكترونات، على التوالي).<br />
<br><br />
يتكون السيتوكروم C البشري من <scene name='89/898985/Amino_acids/4'>سلسلة من 104 من الاحماض الامينية</scene> . يرتبط اثنان من الأحماض الأمينية بذرة الحديد <scene name='89/898985/Bond_to_iron_18_80/2'>(الهيستيدين في الموضع 18 والمثيونين في الموضع 80)</scene> ، ويرتبط اثنان من الأحماض الأمينية تساهميًا (رباط تساهمي) من خلال ذرة الكبريت (S) بمجموعة هيم <scene name='89/898985/Bond_to_iron_14_17/2'>(السيستئين في الموضع 17 وسيستئين في الموضع 14)</scene><br />
<br><br />
لقد وجد أن هناك عدد من الأحماض الأمينية المحفوظة تطوريًا، وهي الأحماض الأمينية المهمة لربط ذرة الحديد ومجموعة هيم. <scene name='89/898985/Cxxch_motive/6'>CXXCH</scene> (السيستئين ، X ، X ، السيستئين ، الهيستيدين) حيث يمكن أن يكون X أي حمض أميني غير السيستئين. وهذه المجموعة موجودة أيضا في بروتين سيتوكروم سي البشري.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 2<br />
[[Image:Consurf key small.gif|center|300px|مفتاح الأوان لعرض الحفظ التطوري- الليلكي الداكن يعرض الاحماض الامينية المحفوظة تطوريا والمتماثلة بكائنات حية مختلفة. الأبيض يعرض الاحماض الامينية المحفوظة بشكل جزئي والازرق يعرض الاحماض الامينية الغير محفوظة تطوريا حيث ان هذه المواقع تتواجد بالعديد من الاحماض الامينية المختلفة بين كائنات حية مختلفة.<br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> الوظيفة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
في سلسلة نقل الالكترونات يقوم سيتوكروم سي بنقل الكترون بين المعقدين III و IV . المعقد III يسمى سيتوكروم bc1 والمعقد IV يسمى سيتوكروم سي أوكسيداز. نقل الالكترونات يكون ممكنا بسبب حالة تأكسد متغيرة لذرة الحديد ، حيث ان في البداية يتواجد أيون الحديد في مجموعة هيم بحالة Fe3+ الأمر الذي يمكن من استيعاب الكترون واحد وبالتالي اختزال الحديد لحالة Fe2+.<br />
<br> <br />
<br> <br />
صورة 3<br />
</p><br />
[[Image:Cytochrome C Oxydoreductase.jpg|border|center|400px|نرى في الصورة المعقدات المختلفة في سلسلة نقل الالكترونات- سيتوكروم سي هو بروتين صغير مقارنة بالمعقدات 2و3و4 ولا يستطيع المرور عبر الغشاء الخلوي. يمر البروتين عبر الغشاء الداخلي للميتوكوندريا بين المعقد 3 و4. ويمكن الملاحظة ان جميع بروتينات سلسلة نقل الالكترونات تحتوي على مجموعة هيم.]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
يلعب السيتوكروم سي أيضًا دورًا وسيطًا في عملية [https://he.wikipedia.org/wiki/%D7%90%D7%A4%D7%95%D7%A4%D7%98%D7%95%D7%96%D7%94 موت الخلايا المبرمج] وهو شكل محكوم من موت الخلايا يستخدم لقتل الخلايا في عملية النمو من اجل نمو أعضاء صحيحة وأيضا مسئول عن انتقاء خلايا الدم البيضاء ولقتل الخلايا السرطانية او المريضة . <br />
<br><br />
<br> <br />
في هذا [https://youtu.be/Od3pUsVdMhQ الفيديو] نرى دور السيتوكروم سي في موت الخلايا المبرمج. <br />
<br><br />
سيتوكروم سي الحامل للإلكترونات يتواجد داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا بواسطة رابط هيدروفوبي (كاره للماء) للفوسفوليبيد كارديوليبين (وهو جزيء هيدروفوبي يبني غشاء الميتوكوندريا).<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 4<br />
</p><br />
[[Image:Cardiolipin.jpg|border|center|280px|في الجهة اليسرى من الرسم نرى البروتين سيتوكروم سي مربوط مع الفوسوفليبيد كارديوليبين ويتواجد داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. في الجهة اليمنى نرى انقسام المعقد كارديوليبين- سيتوكروم سي نتيجة لتأكسد جزيء الكارديوليبين. سيتوكورم سي ينفصل عن الغشاء ويصبح حر ويمكنه الوصول للسيتوبلازما.]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
تتميز بداية عملية الموت الخلوي بارتفاع في نسبة الشوارد الحرة (ROS) في الميتوكوندريا. نتيجة لذلك يتم تأكسد الكارديوليبين وبالتالي فانه يتم تفكيك المعقد كارديوليبين- سيتوكروم سي. <br />
يقوم بعد ذلك السيتوكروم سي بالخروج من الغشاء الداخلي للميتوكوندريا ويمر من خلال الثقوب الموجودة في الغشاء الخارجي وصولا الى السيتوبرلازما. في السيتوبلازما يرتبط سيتوكروم سي لبروتين APAF1 وبروتين dATP وهكذا يتكون مبنى ال أبوبتوسوم وهو بروتين يربط بروتين بروكسباز 9 ويحوله الى صورته النشطة والفعالة وهكذا تتمكن الكاسباسات 3 و7 من الارتباط والعمل (caspase). هذه العملية تؤدي الى ضرر وانقسام في ال DNA الذي ينتهي بموت موجه للخلية.<br />
<br><br />
<br> <br />
صورة 5<br />
</p><br />
[[Image:Apoptosome.jpg|border|center|280px|بداية نرى اطلاق السيتوكروم سي من الميتوكوندريا الى السيتوبلازما. بعد ذلك يرتبط السيتوكورم سي مع بروتين في السيتوبلازما ويتم انتاج الأبوبتوسوم وهو مركب مهم في مراقبة عملية الموت المبرمج للخلايا حيث انه يربط بروتين بروكسباز 9 ويحوله الى صورته النشطة والفعالة وهكذا ينشط المسار الداخلي لعملية الموت الخلوي والتي تنتهي بموت موجه للخلية.]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
منع الموت المبرمج للخلية<br />
<br><br />
تشير العديد من الأبحاث ان الخلايا تستطيع ان تتحكم وتسيطر على موت الخلايا المبرمج ولذك من خلال تعديل تقوم به بعد عملية الترجمة في البروتين. البروتينات هي سلسلة طويلة من الاحماض الامينية، المرحلة الأولى في بناء البروتين هي انتاج سلسلة من الاحماض الامينية (المبنى الاولي) وبعد ذلك تمر هذه السلسلة بالعديد من المعالجات والتعديلات. واحدة من هذه التعديلات هي عملية الفسفرة. عملية الفسفرة يتم فيها إضافة مجموعة فوسفات للبروتين (أيون يحتوي على ذرة فوسفات واحدة و4 ذرات هيدروجين). تتم العملية بواسطة إنزيمات الكيناز والتي تنقل الفوسفات وهي تغيير الشكل التركيبي للبروتين بحيث تعدل من صفاته أو وظيفته. والعملية العكسية تسمى إزالة الفسفرة بواسطة انزيم الفوسفاتيز الذي يقوم بإزالة مجموعة فوسفات من البروتين. في سيتوكروم سي وجد أن هناك عدد من الأحماض الأمينية المحفوظة تطوريًا والتي تمر <scene name='89/898985/Phosphotyrosine_48_97/4'>بعملية الفسفرة</scene> ، الامر الذي يمنع من الإنتاج الزائد للشوارد الحرة (ROS)<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 6<br />
</p><br />
[[Image:Apoptosome formation.jpg|border|center|يعرض لنا المخطط التالي البروتين سيتوكروم سي في حالته المفسفرة (مراقب) وفي الحالة الغير مفسفرة (غير مراقب). في الحالة المراقبة نرى ان وتيرة التنفس الخلوي متوازنة ولذلك تنتج كمية شوارد حرة صغيرة ، جهد الغشاء إيجابي والسيتوكروم سي يرتبط مع الغشاء الداخلي للميتوكوندريا بواسطة الكارديوليبين.<br />
في الحالة الغير متوازنة يكون التنفس الخلوي بأعلى وتيرة له ونتيجة لذلك يصبح جهد الخلية سلبي ويتم انتاج الشوارد الحرة بشكل متزايد ونرى انفصال المعقد كارديوليبين-سيتوكروم سي. <br />
<br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
صورة 7<br />
</p><br />
[[Image:Cytochrome c alignment.jpg|border|center|<br />
نرى في المكان 14 و17 الحمض الأميني سيستئين مربوط برباط كوفلنتي (تساهمي) مع مجموعة هيم (الحرف سي ). في أماكن الأسهم توجد مناطق محفوظة تطوريا والتي تمر بتعديل بعد عملية الترجمة من بينها المكان 48 و 97 (الحمض الأميني تيروسين-الحرف واي )<br />
(سيتوكروم سي مأخوذ من انسان وفأر من نسيج جسدي ونسيج جنسي).]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
وظيفة السيتوكروم سي كمانع للأكسدة (تقليل ROS) تتم بشكل مباشر عن طريق إزالة الأكسيد الفائق O2- وماء الاكسجين (H2O2) من الميتوكوندريا كما هو موضح في الرسم التالي:<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 8<br />
</p><br />
[[Image:Antioxidante.png|center|]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي هو بروتين يلعب دور مركزي في انتاج الطاقة في الخلية وأيضا له دور رئيسي بعمليات موت الخلايا المبرمج.<br />
</p><br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> وراثة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
جين CYCS الذي يشفر بروتين السيتوكروم C في البشر يتواجد على كروموسوم 7 في الحمض النووي DNA في نواة الخلية. هذا على عكس البروتينات الأخرى التي تعمل في عضية الميتوكوندريا المشفرة بواسطة الحمض النووي DNA للميتوكوندريا. حيث ان ال DNA للميتوكوندريا صغير جدًا، ويتألف من كروموسوم واحد صغير ويتضمن أقل من 17000 زوج قواعد نيتروجينية. بينما ال DNA في نواة الخلية يتضمن ثلاثة مليارات قاعدة نيتروجينية في 23 زوجًا من الكروموسومات.<br />
ومع ذلك، تحتوي كل خلية على نواة واحدة والعديد من الميتوكوندريا: في بعض الخلايا يصل عدد عضيات الميتوكوندريا إلى الآلاف، لذلك لديهم أيضًا آلاف النسخ من الحمض النووي DNA للميتوكوندريا. هناك اختلاف آخر بين أنواع الحمض النووي DNA وهو أننا نحصل على الحمض النووي DNA للميتوكوندريا من الأم فقط. تحتوي خلية الحيوانات المنوية على ميتوكوندريا، لكنها موجودة في "ذيل" الخلية، والذي يبقى بالخارج عند اتحاد الحيوان المنوي مع البويضة، يقوم الحمض النووي DNA للميتوكوندريا بتشفير13 بروتينًا ضروريًا لوظيفة الميتوكوندريا باعتبارها "محطة القوة الخلية".<br />
<br><br />
يحتوي الجينوم البشري على 49 "جينا كاذبا" للجين CYCS (وهي جينات غير فعالة ولا تمر في مرحلة النسخ ولا الترجمة). للجين توجد ثلاثة اكسونات. <br />
<br><br />
يتم تركيب البروتينات من أحماض أمينية باستخدام المعلومة المشفرة في الجينات، لدى كل بروتين تسلسلٌ خاص به من الأحماض الأمينية والذي يُحدَّد بواسطة تسلسل نوكليوتيدات الجين المشفر لذلك البروتين. تُنسخ الجينات المشفرة في الدنا إلى رنا رسول والذي يُستخدم بعدها كقالب لتخليق (ترجمة) البروتين بواسطة الريبوسوم. لا يتم التعبير عن جميع الجينات في الكائن الحي في نفس الوقت حيث ان كل خلية تعبر فقط عن جزء معين من المعلومات الموجودة بها ويتم قمع الجينات الأخرى التي ليست ضرورية لوظيفة الخلية. يتم قياس التعبير الجيني للجين CYCS حسب كمية الرنا رسول في الانسجة المختلفة حيث ان التعبير يختلف من نسيج الى اخر.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 9<br />
[[Image:Expression cytochrome c.JPG|border|center|600px|]]<br />
</p><br />
<br><br />
==<div style="text-align: right;"> أمراض </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
عند الأشخاص الذين يعانون من متلازمة نقص الصفيحات وجدت طفرة في جين CYCS والتي بها يتم استبدال الحمض الاميني <scene name='89/898985/Gly__41/3'>جلايسين في المكان ال41 ( مكان محفوظ تطوريا) </scene> بالحمض الاميني سيرين . هذه المتلازمة هي متلازمة سائدة تتميز بنقص في عدد صفائح الدم وبالتالي يزداد الاحتمال لحدوث النزيف وتقل احتمالية تخثر الدم. <br />
لقد وجدت الدراسات الحديثة أن هذه الطفرة تزيد من النشاط المؤيد لموت الخلايا المبرمج عن طريق تنشيط الكاسبيز(caspase) بشكل أكثر كفاءة من البروتين الطبيعي. لا تؤثر هذه الطفرة على وظيفة الأكسدة والاختزال للبروتين<br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> ورقة عمل للطالب </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
[https://proteopedia.org/wiki/images/a/a8/Homework_%28arabic%29.pdf ورقة عمل للطالب]<br />
<br><br />
[https://proteopedia.org/wiki/images/0/08/%D7%A0%D7%A1%D7%A4%D7%97_FASTA_%D7%A9%D7%9C_%D7%94%D7%97%D7%9C%D7%91%D7%95%D7%A0%D7%99%D7%9D.doc נספח]<br />
</p><br />
<br><br />
==<div style="text-align: right;"> المصادر </div> ==<br />
<br><br />
[https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/compound/444125#section=3D-Conformer pubchem]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/NP_061820.1 ncbi - cytochrome c - homo sapiens]<br />
<br><br />
[https://ashpublications.org/blood/article/132/Supplement%201/3758/265249/A-Novel-Cycs-Missense-Mutation-in-the-Helix-of-the A Novel Cycs Missense Mutation in the α-Helix of the Cycs C-Terminal Domain Causes Non-Syndromic Thrombocytopenia]<br />
<br><br />
[https://davidson.weizmann.ac.il/online/sciencenews/%D7%9C%D7%A8%D7%90%D7%95%D7%AA-%D7%90%D7%AA-%D7%94%D7%9E%D7%95%D7%9C%D7%A7%D7%95%D7%9C%D7%95%D7%AA-%D7%A0%D7%98%D7%A2%D7%A0%D7%95%D7%AA לראות את המולקולות נטענות - מכון דוידסון]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/browser/gene/?id=54205 ncbi cics gene]<br />
<br><br />
[https://www.rcsb.org/structure/1gu2 pdb - 1GU2]<br />
<br><br />
[https://www.rcsb.org/structure/1AKK pdb - 1AKK]<br />
<br><br />
[https://chem.libretexts.org/Courses/Saint_Marys_College_Notre_Dame_IN/CHEM_342%3A_Bio-inorganic_Chemistry/Readings/Metals_in_Biological_Systems_(Saint_Mary's_College)/Cytochrome_C Cytochrome C. (2019, June 5).]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/54205 ncbi - CYCS cytochrome c - Homo sapiens]<br />
<br><br />
[https://www.nature.com/articles/nrm2434 nature - Cytochrome c: functions beyond respiration]</div>Fatima M Hameedhttps://proteopedia.org/index.php?title=Cytochrome_C_(arabic)&diff=3554945Cytochrome C (arabic)2022-05-01T22:51:55Z<p>Fatima M Hameed: </p>
<hr />
<div>==<center>'''سيتوكروم سي البشري '''</center>==<br />
<p dir='rtl'><br />
<br />
.سيتوكروم سي عبارة عن زلال صغير (الوزن الجزيئي حوالي 1200 دالتون ) وهو بروتين محفوظ للغاية عبر مجموعة من الأنواع ، موجود في النباتات والحيوانات والعديد من الكائنات أحادية الخلية<br />
<br />
يرتبط هذا البروتين بمجموعة [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D9%87%D9%8A%D9%85 هيم] وبمركزها توجد ذرة حديد، وهو بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات وبعملية الاستموات (موت الخلايا المبرمج)<br />
</p><br />
<StructureSection load='1J3S' size='340' side='left' caption=' سيتوكروم سي البشري (PDB code [[1j3s]])' scene='89/898985/Cytochrome_c_basic/19'><br />
==<div style="text-align: right;"> المقدمة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي عبارة عن بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات، والتي هي العملية الأخيرة في عملية <br />
[https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D9%86%D9%81%D8%B3_%D8%AE%D9%84%D9%88%D9%8A التنفس الخلوي]<br />
. عملية التنفس الخلوي تقسم الى 3 أقسام مركزية: [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D8%AD%D9%84%D9%84_%D8%A7%D9%84%D8%AC%D9%84%D9%88%D9%83%D9%88%D8%B2 جليكوليزا ] (التي تحدث في السيتوبلازما)، [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AF%D9%88%D8%B1%D8%A9_%D8%AD%D9%85%D8%B6_%D8%A7%D9%84%D8%B3%D8%AA%D8%B1%D9%8A%D9%83 دورة كريبس] (تحدث في المساحة الداخلية للميتوكوندريا) وسلسلة نقل الالكترونات التي تحدث داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. <br />
<br />
.بنقل الالكترونات لجزيئات أخرى ملامسة لها، وهكذا يتم تشكيل سلسلة من البروتينات حاملة الإلكترونات FADH2 و NADH في سلسلة نقل الالكترونات تقوم الجزيئات المختزلة بدورة كريبس مثل<br />
.يتم استيعاب الإلكترونات في نهاية الأمر بواسطة الأكسجين ويؤدي هذا الاتحاد الى انتاج الماء<br />
نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة ، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا<br />
بواسطة منحدر التركيز الناتج في أيونات الهيدروجين يتم دفع عمل البروتين ATP سنتاز من أجل انتاج ATP. [https://davidson.weizmann.ac.il/ar/online/maagarmada/atp-%D8%B3%D9%8A%D9%86%D8%AB%D8%A7%D8%B2-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AD%D8%B1%D9%83-%D8%A7%D9%84%D8%AC%D8%B2%D9%8A%D8%A6%D9%8A%D9%91-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AA%D9%83%D8%A7%D9%85%D9%84 ATP] هو جزيء غنيّ بالطّاقة، يحتوي على مجموعة من الأدينوساين وثلاث مجموعات من الفوسفور المرتبطة به. يؤدّي التحلّل المائيّ لمجموعة الفوسفور الثالثة إلى إطلاق طاقة تسمح للجسم بتنشيط العديد من الإنزيمات والعمليات الموجودة فيه. يقوم الجسم بإنتاج الATP في الميتوكوندريا في جميع الأوقات وذلك من الاجل الحفاظ على نسبة عالية من الATP داخل الخلية وبالتالي فان نقل الالكترونات وإنتاج منحدر تراكيز لأيونات الهيدروجين تعتبر عملية رئيسية من اجل وجود سليم للخلية.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة1 (قوموا بالوقف على الصورة بالفأرة من أجل اظهار الشرح)<br />
</p><br />
[[Image:Electron_transport_chain_cytochrome_c.jpg|border|center|600px|نرى في الصورة سلسلة نقل الالكترونات – نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا. هذا النقل فعال (يحتاج الى طاقة) وهو عكس منحدر التركيز. تراكم ايونات الهيدروجين في الفراغ بين غشائي الخلية يمكن من دخول الهيدروجين بشكل غير فعال من اجل انتاج جزيء ATP .]]<br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
هنا توجد 3 مقاطع فيديو:<br />
<br><br />
[https://youtu.be/3YTPOIcj6lw סרטון] حول عملية نقل الإلكترون في الميتوكوندريا.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/LQmTKxI4Wn4 סרטון] فيديو يشرح العملية من زاوية أوسع.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/YZsJ-8TenYw סרטון] فيديو عن انحدار التراكيز مع التركيز على ATP سينثاز.<br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> المبنى الجزيئي </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي ينتمي لعائلة البروتين باسم all-α proteins والتي تتميز بوجود <scene name='89/898985/Secondary_structure/4'>المبنى الثنائي</scene> لولب ألفا. كل بروتين ينتمي لهذه المجموعة يحتوي أيضا على مجموعة هيم واحدة أو أكثر.<br />
<br><br />
<scene name='89/898985/Hem_c/2'>HEME C</scene> – مجموعة هيم عبارة عن مركب عضوي يتم انتاجه في النخاع العظمي والكبد. والهيم هو جزء من البروتينات التي تقوم بوظائف متعددة في الجسم. ان فعالية مجموعة هيم تنبع من قدرة ذرة الحديد على ربط جزيئات صغيرة (مثل الاكسجين) وأيضا على قدرتها لأكسدة واختزال مركبات أخرى (ان تعطي الكترونات او ان تستقبل الكترونات، على التوالي).<br />
<br><br />
يتكون السيتوكروم C البشري من <scene name='89/898985/Amino_acids/4'>سلسلة من 104 من الاحماض الامينية</scene> . يرتبط اثنان من الأحماض الأمينية بذرة الحديد <scene name='89/898985/Bond_to_iron_18_80/2'>(الهيستيدين في الموضع 18 والمثيونين في الموضع 80)</scene> ، ويرتبط اثنان من الأحماض الأمينية تساهميًا (رباط تساهمي) من خلال ذرة الكبريت (S) بمجموعة هيم <scene name='89/898985/Bond_to_iron_14_17/2'>(السيستئين في الموضع 17 وسيستئين في الموضع 14)</scene><br />
<br><br />
لقد وجد أن هناك عدد من الأحماض الأمينية المحفوظة تطوريًا، وهي الأحماض الأمينية المهمة لربط ذرة الحديد ومجموعة هيم. <scene name='89/898985/Cxxch_motive/6'>CXXCH</scene> (السيستئين ، X ، X ، السيستئين ، الهيستيدين) حيث يمكن أن يكون X أي حمض أميني غير السيستئين. وهذه المجموعة موجودة أيضا في بروتين سيتوكروم سي البشري.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 2<br />
[[Image:Consurf key small.gif|center|300px|مفتاح الأوان لعرض الحفظ التطوري- الليلكي الداكن يعرض الاحماض الامينية المحفوظة تطوريا والمتماثلة بكائنات حية مختلفة. الأبيض يعرض الاحماض الامينية المحفوظة بشكل جزئي والازرق يعرض الاحماض الامينية الغير محفوظة تطوريا حيث ان هذه المواقع تتواجد بالعديد من الاحماض الامينية المختلفة بين كائنات حية مختلفة.<br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> الوظيفة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
في سلسلة نقل الالكترونات يقوم سيتوكروم سي بنقل الكترون بين المعقدين III و IV . المعقد III يسمى سيتوكروم bc1 والمعقد IV يسمى سيتوكروم سي أوكسيداز. نقل الالكترونات يكون ممكنا بسبب حالة تأكسد متغيرة لذرة الحديد ، حيث ان في البداية يتواجد أيون الحديد في مجموعة هيم بحالة Fe3+ الأمر الذي يمكن من استيعاب الكترون واحد وبالتالي اختزال الحديد لحالة Fe2+.<br />
<br> <br />
<br> <br />
صورة 3<br />
</p><br />
[[Image:Cytochrome C Oxydoreductase.jpg|border|center|400px|نرى في الصورة المعقدات المختلفة في سلسلة نقل الالكترونات- سيتوكروم سي هو بروتين صغير مقارنة بالمعقدات 2و3و4 ولا يستطيع المرور عبر الغشاء الخلوي. يمر البروتين عبر الغشاء الداخلي للميتوكوندريا بين المعقد 3 و4. ويمكن الملاحظة ان جميع بروتينات سلسلة نقل الالكترونات تحتوي على مجموعة هيم.]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
يلعب السيتوكروم سي أيضًا دورًا وسيطًا في عملية [https://he.wikipedia.org/wiki/%D7%90%D7%A4%D7%95%D7%A4%D7%98%D7%95%D7%96%D7%94 موت الخلايا المبرمج] وهو شكل محكوم من موت الخلايا يستخدم لقتل الخلايا في عملية النمو من اجل نمو أعضاء صحيحة وأيضا مسئول عن انتقاء خلايا الدم البيضاء ولقتل الخلايا السرطانية او المريضة . <br />
<br><br />
<br> <br />
في هذا [https://youtu.be/Od3pUsVdMhQ الفيديو] نرى دور السيتوكروم سي في موت الخلايا المبرمج. <br />
<br><br />
سيتوكروم سي الحامل للإلكترونات يتواجد داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا بواسطة رابط هيدروفوبي (كاره للماء) للفوسفوليبيد كارديوليبين (وهو جزيء هيدروفوبي يبني غشاء الميتوكوندريا).<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 4<br />
</p><br />
[[Image:Cardiolipin.jpg|border|center|280px|في الجهة اليسرى من الرسم نرى البروتين سيتوكروم سي مربوط مع الفوسوفليبيد كارديوليبين ويتواجد داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. في الجهة اليمنى نرى انقسام المعقد كارديوليبين- سيتوكروم سي نتيجة لتأكسد جزيء الكارديوليبين. سيتوكورم سي ينفصل عن الغشاء ويصبح حر ويمكنه الوصول للسيتوبلازما.]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
تتميز بداية عملية الموت الخلوي بارتفاع في نسبة الشوارد الحرة (ROS) في الميتوكوندريا. نتيجة لذلك يتم تأكسد الكارديوليبين وبالتالي فانه يتم تفكيك المعقد كارديوليبين- سيتوكروم سي. <br />
يقوم بعد ذلك السيتوكروم سي بالخروج من الغشاء الداخلي للميتوكوندريا ويمر من خلال الثقوب الموجودة في الغشاء الخارجي وصولا الى السيتوبرلازما. في السيتوبلازما يرتبط سيتوكروم سي لبروتين APAF1 وبروتين dATP وهكذا يتكون مبنى ال أبوبتوسوم وهو بروتين يربط بروتين بروكسباز 9 ويحوله الى صورته النشطة والفعالة وهكذا تتمكن الكاسباسات 3 و7 من الارتباط والعمل (caspase). هذه العملية تؤدي الى ضرر وانقسام في ال DNA الذي ينتهي بموت موجه للخلية.<br />
<br><br />
<br> <br />
صورة 5<br />
</p><br />
[[Image:Apoptosome.jpg|border|center|280px|بداية نرى اطلاق السيتوكروم سي من الميتوكوندريا الى السيتوبلازما. بعد ذلك يرتبط السيتوكورم سي مع بروتين في السيتوبلازما ويتم انتاج الأبوبتوسوم وهو مركب مهم في مراقبة عملية الموت المبرمج للخلايا حيث انه يربط بروتين بروكسباز 9 ويحوله الى صورته النشطة والفعالة وهكذا ينشط المسار الداخلي لعملية الموت الخلوي والتي تنتهي بموت موجه للخلية.]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
منع الموت المبرمج للخلية<br />
<br><br />
تشير العديد من الأبحاث ان الخلايا تستطيع ان تتحكم وتسيطر على موت الخلايا المبرمج ولذك من خلال تعديل تقوم به بعد عملية الترجمة في البروتين. البروتينات هي سلسلة طويلة من الاحماض الامينية، المرحلة الأولى في بناء البروتين هي انتاج سلسلة من الاحماض الامينية (المبنى الاولي) وبعد ذلك تمر هذه السلسلة بالعديد من المعالجات والتعديلات. واحدة من هذه التعديلات هي عملية الفسفرة. عملية الفسفرة يتم فيها إضافة مجموعة فوسفات للبروتين (أيون يحتوي على ذرة فوسفات واحدة و4 ذرات هيدروجين). تتم العملية بواسطة إنزيمات الكيناز والتي تنقل الفوسفات وهي تغيير الشكل التركيبي للبروتين بحيث تعدل من صفاته أو وظيفته. والعملية العكسية تسمى إزالة الفسفرة بواسطة انزيم الفوسفاتيز الذي يقوم بإزالة مجموعة فوسفات من البروتين. في سيتوكروم سي وجد أن هناك عدد من الأحماض الأمينية المحفوظة تطوريًا والتي تمر <scene name='89/898985/Phosphotyrosine_48_97/4'>بعملية الفسفرة</scene> ، الامر الذي يمنع من الإنتاج الزائد للشوارد الحرة (ROS)<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 6<br />
</p><br />
[[Image:Apoptosome formation.jpg|border|center|يعرض لنا المخطط التالي البروتين سيتوكروم سي في حالته المفسفرة (مراقب) وفي الحالة الغير مفسفرة (غير مراقب). في الحالة المراقبة نرى ان وتيرة التنفس الخلوي متوازنة ولذلك تنتج كمية شوارد حرة صغيرة ، جهد الغشاء إيجابي والسيتوكروم سي يرتبط مع الغشاء الداخلي للميتوكوندريا بواسطة الكارديوليبين.<br />
في الحالة الغير متوازنة يكون التنفس الخلوي بأعلى وتيرة له ونتيجة لذلك يصبح جهد الخلية سلبي ويتم انتاج الشوارد الحرة بشكل متزايد ونرى انفصال المعقد كارديوليبين-سيتوكروم سي. <br />
<br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
صورة 7<br />
</p><br />
[[Image:Cytochrome c alignment.jpg|border|center|<br />
نرى في المكان 14 و17 الحمض الأميني سيستئين مربوط برباط كوفلنتي (تساهمي) مع مجموعة هيم (الحرف سي ). في أماكن الأسهم توجد مناطق محفوظة تطوريا والتي تمر بتعديل بعد عملية الترجمة من بينها المكان 48 و 97 (الحمض الأميني تيروسين-الحرف واي )<br />
(سيتوكروم سي مأخوذ من انسان وفأر من نسيج جسدي ونسيج جنسي).]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
وظيفة السيتوكروم سي كمانع للأكسدة (تقليل ROS) تتم بشكل مباشر عن طريق إزالة الأكسيد الفائق O2- وماء الاكسجين (H2O2) من الميتوكوندريا كما هو موضح في الرسم التالي:<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 8<br />
</p><br />
[[Image:Antioxidante.png|center|]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي هو بروتين يلعب دور مركزي في انتاج الطاقة في الخلية وأيضا له دور رئيسي بعمليات موت الخلايا المبرمج.<br />
</p><br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> وراثة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
جين CYCS الذي يشفر بروتين السيتوكروم C في البشر يتواجد على كروموسوم 7 في الحمض النووي DNA في نواة الخلية. هذا على عكس البروتينات الأخرى التي تعمل في عضية الميتوكوندريا المشفرة بواسطة الحمض النووي DNA للميتوكوندريا. حيث ان ال DNA للميتوكوندريا صغير جدًا، ويتألف من كروموسوم واحد صغير ويتضمن أقل من 17000 زوج قواعد نيتروجينية. بينما ال DNA في نواة الخلية يتضمن ثلاثة مليارات قاعدة نيتروجينية في 23 زوجًا من الكروموسومات.<br />
ومع ذلك، تحتوي كل خلية على نواة واحدة والعديد من الميتوكوندريا: في بعض الخلايا يصل عدد عضيات الميتوكوندريا إلى الآلاف، لذلك لديهم أيضًا آلاف النسخ من الحمض النووي DNA للميتوكوندريا. هناك اختلاف آخر بين أنواع الحمض النووي DNA وهو أننا نحصل على الحمض النووي DNA للميتوكوندريا من الأم فقط. تحتوي خلية الحيوانات المنوية على ميتوكوندريا، لكنها موجودة في "ذيل" الخلية، والذي يبقى بالخارج عند اتحاد الحيوان المنوي مع البويضة، يقوم الحمض النووي DNA للميتوكوندريا بتشفير13 بروتينًا ضروريًا لوظيفة الميتوكوندريا باعتبارها "محطة القوة الخلية".<br />
<br><br />
يحتوي الجينوم البشري على 49 "جينا كاذبا" للجين CYCS (وهي جينات غير فعالة ولا تمر في مرحلة النسخ ولا الترجمة). للجين توجد ثلاثة اكسونات. <br />
<br><br />
يتم تركيب البروتينات من أحماض أمينية باستخدام المعلومة المشفرة في الجينات، لدى كل بروتين تسلسلٌ خاص به من الأحماض الأمينية والذي يُحدَّد بواسطة تسلسل نوكليوتيدات الجين المشفر لذلك البروتين. تُنسخ الجينات المشفرة في الدنا إلى رنا رسول والذي يُستخدم بعدها كقالب لتخليق (ترجمة) البروتين بواسطة الريبوسوم. لا يتم التعبير عن جميع الجينات في الكائن الحي في نفس الوقت حيث ان كل خلية تعبر فقط عن جزء معين من المعلومات الموجودة بها ويتم قمع الجينات الأخرى التي ليست ضرورية لوظيفة الخلية. يتم قياس التعبير الجيني للجين CYCS حسب كمية الرنا رسول في الانسجة المختلفة حيث ان التعبير يختلف من نسيج الى اخر.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 9<br />
[[Image:Expression cytochrome c.JPG|border|center|600px|]]<br />
</p><br />
<br><br />
==<div style="text-align: right;"> أمراض </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
عند الأشخاص الذين يعانون من متلازمة نقص الصفيحات وجدت طفرة في جين CYCS والتي بها يتم استبدال الحمض الاميني <scene name='89/898985/Gly__41/3'>جلايسين في المكان ال41 ( مكان محفوظ تطوريا) </scene> بالحمض الاميني سيرين . هذه المتلازمة هي متلازمة سائدة تتميز بنقص في عدد صفائح الدم وبالتالي يزداد الاحتمال لحدوث النزيف وتقل احتمالية تخثر الدم. <br />
لقد وجدت الدراسات الحديثة أن هذه الطفرة تزيد من النشاط المؤيد لموت الخلايا المبرمج عن طريق تنشيط الكاسبيز(caspase) بشكل أكثر كفاءة من البروتين الطبيعي. لا تؤثر هذه الطفرة على وظيفة الأكسدة والاختزال للبروتين<br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> ورقة عمل للطالب </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
[https://proteopedia.org/wiki/index.php/Image:Homework_%28arabic%29.pdf ورقة عمل للطالب]<br />
<br><br />
[https://proteopedia.org/wiki/images/0/08/%D7%A0%D7%A1%D7%A4%D7%97_FASTA_%D7%A9%D7%9C_%D7%94%D7%97%D7%9C%D7%91%D7%95%D7%A0%D7%99%D7%9D.doc נספח]<br />
</p><br />
<br><br />
==<div style="text-align: right;"> المصادر </div> ==<br />
<br><br />
[https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/compound/444125#section=3D-Conformer pubchem]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/NP_061820.1 ncbi - cytochrome c - homo sapiens]<br />
<br><br />
[https://ashpublications.org/blood/article/132/Supplement%201/3758/265249/A-Novel-Cycs-Missense-Mutation-in-the-Helix-of-the A Novel Cycs Missense Mutation in the α-Helix of the Cycs C-Terminal Domain Causes Non-Syndromic Thrombocytopenia]<br />
<br><br />
[https://davidson.weizmann.ac.il/online/sciencenews/%D7%9C%D7%A8%D7%90%D7%95%D7%AA-%D7%90%D7%AA-%D7%94%D7%9E%D7%95%D7%9C%D7%A7%D7%95%D7%9C%D7%95%D7%AA-%D7%A0%D7%98%D7%A2%D7%A0%D7%95%D7%AA לראות את המולקולות נטענות - מכון דוידסון]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/browser/gene/?id=54205 ncbi cics gene]<br />
<br><br />
[https://www.rcsb.org/structure/1gu2 pdb - 1GU2]<br />
<br><br />
[https://www.rcsb.org/structure/1AKK pdb - 1AKK]<br />
<br><br />
[https://chem.libretexts.org/Courses/Saint_Marys_College_Notre_Dame_IN/CHEM_342%3A_Bio-inorganic_Chemistry/Readings/Metals_in_Biological_Systems_(Saint_Mary's_College)/Cytochrome_C Cytochrome C. (2019, June 5).]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/54205 ncbi - CYCS cytochrome c - Homo sapiens]<br />
<br><br />
[https://www.nature.com/articles/nrm2434 nature - Cytochrome c: functions beyond respiration]</div>Fatima M Hameedhttps://proteopedia.org/index.php?title=Cytochrome_C_(arabic)&diff=3554943Cytochrome C (arabic)2022-05-01T22:46:10Z<p>Fatima M Hameed: </p>
<hr />
<div>==<center>'''سيتوكروم سي البشري '''</center>==<br />
<p dir='rtl'><br />
<br />
.سيتوكروم سي عبارة عن زلال صغير (الوزن الجزيئي حوالي 1200 دالتون ) وهو بروتين محفوظ للغاية عبر مجموعة من الأنواع ، موجود في النباتات والحيوانات والعديد من الكائنات أحادية الخلية<br />
<br />
يرتبط هذا البروتين بمجموعة [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D9%87%D9%8A%D9%85 هيم] وبمركزها توجد ذرة حديد، وهو بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات وبعملية الاستموات (موت الخلايا المبرمج)<br />
</p><br />
<StructureSection load='1J3S' size='340' side='left' caption=' سيتوكروم سي البشري (PDB code [[1j3s]])' scene='89/898985/Cytochrome_c_basic/19'><br />
==<div style="text-align: right;"> المقدمة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي عبارة عن بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات، والتي هي العملية الأخيرة في عملية <br />
[https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D9%86%D9%81%D8%B3_%D8%AE%D9%84%D9%88%D9%8A التنفس الخلوي]<br />
. عملية التنفس الخلوي تقسم الى 3 أقسام مركزية: [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D8%AD%D9%84%D9%84_%D8%A7%D9%84%D8%AC%D9%84%D9%88%D9%83%D9%88%D8%B2 جليكوليزا ] (التي تحدث في السيتوبلازما)، [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AF%D9%88%D8%B1%D8%A9_%D8%AD%D9%85%D8%B6_%D8%A7%D9%84%D8%B3%D8%AA%D8%B1%D9%8A%D9%83 دورة كريبس] (تحدث في المساحة الداخلية للميتوكوندريا) وسلسلة نقل الالكترونات التي تحدث داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. <br />
<br />
.بنقل الالكترونات لجزيئات أخرى ملامسة لها، وهكذا يتم تشكيل سلسلة من البروتينات حاملة الإلكترونات FADH2 و NADH في سلسلة نقل الالكترونات تقوم الجزيئات المختزلة بدورة كريبس مثل<br />
.يتم استيعاب الإلكترونات في نهاية الأمر بواسطة الأكسجين ويؤدي هذا الاتحاد الى انتاج الماء<br />
نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة ، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا<br />
بواسطة منحدر التركيز الناتج في أيونات الهيدروجين يتم دفع عمل البروتين ATP سنتاز من أجل انتاج ATP. [https://davidson.weizmann.ac.il/ar/online/maagarmada/atp-%D8%B3%D9%8A%D9%86%D8%AB%D8%A7%D8%B2-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AD%D8%B1%D9%83-%D8%A7%D9%84%D8%AC%D8%B2%D9%8A%D8%A6%D9%8A%D9%91-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AA%D9%83%D8%A7%D9%85%D9%84 ATP] هو جزيء غنيّ بالطّاقة، يحتوي على مجموعة من الأدينوساين وثلاث مجموعات من الفوسفور المرتبطة به. يؤدّي التحلّل المائيّ لمجموعة الفوسفور الثالثة إلى إطلاق طاقة تسمح للجسم بتنشيط العديد من الإنزيمات والعمليات الموجودة فيه. يقوم الجسم بإنتاج الATP في الميتوكوندريا في جميع الأوقات وذلك من الاجل الحفاظ على نسبة عالية من الATP داخل الخلية وبالتالي فان نقل الالكترونات وإنتاج منحدر تراكيز لأيونات الهيدروجين تعتبر عملية رئيسية من اجل وجود سليم للخلية.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة1 (قوموا بالوقف على الصورة بالفأرة من أجل اظهار الشرح)<br />
</p><br />
[[Image:Electron_transport_chain_cytochrome_c.jpg|border|center|600px|نرى في الصورة سلسلة نقل الالكترونات – نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا. هذا النقل فعال (يحتاج الى طاقة) وهو عكس منحدر التركيز. تراكم ايونات الهيدروجين في الفراغ بين غشائي الخلية يمكن من دخول الهيدروجين بشكل غير فعال من اجل انتاج جزيء ATP .]]<br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
هنا توجد 3 مقاطع فيديو:<br />
<br><br />
[https://youtu.be/3YTPOIcj6lw סרטון] حول عملية نقل الإلكترون في الميتوكوندريا.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/LQmTKxI4Wn4 סרטון] فيديو يشرح العملية من زاوية أوسع.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/YZsJ-8TenYw סרטון] فيديو عن انحدار التراكيز مع التركيز على ATP سينثاز.<br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> المبنى الجزيئي </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي ينتمي لعائلة البروتين باسم all-α proteins والتي تتميز بوجود <scene name='89/898985/Secondary_structure/4'>المبنى الثنائي</scene> لولب ألفا. كل بروتين ينتمي لهذه المجموعة يحتوي أيضا على مجموعة هيم واحدة أو أكثر.<br />
<br><br />
<scene name='89/898985/Hem_c/2'>HEME C</scene> – مجموعة هيم عبارة عن مركب عضوي يتم انتاجه في النخاع العظمي والكبد. والهيم هو جزء من البروتينات التي تقوم بوظائف متعددة في الجسم. ان فعالية مجموعة هيم تنبع من قدرة ذرة الحديد على ربط جزيئات صغيرة (مثل الاكسجين) وأيضا على قدرتها لأكسدة واختزال مركبات أخرى (ان تعطي الكترونات او ان تستقبل الكترونات، على التوالي).<br />
<br><br />
يتكون السيتوكروم C البشري من <scene name='89/898985/Amino_acids/4'>سلسلة من 104 من الاحماض الامينية</scene> . يرتبط اثنان من الأحماض الأمينية بذرة الحديد <scene name='89/898985/Bond_to_iron_18_80/2'>(الهيستيدين في الموضع 18 والمثيونين في الموضع 80)</scene> ، ويرتبط اثنان من الأحماض الأمينية تساهميًا (رباط تساهمي) من خلال ذرة الكبريت (S) بمجموعة هيم <scene name='89/898985/Bond_to_iron_14_17/2'>(السيستئين في الموضع 17 وسيستئين في الموضع 14)</scene><br />
<br><br />
لقد وجد أن هناك عدد من الأحماض الأمينية المحفوظة تطوريًا، وهي الأحماض الأمينية المهمة لربط ذرة الحديد ومجموعة هيم. <scene name='89/898985/Cxxch_motive/6'>CXXCH</scene> (السيستئين ، X ، X ، السيستئين ، الهيستيدين) حيث يمكن أن يكون X أي حمض أميني غير السيستئين. وهذه المجموعة موجودة أيضا في بروتين سيتوكروم سي البشري.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 2<br />
[[Image:Consurf key small.gif|center|300px|مفتاح الأوان لعرض الحفظ التطوري- الليلكي الداكن يعرض الاحماض الامينية المحفوظة تطوريا والمتماثلة بكائنات حية مختلفة. الأبيض يعرض الاحماض الامينية المحفوظة بشكل جزئي والازرق يعرض الاحماض الامينية الغير محفوظة تطوريا حيث ان هذه المواقع تتواجد بالعديد من الاحماض الامينية المختلفة بين كائنات حية مختلفة.<br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> الوظيفة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
في سلسلة نقل الالكترونات يقوم سيتوكروم سي بنقل الكترون بين المعقدين III و IV . المعقد III يسمى سيتوكروم bc1 والمعقد IV يسمى سيتوكروم سي أوكسيداز. نقل الالكترونات يكون ممكنا بسبب حالة تأكسد متغيرة لذرة الحديد ، حيث ان في البداية يتواجد أيون الحديد في مجموعة هيم بحالة Fe3+ الأمر الذي يمكن من استيعاب الكترون واحد وبالتالي اختزال الحديد لحالة Fe2+.<br />
<br> <br />
<br> <br />
صورة 3<br />
</p><br />
[[Image:Cytochrome C Oxydoreductase.jpg|border|center|400px|نرى في الصورة المعقدات المختلفة في سلسلة نقل الالكترونات- سيتوكروم سي هو بروتين صغير مقارنة بالمعقدات 2و3و4 ولا يستطيع المرور عبر الغشاء الخلوي. يمر البروتين عبر الغشاء الداخلي للميتوكوندريا بين المعقد 3 و4. ويمكن الملاحظة ان جميع بروتينات سلسلة نقل الالكترونات تحتوي على مجموعة هيم.]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
يلعب السيتوكروم سي أيضًا دورًا وسيطًا في عملية [https://he.wikipedia.org/wiki/%D7%90%D7%A4%D7%95%D7%A4%D7%98%D7%95%D7%96%D7%94 موت الخلايا المبرمج] وهو شكل محكوم من موت الخلايا يستخدم لقتل الخلايا في عملية النمو من اجل نمو أعضاء صحيحة وأيضا مسئول عن انتقاء خلايا الدم البيضاء ولقتل الخلايا السرطانية او المريضة . <br />
<br><br />
<br> <br />
في هذا [https://youtu.be/Od3pUsVdMhQ الفيديو] نرى دور السيتوكروم سي في موت الخلايا المبرمج. <br />
<br><br />
سيتوكروم سي الحامل للإلكترونات يتواجد داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا بواسطة رابط هيدروفوبي (كاره للماء) للفوسفوليبيد كارديوليبين (وهو جزيء هيدروفوبي يبني غشاء الميتوكوندريا).<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 4<br />
</p><br />
[[Image:Cardiolipin.jpg|border|center|280px|في الجهة اليسرى من الرسم نرى البروتين سيتوكروم سي مربوط مع الفوسوفليبيد كارديوليبين ويتواجد داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. في الجهة اليمنى نرى انقسام المعقد كارديوليبين- سيتوكروم سي نتيجة لتأكسد جزيء الكارديوليبين. سيتوكورم سي ينفصل عن الغشاء ويصبح حر ويمكنه الوصول للسيتوبلازما.]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
تتميز بداية عملية الموت الخلوي بارتفاع في نسبة الشوارد الحرة (ROS) في الميتوكوندريا. نتيجة لذلك يتم تأكسد الكارديوليبين وبالتالي فانه يتم تفكيك المعقد كارديوليبين- سيتوكروم سي. <br />
يقوم بعد ذلك السيتوكروم سي بالخروج من الغشاء الداخلي للميتوكوندريا ويمر من خلال الثقوب الموجودة في الغشاء الخارجي وصولا الى السيتوبرلازما. في السيتوبلازما يرتبط سيتوكروم سي لبروتين APAF1 وبروتين dATP وهكذا يتكون مبنى ال أبوبتوسوم وهو بروتين يربط بروتين بروكسباز 9 ويحوله الى صورته النشطة والفعالة وهكذا تتمكن الكاسباسات 3 و7 من الارتباط والعمل (caspase). هذه العملية تؤدي الى ضرر وانقسام في ال DNA الذي ينتهي بموت موجه للخلية.<br />
<br><br />
<br> <br />
صورة 5<br />
</p><br />
[[Image:Apoptosome.jpg|border|center|280px|بداية نرى اطلاق السيتوكروم سي من الميتوكوندريا الى السيتوبلازما. بعد ذلك يرتبط السيتوكورم سي مع بروتين في السيتوبلازما ويتم انتاج الأبوبتوسوم وهو مركب مهم في مراقبة عملية الموت المبرمج للخلايا حيث انه يربط بروتين بروكسباز 9 ويحوله الى صورته النشطة والفعالة وهكذا ينشط المسار الداخلي لعملية الموت الخلوي والتي تنتهي بموت موجه للخلية.]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
منع الموت المبرمج للخلية<br />
<br><br />
تشير العديد من الأبحاث ان الخلايا تستطيع ان تتحكم وتسيطر على موت الخلايا المبرمج ولذك من خلال تعديل تقوم به بعد عملية الترجمة في البروتين. البروتينات هي سلسلة طويلة من الاحماض الامينية، المرحلة الأولى في بناء البروتين هي انتاج سلسلة من الاحماض الامينية (المبنى الاولي) وبعد ذلك تمر هذه السلسلة بالعديد من المعالجات والتعديلات. واحدة من هذه التعديلات هي عملية الفسفرة. عملية الفسفرة يتم فيها إضافة مجموعة فوسفات للبروتين (أيون يحتوي على ذرة فوسفات واحدة و4 ذرات هيدروجين). تتم العملية بواسطة إنزيمات الكيناز والتي تنقل الفوسفات وهي تغيير الشكل التركيبي للبروتين بحيث تعدل من صفاته أو وظيفته. والعملية العكسية تسمى إزالة الفسفرة بواسطة انزيم الفوسفاتيز الذي يقوم بإزالة مجموعة فوسفات من البروتين. في سيتوكروم سي وجد أن هناك عدد من الأحماض الأمينية المحفوظة تطوريًا والتي تمر <scene name='89/898985/Phosphotyrosine_48_97/4'>بعملية الفسفرة</scene> ، الامر الذي يمنع من الإنتاج الزائد للشوارد الحرة (ROS)<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 6<br />
</p><br />
[[Image:Apoptosome formation.jpg|border|center|يعرض لنا المخطط التالي البروتين سيتوكروم سي في حالته المفسفرة (مراقب) وفي الحالة الغير مفسفرة (غير مراقب). في الحالة المراقبة نرى ان وتيرة التنفس الخلوي متوازنة ولذلك تنتج كمية شوارد حرة صغيرة ، جهد الغشاء إيجابي والسيتوكروم سي يرتبط مع الغشاء الداخلي للميتوكوندريا بواسطة الكارديوليبين.<br />
في الحالة الغير متوازنة يكون التنفس الخلوي بأعلى وتيرة له ونتيجة لذلك يصبح جهد الخلية سلبي ويتم انتاج الشوارد الحرة بشكل متزايد ونرى انفصال المعقد كارديوليبين-سيتوكروم سي. <br />
<br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
صورة 7<br />
</p><br />
[[Image:Cytochrome c alignment.jpg|border|center|<br />
نرى في المكان 14 و17 الحمض الأميني سيستئين مربوط برباط كوفلنتي (تساهمي) مع مجموعة هيم (الحرف سي ). في أماكن الأسهم توجد مناطق محفوظة تطوريا والتي تمر بتعديل بعد عملية الترجمة من بينها المكان 48 و 97 (الحمض الأميني تيروسين-الحرف واي )<br />
(سيتوكروم سي مأخوذ من انسان وفأر من نسيج جسدي ونسيج جنسي).]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
وظيفة السيتوكروم سي كمانع للأكسدة (تقليل ROS) تتم بشكل مباشر عن طريق إزالة الأكسيد الفائق O2- وماء الاكسجين (H2O2) من الميتوكوندريا كما هو موضح في الرسم التالي:<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 8<br />
</p><br />
[[Image:Antioxidante.png|center|]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي هو بروتين يلعب دور مركزي في انتاج الطاقة في الخلية وأيضا له دور رئيسي بعمليات موت الخلايا المبرمج.<br />
</p><br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> وراثة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
جين CYCS الذي يشفر بروتين السيتوكروم C في البشر يتواجد على كروموسوم 7 في الحمض النووي DNA في نواة الخلية. هذا على عكس البروتينات الأخرى التي تعمل في عضية الميتوكوندريا المشفرة بواسطة الحمض النووي DNA للميتوكوندريا. حيث ان ال DNA للميتوكوندريا صغير جدًا، ويتألف من كروموسوم واحد صغير ويتضمن أقل من 17000 زوج قواعد نيتروجينية. بينما ال DNA في نواة الخلية يتضمن ثلاثة مليارات قاعدة نيتروجينية في 23 زوجًا من الكروموسومات.<br />
ومع ذلك، تحتوي كل خلية على نواة واحدة والعديد من الميتوكوندريا: في بعض الخلايا يصل عدد عضيات الميتوكوندريا إلى الآلاف، لذلك لديهم أيضًا آلاف النسخ من الحمض النووي DNA للميتوكوندريا. هناك اختلاف آخر بين أنواع الحمض النووي DNA وهو أننا نحصل على الحمض النووي DNA للميتوكوندريا من الأم فقط. تحتوي خلية الحيوانات المنوية على ميتوكوندريا، لكنها موجودة في "ذيل" الخلية، والذي يبقى بالخارج عند اتحاد الحيوان المنوي مع البويضة، يقوم الحمض النووي DNA للميتوكوندريا بتشفير13 بروتينًا ضروريًا لوظيفة الميتوكوندريا باعتبارها "محطة القوة الخلية".<br />
<br><br />
يحتوي الجينوم البشري على 49 "جينا كاذبا" للجين CYCS (وهي جينات غير فعالة ولا تمر في مرحلة النسخ ولا الترجمة). للجين توجد ثلاثة اكسونات. <br />
<br><br />
يتم تركيب البروتينات من أحماض أمينية باستخدام المعلومة المشفرة في الجينات، لدى كل بروتين تسلسلٌ خاص به من الأحماض الأمينية والذي يُحدَّد بواسطة تسلسل نوكليوتيدات الجين المشفر لذلك البروتين. تُنسخ الجينات المشفرة في الدنا إلى رنا رسول والذي يُستخدم بعدها كقالب لتخليق (ترجمة) البروتين بواسطة الريبوسوم. لا يتم التعبير عن جميع الجينات في الكائن الحي في نفس الوقت حيث ان كل خلية تعبر فقط عن جزء معين من المعلومات الموجودة بها ويتم قمع الجينات الأخرى التي ليست ضرورية لوظيفة الخلية. يتم قياس التعبير الجيني للجين CYCS حسب كمية الرنا رسول في الانسجة المختلفة حيث ان التعبير يختلف من نسيج الى اخر.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 9<br />
[[Image:Expression cytochrome c.JPG|border|center|600px|]]<br />
</p><br />
<br><br />
==<div style="text-align: right;"> أمراض </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
عند الأشخاص الذين يعانون من متلازمة نقص الصفيحات وجدت طفرة في جين CYCS والتي بها يتم استبدال الحمض الاميني <scene name='89/898985/Gly__41/3'>جلايسين في المكان ال41 ( مكان محفوظ تطوريا) </scene> بالحمض الاميني سيرين . هذه المتلازمة هي متلازمة سائدة تتميز بنقص في عدد صفائح الدم وبالتالي يزداد الاحتمال لحدوث النزيف وتقل احتمالية تخثر الدم. <br />
لقد وجدت الدراسات الحديثة أن هذه الطفرة تزيد من النشاط المؤيد لموت الخلايا المبرمج عن طريق تنشيط الكاسبيز(caspase) بشكل أكثر كفاءة من البروتين الطبيعي. لا تؤثر هذه الطفرة على وظيفة الأكسدة والاختزال للبروتين<br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> ورقة عمل للطالب </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
[https://proteopedia.org/wiki/images/d/d8/ Homework_(arabic).pdf ]<br />
<br><br />
[https://proteopedia.org/wiki/images/0/08/%D7%A0%D7%A1%D7%A4%D7%97_FASTA_%D7%A9%D7%9C_%D7%94%D7%97%D7%9C%D7%91%D7%95%D7%A0%D7%99%D7%9D.doc נספח]<br />
</p><br />
<br><br />
==<div style="text-align: right;"> المصادر </div> ==<br />
<br><br />
[https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/compound/444125#section=3D-Conformer pubchem]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/NP_061820.1 ncbi - cytochrome c - homo sapiens]<br />
<br><br />
[https://ashpublications.org/blood/article/132/Supplement%201/3758/265249/A-Novel-Cycs-Missense-Mutation-in-the-Helix-of-the A Novel Cycs Missense Mutation in the α-Helix of the Cycs C-Terminal Domain Causes Non-Syndromic Thrombocytopenia]<br />
<br><br />
[https://davidson.weizmann.ac.il/online/sciencenews/%D7%9C%D7%A8%D7%90%D7%95%D7%AA-%D7%90%D7%AA-%D7%94%D7%9E%D7%95%D7%9C%D7%A7%D7%95%D7%9C%D7%95%D7%AA-%D7%A0%D7%98%D7%A2%D7%A0%D7%95%D7%AA לראות את המולקולות נטענות - מכון דוידסון]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/browser/gene/?id=54205 ncbi cics gene]<br />
<br><br />
[https://www.rcsb.org/structure/1gu2 pdb - 1GU2]<br />
<br><br />
[https://www.rcsb.org/structure/1AKK pdb - 1AKK]<br />
<br><br />
[https://chem.libretexts.org/Courses/Saint_Marys_College_Notre_Dame_IN/CHEM_342%3A_Bio-inorganic_Chemistry/Readings/Metals_in_Biological_Systems_(Saint_Mary's_College)/Cytochrome_C Cytochrome C. (2019, June 5).]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/54205 ncbi - CYCS cytochrome c - Homo sapiens]<br />
<br><br />
[https://www.nature.com/articles/nrm2434 nature - Cytochrome c: functions beyond respiration]</div>Fatima M Hameedhttps://proteopedia.org/index.php?title=File:Homework_(arabic).pdf&diff=3554940File:Homework (arabic).pdf2022-05-01T22:44:04Z<p>Fatima M Hameed: </p>
<hr />
<div></div>Fatima M Hameedhttps://proteopedia.org/index.php?title=Cytochrome_C_(arabic)&diff=3554833Cytochrome C (arabic)2022-05-01T09:56:57Z<p>Fatima M Hameed: </p>
<hr />
<div>==<center>'''سيتوكروم سي البشري '''</center>==<br />
<p dir='rtl'><br />
<br />
.سيتوكروم سي عبارة عن زلال صغير (الوزن الجزيئي حوالي 1200 دالتون ) وهو بروتين محفوظ للغاية عبر مجموعة من الأنواع ، موجود في النباتات والحيوانات والعديد من الكائنات أحادية الخلية<br />
<br />
يرتبط هذا البروتين بمجموعة [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D9%87%D9%8A%D9%85 هيم] وبمركزها توجد ذرة حديد، وهو بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات وبعملية الاستموات (موت الخلايا المبرمج)<br />
</p><br />
<StructureSection load='1J3S' size='340' side='left' caption=' سيتوكروم سي البشري (PDB code [[1j3s]])' scene='89/898985/Cytochrome_c_basic/19'><br />
==<div style="text-align: right;"> المقدمة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي عبارة عن بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات، والتي هي العملية الأخيرة في عملية <br />
[https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D9%86%D9%81%D8%B3_%D8%AE%D9%84%D9%88%D9%8A التنفس الخلوي]<br />
. عملية التنفس الخلوي تقسم الى 3 أقسام مركزية: [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D8%AD%D9%84%D9%84_%D8%A7%D9%84%D8%AC%D9%84%D9%88%D9%83%D9%88%D8%B2 جليكوليزا ] (التي تحدث في السيتوبلازما)، [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AF%D9%88%D8%B1%D8%A9_%D8%AD%D9%85%D8%B6_%D8%A7%D9%84%D8%B3%D8%AA%D8%B1%D9%8A%D9%83 دورة كريبس] (تحدث في المساحة الداخلية للميتوكوندريا) وسلسلة نقل الالكترونات التي تحدث داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. <br />
<br />
.بنقل الالكترونات لجزيئات أخرى ملامسة لها، وهكذا يتم تشكيل سلسلة من البروتينات حاملة الإلكترونات FADH2 و NADH في سلسلة نقل الالكترونات تقوم الجزيئات المختزلة بدورة كريبس مثل<br />
.يتم استيعاب الإلكترونات في نهاية الأمر بواسطة الأكسجين ويؤدي هذا الاتحاد الى انتاج الماء<br />
نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة ، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا<br />
بواسطة منحدر التركيز الناتج في أيونات الهيدروجين يتم دفع عمل البروتين ATP سنتاز من أجل انتاج ATP. [https://davidson.weizmann.ac.il/ar/online/maagarmada/atp-%D8%B3%D9%8A%D9%86%D8%AB%D8%A7%D8%B2-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AD%D8%B1%D9%83-%D8%A7%D9%84%D8%AC%D8%B2%D9%8A%D8%A6%D9%8A%D9%91-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AA%D9%83%D8%A7%D9%85%D9%84 ATP] هو جزيء غنيّ بالطّاقة، يحتوي على مجموعة من الأدينوساين وثلاث مجموعات من الفوسفور المرتبطة به. يؤدّي التحلّل المائيّ لمجموعة الفوسفور الثالثة إلى إطلاق طاقة تسمح للجسم بتنشيط العديد من الإنزيمات والعمليات الموجودة فيه. يقوم الجسم بإنتاج الATP في الميتوكوندريا في جميع الأوقات وذلك من الاجل الحفاظ على نسبة عالية من الATP داخل الخلية وبالتالي فان نقل الالكترونات وإنتاج منحدر تراكيز لأيونات الهيدروجين تعتبر عملية رئيسية من اجل وجود سليم للخلية.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة1 (قوموا بالوقف على الصورة بالفأرة من أجل اظهار الشرح)<br />
</p><br />
[[Image:Electron_transport_chain_cytochrome_c.jpg|border|center|600px|نرى في الصورة سلسلة نقل الالكترونات – نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا. هذا النقل فعال (يحتاج الى طاقة) وهو عكس منحدر التركيز. تراكم ايونات الهيدروجين في الفراغ بين غشائي الخلية يمكن من دخول الهيدروجين بشكل غير فعال من اجل انتاج جزيء ATP .]]<br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
هنا توجد 3 مقاطع فيديو:<br />
<br><br />
[https://youtu.be/3YTPOIcj6lw סרטון] حول عملية نقل الإلكترون في الميتوكوندريا.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/LQmTKxI4Wn4 סרטון] فيديو يشرح العملية من زاوية أوسع.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/YZsJ-8TenYw סרטון] فيديو عن انحدار التراكيز مع التركيز على ATP سينثاز.<br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> المبنى الجزيئي </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي ينتمي لعائلة البروتين باسم all-α proteins والتي تتميز بوجود <scene name='89/898985/Secondary_structure/4'>المبنى الثنائي</scene> لولب ألفا. كل بروتين ينتمي لهذه المجموعة يحتوي أيضا على مجموعة هيم واحدة أو أكثر.<br />
<br><br />
<scene name='89/898985/Hem_c/2'>HEME C</scene> – مجموعة هيم عبارة عن مركب عضوي يتم انتاجه في النخاع العظمي والكبد. والهيم هو جزء من البروتينات التي تقوم بوظائف متعددة في الجسم. ان فعالية مجموعة هيم تنبع من قدرة ذرة الحديد على ربط جزيئات صغيرة (مثل الاكسجين) وأيضا على قدرتها لأكسدة واختزال مركبات أخرى (ان تعطي الكترونات او ان تستقبل الكترونات، على التوالي).<br />
<br><br />
يتكون السيتوكروم C البشري من <scene name='89/898985/Amino_acids/4'>سلسلة من 104 من الاحماض الامينية</scene> . يرتبط اثنان من الأحماض الأمينية بذرة الحديد <scene name='89/898985/Bond_to_iron_18_80/2'>(الهيستيدين في الموضع 18 والمثيونين في الموضع 80)</scene> ، ويرتبط اثنان من الأحماض الأمينية تساهميًا (رباط تساهمي) من خلال ذرة الكبريت (S) بمجموعة هيم <scene name='89/898985/Bond_to_iron_14_17/2'>(السيستئين في الموضع 17 وسيستئين في الموضع 14)</scene><br />
<br><br />
لقد وجد أن هناك عدد من الأحماض الأمينية المحفوظة تطوريًا، وهي الأحماض الأمينية المهمة لربط ذرة الحديد ومجموعة هيم. <scene name='89/898985/Cxxch_motive/6'>CXXCH</scene> (السيستئين ، X ، X ، السيستئين ، الهيستيدين) حيث يمكن أن يكون X أي حمض أميني غير السيستئين. وهذه المجموعة موجودة أيضا في بروتين سيتوكروم سي البشري.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 2<br />
[[Image:Consurf key small.gif|center|300px|مفتاح الأوان لعرض الحفظ التطوري- الليلكي الداكن يعرض الاحماض الامينية المحفوظة تطوريا والمتماثلة بكائنات حية مختلفة. الأبيض يعرض الاحماض الامينية المحفوظة بشكل جزئي والازرق يعرض الاحماض الامينية الغير محفوظة تطوريا حيث ان هذه المواقع تتواجد بالعديد من الاحماض الامينية المختلفة بين كائنات حية مختلفة.<br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> الوظيفة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
في سلسلة نقل الالكترونات يقوم سيتوكروم سي بنقل الكترون بين المعقدين III و IV . المعقد III يسمى سيتوكروم bc1 والمعقد IV يسمى سيتوكروم سي أوكسيداز. نقل الالكترونات يكون ممكنا بسبب حالة تأكسد متغيرة لذرة الحديد ، حيث ان في البداية يتواجد أيون الحديد في مجموعة هيم بحالة Fe3+ الأمر الذي يمكن من استيعاب الكترون واحد وبالتالي اختزال الحديد لحالة Fe2+.<br />
<br> <br />
<br> <br />
صورة 3<br />
</p><br />
[[Image:Cytochrome C Oxydoreductase.jpg|border|center|400px|نرى في الصورة المعقدات المختلفة في سلسلة نقل الالكترونات- سيتوكروم سي هو بروتين صغير مقارنة بالمعقدات 2و3و4 ولا يستطيع المرور عبر الغشاء الخلوي. يمر البروتين عبر الغشاء الداخلي للميتوكوندريا بين المعقد 3 و4. ويمكن الملاحظة ان جميع بروتينات سلسلة نقل الالكترونات تحتوي على مجموعة هيم.]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
يلعب السيتوكروم سي أيضًا دورًا وسيطًا في عملية [https://he.wikipedia.org/wiki/%D7%90%D7%A4%D7%95%D7%A4%D7%98%D7%95%D7%96%D7%94 موت الخلايا المبرمج] وهو شكل محكوم من موت الخلايا يستخدم لقتل الخلايا في عملية النمو من اجل نمو أعضاء صحيحة وأيضا مسئول عن انتقاء خلايا الدم البيضاء ولقتل الخلايا السرطانية او المريضة . <br />
<br><br />
<br> <br />
في هذا [https://youtu.be/Od3pUsVdMhQ الفيديو] نرى دور السيتوكروم سي في موت الخلايا المبرمج. <br />
<br><br />
سيتوكروم سي الحامل للإلكترونات يتواجد داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا بواسطة رابط هيدروفوبي (كاره للماء) للفوسفوليبيد كارديوليبين (وهو جزيء هيدروفوبي يبني غشاء الميتوكوندريا).<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 4<br />
</p><br />
[[Image:Cardiolipin.jpg|border|center|280px|في الجهة اليسرى من الرسم نرى البروتين سيتوكروم سي مربوط مع الفوسوفليبيد كارديوليبين ويتواجد داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. في الجهة اليمنى نرى انقسام المعقد كارديوليبين- سيتوكروم سي نتيجة لتأكسد جزيء الكارديوليبين. سيتوكورم سي ينفصل عن الغشاء ويصبح حر ويمكنه الوصول للسيتوبلازما.]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
تتميز بداية عملية الموت الخلوي بارتفاع في نسبة الشوارد الحرة (ROS) في الميتوكوندريا. نتيجة لذلك يتم تأكسد الكارديوليبين وبالتالي فانه يتم تفكيك المعقد كارديوليبين- سيتوكروم سي. <br />
يقوم بعد ذلك السيتوكروم سي بالخروج من الغشاء الداخلي للميتوكوندريا ويمر من خلال الثقوب الموجودة في الغشاء الخارجي وصولا الى السيتوبرلازما. في السيتوبلازما يرتبط سيتوكروم سي لبروتين APAF1 وبروتين dATP وهكذا يتكون مبنى ال أبوبتوسوم وهو بروتين يربط بروتين بروكسباز 9 ويحوله الى صورته النشطة والفعالة وهكذا تتمكن الكاسباسات 3 و7 من الارتباط والعمل (caspase). هذه العملية تؤدي الى ضرر وانقسام في ال DNA الذي ينتهي بموت موجه للخلية.<br />
<br><br />
<br> <br />
صورة 5<br />
</p><br />
[[Image:Apoptosome.jpg|border|center|280px|بداية نرى اطلاق السيتوكروم سي من الميتوكوندريا الى السيتوبلازما. بعد ذلك يرتبط السيتوكورم سي مع بروتين في السيتوبلازما ويتم انتاج الأبوبتوسوم وهو مركب مهم في مراقبة عملية الموت المبرمج للخلايا حيث انه يربط بروتين بروكسباز 9 ويحوله الى صورته النشطة والفعالة وهكذا ينشط المسار الداخلي لعملية الموت الخلوي والتي تنتهي بموت موجه للخلية.]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
منع الموت المبرمج للخلية<br />
<br><br />
تشير العديد من الأبحاث ان الخلايا تستطيع ان تتحكم وتسيطر على موت الخلايا المبرمج ولذك من خلال تعديل تقوم به بعد عملية الترجمة في البروتين. البروتينات هي سلسلة طويلة من الاحماض الامينية، المرحلة الأولى في بناء البروتين هي انتاج سلسلة من الاحماض الامينية (المبنى الاولي) وبعد ذلك تمر هذه السلسلة بالعديد من المعالجات والتعديلات. واحدة من هذه التعديلات هي عملية الفسفرة. عملية الفسفرة يتم فيها إضافة مجموعة فوسفات للبروتين (أيون يحتوي على ذرة فوسفات واحدة و4 ذرات هيدروجين). تتم العملية بواسطة إنزيمات الكيناز والتي تنقل الفوسفات وهي تغيير الشكل التركيبي للبروتين بحيث تعدل من صفاته أو وظيفته. والعملية العكسية تسمى إزالة الفسفرة بواسطة انزيم الفوسفاتيز الذي يقوم بإزالة مجموعة فوسفات من البروتين. في سيتوكروم سي وجد أن هناك عدد من الأحماض الأمينية المحفوظة تطوريًا والتي تمر <scene name='89/898985/Phosphotyrosine_48_97/4'>بعملية الفسفرة</scene> ، الامر الذي يمنع من الإنتاج الزائد للشوارد الحرة (ROS)<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 6<br />
</p><br />
[[Image:Apoptosome formation.jpg|border|center|يعرض لنا المخطط التالي البروتين سيتوكروم سي في حالته المفسفرة (مراقب) وفي الحالة الغير مفسفرة (غير مراقب). في الحالة المراقبة نرى ان وتيرة التنفس الخلوي متوازنة ولذلك تنتج كمية شوارد حرة صغيرة ، جهد الغشاء إيجابي والسيتوكروم سي يرتبط مع الغشاء الداخلي للميتوكوندريا بواسطة الكارديوليبين.<br />
في الحالة الغير متوازنة يكون التنفس الخلوي بأعلى وتيرة له ونتيجة لذلك يصبح جهد الخلية سلبي ويتم انتاج الشوارد الحرة بشكل متزايد ونرى انفصال المعقد كارديوليبين-سيتوكروم سي. <br />
<br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
صورة 7<br />
</p><br />
[[Image:Cytochrome c alignment.jpg|border|center|<br />
نرى في المكان 14 و17 الحمض الأميني سيستئين مربوط برباط كوفلنتي (تساهمي) مع مجموعة هيم (الحرف سي ). في أماكن الأسهم توجد مناطق محفوظة تطوريا والتي تمر بتعديل بعد عملية الترجمة من بينها المكان 48 و 97 (الحمض الأميني تيروسين-الحرف واي )<br />
(سيتوكروم سي مأخوذ من انسان وفأر من نسيج جسدي ونسيج جنسي).]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
وظيفة السيتوكروم سي كمانع للأكسدة (تقليل ROS) تتم بشكل مباشر عن طريق إزالة الأكسيد الفائق O2- وماء الاكسجين (H2O2) من الميتوكوندريا كما هو موضح في الرسم التالي:<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 8<br />
</p><br />
[[Image:Antioxidante.png|center|]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي هو بروتين يلعب دور مركزي في انتاج الطاقة في الخلية وأيضا له دور رئيسي بعمليات موت الخلايا المبرمج.<br />
</p><br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> وراثة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
جين CYCS الذي يشفر بروتين السيتوكروم C في البشر يتواجد على كروموسوم 7 في الحمض النووي DNA في نواة الخلية. هذا على عكس البروتينات الأخرى التي تعمل في عضية الميتوكوندريا المشفرة بواسطة الحمض النووي DNA للميتوكوندريا. حيث ان ال DNA للميتوكوندريا صغير جدًا، ويتألف من كروموسوم واحد صغير ويتضمن أقل من 17000 زوج قواعد نيتروجينية. بينما ال DNA في نواة الخلية يتضمن ثلاثة مليارات قاعدة نيتروجينية في 23 زوجًا من الكروموسومات.<br />
ومع ذلك، تحتوي كل خلية على نواة واحدة والعديد من الميتوكوندريا: في بعض الخلايا يصل عدد عضيات الميتوكوندريا إلى الآلاف، لذلك لديهم أيضًا آلاف النسخ من الحمض النووي DNA للميتوكوندريا. هناك اختلاف آخر بين أنواع الحمض النووي DNA وهو أننا نحصل على الحمض النووي DNA للميتوكوندريا من الأم فقط. تحتوي خلية الحيوانات المنوية على ميتوكوندريا، لكنها موجودة في "ذيل" الخلية، والذي يبقى بالخارج عند اتحاد الحيوان المنوي مع البويضة، يقوم الحمض النووي DNA للميتوكوندريا بتشفير13 بروتينًا ضروريًا لوظيفة الميتوكوندريا باعتبارها "محطة القوة الخلية".<br />
<br><br />
يحتوي الجينوم البشري على 49 "جينا كاذبا" للجين CYCS (وهي جينات غير فعالة ولا تمر في مرحلة النسخ ولا الترجمة). للجين توجد ثلاثة اكسونات. <br />
<br><br />
يتم تركيب البروتينات من أحماض أمينية باستخدام المعلومة المشفرة في الجينات، لدى كل بروتين تسلسلٌ خاص به من الأحماض الأمينية والذي يُحدَّد بواسطة تسلسل نوكليوتيدات الجين المشفر لذلك البروتين. تُنسخ الجينات المشفرة في الدنا إلى رنا رسول والذي يُستخدم بعدها كقالب لتخليق (ترجمة) البروتين بواسطة الريبوسوم. لا يتم التعبير عن جميع الجينات في الكائن الحي في نفس الوقت حيث ان كل خلية تعبر فقط عن جزء معين من المعلومات الموجودة بها ويتم قمع الجينات الأخرى التي ليست ضرورية لوظيفة الخلية. يتم قياس التعبير الجيني للجين CYCS حسب كمية الرنا رسول في الانسجة المختلفة حيث ان التعبير يختلف من نسيج الى اخر.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 9<br />
[[Image:Expression cytochrome c.JPG|border|center|600px|]]<br />
</p><br />
<br><br />
==<div style="text-align: right;"> أمراض </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
عند الأشخاص الذين يعانون من متلازمة نقص الصفيحات وجدت طفرة في جين CYCS والتي بها يتم استبدال الحمض الاميني <scene name='89/898985/Gly__41/3'>جلايسين في المكان ال41 ( مكان محفوظ تطوريا) </scene> بالحمض الاميني سيرين . هذه المتلازمة هي متلازمة سائدة تتميز بنقص في عدد صفائح الدم وبالتالي يزداد الاحتمال لحدوث النزيف وتقل احتمالية تخثر الدم. <br />
لقد وجدت الدراسات الحديثة أن هذه الطفرة تزيد من النشاط المؤيد لموت الخلايا المبرمج عن طريق تنشيط الكاسبيز(caspase) بشكل أكثر كفاءة من البروتين الطبيعي. لا تؤثر هذه الطفرة على وظيفة الأكسدة والاختزال للبروتين<br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> ورقة عمل للطالب </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
[https://proteopedia.org/wiki/images/d/d8/%D7%93%D7%A3_%D7%A2%D7%91%D7%95%D7%93%D7%94_%D7%9C%D7%AA%D7%9C%D7%9E%D7%99%D7%93_-_cytochrome_C.pdf דף עבודה לתלמיד]<br />
<br><br />
[https://proteopedia.org/wiki/images/0/08/%D7%A0%D7%A1%D7%A4%D7%97_FASTA_%D7%A9%D7%9C_%D7%94%D7%97%D7%9C%D7%91%D7%95%D7%A0%D7%99%D7%9D.doc נספח]<br />
</p><br />
<br><br />
==<div style="text-align: right;"> المصادر </div> ==<br />
<br><br />
[https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/compound/444125#section=3D-Conformer pubchem]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/NP_061820.1 ncbi - cytochrome c - homo sapiens]<br />
<br><br />
[https://ashpublications.org/blood/article/132/Supplement%201/3758/265249/A-Novel-Cycs-Missense-Mutation-in-the-Helix-of-the A Novel Cycs Missense Mutation in the α-Helix of the Cycs C-Terminal Domain Causes Non-Syndromic Thrombocytopenia]<br />
<br><br />
[https://davidson.weizmann.ac.il/online/sciencenews/%D7%9C%D7%A8%D7%90%D7%95%D7%AA-%D7%90%D7%AA-%D7%94%D7%9E%D7%95%D7%9C%D7%A7%D7%95%D7%9C%D7%95%D7%AA-%D7%A0%D7%98%D7%A2%D7%A0%D7%95%D7%AA לראות את המולקולות נטענות - מכון דוידסון]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/browser/gene/?id=54205 ncbi cics gene]<br />
<br><br />
[https://www.rcsb.org/structure/1gu2 pdb - 1GU2]<br />
<br><br />
[https://www.rcsb.org/structure/1AKK pdb - 1AKK]<br />
<br><br />
[https://chem.libretexts.org/Courses/Saint_Marys_College_Notre_Dame_IN/CHEM_342%3A_Bio-inorganic_Chemistry/Readings/Metals_in_Biological_Systems_(Saint_Mary's_College)/Cytochrome_C Cytochrome C. (2019, June 5).]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/54205 ncbi - CYCS cytochrome c - Homo sapiens]<br />
<br><br />
[https://www.nature.com/articles/nrm2434 nature - Cytochrome c: functions beyond respiration]</div>Fatima M Hameedhttps://proteopedia.org/index.php?title=Cytochrome_C_(arabic)&diff=3554832Cytochrome C (arabic)2022-05-01T09:55:11Z<p>Fatima M Hameed: </p>
<hr />
<div>==<center>'''سيتوكروم سي البشري '''</center>==<br />
<p dir='rtl'><br />
<br />
.سيتوكروم سي عبارة عن زلال صغير (الوزن الجزيئي حوالي 1200 دالتون ) وهو بروتين محفوظ للغاية عبر مجموعة من الأنواع ، موجود في النباتات والحيوانات والعديد من الكائنات أحادية الخلية<br />
<br />
يرتبط هذا البروتين بمجموعة [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D9%87%D9%8A%D9%85 هيم] وبمركزها توجد ذرة حديد، وهو بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات وبعملية الاستموات (موت الخلايا المبرمج)<br />
</p><br />
<StructureSection load='1J3S' size='340' side='left' caption=' سيتوكروم سي البشري (PDB code [[1j3s]])' scene='89/898985/Cytochrome_c_basic/19'><br />
==<div style="text-align: right;"> المقدمة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي عبارة عن بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات، والتي هي العملية الأخيرة في عملية <br />
[https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D9%86%D9%81%D8%B3_%D8%AE%D9%84%D9%88%D9%8A التنفس الخلوي]<br />
. عملية التنفس الخلوي تقسم الى 3 أقسام مركزية: [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D8%AD%D9%84%D9%84_%D8%A7%D9%84%D8%AC%D9%84%D9%88%D9%83%D9%88%D8%B2 جليكوليزا ] (التي تحدث في السيتوبلازما)، [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AF%D9%88%D8%B1%D8%A9_%D8%AD%D9%85%D8%B6_%D8%A7%D9%84%D8%B3%D8%AA%D8%B1%D9%8A%D9%83 دورة كريبس] (تحدث في المساحة الداخلية للميتوكوندريا) وسلسلة نقل الالكترونات التي تحدث داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. <br />
<br />
.بنقل الالكترونات لجزيئات أخرى ملامسة لها، وهكذا يتم تشكيل سلسلة من البروتينات حاملة الإلكترونات FADH2 و NADH في سلسلة نقل الالكترونات تقوم الجزيئات المختزلة بدورة كريبس مثل<br />
.يتم استيعاب الإلكترونات في نهاية الأمر بواسطة الأكسجين ويؤدي هذا الاتحاد الى انتاج الماء<br />
نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة ، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا<br />
بواسطة منحدر التركيز الناتج في أيونات الهيدروجين يتم دفع عمل البروتين ATP سنتاز من أجل انتاج ATP. [https://davidson.weizmann.ac.il/ar/online/maagarmada/atp-%D8%B3%D9%8A%D9%86%D8%AB%D8%A7%D8%B2-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AD%D8%B1%D9%83-%D8%A7%D9%84%D8%AC%D8%B2%D9%8A%D8%A6%D9%8A%D9%91-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AA%D9%83%D8%A7%D9%85%D9%84 ATP] هو جزيء غنيّ بالطّاقة، يحتوي على مجموعة من الأدينوساين وثلاث مجموعات من الفوسفور المرتبطة به. يؤدّي التحلّل المائيّ لمجموعة الفوسفور الثالثة إلى إطلاق طاقة تسمح للجسم بتنشيط العديد من الإنزيمات والعمليات الموجودة فيه. يقوم الجسم بإنتاج الATP في الميتوكوندريا في جميع الأوقات وذلك من الاجل الحفاظ على نسبة عالية من الATP داخل الخلية وبالتالي فان نقل الالكترونات وإنتاج منحدر تراكيز لأيونات الهيدروجين تعتبر عملية رئيسية من اجل وجود سليم للخلية.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة1 (قوموا بالوقف على الصورة بالفأرة من أجل اظهار الشرح)<br />
</p><br />
[[Image:Electron_transport_chain_cytochrome_c.jpg|border|center|600px|نرى في الصورة سلسلة نقل الالكترونات – نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا. هذا النقل فعال (يحتاج الى طاقة) وهو عكس منحدر التركيز. تراكم ايونات الهيدروجين في الفراغ بين غشائي الخلية يمكن من دخول الهيدروجين بشكل غير فعال من اجل انتاج جزيء ATP .]]<br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
هنا توجد 3 مقاطع فيديو:<br />
<br><br />
[https://youtu.be/3YTPOIcj6lw סרטון] حول عملية نقل الإلكترون في الميتوكوندريا.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/LQmTKxI4Wn4 סרטון] فيديو يشرح العملية من زاوية أوسع.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/YZsJ-8TenYw סרטון] فيديو عن انحدار التراكيز مع التركيز على ATP سينثاز.<br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> المبنى الجزيئي </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي ينتمي لعائلة البروتين باسم all-α proteins والتي تتميز بوجود <scene name='89/898985/Secondary_structure/4'>المبنى الثنائي</scene> لولب ألفا. كل بروتين ينتمي لهذه المجموعة يحتوي أيضا على مجموعة هيم واحدة أو أكثر.<br />
<br><br />
<scene name='89/898985/Hem_c/2'>HEME C</scene> – مجموعة هيم عبارة عن مركب عضوي يتم انتاجه في النخاع العظمي والكبد. والهيم هو جزء من البروتينات التي تقوم بوظائف متعددة في الجسم. ان فعالية مجموعة هيم تنبع من قدرة ذرة الحديد على ربط جزيئات صغيرة (مثل الاكسجين) وأيضا على قدرتها لأكسدة واختزال مركبات أخرى (ان تعطي الكترونات او ان تستقبل الكترونات، على التوالي).<br />
<br><br />
يتكون السيتوكروم C البشري من <scene name='89/898985/Amino_acids/4'>سلسلة من 104 من الاحماض الامينية</scene> . يرتبط اثنان من الأحماض الأمينية بذرة الحديد <scene name='89/898985/Bond_to_iron_18_80/2'>(الهيستيدين في الموضع 18 والمثيونين في الموضع 80)</scene> ، ويرتبط اثنان من الأحماض الأمينية تساهميًا (رباط تساهمي) من خلال ذرة الكبريت (S) بمجموعة هيم <scene name='89/898985/Bond_to_iron_14_17/2'>(السيستئين في الموضع 17 وسيستئين في الموضع 14)</scene><br />
<br><br />
لقد وجد أن هناك عدد من الأحماض الأمينية المحفوظة تطوريًا، وهي الأحماض الأمينية المهمة لربط ذرة الحديد ومجموعة هيم. <scene name='89/898985/Cxxch_motive/6'>CXXCH</scene> (السيستئين ، X ، X ، السيستئين ، الهيستيدين) حيث يمكن أن يكون X أي حمض أميني غير السيستئين. وهذه المجموعة موجودة أيضا في بروتين سيتوكروم سي البشري.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 2<br />
[[Image:Consurf key small.gif|center|300px|مفتاح الأوان لعرض الحفظ التطوري- الليلكي الداكن يعرض الاحماض الامينية المحفوظة تطوريا والمتماثلة بكائنات حية مختلفة. الأبيض يعرض الاحماض الامينية المحفوظة بشكل جزئي والازرق يعرض الاحماض الامينية الغير محفوظة تطوريا حيث ان هذه المواقع تتواجد بالعديد من الاحماض الامينية المختلفة بين كائنات حية مختلفة.<br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> الوظيفة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
في سلسلة نقل الالكترونات يقوم سيتوكروم سي بنقل الكترون بين المعقدين III و IV . المعقد III يسمى سيتوكروم bc1 والمعقد IV يسمى سيتوكروم سي أوكسيداز. نقل الالكترونات يكون ممكنا بسبب حالة تأكسد متغيرة لذرة الحديد ، حيث ان في البداية يتواجد أيون الحديد في مجموعة هيم بحالة Fe3+ الأمر الذي يمكن من استيعاب الكترون واحد وبالتالي اختزال الحديد لحالة Fe2+.<br />
<br> <br />
<br> <br />
صورة 3<br />
</p><br />
[[Image:Cytochrome C Oxydoreductase.jpg|border|center|400px|نرى في الصورة المعقدات المختلفة في سلسلة نقل الالكترونات- سيتوكروم سي هو بروتين صغير مقارنة بالمعقدات 2و3و4 ولا يستطيع المرور عبر الغشاء الخلوي. يمر البروتين عبر الغشاء الداخلي للميتوكوندريا بين المعقد 3 و4. ويمكن الملاحظة ان جميع بروتينات سلسلة نقل الالكترونات تحتوي على مجموعة هيم.]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
يلعب السيتوكروم سي أيضًا دورًا وسيطًا في عملية [https://he.wikipedia.org/wiki/%D7%90%D7%A4%D7%95%D7%A4%D7%98%D7%95%D7%96%D7%94 موت الخلايا المبرمج] وهو شكل محكوم من موت الخلايا يستخدم لقتل الخلايا في عملية النمو من اجل نمو أعضاء صحيحة وأيضا مسئول عن انتقاء خلايا الدم البيضاء ولقتل الخلايا السرطانية او المريضة . <br />
<br><br />
<br> <br />
في هذا [https://youtu.be/Od3pUsVdMhQ الفيديو] نرى دور السيتوكروم سي في موت الخلايا المبرمج. <br />
<br><br />
سيتوكروم سي الحامل للإلكترونات يتواجد داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا بواسطة رابط هيدروفوبي (كاره للماء) للفوسفوليبيد كارديوليبين (وهو جزيء هيدروفوبي يبني غشاء الميتوكوندريا).<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 4<br />
</p><br />
[[Image:Cardiolipin.jpg|border|center|280px|في الجهة اليسرى من الرسم نرى البروتين سيتوكروم سي مربوط مع الفوسوفليبيد كارديوليبين ويتواجد داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. في الجهة اليمنى نرى انقسام المعقد كارديوليبين- سيتوكروم سي نتيجة لتأكسد جزيء الكارديوليبين. سيتوكورم سي ينفصل عن الغشاء ويصبح حر ويمكنه الوصول للسيتوبلازما.]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
تتميز بداية عملية الموت الخلوي بارتفاع في نسبة الشوارد الحرة (ROS) في الميتوكوندريا. نتيجة لذلك يتم تأكسد الكارديوليبين وبالتالي فانه يتم تفكيك المعقد كارديوليبين- سيتوكروم سي. <br />
يقوم بعد ذلك السيتوكروم سي بالخروج من الغشاء الداخلي للميتوكوندريا ويمر من خلال الثقوب الموجودة في الغشاء الخارجي وصولا الى السيتوبرلازما. في السيتوبلازما يرتبط سيتوكروم سي لبروتين APAF1 وبروتين dATP وهكذا يتكون مبنى ال أبوبتوسوم وهو بروتين يربط بروتين بروكسباز 9 ويحوله الى صورته النشطة والفعالة وهكذا تتمكن الكاسباسات 3 و7 من الارتباط والعمل (caspase). هذه العملية تؤدي الى ضرر وانقسام في ال DNA الذي ينتهي بموت موجه للخلية.<br />
<br><br />
<br> <br />
صورة 5<br />
</p><br />
[[Image:Apoptosome.jpg|border|center|280px|بداية نرى اطلاق السيتوكروم سي من الميتوكوندريا الى السيتوبلازما. بعد ذلك يرتبط السيتوكورم سي مع بروتين في السيتوبلازما ويتم انتاج الأبوبتوسوم وهو مركب مهم في مراقبة عملية الموت المبرمج للخلايا حيث انه يربط بروتين بروكسباز 9 ويحوله الى صورته النشطة والفعالة وهكذا ينشط المسار الداخلي لعملية الموت الخلوي والتي تنتهي بموت موجه للخلية.]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
منع الموت المبرمج للخلية<br />
<br><br />
تشير العديد من الأبحاث ان الخلايا تستطيع ان تتحكم وتسيطر على موت الخلايا المبرمج ولذك من خلال تعديل تقوم به بعد عملية الترجمة في البروتين. البروتينات هي سلسلة طويلة من الاحماض الامينية، المرحلة الأولى في بناء البروتين هي انتاج سلسلة من الاحماض الامينية (المبنى الاولي) وبعد ذلك تمر هذه السلسلة بالعديد من المعالجات والتعديلات. واحدة من هذه التعديلات هي عملية الفسفرة. عملية الفسفرة يتم فيها إضافة مجموعة فوسفات للبروتين (أيون يحتوي على ذرة فوسفات واحدة و4 ذرات هيدروجين). تتم العملية بواسطة إنزيمات الكيناز والتي تنقل الفوسفات وهي تغيير الشكل التركيبي للبروتين بحيث تعدل من صفاته أو وظيفته. والعملية العكسية تسمى إزالة الفسفرة بواسطة انزيم الفوسفاتيز الذي يقوم بإزالة مجموعة فوسفات من البروتين. في سيتوكروم سي وجد أن هناك عدد من الأحماض الأمينية المحفوظة تطوريًا والتي تمر <scene name='89/898985/Phosphotyrosine_48_97/4'>بعملية الفسفرة</scene> ، الامر الذي يمنع من الإنتاج الزائد للشوارد الحرة (ROS)<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 6<br />
</p><br />
[[Image:Apoptosome formation.jpg|border|center|يعرض لنا المخطط التالي عملية البروتين في حالته المفسفرة (مراقب) وفي الحالة الغير مفسفرة (غير مراقب). في الحالة المراقبة نرى ان وتيرة التنفس الخلوي متوازنة ولذلك تنتج كمية شوارد حرة صغيرة ، جهد الغشاء إيجابي والسيتوكروم سي يرتبط مع الغشاء الداخلي للميتوكوندريا بواسطة الكارديوليبين.<br />
في الحالة الغير متوازنة يكون التنفس الخلوي بأعلى وتيرة له ونتيجة لذلك يصبح جهد الخلية سلبي ويتم انتاج الشوارد الحرة بشكل متزايد ونرى انفصال المعقد كارديوليبين-سيتوكروم سي. <br />
<br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
صورة 7<br />
</p><br />
[[Image:Cytochrome c alignment.jpg|border|center|<br />
نرى في المكان 14 و17 الحمض الأميني سيستئين مربوط برباط كوفلنتي (تساهمي) مع مجموعة هيم (الحرف سي ). في أماكن الأسهم توجد مناطق محفوظة تطوريا والتي تمر بتعديل بعد عملية الترجمة من بينها المكان 48 و 97 (الحمض الأميني تيروسين-الحرف واي )<br />
(سيتوكروم سي مأخوذ من انسان وفأر من نسيج جسدي ونسيج جنسي).]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
وظيفة السيتوكروم سي كمانع للأكسدة (تقليل ROS) تتم بشكل مباشر عن طريق إزالة الأكسيد الفائق O2- وماء الاكسجين (H2O2) من الميتوكوندريا كما هو موضح في الرسم التالي:<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 8<br />
</p><br />
[[Image:Antioxidante.png|center|]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي هو بروتين يلعب دور مركزي في انتاج الطاقة في الخلية وأيضا له دور رئيسي بعمليات موت الخلايا المبرمج.<br />
</p><br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> وراثة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
جين CYCS الذي يشفر بروتين السيتوكروم C في البشر يتواجد على كروموسوم 7 في الحمض النووي DNA في نواة الخلية. هذا على عكس البروتينات الأخرى التي تعمل في عضية الميتوكوندريا المشفرة بواسطة الحمض النووي DNA للميتوكوندريا. حيث ان ال DNA للميتوكوندريا صغير جدًا، ويتألف من كروموسوم واحد صغير ويتضمن أقل من 17000 زوج قواعد نيتروجينية. بينما ال DNA في نواة الخلية يتضمن ثلاثة مليارات قاعدة نيتروجينية في 23 زوجًا من الكروموسومات.<br />
ومع ذلك، تحتوي كل خلية على نواة واحدة والعديد من الميتوكوندريا: في بعض الخلايا يصل عدد عضيات الميتوكوندريا إلى الآلاف، لذلك لديهم أيضًا آلاف النسخ من الحمض النووي DNA للميتوكوندريا. هناك اختلاف آخر بين أنواع الحمض النووي DNA وهو أننا نحصل على الحمض النووي DNA للميتوكوندريا من الأم فقط. تحتوي خلية الحيوانات المنوية على ميتوكوندريا، لكنها موجودة في "ذيل" الخلية، والذي يبقى بالخارج عند اتحاد الحيوان المنوي مع البويضة، يقوم الحمض النووي DNA للميتوكوندريا بتشفير13 بروتينًا ضروريًا لوظيفة الميتوكوندريا باعتبارها "محطة القوة الخلية".<br />
<br><br />
يحتوي الجينوم البشري على 49 "جينا كاذبا" للجين CYCS (وهي جينات غير فعالة ولا تمر في مرحلة النسخ ولا الترجمة). للجين توجد ثلاثة اكسونات. <br />
<br><br />
يتم تركيب البروتينات من أحماض أمينية باستخدام المعلومة المشفرة في الجينات، لدى كل بروتين تسلسلٌ خاص به من الأحماض الأمينية والذي يُحدَّد بواسطة تسلسل نوكليوتيدات الجين المشفر لذلك البروتين. تُنسخ الجينات المشفرة في الدنا إلى رنا رسول والذي يُستخدم بعدها كقالب لتخليق (ترجمة) البروتين بواسطة الريبوسوم. لا يتم التعبير عن جميع الجينات في الكائن الحي في نفس الوقت حيث ان كل خلية تعبر فقط عن جزء معين من المعلومات الموجودة بها ويتم قمع الجينات الأخرى التي ليست ضرورية لوظيفة الخلية. يتم قياس التعبير الجيني للجين CYCS حسب كمية الرنا رسول في الانسجة المختلفة حيث ان التعبير يختلف من نسيج الى اخر.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 9<br />
[[Image:Expression cytochrome c.JPG|border|center|600px|]]<br />
</p><br />
<br><br />
==<div style="text-align: right;"> أمراض </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
عند الأشخاص الذين يعانون من متلازمة نقص الصفيحات وجدت طفرة في جين CYCS والتي بها يتم استبدال الحمض الاميني <scene name='89/898985/Gly__41/3'>جلايسين في المكان ال41 ( مكان محفوظ تطوريا) </scene> بالحمض الاميني سيرين . هذه المتلازمة هي متلازمة سائدة تتميز بنقص في عدد صفائح الدم وبالتالي يزداد الاحتمال لحدوث النزيف وتقل احتمالية تخثر الدم. <br />
لقد وجدت الدراسات الحديثة أن هذه الطفرة تزيد من النشاط المؤيد لموت الخلايا المبرمج عن طريق تنشيط الكاسبيز(caspase) بشكل أكثر كفاءة من البروتين الطبيعي. لا تؤثر هذه الطفرة على وظيفة الأكسدة والاختزال للبروتين<br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> ورقة عمل للطالب </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
[https://proteopedia.org/wiki/images/d/d8/%D7%93%D7%A3_%D7%A2%D7%91%D7%95%D7%93%D7%94_%D7%9C%D7%AA%D7%9C%D7%9E%D7%99%D7%93_-_cytochrome_C.pdf דף עבודה לתלמיד]<br />
<br><br />
[https://proteopedia.org/wiki/images/0/08/%D7%A0%D7%A1%D7%A4%D7%97_FASTA_%D7%A9%D7%9C_%D7%94%D7%97%D7%9C%D7%91%D7%95%D7%A0%D7%99%D7%9D.doc נספח]<br />
</p><br />
<br><br />
==<div style="text-align: right;"> المصادر </div> ==<br />
<br><br />
[https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/compound/444125#section=3D-Conformer pubchem]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/NP_061820.1 ncbi - cytochrome c - homo sapiens]<br />
<br><br />
[https://ashpublications.org/blood/article/132/Supplement%201/3758/265249/A-Novel-Cycs-Missense-Mutation-in-the-Helix-of-the A Novel Cycs Missense Mutation in the α-Helix of the Cycs C-Terminal Domain Causes Non-Syndromic Thrombocytopenia]<br />
<br><br />
[https://davidson.weizmann.ac.il/online/sciencenews/%D7%9C%D7%A8%D7%90%D7%95%D7%AA-%D7%90%D7%AA-%D7%94%D7%9E%D7%95%D7%9C%D7%A7%D7%95%D7%9C%D7%95%D7%AA-%D7%A0%D7%98%D7%A2%D7%A0%D7%95%D7%AA לראות את המולקולות נטענות - מכון דוידסון]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/browser/gene/?id=54205 ncbi cics gene]<br />
<br><br />
[https://www.rcsb.org/structure/1gu2 pdb - 1GU2]<br />
<br><br />
[https://www.rcsb.org/structure/1AKK pdb - 1AKK]<br />
<br><br />
[https://chem.libretexts.org/Courses/Saint_Marys_College_Notre_Dame_IN/CHEM_342%3A_Bio-inorganic_Chemistry/Readings/Metals_in_Biological_Systems_(Saint_Mary's_College)/Cytochrome_C Cytochrome C. (2019, June 5).]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/54205 ncbi - CYCS cytochrome c - Homo sapiens]<br />
<br><br />
[https://www.nature.com/articles/nrm2434 nature - Cytochrome c: functions beyond respiration]</div>Fatima M Hameedhttps://proteopedia.org/index.php?title=Cytochrome_C_(arabic)&diff=3554831Cytochrome C (arabic)2022-05-01T09:54:09Z<p>Fatima M Hameed: </p>
<hr />
<div>==<center>'''سيتوكروم سي البشري '''</center>==<br />
<p dir='rtl'><br />
<br />
.سيتوكروم سي عبارة عن زلال صغير (الوزن الجزيئي حوالي 1200 دالتون ) وهو بروتين محفوظ للغاية عبر مجموعة من الأنواع ، موجود في النباتات والحيوانات والعديد من الكائنات أحادية الخلية<br />
<br />
يرتبط هذا البروتين بمجموعة [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D9%87%D9%8A%D9%85 هيم] وبمركزها توجد ذرة حديد، وهو بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات وبعملية الاستموات (موت الخلايا المبرمج)<br />
</p><br />
<StructureSection load='1J3S' size='340' side='left' caption=' سيتوكروم سي البشري (PDB code [[1j3s]])' scene='89/898985/Cytochrome_c_basic/19'><br />
==<div style="text-align: right;"> المقدمة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي عبارة عن بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات، والتي هي العملية الأخيرة في عملية <br />
[https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D9%86%D9%81%D8%B3_%D8%AE%D9%84%D9%88%D9%8A التنفس الخلوي]<br />
. عملية التنفس الخلوي تقسم الى 3 أقسام مركزية: [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D8%AD%D9%84%D9%84_%D8%A7%D9%84%D8%AC%D9%84%D9%88%D9%83%D9%88%D8%B2 جليكوليزا ] (التي تحدث في السيتوبلازما)، [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AF%D9%88%D8%B1%D8%A9_%D8%AD%D9%85%D8%B6_%D8%A7%D9%84%D8%B3%D8%AA%D8%B1%D9%8A%D9%83 دورة كريبس] (تحدث في المساحة الداخلية للميتوكوندريا) وسلسلة نقل الالكترونات التي تحدث داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. <br />
<br />
.بنقل الالكترونات لجزيئات أخرى ملامسة لها، وهكذا يتم تشكيل سلسلة من البروتينات حاملة الإلكترونات FADH2 و NADH في سلسلة نقل الالكترونات تقوم الجزيئات المختزلة بدورة كريبس مثل<br />
.يتم استيعاب الإلكترونات في نهاية الأمر بواسطة الأكسجين ويؤدي هذا الاتحاد الى انتاج الماء<br />
نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة ، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا<br />
بواسطة منحدر التركيز الناتج في أيونات الهيدروجين يتم دفع عمل البروتين ATP سنتاز من أجل انتاج ATP. [https://davidson.weizmann.ac.il/ar/online/maagarmada/atp-%D8%B3%D9%8A%D9%86%D8%AB%D8%A7%D8%B2-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AD%D8%B1%D9%83-%D8%A7%D9%84%D8%AC%D8%B2%D9%8A%D8%A6%D9%8A%D9%91-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AA%D9%83%D8%A7%D9%85%D9%84 ATP] هو جزيء غنيّ بالطّاقة، يحتوي على مجموعة من الأدينوساين وثلاث مجموعات من الفوسفور المرتبطة به. يؤدّي التحلّل المائيّ لمجموعة الفوسفور الثالثة إلى إطلاق طاقة تسمح للجسم بتنشيط العديد من الإنزيمات والعمليات الموجودة فيه. يقوم الجسم بإنتاج الATP في الميتوكوندريا في جميع الأوقات وذلك من الاجل الحفاظ على نسبة عالية من الATP داخل الخلية وبالتالي فان نقل الالكترونات وإنتاج منحدر تراكيز لأيونات الهيدروجين تعتبر عملية رئيسية من اجل وجود سليم للخلية.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة1 (قوموا بالوقف على الصورة بالفأرة من أجل اظهار الشرح)<br />
</p><br />
[[Image:Electron_transport_chain_cytochrome_c.jpg|border|center|600px|نرى في الصورة سلسلة نقل الالكترونات – نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا. هذا النقل فعال (يحتاج الى طاقة) وهو عكس منحدر التركيز. تراكم ايونات الهيدروجين في الفراغ بين غشائي الخلية يمكن من دخول الهيدروجين بشكل غير فعال من اجل انتاج جزيء ATP .]]<br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
هنا توجد 3 مقاطع فيديو:<br />
<br><br />
[https://youtu.be/3YTPOIcj6lw סרטון] حول عملية نقل الإلكترون في الميتوكوندريا.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/LQmTKxI4Wn4 סרטון] فيديو يشرح العملية من زاوية أوسع.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/YZsJ-8TenYw סרטון] فيديو عن انحدار التراكيز مع التركيز على ATP سينثاز.<br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> المبنى الجزيئي </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي ينتمي لعائلة البروتين باسم all-α proteins والتي تتميز بوجود <scene name='89/898985/Secondary_structure/4'>المبنى الثنائي</scene> لولب ألفا. كل بروتين ينتمي لهذه المجموعة يحتوي أيضا على مجموعة هيم واحدة أو أكثر.<br />
<br><br />
<scene name='89/898985/Hem_c/2'>HEME C</scene> – مجموعة هيم عبارة عن مركب عضوي يتم انتاجه في النخاع العظمي والكبد. والهيم هو جزء من البروتينات التي تقوم بوظائف متعددة في الجسم. ان فعالية مجموعة هيم تنبع من قدرة ذرة الحديد على ربط جزيئات صغيرة (مثل الاكسجين) وأيضا على قدرتها لأكسدة واختزال مركبات أخرى (ان تعطي الكترونات او ان تستقبل الكترونات، على التوالي).<br />
<br><br />
يتكون السيتوكروم C البشري من <scene name='89/898985/Amino_acids/4'>سلسلة من 104 من الاحماض الامينية</scene> . يرتبط اثنان من الأحماض الأمينية بذرة الحديد <scene name='89/898985/Bond_to_iron_18_80/2'>(الهيستيدين في الموضع 18 والمثيونين في الموضع 80)</scene> ، ويرتبط اثنان من الأحماض الأمينية تساهميًا (رباط تساهمي) من خلال ذرة الكبريت (S) بمجموعة هيم <scene name='89/898985/Bond_to_iron_14_17/2'>(السيستئين في الموضع 17 وسيستئين في الموضع 14)</scene><br />
<br><br />
لقد وجد أن هناك عدد من الأحماض الأمينية المحفوظة تطوريًا، وهي الأحماض الأمينية المهمة لربط ذرة الحديد ومجموعة هيم. <scene name='89/898985/Cxxch_motive/6'>CXXCH</scene> (السيستئين ، X ، X ، السيستئين ، الهيستيدين) حيث يمكن أن يكون X أي حمض أميني غير السيستئين. وهذه المجموعة موجودة أيضا في بروتين سيتوكروم سي البشري.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 2<br />
[[Image:Consurf key small.gif|center|300px|مفتاح الأوان لعرض الحفظ التطوري- الليلكي الداكن يعرض الاحماض الامينية المحفوظة تطوريا والمتماثلة بكائنات حية مختلفة. الأبيض يعرض الاحماض الامينية المحفوظة بشكل جزئي والازرق يعرض الاحماض الامينية الغير محفوظة تطوريا حيث ان هذه المواقع تتواجد بالعديد من الاحماض الامينية المختلفة بين كائنات حية مختلفة.<br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> الوظيفة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
في سلسلة نقل الالكترونات يقوم سيتوكروم سي بنقل الكترون بين المعقدين III و IV . المعقد III يسمى سيتوكروم bc1 والمعقد IV يسمى سيتوكروم سي أوكسيداز. نقل الالكترونات يكون ممكنا بسبب حالة تأكسد متغيرة لذرة الحديد ، حيث ان في البداية يتواجد أيون الحديد في مجموعة هيم بحالة Fe3+ الأمر الذي يمكن من استيعاب الكترون واحد وبالتالي اختزال الحديد لحالة Fe2+.<br />
<br> <br />
<br> <br />
صورة 3<br />
</p><br />
[[Image:Cytochrome C Oxydoreductase.jpg|border|center|400px|نرى في الصورة المعقدات المختلفة في سلسلة نقل الالكترونات- سيتوكروم سي هو بروتين صغير مقارنة بالمعقدات 2و3و4 ولا يستطيع المرور عبر الغشاء الخلوي. يمر البروتين عبر الغشاء الداخلي للميتوكوندريا بين المعقد 3 و4. ويمكن الملاحظة ان جميع بروتينات سلسلة نقل الالكترونات تحتوي على مجموعة هيم.]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
يلعب السيتوكروم سي أيضًا دورًا وسيطًا في عملية [https://he.wikipedia.org/wiki/%D7%90%D7%A4%D7%95%D7%A4%D7%98%D7%95%D7%96%D7%94 موت الخلايا المبرمج] وهو شكل محكوم من موت الخلايا يستخدم لقتل الخلايا في عملية النمو من اجل نمو أعضاء صحيحة وأيضا مسئول عن انتقاء خلايا الدم البيضاء ولقتل الخلايا السرطانية او المريضة . <br />
<br><br />
<br> <br />
في هذا [https://youtu.be/Od3pUsVdMhQ الفيديو] نرى دور السيتوكروم سي في موت الخلايا المبرمج. <br />
<br><br />
سيتوكروم سي الحامل للإلكترونات يتواجد داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا بواسطة رابط هيدروفوبي (كاره للماء) للفوسفوليبيد كارديوليبين (وهو جزيء هيدروفوبي يبني غشاء الميتوكوندريا).<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 4<br />
</p><br />
[[Image:Cardiolipin.jpg|border|center|280px|في الجهة اليسرى من الرسم نرى البروتين سيتوكروم سي مربوط مع الفوسوفليبيد كارديوليبين ويتواجد داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. في الجهة اليمنى نرى انقسام المعقد كارديوليبين- سيتوكروم سي نتيجة لتأكسد جزيء الكارديوليبين. سيتوكورم سي ينفصل عن الغشاء ويصبح حر ويمكنه الوصول للسيتوبلازما.]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
تتميز بداية عملية الموت الخلوي بارتفاع في نسبة الشوارد الحرة (ROS) في الميتوكوندريا. نتيجة لذلك يتم تأكسد الكارديوليبين وبالتالي فانه يتم تفكيك المعقد كارديوليبين- سيتوكروم سي. <br />
يقوم بعد ذلك السيتوكروم سي بالخروج من الغشاء الداخلي للميتوكوندريا ويمر من خلال الثقوب الموجودة في الغشاء الخارجي وصولا الى السيتوبرلازما. في السيتوبلازما يرتبط سيتوكروم سي لبروتين APAF1 وبروتين dATP وهكذا يتكون مبنى ال أبوبتوسوم وهو بروتين يربط بروتين بروكسباز 9 ويحوله الى صورته النشطة والفعالة وهكذا تتمكن الكاسباسات 3 و7 من الارتباط والعمل (caspase). هذه العملية تؤدي الى ضرر وانقسام في ال DNA الذي ينتهي بموت موجه للخلية.<br />
<br><br />
<br> <br />
صورة 5<br />
</p><br />
[[Image:Apoptosome.jpg|border|center|280px|بداية نرى اطلاق السيتوكروم سي من الميتوكوندريا الى السيتوبلازما. بعد ذلك يرتبط السيتوكورم سي مع بروتين في السيتوبلازما ويتم انتاج الأبوبتوسوم وهو مركب مهم في مراقبة عملية الموت المبرمج للخلايا حيث انه يربط بروتين بروكسباز 9 ويحوله الى صورته النشطة والفعالة وهكذا ينشط المسار الداخلي لعملية الموت الخلوي والتي تنتهي بموت موجه للخلية.]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
منع الموت المبرمج للخلية<br />
<br><br />
تشير العديد من الأبحاث ان الخلايا تستطيع ان تتحكم وتسيطر على موت الخلايا المبرمج ولذك من خلال تعديل تقوم به بعد عملية الترجمة في البروتين. البروتينات هي سلسلة طويلة من الاحماض الامينية، المرحلة الأولى في بناء البروتين هي انتاج سلسلة من الاحماض الامينية (المبنى الاولي) وبعد ذلك تمر هذه السلسلة بالعديد من المعالجات والتعديلات. واحدة من هذه التعديلات هي عملية الفسفرة. عملية الفسفرة يتم فيها إضافة مجموعة فوسفات للبروتين (أيون يحتوي على ذرة فوسفات واحدة و4 ذرات هيدروجين). تتم العملية بواسطة إنزيمات الكيناز والتي تنقل الفوسفات وهي تغيير الشكل التركيبي للبروتين بحيث تعدل من صفاته أو وظيفته. والعملية العكسية تسمى إزالة الفسفرة بواسطة انزيم الفوسفاتيز الذي يقوم بإزالة مجموعة فوسفات من البروتين. في سيتوكروم سي وجد أن هناك عدد من الأحماض الأمينية المحفوظة تطوريًا والتي تمر <scene name='89/898985/Phosphotyrosine_48_97/4'>بعملية الفسفرة</scene> ، الامر الذي يمنع من الإنتاج الزائد للشوارد الحرة (ROS)<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 6<br />
</p><br />
[[Image:Apoptosome formation.jpg|border|center|בתרשים מוצגת פעילות החלבון במצב מזורחן (מבוקר) ובמצב לא מזורחן (לא מבוקר); במצב מבוקר ניתן לראות שקצב הנשימה מווסת ולכן נוצרים מעט רדיקלים חופשיים, פוטנציאל הממברנה חיובי וציטוכרום סי קשור לממברנה הפנימית של המיטוכונדריה באמצעות קרדיוליפין. <br />
במצב לא מבוקר קצב הנשימה התאית הינו קצב מקסימאלי המייצר פוטנציאל ממברנה שלילי, יש עלייה בייצור רדיקלים חופשיים וקומפלקס קרדיוליפין+ציטוכרום סי נפרד. <br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
صورة 7<br />
</p><br />
[[Image:Cytochrome c alignment.jpg|border|center|<br />
نرى في المكان 14 و17 الحمض الأميني سيستئين مربوط برباط كوفلنتي (تساهمي) مع مجموعة هيم (الحرف سي ). في أماكن الأسهم توجد مناطق محفوظة تطوريا والتي تمر بتعديل بعد عملية الترجمة من بينها المكان 48 و 97 (الحمض الأميني تيروسين-الحرف واي )<br />
(سيتوكروم سي مأخوذ من انسان وفأر من نسيج جسدي ونسيج جنسي).]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
وظيفة السيتوكروم سي كمانع للأكسدة (تقليل ROS) تتم بشكل مباشر عن طريق إزالة الأكسيد الفائق O2- وماء الاكسجين (H2O2) من الميتوكوندريا كما هو موضح في الرسم التالي:<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 8<br />
</p><br />
[[Image:Antioxidante.png|center|]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي هو بروتين يلعب دور مركزي في انتاج الطاقة في الخلية وأيضا له دور رئيسي بعمليات موت الخلايا المبرمج.<br />
</p><br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> وراثة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
جين CYCS الذي يشفر بروتين السيتوكروم C في البشر يتواجد على كروموسوم 7 في الحمض النووي DNA في نواة الخلية. هذا على عكس البروتينات الأخرى التي تعمل في عضية الميتوكوندريا المشفرة بواسطة الحمض النووي DNA للميتوكوندريا. حيث ان ال DNA للميتوكوندريا صغير جدًا، ويتألف من كروموسوم واحد صغير ويتضمن أقل من 17000 زوج قواعد نيتروجينية. بينما ال DNA في نواة الخلية يتضمن ثلاثة مليارات قاعدة نيتروجينية في 23 زوجًا من الكروموسومات.<br />
ومع ذلك، تحتوي كل خلية على نواة واحدة والعديد من الميتوكوندريا: في بعض الخلايا يصل عدد عضيات الميتوكوندريا إلى الآلاف، لذلك لديهم أيضًا آلاف النسخ من الحمض النووي DNA للميتوكوندريا. هناك اختلاف آخر بين أنواع الحمض النووي DNA وهو أننا نحصل على الحمض النووي DNA للميتوكوندريا من الأم فقط. تحتوي خلية الحيوانات المنوية على ميتوكوندريا، لكنها موجودة في "ذيل" الخلية، والذي يبقى بالخارج عند اتحاد الحيوان المنوي مع البويضة، يقوم الحمض النووي DNA للميتوكوندريا بتشفير13 بروتينًا ضروريًا لوظيفة الميتوكوندريا باعتبارها "محطة القوة الخلية".<br />
<br><br />
يحتوي الجينوم البشري على 49 "جينا كاذبا" للجين CYCS (وهي جينات غير فعالة ولا تمر في مرحلة النسخ ولا الترجمة). للجين توجد ثلاثة اكسونات. <br />
<br><br />
يتم تركيب البروتينات من أحماض أمينية باستخدام المعلومة المشفرة في الجينات، لدى كل بروتين تسلسلٌ خاص به من الأحماض الأمينية والذي يُحدَّد بواسطة تسلسل نوكليوتيدات الجين المشفر لذلك البروتين. تُنسخ الجينات المشفرة في الدنا إلى رنا رسول والذي يُستخدم بعدها كقالب لتخليق (ترجمة) البروتين بواسطة الريبوسوم. لا يتم التعبير عن جميع الجينات في الكائن الحي في نفس الوقت حيث ان كل خلية تعبر فقط عن جزء معين من المعلومات الموجودة بها ويتم قمع الجينات الأخرى التي ليست ضرورية لوظيفة الخلية. يتم قياس التعبير الجيني للجين CYCS حسب كمية الرنا رسول في الانسجة المختلفة حيث ان التعبير يختلف من نسيج الى اخر.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 9<br />
[[Image:Expression cytochrome c.JPG|border|center|600px|]]<br />
</p><br />
<br><br />
==<div style="text-align: right;"> أمراض </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
عند الأشخاص الذين يعانون من متلازمة نقص الصفيحات وجدت طفرة في جين CYCS والتي بها يتم استبدال الحمض الاميني <scene name='89/898985/Gly__41/3'>جلايسين في المكان ال41 ( مكان محفوظ تطوريا) </scene> بالحمض الاميني سيرين . هذه المتلازمة هي متلازمة سائدة تتميز بنقص في عدد صفائح الدم وبالتالي يزداد الاحتمال لحدوث النزيف وتقل احتمالية تخثر الدم. <br />
لقد وجدت الدراسات الحديثة أن هذه الطفرة تزيد من النشاط المؤيد لموت الخلايا المبرمج عن طريق تنشيط الكاسبيز(caspase) بشكل أكثر كفاءة من البروتين الطبيعي. لا تؤثر هذه الطفرة على وظيفة الأكسدة والاختزال للبروتين<br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> ورقة عمل للطالب </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
[https://proteopedia.org/wiki/images/d/d8/%D7%93%D7%A3_%D7%A2%D7%91%D7%95%D7%93%D7%94_%D7%9C%D7%AA%D7%9C%D7%9E%D7%99%D7%93_-_cytochrome_C.pdf דף עבודה לתלמיד]<br />
<br><br />
[https://proteopedia.org/wiki/images/0/08/%D7%A0%D7%A1%D7%A4%D7%97_FASTA_%D7%A9%D7%9C_%D7%94%D7%97%D7%9C%D7%91%D7%95%D7%A0%D7%99%D7%9D.doc נספח]<br />
</p><br />
<br><br />
==<div style="text-align: right;"> المصادر </div> ==<br />
<br><br />
[https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/compound/444125#section=3D-Conformer pubchem]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/NP_061820.1 ncbi - cytochrome c - homo sapiens]<br />
<br><br />
[https://ashpublications.org/blood/article/132/Supplement%201/3758/265249/A-Novel-Cycs-Missense-Mutation-in-the-Helix-of-the A Novel Cycs Missense Mutation in the α-Helix of the Cycs C-Terminal Domain Causes Non-Syndromic Thrombocytopenia]<br />
<br><br />
[https://davidson.weizmann.ac.il/online/sciencenews/%D7%9C%D7%A8%D7%90%D7%95%D7%AA-%D7%90%D7%AA-%D7%94%D7%9E%D7%95%D7%9C%D7%A7%D7%95%D7%9C%D7%95%D7%AA-%D7%A0%D7%98%D7%A2%D7%A0%D7%95%D7%AA לראות את המולקולות נטענות - מכון דוידסון]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/browser/gene/?id=54205 ncbi cics gene]<br />
<br><br />
[https://www.rcsb.org/structure/1gu2 pdb - 1GU2]<br />
<br><br />
[https://www.rcsb.org/structure/1AKK pdb - 1AKK]<br />
<br><br />
[https://chem.libretexts.org/Courses/Saint_Marys_College_Notre_Dame_IN/CHEM_342%3A_Bio-inorganic_Chemistry/Readings/Metals_in_Biological_Systems_(Saint_Mary's_College)/Cytochrome_C Cytochrome C. (2019, June 5).]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/54205 ncbi - CYCS cytochrome c - Homo sapiens]<br />
<br><br />
[https://www.nature.com/articles/nrm2434 nature - Cytochrome c: functions beyond respiration]</div>Fatima M Hameedhttps://proteopedia.org/index.php?title=Cytochrome_C_(arabic)&diff=3554830Cytochrome C (arabic)2022-05-01T09:52:58Z<p>Fatima M Hameed: </p>
<hr />
<div>==<center>'''سيتوكروم سي البشري '''</center>==<br />
<p dir='rtl'><br />
<br />
.سيتوكروم سي عبارة عن زلال صغير (الوزن الجزيئي حوالي 1200 دالتون ) وهو بروتين محفوظ للغاية عبر مجموعة من الأنواع ، موجود في النباتات والحيوانات والعديد من الكائنات أحادية الخلية<br />
<br />
يرتبط هذا البروتين بمجموعة [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D9%87%D9%8A%D9%85 هيم] وبمركزها توجد ذرة حديد، وهو بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات وبعملية الاستموات (موت الخلايا المبرمج)<br />
</p><br />
<StructureSection load='1J3S' size='340' side='left' caption=' سيتوكروم سي البشري (PDB code [[1j3s]])' scene='89/898985/Cytochrome_c_basic/19'><br />
==<div style="text-align: right;"> المقدمة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي عبارة عن بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات، والتي هي العملية الأخيرة في عملية <br />
[https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D9%86%D9%81%D8%B3_%D8%AE%D9%84%D9%88%D9%8A التنفس الخلوي]<br />
. عملية التنفس الخلوي تقسم الى 3 أقسام مركزية: [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D8%AD%D9%84%D9%84_%D8%A7%D9%84%D8%AC%D9%84%D9%88%D9%83%D9%88%D8%B2 جليكوليزا ] (التي تحدث في السيتوبلازما)، [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AF%D9%88%D8%B1%D8%A9_%D8%AD%D9%85%D8%B6_%D8%A7%D9%84%D8%B3%D8%AA%D8%B1%D9%8A%D9%83 دورة كريبس] (تحدث في المساحة الداخلية للميتوكوندريا) وسلسلة نقل الالكترونات التي تحدث داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. <br />
<br />
.بنقل الالكترونات لجزيئات أخرى ملامسة لها، وهكذا يتم تشكيل سلسلة من البروتينات حاملة الإلكترونات FADH2 و NADH في سلسلة نقل الالكترونات تقوم الجزيئات المختزلة بدورة كريبس مثل<br />
.يتم استيعاب الإلكترونات في نهاية الأمر بواسطة الأكسجين ويؤدي هذا الاتحاد الى انتاج الماء<br />
نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة ، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا<br />
بواسطة منحدر التركيز الناتج في أيونات الهيدروجين يتم دفع عمل البروتين ATP سنتاز من أجل انتاج ATP. [https://davidson.weizmann.ac.il/ar/online/maagarmada/atp-%D8%B3%D9%8A%D9%86%D8%AB%D8%A7%D8%B2-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AD%D8%B1%D9%83-%D8%A7%D9%84%D8%AC%D8%B2%D9%8A%D8%A6%D9%8A%D9%91-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AA%D9%83%D8%A7%D9%85%D9%84 ATP] هو جزيء غنيّ بالطّاقة، يحتوي على مجموعة من الأدينوساين وثلاث مجموعات من الفوسفور المرتبطة به. يؤدّي التحلّل المائيّ لمجموعة الفوسفور الثالثة إلى إطلاق طاقة تسمح للجسم بتنشيط العديد من الإنزيمات والعمليات الموجودة فيه. يقوم الجسم بإنتاج الATP في الميتوكوندريا في جميع الأوقات وذلك من الاجل الحفاظ على نسبة عالية من الATP داخل الخلية وبالتالي فان نقل الالكترونات وإنتاج منحدر تراكيز لأيونات الهيدروجين تعتبر عملية رئيسية من اجل وجود سليم للخلية.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة1 (قوموا بالوقف على الصورة بالفأرة من أجل اظهار الشرح)<br />
</p><br />
[[Image:Electron_transport_chain_cytochrome_c.jpg|border|center|600px|نرى في الصورة سلسلة نقل الالكترونات – نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا. هذا النقل فعال (يحتاج الى طاقة) وهو عكس منحدر التركيز. تراكم ايونات الهيدروجين في الفراغ بين غشائي الخلية يمكن من دخول الهيدروجين بشكل غير فعال من اجل انتاج جزيء ATP .]]<br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
هنا توجد 3 مقاطع فيديو:<br />
<br><br />
[https://youtu.be/3YTPOIcj6lw סרטון] حول عملية نقل الإلكترون في الميتوكوندريا.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/LQmTKxI4Wn4 סרטון] فيديو يشرح العملية من زاوية أوسع.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/YZsJ-8TenYw סרטון] فيديو عن انحدار التراكيز مع التركيز على ATP سينثاز.<br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> المبنى الجزيئي </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي ينتمي لعائلة البروتين باسم all-α proteins والتي تتميز بوجود <scene name='89/898985/Secondary_structure/4'>المبنى الثنائي</scene> لولب ألفا. كل بروتين ينتمي لهذه المجموعة يحتوي أيضا على مجموعة هيم واحدة أو أكثر.<br />
<br><br />
<scene name='89/898985/Hem_c/2'>HEME C</scene> – مجموعة هيم عبارة عن مركب عضوي يتم انتاجه في النخاع العظمي والكبد. والهيم هو جزء من البروتينات التي تقوم بوظائف متعددة في الجسم. ان فعالية مجموعة هيم تنبع من قدرة ذرة الحديد على ربط جزيئات صغيرة (مثل الاكسجين) وأيضا على قدرتها لأكسدة واختزال مركبات أخرى (ان تعطي الكترونات او ان تستقبل الكترونات، على التوالي).<br />
<br><br />
يتكون السيتوكروم C البشري من <scene name='89/898985/Amino_acids/4'>سلسلة من 104 من الاحماض الامينية</scene> . يرتبط اثنان من الأحماض الأمينية بذرة الحديد <scene name='89/898985/Bond_to_iron_18_80/2'>(الهيستيدين في الموضع 18 والمثيونين في الموضع 80)</scene> ، ويرتبط اثنان من الأحماض الأمينية تساهميًا (رباط تساهمي) من خلال ذرة الكبريت (S) بمجموعة هيم <scene name='89/898985/Bond_to_iron_14_17/2'>(السيستئين في الموضع 17 وسيستئين في الموضع 14)</scene><br />
<br><br />
لقد وجد أن هناك عدد من الأحماض الأمينية المحفوظة تطوريًا، وهي الأحماض الأمينية المهمة لربط ذرة الحديد ومجموعة هيم. <scene name='89/898985/Cxxch_motive/6'>CXXCH</scene> (السيستئين ، X ، X ، السيستئين ، الهيستيدين) حيث يمكن أن يكون X أي حمض أميني غير السيستئين. وهذه المجموعة موجودة أيضا في بروتين سيتوكروم سي البشري.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 2<br />
[[Image:Consurf key small.gif|center|300px|مفتاح الأوان لعرض الحفظ التطوري- الليلكي الداكن يعرض الاحماض الامينية المحفوظة تطوريا والمتماثلة بكائنات حية مختلفة. الأبيض يعرض الاحماض الامينية المحفوظة بشكل جزئي والازرق يعرض الاحماض الامينية الغير محفوظة تطوريا حيث ان هذه المواقع تتواجد بالعديد من الاحماض الامينية المختلفة بين كائنات حية مختلفة.<br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> الوظيفة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
في سلسلة نقل الالكترونات يقوم سيتوكروم سي بنقل الكترون بين المعقدين III و IV . المعقد III يسمى سيتوكروم bc1 والمعقد IV يسمى سيتوكروم سي أوكسيداز. نقل الالكترونات يكون ممكنا بسبب حالة تأكسد متغيرة لذرة الحديد ، حيث ان في البداية يتواجد أيون الحديد في مجموعة هيم بحالة Fe3+ الأمر الذي يمكن من استيعاب الكترون واحد وبالتالي اختزال الحديد لحالة Fe2+.<br />
<br> <br />
<br> <br />
صورة 3<br />
</p><br />
[[Image:Cytochrome C Oxydoreductase.jpg|border|center|400px|نرى في الصورة المعقدات المختلفة في سلسلة نقل الالكترونات- سيتوكروم سي هو بروتين صغير مقارنة بالمعقدات 2و3و4 ولا يستطيع المرور عبر الغشاء الخلوي. يمر البروتين عبر الغشاء الداخلي للميتوكوندريا بين المعقد 3 و4. ويمكن الملاحظة ان جميع بروتينات سلسلة نقل الالكترونات تحتوي على مجموعة هيم.]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
يلعب السيتوكروم سي أيضًا دورًا وسيطًا في عملية [https://he.wikipedia.org/wiki/%D7%90%D7%A4%D7%95%D7%A4%D7%98%D7%95%D7%96%D7%94 موت الخلايا المبرمج] وهو شكل محكوم من موت الخلايا يستخدم لقتل الخلايا في عملية النمو من اجل نمو أعضاء صحيحة وأيضا مسئول عن انتقاء خلايا الدم البيضاء ولقتل الخلايا السرطانية او المريضة . <br />
<br><br />
<br> <br />
في هذا [https://youtu.be/Od3pUsVdMhQ الفيديو] نرى دور السيتوكروم سي في موت الخلايا المبرمج. <br />
<br><br />
سيتوكروم سي الحامل للإلكترونات يتواجد داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا بواسطة رابط هيدروفوبي (كاره للماء) للفوسفوليبيد كارديوليبين (وهو جزيء هيدروفوبي يبني غشاء الميتوكوندريا).<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 4<br />
</p><br />
[[Image:Cardiolipin.jpg|border|center|280px|في الجهة اليسرى من الرسم نرى البروتين سيتوكروم سي مربوط مع الفوسوفليبيد كارديوليبين ويتواجد داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. في الجهة اليمنى نرى انقسام المعقد كارديوليبين- سيتوكروم سي نتيجة لتأكسد جزيء الكارديوليبين. سيتوكورم سي ينفصل عن الغشاء ويصبح حر ويمكنه الوصول للسيتوبلازما.]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
تتميز بداية عملية الموت الخلوي بارتفاع في نسبة الشوارد الحرة (ROS) في الميتوكوندريا. نتيجة لذلك يتم تأكسد الكارديوليبين وبالتالي فانه يتم تفكيك المعقد كارديوليبين- سيتوكروم سي. <br />
يقوم بعد ذلك السيتوكروم سي بالخروج من الغشاء الداخلي للميتوكوندريا ويمر من خلال الثقوب الموجودة في الغشاء الخارجي وصولا الى السيتوبرلازما. في السيتوبلازما يرتبط سيتوكروم سي لبروتين APAF1 وبروتين dATP وهكذا يتكون مبنى ال أبوبتوسوم وهو بروتين يربط بروتين بروكسباز 9 ويحوله الى صورته النشطة والفعالة وهكذا تتمكن الكاسباسات 3 و7 من الارتباط والعمل (caspase). هذه العملية تؤدي الى ضرر وانقسام في ال DNA الذي ينتهي بموت موجه للخلية.<br />
<br><br />
<br> <br />
صورة 5<br />
</p><br />
[[Image:Apoptosome.jpg|border|center|280px|بداية نرى اطلاق السيتوكروم سي من الميتوكوندريا الى السيتوبلازما. بعد ذلك يرتبط السيتوكورم سي مع بروتين في السيتوبلازما ويتم انتاج الأبوبتوسوم وهو مركب مهم في مراقبة عملية الموت المبرمج للخلايا حيث انه يربط بروتين بروكسباز 9 ويحوله الى صورته النشطة والفعالة وهكذا ينشط المسار الداخلي لعملية الموت الخلوي والتي تنتهي بموت موجه للخلية.]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
منع الموت المبرمج للخلية<br />
<br><br />
تشير العديد من الأبحاث ان الخلايا تستطيع ان تتحكم وتسيطر على موت الخلايا المبرمج ولذك من خلال تعديل تقوم به بعد عملية الترجمة في البروتين. البروتينات هي سلسلة طويلة من الاحماض الامينية، المرحلة الأولى في بناء البروتين هي انتاج سلسلة من الاحماض الامينية (المبنى الاولي) وبعد ذلك تمر هذه السلسلة بالعديد من المعالجات والتعديلات. واحدة من هذه التعديلات هي عملية الفسفرة. عملية الفسفرة يتم فيها إضافة مجموعة فوسفات للبروتين (أيون يحتوي على ذرة فوسفات واحدة و4 ذرات هيدروجين). تتم العملية بواسطة إنزيمات الكيناز والتي تنقل الفوسفات وهي تغيير الشكل التركيبي للبروتين بحيث تعدل من صفاته أو وظيفته. والعملية العكسية تسمى إزالة الفسفرة بواسطة انزيم الفوسفاتيز الذي يقوم بإزالة مجموعة فوسفات من البروتين. في سيتوكروم سي وجد أن هناك عدد من الأحماض الأمينية المحفوظة تطوريًا والتي تمر <scene name='89/898985/Phosphotyrosine_48_97/4'>بعملية الفسفرة</scene> ، الامر الذي يمنع من الإنتاج الزائد للشوارد الحرة (ROS)<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 6<br />
</p><br />
[[Image:Apoptosome formation.jpg|border|center|בתרשים מוצגת פעילות החלבון במצב מזורחן (מבוקר) ובמצב לא מזורחן (לא מבוקר); במצב מבוקר ניתן לראות שקצב הנשימה מווסת ולכן נוצרים מעט רדיקלים חופשיים, פוטנציאל הממברנה חיובי וציטוכרום סי קשור לממברנה הפנימית של המיטוכונדריה באמצעות קרדיוליפין. <br />
במצב לא מבוקר קצב הנשימה התאית הינו קצב מקסימאלי המייצר פוטנציאל ממברנה שלילי, יש עלייה בייצור רדיקלים חופשיים וקומפלקס קרדיוליפין+ציטוכרום סי נפרד. <br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
صورة 7<br />
</p><br />
[[Image:Cytochrome c alignment.jpg|border|center|(سيتوكروم سي المأخوذ من انسان وفأر من نسيج جسدي ونسيج جنسي)<br />
نرى في المكان 14 و17 الحمض الأميني سيستئين مربوط برباط كوفلنتي (تساهمي) مع مجموعة هيم (الحرف سي ). في أماكن الأسهم توجد مناطق محفوظة تطوريا والتي تمر بتعديل بعد عملية الترجمة من بينها المكان 48 و 97 (الحمض الأميني تيروسين-الحرف واي ).]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
وظيفة السيتوكروم سي كمانع للأكسدة (تقليل ROS) تتم بشكل مباشر عن طريق إزالة الأكسيد الفائق O2- وماء الاكسجين (H2O2) من الميتوكوندريا كما هو موضح في الرسم التالي:<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 8<br />
</p><br />
[[Image:Antioxidante.png|center|]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي هو بروتين يلعب دور مركزي في انتاج الطاقة في الخلية وأيضا له دور رئيسي بعمليات موت الخلايا المبرمج.<br />
</p><br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> وراثة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
جين CYCS الذي يشفر بروتين السيتوكروم C في البشر يتواجد على كروموسوم 7 في الحمض النووي DNA في نواة الخلية. هذا على عكس البروتينات الأخرى التي تعمل في عضية الميتوكوندريا المشفرة بواسطة الحمض النووي DNA للميتوكوندريا. حيث ان ال DNA للميتوكوندريا صغير جدًا، ويتألف من كروموسوم واحد صغير ويتضمن أقل من 17000 زوج قواعد نيتروجينية. بينما ال DNA في نواة الخلية يتضمن ثلاثة مليارات قاعدة نيتروجينية في 23 زوجًا من الكروموسومات.<br />
ومع ذلك، تحتوي كل خلية على نواة واحدة والعديد من الميتوكوندريا: في بعض الخلايا يصل عدد عضيات الميتوكوندريا إلى الآلاف، لذلك لديهم أيضًا آلاف النسخ من الحمض النووي DNA للميتوكوندريا. هناك اختلاف آخر بين أنواع الحمض النووي DNA وهو أننا نحصل على الحمض النووي DNA للميتوكوندريا من الأم فقط. تحتوي خلية الحيوانات المنوية على ميتوكوندريا، لكنها موجودة في "ذيل" الخلية، والذي يبقى بالخارج عند اتحاد الحيوان المنوي مع البويضة، يقوم الحمض النووي DNA للميتوكوندريا بتشفير13 بروتينًا ضروريًا لوظيفة الميتوكوندريا باعتبارها "محطة القوة الخلية".<br />
<br><br />
يحتوي الجينوم البشري على 49 "جينا كاذبا" للجين CYCS (وهي جينات غير فعالة ولا تمر في مرحلة النسخ ولا الترجمة). للجين توجد ثلاثة اكسونات. <br />
<br><br />
يتم تركيب البروتينات من أحماض أمينية باستخدام المعلومة المشفرة في الجينات، لدى كل بروتين تسلسلٌ خاص به من الأحماض الأمينية والذي يُحدَّد بواسطة تسلسل نوكليوتيدات الجين المشفر لذلك البروتين. تُنسخ الجينات المشفرة في الدنا إلى رنا رسول والذي يُستخدم بعدها كقالب لتخليق (ترجمة) البروتين بواسطة الريبوسوم. لا يتم التعبير عن جميع الجينات في الكائن الحي في نفس الوقت حيث ان كل خلية تعبر فقط عن جزء معين من المعلومات الموجودة بها ويتم قمع الجينات الأخرى التي ليست ضرورية لوظيفة الخلية. يتم قياس التعبير الجيني للجين CYCS حسب كمية الرنا رسول في الانسجة المختلفة حيث ان التعبير يختلف من نسيج الى اخر.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 9<br />
[[Image:Expression cytochrome c.JPG|border|center|600px|]]<br />
</p><br />
<br><br />
==<div style="text-align: right;"> أمراض </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
عند الأشخاص الذين يعانون من متلازمة نقص الصفيحات وجدت طفرة في جين CYCS والتي بها يتم استبدال الحمض الاميني <scene name='89/898985/Gly__41/3'>جلايسين في المكان ال41 ( مكان محفوظ تطوريا) </scene> بالحمض الاميني سيرين . هذه المتلازمة هي متلازمة سائدة تتميز بنقص في عدد صفائح الدم وبالتالي يزداد الاحتمال لحدوث النزيف وتقل احتمالية تخثر الدم. <br />
لقد وجدت الدراسات الحديثة أن هذه الطفرة تزيد من النشاط المؤيد لموت الخلايا المبرمج عن طريق تنشيط الكاسبيز(caspase) بشكل أكثر كفاءة من البروتين الطبيعي. لا تؤثر هذه الطفرة على وظيفة الأكسدة والاختزال للبروتين<br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> ورقة عمل للطالب </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
[https://proteopedia.org/wiki/images/d/d8/%D7%93%D7%A3_%D7%A2%D7%91%D7%95%D7%93%D7%94_%D7%9C%D7%AA%D7%9C%D7%9E%D7%99%D7%93_-_cytochrome_C.pdf דף עבודה לתלמיד]<br />
<br><br />
[https://proteopedia.org/wiki/images/0/08/%D7%A0%D7%A1%D7%A4%D7%97_FASTA_%D7%A9%D7%9C_%D7%94%D7%97%D7%9C%D7%91%D7%95%D7%A0%D7%99%D7%9D.doc נספח]<br />
</p><br />
<br><br />
==<div style="text-align: right;"> المصادر </div> ==<br />
<br><br />
[https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/compound/444125#section=3D-Conformer pubchem]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/NP_061820.1 ncbi - cytochrome c - homo sapiens]<br />
<br><br />
[https://ashpublications.org/blood/article/132/Supplement%201/3758/265249/A-Novel-Cycs-Missense-Mutation-in-the-Helix-of-the A Novel Cycs Missense Mutation in the α-Helix of the Cycs C-Terminal Domain Causes Non-Syndromic Thrombocytopenia]<br />
<br><br />
[https://davidson.weizmann.ac.il/online/sciencenews/%D7%9C%D7%A8%D7%90%D7%95%D7%AA-%D7%90%D7%AA-%D7%94%D7%9E%D7%95%D7%9C%D7%A7%D7%95%D7%9C%D7%95%D7%AA-%D7%A0%D7%98%D7%A2%D7%A0%D7%95%D7%AA לראות את המולקולות נטענות - מכון דוידסון]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/browser/gene/?id=54205 ncbi cics gene]<br />
<br><br />
[https://www.rcsb.org/structure/1gu2 pdb - 1GU2]<br />
<br><br />
[https://www.rcsb.org/structure/1AKK pdb - 1AKK]<br />
<br><br />
[https://chem.libretexts.org/Courses/Saint_Marys_College_Notre_Dame_IN/CHEM_342%3A_Bio-inorganic_Chemistry/Readings/Metals_in_Biological_Systems_(Saint_Mary's_College)/Cytochrome_C Cytochrome C. (2019, June 5).]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/54205 ncbi - CYCS cytochrome c - Homo sapiens]<br />
<br><br />
[https://www.nature.com/articles/nrm2434 nature - Cytochrome c: functions beyond respiration]</div>Fatima M Hameedhttps://proteopedia.org/index.php?title=Cytochrome_C_(arabic)&diff=3554829Cytochrome C (arabic)2022-05-01T09:50:49Z<p>Fatima M Hameed: </p>
<hr />
<div>==<center>'''سيتوكروم سي البشري '''</center>==<br />
<p dir='rtl'><br />
<br />
.سيتوكروم سي عبارة عن زلال صغير (الوزن الجزيئي حوالي 1200 دالتون ) وهو بروتين محفوظ للغاية عبر مجموعة من الأنواع ، موجود في النباتات والحيوانات والعديد من الكائنات أحادية الخلية<br />
<br />
يرتبط هذا البروتين بمجموعة [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D9%87%D9%8A%D9%85 هيم] وبمركزها توجد ذرة حديد، وهو بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات وبعملية الاستموات (موت الخلايا المبرمج)<br />
</p><br />
<StructureSection load='1J3S' size='340' side='left' caption=' سيتوكروم سي البشري (PDB code [[1j3s]])' scene='89/898985/Cytochrome_c_basic/19'><br />
==<div style="text-align: right;"> المقدمة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي عبارة عن بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات، والتي هي العملية الأخيرة في عملية <br />
[https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D9%86%D9%81%D8%B3_%D8%AE%D9%84%D9%88%D9%8A التنفس الخلوي]<br />
. عملية التنفس الخلوي تقسم الى 3 أقسام مركزية: [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D8%AD%D9%84%D9%84_%D8%A7%D9%84%D8%AC%D9%84%D9%88%D9%83%D9%88%D8%B2 جليكوليزا ] (التي تحدث في السيتوبلازما)، [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AF%D9%88%D8%B1%D8%A9_%D8%AD%D9%85%D8%B6_%D8%A7%D9%84%D8%B3%D8%AA%D8%B1%D9%8A%D9%83 دورة كريبس] (تحدث في المساحة الداخلية للميتوكوندريا) وسلسلة نقل الالكترونات التي تحدث داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. <br />
<br />
.بنقل الالكترونات لجزيئات أخرى ملامسة لها، وهكذا يتم تشكيل سلسلة من البروتينات حاملة الإلكترونات FADH2 و NADH في سلسلة نقل الالكترونات تقوم الجزيئات المختزلة بدورة كريبس مثل<br />
.يتم استيعاب الإلكترونات في نهاية الأمر بواسطة الأكسجين ويؤدي هذا الاتحاد الى انتاج الماء<br />
نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة ، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا<br />
بواسطة منحدر التركيز الناتج في أيونات الهيدروجين يتم دفع عمل البروتين ATP سنتاز من أجل انتاج ATP. [https://davidson.weizmann.ac.il/ar/online/maagarmada/atp-%D8%B3%D9%8A%D9%86%D8%AB%D8%A7%D8%B2-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AD%D8%B1%D9%83-%D8%A7%D9%84%D8%AC%D8%B2%D9%8A%D8%A6%D9%8A%D9%91-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AA%D9%83%D8%A7%D9%85%D9%84 ATP] هو جزيء غنيّ بالطّاقة، يحتوي على مجموعة من الأدينوساين وثلاث مجموعات من الفوسفور المرتبطة به. يؤدّي التحلّل المائيّ لمجموعة الفوسفور الثالثة إلى إطلاق طاقة تسمح للجسم بتنشيط العديد من الإنزيمات والعمليات الموجودة فيه. يقوم الجسم بإنتاج الATP في الميتوكوندريا في جميع الأوقات وذلك من الاجل الحفاظ على نسبة عالية من الATP داخل الخلية وبالتالي فان نقل الالكترونات وإنتاج منحدر تراكيز لأيونات الهيدروجين تعتبر عملية رئيسية من اجل وجود سليم للخلية.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة1 (قوموا بالوقف على الصورة بالفأرة من أجل اظهار الشرح)<br />
</p><br />
[[Image:Electron_transport_chain_cytochrome_c.jpg|border|center|600px|نرى في الصورة سلسلة نقل الالكترونات – نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا. هذا النقل فعال (يحتاج الى طاقة) وهو عكس منحدر التركيز. تراكم ايونات الهيدروجين في الفراغ بين غشائي الخلية يمكن من دخول الهيدروجين بشكل غير فعال من اجل انتاج جزيء ATP .]]<br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
هنا توجد 3 مقاطع فيديو:<br />
<br><br />
[https://youtu.be/3YTPOIcj6lw סרטון] حول عملية نقل الإلكترون في الميتوكوندريا.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/LQmTKxI4Wn4 סרטון] فيديو يشرح العملية من زاوية أوسع.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/YZsJ-8TenYw סרטון] فيديو عن انحدار التراكيز مع التركيز على ATP سينثاز.<br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> المبنى الجزيئي </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي ينتمي لعائلة البروتين باسم all-α proteins والتي تتميز بوجود <scene name='89/898985/Secondary_structure/4'>المبنى الثنائي</scene> لولب ألفا. كل بروتين ينتمي لهذه المجموعة يحتوي أيضا على مجموعة هيم واحدة أو أكثر.<br />
<br><br />
<scene name='89/898985/Hem_c/2'>HEME C</scene> – مجموعة هيم عبارة عن مركب عضوي يتم انتاجه في النخاع العظمي والكبد. والهيم هو جزء من البروتينات التي تقوم بوظائف متعددة في الجسم. ان فعالية مجموعة هيم تنبع من قدرة ذرة الحديد على ربط جزيئات صغيرة (مثل الاكسجين) وأيضا على قدرتها لأكسدة واختزال مركبات أخرى (ان تعطي الكترونات او ان تستقبل الكترونات، على التوالي).<br />
<br><br />
يتكون السيتوكروم C البشري من <scene name='89/898985/Amino_acids/4'>سلسلة من 104 من الاحماض الامينية</scene> . يرتبط اثنان من الأحماض الأمينية بذرة الحديد <scene name='89/898985/Bond_to_iron_18_80/2'>(الهيستيدين في الموضع 18 والمثيونين في الموضع 80)</scene> ، ويرتبط اثنان من الأحماض الأمينية تساهميًا (رباط تساهمي) من خلال ذرة الكبريت (S) بمجموعة هيم <scene name='89/898985/Bond_to_iron_14_17/2'>(السيستئين في الموضع 17 وسيستئين في الموضع 14)</scene><br />
<br><br />
لقد وجد أن هناك عدد من الأحماض الأمينية المحفوظة تطوريًا، وهي الأحماض الأمينية المهمة لربط ذرة الحديد ومجموعة هيم. <scene name='89/898985/Cxxch_motive/6'>CXXCH</scene> (السيستئين ، X ، X ، السيستئين ، الهيستيدين) حيث يمكن أن يكون X أي حمض أميني غير السيستئين. وهذه المجموعة موجودة أيضا في بروتين سيتوكروم سي البشري.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 2<br />
[[Image:Consurf key small.gif|center|300px|مفتاح الأوان لعرض الحفظ التطوري- الليلكي الداكن يعرض الاحماض الامينية المحفوظة تطوريا والمتماثلة بكائنات حية مختلفة. الأبيض يعرض الاحماض الامينية المحفوظة بشكل جزئي والازرق يعرض الاحماض الامينية الغير محفوظة تطوريا حيث ان هذه المواقع تتواجد بالعديد من الاحماض الامينية المختلفة بين كائنات حية مختلفة.<br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> الوظيفة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
في سلسلة نقل الالكترونات يقوم سيتوكروم سي بنقل الكترون بين المعقدين III و IV . المعقد III يسمى سيتوكروم bc1 والمعقد IV يسمى سيتوكروم سي أوكسيداز. نقل الالكترونات يكون ممكنا بسبب حالة تأكسد متغيرة لذرة الحديد ، حيث ان في البداية يتواجد أيون الحديد في مجموعة هيم بحالة Fe3+ الأمر الذي يمكن من استيعاب الكترون واحد وبالتالي اختزال الحديد لحالة Fe2+.<br />
<br> <br />
<br> <br />
صورة 3<br />
</p><br />
[[Image:Cytochrome C Oxydoreductase.jpg|border|center|400px|نرى في الصورة المعقدات المختلفة في سلسلة نقل الالكترونات- سيتوكروم سي هو بروتين صغير مقارنة بالمعقدات 2و3و4 ولا يستطيع المرور عبر الغشاء الخلوي. يمر البروتين عبر الغشاء الداخلي للميتوكوندريا بين المعقد 3 و4. ويمكن الملاحظة ان جميع بروتينات سلسلة نقل الالكترونات تحتوي على مجموعة هيم.]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
يلعب السيتوكروم سي أيضًا دورًا وسيطًا في عملية [https://he.wikipedia.org/wiki/%D7%90%D7%A4%D7%95%D7%A4%D7%98%D7%95%D7%96%D7%94 موت الخلايا المبرمج] وهو شكل محكوم من موت الخلايا يستخدم لقتل الخلايا في عملية النمو من اجل نمو أعضاء صحيحة وأيضا مسئول عن انتقاء خلايا الدم البيضاء ولقتل الخلايا السرطانية او المريضة . <br />
<br><br />
<br> <br />
في هذا [https://youtu.be/Od3pUsVdMhQ الفيديو] نرى دور السيتوكروم سي في موت الخلايا المبرمج. <br />
<br><br />
سيتوكروم سي الحامل للإلكترونات يتواجد داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا بواسطة رابط هيدروفوبي (كاره للماء) للفوسفوليبيد كارديوليبين (وهو جزيء هيدروفوبي يبني غشاء الميتوكوندريا).<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 4<br />
</p><br />
[[Image:Cardiolipin.jpg|border|center|280px|في الجهة اليسرى من الرسم نرى البروتين سيتوكروم سي مربوط مع الفوسوفليبيد كارديوليبين ويتواجد داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. في الجهة اليمنى نرى انقسام المعقد كارديوليبين- سيتوكروم سي نتيجة لتأكسد جزيء الكارديوليبين. سيتوكورم سي ينفصل عن الغشاء ويصبح حر ويمكنه الوصول للسيتوبلازما.]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
تتميز بداية عملية الموت الخلوي بارتفاع في نسبة الشوارد الحرة (ROS) في الميتوكوندريا. نتيجة لذلك يتم تأكسد الكارديوليبين وبالتالي فانه يتم تفكيك المعقد كارديوليبين- سيتوكروم سي. <br />
يقوم بعد ذلك السيتوكروم سي بالخروج من الغشاء الداخلي للميتوكوندريا ويمر من خلال الثقوب الموجودة في الغشاء الخارجي وصولا الى السيتوبرلازما. في السيتوبلازما يرتبط سيتوكروم سي لبروتين APAF1 وبروتين dATP وهكذا يتكون مبنى ال أبوبتوسوم وهو بروتين يربط بروتين بروكسباز 9 ويحوله الى صورته النشطة والفعالة وهكذا تتمكن الكاسباسات 3 و7 من الارتباط والعمل (caspase). هذه العملية تؤدي الى ضرر وانقسام في ال DNA الذي ينتهي بموت موجه للخلية.<br />
<br><br />
<br> <br />
صورة 5<br />
</p><br />
[[Image:Apoptosome.jpg|border|center|280px|بداية نرى اطلاق السيتوكروم سي من الميتوكوندريا الى السيتوبلازما. بعد ذلك يرتبط السيتوكورم سي مع بروتين في السيتوبلازما ويتم انتاج الأبوبتوسوم وهو مركب مهم في مراقبة عملية الموت المبرمج للخلايا حيث انه يربط بروتين بروكسباز 9 ويحوله الى صورته النشطة والفعالة وهكذا ينشط المسار الداخلي لعملية الموت الخلوي والتي تنتهي بموت موجه للخلية.]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
منع الموت المبرمج للخلية<br />
<br><br />
تشير العديد من الأبحاث ان الخلايا تستطيع ان تتحكم وتسيطر على موت الخلايا المبرمج ولذك من خلال تعديل تقوم به بعد عملية الترجمة في البروتين. البروتينات هي سلسلة طويلة من الاحماض الامينية، المرحلة الأولى في بناء البروتين هي انتاج سلسلة من الاحماض الامينية (المبنى الاولي) وبعد ذلك تمر هذه السلسلة بالعديد من المعالجات والتعديلات. واحدة من هذه التعديلات هي عملية الفسفرة. عملية الفسفرة يتم فيها إضافة مجموعة فوسفات للبروتين (أيون يحتوي على ذرة فوسفات واحدة و4 ذرات هيدروجين). تتم العملية بواسطة إنزيمات الكيناز والتي تنقل الفوسفات وهي تغيير الشكل التركيبي للبروتين بحيث تعدل من صفاته أو وظيفته. والعملية العكسية تسمى إزالة الفسفرة بواسطة انزيم الفوسفاتيز الذي يقوم بإزالة مجموعة فوسفات من البروتين. في سيتوكروم سي وجد أن هناك عدد من الأحماض الأمينية المحفوظة تطوريًا والتي تمر <scene name='89/898985/Phosphotyrosine_48_97/4'>بعملية الفسفرة</scene> ، الامر الذي يمنع من الإنتاج الزائد للشوارد الحرة (ROS)<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 6<br />
</p><br />
[[Image:Apoptosome formation.jpg|border|center|בתרשים מוצגת פעילות החלבון במצב מזורחן (מבוקר) ובמצב לא מזורחן (לא מבוקר); במצב מבוקר ניתן לראות שקצב הנשימה מווסת ולכן נוצרים מעט רדיקלים חופשיים, פוטנציאל הממברנה חיובי וציטוכרום סי קשור לממברנה הפנימית של המיטוכונדריה באמצעות קרדיוליפין. <br />
במצב לא מבוקר קצב הנשימה התאית הינו קצב מקסימאלי המייצר פוטנציאל ממברנה שלילי, יש עלייה בייצור רדיקלים חופשיים וקומפלקס קרדיוליפין+ציטוכרום סי נפרד. <br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
صورة 7<br />
</p><br />
[[Image:Cytochrome c alignment.jpg|border|center|(سيتوكروم سي المأخوذ من انسان وفأر من نسيج جسدي ونسيج جنسي). نرى في المكان 14 و17 الحمض الأميني سيستئين (الحرف C) مربوط برباط كوفلنتي (تساهمي) مع مجموعة هيم. في أماكن الأسهم توجد مناطق محفوظة تطوريا والتي تمر بتعديل بعد عملية الترجمة من بينها المكان 48 و 97 (الحمض الأميني تيروسين المرموز له بالحرف Y). ]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
وظيفة السيتوكروم سي كمانع للأكسدة (تقليل ROS) تتم بشكل مباشر عن طريق إزالة الأكسيد الفائق O2- وماء الاكسجين (H2O2) من الميتوكوندريا كما هو موضح في الرسم التالي:<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 8<br />
</p><br />
[[Image:Antioxidante.png|center|]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي هو بروتين يلعب دور مركزي في انتاج الطاقة في الخلية وأيضا له دور رئيسي بعمليات موت الخلايا المبرمج.<br />
</p><br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> وراثة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
جين CYCS الذي يشفر بروتين السيتوكروم C في البشر يتواجد على كروموسوم 7 في الحمض النووي DNA في نواة الخلية. هذا على عكس البروتينات الأخرى التي تعمل في عضية الميتوكوندريا المشفرة بواسطة الحمض النووي DNA للميتوكوندريا. حيث ان ال DNA للميتوكوندريا صغير جدًا، ويتألف من كروموسوم واحد صغير ويتضمن أقل من 17000 زوج قواعد نيتروجينية. بينما ال DNA في نواة الخلية يتضمن ثلاثة مليارات قاعدة نيتروجينية في 23 زوجًا من الكروموسومات.<br />
ومع ذلك، تحتوي كل خلية على نواة واحدة والعديد من الميتوكوندريا: في بعض الخلايا يصل عدد عضيات الميتوكوندريا إلى الآلاف، لذلك لديهم أيضًا آلاف النسخ من الحمض النووي DNA للميتوكوندريا. هناك اختلاف آخر بين أنواع الحمض النووي DNA وهو أننا نحصل على الحمض النووي DNA للميتوكوندريا من الأم فقط. تحتوي خلية الحيوانات المنوية على ميتوكوندريا، لكنها موجودة في "ذيل" الخلية، والذي يبقى بالخارج عند اتحاد الحيوان المنوي مع البويضة، يقوم الحمض النووي DNA للميتوكوندريا بتشفير13 بروتينًا ضروريًا لوظيفة الميتوكوندريا باعتبارها "محطة القوة الخلية".<br />
<br><br />
يحتوي الجينوم البشري على 49 "جينا كاذبا" للجين CYCS (وهي جينات غير فعالة ولا تمر في مرحلة النسخ ولا الترجمة). للجين توجد ثلاثة اكسونات. <br />
<br><br />
يتم تركيب البروتينات من أحماض أمينية باستخدام المعلومة المشفرة في الجينات، لدى كل بروتين تسلسلٌ خاص به من الأحماض الأمينية والذي يُحدَّد بواسطة تسلسل نوكليوتيدات الجين المشفر لذلك البروتين. تُنسخ الجينات المشفرة في الدنا إلى رنا رسول والذي يُستخدم بعدها كقالب لتخليق (ترجمة) البروتين بواسطة الريبوسوم. لا يتم التعبير عن جميع الجينات في الكائن الحي في نفس الوقت حيث ان كل خلية تعبر فقط عن جزء معين من المعلومات الموجودة بها ويتم قمع الجينات الأخرى التي ليست ضرورية لوظيفة الخلية. يتم قياس التعبير الجيني للجين CYCS حسب كمية الرنا رسول في الانسجة المختلفة حيث ان التعبير يختلف من نسيج الى اخر.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 9<br />
[[Image:Expression cytochrome c.JPG|border|center|600px|]]<br />
</p><br />
<br><br />
==<div style="text-align: right;"> أمراض </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
عند الأشخاص الذين يعانون من متلازمة نقص الصفيحات وجدت طفرة في جين CYCS والتي بها يتم استبدال الحمض الاميني <scene name='89/898985/Gly__41/3'>جلايسين في المكان ال41 ( مكان محفوظ تطوريا) </scene> بالحمض الاميني سيرين . هذه المتلازمة هي متلازمة سائدة تتميز بنقص في عدد صفائح الدم وبالتالي يزداد الاحتمال لحدوث النزيف وتقل احتمالية تخثر الدم. <br />
لقد وجدت الدراسات الحديثة أن هذه الطفرة تزيد من النشاط المؤيد لموت الخلايا المبرمج عن طريق تنشيط الكاسبيز(caspase) بشكل أكثر كفاءة من البروتين الطبيعي. لا تؤثر هذه الطفرة على وظيفة الأكسدة والاختزال للبروتين<br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> ورقة عمل للطالب </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
[https://proteopedia.org/wiki/images/d/d8/%D7%93%D7%A3_%D7%A2%D7%91%D7%95%D7%93%D7%94_%D7%9C%D7%AA%D7%9C%D7%9E%D7%99%D7%93_-_cytochrome_C.pdf דף עבודה לתלמיד]<br />
<br><br />
[https://proteopedia.org/wiki/images/0/08/%D7%A0%D7%A1%D7%A4%D7%97_FASTA_%D7%A9%D7%9C_%D7%94%D7%97%D7%9C%D7%91%D7%95%D7%A0%D7%99%D7%9D.doc נספח]<br />
</p><br />
<br><br />
==<div style="text-align: right;"> المصادر </div> ==<br />
<br><br />
[https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/compound/444125#section=3D-Conformer pubchem]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/NP_061820.1 ncbi - cytochrome c - homo sapiens]<br />
<br><br />
[https://ashpublications.org/blood/article/132/Supplement%201/3758/265249/A-Novel-Cycs-Missense-Mutation-in-the-Helix-of-the A Novel Cycs Missense Mutation in the α-Helix of the Cycs C-Terminal Domain Causes Non-Syndromic Thrombocytopenia]<br />
<br><br />
[https://davidson.weizmann.ac.il/online/sciencenews/%D7%9C%D7%A8%D7%90%D7%95%D7%AA-%D7%90%D7%AA-%D7%94%D7%9E%D7%95%D7%9C%D7%A7%D7%95%D7%9C%D7%95%D7%AA-%D7%A0%D7%98%D7%A2%D7%A0%D7%95%D7%AA לראות את המולקולות נטענות - מכון דוידסון]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/browser/gene/?id=54205 ncbi cics gene]<br />
<br><br />
[https://www.rcsb.org/structure/1gu2 pdb - 1GU2]<br />
<br><br />
[https://www.rcsb.org/structure/1AKK pdb - 1AKK]<br />
<br><br />
[https://chem.libretexts.org/Courses/Saint_Marys_College_Notre_Dame_IN/CHEM_342%3A_Bio-inorganic_Chemistry/Readings/Metals_in_Biological_Systems_(Saint_Mary's_College)/Cytochrome_C Cytochrome C. (2019, June 5).]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/54205 ncbi - CYCS cytochrome c - Homo sapiens]<br />
<br><br />
[https://www.nature.com/articles/nrm2434 nature - Cytochrome c: functions beyond respiration]</div>Fatima M Hameedhttps://proteopedia.org/index.php?title=Cytochrome_C_(arabic)&diff=3554820Cytochrome C (arabic)2022-05-01T09:18:20Z<p>Fatima M Hameed: </p>
<hr />
<div>==<center>'''سيتوكروم سي البشري '''</center>==<br />
<p dir='rtl'><br />
<br />
.سيتوكروم سي عبارة عن زلال صغير (الوزن الجزيئي حوالي 1200 دالتون ) وهو بروتين محفوظ للغاية عبر مجموعة من الأنواع ، موجود في النباتات والحيوانات والعديد من الكائنات أحادية الخلية<br />
<br />
يرتبط هذا البروتين بمجموعة [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D9%87%D9%8A%D9%85 هيم] وبمركزها توجد ذرة حديد، وهو بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات وبعملية الاستموات (موت الخلايا المبرمج)<br />
</p><br />
<StructureSection load='1J3S' size='340' side='left' caption=' سيتوكروم سي البشري (PDB code [[1j3s]])' scene='89/898985/Cytochrome_c_basic/19'><br />
==<div style="text-align: right;"> المقدمة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي عبارة عن بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات، والتي هي العملية الأخيرة في عملية <br />
[https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D9%86%D9%81%D8%B3_%D8%AE%D9%84%D9%88%D9%8A التنفس الخلوي]<br />
. عملية التنفس الخلوي تقسم الى 3 أقسام مركزية: [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D8%AD%D9%84%D9%84_%D8%A7%D9%84%D8%AC%D9%84%D9%88%D9%83%D9%88%D8%B2 جليكوليزا ] (التي تحدث في السيتوبلازما)، [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AF%D9%88%D8%B1%D8%A9_%D8%AD%D9%85%D8%B6_%D8%A7%D9%84%D8%B3%D8%AA%D8%B1%D9%8A%D9%83 دورة كريبس] (تحدث في المساحة الداخلية للميتوكوندريا) وسلسلة نقل الالكترونات التي تحدث داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. <br />
<br />
.بنقل الالكترونات لجزيئات أخرى ملامسة لها، وهكذا يتم تشكيل سلسلة من البروتينات حاملة الإلكترونات FADH2 و NADH في سلسلة نقل الالكترونات تقوم الجزيئات المختزلة بدورة كريبس مثل<br />
.يتم استيعاب الإلكترونات في نهاية الأمر بواسطة الأكسجين ويؤدي هذا الاتحاد الى انتاج الماء<br />
نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة ، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا<br />
بواسطة منحدر التركيز الناتج في أيونات الهيدروجين يتم دفع عمل البروتين ATP سنتاز من أجل انتاج ATP. [https://davidson.weizmann.ac.il/ar/online/maagarmada/atp-%D8%B3%D9%8A%D9%86%D8%AB%D8%A7%D8%B2-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AD%D8%B1%D9%83-%D8%A7%D9%84%D8%AC%D8%B2%D9%8A%D8%A6%D9%8A%D9%91-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AA%D9%83%D8%A7%D9%85%D9%84 ATP] هو جزيء غنيّ بالطّاقة، يحتوي على مجموعة من الأدينوساين وثلاث مجموعات من الفوسفور المرتبطة به. يؤدّي التحلّل المائيّ لمجموعة الفوسفور الثالثة إلى إطلاق طاقة تسمح للجسم بتنشيط العديد من الإنزيمات والعمليات الموجودة فيه. يقوم الجسم بإنتاج الATP في الميتوكوندريا في جميع الأوقات وذلك من الاجل الحفاظ على نسبة عالية من الATP داخل الخلية وبالتالي فان نقل الالكترونات وإنتاج منحدر تراكيز لأيونات الهيدروجين تعتبر عملية رئيسية من اجل وجود سليم للخلية.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة1 (قوموا بالوقف على الصورة بالفأرة من أجل اظهار الشرح)<br />
</p><br />
[[Image:Electron_transport_chain_cytochrome_c.jpg|border|center|600px|نرى في الصورة سلسلة نقل الالكترونات – نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا. هذا النقل فعال (يحتاج الى طاقة) وهو عكس منحدر التركيز. تراكم ايونات الهيدروجين في الفراغ بين غشائي الخلية يمكن من دخول الهيدروجين بشكل غير فعال من اجل انتاج جزيء ATP .]]<br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
هنا توجد 3 مقاطع فيديو:<br />
<br><br />
[https://youtu.be/3YTPOIcj6lw סרטון] حول عملية نقل الإلكترون في الميتوكوندريا.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/LQmTKxI4Wn4 סרטון] فيديو يشرح العملية من زاوية أوسع.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/YZsJ-8TenYw סרטון] فيديو عن انحدار التراكيز مع التركيز على ATP سينثاز.<br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> المبنى الجزيئي </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي ينتمي لعائلة البروتين باسم all-α proteins والتي تتميز بوجود <scene name='89/898985/Secondary_structure/4'>المبنى الثنائي</scene> لولب ألفا. كل بروتين ينتمي لهذه المجموعة يحتوي أيضا على مجموعة هيم واحدة أو أكثر.<br />
<br><br />
<scene name='89/898985/Hem_c/2'>HEME C</scene> – مجموعة هيم عبارة عن مركب عضوي يتم انتاجه في النخاع العظمي والكبد. والهيم هو جزء من البروتينات التي تقوم بوظائف متعددة في الجسم. ان فعالية مجموعة هيم تنبع من قدرة ذرة الحديد على ربط جزيئات صغيرة (مثل الاكسجين) وأيضا على قدرتها لأكسدة واختزال مركبات أخرى (ان تعطي الكترونات او ان تستقبل الكترونات، على التوالي).<br />
<br><br />
يتكون السيتوكروم C البشري من <scene name='89/898985/Amino_acids/4'>سلسلة من 104 من الاحماض الامينية</scene> . يرتبط اثنان من الأحماض الأمينية بذرة الحديد <scene name='89/898985/Bond_to_iron_18_80/2'>(الهيستيدين في الموضع 18 والمثيونين في الموضع 80)</scene> ، ويرتبط اثنان من الأحماض الأمينية تساهميًا (رباط تساهمي) من خلال ذرة الكبريت (S) بمجموعة هيم <scene name='89/898985/Bond_to_iron_14_17/2'>(السيستئين في الموضع 17 وسيستئين في الموضع 14)</scene><br />
<br><br />
لقد وجد أن هناك عدد من الأحماض الأمينية المحفوظة تطوريًا، وهي الأحماض الأمينية المهمة لربط ذرة الحديد ومجموعة هيم. <scene name='89/898985/Cxxch_motive/6'>CXXCH</scene> (السيستئين ، X ، X ، السيستئين ، الهيستيدين) حيث يمكن أن يكون X أي حمض أميني غير السيستئين. وهذه المجموعة موجودة أيضا في بروتين سيتوكروم سي البشري.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 2<br />
[[Image:Consurf key small.gif|center|300px|مفتاح الأوان لعرض الحفظ التطوري- الليلكي الداكن يعرض الاحماض الامينية المحفوظة تطوريا والمتماثلة بكائنات حية مختلفة. الأبيض يعرض الاحماض الامينية المحفوظة بشكل جزئي والازرق يعرض الاحماض الامينية الغير محفوظة تطوريا حيث ان هذه المواقع تتواجد بالعديد من الاحماض الامينية المختلفة بين كائنات حية مختلفة.<br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> الوظيفة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
في سلسلة نقل الالكترونات يقوم سيتوكروم سي بنقل الكترون بين المعقدين III و IV . المعقد III يسمى سيتوكروم bc1 والمعقد IV يسمى سيتوكروم سي أوكسيداز. نقل الالكترونات يكون ممكنا بسبب حالة تأكسد متغيرة لذرة الحديد ، حيث ان في البداية يتواجد أيون الحديد في مجموعة هيم بحالة Fe3+ الأمر الذي يمكن من استيعاب الكترون واحد وبالتالي اختزال الحديد لحالة Fe2+.<br />
<br> <br />
<br> <br />
صورة 3<br />
</p><br />
[[Image:Cytochrome C Oxydoreductase.jpg|border|center|400px|نرى في الصورة المعقدات المختلفة في سلسلة نقل الالكترونات- سيتوكروم سي هو بروتين صغير مقارنة بالمعقدات 2و3و4 ولا يستطيع المرور عبر الغشاء الخلوي. يمر البروتين عبر الغشاء الداخلي للميتوكوندريا بين المعقد 3 و4. ويمكن الملاحظة ان جميع بروتينات سلسلة نقل الالكترونات تحتوي على مجموعة هيم.]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
يلعب السيتوكروم سي أيضًا دورًا وسيطًا في عملية [https://he.wikipedia.org/wiki/%D7%90%D7%A4%D7%95%D7%A4%D7%98%D7%95%D7%96%D7%94 موت الخلايا المبرمج] وهو شكل محكوم من موت الخلايا يستخدم لقتل الخلايا في عملية النمو من اجل نمو أعضاء صحيحة وأيضا مسئول عن انتقاء خلايا الدم البيضاء ولقتل الخلايا السرطانية او المريضة . <br />
<br><br />
<br> <br />
في هذا [https://youtu.be/Od3pUsVdMhQ الفيديو] نرى دور السيتوكروم سي في موت الخلايا المبرمج. <br />
<br><br />
سيتوكروم سي الحامل للإلكترونات يتواجد داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا بواسطة رابط هيدروفوبي (كاره للماء) للفوسفوليبيد كارديوليبين (وهو جزيء هيدروفوبي يبني غشاء الميتوكوندريا).<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 4<br />
</p><br />
[[Image:Cardiolipin.jpg|border|center|280px|في الجهة اليسرى من الرسم نرى البروتين سيتوكروم سي مربوط مع الفوسوفليبيد كارديوليبين ويتواجد داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. في الجهة اليمنى نرى انقسام المعقد كارديوليبين- سيتوكروم سي نتيجة لتأكسد جزيء الكارديوليبين. سيتوكورم سي ينفصل عن الغشاء ويصبح حر ويمكنه الوصول للسيتوبلازما.]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
تتميز بداية عملية الموت الخلوي بارتفاع في نسبة الشوارد الحرة (ROS) في الميتوكوندريا. نتيجة لذلك يتم تأكسد الكارديوليبين وبالتالي فانه يتم تفكيك المعقد كارديوليبين- سيتوكروم سي. <br />
يقوم بعد ذلك السيتوكروم سي بالخروج من الغشاء الداخلي للميتوكوندريا ويمر من خلال الثقوب الموجودة في الغشاء الخارجي وصولا الى السيتوبرلازما. في السيتوبلازما يرتبط سيتوكروم سي لبروتين APAF1 وبروتين dATP وهكذا يتكون مبنى ال أبوبتوسوم وهو بروتين يربط بروتين بروكسباز 9 ويحوله الى صورته النشطة والفعالة وهكذا تتمكن الكاسباسات 3 و7 من الارتباط والعمل (caspase). هذه العملية تؤدي الى ضرر وانقسام في ال DNA الذي ينتهي بموت موجه للخلية.<br />
<br><br />
<br> <br />
صورة 5<br />
</p><br />
[[Image:Apoptosome.jpg|border|center|280px|بداية نرى اطلاق السيتوكروم سي من الميتوكوندريا الى السيتوبلازما. بعد ذلك يرتبط السيتوكورم سي مع بروتين في السيتوبلازما ويتم انتاج الأبوبتوسوم وهو مركب مهم في مراقبة عملية الموت المبرمج للخلايا حيث انه يربط بروتين بروكسباز 9 ويحوله الى صورته النشطة والفعالة وهكذا ينشط المسار الداخلي لعملية الموت الخلوي والتي تنتهي بموت موجه للخلية.]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
منع الموت المبرمج للخلية<br />
<br><br />
تشير العديد من الأبحاث ان الخلايا تستطيع ان تتحكم وتسيطر على موت الخلايا المبرمج ولذك من خلال تعديل تقوم به بعد عملية الترجمة في البروتين. البروتينات هي سلسلة طويلة من الاحماض الامينية، المرحلة الأولى في بناء البروتين هي انتاج سلسلة من الاحماض الامينية (المبنى الاولي) وبعد ذلك تمر هذه السلسلة بالعديد من المعالجات والتعديلات. واحدة من هذه التعديلات هي عملية الفسفرة. عملية الفسفرة يتم فيها إضافة مجموعة فوسفات للبروتين (أيون يحتوي على ذرة فوسفات واحدة و4 ذرات هيدروجين). تتم العملية بواسطة إنزيمات الكيناز والتي تنقل الفوسفات وهي تغيير الشكل التركيبي للبروتين بحيث تعدل من صفاته أو وظيفته. والعملية العكسية تسمى إزالة الفسفرة بواسطة انزيم الفوسفاتيز الذي يقوم بإزالة مجموعة فوسفات من البروتين. في سيتوكروم سي وجد أن هناك عدد من الأحماض الأمينية المحفوظة تطوريًا والتي تمر <scene name='89/898985/Phosphotyrosine_48_97/4'>بعملية الفسفرة</scene> ، الامر الذي يمنع من الإنتاج الزائد للشوارد الحرة (ROS)<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 6<br />
</p><br />
[[Image:Apoptosome formation.jpg|border|center|בתרשים מוצגת פעילות החלבון במצב מזורחן (מבוקר) ובמצב לא מזורחן (לא מבוקר); במצב מבוקר ניתן לראות שקצב הנשימה מווסת ולכן נוצרים מעט רדיקלים חופשיים, פוטנציאל הממברנה חיובי וציטוכרום סי קשור לממברנה הפנימית של המיטוכונדריה באמצעות קרדיוליפין. <br />
במצב לא מבוקר קצב הנשימה התאית הינו קצב מקסימאלי המייצר פוטנציאל ממברנה שלילי, יש עלייה בייצור רדיקלים חופשיים וקומפלקס קרדיוליפין+ציטוכרום סי נפרד. <br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
صورة 7<br />
</p><br />
[[Image:Cytochrome c alignment.jpg|border|center|עימוד ציטוכרום סי מאדם ומעכבר (מרקמה סומטית ומרקמת תאי מין) מאפשר לזהות עמדות שמורות אבולוציונית. ניתן לראות את עמדות 14 ו- 17 הקושרות קוולנטית את קבוצת ההם (חומצות אמינו ציסטאין המסומנות באות הגדולה סי). במיקום החיצים נמצאות עמדות שמורות העוברות מודיפיקציות לאחר תרגום, ביניהן גם עמדות 48 ו- 97 (חומצה אמינית טירוזין המסומנת באות וואי) המוזכרות בערך זה. ]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
وظيفة السيتوكروم سي كمانع للأكسدة (تقليل ROS) تتم بشكل مباشر عن طريق إزالة الأكسيد الفائق O2- وماء الاكسجين (H2O2) من الميتوكوندريا كما هو موضح في الرسم التالي:<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 8<br />
</p><br />
[[Image:Antioxidante.png|center|]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي هو بروتين يلعب دور مركزي في انتاج الطاقة في الخلية وأيضا له دور رئيسي بعمليات موت الخلايا المبرمج.<br />
</p><br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> وراثة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
جين CYCS الذي يشفر بروتين السيتوكروم C في البشر يتواجد على كروموسوم 7 في الحمض النووي DNA في نواة الخلية. هذا على عكس البروتينات الأخرى التي تعمل في عضية الميتوكوندريا المشفرة بواسطة الحمض النووي DNA للميتوكوندريا. حيث ان ال DNA للميتوكوندريا صغير جدًا، ويتألف من كروموسوم واحد صغير ويتضمن أقل من 17000 زوج قواعد نيتروجينية. بينما ال DNA في نواة الخلية يتضمن ثلاثة مليارات قاعدة نيتروجينية في 23 زوجًا من الكروموسومات.<br />
ومع ذلك، تحتوي كل خلية على نواة واحدة والعديد من الميتوكوندريا: في بعض الخلايا يصل عدد عضيات الميتوكوندريا إلى الآلاف، لذلك لديهم أيضًا آلاف النسخ من الحمض النووي DNA للميتوكوندريا. هناك اختلاف آخر بين أنواع الحمض النووي DNA وهو أننا نحصل على الحمض النووي DNA للميتوكوندريا من الأم فقط. تحتوي خلية الحيوانات المنوية على ميتوكوندريا، لكنها موجودة في "ذيل" الخلية، والذي يبقى بالخارج عند اتحاد الحيوان المنوي مع البويضة، يقوم الحمض النووي DNA للميتوكوندريا بتشفير13 بروتينًا ضروريًا لوظيفة الميتوكوندريا باعتبارها "محطة القوة الخلية".<br />
<br><br />
يحتوي الجينوم البشري على 49 "جينا كاذبا" للجين CYCS (وهي جينات غير فعالة ولا تمر في مرحلة النسخ ولا الترجمة). للجين توجد ثلاثة اكسونات. <br />
<br><br />
يتم تركيب البروتينات من أحماض أمينية باستخدام المعلومة المشفرة في الجينات، لدى كل بروتين تسلسلٌ خاص به من الأحماض الأمينية والذي يُحدَّد بواسطة تسلسل نوكليوتيدات الجين المشفر لذلك البروتين. تُنسخ الجينات المشفرة في الدنا إلى رنا رسول والذي يُستخدم بعدها كقالب لتخليق (ترجمة) البروتين بواسطة الريبوسوم. لا يتم التعبير عن جميع الجينات في الكائن الحي في نفس الوقت حيث ان كل خلية تعبر فقط عن جزء معين من المعلومات الموجودة بها ويتم قمع الجينات الأخرى التي ليست ضرورية لوظيفة الخلية. يتم قياس التعبير الجيني للجين CYCS حسب كمية الرنا رسول في الانسجة المختلفة حيث ان التعبير يختلف من نسيج الى اخر.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 9<br />
[[Image:Expression cytochrome c.JPG|border|center|600px|]]<br />
</p><br />
<br><br />
==<div style="text-align: right;"> أمراض </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
عند الأشخاص الذين يعانون من متلازمة نقص الصفيحات وجدت طفرة في جين CYCS والتي بها يتم استبدال الحمض الاميني <scene name='89/898985/Gly__41/3'>جلايسين في المكان ال41 ( مكان محفوظ تطوريا) </scene> بالحمض الاميني سيرين . هذه المتلازمة هي متلازمة سائدة تتميز بنقص في عدد صفائح الدم وبالتالي يزداد الاحتمال لحدوث النزيف وتقل احتمالية تخثر الدم. <br />
لقد وجدت الدراسات الحديثة أن هذه الطفرة تزيد من النشاط المؤيد لموت الخلايا المبرمج عن طريق تنشيط الكاسبيز(caspase) بشكل أكثر كفاءة من البروتين الطبيعي. لا تؤثر هذه الطفرة على وظيفة الأكسدة والاختزال للبروتين<br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> ورقة عمل للطالب </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
[https://proteopedia.org/wiki/images/d/d8/%D7%93%D7%A3_%D7%A2%D7%91%D7%95%D7%93%D7%94_%D7%9C%D7%AA%D7%9C%D7%9E%D7%99%D7%93_-_cytochrome_C.pdf דף עבודה לתלמיד]<br />
<br><br />
[https://proteopedia.org/wiki/images/0/08/%D7%A0%D7%A1%D7%A4%D7%97_FASTA_%D7%A9%D7%9C_%D7%94%D7%97%D7%9C%D7%91%D7%95%D7%A0%D7%99%D7%9D.doc נספח]<br />
</p><br />
<br><br />
==<div style="text-align: right;"> المصادر </div> ==<br />
<br><br />
[https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/compound/444125#section=3D-Conformer pubchem]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/NP_061820.1 ncbi - cytochrome c - homo sapiens]<br />
<br><br />
[https://ashpublications.org/blood/article/132/Supplement%201/3758/265249/A-Novel-Cycs-Missense-Mutation-in-the-Helix-of-the A Novel Cycs Missense Mutation in the α-Helix of the Cycs C-Terminal Domain Causes Non-Syndromic Thrombocytopenia]<br />
<br><br />
[https://davidson.weizmann.ac.il/online/sciencenews/%D7%9C%D7%A8%D7%90%D7%95%D7%AA-%D7%90%D7%AA-%D7%94%D7%9E%D7%95%D7%9C%D7%A7%D7%95%D7%9C%D7%95%D7%AA-%D7%A0%D7%98%D7%A2%D7%A0%D7%95%D7%AA לראות את המולקולות נטענות - מכון דוידסון]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/browser/gene/?id=54205 ncbi cics gene]<br />
<br><br />
[https://www.rcsb.org/structure/1gu2 pdb - 1GU2]<br />
<br><br />
[https://www.rcsb.org/structure/1AKK pdb - 1AKK]<br />
<br><br />
[https://chem.libretexts.org/Courses/Saint_Marys_College_Notre_Dame_IN/CHEM_342%3A_Bio-inorganic_Chemistry/Readings/Metals_in_Biological_Systems_(Saint_Mary's_College)/Cytochrome_C Cytochrome C. (2019, June 5).]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/54205 ncbi - CYCS cytochrome c - Homo sapiens]<br />
<br><br />
[https://www.nature.com/articles/nrm2434 nature - Cytochrome c: functions beyond respiration]</div>Fatima M Hameedhttps://proteopedia.org/index.php?title=Cytochrome_C_(arabic)&diff=3554818Cytochrome C (arabic)2022-05-01T09:17:16Z<p>Fatima M Hameed: </p>
<hr />
<div>==<center>'''سيتوكروم سي البشري '''</center>==<br />
<p dir='rtl'><br />
<br />
.سيتوكروم سي عبارة عن زلال صغير (الوزن الجزيئي حوالي 1200 دالتون ) وهو بروتين محفوظ للغاية عبر مجموعة من الأنواع ، موجود في النباتات والحيوانات والعديد من الكائنات أحادية الخلية<br />
<br />
يرتبط هذا البروتين بمجموعة [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D9%87%D9%8A%D9%85 هيم] وبمركزها توجد ذرة حديد، وهو بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات وبعملية الاستموات (موت الخلايا المبرمج)<br />
</p><br />
<StructureSection load='1J3S' size='340' side='left' caption=' سيتوكروم سي البشري (PDB code [[1j3s]])' scene='89/898985/Cytochrome_c_basic/19'><br />
==<div style="text-align: right;"> المقدمة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي عبارة عن بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات، والتي هي العملية الأخيرة في عملية <br />
[https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D9%86%D9%81%D8%B3_%D8%AE%D9%84%D9%88%D9%8A التنفس الخلوي]<br />
. عملية التنفس الخلوي تقسم الى 3 أقسام مركزية: [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D8%AD%D9%84%D9%84_%D8%A7%D9%84%D8%AC%D9%84%D9%88%D9%83%D9%88%D8%B2 جليكوليزا ] (التي تحدث في السيتوبلازما)، [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AF%D9%88%D8%B1%D8%A9_%D8%AD%D9%85%D8%B6_%D8%A7%D9%84%D8%B3%D8%AA%D8%B1%D9%8A%D9%83 دورة كريبس] (تحدث في المساحة الداخلية للميتوكوندريا) وسلسلة نقل الالكترونات التي تحدث داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. <br />
<br />
.بنقل الالكترونات لجزيئات أخرى ملامسة لها، وهكذا يتم تشكيل سلسلة من البروتينات حاملة الإلكترونات FADH2 و NADH في سلسلة نقل الالكترونات تقوم الجزيئات المختزلة بدورة كريبس مثل<br />
.يتم استيعاب الإلكترونات في نهاية الأمر بواسطة الأكسجين ويؤدي هذا الاتحاد الى انتاج الماء<br />
نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة ، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا<br />
بواسطة منحدر التركيز الناتج في أيونات الهيدروجين يتم دفع عمل البروتين ATP سنتاز من أجل انتاج ATP. [https://davidson.weizmann.ac.il/ar/online/maagarmada/atp-%D8%B3%D9%8A%D9%86%D8%AB%D8%A7%D8%B2-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AD%D8%B1%D9%83-%D8%A7%D9%84%D8%AC%D8%B2%D9%8A%D8%A6%D9%8A%D9%91-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AA%D9%83%D8%A7%D9%85%D9%84 ATP] هو جزيء غنيّ بالطّاقة، يحتوي على مجموعة من الأدينوساين وثلاث مجموعات من الفوسفور المرتبطة به. يؤدّي التحلّل المائيّ لمجموعة الفوسفور الثالثة إلى إطلاق طاقة تسمح للجسم بتنشيط العديد من الإنزيمات والعمليات الموجودة فيه. يقوم الجسم بإنتاج الATP في الميتوكوندريا في جميع الأوقات وذلك من الاجل الحفاظ على نسبة عالية من الATP داخل الخلية وبالتالي فان نقل الالكترونات وإنتاج منحدر تراكيز لأيونات الهيدروجين تعتبر عملية رئيسية من اجل وجود سليم للخلية.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة1 (قوموا بالوقف على الصورة بالفأرة من أجل اظهار الشرح)<br />
</p><br />
[[Image:Electron_transport_chain_cytochrome_c.jpg|border|center|600px|نرى في الصورة سلسلة نقل الالكترونات – نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا. هذا النقل فعال (يحتاج الى طاقة) وهو عكس منحدر التركيز. تراكم ايونات الهيدروجين في الفراغ بين غشائي الخلية يمكن من دخول الهيدروجين بشكل غير فعال من اجل انتاج جزيء ATP .]]<br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
هنا توجد 3 مقاطع فيديو:<br />
<br><br />
[https://youtu.be/3YTPOIcj6lw סרטון] حول عملية نقل الإلكترون في الميتوكوندريا.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/LQmTKxI4Wn4 סרטון] فيديو يشرح العملية من زاوية أوسع.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/YZsJ-8TenYw סרטון] فيديو عن انحدار التراكيز مع التركيز على ATP سينثاز.<br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> المبنى الجزيئي </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي ينتمي لعائلة البروتين باسم all-α proteins والتي تتميز بوجود <scene name='89/898985/Secondary_structure/4'>المبنى الثنائي</scene> لولب ألفا. كل بروتين ينتمي لهذه المجموعة يحتوي أيضا على مجموعة هيم واحدة أو أكثر.<br />
<br><br />
<scene name='89/898985/Hem_c/2'>HEME C</scene> – مجموعة هيم عبارة عن مركب عضوي يتم انتاجه في النخاع العظمي والكبد. والهيم هو جزء من البروتينات التي تقوم بوظائف متعددة في الجسم. ان فعالية مجموعة هيم تنبع من قدرة ذرة الحديد على ربط جزيئات صغيرة (مثل الاكسجين) وأيضا على قدرتها لأكسدة واختزال مركبات أخرى (ان تعطي الكترونات او ان تستقبل الكترونات، على التوالي).<br />
<br><br />
يتكون السيتوكروم C البشري من <scene name='89/898985/Amino_acids/4'>سلسلة من 104 من الاحماض الامينية</scene> . يرتبط اثنان من الأحماض الأمينية بذرة الحديد <scene name='89/898985/Bond_to_iron_18_80/2'>(الهيستيدين في الموضع 18 والمثيونين في الموضع 80)</scene> ، ويرتبط اثنان من الأحماض الأمينية تساهميًا (رباط تساهمي) من خلال ذرة الكبريت (S) بمجموعة هيم <scene name='89/898985/Bond_to_iron_14_17/2'>(السيستئين في الموضع 17 وسيستئين في الموضع 14)</scene><br />
<br><br />
لقد وجد أن هناك عدد من الأحماض الأمينية المحفوظة تطوريًا، وهي الأحماض الأمينية المهمة لربط ذرة الحديد ومجموعة هيم. <scene name='89/898985/Cxxch_motive/6'>CXXCH</scene> (السيستئين ، X ، X ، السيستئين ، الهيستيدين) حيث يمكن أن يكون X أي حمض أميني غير السيستئين. وهذه المجموعة موجودة أيضا في بروتين سيتوكروم سي البشري.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 2<br />
[[Image:Consurf key small.gif|center|300px|مفتاح الأوان لعرض الحفظ التطوري- الليلكي الداكن يعرض الاحماض الامينية المحفوظة تطوريا والمتماثلة بكائنات حية مختلفة. الأبيض يعرض الاحماض الامينية المحفوظة بشكل جزئي والازرق يعرض الاحماض الامينية الغير محفوظة تطوريا حيث ان هذه المواقع تتواجد بالعديد من الاحماض الامينية المختلفة بين كائنات حية مختلفة.<br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> الوظيفة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
في سلسلة نقل الالكترونات يقوم سيتوكروم سي بنقل الكترون بين المعقدين III و IV . المعقد III يسمى سيتوكروم bc1 والمعقد IV يسمى سيتوكروم سي أوكسيداز. نقل الالكترونات يكون ممكنا بسبب حالة تأكسد متغيرة لذرة الحديد ، حيث ان في البداية يتواجد أيون الحديد في مجموعة هيم بحالة Fe3+ الأمر الذي يمكن من استيعاب الكترون واحد وبالتالي اختزال الحديد لحالة Fe2+.<br />
<br> <br />
<br> <br />
صورة 3<br />
</p><br />
[[Image:Cytochrome C Oxydoreductase.jpg|border|center|400px|نرى في الصورة المعقدات المختلفة في سلسلة نقل الالكترونات- سيتوكروم سي هو بروتين صغير مقارنة بالمعقدات 2و3و4 ولا يستطيع المرور عبر الغشاء الخلوي. يمر البروتين عبر الغشاء الداخلي للميتوكوندريا بين المعقد 3 و4. ويمكن الملاحظة ان جميع بروتينات سلسلة نقل الالكترونات تحتوي على مجموعة هيم.]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
يلعب السيتوكروم سي أيضًا دورًا وسيطًا في عملية [https://he.wikipedia.org/wiki/%D7%90%D7%A4%D7%95%D7%A4%D7%98%D7%95%D7%96%D7%94 موت الخلايا المبرمج] وهو شكل محكوم من موت الخلايا يستخدم لقتل الخلايا في عملية النمو من اجل نمو أعضاء صحيحة وأيضا مسئول عن انتقاء خلايا الدم البيضاء ولقتل الخلايا السرطانية او المريضة . <br />
<br><br />
<br> <br />
في هذا [https://youtu.be/Od3pUsVdMhQ الفيديو] نرى دور السيتوكروم سي في موت الخلايا المبرمج. <br />
<br><br />
سيتوكروم سي الحامل للإلكترونات يتواجد داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا بواسطة رابط هيدروفوبي (كاره للماء) للفوسفوليبيد كارديوليبين (وهو جزيء هيدروفوبي يبني غشاء الميتوكوندريا).<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 4<br />
</p><br />
[[Image:Cardiolipin.jpg|border|center|280px|في الجهة اليسرى من الرسم نرى البروتين سيتوكروم سي مربوط مع الفوسوفليبيد كارديوليبين ويتواجد داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. في الجهة اليمنى نرى انقسام المعقد كارديوليبين- سيتوكروم سي نتيجة لتأكسد جزيء الكارديوليبين. سيتوكورم سي ينفصل عن الغشاء ويصبح حر ويمكنه الوصول للسيتوبلازما.]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
تتميز بداية عملية الموت الخلوي بارتفاع في نسبة الشوارد الحرة (ROS) في الميتوكوندريا. نتيجة لذلك يتم تأكسد الكارديوليبين وبالتالي فانه يتم تفكيك المعقد كارديوليبين- سيتوكروم سي. <br />
يقوم بعد ذلك السيتوكروم سي بالخروج من الغشاء الداخلي للميتوكوندريا ويمر من خلال الثقوب الموجودة في الغشاء الخارجي وصولا الى السيتوبرلازما. في السيتوبلازما يرتبط سيتوكروم سي لبروتين APAF1 وبروتين dATP وهكذا يتكون مبنى ال أبوبتوسوم وهو بروتين يربط بروتين بروكسباز 9 ويحوله الى صورته النشطة والفعالة وهكذا تتمكن الكاسباسات 3 و7 من الارتباط والعمل (caspase). هذه العملية تؤدي الى ضرر وانقسام في ال DNA الذي ينتهي بموت موجه للخلية.<br />
<br><br />
<br> <br />
صورة 5<br />
</p><br />
[[Image:Apoptosome.jpg|border|center|280px| يسمى بداية نرى اطلاق السيتوكروم سي من الميتوكوندريا الى السيتوبلازما. بعد ذلك يرتبط السيتوكورم سي مع بروتين في السيتوبلازما لتشكيل مركب الابوبتوسوم وهو مركب مهم في مراقبة عملية الموت المبرمج للخلايا حيث انه يربط بروتين بروكسباز 9 ويحوله الى صورته النشطة والفعالة وهكذا ينشط المسار الداخلي لعملية الموت الخلوي والتي تنتهي بموت موجه للخلية. ]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
منع الموت المبرمج للخلية<br />
<br><br />
تشير العديد من الأبحاث ان الخلايا تستطيع ان تتحكم وتسيطر على موت الخلايا المبرمج ولذك من خلال تعديل تقوم به بعد عملية الترجمة في البروتين. البروتينات هي سلسلة طويلة من الاحماض الامينية، المرحلة الأولى في بناء البروتين هي انتاج سلسلة من الاحماض الامينية (المبنى الاولي) وبعد ذلك تمر هذه السلسلة بالعديد من المعالجات والتعديلات. واحدة من هذه التعديلات هي عملية الفسفرة. عملية الفسفرة يتم فيها إضافة مجموعة فوسفات للبروتين (أيون يحتوي على ذرة فوسفات واحدة و4 ذرات هيدروجين). تتم العملية بواسطة إنزيمات الكيناز والتي تنقل الفوسفات وهي تغيير الشكل التركيبي للبروتين بحيث تعدل من صفاته أو وظيفته. والعملية العكسية تسمى إزالة الفسفرة بواسطة انزيم الفوسفاتيز الذي يقوم بإزالة مجموعة فوسفات من البروتين. في سيتوكروم سي وجد أن هناك عدد من الأحماض الأمينية المحفوظة تطوريًا والتي تمر <scene name='89/898985/Phosphotyrosine_48_97/4'>بعملية الفسفرة</scene> ، الامر الذي يمنع من الإنتاج الزائد للشوارد الحرة (ROS)<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 6<br />
</p><br />
[[Image:Apoptosome formation.jpg|border|center|בתרשים מוצגת פעילות החלבון במצב מזורחן (מבוקר) ובמצב לא מזורחן (לא מבוקר); במצב מבוקר ניתן לראות שקצב הנשימה מווסת ולכן נוצרים מעט רדיקלים חופשיים, פוטנציאל הממברנה חיובי וציטוכרום סי קשור לממברנה הפנימית של המיטוכונדריה באמצעות קרדיוליפין. <br />
במצב לא מבוקר קצב הנשימה התאית הינו קצב מקסימאלי המייצר פוטנציאל ממברנה שלילי, יש עלייה בייצור רדיקלים חופשיים וקומפלקס קרדיוליפין+ציטוכרום סי נפרד. <br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
صورة 7<br />
</p><br />
[[Image:Cytochrome c alignment.jpg|border|center|עימוד ציטוכרום סי מאדם ומעכבר (מרקמה סומטית ומרקמת תאי מין) מאפשר לזהות עמדות שמורות אבולוציונית. ניתן לראות את עמדות 14 ו- 17 הקושרות קוולנטית את קבוצת ההם (חומצות אמינו ציסטאין המסומנות באות הגדולה סי). במיקום החיצים נמצאות עמדות שמורות העוברות מודיפיקציות לאחר תרגום, ביניהן גם עמדות 48 ו- 97 (חומצה אמינית טירוזין המסומנת באות וואי) המוזכרות בערך זה. ]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
وظيفة السيتوكروم سي كمانع للأكسدة (تقليل ROS) تتم بشكل مباشر عن طريق إزالة الأكسيد الفائق O2- وماء الاكسجين (H2O2) من الميتوكوندريا كما هو موضح في الرسم التالي:<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 8<br />
</p><br />
[[Image:Antioxidante.png|center|]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي هو بروتين يلعب دور مركزي في انتاج الطاقة في الخلية وأيضا له دور رئيسي بعمليات موت الخلايا المبرمج.<br />
</p><br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> وراثة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
جين CYCS الذي يشفر بروتين السيتوكروم C في البشر يتواجد على كروموسوم 7 في الحمض النووي DNA في نواة الخلية. هذا على عكس البروتينات الأخرى التي تعمل في عضية الميتوكوندريا المشفرة بواسطة الحمض النووي DNA للميتوكوندريا. حيث ان ال DNA للميتوكوندريا صغير جدًا، ويتألف من كروموسوم واحد صغير ويتضمن أقل من 17000 زوج قواعد نيتروجينية. بينما ال DNA في نواة الخلية يتضمن ثلاثة مليارات قاعدة نيتروجينية في 23 زوجًا من الكروموسومات.<br />
ومع ذلك، تحتوي كل خلية على نواة واحدة والعديد من الميتوكوندريا: في بعض الخلايا يصل عدد عضيات الميتوكوندريا إلى الآلاف، لذلك لديهم أيضًا آلاف النسخ من الحمض النووي DNA للميتوكوندريا. هناك اختلاف آخر بين أنواع الحمض النووي DNA وهو أننا نحصل على الحمض النووي DNA للميتوكوندريا من الأم فقط. تحتوي خلية الحيوانات المنوية على ميتوكوندريا، لكنها موجودة في "ذيل" الخلية، والذي يبقى بالخارج عند اتحاد الحيوان المنوي مع البويضة، يقوم الحمض النووي DNA للميتوكوندريا بتشفير13 بروتينًا ضروريًا لوظيفة الميتوكوندريا باعتبارها "محطة القوة الخلية".<br />
<br><br />
يحتوي الجينوم البشري على 49 "جينا كاذبا" للجين CYCS (وهي جينات غير فعالة ولا تمر في مرحلة النسخ ولا الترجمة). للجين توجد ثلاثة اكسونات. <br />
<br><br />
يتم تركيب البروتينات من أحماض أمينية باستخدام المعلومة المشفرة في الجينات، لدى كل بروتين تسلسلٌ خاص به من الأحماض الأمينية والذي يُحدَّد بواسطة تسلسل نوكليوتيدات الجين المشفر لذلك البروتين. تُنسخ الجينات المشفرة في الدنا إلى رنا رسول والذي يُستخدم بعدها كقالب لتخليق (ترجمة) البروتين بواسطة الريبوسوم. لا يتم التعبير عن جميع الجينات في الكائن الحي في نفس الوقت حيث ان كل خلية تعبر فقط عن جزء معين من المعلومات الموجودة بها ويتم قمع الجينات الأخرى التي ليست ضرورية لوظيفة الخلية. يتم قياس التعبير الجيني للجين CYCS حسب كمية الرنا رسول في الانسجة المختلفة حيث ان التعبير يختلف من نسيج الى اخر.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 9<br />
[[Image:Expression cytochrome c.JPG|border|center|600px|]]<br />
</p><br />
<br><br />
==<div style="text-align: right;"> أمراض </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
عند الأشخاص الذين يعانون من متلازمة نقص الصفيحات وجدت طفرة في جين CYCS والتي بها يتم استبدال الحمض الاميني <scene name='89/898985/Gly__41/3'>جلايسين في المكان ال41 ( مكان محفوظ تطوريا) </scene> بالحمض الاميني سيرين . هذه المتلازمة هي متلازمة سائدة تتميز بنقص في عدد صفائح الدم وبالتالي يزداد الاحتمال لحدوث النزيف وتقل احتمالية تخثر الدم. <br />
لقد وجدت الدراسات الحديثة أن هذه الطفرة تزيد من النشاط المؤيد لموت الخلايا المبرمج عن طريق تنشيط الكاسبيز(caspase) بشكل أكثر كفاءة من البروتين الطبيعي. لا تؤثر هذه الطفرة على وظيفة الأكسدة والاختزال للبروتين<br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> ورقة عمل للطالب </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
[https://proteopedia.org/wiki/images/d/d8/%D7%93%D7%A3_%D7%A2%D7%91%D7%95%D7%93%D7%94_%D7%9C%D7%AA%D7%9C%D7%9E%D7%99%D7%93_-_cytochrome_C.pdf דף עבודה לתלמיד]<br />
<br><br />
[https://proteopedia.org/wiki/images/0/08/%D7%A0%D7%A1%D7%A4%D7%97_FASTA_%D7%A9%D7%9C_%D7%94%D7%97%D7%9C%D7%91%D7%95%D7%A0%D7%99%D7%9D.doc נספח]<br />
</p><br />
<br><br />
==<div style="text-align: right;"> المصادر </div> ==<br />
<br><br />
[https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/compound/444125#section=3D-Conformer pubchem]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/NP_061820.1 ncbi - cytochrome c - homo sapiens]<br />
<br><br />
[https://ashpublications.org/blood/article/132/Supplement%201/3758/265249/A-Novel-Cycs-Missense-Mutation-in-the-Helix-of-the A Novel Cycs Missense Mutation in the α-Helix of the Cycs C-Terminal Domain Causes Non-Syndromic Thrombocytopenia]<br />
<br><br />
[https://davidson.weizmann.ac.il/online/sciencenews/%D7%9C%D7%A8%D7%90%D7%95%D7%AA-%D7%90%D7%AA-%D7%94%D7%9E%D7%95%D7%9C%D7%A7%D7%95%D7%9C%D7%95%D7%AA-%D7%A0%D7%98%D7%A2%D7%A0%D7%95%D7%AA לראות את המולקולות נטענות - מכון דוידסון]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/browser/gene/?id=54205 ncbi cics gene]<br />
<br><br />
[https://www.rcsb.org/structure/1gu2 pdb - 1GU2]<br />
<br><br />
[https://www.rcsb.org/structure/1AKK pdb - 1AKK]<br />
<br><br />
[https://chem.libretexts.org/Courses/Saint_Marys_College_Notre_Dame_IN/CHEM_342%3A_Bio-inorganic_Chemistry/Readings/Metals_in_Biological_Systems_(Saint_Mary's_College)/Cytochrome_C Cytochrome C. (2019, June 5).]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/54205 ncbi - CYCS cytochrome c - Homo sapiens]<br />
<br><br />
[https://www.nature.com/articles/nrm2434 nature - Cytochrome c: functions beyond respiration]</div>Fatima M Hameedhttps://proteopedia.org/index.php?title=Cytochrome_C_(arabic)&diff=3554816Cytochrome C (arabic)2022-05-01T09:10:26Z<p>Fatima M Hameed: </p>
<hr />
<div>==<center>'''سيتوكروم سي البشري '''</center>==<br />
<p dir='rtl'><br />
<br />
.سيتوكروم سي عبارة عن زلال صغير (الوزن الجزيئي حوالي 1200 دالتون ) وهو بروتين محفوظ للغاية عبر مجموعة من الأنواع ، موجود في النباتات والحيوانات والعديد من الكائنات أحادية الخلية<br />
<br />
يرتبط هذا البروتين بمجموعة [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D9%87%D9%8A%D9%85 هيم] وبمركزها توجد ذرة حديد، وهو بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات وبعملية الاستموات (موت الخلايا المبرمج)<br />
</p><br />
<StructureSection load='1J3S' size='340' side='left' caption=' سيتوكروم سي البشري (PDB code [[1j3s]])' scene='89/898985/Cytochrome_c_basic/19'><br />
==<div style="text-align: right;"> المقدمة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي عبارة عن بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات، والتي هي العملية الأخيرة في عملية <br />
[https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D9%86%D9%81%D8%B3_%D8%AE%D9%84%D9%88%D9%8A التنفس الخلوي]<br />
. عملية التنفس الخلوي تقسم الى 3 أقسام مركزية: [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D8%AD%D9%84%D9%84_%D8%A7%D9%84%D8%AC%D9%84%D9%88%D9%83%D9%88%D8%B2 جليكوليزا ] (التي تحدث في السيتوبلازما)، [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AF%D9%88%D8%B1%D8%A9_%D8%AD%D9%85%D8%B6_%D8%A7%D9%84%D8%B3%D8%AA%D8%B1%D9%8A%D9%83 دورة كريبس] (تحدث في المساحة الداخلية للميتوكوندريا) وسلسلة نقل الالكترونات التي تحدث داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. <br />
<br />
.بنقل الالكترونات لجزيئات أخرى ملامسة لها، وهكذا يتم تشكيل سلسلة من البروتينات حاملة الإلكترونات FADH2 و NADH في سلسلة نقل الالكترونات تقوم الجزيئات المختزلة بدورة كريبس مثل<br />
.يتم استيعاب الإلكترونات في نهاية الأمر بواسطة الأكسجين ويؤدي هذا الاتحاد الى انتاج الماء<br />
نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة ، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا<br />
بواسطة منحدر التركيز الناتج في أيونات الهيدروجين يتم دفع عمل البروتين ATP سنتاز من أجل انتاج ATP. [https://davidson.weizmann.ac.il/ar/online/maagarmada/atp-%D8%B3%D9%8A%D9%86%D8%AB%D8%A7%D8%B2-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AD%D8%B1%D9%83-%D8%A7%D9%84%D8%AC%D8%B2%D9%8A%D8%A6%D9%8A%D9%91-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AA%D9%83%D8%A7%D9%85%D9%84 ATP] هو جزيء غنيّ بالطّاقة، يحتوي على مجموعة من الأدينوساين وثلاث مجموعات من الفوسفور المرتبطة به. يؤدّي التحلّل المائيّ لمجموعة الفوسفور الثالثة إلى إطلاق طاقة تسمح للجسم بتنشيط العديد من الإنزيمات والعمليات الموجودة فيه. يقوم الجسم بإنتاج الATP في الميتوكوندريا في جميع الأوقات وذلك من الاجل الحفاظ على نسبة عالية من الATP داخل الخلية وبالتالي فان نقل الالكترونات وإنتاج منحدر تراكيز لأيونات الهيدروجين تعتبر عملية رئيسية من اجل وجود سليم للخلية.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة1 (قوموا بالوقف على الصورة بالفأرة من أجل اظهار الشرح)<br />
</p><br />
[[Image:Electron_transport_chain_cytochrome_c.jpg|border|center|600px|نرى في الصورة سلسلة نقل الالكترونات – نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا. هذا النقل فعال (يحتاج الى طاقة) وهو عكس منحدر التركيز. تراكم ايونات الهيدروجين في الفراغ بين غشائي الخلية يمكن من دخول الهيدروجين بشكل غير فعال من اجل انتاج جزيء ATP .]]<br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
هنا توجد 3 مقاطع فيديو:<br />
<br><br />
[https://youtu.be/3YTPOIcj6lw סרטון] حول عملية نقل الإلكترون في الميتوكوندريا.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/LQmTKxI4Wn4 סרטון] فيديو يشرح العملية من زاوية أوسع.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/YZsJ-8TenYw סרטון] فيديو عن انحدار التراكيز مع التركيز على ATP سينثاز.<br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> المبنى الجزيئي </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي ينتمي لعائلة البروتين باسم all-α proteins والتي تتميز بوجود <scene name='89/898985/Secondary_structure/4'>المبنى الثنائي</scene> لولب ألفا. كل بروتين ينتمي لهذه المجموعة يحتوي أيضا على مجموعة هيم واحدة أو أكثر.<br />
<br><br />
<scene name='89/898985/Hem_c/2'>HEME C</scene> – مجموعة هيم عبارة عن مركب عضوي يتم انتاجه في النخاع العظمي والكبد. والهيم هو جزء من البروتينات التي تقوم بوظائف متعددة في الجسم. ان فعالية مجموعة هيم تنبع من قدرة ذرة الحديد على ربط جزيئات صغيرة (مثل الاكسجين) وأيضا على قدرتها لأكسدة واختزال مركبات أخرى (ان تعطي الكترونات او ان تستقبل الكترونات، على التوالي).<br />
<br><br />
يتكون السيتوكروم C البشري من <scene name='89/898985/Amino_acids/4'>سلسلة من 104 من الاحماض الامينية</scene> . يرتبط اثنان من الأحماض الأمينية بذرة الحديد <scene name='89/898985/Bond_to_iron_18_80/2'>(الهيستيدين في الموضع 18 والمثيونين في الموضع 80)</scene> ، ويرتبط اثنان من الأحماض الأمينية تساهميًا (رباط تساهمي) من خلال ذرة الكبريت (S) بمجموعة هيم <scene name='89/898985/Bond_to_iron_14_17/2'>(السيستئين في الموضع 17 وسيستئين في الموضع 14)</scene><br />
<br><br />
لقد وجد أن هناك عدد من الأحماض الأمينية المحفوظة تطوريًا، وهي الأحماض الأمينية المهمة لربط ذرة الحديد ومجموعة هيم. <scene name='89/898985/Cxxch_motive/6'>CXXCH</scene> (السيستئين ، X ، X ، السيستئين ، الهيستيدين) حيث يمكن أن يكون X أي حمض أميني غير السيستئين. وهذه المجموعة موجودة أيضا في بروتين سيتوكروم سي البشري.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 2<br />
[[Image:Consurf key small.gif|center|300px|مفتاح الأوان لعرض الحفظ التطوري- الليلكي الداكن يعرض الاحماض الامينية المحفوظة تطوريا والمتماثلة بكائنات حية مختلفة. الأبيض يعرض الاحماض الامينية المحفوظة بشكل جزئي والازرق يعرض الاحماض الامينية الغير محفوظة تطوريا حيث ان هذه المواقع تتواجد بالعديد من الاحماض الامينية المختلفة بين كائنات حية مختلفة.<br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> الوظيفة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
في سلسلة نقل الالكترونات يقوم سيتوكروم سي بنقل الكترون بين المعقدين III و IV . المعقد III يسمى سيتوكروم bc1 والمعقد IV يسمى سيتوكروم سي أوكسيداز. نقل الالكترونات يكون ممكنا بسبب حالة تأكسد متغيرة لذرة الحديد ، حيث ان في البداية يتواجد أيون الحديد في مجموعة هيم بحالة Fe3+ الأمر الذي يمكن من استيعاب الكترون واحد وبالتالي اختزال الحديد لحالة Fe2+.<br />
<br> <br />
<br> <br />
صورة 3<br />
</p><br />
[[Image:Cytochrome C Oxydoreductase.jpg|border|center|400px|نرى في الصورة المعقدات المختلفة في سلسلة نقل الالكترونات- سيتوكروم سي هو بروتين صغير مقارنة بالمعقدات 2و3و4 ولا يستطيع المرور عبر الغشاء الخلوي. يمر البروتين عبر الغشاء الداخلي للميتوكوندريا بين المعقد 3 و4. ويمكن الملاحظة ان جميع بروتينات سلسلة نقل الالكترونات تحتوي على مجموعة هيم.]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
يلعب السيتوكروم سي أيضًا دورًا وسيطًا في عملية [https://he.wikipedia.org/wiki/%D7%90%D7%A4%D7%95%D7%A4%D7%98%D7%95%D7%96%D7%94 موت الخلايا المبرمج] وهو شكل محكوم من موت الخلايا يستخدم لقتل الخلايا في عملية النمو من اجل نمو أعضاء صحيحة وأيضا مسئول عن انتقاء خلايا الدم البيضاء ولقتل الخلايا السرطانية او المريضة . <br />
<br><br />
<br> <br />
في هذا [https://youtu.be/Od3pUsVdMhQ الفيديو] نرى دور السيتوكروم سي في موت الخلايا المبرمج. <br />
<br><br />
سيتوكروم سي الحامل للإلكترونات يتواجد داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا بواسطة رابط هيدروفوبي (كاره للماء) للفوسفوليبيد كارديوليبين (وهو جزيء هيدروفوبي يبني غشاء الميتوكوندريا).<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 4<br />
</p><br />
[[Image:Cardiolipin.jpg|border|center|280px|في الجهة اليسرى من الرسم نرى البروتين سيتوكروم سي مربوط مع الفوسوفليبيد كارديوليبين ويتواجد داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. في الجهة اليمنى نرى انقسام المعقد كارديوليبين- سيتوكروم سي نتيجة لتأكسد جزيء الكارديوليبين. سيتوكورم سي ينفصل عن الغشاء ويصبح حر ويمكنه الوصول للسيتوبلازما.]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
تتميز بداية عملية الموت الخلوي بارتفاع في نسبة الشوارد الحرة (ROS) في الميتوكوندريا. نتيجة لذلك يتم تأكسد الكارديوليبين وبالتالي فانه يتم تفكيك المعقد كارديوليبين- سيتوكروم سي. <br />
يقوم بعد ذلك السيتوكروم سي بالخروج من الغشاء الداخلي للميتوكوندريا ويمر من خلال الثقوب الموجودة في الغشاء الخارجي وصولا الى السيتوبرلازما. في السيتوبلازما يرتبط سيتوكروم سي لبروتين APAF1 وبروتين dATP وهكذا يتكون مبنى ال أبوبتوسوم وهو بروتين يربط بروتين بروكسباز 9 ويحوله الى صورته النشطة والفعالة وهكذا تتمكن الكاسباسات 3 و7 من الارتباط والعمل (caspase). هذه العملية تؤدي الى ضرر وانقسام في ال DNA الذي ينتهي بموت موجه للخلية.<br />
<br><br />
<br> <br />
صورة 5<br />
</p><br />
[[Image:Apoptosome.jpg|border|center|280px|بداية نرى اطلاق السيتوكروم سي من الميتوكوندريا الى السيتوبلازما. بعد ذلك يرتبط السيتوكورم سي مع بروتين في السيتوبلازما يسمى Apaf-1 ويتم انتاج الأبوبتوسوم (apoptosome)وهو مركب مهم في مراقبة عملية الموت المبرمج للخلايا حيث انه يربط بروتين بروكسباز 9 ويحوله الى صورته النشطة والفعالة وهكذا ينشط المسار الداخلي لعملية الموت الخلوي والتي تنتهي بموت موجه للخلية.]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
منع الموت المبرمج للخلية<br />
<br><br />
تشير العديد من الأبحاث ان الخلايا تستطيع ان تتحكم وتسيطر على موت الخلايا المبرمج ولذك من خلال تعديل تقوم به بعد عملية الترجمة في البروتين. البروتينات هي سلسلة طويلة من الاحماض الامينية، المرحلة الأولى في بناء البروتين هي انتاج سلسلة من الاحماض الامينية (المبنى الاولي) وبعد ذلك تمر هذه السلسلة بالعديد من المعالجات والتعديلات. واحدة من هذه التعديلات هي عملية الفسفرة. عملية الفسفرة يتم فيها إضافة مجموعة فوسفات للبروتين (أيون يحتوي على ذرة فوسفات واحدة و4 ذرات هيدروجين). تتم العملية بواسطة إنزيمات الكيناز والتي تنقل الفوسفات وهي تغيير الشكل التركيبي للبروتين بحيث تعدل من صفاته أو وظيفته. والعملية العكسية تسمى إزالة الفسفرة بواسطة انزيم الفوسفاتيز الذي يقوم بإزالة مجموعة فوسفات من البروتين. في سيتوكروم سي وجد أن هناك عدد من الأحماض الأمينية المحفوظة تطوريًا والتي تمر <scene name='89/898985/Phosphotyrosine_48_97/4'>بعملية الفسفرة</scene> ، الامر الذي يمنع من الإنتاج الزائد للشوارد الحرة (ROS)<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 6<br />
</p><br />
[[Image:Apoptosome formation.jpg|border|center|בתרשים מוצגת פעילות החלבון במצב מזורחן (מבוקר) ובמצב לא מזורחן (לא מבוקר); במצב מבוקר ניתן לראות שקצב הנשימה מווסת ולכן נוצרים מעט רדיקלים חופשיים, פוטנציאל הממברנה חיובי וציטוכרום סי קשור לממברנה הפנימית של המיטוכונדריה באמצעות קרדיוליפין. <br />
במצב לא מבוקר קצב הנשימה התאית הינו קצב מקסימאלי המייצר פוטנציאל ממברנה שלילי, יש עלייה בייצור רדיקלים חופשיים וקומפלקס קרדיוליפין+ציטוכרום סי נפרד. <br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
صورة 7<br />
</p><br />
[[Image:Cytochrome c alignment.jpg|border|center|עימוד ציטוכרום סי מאדם ומעכבר (מרקמה סומטית ומרקמת תאי מין) מאפשר לזהות עמדות שמורות אבולוציונית. ניתן לראות את עמדות 14 ו- 17 הקושרות קוולנטית את קבוצת ההם (חומצות אמינו ציסטאין המסומנות באות הגדולה סי). במיקום החיצים נמצאות עמדות שמורות העוברות מודיפיקציות לאחר תרגום, ביניהן גם עמדות 48 ו- 97 (חומצה אמינית טירוזין המסומנת באות וואי) המוזכרות בערך זה. ]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
وظيفة السيتوكروم سي كمانع للأكسدة (تقليل ROS) تتم بشكل مباشر عن طريق إزالة الأكسيد الفائق O2- وماء الاكسجين (H2O2) من الميتوكوندريا كما هو موضح في الرسم التالي:<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 8<br />
</p><br />
[[Image:Antioxidante.png|center|]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي هو بروتين يلعب دور مركزي في انتاج الطاقة في الخلية وأيضا له دور رئيسي بعمليات موت الخلايا المبرمج.<br />
</p><br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> وراثة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
جين CYCS الذي يشفر بروتين السيتوكروم C في البشر يتواجد على كروموسوم 7 في الحمض النووي DNA في نواة الخلية. هذا على عكس البروتينات الأخرى التي تعمل في عضية الميتوكوندريا المشفرة بواسطة الحمض النووي DNA للميتوكوندريا. حيث ان ال DNA للميتوكوندريا صغير جدًا، ويتألف من كروموسوم واحد صغير ويتضمن أقل من 17000 زوج قواعد نيتروجينية. بينما ال DNA في نواة الخلية يتضمن ثلاثة مليارات قاعدة نيتروجينية في 23 زوجًا من الكروموسومات.<br />
ومع ذلك، تحتوي كل خلية على نواة واحدة والعديد من الميتوكوندريا: في بعض الخلايا يصل عدد عضيات الميتوكوندريا إلى الآلاف، لذلك لديهم أيضًا آلاف النسخ من الحمض النووي DNA للميتوكوندريا. هناك اختلاف آخر بين أنواع الحمض النووي DNA وهو أننا نحصل على الحمض النووي DNA للميتوكوندريا من الأم فقط. تحتوي خلية الحيوانات المنوية على ميتوكوندريا، لكنها موجودة في "ذيل" الخلية، والذي يبقى بالخارج عند اتحاد الحيوان المنوي مع البويضة، يقوم الحمض النووي DNA للميتوكوندريا بتشفير13 بروتينًا ضروريًا لوظيفة الميتوكوندريا باعتبارها "محطة القوة الخلية".<br />
<br><br />
يحتوي الجينوم البشري على 49 "جينا كاذبا" للجين CYCS (وهي جينات غير فعالة ولا تمر في مرحلة النسخ ولا الترجمة). للجين توجد ثلاثة اكسونات. <br />
<br><br />
يتم تركيب البروتينات من أحماض أمينية باستخدام المعلومة المشفرة في الجينات، لدى كل بروتين تسلسلٌ خاص به من الأحماض الأمينية والذي يُحدَّد بواسطة تسلسل نوكليوتيدات الجين المشفر لذلك البروتين. تُنسخ الجينات المشفرة في الدنا إلى رنا رسول والذي يُستخدم بعدها كقالب لتخليق (ترجمة) البروتين بواسطة الريبوسوم. لا يتم التعبير عن جميع الجينات في الكائن الحي في نفس الوقت حيث ان كل خلية تعبر فقط عن جزء معين من المعلومات الموجودة بها ويتم قمع الجينات الأخرى التي ليست ضرورية لوظيفة الخلية. يتم قياس التعبير الجيني للجين CYCS حسب كمية الرنا رسول في الانسجة المختلفة حيث ان التعبير يختلف من نسيج الى اخر.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 9<br />
[[Image:Expression cytochrome c.JPG|border|center|600px|]]<br />
</p><br />
<br><br />
==<div style="text-align: right;"> أمراض </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
عند الأشخاص الذين يعانون من متلازمة نقص الصفيحات وجدت طفرة في جين CYCS والتي بها يتم استبدال الحمض الاميني <scene name='89/898985/Gly__41/3'>جلايسين في المكان ال41 ( مكان محفوظ تطوريا) </scene> بالحمض الاميني سيرين . هذه المتلازمة هي متلازمة سائدة تتميز بنقص في عدد صفائح الدم وبالتالي يزداد الاحتمال لحدوث النزيف وتقل احتمالية تخثر الدم. <br />
لقد وجدت الدراسات الحديثة أن هذه الطفرة تزيد من النشاط المؤيد لموت الخلايا المبرمج عن طريق تنشيط الكاسبيز(caspase) بشكل أكثر كفاءة من البروتين الطبيعي. لا تؤثر هذه الطفرة على وظيفة الأكسدة والاختزال للبروتين<br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> ورقة عمل للطالب </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
[https://proteopedia.org/wiki/images/d/d8/%D7%93%D7%A3_%D7%A2%D7%91%D7%95%D7%93%D7%94_%D7%9C%D7%AA%D7%9C%D7%9E%D7%99%D7%93_-_cytochrome_C.pdf דף עבודה לתלמיד]<br />
<br><br />
[https://proteopedia.org/wiki/images/0/08/%D7%A0%D7%A1%D7%A4%D7%97_FASTA_%D7%A9%D7%9C_%D7%94%D7%97%D7%9C%D7%91%D7%95%D7%A0%D7%99%D7%9D.doc נספח]<br />
</p><br />
<br><br />
==<div style="text-align: right;"> المصادر </div> ==<br />
<br><br />
[https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/compound/444125#section=3D-Conformer pubchem]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/NP_061820.1 ncbi - cytochrome c - homo sapiens]<br />
<br><br />
[https://ashpublications.org/blood/article/132/Supplement%201/3758/265249/A-Novel-Cycs-Missense-Mutation-in-the-Helix-of-the A Novel Cycs Missense Mutation in the α-Helix of the Cycs C-Terminal Domain Causes Non-Syndromic Thrombocytopenia]<br />
<br><br />
[https://davidson.weizmann.ac.il/online/sciencenews/%D7%9C%D7%A8%D7%90%D7%95%D7%AA-%D7%90%D7%AA-%D7%94%D7%9E%D7%95%D7%9C%D7%A7%D7%95%D7%9C%D7%95%D7%AA-%D7%A0%D7%98%D7%A2%D7%A0%D7%95%D7%AA לראות את המולקולות נטענות - מכון דוידסון]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/browser/gene/?id=54205 ncbi cics gene]<br />
<br><br />
[https://www.rcsb.org/structure/1gu2 pdb - 1GU2]<br />
<br><br />
[https://www.rcsb.org/structure/1AKK pdb - 1AKK]<br />
<br><br />
[https://chem.libretexts.org/Courses/Saint_Marys_College_Notre_Dame_IN/CHEM_342%3A_Bio-inorganic_Chemistry/Readings/Metals_in_Biological_Systems_(Saint_Mary's_College)/Cytochrome_C Cytochrome C. (2019, June 5).]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/54205 ncbi - CYCS cytochrome c - Homo sapiens]<br />
<br><br />
[https://www.nature.com/articles/nrm2434 nature - Cytochrome c: functions beyond respiration]</div>Fatima M Hameedhttps://proteopedia.org/index.php?title=Cytochrome_C_(arabic)&diff=3554809Cytochrome C (arabic)2022-05-01T08:45:41Z<p>Fatima M Hameed: </p>
<hr />
<div>==<center>'''سيتوكروم سي البشري '''</center>==<br />
<p dir='rtl'><br />
<br />
.سيتوكروم سي عبارة عن زلال صغير (الوزن الجزيئي حوالي 1200 دالتون ) وهو بروتين محفوظ للغاية عبر مجموعة من الأنواع ، موجود في النباتات والحيوانات والعديد من الكائنات أحادية الخلية<br />
<br />
يرتبط هذا البروتين بمجموعة [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D9%87%D9%8A%D9%85 هيم] وبمركزها توجد ذرة حديد، وهو بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات وبعملية الاستموات (موت الخلايا المبرمج)<br />
</p><br />
<StructureSection load='1J3S' size='340' side='left' caption=' سيتوكروم سي البشري (PDB code [[1j3s]])' scene='89/898985/Cytochrome_c_basic/19'><br />
==<div style="text-align: right;"> المقدمة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي عبارة عن بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات، والتي هي العملية الأخيرة في عملية <br />
[https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D9%86%D9%81%D8%B3_%D8%AE%D9%84%D9%88%D9%8A التنفس الخلوي]<br />
. عملية التنفس الخلوي تقسم الى 3 أقسام مركزية: [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D8%AD%D9%84%D9%84_%D8%A7%D9%84%D8%AC%D9%84%D9%88%D9%83%D9%88%D8%B2 جليكوليزا ] (التي تحدث في السيتوبلازما)، [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AF%D9%88%D8%B1%D8%A9_%D8%AD%D9%85%D8%B6_%D8%A7%D9%84%D8%B3%D8%AA%D8%B1%D9%8A%D9%83 دورة كريبس] (تحدث في المساحة الداخلية للميتوكوندريا) وسلسلة نقل الالكترونات التي تحدث داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. <br />
<br />
.بنقل الالكترونات لجزيئات أخرى ملامسة لها، وهكذا يتم تشكيل سلسلة من البروتينات حاملة الإلكترونات FADH2 و NADH في سلسلة نقل الالكترونات تقوم الجزيئات المختزلة بدورة كريبس مثل<br />
.يتم استيعاب الإلكترونات في نهاية الأمر بواسطة الأكسجين ويؤدي هذا الاتحاد الى انتاج الماء<br />
نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة ، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا<br />
بواسطة منحدر التركيز الناتج في أيونات الهيدروجين يتم دفع عمل البروتين ATP سنتاز من أجل انتاج ATP. [https://davidson.weizmann.ac.il/ar/online/maagarmada/atp-%D8%B3%D9%8A%D9%86%D8%AB%D8%A7%D8%B2-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AD%D8%B1%D9%83-%D8%A7%D9%84%D8%AC%D8%B2%D9%8A%D8%A6%D9%8A%D9%91-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AA%D9%83%D8%A7%D9%85%D9%84 ATP] هو جزيء غنيّ بالطّاقة، يحتوي على مجموعة من الأدينوساين وثلاث مجموعات من الفوسفور المرتبطة به. يؤدّي التحلّل المائيّ لمجموعة الفوسفور الثالثة إلى إطلاق طاقة تسمح للجسم بتنشيط العديد من الإنزيمات والعمليات الموجودة فيه. يقوم الجسم بإنتاج الATP في الميتوكوندريا في جميع الأوقات وذلك من الاجل الحفاظ على نسبة عالية من الATP داخل الخلية وبالتالي فان نقل الالكترونات وإنتاج منحدر تراكيز لأيونات الهيدروجين تعتبر عملية رئيسية من اجل وجود سليم للخلية.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة1 (قوموا بالوقف على الصورة بالفأرة من أجل اظهار الشرح)<br />
</p><br />
[[Image:Electron_transport_chain_cytochrome_c.jpg|border|center|600px|نرى في الصورة سلسلة نقل الالكترونات – نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا. هذا النقل فعال (يحتاج الى طاقة) وهو عكس منحدر التركيز. تراكم ايونات الهيدروجين في الفراغ بين غشائي الخلية يمكن من دخول الهيدروجين بشكل غير فعال من اجل انتاج جزيء ATP .]]<br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
هنا توجد 3 مقاطع فيديو:<br />
<br><br />
[https://youtu.be/3YTPOIcj6lw סרטון] حول عملية نقل الإلكترون في الميتوكوندريا.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/LQmTKxI4Wn4 סרטון] فيديو يشرح العملية من زاوية أوسع.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/YZsJ-8TenYw סרטון] فيديو عن انحدار التراكيز مع التركيز على ATP سينثاز.<br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> المبنى الجزيئي </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي ينتمي لعائلة البروتين باسم all-α proteins والتي تتميز بوجود <scene name='89/898985/Secondary_structure/4'>المبنى الثنائي</scene> لولب ألفا. كل بروتين ينتمي لهذه المجموعة يحتوي أيضا على مجموعة هيم واحدة أو أكثر.<br />
<br><br />
<scene name='89/898985/Hem_c/2'>HEME C</scene> – مجموعة هيم عبارة عن مركب عضوي يتم انتاجه في النخاع العظمي والكبد. والهيم هو جزء من البروتينات التي تقوم بوظائف متعددة في الجسم. ان فعالية مجموعة هيم تنبع من قدرة ذرة الحديد على ربط جزيئات صغيرة (مثل الاكسجين) وأيضا على قدرتها لأكسدة واختزال مركبات أخرى (ان تعطي الكترونات او ان تستقبل الكترونات، على التوالي).<br />
<br><br />
يتكون السيتوكروم C البشري من <scene name='89/898985/Amino_acids/4'>سلسلة من 104 من الاحماض الامينية</scene> . يرتبط اثنان من الأحماض الأمينية بذرة الحديد <scene name='89/898985/Bond_to_iron_18_80/2'>(الهيستيدين في الموضع 18 والمثيونين في الموضع 80)</scene> ، ويرتبط اثنان من الأحماض الأمينية تساهميًا (رباط تساهمي) من خلال ذرة الكبريت (S) بمجموعة هيم <scene name='89/898985/Bond_to_iron_14_17/2'>(السيستئين في الموضع 17 وسيستئين في الموضع 14)</scene><br />
<br><br />
لقد وجد أن هناك عدد من الأحماض الأمينية المحفوظة تطوريًا، وهي الأحماض الأمينية المهمة لربط ذرة الحديد ومجموعة هيم. <scene name='89/898985/Cxxch_motive/6'>CXXCH</scene> (السيستئين ، X ، X ، السيستئين ، الهيستيدين) حيث يمكن أن يكون X أي حمض أميني غير السيستئين. وهذه المجموعة موجودة أيضا في بروتين سيتوكروم سي البشري.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 2<br />
[[Image:Consurf key small.gif|center|300px|مفتاح الأوان لعرض الحفظ التطوري- الليلكي الداكن يعرض الاحماض الامينية المحفوظة تطوريا والمتماثلة بكائنات حية مختلفة. الأبيض يعرض الاحماض الامينية المحفوظة بشكل جزئي والازرق يعرض الاحماض الامينية الغير محفوظة تطوريا حيث ان هذه المواقع تتواجد بالعديد من الاحماض الامينية المختلفة بين كائنات حية مختلفة.<br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> الوظيفة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
في سلسلة نقل الالكترونات يقوم سيتوكروم سي بنقل الكترون بين المعقدين III و IV . المعقد III يسمى سيتوكروم bc1 والمعقد IV يسمى سيتوكروم سي أوكسيداز. نقل الالكترونات يكون ممكنا بسبب حالة تأكسد متغيرة لذرة الحديد ، حيث ان في البداية يتواجد أيون الحديد في مجموعة هيم بحالة Fe3+ الأمر الذي يمكن من استيعاب الكترون واحد وبالتالي اختزال الحديد لحالة Fe2+.<br />
<br> <br />
<br> <br />
صورة 3<br />
</p><br />
[[Image:Cytochrome C Oxydoreductase.jpg|border|center|400px|نرى في الصورة المعقدات المختلفة في سلسلة نقل الالكترونات- سيتوكروم سي هو بروتين صغير مقارنة بالمعقدات 2و3و4 ولا يستطيع المرور عبر الغشاء الخلوي. يمر البروتين عبر الغشاء الداخلي للميتوكوندريا بين المعقد 3 و4. ويمكن الملاحظة ان جميع بروتينات سلسلة نقل الالكترونات تحتوي على مجموعة هيم.]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
يلعب السيتوكروم سي أيضًا دورًا وسيطًا في عملية [https://he.wikipedia.org/wiki/%D7%90%D7%A4%D7%95%D7%A4%D7%98%D7%95%D7%96%D7%94 موت الخلايا المبرمج] وهو شكل محكوم من موت الخلايا يستخدم لقتل الخلايا في عملية النمو من اجل نمو أعضاء صحيحة وأيضا مسئول عن انتقاء خلايا الدم البيضاء ولقتل الخلايا السرطانية او المريضة . <br />
<br><br />
<br> <br />
في هذا [https://youtu.be/Od3pUsVdMhQ الفيديو] نرى دور السيتوكروم سي في موت الخلايا المبرمج. <br />
<br><br />
سيتوكروم سي الحامل للإلكترونات يتواجد داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا بواسطة رابط هيدروفوبي (كاره للماء) للفوسفوليبيد كارديوليبين (وهو جزيء هيدروفوبي يبني غشاء الميتوكوندريا).<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 4<br />
</p><br />
[[Image:Cardiolipin.jpg|border|center|280px|في الجهة اليسرى من الرسم نرى البروتين سيتوكروم سي مربوط مع الفوسوفليبيد كارديوليبين ويتواجد داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. في الجهة اليمنى نرى انقسام المعقد كارديوليبين- سيتوكروم سي نتيجة لتأكسد جزيء الكارديوليبين. سيتوكورم سي ينفصل عن الغشاء ويصبح حر ويمكنه الوصول للسيتوبلازما.]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
تتميز بداية عملية الموت الخلوي بارتفاع في نسبة الشوارد الحرة (ROS) في الميتوكوندريا. نتيجة لذلك يتم تأكسد الكارديوليبين وبالتالي فانه يتم تفكيك المعقد كارديوليبين- سيتوكروم سي. <br />
يقوم بعد ذلك السيتوكروم سي بالخروج من الغشاء الداخلي للميتوكوندريا ويمر من خلال الثقوب الموجودة في الغشاء الخارجي وصولا الى السيتوبرلازما. في السيتوبلازما يرتبط سيتوكروم سي لبروتين APAF1 وبروتين dATP وهكذا يتكون مبنى ال أبوبتوسوم وهو بروتين يربط بروتين بروكسباز 9 ويحوله الى صورته النشطة والفعالة وهكذا تتمكن الكاسباسات 3 و7 من الارتباط والعمل (caspase). هذه العملية تؤدي الى ضرر وانقسام في ال DNA الذي ينتهي بموت موجه للخلية.<br />
<br><br />
<br> <br />
صورة 5<br />
</p><br />
[[Image:Apoptosome.jpg|border|center|280px|באיור מתוארת תחילה ההשתחררות של ציטוכרום סי מהמיטוכונדריה אל הציטוזול. לאחר מכן ציטוכרום סי נקשר לחלבון ציטופלזמי היוצר את מכלול האפופטוזום, מכלול זה מהווה את אחד ממרכזי הבקרה החשובים ביותר של האפופטוזה - הוא קושר ומבקע את החלבון פרוקספאז 9, משחרר אותו בצורתו הבוגרת והפעילה, וכך מפעיל את המסלול האפופטוטי הפנימי המסתיים במוות מכוון של התא.]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
منع الموت المبرمج للخلية<br />
<br><br />
تشير العديد من الأبحاث ان الخلايا تستطيع ان تتحكم وتسيطر على موت الخلايا المبرمج ولذك من خلال تعديل تقوم به بعد عملية الترجمة في البروتين. البروتينات هي سلسلة طويلة من الاحماض الامينية، المرحلة الأولى في بناء البروتين هي انتاج سلسلة من الاحماض الامينية (المبنى الاولي) وبعد ذلك تمر هذه السلسلة بالعديد من المعالجات والتعديلات. واحدة من هذه التعديلات هي عملية الفسفرة. عملية الفسفرة يتم فيها إضافة مجموعة فوسفات للبروتين (أيون يحتوي على ذرة فوسفات واحدة و4 ذرات هيدروجين). تتم العملية بواسطة إنزيمات الكيناز والتي تنقل الفوسفات وهي تغيير الشكل التركيبي للبروتين بحيث تعدل من صفاته أو وظيفته. والعملية العكسية تسمى إزالة الفسفرة بواسطة انزيم الفوسفاتيز الذي يقوم بإزالة مجموعة فوسفات من البروتين. في سيتوكروم سي وجد أن هناك عدد من الأحماض الأمينية المحفوظة تطوريًا والتي تمر <scene name='89/898985/Phosphotyrosine_48_97/4'>بعملية الفسفرة</scene> ، الامر الذي يمنع من الإنتاج الزائد للشوارد الحرة (ROS)<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 6<br />
</p><br />
[[Image:Apoptosome formation.jpg|border|center|בתרשים מוצגת פעילות החלבון במצב מזורחן (מבוקר) ובמצב לא מזורחן (לא מבוקר); במצב מבוקר ניתן לראות שקצב הנשימה מווסת ולכן נוצרים מעט רדיקלים חופשיים, פוטנציאל הממברנה חיובי וציטוכרום סי קשור לממברנה הפנימית של המיטוכונדריה באמצעות קרדיוליפין. <br />
במצב לא מבוקר קצב הנשימה התאית הינו קצב מקסימאלי המייצר פוטנציאל ממברנה שלילי, יש עלייה בייצור רדיקלים חופשיים וקומפלקס קרדיוליפין+ציטוכרום סי נפרד. <br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
صورة 7<br />
</p><br />
[[Image:Cytochrome c alignment.jpg|border|center|עימוד ציטוכרום סי מאדם ומעכבר (מרקמה סומטית ומרקמת תאי מין) מאפשר לזהות עמדות שמורות אבולוציונית. ניתן לראות את עמדות 14 ו- 17 הקושרות קוולנטית את קבוצת ההם (חומצות אמינו ציסטאין המסומנות באות הגדולה סי). במיקום החיצים נמצאות עמדות שמורות העוברות מודיפיקציות לאחר תרגום, ביניהן גם עמדות 48 ו- 97 (חומצה אמינית טירוזין המסומנת באות וואי) המוזכרות בערך זה. ]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
وظيفة السيتوكروم سي كمانع للأكسدة (تقليل ROS) تتم بشكل مباشر عن طريق إزالة الأكسيد الفائق O2- وماء الاكسجين (H2O2) من الميتوكوندريا كما هو موضح في الرسم التالي:<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 8<br />
</p><br />
[[Image:Antioxidante.png|center|]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي هو بروتين يلعب دور مركزي في انتاج الطاقة في الخلية وأيضا له دور رئيسي بعمليات موت الخلايا المبرمج.<br />
</p><br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> وراثة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
جين CYCS الذي يشفر بروتين السيتوكروم C في البشر يتواجد على كروموسوم 7 في الحمض النووي DNA في نواة الخلية. هذا على عكس البروتينات الأخرى التي تعمل في عضية الميتوكوندريا المشفرة بواسطة الحمض النووي DNA للميتوكوندريا. حيث ان ال DNA للميتوكوندريا صغير جدًا، ويتألف من كروموسوم واحد صغير ويتضمن أقل من 17000 زوج قواعد نيتروجينية. بينما ال DNA في نواة الخلية يتضمن ثلاثة مليارات قاعدة نيتروجينية في 23 زوجًا من الكروموسومات.<br />
ومع ذلك، تحتوي كل خلية على نواة واحدة والعديد من الميتوكوندريا: في بعض الخلايا يصل عدد عضيات الميتوكوندريا إلى الآلاف، لذلك لديهم أيضًا آلاف النسخ من الحمض النووي DNA للميتوكوندريا. هناك اختلاف آخر بين أنواع الحمض النووي DNA وهو أننا نحصل على الحمض النووي DNA للميتوكوندريا من الأم فقط. تحتوي خلية الحيوانات المنوية على ميتوكوندريا، لكنها موجودة في "ذيل" الخلية، والذي يبقى بالخارج عند اتحاد الحيوان المنوي مع البويضة، يقوم الحمض النووي DNA للميتوكوندريا بتشفير13 بروتينًا ضروريًا لوظيفة الميتوكوندريا باعتبارها "محطة القوة الخلية".<br />
<br><br />
يحتوي الجينوم البشري على 49 "جينا كاذبا" للجين CYCS (وهي جينات غير فعالة ولا تمر في مرحلة النسخ ولا الترجمة). للجين توجد ثلاثة اكسونات. <br />
<br><br />
يتم تركيب البروتينات من أحماض أمينية باستخدام المعلومة المشفرة في الجينات، لدى كل بروتين تسلسلٌ خاص به من الأحماض الأمينية والذي يُحدَّد بواسطة تسلسل نوكليوتيدات الجين المشفر لذلك البروتين. تُنسخ الجينات المشفرة في الدنا إلى رنا رسول والذي يُستخدم بعدها كقالب لتخليق (ترجمة) البروتين بواسطة الريبوسوم. لا يتم التعبير عن جميع الجينات في الكائن الحي في نفس الوقت حيث ان كل خلية تعبر فقط عن جزء معين من المعلومات الموجودة بها ويتم قمع الجينات الأخرى التي ليست ضرورية لوظيفة الخلية. يتم قياس التعبير الجيني للجين CYCS حسب كمية الرنا رسول في الانسجة المختلفة حيث ان التعبير يختلف من نسيج الى اخر.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 9<br />
[[Image:Expression cytochrome c.JPG|border|center|600px|]]<br />
</p><br />
<br><br />
==<div style="text-align: right;"> أمراض </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
عند الأشخاص الذين يعانون من متلازمة نقص الصفيحات وجدت طفرة في جين CYCS والتي بها يتم استبدال الحمض الاميني <scene name='89/898985/Gly__41/3'>جلايسين في المكان ال41 ( مكان محفوظ تطوريا) </scene> بالحمض الاميني سيرين . هذه المتلازمة هي متلازمة سائدة تتميز بنقص في عدد صفائح الدم وبالتالي يزداد الاحتمال لحدوث النزيف وتقل احتمالية تخثر الدم. <br />
لقد وجدت الدراسات الحديثة أن هذه الطفرة تزيد من النشاط المؤيد لموت الخلايا المبرمج عن طريق تنشيط الكاسبيز(caspase) بشكل أكثر كفاءة من البروتين الطبيعي. لا تؤثر هذه الطفرة على وظيفة الأكسدة والاختزال للبروتين<br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> ورقة عمل للطالب </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
[https://proteopedia.org/wiki/images/d/d8/%D7%93%D7%A3_%D7%A2%D7%91%D7%95%D7%93%D7%94_%D7%9C%D7%AA%D7%9C%D7%9E%D7%99%D7%93_-_cytochrome_C.pdf דף עבודה לתלמיד]<br />
<br><br />
[https://proteopedia.org/wiki/images/0/08/%D7%A0%D7%A1%D7%A4%D7%97_FASTA_%D7%A9%D7%9C_%D7%94%D7%97%D7%9C%D7%91%D7%95%D7%A0%D7%99%D7%9D.doc נספח]<br />
</p><br />
<br><br />
==<div style="text-align: right;"> المصادر </div> ==<br />
<br><br />
[https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/compound/444125#section=3D-Conformer pubchem]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/NP_061820.1 ncbi - cytochrome c - homo sapiens]<br />
<br><br />
[https://ashpublications.org/blood/article/132/Supplement%201/3758/265249/A-Novel-Cycs-Missense-Mutation-in-the-Helix-of-the A Novel Cycs Missense Mutation in the α-Helix of the Cycs C-Terminal Domain Causes Non-Syndromic Thrombocytopenia]<br />
<br><br />
[https://davidson.weizmann.ac.il/online/sciencenews/%D7%9C%D7%A8%D7%90%D7%95%D7%AA-%D7%90%D7%AA-%D7%94%D7%9E%D7%95%D7%9C%D7%A7%D7%95%D7%9C%D7%95%D7%AA-%D7%A0%D7%98%D7%A2%D7%A0%D7%95%D7%AA לראות את המולקולות נטענות - מכון דוידסון]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/browser/gene/?id=54205 ncbi cics gene]<br />
<br><br />
[https://www.rcsb.org/structure/1gu2 pdb - 1GU2]<br />
<br><br />
[https://www.rcsb.org/structure/1AKK pdb - 1AKK]<br />
<br><br />
[https://chem.libretexts.org/Courses/Saint_Marys_College_Notre_Dame_IN/CHEM_342%3A_Bio-inorganic_Chemistry/Readings/Metals_in_Biological_Systems_(Saint_Mary's_College)/Cytochrome_C Cytochrome C. (2019, June 5).]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/54205 ncbi - CYCS cytochrome c - Homo sapiens]<br />
<br><br />
[https://www.nature.com/articles/nrm2434 nature - Cytochrome c: functions beyond respiration]</div>Fatima M Hameedhttps://proteopedia.org/index.php?title=Cytochrome_C_(arabic)&diff=3554807Cytochrome C (arabic)2022-05-01T08:38:49Z<p>Fatima M Hameed: </p>
<hr />
<div>==<center>'''سيتوكروم سي البشري '''</center>==<br />
<p dir='rtl'><br />
<br />
.سيتوكروم سي عبارة عن زلال صغير (الوزن الجزيئي حوالي 1200 دالتون ) وهو بروتين محفوظ للغاية عبر مجموعة من الأنواع ، موجود في النباتات والحيوانات والعديد من الكائنات أحادية الخلية<br />
<br />
يرتبط هذا البروتين بمجموعة [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D9%87%D9%8A%D9%85 هيم] وبمركزها توجد ذرة حديد، وهو بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات وبعملية الاستموات (موت الخلايا المبرمج)<br />
</p><br />
<StructureSection load='1J3S' size='340' side='left' caption=' سيتوكروم سي البشري (PDB code [[1j3s]])' scene='89/898985/Cytochrome_c_basic/19'><br />
==<div style="text-align: right;"> المقدمة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي عبارة عن بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات، والتي هي العملية الأخيرة في عملية <br />
[https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D9%86%D9%81%D8%B3_%D8%AE%D9%84%D9%88%D9%8A التنفس الخلوي]<br />
. عملية التنفس الخلوي تقسم الى 3 أقسام مركزية: [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D8%AD%D9%84%D9%84_%D8%A7%D9%84%D8%AC%D9%84%D9%88%D9%83%D9%88%D8%B2 جليكوليزا ] (التي تحدث في السيتوبلازما)، [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AF%D9%88%D8%B1%D8%A9_%D8%AD%D9%85%D8%B6_%D8%A7%D9%84%D8%B3%D8%AA%D8%B1%D9%8A%D9%83 دورة كريبس] (تحدث في المساحة الداخلية للميتوكوندريا) وسلسلة نقل الالكترونات التي تحدث داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. <br />
<br />
.بنقل الالكترونات لجزيئات أخرى ملامسة لها، وهكذا يتم تشكيل سلسلة من البروتينات حاملة الإلكترونات FADH2 و NADH في سلسلة نقل الالكترونات تقوم الجزيئات المختزلة بدورة كريبس مثل<br />
.يتم استيعاب الإلكترونات في نهاية الأمر بواسطة الأكسجين ويؤدي هذا الاتحاد الى انتاج الماء<br />
نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة ، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا<br />
بواسطة منحدر التركيز الناتج في أيونات الهيدروجين يتم دفع عمل البروتين ATP سنتاز من أجل انتاج ATP. [https://davidson.weizmann.ac.il/ar/online/maagarmada/atp-%D8%B3%D9%8A%D9%86%D8%AB%D8%A7%D8%B2-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AD%D8%B1%D9%83-%D8%A7%D9%84%D8%AC%D8%B2%D9%8A%D8%A6%D9%8A%D9%91-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AA%D9%83%D8%A7%D9%85%D9%84 ATP] هو جزيء غنيّ بالطّاقة، يحتوي على مجموعة من الأدينوساين وثلاث مجموعات من الفوسفور المرتبطة به. يؤدّي التحلّل المائيّ لمجموعة الفوسفور الثالثة إلى إطلاق طاقة تسمح للجسم بتنشيط العديد من الإنزيمات والعمليات الموجودة فيه. يقوم الجسم بإنتاج الATP في الميتوكوندريا في جميع الأوقات وذلك من الاجل الحفاظ على نسبة عالية من الATP داخل الخلية وبالتالي فان نقل الالكترونات وإنتاج منحدر تراكيز لأيونات الهيدروجين تعتبر عملية رئيسية من اجل وجود سليم للخلية.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة1 (قوموا بالوقف على الصورة بالفأرة من أجل اظهار الشرح)<br />
</p><br />
[[Image:Electron_transport_chain_cytochrome_c.jpg|border|center|600px|نرى في الصورة سلسلة نقل الالكترونات – نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا. هذا النقل فعال (يحتاج الى طاقة) وهو عكس منحدر التركيز. تراكم ايونات الهيدروجين في الفراغ بين غشائي الخلية يمكن من دخول الهيدروجين بشكل غير فعال من اجل انتاج جزيء ATP .]]<br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
هنا توجد 3 مقاطع فيديو:<br />
<br><br />
[https://youtu.be/3YTPOIcj6lw סרטון] حول عملية نقل الإلكترون في الميتوكوندريا.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/LQmTKxI4Wn4 סרטון] فيديو يشرح العملية من زاوية أوسع.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/YZsJ-8TenYw סרטון] فيديو عن انحدار التراكيز مع التركيز على ATP سينثاز.<br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> المبنى الجزيئي </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي ينتمي لعائلة البروتين باسم all-α proteins والتي تتميز بوجود <scene name='89/898985/Secondary_structure/4'>المبنى الثنائي</scene> لولب ألفا. كل بروتين ينتمي لهذه المجموعة يحتوي أيضا على مجموعة هيم واحدة أو أكثر.<br />
<br><br />
<scene name='89/898985/Hem_c/2'>HEME C</scene> – مجموعة هيم عبارة عن مركب عضوي يتم انتاجه في النخاع العظمي والكبد. والهيم هو جزء من البروتينات التي تقوم بوظائف متعددة في الجسم. ان فعالية مجموعة هيم تنبع من قدرة ذرة الحديد على ربط جزيئات صغيرة (مثل الاكسجين) وأيضا على قدرتها لأكسدة واختزال مركبات أخرى (ان تعطي الكترونات او ان تستقبل الكترونات، على التوالي).<br />
<br><br />
يتكون السيتوكروم C البشري من <scene name='89/898985/Amino_acids/4'>سلسلة من 104 من الاحماض الامينية</scene> . يرتبط اثنان من الأحماض الأمينية بذرة الحديد <scene name='89/898985/Bond_to_iron_18_80/2'>(الهيستيدين في الموضع 18 والمثيونين في الموضع 80)</scene> ، ويرتبط اثنان من الأحماض الأمينية تساهميًا (رباط تساهمي) من خلال ذرة الكبريت (S) بمجموعة هيم <scene name='89/898985/Bond_to_iron_14_17/2'>(السيستئين في الموضع 17 وسيستئين في الموضع 14)</scene><br />
<br><br />
لقد وجد أن هناك عدد من الأحماض الأمينية المحفوظة تطوريًا، وهي الأحماض الأمينية المهمة لربط ذرة الحديد ومجموعة هيم. <scene name='89/898985/Cxxch_motive/6'>CXXCH</scene> (السيستئين ، X ، X ، السيستئين ، الهيستيدين) حيث يمكن أن يكون X أي حمض أميني غير السيستئين. وهذه المجموعة موجودة أيضا في بروتين سيتوكروم سي البشري.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 2<br />
[[Image:Consurf key small.gif|center|300px|مفتاح الأوان لعرض الحفظ التطوري- الليلكي الداكن يعرض الاحماض الامينية المحفوظة تطوريا والمتماثلة بكائنات حية مختلفة. الأبيض يعرض الاحماض الامينية المحفوظة بشكل جزئي والازرق يعرض الاحماض الامينية الغير محفوظة تطوريا حيث ان هذه المواقع تتواجد بالعديد من الاحماض الامينية المختلفة بين كائنات حية مختلفة.<br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> الوظيفة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
في سلسلة نقل الالكترونات يقوم سيتوكروم سي بنقل الكترون بين المعقدين III و IV . المعقد III يسمى سيتوكروم bc1 والمعقد IV يسمى سيتوكروم سي أوكسيداز. نقل الالكترونات يكون ممكنا بسبب حالة تأكسد متغيرة لذرة الحديد ، حيث ان في البداية يتواجد أيون الحديد في مجموعة هيم بحالة Fe3+ الأمر الذي يمكن من استيعاب الكترون واحد وبالتالي اختزال الحديد لحالة Fe2+.<br />
<br> <br />
<br> <br />
صورة 3<br />
</p><br />
[[Image:Cytochrome C Oxydoreductase.jpg|border|center|400px|نرى في الصورة المعقدات المختلفة في سلسلة نقل الالكترونات- سيتوكروم سي هو بروتين صغير مقارنة بالمعقدات 2و3و4 ولا يستطيع المرور عبر الغشاء الخلوي. يمر البروتين عبر الغشاء الداخلي للميتوكوندريا بين المعقد 3 و4. ويمكن الملاحظة ان جميع بروتينات سلسلة نقل الالكترونات تحتوي على مجموعة هيم.]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
يلعب السيتوكروم سي أيضًا دورًا وسيطًا في عملية [https://he.wikipedia.org/wiki/%D7%90%D7%A4%D7%95%D7%A4%D7%98%D7%95%D7%96%D7%94 موت الخلايا المبرمج] وهو شكل محكوم من موت الخلايا يستخدم لقتل الخلايا في عملية النمو من اجل نمو أعضاء صحيحة وأيضا مسئول عن انتقاء خلايا الدم البيضاء ولقتل الخلايا السرطانية او المريضة . <br />
<br><br />
<br> <br />
في هذا [https://youtu.be/Od3pUsVdMhQ الفيديو] نرى دور السيتوكروم سي في موت الخلايا المبرمج. <br />
<br><br />
سيتوكروم سي الحامل للإلكترونات يتواجد داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا بواسطة رابط هيدروفوبي (كاره للماء) للفوسفوليبيد كارديوليبين (وهو جزيء هيدروفوبي يبني غشاء الميتوكوندريا).<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 4<br />
</p><br />
[[Image:Cardiolipin.jpg|border|center|280px|באיור בצד שמאל ניתן לראות את החלבון ציטוכרום סי (אדום) מחובר לפוספוליפיד קרדיוליפין ומעוגן בממברנה הפנימית של המיטוכונדריה. באיור בצד ימין ניתן לראות את הפירוק של הקומפלקס קרדיוליפין + ציטוכרום סי כתוצאה מחימצון מולקולת קרדיוליפין. ציטוכרום סי מתנתק מהממברנה וחופשי לצאת לציטוזול.]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
تتميز بداية عملية الموت الخلوي بارتفاع في نسبة الشوارد الحرة (ROS) في الميتوكوندريا. نتيجة لذلك يتم تأكسد الكارديوليبين وبالتالي فانه يتم تفكيك المعقد كارديوليبين- سيتوكروم سي. <br />
يقوم بعد ذلك السيتوكروم سي بالخروج من الغشاء الداخلي للميتوكوندريا ويمر من خلال الثقوب الموجودة في الغشاء الخارجي وصولا الى السيتوبرلازما. في السيتوبلازما يرتبط سيتوكروم سي لبروتين APAF1 وبروتين dATP وهكذا يتكون مبنى ال أبوبتوسوم وهو بروتين يربط بروتين بروكسباز 9 ويحوله الى صورته النشطة والفعالة وهكذا تتمكن الكاسباسات 3 و7 من الارتباط والعمل (caspase). هذه العملية تؤدي الى ضرر وانقسام في ال DNA الذي ينتهي بموت موجه للخلية.<br />
<br><br />
<br> <br />
صورة 5<br />
</p><br />
[[Image:Apoptosome.jpg|border|center|280px|באיור מתוארת תחילה ההשתחררות של ציטוכרום סי מהמיטוכונדריה אל הציטוזול. לאחר מכן ציטוכרום סי נקשר לחלבון ציטופלזמי היוצר את מכלול האפופטוזום, מכלול זה מהווה את אחד ממרכזי הבקרה החשובים ביותר של האפופטוזה - הוא קושר ומבקע את החלבון פרוקספאז 9, משחרר אותו בצורתו הבוגרת והפעילה, וכך מפעיל את המסלול האפופטוטי הפנימי המסתיים במוות מכוון של התא.]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
منع الموت المبرمج للخلية<br />
<br><br />
تشير العديد من الأبحاث ان الخلايا تستطيع ان تتحكم وتسيطر على موت الخلايا المبرمج ولذك من خلال تعديل تقوم به بعد عملية الترجمة في البروتين. البروتينات هي سلسلة طويلة من الاحماض الامينية، المرحلة الأولى في بناء البروتين هي انتاج سلسلة من الاحماض الامينية (المبنى الاولي) وبعد ذلك تمر هذه السلسلة بالعديد من المعالجات والتعديلات. واحدة من هذه التعديلات هي عملية الفسفرة. عملية الفسفرة يتم فيها إضافة مجموعة فوسفات للبروتين (أيون يحتوي على ذرة فوسفات واحدة و4 ذرات هيدروجين). تتم العملية بواسطة إنزيمات الكيناز والتي تنقل الفوسفات وهي تغيير الشكل التركيبي للبروتين بحيث تعدل من صفاته أو وظيفته. والعملية العكسية تسمى إزالة الفسفرة بواسطة انزيم الفوسفاتيز الذي يقوم بإزالة مجموعة فوسفات من البروتين. في سيتوكروم سي وجد أن هناك عدد من الأحماض الأمينية المحفوظة تطوريًا والتي تمر <scene name='89/898985/Phosphotyrosine_48_97/4'>بعملية الفسفرة</scene> ، الامر الذي يمنع من الإنتاج الزائد للشوارد الحرة (ROS)<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 6<br />
</p><br />
[[Image:Apoptosome formation.jpg|border|center|בתרשים מוצגת פעילות החלבון במצב מזורחן (מבוקר) ובמצב לא מזורחן (לא מבוקר); במצב מבוקר ניתן לראות שקצב הנשימה מווסת ולכן נוצרים מעט רדיקלים חופשיים, פוטנציאל הממברנה חיובי וציטוכרום סי קשור לממברנה הפנימית של המיטוכונדריה באמצעות קרדיוליפין. <br />
במצב לא מבוקר קצב הנשימה התאית הינו קצב מקסימאלי המייצר פוטנציאל ממברנה שלילי, יש עלייה בייצור רדיקלים חופשיים וקומפלקס קרדיוליפין+ציטוכרום סי נפרד. <br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
صورة 7<br />
</p><br />
[[Image:Cytochrome c alignment.jpg|border|center|עימוד ציטוכרום סי מאדם ומעכבר (מרקמה סומטית ומרקמת תאי מין) מאפשר לזהות עמדות שמורות אבולוציונית. ניתן לראות את עמדות 14 ו- 17 הקושרות קוולנטית את קבוצת ההם (חומצות אמינו ציסטאין המסומנות באות הגדולה סי). במיקום החיצים נמצאות עמדות שמורות העוברות מודיפיקציות לאחר תרגום, ביניהן גם עמדות 48 ו- 97 (חומצה אמינית טירוזין המסומנת באות וואי) המוזכרות בערך זה. ]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
وظيفة السيتوكروم سي كمانع للأكسدة (تقليل ROS) تتم بشكل مباشر عن طريق إزالة الأكسيد الفائق O2- وماء الاكسجين (H2O2) من الميتوكوندريا كما هو موضح في الرسم التالي:<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 8<br />
</p><br />
[[Image:Antioxidante.png|center|]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي هو بروتين يلعب دور مركزي في انتاج الطاقة في الخلية وأيضا له دور رئيسي بعمليات موت الخلايا المبرمج.<br />
</p><br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> وراثة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
جين CYCS الذي يشفر بروتين السيتوكروم C في البشر يتواجد على كروموسوم 7 في الحمض النووي DNA في نواة الخلية. هذا على عكس البروتينات الأخرى التي تعمل في عضية الميتوكوندريا المشفرة بواسطة الحمض النووي DNA للميتوكوندريا. حيث ان ال DNA للميتوكوندريا صغير جدًا، ويتألف من كروموسوم واحد صغير ويتضمن أقل من 17000 زوج قواعد نيتروجينية. بينما ال DNA في نواة الخلية يتضمن ثلاثة مليارات قاعدة نيتروجينية في 23 زوجًا من الكروموسومات.<br />
ومع ذلك، تحتوي كل خلية على نواة واحدة والعديد من الميتوكوندريا: في بعض الخلايا يصل عدد عضيات الميتوكوندريا إلى الآلاف، لذلك لديهم أيضًا آلاف النسخ من الحمض النووي DNA للميتوكوندريا. هناك اختلاف آخر بين أنواع الحمض النووي DNA وهو أننا نحصل على الحمض النووي DNA للميتوكوندريا من الأم فقط. تحتوي خلية الحيوانات المنوية على ميتوكوندريا، لكنها موجودة في "ذيل" الخلية، والذي يبقى بالخارج عند اتحاد الحيوان المنوي مع البويضة، يقوم الحمض النووي DNA للميتوكوندريا بتشفير13 بروتينًا ضروريًا لوظيفة الميتوكوندريا باعتبارها "محطة القوة الخلية".<br />
<br><br />
يحتوي الجينوم البشري على 49 "جينا كاذبا" للجين CYCS (وهي جينات غير فعالة ولا تمر في مرحلة النسخ ولا الترجمة). للجين توجد ثلاثة اكسونات. <br />
<br><br />
يتم تركيب البروتينات من أحماض أمينية باستخدام المعلومة المشفرة في الجينات، لدى كل بروتين تسلسلٌ خاص به من الأحماض الأمينية والذي يُحدَّد بواسطة تسلسل نوكليوتيدات الجين المشفر لذلك البروتين. تُنسخ الجينات المشفرة في الدنا إلى رنا رسول والذي يُستخدم بعدها كقالب لتخليق (ترجمة) البروتين بواسطة الريبوسوم. لا يتم التعبير عن جميع الجينات في الكائن الحي في نفس الوقت حيث ان كل خلية تعبر فقط عن جزء معين من المعلومات الموجودة بها ويتم قمع الجينات الأخرى التي ليست ضرورية لوظيفة الخلية. يتم قياس التعبير الجيني للجين CYCS حسب كمية الرنا رسول في الانسجة المختلفة حيث ان التعبير يختلف من نسيج الى اخر.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 9<br />
[[Image:Expression cytochrome c.JPG|border|center|600px|]]<br />
</p><br />
<br><br />
==<div style="text-align: right;"> أمراض </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
عند الأشخاص الذين يعانون من متلازمة نقص الصفيحات وجدت طفرة في جين CYCS والتي بها يتم استبدال الحمض الاميني <scene name='89/898985/Gly__41/3'>جلايسين في المكان ال41 ( مكان محفوظ تطوريا) </scene> بالحمض الاميني سيرين . هذه المتلازمة هي متلازمة سائدة تتميز بنقص في عدد صفائح الدم وبالتالي يزداد الاحتمال لحدوث النزيف وتقل احتمالية تخثر الدم. <br />
لقد وجدت الدراسات الحديثة أن هذه الطفرة تزيد من النشاط المؤيد لموت الخلايا المبرمج عن طريق تنشيط الكاسبيز(caspase) بشكل أكثر كفاءة من البروتين الطبيعي. لا تؤثر هذه الطفرة على وظيفة الأكسدة والاختزال للبروتين<br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> ورقة عمل للطالب </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
[https://proteopedia.org/wiki/images/d/d8/%D7%93%D7%A3_%D7%A2%D7%91%D7%95%D7%93%D7%94_%D7%9C%D7%AA%D7%9C%D7%9E%D7%99%D7%93_-_cytochrome_C.pdf דף עבודה לתלמיד]<br />
<br><br />
[https://proteopedia.org/wiki/images/0/08/%D7%A0%D7%A1%D7%A4%D7%97_FASTA_%D7%A9%D7%9C_%D7%94%D7%97%D7%9C%D7%91%D7%95%D7%A0%D7%99%D7%9D.doc נספח]<br />
</p><br />
<br><br />
==<div style="text-align: right;"> المصادر </div> ==<br />
<br><br />
[https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/compound/444125#section=3D-Conformer pubchem]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/NP_061820.1 ncbi - cytochrome c - homo sapiens]<br />
<br><br />
[https://ashpublications.org/blood/article/132/Supplement%201/3758/265249/A-Novel-Cycs-Missense-Mutation-in-the-Helix-of-the A Novel Cycs Missense Mutation in the α-Helix of the Cycs C-Terminal Domain Causes Non-Syndromic Thrombocytopenia]<br />
<br><br />
[https://davidson.weizmann.ac.il/online/sciencenews/%D7%9C%D7%A8%D7%90%D7%95%D7%AA-%D7%90%D7%AA-%D7%94%D7%9E%D7%95%D7%9C%D7%A7%D7%95%D7%9C%D7%95%D7%AA-%D7%A0%D7%98%D7%A2%D7%A0%D7%95%D7%AA לראות את המולקולות נטענות - מכון דוידסון]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/browser/gene/?id=54205 ncbi cics gene]<br />
<br><br />
[https://www.rcsb.org/structure/1gu2 pdb - 1GU2]<br />
<br><br />
[https://www.rcsb.org/structure/1AKK pdb - 1AKK]<br />
<br><br />
[https://chem.libretexts.org/Courses/Saint_Marys_College_Notre_Dame_IN/CHEM_342%3A_Bio-inorganic_Chemistry/Readings/Metals_in_Biological_Systems_(Saint_Mary's_College)/Cytochrome_C Cytochrome C. (2019, June 5).]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/54205 ncbi - CYCS cytochrome c - Homo sapiens]<br />
<br><br />
[https://www.nature.com/articles/nrm2434 nature - Cytochrome c: functions beyond respiration]</div>Fatima M Hameedhttps://proteopedia.org/index.php?title=Cytochrome_C_(arabic)&diff=3554806Cytochrome C (arabic)2022-05-01T08:32:16Z<p>Fatima M Hameed: </p>
<hr />
<div>==<center>'''سيتوكروم سي البشري '''</center>==<br />
<p dir='rtl'><br />
<br />
.سيتوكروم سي عبارة عن زلال صغير (الوزن الجزيئي حوالي 1200 دالتون ) وهو بروتين محفوظ للغاية عبر مجموعة من الأنواع ، موجود في النباتات والحيوانات والعديد من الكائنات أحادية الخلية<br />
<br />
يرتبط هذا البروتين بمجموعة [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D9%87%D9%8A%D9%85 هيم] وبمركزها توجد ذرة حديد، وهو بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات وبعملية الاستموات (موت الخلايا المبرمج)<br />
</p><br />
<StructureSection load='1J3S' size='340' side='left' caption=' سيتوكروم سي البشري (PDB code [[1j3s]])' scene='89/898985/Cytochrome_c_basic/19'><br />
==<div style="text-align: right;"> المقدمة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي عبارة عن بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات، والتي هي العملية الأخيرة في عملية <br />
[https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D9%86%D9%81%D8%B3_%D8%AE%D9%84%D9%88%D9%8A التنفس الخلوي]<br />
. عملية التنفس الخلوي تقسم الى 3 أقسام مركزية: [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D8%AD%D9%84%D9%84_%D8%A7%D9%84%D8%AC%D9%84%D9%88%D9%83%D9%88%D8%B2 جليكوليزا ] (التي تحدث في السيتوبلازما)، [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AF%D9%88%D8%B1%D8%A9_%D8%AD%D9%85%D8%B6_%D8%A7%D9%84%D8%B3%D8%AA%D8%B1%D9%8A%D9%83 دورة كريبس] (تحدث في المساحة الداخلية للميتوكوندريا) وسلسلة نقل الالكترونات التي تحدث داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. <br />
<br />
.بنقل الالكترونات لجزيئات أخرى ملامسة لها، وهكذا يتم تشكيل سلسلة من البروتينات حاملة الإلكترونات FADH2 و NADH في سلسلة نقل الالكترونات تقوم الجزيئات المختزلة بدورة كريبس مثل<br />
.يتم استيعاب الإلكترونات في نهاية الأمر بواسطة الأكسجين ويؤدي هذا الاتحاد الى انتاج الماء<br />
نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة ، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا<br />
بواسطة منحدر التركيز الناتج في أيونات الهيدروجين يتم دفع عمل البروتين ATP سنتاز من أجل انتاج ATP. [https://davidson.weizmann.ac.il/ar/online/maagarmada/atp-%D8%B3%D9%8A%D9%86%D8%AB%D8%A7%D8%B2-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AD%D8%B1%D9%83-%D8%A7%D9%84%D8%AC%D8%B2%D9%8A%D8%A6%D9%8A%D9%91-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AA%D9%83%D8%A7%D9%85%D9%84 ATP] هو جزيء غنيّ بالطّاقة، يحتوي على مجموعة من الأدينوساين وثلاث مجموعات من الفوسفور المرتبطة به. يؤدّي التحلّل المائيّ لمجموعة الفوسفور الثالثة إلى إطلاق طاقة تسمح للجسم بتنشيط العديد من الإنزيمات والعمليات الموجودة فيه. يقوم الجسم بإنتاج الATP في الميتوكوندريا في جميع الأوقات وذلك من الاجل الحفاظ على نسبة عالية من الATP داخل الخلية وبالتالي فان نقل الالكترونات وإنتاج منحدر تراكيز لأيونات الهيدروجين تعتبر عملية رئيسية من اجل وجود سليم للخلية.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة1 (قوموا بالوقف على الصورة بالفأرة من أجل اظهار الشرح)<br />
</p><br />
[[Image:Electron_transport_chain_cytochrome_c.jpg|border|center|600px|نرى في الصورة سلسلة نقل الالكترونات – نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا. هذا النقل فعال (يحتاج الى طاقة) وهو عكس منحدر التركيز. تراكم ايونات الهيدروجين في الفراغ بين غشائي الخلية يمكن من دخول الهيدروجين بشكل غير فعال من اجل انتاج جزيء ATP .]]<br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
هنا توجد 3 مقاطع فيديو:<br />
<br><br />
[https://youtu.be/3YTPOIcj6lw סרטון] حول عملية نقل الإلكترون في الميتوكوندريا.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/LQmTKxI4Wn4 סרטון] فيديو يشرح العملية من زاوية أوسع.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/YZsJ-8TenYw סרטון] فيديو عن انحدار التراكيز مع التركيز على ATP سينثاز.<br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> المبنى الجزيئي </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي ينتمي لعائلة البروتين باسم all-α proteins والتي تتميز بوجود <scene name='89/898985/Secondary_structure/4'>المبنى الثنائي</scene> لولب ألفا. كل بروتين ينتمي لهذه المجموعة يحتوي أيضا على مجموعة هيم واحدة أو أكثر.<br />
<br><br />
<scene name='89/898985/Hem_c/2'>HEME C</scene> – مجموعة هيم عبارة عن مركب عضوي يتم انتاجه في النخاع العظمي والكبد. والهيم هو جزء من البروتينات التي تقوم بوظائف متعددة في الجسم. ان فعالية مجموعة هيم تنبع من قدرة ذرة الحديد على ربط جزيئات صغيرة (مثل الاكسجين) وأيضا على قدرتها لأكسدة واختزال مركبات أخرى (ان تعطي الكترونات او ان تستقبل الكترونات، على التوالي).<br />
<br><br />
يتكون السيتوكروم C البشري من <scene name='89/898985/Amino_acids/4'>سلسلة من 104 من الاحماض الامينية</scene> . يرتبط اثنان من الأحماض الأمينية بذرة الحديد <scene name='89/898985/Bond_to_iron_18_80/2'>(الهيستيدين في الموضع 18 والمثيونين في الموضع 80)</scene> ، ويرتبط اثنان من الأحماض الأمينية تساهميًا (رباط تساهمي) من خلال ذرة الكبريت (S) بمجموعة هيم <scene name='89/898985/Bond_to_iron_14_17/2'>(السيستئين في الموضع 17 وسيستئين في الموضع 14)</scene><br />
<br><br />
لقد وجد أن هناك عدد من الأحماض الأمينية المحفوظة تطوريًا، وهي الأحماض الأمينية المهمة لربط ذرة الحديد ومجموعة هيم. <scene name='89/898985/Cxxch_motive/6'>CXXCH</scene> (السيستئين ، X ، X ، السيستئين ، الهيستيدين) حيث يمكن أن يكون X أي حمض أميني غير السيستئين. وهذه المجموعة موجودة أيضا في بروتين سيتوكروم سي البشري.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 2<br />
[[Image:Consurf key small.gif|center|300px|מקרא צבעים לייצוג שמירות אבולוציונית - <br />
סגול כהה מייצג חומצות אמינו השמורות באבולוציה וזהות באורגניזמים שונים,<br />
לבן מייצג חומצות אמינו עם שמירות ממוצעת <br />
כחול מייצג חומצות אמינו שאינן שמורות אבולוציונית ועמדות אלו מאופיינות במגוון של חומצות אמינו משתנות בין אורגניזמים שונים.<br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> الوظيفة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
في سلسلة نقل الالكترونات يقوم سيتوكروم سي بنقل الكترون بين المعقدين III و IV . المعقد III يسمى سيتوكروم bc1 والمعقد IV يسمى سيتوكروم سي أوكسيداز. نقل الالكترونات يكون ممكنا بسبب حالة تأكسد متغيرة لذرة الحديد ، حيث ان في البداية يتواجد أيون الحديد في مجموعة هيم بحالة Fe3+ الأمر الذي يمكن من استيعاب الكترون واحد وبالتالي اختزال الحديد لحالة Fe2+.<br />
<br> <br />
<br> <br />
صورة 3<br />
</p><br />
[[Image:Cytochrome C Oxydoreductase.jpg|border|center|400px|نرى في الصورة المعقدات المختلفة في سلسلة نقل الالكترونات- سيتوكروم سي هو بروتين صغير مقارنة بالمعقدات 2و3و4 ولا يستطيع المرور عبر الغشاء الخلوي. يمر البروتين عبر الغشاء الداخلي للميتوكوندريا بين المعقد 3 و4. ويمكن الملاحظة ان جميع بروتينات سلسلة نقل الالكترونات تحتوي على مجموعة هيم.]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
يلعب السيتوكروم سي أيضًا دورًا وسيطًا في عملية [https://he.wikipedia.org/wiki/%D7%90%D7%A4%D7%95%D7%A4%D7%98%D7%95%D7%96%D7%94 موت الخلايا المبرمج] وهو شكل محكوم من موت الخلايا يستخدم لقتل الخلايا في عملية النمو من اجل نمو أعضاء صحيحة وأيضا مسئول عن انتقاء خلايا الدم البيضاء ولقتل الخلايا السرطانية او المريضة . <br />
<br><br />
<br> <br />
في هذا [https://youtu.be/Od3pUsVdMhQ الفيديو] نرى دور السيتوكروم سي في موت الخلايا المبرمج. <br />
<br><br />
سيتوكروم سي الحامل للإلكترونات يتواجد داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا بواسطة رابط هيدروفوبي (كاره للماء) للفوسفوليبيد كارديوليبين (وهو جزيء هيدروفوبي يبني غشاء الميتوكوندريا).<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 4<br />
</p><br />
[[Image:Cardiolipin.jpg|border|center|280px|באיור בצד שמאל ניתן לראות את החלבון ציטוכרום סי (אדום) מחובר לפוספוליפיד קרדיוליפין ומעוגן בממברנה הפנימית של המיטוכונדריה. באיור בצד ימין ניתן לראות את הפירוק של הקומפלקס קרדיוליפין + ציטוכרום סי כתוצאה מחימצון מולקולת קרדיוליפין. ציטוכרום סי מתנתק מהממברנה וחופשי לצאת לציטוזול.]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
تتميز بداية عملية الموت الخلوي بارتفاع في نسبة الشوارد الحرة (ROS) في الميتوكوندريا. نتيجة لذلك يتم تأكسد الكارديوليبين وبالتالي فانه يتم تفكيك المعقد كارديوليبين- سيتوكروم سي. <br />
يقوم بعد ذلك السيتوكروم سي بالخروج من الغشاء الداخلي للميتوكوندريا ويمر من خلال الثقوب الموجودة في الغشاء الخارجي وصولا الى السيتوبرلازما. في السيتوبلازما يرتبط سيتوكروم سي لبروتين APAF1 وبروتين dATP وهكذا يتكون مبنى ال أبوبتوسوم وهو بروتين يربط بروتين بروكسباز 9 ويحوله الى صورته النشطة والفعالة وهكذا تتمكن الكاسباسات 3 و7 من الارتباط والعمل (caspase). هذه العملية تؤدي الى ضرر وانقسام في ال DNA الذي ينتهي بموت موجه للخلية.<br />
<br><br />
<br> <br />
صورة 5<br />
</p><br />
[[Image:Apoptosome.jpg|border|center|280px|באיור מתוארת תחילה ההשתחררות של ציטוכרום סי מהמיטוכונדריה אל הציטוזול. לאחר מכן ציטוכרום סי נקשר לחלבון ציטופלזמי היוצר את מכלול האפופטוזום, מכלול זה מהווה את אחד ממרכזי הבקרה החשובים ביותר של האפופטוזה - הוא קושר ומבקע את החלבון פרוקספאז 9, משחרר אותו בצורתו הבוגרת והפעילה, וכך מפעיל את המסלול האפופטוטי הפנימי המסתיים במוות מכוון של התא.]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
منع الموت المبرمج للخلية<br />
<br><br />
تشير العديد من الأبحاث ان الخلايا تستطيع ان تتحكم وتسيطر على موت الخلايا المبرمج ولذك من خلال تعديل تقوم به بعد عملية الترجمة في البروتين. البروتينات هي سلسلة طويلة من الاحماض الامينية، المرحلة الأولى في بناء البروتين هي انتاج سلسلة من الاحماض الامينية (المبنى الاولي) وبعد ذلك تمر هذه السلسلة بالعديد من المعالجات والتعديلات. واحدة من هذه التعديلات هي عملية الفسفرة. عملية الفسفرة يتم فيها إضافة مجموعة فوسفات للبروتين (أيون يحتوي على ذرة فوسفات واحدة و4 ذرات هيدروجين). تتم العملية بواسطة إنزيمات الكيناز والتي تنقل الفوسفات وهي تغيير الشكل التركيبي للبروتين بحيث تعدل من صفاته أو وظيفته. والعملية العكسية تسمى إزالة الفسفرة بواسطة انزيم الفوسفاتيز الذي يقوم بإزالة مجموعة فوسفات من البروتين. في سيتوكروم سي وجد أن هناك عدد من الأحماض الأمينية المحفوظة تطوريًا والتي تمر <scene name='89/898985/Phosphotyrosine_48_97/4'>بعملية الفسفرة</scene> ، الامر الذي يمنع من الإنتاج الزائد للشوارد الحرة (ROS)<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 6<br />
</p><br />
[[Image:Apoptosome formation.jpg|border|center|בתרשים מוצגת פעילות החלבון במצב מזורחן (מבוקר) ובמצב לא מזורחן (לא מבוקר); במצב מבוקר ניתן לראות שקצב הנשימה מווסת ולכן נוצרים מעט רדיקלים חופשיים, פוטנציאל הממברנה חיובי וציטוכרום סי קשור לממברנה הפנימית של המיטוכונדריה באמצעות קרדיוליפין. <br />
במצב לא מבוקר קצב הנשימה התאית הינו קצב מקסימאלי המייצר פוטנציאל ממברנה שלילי, יש עלייה בייצור רדיקלים חופשיים וקומפלקס קרדיוליפין+ציטוכרום סי נפרד. <br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
صورة 7<br />
</p><br />
[[Image:Cytochrome c alignment.jpg|border|center|עימוד ציטוכרום סי מאדם ומעכבר (מרקמה סומטית ומרקמת תאי מין) מאפשר לזהות עמדות שמורות אבולוציונית. ניתן לראות את עמדות 14 ו- 17 הקושרות קוולנטית את קבוצת ההם (חומצות אמינו ציסטאין המסומנות באות הגדולה סי). במיקום החיצים נמצאות עמדות שמורות העוברות מודיפיקציות לאחר תרגום, ביניהן גם עמדות 48 ו- 97 (חומצה אמינית טירוזין המסומנת באות וואי) המוזכרות בערך זה. ]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
وظيفة السيتوكروم سي كمانع للأكسدة (تقليل ROS) تتم بشكل مباشر عن طريق إزالة الأكسيد الفائق O2- وماء الاكسجين (H2O2) من الميتوكوندريا كما هو موضح في الرسم التالي:<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 8<br />
</p><br />
[[Image:Antioxidante.png|center|]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي هو بروتين يلعب دور مركزي في انتاج الطاقة في الخلية وأيضا له دور رئيسي بعمليات موت الخلايا المبرمج.<br />
</p><br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> وراثة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
جين CYCS الذي يشفر بروتين السيتوكروم C في البشر يتواجد على كروموسوم 7 في الحمض النووي DNA في نواة الخلية. هذا على عكس البروتينات الأخرى التي تعمل في عضية الميتوكوندريا المشفرة بواسطة الحمض النووي DNA للميتوكوندريا. حيث ان ال DNA للميتوكوندريا صغير جدًا، ويتألف من كروموسوم واحد صغير ويتضمن أقل من 17000 زوج قواعد نيتروجينية. بينما ال DNA في نواة الخلية يتضمن ثلاثة مليارات قاعدة نيتروجينية في 23 زوجًا من الكروموسومات.<br />
ومع ذلك، تحتوي كل خلية على نواة واحدة والعديد من الميتوكوندريا: في بعض الخلايا يصل عدد عضيات الميتوكوندريا إلى الآلاف، لذلك لديهم أيضًا آلاف النسخ من الحمض النووي DNA للميتوكوندريا. هناك اختلاف آخر بين أنواع الحمض النووي DNA وهو أننا نحصل على الحمض النووي DNA للميتوكوندريا من الأم فقط. تحتوي خلية الحيوانات المنوية على ميتوكوندريا، لكنها موجودة في "ذيل" الخلية، والذي يبقى بالخارج عند اتحاد الحيوان المنوي مع البويضة، يقوم الحمض النووي DNA للميتوكوندريا بتشفير13 بروتينًا ضروريًا لوظيفة الميتوكوندريا باعتبارها "محطة القوة الخلية".<br />
<br><br />
يحتوي الجينوم البشري على 49 "جينا كاذبا" للجين CYCS (وهي جينات غير فعالة ولا تمر في مرحلة النسخ ولا الترجمة). للجين توجد ثلاثة اكسونات. <br />
<br><br />
يتم تركيب البروتينات من أحماض أمينية باستخدام المعلومة المشفرة في الجينات، لدى كل بروتين تسلسلٌ خاص به من الأحماض الأمينية والذي يُحدَّد بواسطة تسلسل نوكليوتيدات الجين المشفر لذلك البروتين. تُنسخ الجينات المشفرة في الدنا إلى رنا رسول والذي يُستخدم بعدها كقالب لتخليق (ترجمة) البروتين بواسطة الريبوسوم. لا يتم التعبير عن جميع الجينات في الكائن الحي في نفس الوقت حيث ان كل خلية تعبر فقط عن جزء معين من المعلومات الموجودة بها ويتم قمع الجينات الأخرى التي ليست ضرورية لوظيفة الخلية. يتم قياس التعبير الجيني للجين CYCS حسب كمية الرنا رسول في الانسجة المختلفة حيث ان التعبير يختلف من نسيج الى اخر.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 9<br />
[[Image:Expression cytochrome c.JPG|border|center|600px|]]<br />
</p><br />
<br><br />
==<div style="text-align: right;"> أمراض </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
عند الأشخاص الذين يعانون من متلازمة نقص الصفيحات وجدت طفرة في جين CYCS والتي بها يتم استبدال الحمض الاميني <scene name='89/898985/Gly__41/3'>جلايسين في المكان ال41 ( مكان محفوظ تطوريا) </scene> بالحمض الاميني سيرين . هذه المتلازمة هي متلازمة سائدة تتميز بنقص في عدد صفائح الدم وبالتالي يزداد الاحتمال لحدوث النزيف وتقل احتمالية تخثر الدم. <br />
لقد وجدت الدراسات الحديثة أن هذه الطفرة تزيد من النشاط المؤيد لموت الخلايا المبرمج عن طريق تنشيط الكاسبيز(caspase) بشكل أكثر كفاءة من البروتين الطبيعي. لا تؤثر هذه الطفرة على وظيفة الأكسدة والاختزال للبروتين<br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> ورقة عمل للطالب </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
[https://proteopedia.org/wiki/images/d/d8/%D7%93%D7%A3_%D7%A2%D7%91%D7%95%D7%93%D7%94_%D7%9C%D7%AA%D7%9C%D7%9E%D7%99%D7%93_-_cytochrome_C.pdf דף עבודה לתלמיד]<br />
<br><br />
[https://proteopedia.org/wiki/images/0/08/%D7%A0%D7%A1%D7%A4%D7%97_FASTA_%D7%A9%D7%9C_%D7%94%D7%97%D7%9C%D7%91%D7%95%D7%A0%D7%99%D7%9D.doc נספח]<br />
</p><br />
<br><br />
==<div style="text-align: right;"> المصادر </div> ==<br />
<br><br />
[https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/compound/444125#section=3D-Conformer pubchem]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/NP_061820.1 ncbi - cytochrome c - homo sapiens]<br />
<br><br />
[https://ashpublications.org/blood/article/132/Supplement%201/3758/265249/A-Novel-Cycs-Missense-Mutation-in-the-Helix-of-the A Novel Cycs Missense Mutation in the α-Helix of the Cycs C-Terminal Domain Causes Non-Syndromic Thrombocytopenia]<br />
<br><br />
[https://davidson.weizmann.ac.il/online/sciencenews/%D7%9C%D7%A8%D7%90%D7%95%D7%AA-%D7%90%D7%AA-%D7%94%D7%9E%D7%95%D7%9C%D7%A7%D7%95%D7%9C%D7%95%D7%AA-%D7%A0%D7%98%D7%A2%D7%A0%D7%95%D7%AA לראות את המולקולות נטענות - מכון דוידסון]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/browser/gene/?id=54205 ncbi cics gene]<br />
<br><br />
[https://www.rcsb.org/structure/1gu2 pdb - 1GU2]<br />
<br><br />
[https://www.rcsb.org/structure/1AKK pdb - 1AKK]<br />
<br><br />
[https://chem.libretexts.org/Courses/Saint_Marys_College_Notre_Dame_IN/CHEM_342%3A_Bio-inorganic_Chemistry/Readings/Metals_in_Biological_Systems_(Saint_Mary's_College)/Cytochrome_C Cytochrome C. (2019, June 5).]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/54205 ncbi - CYCS cytochrome c - Homo sapiens]<br />
<br><br />
[https://www.nature.com/articles/nrm2434 nature - Cytochrome c: functions beyond respiration]</div>Fatima M Hameedhttps://proteopedia.org/index.php?title=Cytochrome_C_(arabic)&diff=3554801Cytochrome C (arabic)2022-05-01T08:20:26Z<p>Fatima M Hameed: </p>
<hr />
<div>==<center>'''سيتوكروم سي البشري '''</center>==<br />
<p dir='rtl'><br />
<br />
.سيتوكروم سي عبارة عن زلال صغير (الوزن الجزيئي حوالي 1200 دالتون ) وهو بروتين محفوظ للغاية عبر مجموعة من الأنواع ، موجود في النباتات والحيوانات والعديد من الكائنات أحادية الخلية<br />
<br />
يرتبط هذا البروتين بمجموعة [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D9%87%D9%8A%D9%85 هيم] وبمركزها توجد ذرة حديد، وهو بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات وبعملية الاستموات (موت الخلايا المبرمج)<br />
</p><br />
<StructureSection load='1J3S' size='340' side='left' caption=' سيتوكروم سي البشري (PDB code [[1j3s]])' scene='89/898985/Cytochrome_c_basic/19'><br />
==<div style="text-align: right;"> المقدمة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي عبارة عن بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات، والتي هي العملية الأخيرة في عملية <br />
[https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D9%86%D9%81%D8%B3_%D8%AE%D9%84%D9%88%D9%8A التنفس الخلوي]<br />
. عملية التنفس الخلوي تقسم الى 3 أقسام مركزية: [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D8%AD%D9%84%D9%84_%D8%A7%D9%84%D8%AC%D9%84%D9%88%D9%83%D9%88%D8%B2 جليكوليزا ] (التي تحدث في السيتوبلازما)، [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AF%D9%88%D8%B1%D8%A9_%D8%AD%D9%85%D8%B6_%D8%A7%D9%84%D8%B3%D8%AA%D8%B1%D9%8A%D9%83 دورة كريبس] (تحدث في المساحة الداخلية للميتوكوندريا) وسلسلة نقل الالكترونات التي تحدث داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. <br />
<br />
.بنقل الالكترونات لجزيئات أخرى ملامسة لها، وهكذا يتم تشكيل سلسلة من البروتينات حاملة الإلكترونات FADH2 و NADH في سلسلة نقل الالكترونات تقوم الجزيئات المختزلة بدورة كريبس مثل<br />
.يتم استيعاب الإلكترونات في نهاية الأمر بواسطة الأكسجين ويؤدي هذا الاتحاد الى انتاج الماء<br />
نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة ، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا<br />
بواسطة منحدر التركيز الناتج في أيونات الهيدروجين يتم دفع عمل البروتين ATP سنتاز من أجل انتاج ATP. [https://davidson.weizmann.ac.il/ar/online/maagarmada/atp-%D8%B3%D9%8A%D9%86%D8%AB%D8%A7%D8%B2-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AD%D8%B1%D9%83-%D8%A7%D9%84%D8%AC%D8%B2%D9%8A%D8%A6%D9%8A%D9%91-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AA%D9%83%D8%A7%D9%85%D9%84 ATP] هو جزيء غنيّ بالطّاقة، يحتوي على مجموعة من الأدينوساين وثلاث مجموعات من الفوسفور المرتبطة به. يؤدّي التحلّل المائيّ لمجموعة الفوسفور الثالثة إلى إطلاق طاقة تسمح للجسم بتنشيط العديد من الإنزيمات والعمليات الموجودة فيه. يقوم الجسم بإنتاج الATP في الميتوكوندريا في جميع الأوقات وذلك من الاجل الحفاظ على نسبة عالية من الATP داخل الخلية وبالتالي فان نقل الالكترونات وإنتاج منحدر تراكيز لأيونات الهيدروجين تعتبر عملية رئيسية من اجل وجود سليم للخلية.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة1 (قوموا بالوقف على الصورة بالفأرة من أجل اظهار الشرح)<br />
</p><br />
[[Image:Electron_transport_chain_cytochrome_c.jpg|border|center|600px|نرى في الصورة سلسلة نقل الالكترونات – نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا. هذا النقل فعال (يحتاج الى طاقة) وهو عكس منحدر التركيز. تراكم ايونات الهيدروجين في الفراغ بين غشائي الخلية يمكن من دخول الهيدروجين بشكل غير فعال من اجل انتاج جزيء ATP .]]<br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
هنا توجد 3 مقاطع فيديو:<br />
<br><br />
[https://youtu.be/3YTPOIcj6lw סרטון] حول عملية نقل الإلكترون في الميتوكوندريا.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/LQmTKxI4Wn4 סרטון] فيديو يشرح العملية من زاوية أوسع.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/YZsJ-8TenYw סרטון] فيديو عن انحدار التراكيز مع التركيز على ATP سينثاز.<br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> المبنى الجزيئي </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي ينتمي لعائلة البروتين باسم all-α proteins والتي تتميز بوجود <scene name='89/898985/Secondary_structure/4'>المبنى الثنائي</scene> لولب ألفا. كل بروتين ينتمي لهذه المجموعة يحتوي أيضا على مجموعة هيم واحدة أو أكثر.<br />
<br><br />
<scene name='89/898985/Hem_c/2'>HEME C</scene> – مجموعة هيم عبارة عن مركب عضوي يتم انتاجه في النخاع العظمي والكبد. والهيم هو جزء من البروتينات التي تقوم بوظائف متعددة في الجسم. ان فعالية مجموعة هيم تنبع من قدرة ذرة الحديد على ربط جزيئات صغيرة (مثل الاكسجين) وأيضا على قدرتها لأكسدة واختزال مركبات أخرى (ان تعطي الكترونات او ان تستقبل الكترونات، على التوالي).<br />
<br><br />
يتكون السيتوكروم C البشري من <scene name='89/898985/Amino_acids/4'>سلسلة من 104 من الاحماض الامينية</scene> . يرتبط اثنان من الأحماض الأمينية بذرة الحديد <scene name='89/898985/Bond_to_iron_18_80/2'>(الهيستيدين في الموضع 18 والمثيونين في الموضع 80)</scene> ، ويرتبط اثنان من الأحماض الأمينية تساهميًا (رباط تساهمي) من خلال ذرة الكبريت (S) بمجموعة هيم <scene name='89/898985/Bond_to_iron_14_17/2'>(السيستئين في الموضع 17 وسيستئين في الموضع 14)</scene><br />
<br><br />
لقد وجد أن هناك عدد من الأحماض الأمينية المحفوظة تطوريًا، وهي الأحماض الأمينية المهمة لربط ذرة الحديد ومجموعة هيم. <scene name='89/898985/Cxxch_motive/6'>CXXCH</scene> (السيستئين ، X ، X ، السيستئين ، الهيستيدين) حيث يمكن أن يكون X أي حمض أميني غير السيستئين. وهذه المجموعة موجودة أيضا في بروتين سيتوكروم سي البشري.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 2<br />
[[Image:Consurf key small.gif|center|300px|מקרא צבעים לייצוג שמירות אבולוציונית - <br />
סגול כהה מייצג חומצות אמינו השמורות באבולוציה וזהות באורגניזמים שונים,<br />
לבן מייצג חומצות אמינו עם שמירות ממוצעת <br />
כחול מייצג חומצות אמינו שאינן שמורות אבולוציונית ועמדות אלו מאופיינות במגוון של חומצות אמינו משתנות בין אורגניזמים שונים.<br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> الوظيفة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
في سلسلة نقل الالكترونات يقوم سيتوكروم سي بنقل الكترون بين المعقدين III و IV . المعقد III يسمى سيتوكروم bc1 والمعقد IV يسمى سيتوكروم سي أوكسيداز. نقل الالكترونات يكون ممكنا بسبب حالة تأكسد متغيرة لذرة الحديد ، حيث ان في البداية يتواجد أيون الحديد في مجموعة هيم بحالة Fe3+ الأمر الذي يمكن من استيعاب الكترون واحد وبالتالي اختزال الحديد لحالة Fe2+.<br />
<br> <br />
<br> <br />
صورة 3<br />
</p><br />
[[Image:Cytochrome C Oxydoreductase.jpg|border|center|400px|نرى في الصورة المعقدات المختلفة في سلسلة نقل الالكترونات- سيتوكروم سي هو بروتين صغير مقارنة بالمعقدات 2و3و4 ولا يستطيع المرور عبر الغشاء الخلوي. يمر البروتين عبر الغشاء الداخلي للميتوكوندريا بين المعقد 3 و4. ويمكن الملاحظة ان جميع بروتينات سلسلة نقل الالكترونات تحتوي على مجموعة هيم.]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
يلعب السيتوكروم سي أيضًا دورًا وسيطًا في عملية [https://he.wikipedia.org/wiki/%D7%90%D7%A4%D7%95%D7%A4%D7%98%D7%95%D7%96%D7%94 موت الخلايا المبرمج] وهو شكل محكوم من موت الخلايا يستخدم لقتل الخلايا في عملية النمو من اجل نمو أعضاء صحيحة وأيضا مسئول عن انتقاء خلايا الدم البيضاء ولقتل الخلايا السرطانية او المريضة . <br />
<br><br />
<br> <br />
في هذا [https://youtu.be/Od3pUsVdMhQ الفيديو] نرى دور السيتوكروم سي في موت الخلايا المبرمج. <br />
<br><br />
سيتوكروم سي الحامل للإلكترونات يتواجد داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا بواسطة رابط هيدروفوبي (كاره للماء) للفوسفوليبيد كارديوليبين (وهو جزيء هيدروفوبي يبني غشاء الميتوكوندريا).<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 4<br />
</p><br />
[[Image:Cardiolipin.jpg|border|center|280px|באיור בצד שמאל ניתן לראות את החלבון ציטוכרום סי (אדום) מחובר לפוספוליפיד קרדיוליפין ומעוגן בממברנה הפנימית של המיטוכונדריה. באיור בצד ימין ניתן לראות את הפירוק של הקומפלקס קרדיוליפין + ציטוכרום סי כתוצאה מחימצון מולקולת קרדיוליפין. ציטוכרום סי מתנתק מהממברנה וחופשי לצאת לציטוזול.]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
تتميز بداية عملية الموت الخلوي بارتفاع في نسبة الشوارد الحرة (ROS) في الميتوكوندريا. نتيجة لذلك يتم تأكسد الكارديوليبين وبالتالي فانه يتم تفكيك المعقد كارديوليبين- سيتوكروم سي. <br />
يقوم بعد ذلك السيتوكروم سي بالخروج من الغشاء الداخلي للميتوكوندريا ويمر من خلال الثقوب الموجودة في الغشاء الخارجي وصولا الى السيتوبرلازما. في السيتوبلازما يرتبط سيتوكروم سي لبروتين APAF1 وبروتين dATP وهكذا يتكون مبنى ال أبوبتوسوم وهو بروتين يربط بروتين بروكسباز 9 ويحوله الى صورته النشطة والفعالة وهكذا تتمكن الكاسباسات 3 و7 من الارتباط والعمل (caspase). هذه العملية تؤدي الى ضرر وانقسام في ال DNA الذي ينتهي بموت موجه للخلية.<br />
<br><br />
<br> <br />
صورة 5<br />
</p><br />
[[Image:Apoptosome.jpg|border|center|280px|באיור מתוארת תחילה ההשתחררות של ציטוכרום סי מהמיטוכונדריה אל הציטוזול. לאחר מכן ציטוכרום סי נקשר לחלבון ציטופלזמי היוצר את מכלול האפופטוזום, מכלול זה מהווה את אחד ממרכזי הבקרה החשובים ביותר של האפופטוזה - הוא קושר ומבקע את החלבון פרוקספאז 9, משחרר אותו בצורתו הבוגרת והפעילה, וכך מפעיל את המסלול האפופטוטי הפנימי המסתיים במוות מכוון של התא.]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
منع الموت المبرمج للخلية<br />
<br><br />
تشير العديد من الأبحاث ان الخلايا تستطيع ان تتحكم وتسيطر على موت الخلايا المبرمج ولذك من خلال تعديل تقوم به بعد عملية الترجمة في البروتين. البروتينات هي سلسلة طويلة من الاحماض الامينية، المرحلة الأولى في بناء البروتين هي انتاج سلسلة من الاحماض الامينية (المبنى الاولي) وبعد ذلك تمر هذه السلسلة بالعديد من المعالجات والتعديلات. واحدة من هذه التعديلات هي عملية الفسفرة. عملية الفسفرة يتم فيها إضافة مجموعة فوسفات للبروتين (أيون يحتوي على ذرة فوسفات واحدة و4 ذرات هيدروجين). تتم العملية بواسطة إنزيمات الكيناز والتي تنقل الفوسفات وهي تغيير الشكل التركيبي للبروتين بحيث تعدل من صفاته أو وظيفته. والعملية العكسية تسمى إزالة الفسفرة بواسطة انزيم الفوسفاتيز الذي يقوم بإزالة مجموعة فوسفات من البروتين. في سيتوكروم سي وجد أن هناك عدد من الأحماض الأمينية المحفوظة تطوريًا والتي تمر <scene name='89/898985/Phosphotyrosine_48_97/4'>بعملية الفسفرة</scene> ، الامر الذي يمنع من الإنتاج الزائد للشوارد الحرة (ROS)<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 6<br />
</p><br />
[[Image:Apoptosome formation.jpg|border|center|בתרשים מוצגת פעילות החלבון במצב מזורחן (מבוקר) ובמצב לא מזורחן (לא מבוקר); במצב מבוקר ניתן לראות שקצב הנשימה מווסת ולכן נוצרים מעט רדיקלים חופשיים, פוטנציאל הממברנה חיובי וציטוכרום סי קשור לממברנה הפנימית של המיטוכונדריה באמצעות קרדיוליפין. <br />
במצב לא מבוקר קצב הנשימה התאית הינו קצב מקסימאלי המייצר פוטנציאל ממברנה שלילי, יש עלייה בייצור רדיקלים חופשיים וקומפלקס קרדיוליפין+ציטוכרום סי נפרד. <br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
صورة 7<br />
</p><br />
[[Image:Cytochrome c alignment.jpg|border|center|עימוד ציטוכרום סי מאדם ומעכבר (מרקמה סומטית ומרקמת תאי מין) מאפשר לזהות עמדות שמורות אבולוציונית. ניתן לראות את עמדות 14 ו- 17 הקושרות קוולנטית את קבוצת ההם (חומצות אמינו ציסטאין המסומנות באות הגדולה סי). במיקום החיצים נמצאות עמדות שמורות העוברות מודיפיקציות לאחר תרגום, ביניהן גם עמדות 48 ו- 97 (חומצה אמינית טירוזין המסומנת באות וואי) המוזכרות בערך זה. ]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
وظيفة السيتوكروم سي كمانع للأكسدة (تقليل ROS) تتم بشكل مباشر عن طريق إزالة الأكسيد الفائق O2- وماء الاكسجين (H2O2) من الميتوكوندريا كما هو موضح في الرسم التالي:<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 8<br />
</p><br />
[[Image:Antioxidante.png|center|]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي هو بروتين يلعب دور مركزي في انتاج الطاقة في الخلية وأيضا له دور رئيسي بعمليات موت الخلايا المبرمج.<br />
</p><br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> وراثة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
جين CYCS الذي يشفر بروتين السيتوكروم C في البشر يتواجد على كروموسوم 7 في الحمض النووي DNA في نواة الخلية. هذا على عكس البروتينات الأخرى التي تعمل في عضية الميتوكوندريا المشفرة بواسطة الحمض النووي DNA للميتوكوندريا. حيث ان ال DNA للميتوكوندريا صغير جدًا، ويتألف من كروموسوم واحد صغير ويتضمن أقل من 17000 زوج قواعد نيتروجينية. بينما ال DNA في نواة الخلية يتضمن ثلاثة مليارات قاعدة نيتروجينية في 23 زوجًا من الكروموسومات.<br />
ومع ذلك، تحتوي كل خلية على نواة واحدة والعديد من الميتوكوندريا: في بعض الخلايا يصل عدد عضيات الميتوكوندريا إلى الآلاف، لذلك لديهم أيضًا آلاف النسخ من الحمض النووي DNA للميتوكوندريا. هناك اختلاف آخر بين أنواع الحمض النووي DNA وهو أننا نحصل على الحمض النووي DNA للميتوكوندريا من الأم فقط. تحتوي خلية الحيوانات المنوية على ميتوكوندريا، لكنها موجودة في "ذيل" الخلية، والذي يبقى بالخارج عند اتحاد الحيوان المنوي مع البويضة، يقوم الحمض النووي DNA للميتوكوندريا بتشفير13 بروتينًا ضروريًا لوظيفة الميتوكوندريا باعتبارها "محطة القوة الخلية".<br />
<br><br />
يحتوي الجينوم البشري على 49 "جينا كاذبا" للجين CYCS (وهي جينات غير فعالة ولا تمر في مرحلة النسخ ولا الترجمة). للجين توجد ثلاثة اكسونات. <br />
<br><br />
يتم تركيب البروتينات من أحماض أمينية باستخدام المعلومة المشفرة في الجينات، لدى كل بروتين تسلسلٌ خاص به من الأحماض الأمينية والذي يُحدَّد بواسطة تسلسل نوكليوتيدات الجين المشفر لذلك البروتين. تُنسخ الجينات المشفرة في الدنا إلى رنا رسول والذي يُستخدم بعدها كقالب لتخليق (ترجمة) البروتين بواسطة الريبوسوم. لا يتم التعبير عن جميع الجينات في الكائن الحي في نفس الوقت حيث ان كل خلية تعبر فقط عن جزء معين من المعلومات الموجودة بها ويتم قمع الجينات الأخرى التي ليست ضرورية لوظيفة الخلية. يتم قياس التعبير الجيني للجين CYCS حسب كمية الرنا رسول في الانسجة المختلفة حيث ان التعبير يختلف من نسيج الى اخر.<br />
<br><br />
<br><br />
9 صورة<br />
[[Image:Expression cytochrome c.JPG|border|center|600px|]]<br />
</p><br />
<br><br />
==<div style="text-align: right;"> أمراض </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
عند الأشخاص الذين يعانون من متلازمة نقص الصفيحات وجدت طفرة في جين CYCS والتي بها يتم استبدال الحمض الاميني <scene name='89/898985/Gly__41/3'>جلايسين في المكان ال41 ( مكان محفوظ تطوريا) </scene> بالحمض الاميني سيرين . هذه المتلازمة هي متلازمة سائدة تتميز بنقص في عدد صفائح الدم وبالتالي يزداد الاحتمال لحدوث النزيف وتقل احتمالية تخثر الدم. <br />
لقد وجدت الدراسات الحديثة أن هذه الطفرة تزيد من النشاط المؤيد لموت الخلايا المبرمج عن طريق تنشيط الكاسبيز(caspase) بشكل أكثر كفاءة من البروتين الطبيعي. لا تؤثر هذه الطفرة على وظيفة الأكسدة والاختزال للبروتين<br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> ورقة عمل للطالب </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
[https://proteopedia.org/wiki/images/d/d8/%D7%93%D7%A3_%D7%A2%D7%91%D7%95%D7%93%D7%94_%D7%9C%D7%AA%D7%9C%D7%9E%D7%99%D7%93_-_cytochrome_C.pdf דף עבודה לתלמיד]<br />
<br><br />
[https://proteopedia.org/wiki/images/0/08/%D7%A0%D7%A1%D7%A4%D7%97_FASTA_%D7%A9%D7%9C_%D7%94%D7%97%D7%9C%D7%91%D7%95%D7%A0%D7%99%D7%9D.doc נספח]<br />
</p><br />
<br><br />
==<div style="text-align: right;"> المصادر </div> ==<br />
<br><br />
[https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/compound/444125#section=3D-Conformer pubchem]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/NP_061820.1 ncbi - cytochrome c - homo sapiens]<br />
<br><br />
[https://ashpublications.org/blood/article/132/Supplement%201/3758/265249/A-Novel-Cycs-Missense-Mutation-in-the-Helix-of-the A Novel Cycs Missense Mutation in the α-Helix of the Cycs C-Terminal Domain Causes Non-Syndromic Thrombocytopenia]<br />
<br><br />
[https://davidson.weizmann.ac.il/online/sciencenews/%D7%9C%D7%A8%D7%90%D7%95%D7%AA-%D7%90%D7%AA-%D7%94%D7%9E%D7%95%D7%9C%D7%A7%D7%95%D7%9C%D7%95%D7%AA-%D7%A0%D7%98%D7%A2%D7%A0%D7%95%D7%AA לראות את המולקולות נטענות - מכון דוידסון]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/browser/gene/?id=54205 ncbi cics gene]<br />
<br><br />
[https://www.rcsb.org/structure/1gu2 pdb - 1GU2]<br />
<br><br />
[https://www.rcsb.org/structure/1AKK pdb - 1AKK]<br />
<br><br />
[https://chem.libretexts.org/Courses/Saint_Marys_College_Notre_Dame_IN/CHEM_342%3A_Bio-inorganic_Chemistry/Readings/Metals_in_Biological_Systems_(Saint_Mary's_College)/Cytochrome_C Cytochrome C. (2019, June 5).]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/54205 ncbi - CYCS cytochrome c - Homo sapiens]<br />
<br><br />
[https://www.nature.com/articles/nrm2434 nature - Cytochrome c: functions beyond respiration]</div>Fatima M Hameedhttps://proteopedia.org/index.php?title=Cytochrome_C_(arabic)&diff=3554799Cytochrome C (arabic)2022-05-01T08:17:21Z<p>Fatima M Hameed: </p>
<hr />
<div>==<center>'''سيتوكروم سي البشري '''</center>==<br />
<p dir='rtl'><br />
<br />
.سيتوكروم سي عبارة عن زلال صغير (الوزن الجزيئي حوالي 1200 دالتون ) وهو بروتين محفوظ للغاية عبر مجموعة من الأنواع ، موجود في النباتات والحيوانات والعديد من الكائنات أحادية الخلية<br />
<br />
يرتبط هذا البروتين بمجموعة [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D9%87%D9%8A%D9%85 هيم] وبمركزها توجد ذرة حديد، وهو بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات وبعملية الاستموات (موت الخلايا المبرمج)<br />
</p><br />
<StructureSection load='1J3S' size='340' side='left' caption=' سيتوكروم سي البشري (PDB code [[1j3s]])' scene='89/898985/Cytochrome_c_basic/19'><br />
==<div style="text-align: right;"> المقدمة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي عبارة عن بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات، والتي هي العملية الأخيرة في عملية <br />
[https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D9%86%D9%81%D8%B3_%D8%AE%D9%84%D9%88%D9%8A التنفس الخلوي]<br />
. عملية التنفس الخلوي تقسم الى 3 أقسام مركزية: [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D8%AD%D9%84%D9%84_%D8%A7%D9%84%D8%AC%D9%84%D9%88%D9%83%D9%88%D8%B2 جليكوليزا ] (التي تحدث في السيتوبلازما)، [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AF%D9%88%D8%B1%D8%A9_%D8%AD%D9%85%D8%B6_%D8%A7%D9%84%D8%B3%D8%AA%D8%B1%D9%8A%D9%83 دورة كريبس] (تحدث في المساحة الداخلية للميتوكوندريا) وسلسلة نقل الالكترونات التي تحدث داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. <br />
<br />
.بنقل الالكترونات لجزيئات أخرى ملامسة لها، وهكذا يتم تشكيل سلسلة من البروتينات حاملة الإلكترونات FADH2 و NADH في سلسلة نقل الالكترونات تقوم الجزيئات المختزلة بدورة كريبس مثل<br />
.يتم استيعاب الإلكترونات في نهاية الأمر بواسطة الأكسجين ويؤدي هذا الاتحاد الى انتاج الماء<br />
نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة ، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا<br />
بواسطة منحدر التركيز الناتج في أيونات الهيدروجين يتم دفع عمل البروتين ATP سنتاز من أجل انتاج ATP. [https://davidson.weizmann.ac.il/ar/online/maagarmada/atp-%D8%B3%D9%8A%D9%86%D8%AB%D8%A7%D8%B2-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AD%D8%B1%D9%83-%D8%A7%D9%84%D8%AC%D8%B2%D9%8A%D8%A6%D9%8A%D9%91-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AA%D9%83%D8%A7%D9%85%D9%84 ATP] هو جزيء غنيّ بالطّاقة، يحتوي على مجموعة من الأدينوساين وثلاث مجموعات من الفوسفور المرتبطة به. يؤدّي التحلّل المائيّ لمجموعة الفوسفور الثالثة إلى إطلاق طاقة تسمح للجسم بتنشيط العديد من الإنزيمات والعمليات الموجودة فيه. يقوم الجسم بإنتاج الATP في الميتوكوندريا في جميع الأوقات وذلك من الاجل الحفاظ على نسبة عالية من الATP داخل الخلية وبالتالي فان نقل الالكترونات وإنتاج منحدر تراكيز لأيونات الهيدروجين تعتبر عملية رئيسية من اجل وجود سليم للخلية.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة1 (قوموا بالوقف على الصورة بالفأرة من أجل اظهار الشرح)<br />
</p><br />
[[Image:Electron_transport_chain_cytochrome_c.jpg|border|center|600px|نرى في الصورة سلسلة نقل الالكترونات – نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا. هذا النقل فعال (يحتاج الى طاقة) وهو عكس منحدر التركيز. تراكم ايونات الهيدروجين في الفراغ بين غشائي الخلية يمكن من دخول الهيدروجين بشكل غير فعال من اجل انتاج جزيء ATP .]]<br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
هنا توجد 3 مقاطع فيديو:<br />
<br><br />
[https://youtu.be/3YTPOIcj6lw סרטון] حول عملية نقل الإلكترون في الميتوكوندريا.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/LQmTKxI4Wn4 סרטון] فيديو يشرح العملية من زاوية أوسع.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/YZsJ-8TenYw סרטון] فيديو عن انحدار التراكيز مع التركيز على ATP سينثاز.<br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> المبنى الجزيئي </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي ينتمي لعائلة البروتين باسم all-α proteins والتي تتميز بوجود <scene name='89/898985/Secondary_structure/4'>المبنى الثنائي</scene> لولب ألفا. كل بروتين ينتمي لهذه المجموعة يحتوي أيضا على مجموعة هيم واحدة أو أكثر.<br />
<br><br />
<scene name='89/898985/Hem_c/2'>HEME C</scene> – مجموعة هيم عبارة عن مركب عضوي يتم انتاجه في النخاع العظمي والكبد. والهيم هو جزء من البروتينات التي تقوم بوظائف متعددة في الجسم. ان فعالية مجموعة هيم تنبع من قدرة ذرة الحديد على ربط جزيئات صغيرة (مثل الاكسجين) وأيضا على قدرتها لأكسدة واختزال مركبات أخرى (ان تعطي الكترونات او ان تستقبل الكترونات، على التوالي).<br />
<br><br />
يتكون السيتوكروم C البشري من <scene name='89/898985/Amino_acids/4'>سلسلة من 104 من الاحماض الامينية</scene> . يرتبط اثنان من الأحماض الأمينية بذرة الحديد <scene name='89/898985/Bond_to_iron_18_80/2'>(الهيستيدين في الموضع 18 والمثيونين في الموضع 80)</scene> ، ويرتبط اثنان من الأحماض الأمينية تساهميًا (رباط تساهمي) من خلال ذرة الكبريت (S) بمجموعة هيم <scene name='89/898985/Bond_to_iron_14_17/2'>(السيستئين في الموضع 17 وسيستئين في الموضع 14)</scene><br />
<br><br />
لقد وجد أن هناك عدد من الأحماض الأمينية المحفوظة تطوريًا، وهي الأحماض الأمينية المهمة لربط ذرة الحديد ومجموعة هيم. <scene name='89/898985/Cxxch_motive/6'>CXXCH</scene> (السيستئين ، X ، X ، السيستئين ، الهيستيدين) حيث يمكن أن يكون X أي حمض أميني غير السيستئين. وهذه المجموعة موجودة أيضا في بروتين سيتوكروم سي البشري.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 2<br />
[[Image:Consurf key small.gif|center|300px|מקרא צבעים לייצוג שמירות אבולוציונית - <br />
סגול כהה מייצג חומצות אמינו השמורות באבולוציה וזהות באורגניזמים שונים,<br />
לבן מייצג חומצות אמינו עם שמירות ממוצעת <br />
כחול מייצג חומצות אמינו שאינן שמורות אבולוציונית ועמדות אלו מאופיינות במגוון של חומצות אמינו משתנות בין אורגניזמים שונים.<br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> الوظيفة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
في سلسلة نقل الالكترونات يقوم سيتوكروم سي بنقل الكترون بين المعقدين III و IV . المعقد III يسمى سيتوكروم bc1 والمعقد IV يسمى سيتوكروم سي أوكسيداز. نقل الالكترونات يكون ممكنا بسبب حالة تأكسد متغيرة لذرة الحديد ، حيث ان في البداية يتواجد أيون الحديد في مجموعة هيم بحالة Fe3+ الأمر الذي يمكن من استيعاب الكترون واحد وبالتالي اختزال الحديد لحالة Fe2+.<br />
<br> <br />
<br> <br />
صورة 3<br />
</p><br />
[[Image:Cytochrome C Oxydoreductase.jpg|border|center|400px|نرى في الصورة المعقدات المختلفة في سلسلة نقل الالكترونات- سيتوكروم سي هو بروتين صغير مقارنة بالمعقدات 2و3و4 ولا يستطيع المرور عبر الغشاء الخلوي. يمر البروتين عبر الغشاء الداخلي للميتوكوندريا بين المعقد 3 و4. ويمكن الملاحظة ان جميع بروتينات سلسلة نقل الالكترونات تحتوي على مجموعة هيم.]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
يلعب السيتوكروم سي أيضًا دورًا وسيطًا في عملية [https://he.wikipedia.org/wiki/%D7%90%D7%A4%D7%95%D7%A4%D7%98%D7%95%D7%96%D7%94 موت الخلايا المبرمج] وهو شكل محكوم من موت الخلايا يستخدم لقتل الخلايا في عملية النمو من اجل نمو أعضاء صحيحة وأيضا مسئول عن انتقاء خلايا الدم البيضاء ولقتل الخلايا السرطانية او المريضة . <br />
<br><br />
<br> <br />
في هذا [https://youtu.be/Od3pUsVdMhQ الفيديو] نرى دور السيتوكروم سي في موت الخلايا المبرمج. <br />
<br><br />
سيتوكروم سي الحامل للإلكترونات يتواجد داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا بواسطة رابط هيدروفوبي (كاره للماء) للفوسفوليبيد كارديوليبين (وهو جزيء هيدروفوبي يبني غشاء الميتوكوندريا).<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 4<br />
</p><br />
[[Image:Cardiolipin.jpg|border|center|280px|באיור בצד שמאל ניתן לראות את החלבון ציטוכרום סי (אדום) מחובר לפוספוליפיד קרדיוליפין ומעוגן בממברנה הפנימית של המיטוכונדריה. באיור בצד ימין ניתן לראות את הפירוק של הקומפלקס קרדיוליפין + ציטוכרום סי כתוצאה מחימצון מולקולת קרדיוליפין. ציטוכרום סי מתנתק מהממברנה וחופשי לצאת לציטוזול.]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
تتميز بداية عملية الموت الخلوي بارتفاع في نسبة الشوارد الحرة (ROS) في الميتوكوندريا. نتيجة لذلك يتم تأكسد الكارديوليبين وبالتالي فانه يتم تفكيك المعقد كارديوليبين- سيتوكروم سي. <br />
يقوم بعد ذلك السيتوكروم سي بالخروج من الغشاء الداخلي للميتوكوندريا ويمر من خلال الثقوب الموجودة في الغشاء الخارجي وصولا الى السيتوبرلازما. في السيتوبلازما يرتبط سيتوكروم سي لبروتين APAF1 وبروتين dATP وهكذا يتكون مبنى ال أبوبتوسوم وهو بروتين يربط بروتين بروكسباز 9 ويحوله الى صورته النشطة والفعالة وهكذا تتمكن الكاسباسات 3 و7 من الارتباط والعمل (caspase). هذه العملية تؤدي الى ضرر وانقسام في ال DNA الذي ينتهي بموت موجه للخلية.<br />
<br><br />
<br> <br />
صورة 5<br />
</p><br />
[[Image:Apoptosome.jpg|border|center|280px|באיור מתוארת תחילה ההשתחררות של ציטוכרום סי מהמיטוכונדריה אל הציטוזול. לאחר מכן ציטוכרום סי נקשר לחלבון ציטופלזמי היוצר את מכלול האפופטוזום, מכלול זה מהווה את אחד ממרכזי הבקרה החשובים ביותר של האפופטוזה - הוא קושר ומבקע את החלבון פרוקספאז 9, משחרר אותו בצורתו הבוגרת והפעילה, וכך מפעיל את המסלול האפופטוטי הפנימי המסתיים במוות מכוון של התא.]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
منع الموت المبرمج للخلية<br />
<br><br />
تشير العديد من الأبحاث ان الخلايا تستطيع ان تتحكم وتسيطر على موت الخلايا المبرمج ولذك من خلال تعديل تقوم به بعد عملية الترجمة في البروتين. البروتينات هي سلسلة طويلة من الاحماض الامينية، المرحلة الأولى في بناء البروتين هي انتاج سلسلة من الاحماض الامينية (المبنى الاولي) وبعد ذلك تمر هذه السلسلة بالعديد من المعالجات والتعديلات. واحدة من هذه التعديلات هي عملية الفسفرة. عملية الفسفرة يتم فيها إضافة مجموعة فوسفات للبروتين (أيون يحتوي على ذرة فوسفات واحدة و4 ذرات هيدروجين). تتم العملية بواسطة إنزيمات الكيناز والتي تنقل الفوسفات وهي تغيير الشكل التركيبي للبروتين بحيث تعدل من صفاته أو وظيفته. والعملية العكسية تسمى إزالة الفسفرة بواسطة انزيم الفوسفاتيز الذي يقوم بإزالة مجموعة فوسفات من البروتين. في سيتوكروم سي وجد أن هناك عدد من الأحماض الأمينية المحفوظة تطوريًا والتي تمر <scene name='89/898985/Phosphotyrosine_48_97/4'>بعملية الفسفرة</scene> ، الامر الذي يمنع من الإنتاج الزائد للشوارد الحرة (ROS)<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 6<br />
</p><br />
[[Image:Apoptosome formation.jpg|border|center|בתרשים מוצגת פעילות החלבון במצב מזורחן (מבוקר) ובמצב לא מזורחן (לא מבוקר); במצב מבוקר ניתן לראות שקצב הנשימה מווסת ולכן נוצרים מעט רדיקלים חופשיים, פוטנציאל הממברנה חיובי וציטוכרום סי קשור לממברנה הפנימית של המיטוכונדריה באמצעות קרדיוליפין. <br />
במצב לא מבוקר קצב הנשימה התאית הינו קצב מקסימאלי המייצר פוטנציאל ממברנה שלילי, יש עלייה בייצור רדיקלים חופשיים וקומפלקס קרדיוליפין+ציטוכרום סי נפרד. <br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
صورة 7<br />
</p><br />
[[Image:Cytochrome c alignment.jpg|border|center|עימוד ציטוכרום סי מאדם ומעכבר (מרקמה סומטית ומרקמת תאי מין) מאפשר לזהות עמדות שמורות אבולוציונית. ניתן לראות את עמדות 14 ו- 17 הקושרות קוולנטית את קבוצת ההם (חומצות אמינו ציסטאין המסומנות באות הגדולה סי). במיקום החיצים נמצאות עמדות שמורות העוברות מודיפיקציות לאחר תרגום, ביניהן גם עמדות 48 ו- 97 (חומצה אמינית טירוזין המסומנת באות וואי) המוזכרות בערך זה. ]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
وظيفة السيتوكروم سي كمانع للأكسدة (تقليل ROS) تتم بشكل مباشر عن طريق إزالة الأكسيد الفائق O2- وماء الاكسجين (H2O2) من الميتوكوندريا كما هو موضح في الرسم التالي:<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 8<br />
</p><br />
[[Image:Antioxidante.png|center|]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي هو بروتين يلعب دور مركزي في انتاج الطاقة في الخلية وأيضا له دور رئيسي بعمليات موت الخلايا المبرمج.<br />
</p><br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> وراثة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
جين CYCS الذي يشفر بروتين السيتوكروم C في البشر يتواجد على كروموسوم 7 في الحمض النووي DNA في نواة الخلية. هذا على عكس البروتينات الأخرى التي تعمل في عضية الميتوكوندريا المشفرة بواسطة الحمض النووي DNA للميتوكوندريا. حيث ان ال DNA للميتوكوندريا صغير جدًا، ويتألف من كروموسوم واحد صغير ويتضمن أقل من 17000 زوج قواعد نيتروجينية. بينما ال DNA في نواة الخلية يتضمن ثلاثة مليارات قاعدة نيتروجينية في 23 زوجًا من الكروموسومات.<br />
ومع ذلك، تحتوي كل خلية على نواة واحدة والعديد من الميتوكوندريا: في بعض الخلايا يصل عدد عضيات الميتوكوندريا إلى الآلاف، لذلك لديهم أيضًا آلاف النسخ من الحمض النووي DNA للميتوكوندريا. هناك اختلاف آخر بين أنواع الحمض النووي DNA وهو أننا نحصل على الحمض النووي DNA للميتوكوندريا من الأم فقط. تحتوي خلية الحيوانات المنوية على ميتوكوندريا، لكنها موجودة في "ذيل" الخلية، والذي يبقى بالخارج عند اتحاد الحيوان المنوي مع البويضة، يقوم الحمض النووي DNA للميتوكوندريا بتشفير13 بروتينًا ضروريًا لوظيفة الميتوكوندريا باعتبارها "محطة القوة الخلية".<br />
<br><br />
يحتوي الجينوم البشري على 49 "جينا كاذبا" للجين CYCS (وهي جينات غير فعالة ولا تمر في مرحلة النسخ ولا الترجمة). للجين توجد ثلاثة اكسونات. <br />
<br><br />
يتم تركيب البروتينات من أحماض أمينية باستخدام المعلومة المشفرة في الجينات، لدى كل بروتين تسلسلٌ خاص به من الأحماض الأمينية والذي يُحدَّد بواسطة تسلسل نوكليوتيدات الجين المشفر لذلك البروتين. تُنسخ الجينات المشفرة في الدنا إلى رنا رسول والذي يُستخدم بعدها كقالب لتخليق (ترجمة) البروتين بواسطة الريبوسوم. لا يتم التعبير عن جميع الجينات في الكائن الحي في نفس الوقت حيث ان كل خلية تعبر فقط عن جزء معين من المعلومات الموجودة بها ويتم قمع الجينات الأخرى التي ليست ضرورية لوظيفة الخلية. يتم قياس التعبير الجيني للجين CYCS حسب كمية الرنا رسول في الانسجة المختلفة حيث ان التعبير يختلف من نسيج الى اخر.<br />
<br><br />
<br><br />
9 صورة<br />
[[Image:Expression cytochrome c.JPG|border|center|600px|]]<br />
</p><br />
<br><br />
==<div style="text-align: right;"> أمراض </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> ورقة عمل للطالب </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المصادر </div> ==</div>Fatima M Hameedhttps://proteopedia.org/index.php?title=Cytochrome_C_(arabic)&diff=3554796Cytochrome C (arabic)2022-05-01T08:06:18Z<p>Fatima M Hameed: </p>
<hr />
<div>==<center>'''سيتوكروم سي البشري '''</center>==<br />
<p dir='rtl'><br />
<br />
.سيتوكروم سي عبارة عن زلال صغير (الوزن الجزيئي حوالي 1200 دالتون ) وهو بروتين محفوظ للغاية عبر مجموعة من الأنواع ، موجود في النباتات والحيوانات والعديد من الكائنات أحادية الخلية<br />
<br />
يرتبط هذا البروتين بمجموعة [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D9%87%D9%8A%D9%85 هيم] وبمركزها توجد ذرة حديد، وهو بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات وبعملية الاستموات (موت الخلايا المبرمج)<br />
</p><br />
<StructureSection load='1J3S' size='340' side='left' caption=' سيتوكروم سي البشري (PDB code [[1j3s]])' scene='89/898985/Cytochrome_c_basic/19'><br />
==<div style="text-align: right;"> المقدمة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي عبارة عن بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات، والتي هي العملية الأخيرة في عملية <br />
[https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D9%86%D9%81%D8%B3_%D8%AE%D9%84%D9%88%D9%8A التنفس الخلوي]<br />
. عملية التنفس الخلوي تقسم الى 3 أقسام مركزية: [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D8%AD%D9%84%D9%84_%D8%A7%D9%84%D8%AC%D9%84%D9%88%D9%83%D9%88%D8%B2 جليكوليزا ] (التي تحدث في السيتوبلازما)، [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AF%D9%88%D8%B1%D8%A9_%D8%AD%D9%85%D8%B6_%D8%A7%D9%84%D8%B3%D8%AA%D8%B1%D9%8A%D9%83 دورة كريبس] (تحدث في المساحة الداخلية للميتوكوندريا) وسلسلة نقل الالكترونات التي تحدث داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. <br />
<br />
.بنقل الالكترونات لجزيئات أخرى ملامسة لها، وهكذا يتم تشكيل سلسلة من البروتينات حاملة الإلكترونات FADH2 و NADH في سلسلة نقل الالكترونات تقوم الجزيئات المختزلة بدورة كريبس مثل<br />
.يتم استيعاب الإلكترونات في نهاية الأمر بواسطة الأكسجين ويؤدي هذا الاتحاد الى انتاج الماء<br />
نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة ، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا<br />
بواسطة منحدر التركيز الناتج في أيونات الهيدروجين يتم دفع عمل البروتين ATP سنتاز من أجل انتاج ATP. [https://davidson.weizmann.ac.il/ar/online/maagarmada/atp-%D8%B3%D9%8A%D9%86%D8%AB%D8%A7%D8%B2-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AD%D8%B1%D9%83-%D8%A7%D9%84%D8%AC%D8%B2%D9%8A%D8%A6%D9%8A%D9%91-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AA%D9%83%D8%A7%D9%85%D9%84 ATP] هو جزيء غنيّ بالطّاقة، يحتوي على مجموعة من الأدينوساين وثلاث مجموعات من الفوسفور المرتبطة به. يؤدّي التحلّل المائيّ لمجموعة الفوسفور الثالثة إلى إطلاق طاقة تسمح للجسم بتنشيط العديد من الإنزيمات والعمليات الموجودة فيه. يقوم الجسم بإنتاج الATP في الميتوكوندريا في جميع الأوقات وذلك من الاجل الحفاظ على نسبة عالية من الATP داخل الخلية وبالتالي فان نقل الالكترونات وإنتاج منحدر تراكيز لأيونات الهيدروجين تعتبر عملية رئيسية من اجل وجود سليم للخلية.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة1 (قوموا بالوقف على الصورة بالفأرة من أجل اظهار الشرح)<br />
</p><br />
[[Image:Electron_transport_chain_cytochrome_c.jpg|border|center|600px|نرى في الصورة سلسلة نقل الالكترونات – نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا. هذا النقل فعال (يحتاج الى طاقة) وهو عكس منحدر التركيز. تراكم ايونات الهيدروجين في الفراغ بين غشائي الخلية يمكن من دخول الهيدروجين بشكل غير فعال من اجل انتاج جزيء ATP .]]<br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
هنا توجد 3 مقاطع فيديو:<br />
<br><br />
[https://youtu.be/3YTPOIcj6lw סרטון] حول عملية نقل الإلكترون في الميتوكوندريا.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/LQmTKxI4Wn4 סרטון] فيديو يشرح العملية من زاوية أوسع.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/YZsJ-8TenYw סרטון] فيديو عن انحدار التراكيز مع التركيز على ATP سينثاز.<br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> المبنى الجزيئي </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي ينتمي لعائلة البروتين باسم all-α proteins والتي تتميز بوجود <scene name='89/898985/Secondary_structure/4'>المبنى الثنائي</scene> لولب ألفا. كل بروتين ينتمي لهذه المجموعة يحتوي أيضا على مجموعة هيم واحدة أو أكثر.<br />
<br><br />
<scene name='89/898985/Hem_c/2'>HEME C</scene> – مجموعة هيم عبارة عن مركب عضوي يتم انتاجه في النخاع العظمي والكبد. والهيم هو جزء من البروتينات التي تقوم بوظائف متعددة في الجسم. ان فعالية مجموعة هيم تنبع من قدرة ذرة الحديد على ربط جزيئات صغيرة (مثل الاكسجين) وأيضا على قدرتها لأكسدة واختزال مركبات أخرى (ان تعطي الكترونات او ان تستقبل الكترونات، على التوالي).<br />
<br><br />
يتكون السيتوكروم C البشري من <scene name='89/898985/Amino_acids/4'>سلسلة من 104 من الاحماض الامينية</scene> . يرتبط اثنان من الأحماض الأمينية بذرة الحديد <scene name='89/898985/Bond_to_iron_18_80/2'>(الهيستيدين في الموضع 18 والمثيونين في الموضع 80)</scene> ، ويرتبط اثنان من الأحماض الأمينية تساهميًا (رباط تساهمي) من خلال ذرة الكبريت (S) بمجموعة هيم <scene name='89/898985/Bond_to_iron_14_17/2'>(السيستئين في الموضع 17 وسيستئين في الموضع 14)</scene><br />
<br><br />
لقد وجد أن هناك عدد من الأحماض الأمينية المحفوظة تطوريًا، وهي الأحماض الأمينية المهمة لربط ذرة الحديد ومجموعة هيم. <scene name='89/898985/Cxxch_motive/6'>CXXCH</scene> (السيستئين ، X ، X ، السيستئين ، الهيستيدين) حيث يمكن أن يكون X أي حمض أميني غير السيستئين. وهذه المجموعة موجودة أيضا في بروتين سيتوكروم سي البشري.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 2<br />
[[Image:Consurf key small.gif|center|300px|מקרא צבעים לייצוג שמירות אבולוציונית - <br />
סגול כהה מייצג חומצות אמינו השמורות באבולוציה וזהות באורגניזמים שונים,<br />
לבן מייצג חומצות אמינו עם שמירות ממוצעת <br />
כחול מייצג חומצות אמינו שאינן שמורות אבולוציונית ועמדות אלו מאופיינות במגוון של חומצות אמינו משתנות בין אורגניזמים שונים.<br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> الوظيفة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
في سلسلة نقل الالكترونات يقوم سيتوكروم سي بنقل الكترون بين المعقدين III و IV . المعقد III يسمى سيتوكروم bc1 والمعقد IV يسمى سيتوكروم سي أوكسيداز. نقل الالكترونات يكون ممكنا بسبب حالة تأكسد متغيرة لذرة الحديد ، حيث ان في البداية يتواجد أيون الحديد في مجموعة هيم بحالة Fe3+ الأمر الذي يمكن من استيعاب الكترون واحد وبالتالي اختزال الحديد لحالة Fe2+.<br />
<br> <br />
<br> <br />
صورة 3<br />
</p><br />
[[Image:Cytochrome C Oxydoreductase.jpg|border|center|400px|نرى في الصورة المعقدات المختلفة في سلسلة نقل الالكترونات- سيتوكروم سي هو بروتين صغير مقارنة بالمعقدات 2و3و4 ولا يستطيع المرور عبر الغشاء الخلوي. يمر البروتين عبر الغشاء الداخلي للميتوكوندريا بين المعقد 3 و4. ويمكن الملاحظة ان جميع بروتينات سلسلة نقل الالكترونات تحتوي على مجموعة هيم.]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
يلعب السيتوكروم سي أيضًا دورًا وسيطًا في عملية [https://he.wikipedia.org/wiki/%D7%90%D7%A4%D7%95%D7%A4%D7%98%D7%95%D7%96%D7%94 موت الخلايا المبرمج] وهو شكل محكوم من موت الخلايا يستخدم لقتل الخلايا في عملية النمو من اجل نمو أعضاء صحيحة وأيضا مسئول عن انتقاء خلايا الدم البيضاء ولقتل الخلايا السرطانية او المريضة . <br />
<br><br />
<br> <br />
في هذا [https://youtu.be/Od3pUsVdMhQ الفيديو] نرى دور السيتوكروم سي في موت الخلايا المبرمج. <br />
<br><br />
سيتوكروم سي الحامل للإلكترونات يتواجد داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا بواسطة رابط هيدروفوبي (كاره للماء) للفوسفوليبيد كارديوليبين (وهو جزيء هيدروفوبي يبني غشاء الميتوكوندريا).<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 4<br />
</p><br />
[[Image:Cardiolipin.jpg|border|center|280px|באיור בצד שמאל ניתן לראות את החלבון ציטוכרום סי (אדום) מחובר לפוספוליפיד קרדיוליפין ומעוגן בממברנה הפנימית של המיטוכונדריה. באיור בצד ימין ניתן לראות את הפירוק של הקומפלקס קרדיוליפין + ציטוכרום סי כתוצאה מחימצון מולקולת קרדיוליפין. ציטוכרום סי מתנתק מהממברנה וחופשי לצאת לציטוזול.]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
تتميز بداية عملية الموت الخلوي بارتفاع في نسبة الشوارد الحرة (ROS) في الميتوكوندريا. نتيجة لذلك يتم تأكسد الكارديوليبين وبالتالي فانه يتم تفكيك المعقد كارديوليبين- سيتوكروم سي. <br />
يقوم بعد ذلك السيتوكروم سي بالخروج من الغشاء الداخلي للميتوكوندريا ويمر من خلال الثقوب الموجودة في الغشاء الخارجي وصولا الى السيتوبرلازما. في السيتوبلازما يرتبط سيتوكروم سي لبروتين APAF1 وبروتين dATP وهكذا يتكون مبنى ال أبوبتوسوم وهو بروتين يربط بروتين بروكسباز 9 ويحوله الى صورته النشطة والفعالة وهكذا تتمكن الكاسباسات 3 و7 من الارتباط والعمل (caspase). هذه العملية تؤدي الى ضرر وانقسام في ال DNA الذي ينتهي بموت موجه للخلية.<br />
<br><br />
<br> <br />
صورة 5<br />
</p><br />
[[Image:Apoptosome.jpg|border|center|280px|באיור מתוארת תחילה ההשתחררות של ציטוכרום סי מהמיטוכונדריה אל הציטוזול. לאחר מכן ציטוכרום סי נקשר לחלבון ציטופלזמי היוצר את מכלול האפופטוזום, מכלול זה מהווה את אחד ממרכזי הבקרה החשובים ביותר של האפופטוזה - הוא קושר ומבקע את החלבון פרוקספאז 9, משחרר אותו בצורתו הבוגרת והפעילה, וכך מפעיל את המסלול האפופטוטי הפנימי המסתיים במוות מכוון של התא.]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
منع الموت المبرمج للخلية<br />
<br><br />
تشير العديد من الأبحاث ان الخلايا تستطيع ان تتحكم وتسيطر على موت الخلايا المبرمج ولذك من خلال تعديل تقوم به بعد عملية الترجمة في البروتين. البروتينات هي سلسلة طويلة من الاحماض الامينية، المرحلة الأولى في بناء البروتين هي انتاج سلسلة من الاحماض الامينية (المبنى الاولي) وبعد ذلك تمر هذه السلسلة بالعديد من المعالجات والتعديلات. واحدة من هذه التعديلات هي عملية الفسفرة. عملية الفسفرة يتم فيها إضافة مجموعة فوسفات للبروتين (أيون يحتوي على ذرة فوسفات واحدة و4 ذرات هيدروجين). تتم العملية بواسطة إنزيمات الكيناز والتي تنقل الفوسفات وهي تغيير الشكل التركيبي للبروتين بحيث تعدل من صفاته أو وظيفته. والعملية العكسية تسمى إزالة الفسفرة بواسطة انزيم الفوسفاتيز الذي يقوم بإزالة مجموعة فوسفات من البروتين. في سيتوكروم سي وجد أن هناك عدد من الأحماض الأمينية المحفوظة تطوريًا والتي تمر <scene name='89/898985/Phosphotyrosine_48_97/4'>بعملية الفسفرة</scene> ، الامر الذي يمنع من الإنتاج الزائد للشوارد الحرة (ROS)<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 6<br />
</p><br />
[[Image:Apoptosome formation.jpg|border|center|בתרשים מוצגת פעילות החלבון במצב מזורחן (מבוקר) ובמצב לא מזורחן (לא מבוקר); במצב מבוקר ניתן לראות שקצב הנשימה מווסת ולכן נוצרים מעט רדיקלים חופשיים, פוטנציאל הממברנה חיובי וציטוכרום סי קשור לממברנה הפנימית של המיטוכונדריה באמצעות קרדיוליפין. <br />
במצב לא מבוקר קצב הנשימה התאית הינו קצב מקסימאלי המייצר פוטנציאל ממברנה שלילי, יש עלייה בייצור רדיקלים חופשיים וקומפלקס קרדיוליפין+ציטוכרום סי נפרד. <br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
صورة 7<br />
</p><br />
[[Image:Cytochrome c alignment.jpg|border|center|עימוד ציטוכרום סי מאדם ומעכבר (מרקמה סומטית ומרקמת תאי מין) מאפשר לזהות עמדות שמורות אבולוציונית. ניתן לראות את עמדות 14 ו- 17 הקושרות קוולנטית את קבוצת ההם (חומצות אמינו ציסטאין המסומנות באות הגדולה סי). במיקום החיצים נמצאות עמדות שמורות העוברות מודיפיקציות לאחר תרגום, ביניהן גם עמדות 48 ו- 97 (חומצה אמינית טירוזין המסומנת באות וואי) המוזכרות בערך זה. ]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
وظيفة السيتوكروم سي كمانع للأكسدة (تقليل ROS) تتم بشكل مباشر عن طريق إزالة الأكسيد الفائق O2- وماء الاكسجين (H2O2) من الميتوكوندريا كما هو موضح في الرسم التالي:<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 8<br />
</p><br />
[[Image:Antioxidante.png|center|]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي هو بروتين يلعب دور مركزي في انتاج الطاقة في الخلية وأيضا له دور رئيسي بعمليات موت الخلايا المبرمج.<br />
</p><br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> وراثة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> أمراض </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> ورقة عمل للطالب </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المصادر </div> ==</div>Fatima M Hameedhttps://proteopedia.org/index.php?title=Cytochrome_C_(arabic)&diff=3554793Cytochrome C (arabic)2022-05-01T07:59:18Z<p>Fatima M Hameed: </p>
<hr />
<div>==<center>'''سيتوكروم سي البشري '''</center>==<br />
<p dir='rtl'><br />
<br />
.سيتوكروم سي عبارة عن زلال صغير (الوزن الجزيئي حوالي 1200 دالتون ) وهو بروتين محفوظ للغاية عبر مجموعة من الأنواع ، موجود في النباتات والحيوانات والعديد من الكائنات أحادية الخلية<br />
<br />
يرتبط هذا البروتين بمجموعة [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D9%87%D9%8A%D9%85 هيم] وبمركزها توجد ذرة حديد، وهو بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات وبعملية الاستموات (موت الخلايا المبرمج)<br />
</p><br />
<StructureSection load='1J3S' size='340' side='left' caption=' سيتوكروم سي البشري (PDB code [[1j3s]])' scene='89/898985/Cytochrome_c_basic/19'><br />
==<div style="text-align: right;"> المقدمة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي عبارة عن بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات، والتي هي العملية الأخيرة في عملية <br />
[https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D9%86%D9%81%D8%B3_%D8%AE%D9%84%D9%88%D9%8A التنفس الخلوي]<br />
. عملية التنفس الخلوي تقسم الى 3 أقسام مركزية: [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D8%AD%D9%84%D9%84_%D8%A7%D9%84%D8%AC%D9%84%D9%88%D9%83%D9%88%D8%B2 جليكوليزا ] (التي تحدث في السيتوبلازما)، [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AF%D9%88%D8%B1%D8%A9_%D8%AD%D9%85%D8%B6_%D8%A7%D9%84%D8%B3%D8%AA%D8%B1%D9%8A%D9%83 دورة كريبس] (تحدث في المساحة الداخلية للميتوكوندريا) وسلسلة نقل الالكترونات التي تحدث داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. <br />
<br />
.بنقل الالكترونات لجزيئات أخرى ملامسة لها، وهكذا يتم تشكيل سلسلة من البروتينات حاملة الإلكترونات FADH2 و NADH في سلسلة نقل الالكترونات تقوم الجزيئات المختزلة بدورة كريبس مثل<br />
.يتم استيعاب الإلكترونات في نهاية الأمر بواسطة الأكسجين ويؤدي هذا الاتحاد الى انتاج الماء<br />
نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة ، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا<br />
بواسطة منحدر التركيز الناتج في أيونات الهيدروجين يتم دفع عمل البروتين ATP سنتاز من أجل انتاج ATP. [https://davidson.weizmann.ac.il/ar/online/maagarmada/atp-%D8%B3%D9%8A%D9%86%D8%AB%D8%A7%D8%B2-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AD%D8%B1%D9%83-%D8%A7%D9%84%D8%AC%D8%B2%D9%8A%D8%A6%D9%8A%D9%91-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AA%D9%83%D8%A7%D9%85%D9%84 ATP] هو جزيء غنيّ بالطّاقة، يحتوي على مجموعة من الأدينوساين وثلاث مجموعات من الفوسفور المرتبطة به. يؤدّي التحلّل المائيّ لمجموعة الفوسفور الثالثة إلى إطلاق طاقة تسمح للجسم بتنشيط العديد من الإنزيمات والعمليات الموجودة فيه. يقوم الجسم بإنتاج الATP في الميتوكوندريا في جميع الأوقات وذلك من الاجل الحفاظ على نسبة عالية من الATP داخل الخلية وبالتالي فان نقل الالكترونات وإنتاج منحدر تراكيز لأيونات الهيدروجين تعتبر عملية رئيسية من اجل وجود سليم للخلية.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة1 (قوموا بالوقف على الصورة بالفأرة من أجل اظهار الشرح)<br />
</p><br />
[[Image:Electron_transport_chain_cytochrome_c.jpg|border|center|600px|نرى في الصورة سلسلة نقل الالكترونات – نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا. هذا النقل فعال (يحتاج الى طاقة) وهو عكس منحدر التركيز. تراكم ايونات الهيدروجين في الفراغ بين غشائي الخلية يمكن من دخول الهيدروجين بشكل غير فعال من اجل انتاج جزيء ATP .]]<br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
هنا توجد 3 مقاطع فيديو:<br />
<br><br />
[https://youtu.be/3YTPOIcj6lw סרטון] حول عملية نقل الإلكترون في الميتوكوندريا.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/LQmTKxI4Wn4 סרטון] فيديو يشرح العملية من زاوية أوسع.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/YZsJ-8TenYw סרטון] فيديو عن انحدار التراكيز مع التركيز على ATP سينثاز.<br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> المبنى الجزيئي </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي ينتمي لعائلة البروتين باسم all-α proteins والتي تتميز بوجود <scene name='89/898985/Secondary_structure/4'>المبنى الثنائي</scene> لولب ألفا. كل بروتين ينتمي لهذه المجموعة يحتوي أيضا على مجموعة هيم واحدة أو أكثر.<br />
<br><br />
<scene name='89/898985/Hem_c/2'>HEME C</scene> – مجموعة هيم عبارة عن مركب عضوي يتم انتاجه في النخاع العظمي والكبد. والهيم هو جزء من البروتينات التي تقوم بوظائف متعددة في الجسم. ان فعالية مجموعة هيم تنبع من قدرة ذرة الحديد على ربط جزيئات صغيرة (مثل الاكسجين) وأيضا على قدرتها لأكسدة واختزال مركبات أخرى (ان تعطي الكترونات او ان تستقبل الكترونات، على التوالي).<br />
<br><br />
يتكون السيتوكروم C البشري من <scene name='89/898985/Amino_acids/4'>سلسلة من 104 من الاحماض الامينية</scene> . يرتبط اثنان من الأحماض الأمينية بذرة الحديد <scene name='89/898985/Bond_to_iron_18_80/2'>(الهيستيدين في الموضع 18 والمثيونين في الموضع 80)</scene> ، ويرتبط اثنان من الأحماض الأمينية تساهميًا (رباط تساهمي) من خلال ذرة الكبريت (S) بمجموعة هيم <scene name='89/898985/Bond_to_iron_14_17/2'>(السيستئين في الموضع 17 وسيستئين في الموضع 14)</scene><br />
<br><br />
لقد وجد أن هناك عدد من الأحماض الأمينية المحفوظة تطوريًا، وهي الأحماض الأمينية المهمة لربط ذرة الحديد ومجموعة هيم. <scene name='89/898985/Cxxch_motive/6'>CXXCH</scene> (السيستئين ، X ، X ، السيستئين ، الهيستيدين) حيث يمكن أن يكون X أي حمض أميني غير السيستئين. وهذه المجموعة موجودة أيضا في بروتين سيتوكروم سي البشري.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 2<br />
[[Image:Consurf key small.gif|center|300px|מקרא צבעים לייצוג שמירות אבולוציונית - <br />
סגול כהה מייצג חומצות אמינו השמורות באבולוציה וזהות באורגניזמים שונים,<br />
לבן מייצג חומצות אמינו עם שמירות ממוצעת <br />
כחול מייצג חומצות אמינו שאינן שמורות אבולוציונית ועמדות אלו מאופיינות במגוון של חומצות אמינו משתנות בין אורגניזמים שונים.<br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> الوظيفة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
في سلسلة نقل الالكترونات يقوم سيتوكروم سي بنقل الكترون بين المعقدين III و IV . المعقد III يسمى سيتوكروم bc1 والمعقد IV يسمى سيتوكروم سي أوكسيداز. نقل الالكترونات يكون ممكنا بسبب حالة تأكسد متغيرة لذرة الحديد ، حيث ان في البداية يتواجد أيون الحديد في مجموعة هيم بحالة Fe3+ الأمر الذي يمكن من استيعاب الكترون واحد وبالتالي اختزال الحديد لحالة Fe2+.<br />
<br> <br />
<br> <br />
صورة 3<br />
</p><br />
[[Image:Cytochrome C Oxydoreductase.jpg|border|center|400px|نرى في الصورة المعقدات المختلفة في سلسلة نقل الالكترونات- سيتوكروم سي هو بروتين صغير مقارنة بالمعقدات 2و3و4 ولا يستطيع المرور عبر الغشاء الخلوي. يمر البروتين عبر الغشاء الداخلي للميتوكوندريا بين المعقد 3 و4. ويمكن الملاحظة ان جميع بروتينات سلسلة نقل الالكترونات تحتوي على مجموعة هيم.]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
يلعب السيتوكروم سي أيضًا دورًا وسيطًا في عملية [https://he.wikipedia.org/wiki/%D7%90%D7%A4%D7%95%D7%A4%D7%98%D7%95%D7%96%D7%94 موت الخلايا المبرمج] وهو شكل محكوم من موت الخلايا يستخدم لقتل الخلايا في عملية النمو من اجل نمو أعضاء صحيحة وأيضا مسئول عن انتقاء خلايا الدم البيضاء ولقتل الخلايا السرطانية او المريضة . <br />
<br><br />
<br> <br />
في هذا [https://youtu.be/Od3pUsVdMhQ الفيديو] نرى دور السيتوكروم سي في موت الخلايا المبرمج. <br />
<br><br />
سيتوكروم سي الحامل للإلكترونات يتواجد داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا بواسطة رابط هيدروفوبي (كاره للماء) للفوسفوليبيد كارديوليبين (وهو جزيء هيدروفوبي يبني غشاء الميتوكوندريا).<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 4<br />
</p><br />
[[Image:Cardiolipin.jpg|border|center|280px|באיור בצד שמאל ניתן לראות את החלבון ציטוכרום סי (אדום) מחובר לפוספוליפיד קרדיוליפין ומעוגן בממברנה הפנימית של המיטוכונדריה. באיור בצד ימין ניתן לראות את הפירוק של הקומפלקס קרדיוליפין + ציטוכרום סי כתוצאה מחימצון מולקולת קרדיוליפין. ציטוכרום סי מתנתק מהממברנה וחופשי לצאת לציטוזול.]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
تتميز بداية عملية الموت الخلوي بارتفاع في نسبة الشوارد الحرة (ROS) في الميتوكوندريا. نتيجة لذلك يتم تأكسد الكارديوليبين وبالتالي فانه يتم تفكيك المعقد كارديوليبين- سيتوكروم سي. <br />
يقوم بعد ذلك السيتوكروم سي بالخروج من الغشاء الداخلي للميتوكوندريا ويمر من خلال الثقوب الموجودة في الغشاء الخارجي وصولا الى السيتوبرلازما. في السيتوبلازما يرتبط سيتوكروم سي لبروتين APAF1 وبروتين dATP وهكذا يتكون مبنى ال أبوبتوسوم وهو بروتين يربط بروتين بروكسباز 9 ويحوله الى صورته النشطة والفعالة وهكذا تتمكن الكاسباسات 3 و7 من الارتباط والعمل (caspase). هذه العملية تؤدي الى ضرر وانقسام في ال DNA الذي ينتهي بموت موجه للخلية.<br />
<br><br />
<br> <br />
صورة 5<br />
</p><br />
[[Image:Apoptosome.jpg|border|center|280px|באיור מתוארת תחילה ההשתחררות של ציטוכרום סי מהמיטוכונדריה אל הציטוזול. לאחר מכן ציטוכרום סי נקשר לחלבון ציטופלזמי היוצר את מכלול האפופטוזום, מכלול זה מהווה את אחד ממרכזי הבקרה החשובים ביותר של האפופטוזה - הוא קושר ומבקע את החלבון פרוקספאז 9, משחרר אותו בצורתו הבוגרת והפעילה, וכך מפעיל את המסלול האפופטוטי הפנימי המסתיים במוות מכוון של התא.]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
منع الموت المبرمج للخلية<br />
<br><br />
تشير العديد من الأبحاث ان الخلايا تستطيع ان تتحكم وتسيطر على موت الخلايا المبرمج ولذك من خلال تعديل تقوم به بعد عملية الترجمة في البروتين. البروتينات هي سلسلة طويلة من الاحماض الامينية، المرحلة الأولى في بناء البروتين هي انتاج سلسلة من الاحماض الامينية (المبنى الاولي) وبعد ذلك تمر هذه السلسلة بالعديد من المعالجات والتعديلات. واحدة من هذه التعديلات هي عملية الفسفرة. عملية الفسفرة يتم فيها إضافة مجموعة فوسفات للبروتين (أيون يحتوي على ذرة فوسفات واحدة و4 ذرات هيدروجين). تتم العملية بواسطة إنزيمات الكيناز والتي تنقل الفوسفات وهي تغيير الشكل التركيبي للبروتين بحيث تعدل من صفاته أو وظيفته. والعملية العكسية تسمى إزالة الفسفرة بواسطة انزيم الفوسفاتيز الذي يقوم بإزالة مجموعة فوسفات من البروتين. في سيتوكروم سي وجد أن هناك عدد من الأحماض الأمينية المحفوظة تطوريًا والتي تمر بعملية الفسفرة ، الامر الذي يمنع من الإنتاج الزائد للشوارد الحرة (ROS)<br />
מחקרים מראים שתאים יכולים לשלוט ולבקר על תהליך האפופטוזיס באמצעות מודיפיקציה לאחר תרגום בחלבון. חלבונים, כידוע, הם שרשרות ארוכות של חומצות אמיניות. השלב הראשון בבניית החלבון הוא סינתזת שרשרת החומצות האמיניות; אך על פי רוב, המבנה הראשוני הזה עובר שלבים נוספים של עיבוד, הנקראים מודיפיקציות (התאמות). אחד מסוגי המודיפיקציות הוא זרחון. תהליך הזרחון הינו הוספה של קבוצת זרחה (יון המכיל אטום זרחן אחד וארבעה אטומי חמצן). אנזימי קינאז מוסיפים קבוצות זרחה ואנזימי פוספטאז מסירים אותן. סימון מולקולות באמצעות זרחון משמש לבקרה על מגוון עצום של תהליכים בתאים חיים .בציטוכרום C התגלו מספר חומצות אמינו שמורות מאוד מבחינה אבולוציונית <scene name='89/898985/Phosphotyrosine_48_97/4'>העוברות זרחון</scene> (פוספורלציה) ובכך מקנות לחלבון פעילות מבוקרת המונעת יצירה מוגברת של רדיקלים חופשיים (ROS). <br />
<br><br />
<br><br />
תמונה 6<br />
</p><br />
[[Image:Apoptosome formation.jpg|border|center|בתרשים מוצגת פעילות החלבון במצב מזורחן (מבוקר) ובמצב לא מזורחן (לא מבוקר); במצב מבוקר ניתן לראות שקצב הנשימה מווסת ולכן נוצרים מעט רדיקלים חופשיים, פוטנציאל הממברנה חיובי וציטוכרום סי קשור לממברנה הפנימית של המיטוכונדריה באמצעות קרדיוליפין. <br />
במצב לא מבוקר קצב הנשימה התאית הינו קצב מקסימאלי המייצר פוטנציאל ממברנה שלילי, יש עלייה בייצור רדיקלים חופשיים וקומפלקס קרדיוליפין+ציטוכרום סי נפרד. <br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
תמונה 7<br />
</p><br />
[[Image:Cytochrome c alignment.jpg|border|center|עימוד ציטוכרום סי מאדם ומעכבר (מרקמה סומטית ומרקמת תאי מין) מאפשר לזהות עמדות שמורות אבולוציונית. ניתן לראות את עמדות 14 ו- 17 הקושרות קוולנטית את קבוצת ההם (חומצות אמינו ציסטאין המסומנות באות הגדולה סי). במיקום החיצים נמצאות עמדות שמורות העוברות מודיפיקציות לאחר תרגום, ביניהן גם עמדות 48 ו- 97 (חומצה אמינית טירוזין המסומנת באות וואי) המוזכרות בערך זה. ]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
פעילותו כנוגד חמצון (מפחית ROS) נעשית גם באופן ישיר על ידי הסרת סופראוקסיד (O2–) ומי חמצן (H2O2) מהמיטוכונדריה לפי התרשים הבא-<br />
<br><br />
<br><br />
תמונה 8<br />
</p><br />
[[Image:Antioxidante.png|center|]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
ציטוכרום C הינו חלבון המשחק תפקיד מרכזי בתהליכי יצור האנרגיה בתא וכמו גם שחקן מפתח בתהליכים של מוות תאי מבוקר.<br />
</p><br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> وراثة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> أمراض </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> ورقة عمل للطالب </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المصادر </div> ==</div>Fatima M Hameedhttps://proteopedia.org/index.php?title=Cytochrome_C_(arabic)&diff=3554792Cytochrome C (arabic)2022-05-01T07:50:07Z<p>Fatima M Hameed: </p>
<hr />
<div>==<center>'''سيتوكروم سي البشري '''</center>==<br />
<p dir='rtl'><br />
<br />
.سيتوكروم سي عبارة عن زلال صغير (الوزن الجزيئي حوالي 1200 دالتون ) وهو بروتين محفوظ للغاية عبر مجموعة من الأنواع ، موجود في النباتات والحيوانات والعديد من الكائنات أحادية الخلية<br />
<br />
يرتبط هذا البروتين بمجموعة [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D9%87%D9%8A%D9%85 هيم] وبمركزها توجد ذرة حديد، وهو بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات وبعملية الاستموات (موت الخلايا المبرمج)<br />
</p><br />
<StructureSection load='1J3S' size='340' side='left' caption=' سيتوكروم سي البشري (PDB code [[1j3s]])' scene='89/898985/Cytochrome_c_basic/19'><br />
==<div style="text-align: right;"> المقدمة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي عبارة عن بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات، والتي هي العملية الأخيرة في عملية <br />
[https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D9%86%D9%81%D8%B3_%D8%AE%D9%84%D9%88%D9%8A التنفس الخلوي]<br />
. عملية التنفس الخلوي تقسم الى 3 أقسام مركزية: [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D8%AD%D9%84%D9%84_%D8%A7%D9%84%D8%AC%D9%84%D9%88%D9%83%D9%88%D8%B2 جليكوليزا ] (التي تحدث في السيتوبلازما)، [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AF%D9%88%D8%B1%D8%A9_%D8%AD%D9%85%D8%B6_%D8%A7%D9%84%D8%B3%D8%AA%D8%B1%D9%8A%D9%83 دورة كريبس] (تحدث في المساحة الداخلية للميتوكوندريا) وسلسلة نقل الالكترونات التي تحدث داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. <br />
<br />
.بنقل الالكترونات لجزيئات أخرى ملامسة لها، وهكذا يتم تشكيل سلسلة من البروتينات حاملة الإلكترونات FADH2 و NADH في سلسلة نقل الالكترونات تقوم الجزيئات المختزلة بدورة كريبس مثل<br />
.يتم استيعاب الإلكترونات في نهاية الأمر بواسطة الأكسجين ويؤدي هذا الاتحاد الى انتاج الماء<br />
نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة ، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا<br />
بواسطة منحدر التركيز الناتج في أيونات الهيدروجين يتم دفع عمل البروتين ATP سنتاز من أجل انتاج ATP. [https://davidson.weizmann.ac.il/ar/online/maagarmada/atp-%D8%B3%D9%8A%D9%86%D8%AB%D8%A7%D8%B2-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AD%D8%B1%D9%83-%D8%A7%D9%84%D8%AC%D8%B2%D9%8A%D8%A6%D9%8A%D9%91-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AA%D9%83%D8%A7%D9%85%D9%84 ATP] هو جزيء غنيّ بالطّاقة، يحتوي على مجموعة من الأدينوساين وثلاث مجموعات من الفوسفور المرتبطة به. يؤدّي التحلّل المائيّ لمجموعة الفوسفور الثالثة إلى إطلاق طاقة تسمح للجسم بتنشيط العديد من الإنزيمات والعمليات الموجودة فيه. يقوم الجسم بإنتاج الATP في الميتوكوندريا في جميع الأوقات وذلك من الاجل الحفاظ على نسبة عالية من الATP داخل الخلية وبالتالي فان نقل الالكترونات وإنتاج منحدر تراكيز لأيونات الهيدروجين تعتبر عملية رئيسية من اجل وجود سليم للخلية.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة1 (قوموا بالوقف على الصورة بالفأرة من أجل اظهار الشرح)<br />
</p><br />
[[Image:Electron_transport_chain_cytochrome_c.jpg|border|center|600px|نرى في الصورة سلسلة نقل الالكترونات – نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا. هذا النقل فعال (يحتاج الى طاقة) وهو عكس منحدر التركيز. تراكم ايونات الهيدروجين في الفراغ بين غشائي الخلية يمكن من دخول الهيدروجين بشكل غير فعال من اجل انتاج جزيء ATP .]]<br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
هنا توجد 3 مقاطع فيديو:<br />
<br><br />
[https://youtu.be/3YTPOIcj6lw סרטון] حول عملية نقل الإلكترون في الميتوكوندريا.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/LQmTKxI4Wn4 סרטון] فيديو يشرح العملية من زاوية أوسع.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/YZsJ-8TenYw סרטון] فيديو عن انحدار التراكيز مع التركيز على ATP سينثاز.<br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> المبنى الجزيئي </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي ينتمي لعائلة البروتين باسم all-α proteins والتي تتميز بوجود <scene name='89/898985/Secondary_structure/4'>المبنى الثنائي</scene> لولب ألفا. كل بروتين ينتمي لهذه المجموعة يحتوي أيضا على مجموعة هيم واحدة أو أكثر.<br />
<br><br />
<scene name='89/898985/Hem_c/2'>HEME C</scene> – مجموعة هيم عبارة عن مركب عضوي يتم انتاجه في النخاع العظمي والكبد. والهيم هو جزء من البروتينات التي تقوم بوظائف متعددة في الجسم. ان فعالية مجموعة هيم تنبع من قدرة ذرة الحديد على ربط جزيئات صغيرة (مثل الاكسجين) وأيضا على قدرتها لأكسدة واختزال مركبات أخرى (ان تعطي الكترونات او ان تستقبل الكترونات، على التوالي).<br />
<br><br />
يتكون السيتوكروم C البشري من <scene name='89/898985/Amino_acids/4'>سلسلة من 104 من الاحماض الامينية</scene> . يرتبط اثنان من الأحماض الأمينية بذرة الحديد <scene name='89/898985/Bond_to_iron_18_80/2'>(الهيستيدين في الموضع 18 والمثيونين في الموضع 80)</scene> ، ويرتبط اثنان من الأحماض الأمينية تساهميًا (رباط تساهمي) من خلال ذرة الكبريت (S) بمجموعة هيم <scene name='89/898985/Bond_to_iron_14_17/2'>(السيستئين في الموضع 17 وسيستئين في الموضع 14)</scene><br />
<br><br />
لقد وجد أن هناك عدد من الأحماض الأمينية المحفوظة تطوريًا، وهي الأحماض الأمينية المهمة لربط ذرة الحديد ومجموعة هيم. <scene name='89/898985/Cxxch_motive/6'>CXXCH</scene> (السيستئين ، X ، X ، السيستئين ، الهيستيدين) حيث يمكن أن يكون X أي حمض أميني غير السيستئين. وهذه المجموعة موجودة أيضا في بروتين سيتوكروم سي البشري.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 2<br />
[[Image:Consurf key small.gif|center|300px|מקרא צבעים לייצוג שמירות אבולוציונית - <br />
סגול כהה מייצג חומצות אמינו השמורות באבולוציה וזהות באורגניזמים שונים,<br />
לבן מייצג חומצות אמינו עם שמירות ממוצעת <br />
כחול מייצג חומצות אמינו שאינן שמורות אבולוציונית ועמדות אלו מאופיינות במגוון של חומצות אמינו משתנות בין אורגניזמים שונים.<br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;"> الوظيفة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
في سلسلة نقل الالكترونات يقوم سيتوكروم سي بنقل الكترون بين المعقدين III و IV . المعقد III يسمى سيتوكروم bc1 والمعقد IV يسمى سيتوكروم سي أوكسيداز. نقل الالكترونات يكون ممكنا بسبب حالة تأكسد متغيرة لذرة الحديد ، حيث ان في البداية يتواجد أيون الحديد في مجموعة هيم بحالة Fe3+ الأمر الذي يمكن من استيعاب الكترون واحد وبالتالي اختزال الحديد لحالة Fe2+.<br />
<br> <br />
<br> <br />
صورة 3<br />
</p><br />
[[Image:Cytochrome C Oxydoreductase.jpg|border|center|400px|نرى في الصورة المعقدات المختلفة في سلسلة نقل الالكترونات- سيتوكروم سي هو بروتين صغير مقارنة بالمعقدات 2و3و4 ولا يستطيع المرور عبر الغشاء الخلوي. يمر البروتين عبر الغشاء الداخلي للميتوكوندريا بين المعقد 3 و4. ويمكن الملاحظة ان جميع بروتينات سلسلة نقل الالكترونات تحتوي على مجموعة هيم.]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
يلعب السيتوكروم سي أيضًا دورًا وسيطًا في عملية [https://he.wikipedia.org/wiki/%D7%90%D7%A4%D7%95%D7%A4%D7%98%D7%95%D7%96%D7%94 موت الخلايا المبرمج] وهو شكل محكوم من موت الخلايا يستخدم لقتل الخلايا في عملية النمو من اجل نمو أعضاء صحيحة وأيضا مسئول عن انتقاء خلايا الدم البيضاء ولقتل الخلايا السرطانية او المريضة . <br />
<br><br />
<br> <br />
ב [https://youtu.be/Od3pUsVdMhQ סרטון] הבא מתואר תהליך המוות המבוקר, ניתן לראות כיצד ציטוכרום C קשור לתהליך. <br />
<br><br />
כאשר ציטוכרום C מתפקד כנשא אלקטרונים הוא מעוגן לממברנה הפנימית של המיטוכונדריה באמצעות קשר הידרופובי לפוסופליפיד קרדיוליפין (מולקולה הידרופובית הבונה את הממברנה של המיטוכונדריה). <br />
<br><br />
<br><br />
תמונה 4<br />
</p><br />
[[Image:Cardiolipin.jpg|border|center|280px|באיור בצד שמאל ניתן לראות את החלבון ציטוכרום סי (אדום) מחובר לפוספוליפיד קרדיוליפין ומעוגן בממברנה הפנימית של המיטוכונדריה. באיור בצד ימין ניתן לראות את הפירוק של הקומפלקס קרדיוליפין + ציטוכרום סי כתוצאה מחימצון מולקולת קרדיוליפין. ציטוכרום סי מתנתק מהממברנה וחופשי לצאת לציטוזול.]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
תחילת תהליך המוות התאי מאופיינת בעלייה של רדיקלים חופשיים (ROS) במיטוכונדריה. כתוצאה מכך, קרדיוליפין מתחמצן והקומפלקס קרדיוליפין-ציטוכרום C נפרד. ציטוכרום C מנותק מהממברנה הפנימית של המיטוכונדריה ועובר דרך נקבוביות בממברנה החיצונית אל הציטופלזמה. בציטופלזמה ציטוכרום C נקשר לחלבון APAF1 וביחד עם dATP נוצר מכלול- מבנה האפופטוזום, הקושר ומבקע את החלבון פרוקספאז 9 לצורתו הבוגרת והפעילה. בכך מתאפשר חיבור עם קספאזות 3 ו- 7 והפעלתן. פעילות זו מובילה לפגיעה וקיטוע ה DNA המסתיים במוות מכוון של התא.<br />
<br><br />
<br> <br />
תמונה 5<br />
</p><br />
[[Image:Apoptosome.jpg|border|center|280px|באיור מתוארת תחילה ההשתחררות של ציטוכרום סי מהמיטוכונדריה אל הציטוזול. לאחר מכן ציטוכרום סי נקשר לחלבון ציטופלזמי היוצר את מכלול האפופטוזום, מכלול זה מהווה את אחד ממרכזי הבקרה החשובים ביותר של האפופטוזה - הוא קושר ומבקע את החלבון פרוקספאז 9, משחרר אותו בצורתו הבוגרת והפעילה, וכך מפעיל את המסלול האפופטוטי הפנימי המסתיים במוות מכוון של התא.]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
מניעת אפופטוזיס - <br />
<br><br />
מחקרים מראים שתאים יכולים לשלוט ולבקר על תהליך האפופטוזיס באמצעות מודיפיקציה לאחר תרגום בחלבון. חלבונים, כידוע, הם שרשרות ארוכות של חומצות אמיניות. השלב הראשון בבניית החלבון הוא סינתזת שרשרת החומצות האמיניות; אך על פי רוב, המבנה הראשוני הזה עובר שלבים נוספים של עיבוד, הנקראים מודיפיקציות (התאמות). אחד מסוגי המודיפיקציות הוא זרחון. תהליך הזרחון הינו הוספה של קבוצת זרחה (יון המכיל אטום זרחן אחד וארבעה אטומי חמצן). אנזימי קינאז מוסיפים קבוצות זרחה ואנזימי פוספטאז מסירים אותן. סימון מולקולות באמצעות זרחון משמש לבקרה על מגוון עצום של תהליכים בתאים חיים .בציטוכרום C התגלו מספר חומצות אמינו שמורות מאוד מבחינה אבולוציונית <scene name='89/898985/Phosphotyrosine_48_97/4'>העוברות זרחון</scene> (פוספורלציה) ובכך מקנות לחלבון פעילות מבוקרת המונעת יצירה מוגברת של רדיקלים חופשיים (ROS). <br />
<br><br />
<br><br />
תמונה 6<br />
</p><br />
[[Image:Apoptosome formation.jpg|border|center|בתרשים מוצגת פעילות החלבון במצב מזורחן (מבוקר) ובמצב לא מזורחן (לא מבוקר); במצב מבוקר ניתן לראות שקצב הנשימה מווסת ולכן נוצרים מעט רדיקלים חופשיים, פוטנציאל הממברנה חיובי וציטוכרום סי קשור לממברנה הפנימית של המיטוכונדריה באמצעות קרדיוליפין. <br />
במצב לא מבוקר קצב הנשימה התאית הינו קצב מקסימאלי המייצר פוטנציאל ממברנה שלילי, יש עלייה בייצור רדיקלים חופשיים וקומפלקס קרדיוליפין+ציטוכרום סי נפרד. <br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
תמונה 7<br />
</p><br />
[[Image:Cytochrome c alignment.jpg|border|center|עימוד ציטוכרום סי מאדם ומעכבר (מרקמה סומטית ומרקמת תאי מין) מאפשר לזהות עמדות שמורות אבולוציונית. ניתן לראות את עמדות 14 ו- 17 הקושרות קוולנטית את קבוצת ההם (חומצות אמינו ציסטאין המסומנות באות הגדולה סי). במיקום החיצים נמצאות עמדות שמורות העוברות מודיפיקציות לאחר תרגום, ביניהן גם עמדות 48 ו- 97 (חומצה אמינית טירוזין המסומנת באות וואי) המוזכרות בערך זה. ]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
פעילותו כנוגד חמצון (מפחית ROS) נעשית גם באופן ישיר על ידי הסרת סופראוקסיד (O2–) ומי חמצן (H2O2) מהמיטוכונדריה לפי התרשים הבא-<br />
<br><br />
<br><br />
תמונה 8<br />
</p><br />
[[Image:Antioxidante.png|center|]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
ציטוכרום C הינו חלבון המשחק תפקיד מרכזי בתהליכי יצור האנרגיה בתא וכמו גם שחקן מפתח בתהליכים של מוות תאי מבוקר.<br />
</p><br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> وراثة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> أمراض </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> ورقة عمل للطالب </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المصادر </div> ==</div>Fatima M Hameedhttps://proteopedia.org/index.php?title=Cytochrome_C_(arabic)&diff=3554791Cytochrome C (arabic)2022-05-01T07:46:47Z<p>Fatima M Hameed: </p>
<hr />
<div>==<center>'''سيتوكروم سي البشري '''</center>==<br />
<p dir='rtl'><br />
<br />
.سيتوكروم سي عبارة عن زلال صغير (الوزن الجزيئي حوالي 1200 دالتون ) وهو بروتين محفوظ للغاية عبر مجموعة من الأنواع ، موجود في النباتات والحيوانات والعديد من الكائنات أحادية الخلية<br />
<br />
يرتبط هذا البروتين بمجموعة [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D9%87%D9%8A%D9%85 هيم] وبمركزها توجد ذرة حديد، وهو بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات وبعملية الاستموات (موت الخلايا المبرمج)<br />
</p><br />
<StructureSection load='1J3S' size='340' side='left' caption=' سيتوكروم سي البشري (PDB code [[1j3s]])' scene='89/898985/Cytochrome_c_basic/19'><br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المقدمة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي عبارة عن بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات، والتي هي العملية الأخيرة في عملية <br />
[https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D9%86%D9%81%D8%B3_%D8%AE%D9%84%D9%88%D9%8A التنفس الخلوي]<br />
. عملية التنفس الخلوي تقسم الى 3 أقسام مركزية: [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D8%AD%D9%84%D9%84_%D8%A7%D9%84%D8%AC%D9%84%D9%88%D9%83%D9%88%D8%B2 جليكوليزا ] (التي تحدث في السيتوبلازما)، [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AF%D9%88%D8%B1%D8%A9_%D8%AD%D9%85%D8%B6_%D8%A7%D9%84%D8%B3%D8%AA%D8%B1%D9%8A%D9%83 دورة كريبس] (تحدث في المساحة الداخلية للميتوكوندريا) وسلسلة نقل الالكترونات التي تحدث داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. <br />
<br />
.بنقل الالكترونات لجزيئات أخرى ملامسة لها، وهكذا يتم تشكيل سلسلة من البروتينات حاملة الإلكترونات FADH2 و NADH في سلسلة نقل الالكترونات تقوم الجزيئات المختزلة بدورة كريبس مثل<br />
.يتم استيعاب الإلكترونات في نهاية الأمر بواسطة الأكسجين ويؤدي هذا الاتحاد الى انتاج الماء<br />
نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة ، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا<br />
بواسطة منحدر التركيز الناتج في أيونات الهيدروجين يتم دفع عمل البروتين ATP سنتاز من أجل انتاج ATP. [https://davidson.weizmann.ac.il/ar/online/maagarmada/atp-%D8%B3%D9%8A%D9%86%D8%AB%D8%A7%D8%B2-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AD%D8%B1%D9%83-%D8%A7%D9%84%D8%AC%D8%B2%D9%8A%D8%A6%D9%8A%D9%91-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AA%D9%83%D8%A7%D9%85%D9%84 ATP] هو جزيء غنيّ بالطّاقة، يحتوي على مجموعة من الأدينوساين وثلاث مجموعات من الفوسفور المرتبطة به. يؤدّي التحلّل المائيّ لمجموعة الفوسفور الثالثة إلى إطلاق طاقة تسمح للجسم بتنشيط العديد من الإنزيمات والعمليات الموجودة فيه. يقوم الجسم بإنتاج الATP في الميتوكوندريا في جميع الأوقات وذلك من الاجل الحفاظ على نسبة عالية من الATP داخل الخلية وبالتالي فان نقل الالكترونات وإنتاج منحدر تراكيز لأيونات الهيدروجين تعتبر عملية رئيسية من اجل وجود سليم للخلية.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة1 (قوموا بالوقف على الصورة بالفأرة من أجل اظهار الشرح)<br />
</p><br />
[[Image:Electron_transport_chain_cytochrome_c.jpg|border|center|600px|نرى في الصورة سلسلة نقل الالكترونات – نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا. هذا النقل فعال (يحتاج الى طاقة) وهو عكس منحدر التركيز. تراكم ايونات الهيدروجين في الفراغ بين غشائي الخلية يمكن من دخول الهيدروجين بشكل غير فعال من اجل انتاج جزيء ATP .]]<br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
هنا توجد 3 مقاطع فيديو:<br />
<br><br />
[https://youtu.be/3YTPOIcj6lw סרטון] حول عملية نقل الإلكترون في الميتوكوندريا.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/LQmTKxI4Wn4 סרטון] فيديو يشرح العملية من زاوية أوسع.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/YZsJ-8TenYw סרטון] فيديو عن انحدار التراكيز مع التركيز على ATP سينثاز.<br />
</p><br />
<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المبنى الجزيئي </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي ينتمي لعائلة البروتين باسم all-α proteins والتي تتميز بوجود <scene name='89/898985/Secondary_structure/4'>المبنى الثنائي</scene> لولب ألفا. كل بروتين ينتمي لهذه المجموعة يحتوي أيضا على مجموعة هيم واحدة أو أكثر.<br />
<br><br />
<scene name='89/898985/Hem_c/2'>HEME C</scene> – مجموعة هيم عبارة عن مركب عضوي يتم انتاجه في النخاع العظمي والكبد. والهيم هو جزء من البروتينات التي تقوم بوظائف متعددة في الجسم. ان فعالية مجموعة هيم تنبع من قدرة ذرة الحديد على ربط جزيئات صغيرة (مثل الاكسجين) وأيضا على قدرتها لأكسدة واختزال مركبات أخرى (ان تعطي الكترونات او ان تستقبل الكترونات، على التوالي).<br />
<br><br />
يتكون السيتوكروم C البشري من <scene name='89/898985/Amino_acids/4'>سلسلة من 104 من الاحماض الامينية</scene> . يرتبط اثنان من الأحماض الأمينية بذرة الحديد <scene name='89/898985/Bond_to_iron_18_80/2'>(الهيستيدين في الموضع 18 والمثيونين في الموضع 80)</scene> ، ويرتبط اثنان من الأحماض الأمينية تساهميًا (رباط تساهمي) من خلال ذرة الكبريت (S) بمجموعة هيم <scene name='89/898985/Bond_to_iron_14_17/2'>(السيستئين في الموضع 17 وسيستئين في الموضع 14)</scene><br />
<br><br />
لقد وجد أن هناك عدد من الأحماض الأمينية المحفوظة تطوريًا، وهي الأحماض الأمينية المهمة لربط ذرة الحديد ومجموعة هيم. <scene name='89/898985/Cxxch_motive/6'>CXXCH</scene> (السيستئين ، X ، X ، السيستئين ، الهيستيدين) حيث يمكن أن يكون X أي حمض أميني غير السيستئين. وهذه المجموعة موجودة أيضا في بروتين سيتوكروم سي البشري.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 2<br />
[[Image:Consurf key small.gif|center|300px|מקרא צבעים לייצוג שמירות אבולוציונית - <br />
סגול כהה מייצג חומצות אמינו השמורות באבולוציה וזהות באורגניזמים שונים,<br />
לבן מייצג חומצות אמינו עם שמירות ממוצעת <br />
כחול מייצג חומצות אמינו שאינן שמורות אבולוציונית ועמדות אלו מאופיינות במגוון של חומצות אמינו משתנות בין אורגניזמים שונים.<br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> الوظيفة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
في سلسلة نقل الالكترونات يقوم سيتوكروم سي بنقل الكترون بين المعقدين III و IV . المعقد III يسمى سيتوكروم bc1 والمعقد IV يسمى سيتوكروم سي أوكسيداز. نقل الالكترونات يكون ممكنا بسبب حالة تأكسد متغيرة لذرة الحديد ، حيث ان في البداية يتواجد أيون الحديد في مجموعة هيم بحالة Fe3+ الأمر الذي يمكن من استيعاب الكترون واحد وبالتالي اختزال الحديد لحالة Fe2+.<br />
<br> <br />
<br> <br />
صورة 3<br />
</p><br />
[[Image:Cytochrome C Oxydoreductase.jpg|border|center|400px|نرى في الصورة المعقدات المختلفة في سلسلة نقل الالكترونات- سيتوكروم سي هو بروتين صغير مقارنة بالمعقدات 2و3و4 ولا يستطيع المرور عبر الغشاء الخلوي. يمر البروتين عبر الغشاء الداخلي للميتوكوندريا بين المعقد 3 و4. ويمكن الملاحظة ان جميع بروتينات سلسلة نقل الالكترونات تحتوي على مجموعة هيم.]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
يلعب السيتوكروم سي أيضًا دورًا وسيطًا في عملية [https://he.wikipedia.org/wiki/%D7%90%D7%A4%D7%95%D7%A4%D7%98%D7%95%D7%96%D7%94 موت الخلايا المبرمج] وهو شكل محكوم من موت الخلايا يستخدم لقتل الخلايا في عملية النمو من اجل نمو أعضاء صحيحة وأيضا مسئول عن انتقاء خلايا الدم البيضاء ولقتل الخلايا السرطانية او المريضة . <br />
<br><br />
<br> <br />
ב [https://youtu.be/Od3pUsVdMhQ סרטון] הבא מתואר תהליך המוות המבוקר, ניתן לראות כיצד ציטוכרום C קשור לתהליך. <br />
<br><br />
כאשר ציטוכרום C מתפקד כנשא אלקטרונים הוא מעוגן לממברנה הפנימית של המיטוכונדריה באמצעות קשר הידרופובי לפוסופליפיד קרדיוליפין (מולקולה הידרופובית הבונה את הממברנה של המיטוכונדריה). <br />
<br><br />
<br><br />
תמונה 4<br />
</p><br />
[[Image:Cardiolipin.jpg|border|center|280px|באיור בצד שמאל ניתן לראות את החלבון ציטוכרום סי (אדום) מחובר לפוספוליפיד קרדיוליפין ומעוגן בממברנה הפנימית של המיטוכונדריה. באיור בצד ימין ניתן לראות את הפירוק של הקומפלקס קרדיוליפין + ציטוכרום סי כתוצאה מחימצון מולקולת קרדיוליפין. ציטוכרום סי מתנתק מהממברנה וחופשי לצאת לציטוזול.]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
תחילת תהליך המוות התאי מאופיינת בעלייה של רדיקלים חופשיים (ROS) במיטוכונדריה. כתוצאה מכך, קרדיוליפין מתחמצן והקומפלקס קרדיוליפין-ציטוכרום C נפרד. ציטוכרום C מנותק מהממברנה הפנימית של המיטוכונדריה ועובר דרך נקבוביות בממברנה החיצונית אל הציטופלזמה. בציטופלזמה ציטוכרום C נקשר לחלבון APAF1 וביחד עם dATP נוצר מכלול- מבנה האפופטוזום, הקושר ומבקע את החלבון פרוקספאז 9 לצורתו הבוגרת והפעילה. בכך מתאפשר חיבור עם קספאזות 3 ו- 7 והפעלתן. פעילות זו מובילה לפגיעה וקיטוע ה DNA המסתיים במוות מכוון של התא.<br />
<br><br />
<br> <br />
תמונה 5<br />
</p><br />
[[Image:Apoptosome.jpg|border|center|280px|באיור מתוארת תחילה ההשתחררות של ציטוכרום סי מהמיטוכונדריה אל הציטוזול. לאחר מכן ציטוכרום סי נקשר לחלבון ציטופלזמי היוצר את מכלול האפופטוזום, מכלול זה מהווה את אחד ממרכזי הבקרה החשובים ביותר של האפופטוזה - הוא קושר ומבקע את החלבון פרוקספאז 9, משחרר אותו בצורתו הבוגרת והפעילה, וכך מפעיל את המסלול האפופטוטי הפנימי המסתיים במוות מכוון של התא.]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
מניעת אפופטוזיס - <br />
<br><br />
מחקרים מראים שתאים יכולים לשלוט ולבקר על תהליך האפופטוזיס באמצעות מודיפיקציה לאחר תרגום בחלבון. חלבונים, כידוע, הם שרשרות ארוכות של חומצות אמיניות. השלב הראשון בבניית החלבון הוא סינתזת שרשרת החומצות האמיניות; אך על פי רוב, המבנה הראשוני הזה עובר שלבים נוספים של עיבוד, הנקראים מודיפיקציות (התאמות). אחד מסוגי המודיפיקציות הוא זרחון. תהליך הזרחון הינו הוספה של קבוצת זרחה (יון המכיל אטום זרחן אחד וארבעה אטומי חמצן). אנזימי קינאז מוסיפים קבוצות זרחה ואנזימי פוספטאז מסירים אותן. סימון מולקולות באמצעות זרחון משמש לבקרה על מגוון עצום של תהליכים בתאים חיים .בציטוכרום C התגלו מספר חומצות אמינו שמורות מאוד מבחינה אבולוציונית <scene name='89/898985/Phosphotyrosine_48_97/4'>העוברות זרחון</scene> (פוספורלציה) ובכך מקנות לחלבון פעילות מבוקרת המונעת יצירה מוגברת של רדיקלים חופשיים (ROS). <br />
<br><br />
<br><br />
תמונה 6<br />
</p><br />
[[Image:Apoptosome formation.jpg|border|center|בתרשים מוצגת פעילות החלבון במצב מזורחן (מבוקר) ובמצב לא מזורחן (לא מבוקר); במצב מבוקר ניתן לראות שקצב הנשימה מווסת ולכן נוצרים מעט רדיקלים חופשיים, פוטנציאל הממברנה חיובי וציטוכרום סי קשור לממברנה הפנימית של המיטוכונדריה באמצעות קרדיוליפין. <br />
במצב לא מבוקר קצב הנשימה התאית הינו קצב מקסימאלי המייצר פוטנציאל ממברנה שלילי, יש עלייה בייצור רדיקלים חופשיים וקומפלקס קרדיוליפין+ציטוכרום סי נפרד. <br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
תמונה 7<br />
</p><br />
[[Image:Cytochrome c alignment.jpg|border|center|עימוד ציטוכרום סי מאדם ומעכבר (מרקמה סומטית ומרקמת תאי מין) מאפשר לזהות עמדות שמורות אבולוציונית. ניתן לראות את עמדות 14 ו- 17 הקושרות קוולנטית את קבוצת ההם (חומצות אמינו ציסטאין המסומנות באות הגדולה סי). במיקום החיצים נמצאות עמדות שמורות העוברות מודיפיקציות לאחר תרגום, ביניהן גם עמדות 48 ו- 97 (חומצה אמינית טירוזין המסומנת באות וואי) המוזכרות בערך זה. ]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
פעילותו כנוגד חמצון (מפחית ROS) נעשית גם באופן ישיר על ידי הסרת סופראוקסיד (O2–) ומי חמצן (H2O2) מהמיטוכונדריה לפי התרשים הבא-<br />
<br><br />
<br><br />
תמונה 8<br />
</p><br />
[[Image:Antioxidante.png|center|]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
ציטוכרום C הינו חלבון המשחק תפקיד מרכזי בתהליכי יצור האנרגיה בתא וכמו גם שחקן מפתח בתהליכים של מוות תאי מבוקר.<br />
</p><br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> وراثة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> أمراض </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> ورقة عمل للطالب </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المصادر </div> ==</div>Fatima M Hameedhttps://proteopedia.org/index.php?title=Cytochrome_C_(arabic)&diff=3554790Cytochrome C (arabic)2022-05-01T07:44:43Z<p>Fatima M Hameed: </p>
<hr />
<div>==<center>'''سيتوكروم سي البشري '''</center>==<br />
<p dir='rtl'><br />
<br />
.سيتوكروم سي عبارة عن زلال صغير (الوزن الجزيئي حوالي 1200 دالتون ) وهو بروتين محفوظ للغاية عبر مجموعة من الأنواع ، موجود في النباتات والحيوانات والعديد من الكائنات أحادية الخلية<br />
<br />
يرتبط هذا البروتين بمجموعة [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D9%87%D9%8A%D9%85 هيم] وبمركزها توجد ذرة حديد، وهو بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات وبعملية الاستموات (موت الخلايا المبرمج)<br />
</p><br />
<StructureSection load='1J3S' size='340' side='left' caption=' سيتوكروم سي البشري (PDB code [[1j3s]])' scene='89/898985/Cytochrome_c_basic/19'><br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> مقدمة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي عبارة عن بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات، والتي هي العملية الأخيرة في عملية <br />
[https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D9%86%D9%81%D8%B3_%D8%AE%D9%84%D9%88%D9%8A التنفس الخلوي]<br />
. عملية التنفس الخلوي تقسم الى 3 أقسام مركزية: [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D8%AD%D9%84%D9%84_%D8%A7%D9%84%D8%AC%D9%84%D9%88%D9%83%D9%88%D8%B2 جليكوليزا ] (التي تحدث في السيتوبلازما)، [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AF%D9%88%D8%B1%D8%A9_%D8%AD%D9%85%D8%B6_%D8%A7%D9%84%D8%B3%D8%AA%D8%B1%D9%8A%D9%83 دورة كريبس] (تحدث في المساحة الداخلية للميتوكوندريا) وسلسلة نقل الالكترونات التي تحدث داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. <br />
<br />
.بنقل الالكترونات لجزيئات أخرى ملامسة لها، وهكذا يتم تشكيل سلسلة من البروتينات حاملة الإلكترونات FADH2 و NADH في سلسلة نقل الالكترونات تقوم الجزيئات المختزلة بدورة كريبس مثل<br />
.يتم استيعاب الإلكترونات في نهاية الأمر بواسطة الأكسجين ويؤدي هذا الاتحاد الى انتاج الماء<br />
نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة ، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا<br />
بواسطة منحدر التركيز الناتج في أيونات الهيدروجين يتم دفع عمل البروتين ATP سنتاز من أجل انتاج ATP. [https://davidson.weizmann.ac.il/ar/online/maagarmada/atp-%D8%B3%D9%8A%D9%86%D8%AB%D8%A7%D8%B2-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AD%D8%B1%D9%83-%D8%A7%D9%84%D8%AC%D8%B2%D9%8A%D8%A6%D9%8A%D9%91-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AA%D9%83%D8%A7%D9%85%D9%84 ATP] هو جزيء غنيّ بالطّاقة، يحتوي على مجموعة من الأدينوساين وثلاث مجموعات من الفوسفور المرتبطة به. يؤدّي التحلّل المائيّ لمجموعة الفوسفور الثالثة إلى إطلاق طاقة تسمح للجسم بتنشيط العديد من الإنزيمات والعمليات الموجودة فيه. يقوم الجسم بإنتاج الATP في الميتوكوندريا في جميع الأوقات وذلك من الاجل الحفاظ على نسبة عالية من الATP داخل الخلية وبالتالي فان نقل الالكترونات وإنتاج منحدر تراكيز لأيونات الهيدروجين تعتبر عملية رئيسية من اجل وجود سليم للخلية.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة1 (قوموا بالوقف على الصورة بالفأرة من أجل اظهار الشرح)<br />
</p><br />
[[Image:Electron_transport_chain_cytochrome_c.jpg|border|center|600px|نرى في الصورة سلسلة نقل الالكترونات – نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا. هذا النقل فعال (يحتاج الى طاقة) وهو عكس منحدر التركيز. تراكم ايونات الهيدروجين في الفراغ بين غشائي الخلية يمكن من دخول الهيدروجين بشكل غير فعال من اجل انتاج جزيء ATP .]]<br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
هنا توجد 3 مقاطع فيديو:<br />
<br><br />
[https://youtu.be/3YTPOIcj6lw סרטון] حول عملية نقل الإلكترون في الميتوكوندريا.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/LQmTKxI4Wn4 סרטון] فيديو يشرح العملية من زاوية أوسع.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/YZsJ-8TenYw סרטון] فيديو عن انحدار التراكيز مع التركيز على ATP سينثاز.<br />
</p><br />
<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المبنى الجزيئي </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي ينتمي لعائلة البروتين باسم all-α proteins والتي تتميز بوجود <scene name='89/898985/Secondary_structure/4'>المبنى الثنائي</scene> لولب ألفا. كل بروتين ينتمي لهذه المجموعة يحتوي أيضا على مجموعة هيم واحدة أو أكثر.<br />
<br><br />
<scene name='89/898985/Hem_c/2'>HEME C</scene> – مجموعة هيم عبارة عن مركب عضوي يتم انتاجه في النخاع العظمي والكبد. والهيم هو جزء من البروتينات التي تقوم بوظائف متعددة في الجسم. ان فعالية مجموعة هيم تنبع من قدرة ذرة الحديد على ربط جزيئات صغيرة (مثل الاكسجين) وأيضا على قدرتها لأكسدة واختزال مركبات أخرى (ان تعطي الكترونات او ان تستقبل الكترونات، على التوالي).<br />
<br><br />
يتكون السيتوكروم C البشري من <scene name='89/898985/Amino_acids/4'>سلسلة من 104 من الاحماض الامينية</scene> . يرتبط اثنان من الأحماض الأمينية بذرة الحديد <scene name='89/898985/Bond_to_iron_18_80/2'>(الهيستيدين في الموضع 18 والمثيونين في الموضع 80)</scene> ، ويرتبط اثنان من الأحماض الأمينية تساهميًا (رباط تساهمي) من خلال ذرة الكبريت (S) بمجموعة هيم <scene name='89/898985/Bond_to_iron_14_17/2'>(السيستئين في الموضع 17 وسيستئين في الموضع 14)</scene><br />
<br><br />
لقد وجد أن هناك عدد من الأحماض الأمينية المحفوظة تطوريًا، وهي الأحماض الأمينية المهمة لربط ذرة الحديد ومجموعة هيم. <scene name='89/898985/Cxxch_motive/6'>CXXCH</scene> (السيستئين ، X ، X ، السيستئين ، الهيستيدين) حيث يمكن أن يكون X أي حمض أميني غير السيستئين. وهذه المجموعة موجودة أيضا في بروتين سيتوكروم سي البشري.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 2<br />
[[Image:Consurf key small.gif|center|300px|מקרא צבעים לייצוג שמירות אבולוציונית - <br />
סגול כהה מייצג חומצות אמינו השמורות באבולוציה וזהות באורגניזמים שונים,<br />
לבן מייצג חומצות אמינו עם שמירות ממוצעת <br />
כחול מייצג חומצות אמינו שאינן שמורות אבולוציונית ועמדות אלו מאופיינות במגוון של חומצות אמינו משתנות בין אורגניזמים שונים.<br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> الوظيفة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
<br />
في سلسلة نقل الالكترونات يقوم سيتوكروم سي بنقل الكترون بين المعقدين III و IV . المعقد III يسمى سيتوكروم bc1 والمعقد IV يسمى سيتوكروم سي أوكسيداز. نقل الالكترونات يكون ممكنا بسبب حالة تأكسد متغيرة لذرة الحديد ، حيث ان في البداية يتواجد أيون الحديد في مجموعة هيم بحالة Fe3+ الأمر الذي يمكن من استيعاب الكترون واحد وبالتالي اختزال الحديد لحالة Fe2+.<br />
<br> <br />
<br> <br />
صورة 3<br />
</p><br />
[[Image:Cytochrome C Oxydoreductase.jpg|border|center|400px|نرى في الصورة المعقدات المختلفة في سلسلة نقل الالكترونات- سيتوكروم سي هو بروتين صغير مقارنة بالمعقدات 2و3و4 ولا يستطيع المرور عبر الغشاء الخلوي. يمر البروتين عبر الغشاء الداخلي للميتوكوندريا بين المعقد 3 و4. ويمكن الملاحظة ان جميع بروتينات سلسلة نقل الالكترونات تحتوي على مجموعة هيم.]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
يلعب السيتوكروم سي أيضًا دورًا وسيطًا في عملية [https://he.wikipedia.org/wiki/%D7%90%D7%A4%D7%95%D7%A4%D7%98%D7%95%D7%96%D7%94 موت الخلايا المبرمج] وهو شكل محكوم من موت الخلايا يستخدم لقتل الخلايا في عملية النمو من اجل نمو أعضاء صحيحة وأيضا مسئول عن انتقاء خلايا الدم البيضاء ولقتل الخلايا السرطانية او المريضة . <br />
<br><br />
<br> <br />
ב [https://youtu.be/Od3pUsVdMhQ סרטון] הבא מתואר תהליך המוות המבוקר, ניתן לראות כיצד ציטוכרום C קשור לתהליך. <br />
<br><br />
כאשר ציטוכרום C מתפקד כנשא אלקטרונים הוא מעוגן לממברנה הפנימית של המיטוכונדריה באמצעות קשר הידרופובי לפוסופליפיד קרדיוליפין (מולקולה הידרופובית הבונה את הממברנה של המיטוכונדריה). <br />
<br><br />
<br><br />
תמונה 4<br />
</p><br />
[[Image:Cardiolipin.jpg|border|center|280px|באיור בצד שמאל ניתן לראות את החלבון ציטוכרום סי (אדום) מחובר לפוספוליפיד קרדיוליפין ומעוגן בממברנה הפנימית של המיטוכונדריה. באיור בצד ימין ניתן לראות את הפירוק של הקומפלקס קרדיוליפין + ציטוכרום סי כתוצאה מחימצון מולקולת קרדיוליפין. ציטוכרום סי מתנתק מהממברנה וחופשי לצאת לציטוזול.]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
תחילת תהליך המוות התאי מאופיינת בעלייה של רדיקלים חופשיים (ROS) במיטוכונדריה. כתוצאה מכך, קרדיוליפין מתחמצן והקומפלקס קרדיוליפין-ציטוכרום C נפרד. ציטוכרום C מנותק מהממברנה הפנימית של המיטוכונדריה ועובר דרך נקבוביות בממברנה החיצונית אל הציטופלזמה. בציטופלזמה ציטוכרום C נקשר לחלבון APAF1 וביחד עם dATP נוצר מכלול- מבנה האפופטוזום, הקושר ומבקע את החלבון פרוקספאז 9 לצורתו הבוגרת והפעילה. בכך מתאפשר חיבור עם קספאזות 3 ו- 7 והפעלתן. פעילות זו מובילה לפגיעה וקיטוע ה DNA המסתיים במוות מכוון של התא.<br />
<br><br />
<br> <br />
תמונה 5<br />
</p><br />
[[Image:Apoptosome.jpg|border|center|280px|באיור מתוארת תחילה ההשתחררות של ציטוכרום סי מהמיטוכונדריה אל הציטוזול. לאחר מכן ציטוכרום סי נקשר לחלבון ציטופלזמי היוצר את מכלול האפופטוזום, מכלול זה מהווה את אחד ממרכזי הבקרה החשובים ביותר של האפופטוזה - הוא קושר ומבקע את החלבון פרוקספאז 9, משחרר אותו בצורתו הבוגרת והפעילה, וכך מפעיל את המסלול האפופטוטי הפנימי המסתיים במוות מכוון של התא.]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
מניעת אפופטוזיס - <br />
<br><br />
מחקרים מראים שתאים יכולים לשלוט ולבקר על תהליך האפופטוזיס באמצעות מודיפיקציה לאחר תרגום בחלבון. חלבונים, כידוע, הם שרשרות ארוכות של חומצות אמיניות. השלב הראשון בבניית החלבון הוא סינתזת שרשרת החומצות האמיניות; אך על פי רוב, המבנה הראשוני הזה עובר שלבים נוספים של עיבוד, הנקראים מודיפיקציות (התאמות). אחד מסוגי המודיפיקציות הוא זרחון. תהליך הזרחון הינו הוספה של קבוצת זרחה (יון המכיל אטום זרחן אחד וארבעה אטומי חמצן). אנזימי קינאז מוסיפים קבוצות זרחה ואנזימי פוספטאז מסירים אותן. סימון מולקולות באמצעות זרחון משמש לבקרה על מגוון עצום של תהליכים בתאים חיים .בציטוכרום C התגלו מספר חומצות אמינו שמורות מאוד מבחינה אבולוציונית <scene name='89/898985/Phosphotyrosine_48_97/4'>העוברות זרחון</scene> (פוספורלציה) ובכך מקנות לחלבון פעילות מבוקרת המונעת יצירה מוגברת של רדיקלים חופשיים (ROS). <br />
<br><br />
<br><br />
תמונה 6<br />
</p><br />
[[Image:Apoptosome formation.jpg|border|center|בתרשים מוצגת פעילות החלבון במצב מזורחן (מבוקר) ובמצב לא מזורחן (לא מבוקר); במצב מבוקר ניתן לראות שקצב הנשימה מווסת ולכן נוצרים מעט רדיקלים חופשיים, פוטנציאל הממברנה חיובי וציטוכרום סי קשור לממברנה הפנימית של המיטוכונדריה באמצעות קרדיוליפין. <br />
במצב לא מבוקר קצב הנשימה התאית הינו קצב מקסימאלי המייצר פוטנציאל ממברנה שלילי, יש עלייה בייצור רדיקלים חופשיים וקומפלקס קרדיוליפין+ציטוכרום סי נפרד. <br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
תמונה 7<br />
</p><br />
[[Image:Cytochrome c alignment.jpg|border|center|עימוד ציטוכרום סי מאדם ומעכבר (מרקמה סומטית ומרקמת תאי מין) מאפשר לזהות עמדות שמורות אבולוציונית. ניתן לראות את עמדות 14 ו- 17 הקושרות קוולנטית את קבוצת ההם (חומצות אמינו ציסטאין המסומנות באות הגדולה סי). במיקום החיצים נמצאות עמדות שמורות העוברות מודיפיקציות לאחר תרגום, ביניהן גם עמדות 48 ו- 97 (חומצה אמינית טירוזין המסומנת באות וואי) המוזכרות בערך זה. ]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
פעילותו כנוגד חמצון (מפחית ROS) נעשית גם באופן ישיר על ידי הסרת סופראוקסיד (O2–) ומי חמצן (H2O2) מהמיטוכונדריה לפי התרשים הבא-<br />
<br><br />
<br><br />
תמונה 8<br />
</p><br />
[[Image:Antioxidante.png|center|]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
ציטוכרום C הינו חלבון המשחק תפקיד מרכזי בתהליכי יצור האנרגיה בתא וכמו גם שחקן מפתח בתהליכים של מוות תאי מבוקר.<br />
</p><br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> وراثة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> أمراض </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> ورقة عمل للطالب </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المصادر </div> ==</div>Fatima M Hameedhttps://proteopedia.org/index.php?title=Cytochrome_C_(arabic)&diff=3554789Cytochrome C (arabic)2022-05-01T07:42:44Z<p>Fatima M Hameed: </p>
<hr />
<div>==<center>'''سيتوكروم سي البشري '''</center>==<br />
<p dir='rtl'><br />
<br />
.سيتوكروم سي عبارة عن زلال صغير (الوزن الجزيئي حوالي 1200 دالتون ) وهو بروتين محفوظ للغاية عبر مجموعة من الأنواع ، موجود في النباتات والحيوانات والعديد من الكائنات أحادية الخلية<br />
<br />
يرتبط هذا البروتين بمجموعة [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D9%87%D9%8A%D9%85 هيم] وبمركزها توجد ذرة حديد، وهو بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات وبعملية الاستموات (موت الخلايا المبرمج)<br />
</p><br />
<StructureSection load='1J3S' size='340' side='left' caption=' سيتوكروم سي البشري (PDB code [[1j3s]])' scene='89/898985/Cytochrome_c_basic/19'><br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> مقدمة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي عبارة عن بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات، والتي هي العملية الأخيرة في عملية <br />
[https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D9%86%D9%81%D8%B3_%D8%AE%D9%84%D9%88%D9%8A التنفس الخلوي]<br />
. عملية التنفس الخلوي تقسم الى 3 أقسام مركزية: [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D8%AD%D9%84%D9%84_%D8%A7%D9%84%D8%AC%D9%84%D9%88%D9%83%D9%88%D8%B2 جليكوليزا ] (التي تحدث في السيتوبلازما)، [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AF%D9%88%D8%B1%D8%A9_%D8%AD%D9%85%D8%B6_%D8%A7%D9%84%D8%B3%D8%AA%D8%B1%D9%8A%D9%83 دورة كريبس] (تحدث في المساحة الداخلية للميتوكوندريا) وسلسلة نقل الالكترونات التي تحدث داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. <br />
<br />
.بنقل الالكترونات لجزيئات أخرى ملامسة لها، وهكذا يتم تشكيل سلسلة من البروتينات حاملة الإلكترونات FADH2 و NADH في سلسلة نقل الالكترونات تقوم الجزيئات المختزلة بدورة كريبس مثل<br />
.يتم استيعاب الإلكترونات في نهاية الأمر بواسطة الأكسجين ويؤدي هذا الاتحاد الى انتاج الماء<br />
نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة ، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا<br />
بواسطة منحدر التركيز الناتج في أيونات الهيدروجين يتم دفع عمل البروتين ATP سنتاز من أجل انتاج ATP. [https://davidson.weizmann.ac.il/ar/online/maagarmada/atp-%D8%B3%D9%8A%D9%86%D8%AB%D8%A7%D8%B2-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AD%D8%B1%D9%83-%D8%A7%D9%84%D8%AC%D8%B2%D9%8A%D8%A6%D9%8A%D9%91-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AA%D9%83%D8%A7%D9%85%D9%84 ATP] هو جزيء غنيّ بالطّاقة، يحتوي على مجموعة من الأدينوساين وثلاث مجموعات من الفوسفور المرتبطة به. يؤدّي التحلّل المائيّ لمجموعة الفوسفور الثالثة إلى إطلاق طاقة تسمح للجسم بتنشيط العديد من الإنزيمات والعمليات الموجودة فيه. يقوم الجسم بإنتاج الATP في الميتوكوندريا في جميع الأوقات وذلك من الاجل الحفاظ على نسبة عالية من الATP داخل الخلية وبالتالي فان نقل الالكترونات وإنتاج منحدر تراكيز لأيونات الهيدروجين تعتبر عملية رئيسية من اجل وجود سليم للخلية.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة1 (قوموا بالوقف على الصورة بالفأرة من أجل اظهار الشرح)<br />
</p><br />
[[Image:Electron_transport_chain_cytochrome_c.jpg|border|center|600px|نرى في الصورة سلسلة نقل الالكترونات – نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا. هذا النقل فعال (يحتاج الى طاقة) وهو عكس منحدر التركيز. تراكم ايونات الهيدروجين في الفراغ بين غشائي الخلية يمكن من دخول الهيدروجين بشكل غير فعال من اجل انتاج جزيء ATP .]]<br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
هنا توجد 3 مقاطع فيديو:<br />
<br><br />
[https://youtu.be/3YTPOIcj6lw סרטון] حول عملية نقل الإلكترون في الميتوكوندريا.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/LQmTKxI4Wn4 סרטון] فيديو يشرح العملية من زاوية أوسع.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/YZsJ-8TenYw סרטון] فيديو عن انحدار التراكيز مع التركيز على ATP سينثاز.<br />
</p><br />
<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المبنى الجزيئي </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي ينتمي لعائلة البروتين باسم all-α proteins والتي تتميز بوجود <scene name='89/898985/Secondary_structure/4'>المبنى الثنائي</scene> لولب ألفا. كل بروتين ينتمي لهذه المجموعة يحتوي أيضا على مجموعة هيم واحدة أو أكثر.<br />
<br><br />
<scene name='89/898985/Hem_c/2'>HEME C</scene> – مجموعة هيم عبارة عن مركب عضوي يتم انتاجه في النخاع العظمي والكبد. والهيم هو جزء من البروتينات التي تقوم بوظائف متعددة في الجسم. ان فعالية مجموعة هيم تنبع من قدرة ذرة الحديد على ربط جزيئات صغيرة (مثل الاكسجين) وأيضا على قدرتها لأكسدة واختزال مركبات أخرى (ان تعطي الكترونات او ان تستقبل الكترونات، على التوالي).<br />
<br><br />
يتكون السيتوكروم C البشري من <scene name='89/898985/Amino_acids/4'>سلسلة من 104 من الاحماض الامينية</scene> . يرتبط اثنان من الأحماض الأمينية بذرة الحديد <scene name='89/898985/Bond_to_iron_18_80/2'>(الهيستيدين في الموضع 18 والمثيونين في الموضع 80)</scene> ، ويرتبط اثنان من الأحماض الأمينية تساهميًا (رباط تساهمي) من خلال ذرة الكبريت (S) بمجموعة هيم <scene name='89/898985/Bond_to_iron_14_17/2'>(السيستئين في الموضع 17 وسيستئين في الموضع 14)</scene><br />
<br><br />
لقد وجد أن هناك عدد من الأحماض الأمينية المحفوظة تطوريًا، وهي الأحماض الأمينية المهمة لربط ذرة الحديد ومجموعة هيم. <scene name='89/898985/Cxxch_motive/6'>CXXCH</scene> (السيستئين ، X ، X ، السيستئين ، الهيستيدين) حيث يمكن أن يكون X أي حمض أميني غير السيستئين. وهذه المجموعة موجودة أيضا في بروتين سيتوكروم سي البشري.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة 2<br />
[[Image:Consurf key small.gif|center|300px|מקרא צבעים לייצוג שמירות אבולוציונית - <br />
סגול כהה מייצג חומצות אמינו השמורות באבולוציה וזהות באורגניזמים שונים,<br />
לבן מייצג חומצות אמינו עם שמירות ממוצעת <br />
כחול מייצג חומצות אמינו שאינן שמורות אבולוציונית ועמדות אלו מאופיינות במגוון של חומצות אמינו משתנות בין אורגניזמים שונים.<br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> الوظيفة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
في سلسلة نقل الالكترونات يقوم سيتوكروم سي بنقل الكترون بين المعقدين III و IV . المعقد III يسمى سيتوكروم bc1 والمعقد IV يسمى سيتوكروم سي أوكسيداز. نقل الالكترونات يكون ممكنا بسبب حالة تأكسد متغيرة لذرة الحديد ، حيث ان في البداية يتواجد أيون الحديد في مجموعة هيم بحالة Fe3+ الأمر الذي يمكن من استيعاب الكترون واحد وبالتالي اختزال الحديد لحالة Fe2+.<br />
<br> <br />
<br> <br />
صورة 3<br />
</p><br />
[[Image:Cytochrome C Oxydoreductase.jpg|border|center|400px|نرى في الصورة المعقدات المختلفة في سلسلة نقل الالكترونات- سيتوكروم سي هو بروتين صغير مقارنة بالمعقدات 2و3و4 ولا يستطيع المرور عبر الغشاء الخلوي. يمر البروتين عبر الغشاء الداخلي للميتوكوندريا بين المعقد 3 و4. ويمكن الملاحظة ان جميع بروتينات سلسلة نقل الالكترونات تحتوي على مجموعة هيم.]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
يلعب السيتوكروم سي أيضًا دورًا وسيطًا في عملية [https://he.wikipedia.org/wiki/%D7%90%D7%A4%D7%95%D7%A4%D7%98%D7%95%D7%96%D7%94 موت الخلايا المبرمج] وهو شكل محكوم من موت الخلايا يستخدم لقتل الخلايا في عملية النمو من اجل نمو أعضاء صحيحة وأيضا مسئول عن انتقاء خلايا الدم البيضاء ولقتل الخلايا السرطانية او المريضة .<br />
לציטוכרום C תפקיד נוסף וחשוב בתהליך מוות מבוקר של התא (תהליך המכונה [https://he.wikipedia.org/wiki/%D7%90%D7%A4%D7%95%D7%A4%D7%98%D7%95%D7%96%D7%94 אפופטוזיס] ). תהליך זה מאפשר התפתחות איברים תקינה בשלב ההתפתחות העוברית, אחראי לסלקציה של תאי דם לבנים, להרג תאים סרטניים או חולים ולהרג של תאים זקנים. <br />
<br><br />
<br> <br />
ב [https://youtu.be/Od3pUsVdMhQ סרטון] הבא מתואר תהליך המוות המבוקר, ניתן לראות כיצד ציטוכרום C קשור לתהליך. <br />
<br><br />
כאשר ציטוכרום C מתפקד כנשא אלקטרונים הוא מעוגן לממברנה הפנימית של המיטוכונדריה באמצעות קשר הידרופובי לפוסופליפיד קרדיוליפין (מולקולה הידרופובית הבונה את הממברנה של המיטוכונדריה). <br />
<br><br />
<br><br />
תמונה 4<br />
</p><br />
[[Image:Cardiolipin.jpg|border|center|280px|באיור בצד שמאל ניתן לראות את החלבון ציטוכרום סי (אדום) מחובר לפוספוליפיד קרדיוליפין ומעוגן בממברנה הפנימית של המיטוכונדריה. באיור בצד ימין ניתן לראות את הפירוק של הקומפלקס קרדיוליפין + ציטוכרום סי כתוצאה מחימצון מולקולת קרדיוליפין. ציטוכרום סי מתנתק מהממברנה וחופשי לצאת לציטוזול.]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
תחילת תהליך המוות התאי מאופיינת בעלייה של רדיקלים חופשיים (ROS) במיטוכונדריה. כתוצאה מכך, קרדיוליפין מתחמצן והקומפלקס קרדיוליפין-ציטוכרום C נפרד. ציטוכרום C מנותק מהממברנה הפנימית של המיטוכונדריה ועובר דרך נקבוביות בממברנה החיצונית אל הציטופלזמה. בציטופלזמה ציטוכרום C נקשר לחלבון APAF1 וביחד עם dATP נוצר מכלול- מבנה האפופטוזום, הקושר ומבקע את החלבון פרוקספאז 9 לצורתו הבוגרת והפעילה. בכך מתאפשר חיבור עם קספאזות 3 ו- 7 והפעלתן. פעילות זו מובילה לפגיעה וקיטוע ה DNA המסתיים במוות מכוון של התא.<br />
<br><br />
<br> <br />
תמונה 5<br />
</p><br />
[[Image:Apoptosome.jpg|border|center|280px|באיור מתוארת תחילה ההשתחררות של ציטוכרום סי מהמיטוכונדריה אל הציטוזול. לאחר מכן ציטוכרום סי נקשר לחלבון ציטופלזמי היוצר את מכלול האפופטוזום, מכלול זה מהווה את אחד ממרכזי הבקרה החשובים ביותר של האפופטוזה - הוא קושר ומבקע את החלבון פרוקספאז 9, משחרר אותו בצורתו הבוגרת והפעילה, וכך מפעיל את המסלול האפופטוטי הפנימי המסתיים במוות מכוון של התא.]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
מניעת אפופטוזיס - <br />
<br><br />
מחקרים מראים שתאים יכולים לשלוט ולבקר על תהליך האפופטוזיס באמצעות מודיפיקציה לאחר תרגום בחלבון. חלבונים, כידוע, הם שרשרות ארוכות של חומצות אמיניות. השלב הראשון בבניית החלבון הוא סינתזת שרשרת החומצות האמיניות; אך על פי רוב, המבנה הראשוני הזה עובר שלבים נוספים של עיבוד, הנקראים מודיפיקציות (התאמות). אחד מסוגי המודיפיקציות הוא זרחון. תהליך הזרחון הינו הוספה של קבוצת זרחה (יון המכיל אטום זרחן אחד וארבעה אטומי חמצן). אנזימי קינאז מוסיפים קבוצות זרחה ואנזימי פוספטאז מסירים אותן. סימון מולקולות באמצעות זרחון משמש לבקרה על מגוון עצום של תהליכים בתאים חיים .בציטוכרום C התגלו מספר חומצות אמינו שמורות מאוד מבחינה אבולוציונית <scene name='89/898985/Phosphotyrosine_48_97/4'>העוברות זרחון</scene> (פוספורלציה) ובכך מקנות לחלבון פעילות מבוקרת המונעת יצירה מוגברת של רדיקלים חופשיים (ROS). <br />
<br><br />
<br><br />
תמונה 6<br />
</p><br />
[[Image:Apoptosome formation.jpg|border|center|בתרשים מוצגת פעילות החלבון במצב מזורחן (מבוקר) ובמצב לא מזורחן (לא מבוקר); במצב מבוקר ניתן לראות שקצב הנשימה מווסת ולכן נוצרים מעט רדיקלים חופשיים, פוטנציאל הממברנה חיובי וציטוכרום סי קשור לממברנה הפנימית של המיטוכונדריה באמצעות קרדיוליפין. <br />
במצב לא מבוקר קצב הנשימה התאית הינו קצב מקסימאלי המייצר פוטנציאל ממברנה שלילי, יש עלייה בייצור רדיקלים חופשיים וקומפלקס קרדיוליפין+ציטוכרום סי נפרד. <br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
תמונה 7<br />
</p><br />
[[Image:Cytochrome c alignment.jpg|border|center|עימוד ציטוכרום סי מאדם ומעכבר (מרקמה סומטית ומרקמת תאי מין) מאפשר לזהות עמדות שמורות אבולוציונית. ניתן לראות את עמדות 14 ו- 17 הקושרות קוולנטית את קבוצת ההם (חומצות אמינו ציסטאין המסומנות באות הגדולה סי). במיקום החיצים נמצאות עמדות שמורות העוברות מודיפיקציות לאחר תרגום, ביניהן גם עמדות 48 ו- 97 (חומצה אמינית טירוזין המסומנת באות וואי) המוזכרות בערך זה. ]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
פעילותו כנוגד חמצון (מפחית ROS) נעשית גם באופן ישיר על ידי הסרת סופראוקסיד (O2–) ומי חמצן (H2O2) מהמיטוכונדריה לפי התרשים הבא-<br />
<br><br />
<br><br />
תמונה 8<br />
</p><br />
[[Image:Antioxidante.png|center|]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
ציטוכרום C הינו חלבון המשחק תפקיד מרכזי בתהליכי יצור האנרגיה בתא וכמו גם שחקן מפתח בתהליכים של מוות תאי מבוקר.<br />
</p><br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> وراثة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> أمراض </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> ورقة عمل للطالب </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المصادر </div> ==</div>Fatima M Hameedhttps://proteopedia.org/index.php?title=Cytochrome_C_(arabic)&diff=3554783Cytochrome C (arabic)2022-05-01T07:22:11Z<p>Fatima M Hameed: </p>
<hr />
<div>==<center>'''سيتوكروم سي البشري '''</center>==<br />
<p dir='rtl'><br />
<br />
.سيتوكروم سي عبارة عن زلال صغير (الوزن الجزيئي حوالي 1200 دالتون ) وهو بروتين محفوظ للغاية عبر مجموعة من الأنواع ، موجود في النباتات والحيوانات والعديد من الكائنات أحادية الخلية<br />
<br />
يرتبط هذا البروتين بمجموعة [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D9%87%D9%8A%D9%85 هيم] وبمركزها توجد ذرة حديد، وهو بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات وبعملية الاستموات (موت الخلايا المبرمج)<br />
</p><br />
<StructureSection load='1J3S' size='340' side='left' caption=' سيتوكروم سي البشري (PDB code [[1j3s]])' scene='89/898985/Cytochrome_c_basic/19'><br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> مقدمة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي عبارة عن بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات، والتي هي العملية الأخيرة في عملية <br />
[https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D9%86%D9%81%D8%B3_%D8%AE%D9%84%D9%88%D9%8A التنفس الخلوي]<br />
. عملية التنفس الخلوي تقسم الى 3 أقسام مركزية: [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D8%AD%D9%84%D9%84_%D8%A7%D9%84%D8%AC%D9%84%D9%88%D9%83%D9%88%D8%B2 جليكوليزا ] (التي تحدث في السيتوبلازما)، [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AF%D9%88%D8%B1%D8%A9_%D8%AD%D9%85%D8%B6_%D8%A7%D9%84%D8%B3%D8%AA%D8%B1%D9%8A%D9%83 دورة كريبس] (تحدث في المساحة الداخلية للميتوكوندريا) وسلسلة نقل الالكترونات التي تحدث داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. <br />
<br />
.بنقل الالكترونات لجزيئات أخرى ملامسة لها، وهكذا يتم تشكيل سلسلة من البروتينات حاملة الإلكترونات FADH2 و NADH في سلسلة نقل الالكترونات تقوم الجزيئات المختزلة بدورة كريبس مثل<br />
.يتم استيعاب الإلكترونات في نهاية الأمر بواسطة الأكسجين ويؤدي هذا الاتحاد الى انتاج الماء<br />
نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة ، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا<br />
بواسطة منحدر التركيز الناتج في أيونات الهيدروجين يتم دفع عمل البروتين ATP سنتاز من أجل انتاج ATP. [https://davidson.weizmann.ac.il/ar/online/maagarmada/atp-%D8%B3%D9%8A%D9%86%D8%AB%D8%A7%D8%B2-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AD%D8%B1%D9%83-%D8%A7%D9%84%D8%AC%D8%B2%D9%8A%D8%A6%D9%8A%D9%91-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AA%D9%83%D8%A7%D9%85%D9%84 ATP] هو جزيء غنيّ بالطّاقة، يحتوي على مجموعة من الأدينوساين وثلاث مجموعات من الفوسفور المرتبطة به. يؤدّي التحلّل المائيّ لمجموعة الفوسفور الثالثة إلى إطلاق طاقة تسمح للجسم بتنشيط العديد من الإنزيمات والعمليات الموجودة فيه. يقوم الجسم بإنتاج الATP في الميتوكوندريا في جميع الأوقات وذلك من الاجل الحفاظ على نسبة عالية من الATP داخل الخلية وبالتالي فان نقل الالكترونات وإنتاج منحدر تراكيز لأيونات الهيدروجين تعتبر عملية رئيسية من اجل وجود سليم للخلية.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة1 (قوموا بالوقف على الصورة بالفأرة من أجل اظهار الشرح)<br />
</p><br />
[[Image:Electron_transport_chain_cytochrome_c.jpg|border|center|600px|نرى في الصورة سلسلة نقل الالكترونات – نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا. هذا النقل فعال (يحتاج الى طاقة) وهو عكس منحدر التركيز. تراكم ايونات الهيدروجين في الفراغ بين غشائي الخلية يمكن من دخول الهيدروجين بشكل غير فعال من اجل انتاج جزيء ATP .]]<br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
هنا توجد 3 مقاطع فيديو:<br />
<br><br />
[https://youtu.be/3YTPOIcj6lw סרטון] حول عملية نقل الإلكترون في الميتوكوندريا.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/LQmTKxI4Wn4 סרטון] فيديو يشرح العملية من زاوية أوسع.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/YZsJ-8TenYw סרטון] فيديو عن انحدار التراكيز مع التركيز على ATP سينثاز.<br />
</p><br />
<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المبنى الجزيئي </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي ينتمي لعائلة البروتين باسم all-α proteins والتي تتميز بوجود <scene name='89/898985/Secondary_structure/4'>المبنى الثنائي</scene> لولب ألفا. كل بروتين ينتمي لهذه المجموعة يحتوي أيضا على مجموعة هيم واحدة أو أكثر.<br />
<br><br />
<scene name='89/898985/Hem_c/2'>HEME C</scene> – مجموعة هيم عبارة عن مركب عضوي يتم انتاجه في النخاع العظمي والكبد. والهيم هو جزء من البروتينات التي تقوم بوظائف متعددة في الجسم. ان فعالية مجموعة هيم تنبع من قدرة ذرة الحديد على ربط جزيئات صغيرة (مثل الاكسجين) وأيضا على قدرتها لأكسدة واختزال مركبات أخرى (ان تعطي الكترونات او ان تستقبل الكترونات، على التوالي).<br />
<br><br />
يتكون السيتوكروم C البشري من <scene name='89/898985/Amino_acids/4'>سلسلة من 104 من الاحماض الامينية</scene> . يرتبط اثنان من الأحماض الأمينية بذرة الحديد <scene name='89/898985/Bond_to_iron_18_80/2'>(الهيستيدين في الموضع 18 والمثيونين في الموضع 80)</scene> ، ويرتبط اثنان من الأحماض الأمينية تساهميًا (رباط تساهمي) من خلال ذرة الكبريت (S) بمجموعة هيم <scene name='89/898985/Bond_to_iron_14_17/2'>(السيستئين في الموضع 17 وسيستئين في الموضع 14)</scene><br />
<br><br />
لقد وجد أن هناك عدد من الأحماض الأمينية المحفوظة تطوريًا، وهي الأحماض الأمينية المهمة لربط ذرة الحديد ومجموعة هيم. <scene name='89/898985/Cxxch_motive/6'>CXXCH</scene> (السيستئين ، X ، X ، السيستئين ، الهيستيدين) حيث يمكن أن يكون X أي حمض أميني غير السيستئين. وهذه المجموعة موجودة أيضا في بروتين سيتوكروم سي البشري.<br />
<br><br />
<br><br />
תמונה 2<br />
[[Image:Consurf key small.gif|center|300px|מקרא צבעים לייצוג שמירות אבולוציונית - <br />
סגול כהה מייצג חומצות אמינו השמורות באבולוציה וזהות באורגניזמים שונים,<br />
לבן מייצג חומצות אמינו עם שמירות ממוצעת <br />
כחול מייצג חומצות אמינו שאינן שמורות אבולוציונית ועמדות אלו מאופיינות במגוון של חומצות אמינו משתנות בין אורגניזמים שונים.<br />
<br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> الوظيفة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> وراثة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> أمراض </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> ورقة عمل للطالب </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المصادر </div> ==</div>Fatima M Hameedhttps://proteopedia.org/index.php?title=Cytochrome_C_(arabic)&diff=3554782Cytochrome C (arabic)2022-05-01T07:07:11Z<p>Fatima M Hameed: </p>
<hr />
<div>==<center>'''سيتوكروم سي البشري '''</center>==<br />
<p dir='rtl'><br />
<br />
.سيتوكروم سي عبارة عن زلال صغير (الوزن الجزيئي حوالي 1200 دالتون ) وهو بروتين محفوظ للغاية عبر مجموعة من الأنواع ، موجود في النباتات والحيوانات والعديد من الكائنات أحادية الخلية<br />
<br />
يرتبط هذا البروتين بمجموعة [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D9%87%D9%8A%D9%85 هيم] وبمركزها توجد ذرة حديد، وهو بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات وبعملية الاستموات (موت الخلايا المبرمج)<br />
</p><br />
<StructureSection load='1J3S' size='340' side='left' caption=' سيتوكروم سي البشري (PDB code [[1j3s]])' scene='89/898985/Cytochrome_c_basic/19'><br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> مقدمة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي عبارة عن بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات، والتي هي العملية الأخيرة في عملية <br />
[https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D9%86%D9%81%D8%B3_%D8%AE%D9%84%D9%88%D9%8A التنفس الخلوي]<br />
. عملية التنفس الخلوي تقسم الى 3 أقسام مركزية: [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D8%AD%D9%84%D9%84_%D8%A7%D9%84%D8%AC%D9%84%D9%88%D9%83%D9%88%D8%B2 جليكوليزا ] (التي تحدث في السيتوبلازما)، [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AF%D9%88%D8%B1%D8%A9_%D8%AD%D9%85%D8%B6_%D8%A7%D9%84%D8%B3%D8%AA%D8%B1%D9%8A%D9%83 دورة كريبس] (تحدث في المساحة الداخلية للميتوكوندريا) وسلسلة نقل الالكترونات التي تحدث داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. <br />
<br />
.بنقل الالكترونات لجزيئات أخرى ملامسة لها، وهكذا يتم تشكيل سلسلة من البروتينات حاملة الإلكترونات FADH2 و NADH في سلسلة نقل الالكترونات تقوم الجزيئات المختزلة بدورة كريبس مثل<br />
.يتم استيعاب الإلكترونات في نهاية الأمر بواسطة الأكسجين ويؤدي هذا الاتحاد الى انتاج الماء<br />
نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة ، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا<br />
بواسطة منحدر التركيز الناتج في أيونات الهيدروجين يتم دفع عمل البروتين ATP سنتاز من أجل انتاج ATP. [https://davidson.weizmann.ac.il/ar/online/maagarmada/atp-%D8%B3%D9%8A%D9%86%D8%AB%D8%A7%D8%B2-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AD%D8%B1%D9%83-%D8%A7%D9%84%D8%AC%D8%B2%D9%8A%D8%A6%D9%8A%D9%91-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AA%D9%83%D8%A7%D9%85%D9%84 ATP] هو جزيء غنيّ بالطّاقة، يحتوي على مجموعة من الأدينوساين وثلاث مجموعات من الفوسفور المرتبطة به. يؤدّي التحلّل المائيّ لمجموعة الفوسفور الثالثة إلى إطلاق طاقة تسمح للجسم بتنشيط العديد من الإنزيمات والعمليات الموجودة فيه. يقوم الجسم بإنتاج الATP في الميتوكوندريا في جميع الأوقات وذلك من الاجل الحفاظ على نسبة عالية من الATP داخل الخلية وبالتالي فان نقل الالكترونات وإنتاج منحدر تراكيز لأيونات الهيدروجين تعتبر عملية رئيسية من اجل وجود سليم للخلية.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة1 (قوموا بالوقف على الصورة بالفأرة من أجل اظهار الشرح)<br />
</p><br />
[[Image:Electron_transport_chain_cytochrome_c.jpg|border|center|600px|نرى في الصورة سلسلة نقل الالكترونات – نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا. هذا النقل فعال (يحتاج الى طاقة) وهو عكس منحدر التركيز. تراكم ايونات الهيدروجين في الفراغ بين غشائي الخلية يمكن من دخول الهيدروجين بشكل غير فعال من اجل انتاج جزيء ATP .]]<br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
هنا توجد 3 مقاطع فيديو:<br />
<br><br />
[https://youtu.be/3YTPOIcj6lw סרטון] حول عملية نقل الإلكترون في الميتوكوندريا.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/LQmTKxI4Wn4 סרטון] فيديو يشرح العملية من زاوية أوسع.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/YZsJ-8TenYw סרטון] فيديو عن انحدار التراكيز مع التركيز على ATP سينثاز.<br />
</p><br />
<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المبنى الجزيئي </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي ينتمي لعائلة البروتين باسم all-α proteins والتي تتميز بوجود <scene name='89/898985/Secondary_structure/4'>المبنى الثنائي</scene> لولب ألفا. كل بروتين ينتمي لهذه المجموعة يحتوي أيضا على مجموعة هيم واحدة أو أكثر.<br />
<br><br />
<scene name='89/898985/Hem_c/2'>HEME C</scene> – مجموعة هيم عبارة عن مركب عضوي يتم انتاجه في النخاع العظمي والكبد. والهيم هو جزء من البروتينات التي تقوم بوظائف متعددة في الجسم. ان فعالية مجموعة هيم تنبع من قدرة ذرة الحديد على ربط جزيئات صغيرة (مثل الاكسجين) وأيضا على قدرتها لأكسدة واختزال مركبات أخرى (ان تعطي الكترونات او ان تستقبل الكترونات، على التوالي).<br />
<br><br />
يتكون السيتوكروم C البشري من <scene name='89/898985/Amino_acids/4'>سلسلة من 104 من الاحماض الامينية</scene> . يرتبط اثنان من الأحماض الأمينية بذرة الحديد <scene name='89/898985/Bond_to_iron_18_80/2'>(الهيستيدين في الموضع 18 والمثيونين في الموضع 80)</scene> ، ويرتبط اثنان من الأحماض الأمينية تساهميًا (رباط تساهمي) من خلال ذرة الكبريت (S) بمجموعة هيم <scene name='89/898985/Bond_to_iron_14_17/2'>(السيستئين في الموضع 17 وسيستئين في الموضع 14)</scene><br />
<br><br />
נמצא שיש מוטיב של מספר חומצות אמינו השמור מבחינה אבולוציונית. הכולל בתוכו את חומצות האמינו החשובות לקישור אטום הברזל וקבוצת ההם. <scene name='89/898985/Cxxch_motive/6'>CXXCH</scene> (ציסטאין,X,X,ציסטאין,היסטדין) כאשר X יכולה להיות כל חומצה אמינית שהיא איננה ציסטאין. ניתן לראות שגם בחלבון ציטוכרום C באדם ישנה את אותה התבנית.<br />
<br><br />
<br><br />
תמונה 2<br />
[[Image:Consurf key small.gif|center|300px|מקרא צבעים לייצוג שמירות אבולוציונית - <br />
סגול כהה מייצג חומצות אמינו השמורות באבולוציה וזהות באורגניזמים שונים,<br />
לבן מייצג חומצות אמינו עם שמירות ממוצעת <br />
כחול מייצג חומצות אמינו שאינן שמורות אבולוציונית ועמדות אלו מאופיינות במגוון של חומצות אמינו משתנות בין אורגניזמים שונים.<br />
<br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> الوظيفة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> وراثة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> أمراض </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> ورقة عمل للطالب </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المصادر </div> ==</div>Fatima M Hameedhttps://proteopedia.org/index.php?title=Cytochrome_C_(arabic)&diff=3554781Cytochrome C (arabic)2022-05-01T06:59:06Z<p>Fatima M Hameed: </p>
<hr />
<div>==<center>'''سيتوكروم سي البشري '''</center>==<br />
<p dir='rtl'><br />
<br />
.سيتوكروم سي عبارة عن زلال صغير (الوزن الجزيئي حوالي 1200 دالتون ) وهو بروتين محفوظ للغاية عبر مجموعة من الأنواع ، موجود في النباتات والحيوانات والعديد من الكائنات أحادية الخلية<br />
<br />
يرتبط هذا البروتين بمجموعة [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D9%87%D9%8A%D9%85 هيم] وبمركزها توجد ذرة حديد، وهو بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات وبعملية الاستموات (موت الخلايا المبرمج)<br />
</p><br />
<StructureSection load='1J3S' size='340' side='left' caption=' سيتوكروم سي البشري (PDB code [[1j3s]])' scene='89/898985/Cytochrome_c_basic/19'><br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> مقدمة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي عبارة عن بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات، والتي هي العملية الأخيرة في عملية <br />
[https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D9%86%D9%81%D8%B3_%D8%AE%D9%84%D9%88%D9%8A التنفس الخلوي]<br />
. عملية التنفس الخلوي تقسم الى 3 أقسام مركزية: [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D8%AD%D9%84%D9%84_%D8%A7%D9%84%D8%AC%D9%84%D9%88%D9%83%D9%88%D8%B2 جليكوليزا ] (التي تحدث في السيتوبلازما)، [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AF%D9%88%D8%B1%D8%A9_%D8%AD%D9%85%D8%B6_%D8%A7%D9%84%D8%B3%D8%AA%D8%B1%D9%8A%D9%83 دورة كريبس] (تحدث في المساحة الداخلية للميتوكوندريا) وسلسلة نقل الالكترونات التي تحدث داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. <br />
<br />
.بنقل الالكترونات لجزيئات أخرى ملامسة لها، وهكذا يتم تشكيل سلسلة من البروتينات حاملة الإلكترونات FADH2 و NADH في سلسلة نقل الالكترونات تقوم الجزيئات المختزلة بدورة كريبس مثل<br />
.يتم استيعاب الإلكترونات في نهاية الأمر بواسطة الأكسجين ويؤدي هذا الاتحاد الى انتاج الماء<br />
نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة ، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا<br />
بواسطة منحدر التركيز الناتج في أيونات الهيدروجين يتم دفع عمل البروتين ATP سنتاز من أجل انتاج ATP. [https://davidson.weizmann.ac.il/ar/online/maagarmada/atp-%D8%B3%D9%8A%D9%86%D8%AB%D8%A7%D8%B2-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AD%D8%B1%D9%83-%D8%A7%D9%84%D8%AC%D8%B2%D9%8A%D8%A6%D9%8A%D9%91-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AA%D9%83%D8%A7%D9%85%D9%84 ATP] هو جزيء غنيّ بالطّاقة، يحتوي على مجموعة من الأدينوساين وثلاث مجموعات من الفوسفور المرتبطة به. يؤدّي التحلّل المائيّ لمجموعة الفوسفور الثالثة إلى إطلاق طاقة تسمح للجسم بتنشيط العديد من الإنزيمات والعمليات الموجودة فيه. يقوم الجسم بإنتاج الATP في الميتوكوندريا في جميع الأوقات وذلك من الاجل الحفاظ على نسبة عالية من الATP داخل الخلية وبالتالي فان نقل الالكترونات وإنتاج منحدر تراكيز لأيونات الهيدروجين تعتبر عملية رئيسية من اجل وجود سليم للخلية.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة1 (قوموا بالوقف على الصورة بالفأرة من أجل اظهار الشرح)<br />
</p><br />
[[Image:Electron_transport_chain_cytochrome_c.jpg|border|center|600px|نرى في الصورة سلسلة نقل الالكترونات – نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا. هذا النقل فعال (يحتاج الى طاقة) وهو عكس منحدر التركيز. تراكم ايونات الهيدروجين في الفراغ بين غشائي الخلية يمكن من دخول الهيدروجين بشكل غير فعال من اجل انتاج جزيء ATP .]]<br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
هنا توجد 3 مقاطع فيديو:<br />
<br><br />
[https://youtu.be/3YTPOIcj6lw סרטון] حول عملية نقل الإلكترون في الميتوكوندريا.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/LQmTKxI4Wn4 סרטון] فيديو يشرح العملية من زاوية أوسع.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/YZsJ-8TenYw סרטון] فيديو عن انحدار التراكيز مع التركيز على ATP سينثاز.<br />
</p><br />
<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المبنى الجزيئي </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي ينتمي لعائلة البروتين باسم all-α proteins والتي تتميز بوجود <scene name='89/898985/Secondary_structure/4'>المبنى الثنائي</scene> لولب ألفا. كل بروتين ينتمي لهذه المجموعة يحتوي أيضا على مجموعة هيم واحدة أو أكثر.<br />
<br><br />
<scene name='89/898985/Hem_c/2'>HEME C</scene> – مجموعة هيم عبارة عن مركب عضوي يتم انتاجه في النخاع العظمي والكبد. والهيم هو جزء من البروتينات التي تقوم بوظائف متعددة في الجسم. ان فعالية مجموعة هيم تنبع من قدرة ذرة الحديد على ربط جزيئات صغيرة (مثل الاكسجين) وأيضا على قدرتها لأكسدة واختزال مركبات أخرى (ان تعطي الكترونات او ان تستقل الكترونات، على التوالي).<br />
<br><br />
ציטוכרום C אנושי <scene name='89/898985/Amino_acids/4'>בנוי מרצף של 104 חומצות אמינו</scene>.שתי חומצות אמינו קושרות את אטום הברזל <scene name='89/898985/Bond_to_iron_18_80/2'>(היסטדין בעמדה 18 ומתיונין בעמדה 80)</scene><br />
,שתי חומצות אמינו נקשרות קוולנטית באמצעות אטום גופרית (S) לקבוצת ההם <scene name='89/898985/Bond_to_iron_14_17/2'>(ציסטאין בעמדה 17 וציסטאין בעמדה 14)</scene>.<br />
<br><br />
נמצא שיש מוטיב של מספר חומצות אמינו השמור מבחינה אבולוציונית. הכולל בתוכו את חומצות האמינו החשובות לקישור אטום הברזל וקבוצת ההם. <scene name='89/898985/Cxxch_motive/6'>CXXCH</scene> (ציסטאין,X,X,ציסטאין,היסטדין) כאשר X יכולה להיות כל חומצה אמינית שהיא איננה ציסטאין. ניתן לראות שגם בחלבון ציטוכרום C באדם ישנה את אותה התבנית.<br />
<br><br />
<br><br />
תמונה 2<br />
[[Image:Consurf key small.gif|center|300px|מקרא צבעים לייצוג שמירות אבולוציונית - <br />
סגול כהה מייצג חומצות אמינו השמורות באבולוציה וזהות באורגניזמים שונים,<br />
לבן מייצג חומצות אמינו עם שמירות ממוצעת <br />
כחול מייצג חומצות אמינו שאינן שמורות אבולוציונית ועמדות אלו מאופיינות במגוון של חומצות אמינו משתנות בין אורגניזמים שונים.<br />
<br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> الوظيفة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> وراثة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> أمراض </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> ورقة عمل للطالب </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المصادر </div> ==</div>Fatima M Hameedhttps://proteopedia.org/index.php?title=Cytochrome_C_(arabic)&diff=3554780Cytochrome C (arabic)2022-05-01T06:50:03Z<p>Fatima M Hameed: </p>
<hr />
<div>==<center>'''سيتوكروم سي البشري '''</center>==<br />
<p dir='rtl'><br />
<br />
.سيتوكروم سي عبارة عن زلال صغير (الوزن الجزيئي حوالي 1200 دالتون ) وهو بروتين محفوظ للغاية عبر مجموعة من الأنواع ، موجود في النباتات والحيوانات والعديد من الكائنات أحادية الخلية<br />
<br />
يرتبط هذا البروتين بمجموعة [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D9%87%D9%8A%D9%85 هيم] وبمركزها توجد ذرة حديد، وهو بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات وبعملية الاستموات (موت الخلايا المبرمج)<br />
</p><br />
<StructureSection load='1J3S' size='340' side='left' caption=' سيتوكروم سي البشري (PDB code [[1j3s]])' scene='89/898985/Cytochrome_c_basic/19'><br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> مقدمة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي عبارة عن بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات، والتي هي العملية الأخيرة في عملية <br />
[https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D9%86%D9%81%D8%B3_%D8%AE%D9%84%D9%88%D9%8A التنفس الخلوي]<br />
. عملية التنفس الخلوي تقسم الى 3 أقسام مركزية: [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D8%AD%D9%84%D9%84_%D8%A7%D9%84%D8%AC%D9%84%D9%88%D9%83%D9%88%D8%B2 جليكوليزا ] (التي تحدث في السيتوبلازما)، [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AF%D9%88%D8%B1%D8%A9_%D8%AD%D9%85%D8%B6_%D8%A7%D9%84%D8%B3%D8%AA%D8%B1%D9%8A%D9%83 دورة كريبس] (تحدث في المساحة الداخلية للميتوكوندريا) وسلسلة نقل الالكترونات التي تحدث داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. <br />
<br />
.بنقل الالكترونات لجزيئات أخرى ملامسة لها، وهكذا يتم تشكيل سلسلة من البروتينات حاملة الإلكترونات FADH2 و NADH في سلسلة نقل الالكترونات تقوم الجزيئات المختزلة بدورة كريبس مثل<br />
.يتم استيعاب الإلكترونات في نهاية الأمر بواسطة الأكسجين ويؤدي هذا الاتحاد الى انتاج الماء<br />
نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة ، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا<br />
بواسطة منحدر التركيز الناتج في أيونات الهيدروجين يتم دفع عمل البروتين ATP سنتاز من أجل انتاج ATP. [https://davidson.weizmann.ac.il/ar/online/maagarmada/atp-%D8%B3%D9%8A%D9%86%D8%AB%D8%A7%D8%B2-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AD%D8%B1%D9%83-%D8%A7%D9%84%D8%AC%D8%B2%D9%8A%D8%A6%D9%8A%D9%91-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AA%D9%83%D8%A7%D9%85%D9%84 ATP] هو جزيء غنيّ بالطّاقة، يحتوي على مجموعة من الأدينوساين وثلاث مجموعات من الفوسفور المرتبطة به. يؤدّي التحلّل المائيّ لمجموعة الفوسفور الثالثة إلى إطلاق طاقة تسمح للجسم بتنشيط العديد من الإنزيمات والعمليات الموجودة فيه. يقوم الجسم بإنتاج الATP في الميتوكوندريا في جميع الأوقات وذلك من الاجل الحفاظ على نسبة عالية من الATP داخل الخلية وبالتالي فان نقل الالكترونات وإنتاج منحدر تراكيز لأيونات الهيدروجين تعتبر عملية رئيسية من اجل وجود سليم للخلية.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة1 (قوموا بالوقف على الصورة بالفأرة من أجل اظهار الشرح)<br />
</p><br />
[[Image:Electron_transport_chain_cytochrome_c.jpg|border|center|600px|نرى في الصورة سلسلة نقل الالكترونات – نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا. هذا النقل فعال (يحتاج الى طاقة) وهو عكس منحدر التركيز. تراكم ايونات الهيدروجين في الفراغ بين غشائي الخلية يمكن من دخول الهيدروجين بشكل غير فعال من اجل انتاج جزيء ATP .]]<br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
هنا توجد 3 مقاطع فيديو:<br />
<br><br />
[https://youtu.be/3YTPOIcj6lw סרטון] حول عملية نقل الإلكترون في الميتوكوندريا.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/LQmTKxI4Wn4 סרטון] فيديو يشرح العملية من زاوية أوسع.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/YZsJ-8TenYw סרטון] فيديو عن انحدار التراكيز مع التركيز على ATP سينثاز.<br />
</p><br />
<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المبنى الجزيئي </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي ينتمي لعائلة البروتين باسم all-α proteins والتي تتميز بوجود <scene name='89/898985/Secondary_structure/4'>المبنى الثنائي</scene> لولب ألفا. كل بروتين ينتمي لهذه المجموعة يحتوي أيضا على مجموعة هيم واحدة أو أكثر.<br />
<br />
<br><br />
<scene name='89/898985/Hem_c/2'>HEME C</scene> - קבוצת ההם הינה תרכובת אורגנית המיוצרת במח העצם ובכבד, קבוצה פרוסתטית - תרכובת קטנה המהווה חלק מחלבון. פעולותיה הפיזיולוגיות של קבוצת ההם נובעות מיכולתו של אטום הברזל לקשור מולקולות קטנות (מולקולה דו-אטומית של חמצן, למשל), וכן לחזר ולחמצן תרכובות אחרות (לתרום אלקטרונים ולקבל אלקטרונים, בהתאמה) . <br />
<br><br />
ציטוכרום C אנושי <scene name='89/898985/Amino_acids/4'>בנוי מרצף של 104 חומצות אמינו</scene>.שתי חומצות אמינו קושרות את אטום הברזל <scene name='89/898985/Bond_to_iron_18_80/2'>(היסטדין בעמדה 18 ומתיונין בעמדה 80)</scene><br />
,שתי חומצות אמינו נקשרות קוולנטית באמצעות אטום גופרית (S) לקבוצת ההם <scene name='89/898985/Bond_to_iron_14_17/2'>(ציסטאין בעמדה 17 וציסטאין בעמדה 14)</scene>.<br />
<br><br />
נמצא שיש מוטיב של מספר חומצות אמינו השמור מבחינה אבולוציונית. הכולל בתוכו את חומצות האמינו החשובות לקישור אטום הברזל וקבוצת ההם. <scene name='89/898985/Cxxch_motive/6'>CXXCH</scene> (ציסטאין,X,X,ציסטאין,היסטדין) כאשר X יכולה להיות כל חומצה אמינית שהיא איננה ציסטאין. ניתן לראות שגם בחלבון ציטוכרום C באדם ישנה את אותה התבנית.<br />
<br><br />
<br><br />
תמונה 2<br />
[[Image:Consurf key small.gif|center|300px|מקרא צבעים לייצוג שמירות אבולוציונית - <br />
סגול כהה מייצג חומצות אמינו השמורות באבולוציה וזהות באורגניזמים שונים,<br />
לבן מייצג חומצות אמינו עם שמירות ממוצעת <br />
כחול מייצג חומצות אמינו שאינן שמורות אבולוציונית ועמדות אלו מאופיינות במגוון של חומצות אמינו משתנות בין אורגניזמים שונים.<br />
<br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> الوظيفة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> وراثة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> أمراض </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> ورقة عمل للطالب </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المصادر </div> ==</div>Fatima M Hameedhttps://proteopedia.org/index.php?title=Cytochrome_C_(arabic)&diff=3554779Cytochrome C (arabic)2022-05-01T06:48:04Z<p>Fatima M Hameed: </p>
<hr />
<div>==<center>'''سيتوكروم سي البشري '''</center>==<br />
<p dir='rtl'><br />
<br />
.سيتوكروم سي عبارة عن زلال صغير (الوزن الجزيئي حوالي 1200 دالتون ) وهو بروتين محفوظ للغاية عبر مجموعة من الأنواع ، موجود في النباتات والحيوانات والعديد من الكائنات أحادية الخلية<br />
<br />
يرتبط هذا البروتين بمجموعة [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D9%87%D9%8A%D9%85 هيم] وبمركزها توجد ذرة حديد، وهو بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات وبعملية الاستموات (موت الخلايا المبرمج)<br />
</p><br />
<StructureSection load='1J3S' size='340' side='left' caption=' سيتوكروم سي البشري (PDB code [[1j3s]])' scene='89/898985/Cytochrome_c_basic/19'><br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> مقدمة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي عبارة عن بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات، والتي هي العملية الأخيرة في عملية <br />
[https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D9%86%D9%81%D8%B3_%D8%AE%D9%84%D9%88%D9%8A التنفس الخلوي]<br />
. عملية التنفس الخلوي تقسم الى 3 أقسام مركزية: [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D8%AD%D9%84%D9%84_%D8%A7%D9%84%D8%AC%D9%84%D9%88%D9%83%D9%88%D8%B2 جليكوليزا ] (التي تحدث في السيتوبلازما)، [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AF%D9%88%D8%B1%D8%A9_%D8%AD%D9%85%D8%B6_%D8%A7%D9%84%D8%B3%D8%AA%D8%B1%D9%8A%D9%83 دورة كريبس] (تحدث في المساحة الداخلية للميتوكوندريا) وسلسلة نقل الالكترونات التي تحدث داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. <br />
<br />
.بنقل الالكترونات لجزيئات أخرى ملامسة لها، وهكذا يتم تشكيل سلسلة من البروتينات حاملة الإلكترونات FADH2 و NADH في سلسلة نقل الالكترونات تقوم الجزيئات المختزلة بدورة كريبس مثل<br />
.يتم استيعاب الإلكترونات في نهاية الأمر بواسطة الأكسجين ويؤدي هذا الاتحاد الى انتاج الماء<br />
نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة ، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا<br />
بواسطة منحدر التركيز الناتج في أيونات الهيدروجين يتم دفع عمل البروتين ATP سنتاز من أجل انتاج ATP. [https://davidson.weizmann.ac.il/ar/online/maagarmada/atp-%D8%B3%D9%8A%D9%86%D8%AB%D8%A7%D8%B2-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AD%D8%B1%D9%83-%D8%A7%D9%84%D8%AC%D8%B2%D9%8A%D8%A6%D9%8A%D9%91-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AA%D9%83%D8%A7%D9%85%D9%84 ATP] هو جزيء غنيّ بالطّاقة، يحتوي على مجموعة من الأدينوساين وثلاث مجموعات من الفوسفور المرتبطة به. يؤدّي التحلّل المائيّ لمجموعة الفوسفور الثالثة إلى إطلاق طاقة تسمح للجسم بتنشيط العديد من الإنزيمات والعمليات الموجودة فيه. يقوم الجسم بإنتاج الATP في الميتوكوندريا في جميع الأوقات وذلك من الاجل الحفاظ على نسبة عالية من الATP داخل الخلية وبالتالي فان نقل الالكترونات وإنتاج منحدر تراكيز لأيونات الهيدروجين تعتبر عملية رئيسية من اجل وجود سليم للخلية.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة1 (قوموا بالوقف على الصورة بالفأرة من أجل اظهار الشرح)<br />
</p><br />
[[Image:Electron_transport_chain_cytochrome_c.jpg|border|center|600px|نرى في الصورة سلسلة نقل الالكترونات – نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا. هذا النقل فعال (يحتاج الى طاقة) وهو عكس منحدر التركيز. تراكم ايونات الهيدروجين في الفراغ بين غشائي الخلية يمكن من دخول الهيدروجين بشكل غير فعال من اجل انتاج جزيء ATP .]]<br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
هنا توجد 3 مقاطع فيديو:<br />
<br><br />
[https://youtu.be/3YTPOIcj6lw סרטון] حول عملية نقل الإلكترون في الميتوكوندريا.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/LQmTKxI4Wn4 סרטון] فيديو يشرح العملية من زاوية أوسع.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/YZsJ-8TenYw סרטון] فيديو عن انحدار التراكيز مع التركيز على ATP سينثاز.<br />
</p><br />
<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المبنى الجزيئي </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم ج ينتمي لعائلة البروتين باسم all-α proteins والتي تتميز بوجود <scene name='89/898985/Secondary_structure/4'>المبنى الثنائي</scene> لولب ألفا. كل بروتين ينتمي لهذه المجموعة يحتوي أيضا على مجموعة هيم واحدة أو أكثر.<br />
ציטוכרום C משתייך למשפחת חלבונים בשם all-α proteins, המאופיינים בליבה העשויה <scene name='89/898985/Secondary_structure/4'>מהמבנה השניוני</scene> <br />
<br />
אלפא הליקס (מקרא צבעים לסצנה מבנה שניוני: {{Template:ColorKey_Helix}})<br />
.כל חלבון במשפחת-על זו מכיל גם קבוצת הם אחת או יותר. <br />
<br><br />
<scene name='89/898985/Hem_c/2'>HEME C</scene> - קבוצת ההם הינה תרכובת אורגנית המיוצרת במח העצם ובכבד, קבוצה פרוסתטית - תרכובת קטנה המהווה חלק מחלבון. פעולותיה הפיזיולוגיות של קבוצת ההם נובעות מיכולתו של אטום הברזל לקשור מולקולות קטנות (מולקולה דו-אטומית של חמצן, למשל), וכן לחזר ולחמצן תרכובות אחרות (לתרום אלקטרונים ולקבל אלקטרונים, בהתאמה) . <br />
<br><br />
ציטוכרום C אנושי <scene name='89/898985/Amino_acids/4'>בנוי מרצף של 104 חומצות אמינו</scene>.שתי חומצות אמינו קושרות את אטום הברזל <scene name='89/898985/Bond_to_iron_18_80/2'>(היסטדין בעמדה 18 ומתיונין בעמדה 80)</scene><br />
,שתי חומצות אמינו נקשרות קוולנטית באמצעות אטום גופרית (S) לקבוצת ההם <scene name='89/898985/Bond_to_iron_14_17/2'>(ציסטאין בעמדה 17 וציסטאין בעמדה 14)</scene>.<br />
<br><br />
נמצא שיש מוטיב של מספר חומצות אמינו השמור מבחינה אבולוציונית. הכולל בתוכו את חומצות האמינו החשובות לקישור אטום הברזל וקבוצת ההם. <scene name='89/898985/Cxxch_motive/6'>CXXCH</scene> (ציסטאין,X,X,ציסטאין,היסטדין) כאשר X יכולה להיות כל חומצה אמינית שהיא איננה ציסטאין. ניתן לראות שגם בחלבון ציטוכרום C באדם ישנה את אותה התבנית.<br />
<br><br />
<br><br />
תמונה 2<br />
[[Image:Consurf key small.gif|center|300px|מקרא צבעים לייצוג שמירות אבולוציונית - <br />
סגול כהה מייצג חומצות אמינו השמורות באבולוציה וזהות באורגניזמים שונים,<br />
לבן מייצג חומצות אמינו עם שמירות ממוצעת <br />
כחול מייצג חומצות אמינו שאינן שמורות אבולוציונית ועמדות אלו מאופיינות במגוון של חומצות אמינו משתנות בין אורגניזמים שונים.<br />
<br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> الوظيفة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> وراثة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> أمراض </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> ورقة عمل للطالب </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المصادر </div> ==</div>Fatima M Hameedhttps://proteopedia.org/index.php?title=Cytochrome_C_(arabic)&diff=3554778Cytochrome C (arabic)2022-05-01T06:45:23Z<p>Fatima M Hameed: </p>
<hr />
<div>==<center>'''سيتوكروم سي البشري '''</center>==<br />
<p dir='rtl'><br />
<br />
.سيتوكروم سي عبارة عن زلال صغير (الوزن الجزيئي حوالي 1200 دالتون ) وهو بروتين محفوظ للغاية عبر مجموعة من الأنواع ، موجود في النباتات والحيوانات والعديد من الكائنات أحادية الخلية<br />
<br />
يرتبط هذا البروتين بمجموعة [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D9%87%D9%8A%D9%85 هيم] وبمركزها توجد ذرة حديد، وهو بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات وبعملية الاستموات (موت الخلايا المبرمج)<br />
</p><br />
<StructureSection load='1J3S' size='340' side='left' caption=' سيتوكروم سي البشري (PDB code [[1j3s]])' scene='89/898985/Cytochrome_c_basic/19'><br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> مقدمة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي عبارة عن بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات، والتي هي العملية الأخيرة في عملية <br />
[https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D9%86%D9%81%D8%B3_%D8%AE%D9%84%D9%88%D9%8A التنفس الخلوي]<br />
. عملية التنفس الخلوي تقسم الى 3 أقسام مركزية: [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D8%AD%D9%84%D9%84_%D8%A7%D9%84%D8%AC%D9%84%D9%88%D9%83%D9%88%D8%B2 جليكوليزا ] (التي تحدث في السيتوبلازما)، [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AF%D9%88%D8%B1%D8%A9_%D8%AD%D9%85%D8%B6_%D8%A7%D9%84%D8%B3%D8%AA%D8%B1%D9%8A%D9%83 دورة كريبس] (تحدث في المساحة الداخلية للميتوكوندريا) وسلسلة نقل الالكترونات التي تحدث داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. <br />
<br />
.بنقل الالكترونات لجزيئات أخرى ملامسة لها، وهكذا يتم تشكيل سلسلة من البروتينات حاملة الإلكترونات FADH2 و NADH في سلسلة نقل الالكترونات تقوم الجزيئات المختزلة بدورة كريبس مثل<br />
.يتم استيعاب الإلكترونات في نهاية الأمر بواسطة الأكسجين ويؤدي هذا الاتحاد الى انتاج الماء<br />
نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة ، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا<br />
بواسطة منحدر التركيز الناتج في أيونات الهيدروجين يتم دفع عمل البروتين ATP سنتاز من أجل انتاج ATP. [https://davidson.weizmann.ac.il/ar/online/maagarmada/atp-%D8%B3%D9%8A%D9%86%D8%AB%D8%A7%D8%B2-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AD%D8%B1%D9%83-%D8%A7%D9%84%D8%AC%D8%B2%D9%8A%D8%A6%D9%8A%D9%91-%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AA%D9%83%D8%A7%D9%85%D9%84 ATP] هو جزيء غنيّ بالطّاقة، يحتوي على مجموعة من الأدينوساين وثلاث مجموعات من الفوسفور المرتبطة به. يؤدّي التحلّل المائيّ لمجموعة الفوسفور الثالثة إلى إطلاق طاقة تسمح للجسم بتنشيط العديد من الإنزيمات والعمليات الموجودة فيه. يقوم الجسم بإنتاج الATP في الميتوكوندريا في جميع الأوقات وذلك من الاجل الحفاظ على نسبة عالية من الATP داخل الخلية وبالتالي فان نقل الالكترونات وإنتاج منحدر تراكيز لأيونات الهيدروجين تعتبر عملية رئيسية من اجل وجود سليم للخلية.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة1 (قوموا بالوقف على الصورة بالفأرة من أجل اظهار الشرح)<br />
</p><br />
[[Image:Electron_transport_chain_cytochrome_c.jpg|border|center|600px|نرى في الصورة سلسلة نقل الالكترونات – نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا. هذا النقل فعال (يحتاج الى طاقة) وهو عكس منحدر التركيز. تراكم ايونات الهيدروجين في الفراغ بين غشائي الخلية يمكن من دخول الهيدروجين بشكل غير فعال من اجل انتاج جزيء ATP .]]<br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
هنا توجد 3 مقاطع فيديو:<br />
<br><br />
[https://youtu.be/3YTPOIcj6lw סרטון] حول عملية نقل الإلكترون في الميتوكوندريا.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/LQmTKxI4Wn4 סרטון] فيديو يشرح العملية من زاوية أوسع.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/YZsJ-8TenYw סרטון] فيديو عن انحدار التراكيز مع التركيز على ATP سينثاز.<br />
</p><br />
<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المبنى الجزيئي </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
ציטוכרום C משתייך למשפחת חלבונים בשם all-α proteins, המאופיינים בליבה העשויה <scene name='89/898985/Secondary_structure/4'>מהמבנה השניוני</scene> <br />
<br />
אלפא הליקס (מקרא צבעים לסצנה מבנה שניוני: {{Template:ColorKey_Helix}})<br />
.כל חלבון במשפחת-על זו מכיל גם קבוצת הם אחת או יותר. <br />
<br><br />
<scene name='89/898985/Hem_c/2'>HEME C</scene> - קבוצת ההם הינה תרכובת אורגנית המיוצרת במח העצם ובכבד, קבוצה פרוסתטית - תרכובת קטנה המהווה חלק מחלבון. פעולותיה הפיזיולוגיות של קבוצת ההם נובעות מיכולתו של אטום הברזל לקשור מולקולות קטנות (מולקולה דו-אטומית של חמצן, למשל), וכן לחזר ולחמצן תרכובות אחרות (לתרום אלקטרונים ולקבל אלקטרונים, בהתאמה) . <br />
<br><br />
ציטוכרום C אנושי <scene name='89/898985/Amino_acids/4'>בנוי מרצף של 104 חומצות אמינו</scene>.שתי חומצות אמינו קושרות את אטום הברזל <scene name='89/898985/Bond_to_iron_18_80/2'>(היסטדין בעמדה 18 ומתיונין בעמדה 80)</scene><br />
,שתי חומצות אמינו נקשרות קוולנטית באמצעות אטום גופרית (S) לקבוצת ההם <scene name='89/898985/Bond_to_iron_14_17/2'>(ציסטאין בעמדה 17 וציסטאין בעמדה 14)</scene>.<br />
<br><br />
נמצא שיש מוטיב של מספר חומצות אמינו השמור מבחינה אבולוציונית. הכולל בתוכו את חומצות האמינו החשובות לקישור אטום הברזל וקבוצת ההם. <scene name='89/898985/Cxxch_motive/6'>CXXCH</scene> (ציסטאין,X,X,ציסטאין,היסטדין) כאשר X יכולה להיות כל חומצה אמינית שהיא איננה ציסטאין. ניתן לראות שגם בחלבון ציטוכרום C באדם ישנה את אותה התבנית.<br />
<br><br />
<br><br />
תמונה 2<br />
[[Image:Consurf key small.gif|center|300px|מקרא צבעים לייצוג שמירות אבולוציונית - <br />
סגול כהה מייצג חומצות אמינו השמורות באבולוציה וזהות באורגניזמים שונים,<br />
לבן מייצג חומצות אמינו עם שמירות ממוצעת <br />
כחול מייצג חומצות אמינו שאינן שמורות אבולוציונית ועמדות אלו מאופיינות במגוון של חומצות אמינו משתנות בין אורגניזמים שונים.<br />
<br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> الوظيفة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> وراثة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> أمراض </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> ورقة عمل للطالب </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المصادر </div> ==</div>Fatima M Hameedhttps://proteopedia.org/index.php?title=Cytochrome_C_(arabic)&diff=3554777Cytochrome C (arabic)2022-05-01T06:41:46Z<p>Fatima M Hameed: </p>
<hr />
<div>==<center>'''سيتوكروم سي البشري '''</center>==<br />
<p dir='rtl'><br />
<br />
.سيتوكروم سي عبارة عن زلال صغير (الوزن الجزيئي حوالي 1200 دالتون ) وهو بروتين محفوظ للغاية عبر مجموعة من الأنواع ، موجود في النباتات والحيوانات والعديد من الكائنات أحادية الخلية<br />
<br />
يرتبط هذا البروتين بمجموعة [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D9%87%D9%8A%D9%85 هيم] وبمركزها توجد ذرة حديد، وهو بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات وبعملية الاستموات (موت الخلايا المبرمج)<br />
</p><br />
<StructureSection load='1J3S' size='340' side='left' caption=' سيتوكروم سي البشري (PDB code [[1j3s]])' scene='89/898985/Cytochrome_c_basic/19'><br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> مقدمة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي عبارة عن بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات، والتي هي العملية الأخيرة في عملية <br />
[https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D9%86%D9%81%D8%B3_%D8%AE%D9%84%D9%88%D9%8A التنفس الخلوي]<br />
. عملية التنفس الخلوي تقسم الى 3 أقسام مركزية: [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D8%AD%D9%84%D9%84_%D8%A7%D9%84%D8%AC%D9%84%D9%88%D9%83%D9%88%D8%B2 جليكوليزا ] (التي تحدث في السيتوبلازما)، [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AF%D9%88%D8%B1%D8%A9_%D8%AD%D9%85%D8%B6_%D8%A7%D9%84%D8%B3%D8%AA%D8%B1%D9%8A%D9%83 دورة كريبس] (تحدث في المساحة الداخلية للميتوكوندريا) وسلسلة نقل الالكترونات التي تحدث داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. <br />
<br />
.بنقل الالكترونات لجزيئات أخرى ملامسة لها، وهكذا يتم تشكيل سلسلة من البروتينات حاملة الإلكترونات FADH2 و NADH في سلسلة نقل الالكترونات تقوم الجزيئات المختزلة بدورة كريبس مثل<br />
.يتم استيعاب الإلكترونات في نهاية الأمر بواسطة الأكسجين ويؤدي هذا الاتحاد الى انتاج الماء<br />
نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة ، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا<br />
بواسطة منحدر التركيز الناتج في أيونات الهيدروجين يتم دفع عمل البروتين ATP سنتاز من أجل انتاج ATP. ATP هو جزيء غنيّ بالطّاقة، يحتوي على مجموعة من الأدينوساين وثلاث مجموعات من الفوسفور المرتبطة به. يؤدّي التحلّل المائيّ لمجموعة الفوسفور الثالثة إلى إطلاق طاقة تسمح للجسم بتنشيط العديد من الإنزيمات والعمليات الموجودة فيه. يقوم الجسم بإنتاج الATP في الميتوكوندريا في جميع الأوقات وذلك من الاجل الحفاظ على نسبة عالية من الATP داخل الخلية وبالتالي فان نقل الالكترونات وإنتاج منحدر تراكيز لأيونات الهيدروجين تعتبر عملية رئيسية من اجل وجود سليم للخلية.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة1 (قوموا بالوقف على الصورة بالفأرة من أجل اظهار الشرح)<br />
</p><br />
[[Image:Electron_transport_chain_cytochrome_c.jpg|border|center|600px|نرى في الصورة سلسلة نقل الالكترونات – نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا. هذا النقل فعال (يحتاج الى طاقة) وهو عكس منحدر التركيز. تراكم ايونات الهيدروجين في الفراغ بين غشائي الخلية يمكن من دخول الهيدروجين بشكل غير فعال من اجل انتاج جزيء ATP .]]<br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
هنا توجد 3 مقاطع فيديو:<br />
<br><br />
[https://youtu.be/3YTPOIcj6lw סרטון] حول عملية نقل الإلكترون في الميتوكوندريا.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/LQmTKxI4Wn4 סרטון] فيديو يشرح العملية من زاوية أوسع.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/YZsJ-8TenYw סרטון] فيديو عن انحدار التراكيز مع التركيز على ATP سينثاز.<br />
</p><br />
<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المبنى الجزيئي </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
ציטוכרום C משתייך למשפחת חלבונים בשם all-α proteins, המאופיינים בליבה העשויה <scene name='89/898985/Secondary_structure/4'>מהמבנה השניוני</scene> <br />
<br />
אלפא הליקס (מקרא צבעים לסצנה מבנה שניוני: {{Template:ColorKey_Helix}})<br />
.כל חלבון במשפחת-על זו מכיל גם קבוצת הם אחת או יותר. <br />
<br><br />
<scene name='89/898985/Hem_c/2'>HEME C</scene> - קבוצת ההם הינה תרכובת אורגנית המיוצרת במח העצם ובכבד, קבוצה פרוסתטית - תרכובת קטנה המהווה חלק מחלבון. פעולותיה הפיזיולוגיות של קבוצת ההם נובעות מיכולתו של אטום הברזל לקשור מולקולות קטנות (מולקולה דו-אטומית של חמצן, למשל), וכן לחזר ולחמצן תרכובות אחרות (לתרום אלקטרונים ולקבל אלקטרונים, בהתאמה) . <br />
<br><br />
ציטוכרום C אנושי <scene name='89/898985/Amino_acids/4'>בנוי מרצף של 104 חומצות אמינו</scene>.שתי חומצות אמינו קושרות את אטום הברזל <scene name='89/898985/Bond_to_iron_18_80/2'>(היסטדין בעמדה 18 ומתיונין בעמדה 80)</scene><br />
,שתי חומצות אמינו נקשרות קוולנטית באמצעות אטום גופרית (S) לקבוצת ההם <scene name='89/898985/Bond_to_iron_14_17/2'>(ציסטאין בעמדה 17 וציסטאין בעמדה 14)</scene>.<br />
<br><br />
נמצא שיש מוטיב של מספר חומצות אמינו השמור מבחינה אבולוציונית. הכולל בתוכו את חומצות האמינו החשובות לקישור אטום הברזל וקבוצת ההם. <scene name='89/898985/Cxxch_motive/6'>CXXCH</scene> (ציסטאין,X,X,ציסטאין,היסטדין) כאשר X יכולה להיות כל חומצה אמינית שהיא איננה ציסטאין. ניתן לראות שגם בחלבון ציטוכרום C באדם ישנה את אותה התבנית.<br />
<br><br />
<br><br />
תמונה 2<br />
[[Image:Consurf key small.gif|center|300px|מקרא צבעים לייצוג שמירות אבולוציונית - <br />
סגול כהה מייצג חומצות אמינו השמורות באבולוציה וזהות באורגניזמים שונים,<br />
לבן מייצג חומצות אמינו עם שמירות ממוצעת <br />
כחול מייצג חומצות אמינו שאינן שמורות אבולוציונית ועמדות אלו מאופיינות במגוון של חומצות אמינו משתנות בין אורגניזמים שונים.<br />
<br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> الوظيفة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> وراثة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> أمراض </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> ورقة عمل للطالب </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المصادر </div> ==</div>Fatima M Hameedhttps://proteopedia.org/index.php?title=Cytochrome_C_(arabic)&diff=3554776Cytochrome C (arabic)2022-05-01T06:40:13Z<p>Fatima M Hameed: </p>
<hr />
<div>==<center>'''سيتوكروم سي البشري '''</center>==<br />
<p dir='rtl'><br />
<br />
.سيتوكروم سي عبارة عن زلال صغير (الوزن الجزيئي حوالي 1200 دالتون ) وهو بروتين محفوظ للغاية عبر مجموعة من الأنواع ، موجود في النباتات والحيوانات والعديد من الكائنات أحادية الخلية<br />
<br />
يرتبط هذا البروتين بمجموعة [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D9%87%D9%8A%D9%85 هيم] وبمركزها توجد ذرة حديد، وهو بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات وبعملية الاستموات (موت الخلايا المبرمج)<br />
</p><br />
<StructureSection load='1J3S' size='340' side='left' caption=' سيتوكروم سي البشري (PDB code [[1j3s]])' scene='89/898985/Cytochrome_c_basic/19'><br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> مقدمة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي عبارة عن بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات، والتي هي العملية الأخيرة في عملية <br />
[https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D9%86%D9%81%D8%B3_%D8%AE%D9%84%D9%88%D9%8A التنفس الخلوي]<br />
. عملية التنفس الخلوي تقسم الى 3 أقسام مركزية: [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D8%AD%D9%84%D9%84_%D8%A7%D9%84%D8%AC%D9%84%D9%88%D9%83%D9%88%D8%B2 جليكوليزا ] (التي تحدث في السيتوبلازما)، [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AF%D9%88%D8%B1%D8%A9_%D8%AD%D9%85%D8%B6_%D8%A7%D9%84%D8%B3%D8%AA%D8%B1%D9%8A%D9%83 دورة كريبس] (تحدث في المساحة الداخلية للميتوكوندريا) وسلسلة نقل الالكترونات التي تحدث داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. <br />
<br />
.بنقل الالكترونات لجزيئات أخرى ملامسة لها، وهكذا يتم تشكيل سلسلة من البروتينات حاملة الإلكترونات FADH2 و NADH في سلسلة نقل الالكترونات تقوم الجزيئات المختزلة بدورة كريبس مثل<br />
.يتم استيعاب الإلكترونات في نهاية الأمر بواسطة الأكسجين ويؤدي هذا الاتحاد الى انتاج الماء<br />
نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة ، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا<br />
بواسطة منحدر التركيز الناتج في أيونات الهيدروجين يتم دفع عمل البروتين ATP سنتاز من أجل انتاج ATP. ATP هو جزيء غنيّ بالطّاقة، يحتوي على مجموعة من الأدينوساين وثلاث مجموعات من الفوسفور المرتبطة به. يؤدّي التحلّل المائيّ لمجموعة الفوسفور الثالثة إلى إطلاق طاقة تسمح للجسم بتنشيط العديد من الإنزيمات والعمليات الموجودة فيه. يقوم الجسم بإنتاج الATP في الميتوكوندريا في جميع الأوقات وذلك من الاجل الحفاظ على نسبة عالية من الATP داخل الخلية وبالتالي فان نقل الالكترونات وإنتاج منحدر تراكيز لأيونات الهيدروجين تعتبر عملية رئيسية من اجل وجود سليم للخلية.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة1 (قوموا بالوقف على الصورة بالفأرة من أجل اظهار الشرح)<br />
</p><br />
[[Image:Electron_transport_chain_cytochrome_c.jpg|border|center|600px|نرى في الصورة سلسلة نقل الالكترونات – نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا. هذا النقل فعال (يحتاج الى طاقة) وهو عكس منحدر التركيز. تراكم ايونات الهيدروجين في الفراغ بين غشائي الخلية يمكن من دخول الهيدروجين بشكل غير فعال من اجل انتاج جزيء ATP .]]<br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
هنا توجد 3 مقاطع فيديو:<br />
<br><br />
[https://youtu.be/3YTPOIcj6lw סרטון] حول عملية نقل الإلكترون في الميتوكوندريا.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/LQmTKxI4Wn4 סרטון] فيديو يشرح العملية من زاوية أوسع.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/YZsJ-8TenYw סרטון] فيديو عن انحدار التراكيز مع التركيز على ATP سينثاز.<br />
</p><br />
<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المبنى الجزيئي </div> ==<br />
<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> الوظيفة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> وراثة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> أمراض </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> ورقة عمل للطالب </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المصادر </div> ==</div>Fatima M Hameedhttps://proteopedia.org/index.php?title=Cytochrome_C_(arabic)&diff=3554775Cytochrome C (arabic)2022-05-01T06:39:20Z<p>Fatima M Hameed: </p>
<hr />
<div>==<center>'''سيتوكروم سي البشري '''</center>==<br />
<p dir='rtl'><br />
<br />
.سيتوكروم سي عبارة عن زلال صغير (الوزن الجزيئي حوالي 1200 دالتون ) وهو بروتين محفوظ للغاية عبر مجموعة من الأنواع ، موجود في النباتات والحيوانات والعديد من الكائنات أحادية الخلية<br />
<br />
يرتبط هذا البروتين بمجموعة [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D9%87%D9%8A%D9%85 هيم] وبمركزها توجد ذرة حديد، وهو بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات وبعملية الاستموات (موت الخلايا المبرمج)<br />
</p><br />
<StructureSection load='1J3S' size='340' side='left' caption=' سيتوكروم سي البشري (PDB code [[1j3s]])' scene='89/898985/Cytochrome_c_basic/19'><br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> مقدمة </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
سيتوكروم سي عبارة عن بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات، والتي هي العملية الأخيرة في عملية <br />
[https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D9%86%D9%81%D8%B3_%D8%AE%D9%84%D9%88%D9%8A التنفس الخلوي]<br />
. عملية التنفس الخلوي تقسم الى 3 أقسام مركزية: [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D8%AD%D9%84%D9%84_%D8%A7%D9%84%D8%AC%D9%84%D9%88%D9%83%D9%88%D8%B2 جليكوليزا ] (التي تحدث في السيتوبلازما)، [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AF%D9%88%D8%B1%D8%A9_%D8%AD%D9%85%D8%B6_%D8%A7%D9%84%D8%B3%D8%AA%D8%B1%D9%8A%D9%83 دورة كريبس] (تحدث في المساحة الداخلية للميتوكوندريا) وسلسلة نقل الالكترونات التي تحدث داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. <br />
<br />
.بنقل الالكترونات لجزيئات أخرى ملامسة لها، وهكذا يتم تشكيل سلسلة من البروتينات حاملة الإلكترونات FADH2 و NADH في سلسلة نقل الالكترونات تقوم الجزيئات المختزلة بدورة كريبس مثل<br />
.يتم استيعاب الإلكترونات في نهاية الأمر بواسطة الأكسجين ويؤدي هذا الاتحاد الى انتاج الماء<br />
نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة ، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا<br />
بواسطة منحدر التركيز الناتج في أيونات الهيدروجين يتم دفع عمل البروتين ATP سنتاز من أجل انتاج ATP. ATP هو جزيء غنيّ بالطّاقة، يحتوي على مجموعة من الأدينوساين وثلاث مجموعات من الفوسفور المرتبطة به. يؤدّي التحلّل المائيّ لمجموعة الفوسفور الثالثة إلى إطلاق طاقة تسمح للجسم بتنشيط العديد من الإنزيمات والعمليات الموجودة فيه. يقوم الجسم بإنتاج الATP في الميتوكوندريا في جميع الأوقات وذلك من الاجل الحفاظ على نسبة عالية من الATP داخل الخلية وبالتالي فان نقل الالكترونات وإنتاج منحدر تراكيز لأيونات الهيدروجين تعتبر عملية رئيسية من اجل وجود سليم للخلية.<br />
<br><br />
<br><br />
صورة1 (قوموا بالوقف على الصورة بالفأرة من أجل اظهار الشرح)<br />
</p><br />
[[Image:Electron_transport_chain_cytochrome_c.jpg|border|center|600px|نرى في الصورة سلسلة نقل الالكترونات – نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا. هذا النقل فعال (يحتاج الى طاقة) وهو عكس منحدر التركيز. تراكم ايونات الهيدروجين في الفراغ بين غشائي الخلية يمكن من دخول الهيدروجين بشكل غير فعال من اجل انتاج جزيء ATP .]]<br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
להלן שלושה סרטונים:<br />
<br><br />
[https://youtu.be/3YTPOIcj6lw סרטון] حول عملية نقل الإلكترون في الميتوكوندريا.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/LQmTKxI4Wn4 סרטון] فيديو يشرح العملية من زاوية أوسع.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/YZsJ-8TenYw סרטון] فيديو عن انحدار التراكيز مع التركيز على ATP سينثاز.<br />
</p><br />
<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المبنى الجزيئي </div> ==<br />
<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> الوظيفة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> وراثة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> أمراض </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> ورقة عمل للطالب </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المصادر </div> ==</div>Fatima M Hameedhttps://proteopedia.org/index.php?title=Cytochrome_C_(arabic)&diff=3554774Cytochrome C (arabic)2022-05-01T06:37:01Z<p>Fatima M Hameed: </p>
<hr />
<div>==<center>'''سيتوكروم سي البشري '''</center>==<br />
<p dir='rtl'><br />
<br />
.سيتوكروم سي عبارة عن زلال صغير (الوزن الجزيئي حوالي 1200 دالتون ) وهو بروتين محفوظ للغاية عبر مجموعة من الأنواع ، موجود في النباتات والحيوانات والعديد من الكائنات أحادية الخلية<br />
<br />
يرتبط هذا البروتين بمجموعة [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D9%87%D9%8A%D9%85 هيم] وبمركزها توجد ذرة حديد، وهو بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات وبعملية الاستموات (موت الخلايا المبرمج)<br />
</p><br />
<StructureSection load='1J3S' size='340' side='left' caption=' سيتوكروم سي البشري (PDB code [[1j3s]])' scene='89/898985/Cytochrome_c_basic/19'><br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> مقدمة </div> ==<br />
<br />
سيتوكروم سي عبارة عن بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات، والتي هي العملية الأخيرة في عملية <br />
[https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D9%86%D9%81%D8%B3_%D8%AE%D9%84%D9%88%D9%8A التنفس الخلوي]<br />
. عملية التنفس الخلوي تقسم الى 3 أقسام مركزية: [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D8%AD%D9%84%D9%84_%D8%A7%D9%84%D8%AC%D9%84%D9%88%D9%83%D9%88%D8%B2 جليكوليزا ] (التي تحدث في السيتوبلازما)، [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AF%D9%88%D8%B1%D8%A9_%D8%AD%D9%85%D8%B6_%D8%A7%D9%84%D8%B3%D8%AA%D8%B1%D9%8A%D9%83 دورة كريبس] (تحدث في المساحة الداخلية للميتوكوندريا) وسلسلة نقل الالكترونات التي تحدث داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. <br />
<br />
.بنقل الالكترونات لجزيئات أخرى ملامسة لها، وهكذا يتم تشكيل سلسلة من البروتينات حاملة الإلكترونات FADH2 و NADH في سلسلة نقل الالكترونات تقوم الجزيئات المختزلة بدورة كريبس مثل<br />
.يتم استيعاب الإلكترونات في نهاية الأمر بواسطة الأكسجين ويؤدي هذا الاتحاد الى انتاج الماء<br />
نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة ، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا<br />
بواسطة منحدر التركيز الناتج في أيونات الهيدروجين يتم دفع عمل البروتين ATP سنتاز من أجل انتاج ATP. ATP هو جزيء غنيّ بالطّاقة، يحتوي على مجموعة من الأدينوساين وثلاث مجموعات من الفوسفور المرتبطة به. يؤدّي التحلّل المائيّ لمجموعة الفوسفور الثالثة إلى إطلاق طاقة تسمح للجسم بتنشيط العديد من الإنزيمات والعمليات الموجودة فيه. يقوم الجسم بإنتاج الATP في الميتوكوندريا في جميع الأوقات وذلك من الاجل الحفاظ على نسبة عالية من الATP داخل الخلية وبالتالي فان نقل الالكترونات وإنتاج منحدر تراكيز لأيونات الهيدروجين تعتبر عملية رئيسية من اجل وجود سليم للخلية.<br />
<br />
<br><br />
<br><br />
<br />
صورة1 (قوموا بالوقف على الصورة بالفأرة من أجل اظهار الشرح)<br />
</p><br />
[[Image:Electron_transport_chain_cytochrome_c.jpg|border|center|600px|نرى في الصورة سلسلة نقل الالكترونات – نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا. هذا النقل فعال (يحتاج الى طاقة) وهو عكس منحدر التركيز. تراكم ايونات الهيدروجين في الفراغ بين غشائي الخلية يمكن من دخول الهيدروجين بشكل غير فعال من اجل انتاج جزيء ATP .]]<br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
להלן שלושה סרטונים:<br />
<br><br />
[https://youtu.be/3YTPOIcj6lw סרטון] حول عملية نقل الإلكترون في الميتوكوندريا.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/LQmTKxI4Wn4 סרטון] فيديو يشرح العملية من زاوية أوسع.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/YZsJ-8TenYw סרטון] فيديو عن انحدار التراكيز مع التركيز على ATP سينثاز.<br />
</p><br />
<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المبنى الجزيئي </div> ==<br />
<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> الوظيفة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> وراثة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> أمراض </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> ورقة عمل للطالب </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المصادر </div> ==</div>Fatima M Hameedhttps://proteopedia.org/index.php?title=Cytochrome_C_(arabic)&diff=3554773Cytochrome C (arabic)2022-05-01T06:29:14Z<p>Fatima M Hameed: </p>
<hr />
<div>==<center>'''سيتوكروم سي البشري '''</center>==<br />
<p dir='rtl'><br />
<br />
.سيتوكروم سي عبارة عن زلال صغير (الوزن الجزيئي حوالي 1200 دالتون ) وهو بروتين محفوظ للغاية عبر مجموعة من الأنواع ، موجود في النباتات والحيوانات والعديد من الكائنات أحادية الخلية<br />
<br />
يرتبط هذا البروتين بمجموعة [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D9%87%D9%8A%D9%85 هيم] وبمركزها توجد ذرة حديد، وهو بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات وبعملية الاستموات (موت الخلايا المبرمج)<br />
</p><br />
<StructureSection load='1J3S' size='340' side='left' caption=' سيتوكروم سي البشري (PDB code [[1j3s]])' scene='89/898985/Cytochrome_c_basic/19'><br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> مقدمة </div> ==<br />
<br />
سيتوكروم سي عبارة عن بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات، والتي هي العملية الأخيرة في عملية <br />
[https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D9%86%D9%81%D8%B3_%D8%AE%D9%84%D9%88%D9%8A التنفس الخلوي]<br />
. عملية التنفس الخلوي تقسم الى 3 أقسام مركزية: [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D8%AD%D9%84%D9%84_%D8%A7%D9%84%D8%AC%D9%84%D9%88%D9%83%D9%88%D8%B2 جليكوليزا ] (التي تحدث في السيتوبلازما)، [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AF%D9%88%D8%B1%D8%A9_%D8%AD%D9%85%D8%B6_%D8%A7%D9%84%D8%B3%D8%AA%D8%B1%D9%8A%D9%83 دورة كريبس] (تحدث في المساحة الداخلية للميتوكوندريا) وسلسلة نقل الالكترونات التي تحدث داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. <br />
<br />
.بنقل الالكترونات لجزيئات أخرى ملامسة لها، وهكذا يتم تشكيل سلسلة من البروتينات حاملة الإلكترونات FADH2 و NADH في سلسلة نقل الالكترونات تقوم الجزيئات المختزلة بدورة كريبس مثل<br />
.يتم استيعاب الإلكترونات في نهاية الأمر بواسطة الأكسجين ويؤدي هذا الاتحاد الى انتاج الماء<br />
نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة ، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا<br />
بواسطة منحدر التركيز الناتج في أيونات الهيدروجين يتم دفع عمل البروتين ATP سنتاز من أجل انتاج ATP. ATP هو جزيء غنيّ بالطّاقة، يحتوي على مجموعة من الأدينوساين وثلاث مجموعات من الفوسفور المرتبطة به. يؤدّي التحلّل المائيّ لمجموعة الفوسفور الثالثة إلى إطلاق طاقة تسمح للجسم بتنشيط العديد من الإنزيمات والعمليات الموجودة فيه. يقوم الجسم بإنتاج الATP في الميتوكوندريا في جميع الأوقات وذلك من الاجل الحفاظ على نسبة عالية من الATP داخل الخلية وبالتالي فان نقل الالكترونات وإنتاج منحدر تراكيز لأيونات الهيدروجين تعتبر عملية رئيسية من اجل وجود سليم للخلية.<br />
<br />
<br><br />
<br><br />
صورة1 (قوموا بالوقف على الصورة بالفأرة من أجل اظهار الشرح)<br />
</p><br />
[[Image:Electron_transport_chain_cytochrome_c.jpg|border|center|600px|نرى في الصورة سلسلة نقل الالكترونات – نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا. هذا النقل فعال (يحتاج الى طاقة) وهو عكس منحدر التركيز. تراكم ايونات الهيدروجين في الفراغ بين غشائي الخلية يمكن من دخول الهيدروجين بشكل غير فعال من اجل انتاج جزيء ATP .]]<br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
להלן שלושה סרטונים:<br />
<br><br />
[https://youtu.be/3YTPOIcj6lw סרטון] על תהליך מעבר האלקטרונים במיטוכונדריון.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/LQmTKxI4Wn4 סרטון] המסביר על התהליך בזווית רחבה יותר.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/YZsJ-8TenYw סרטון] על על מפלי ריכוזים בדגש על ATP סינטאז.<br />
</p><br />
<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المبنى الجزيئي </div> ==<br />
<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> الوظيفة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> وراثة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> أمراض </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> ورقة عمل للطالب </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المصادر </div> ==</div>Fatima M Hameedhttps://proteopedia.org/index.php?title=Cytochrome_C_(Hebrew)&diff=3554772Cytochrome C (Hebrew)2022-05-01T06:28:52Z<p>Fatima M Hameed: </p>
<hr />
<div>==<center>'''אנושי C ציטוכרום'''</center>==<br />
<p dir='rtl'><br />
ציטוכרום C הוא חלבון קטן (משקלו המולקולרי כ-12,000 דלטון) שמור מאוד לאורך האבולוציה ומצוי בצמחים, בבעלי חיים ובאורגניזמים חד-תאיים רבים. לחלבון קשורה קבוצת [https://he.wikipedia.org/wiki/%D7%94%D7%9D הם] ובמרכזה אטום ברזל. חלבון מפתח בשרשרת הולכת האלקטרונים ובתהליך האפופטוזיס (מוות מבוקר של התא). <br />
</p><br />
<StructureSection load='1J3S' size='340' side='left' caption=' אנושי C ציטוכרום (PDB code [[1j3s]])' scene='89/898985/Cytochrome_c_basic/19'><br />
==<div style="text-align: right;">מבוא </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
<br />
ציטוכרום C הינו חלבון מפתח בשרשרת הולכת האלקטרונים. תהליך זה הינו השלב האחרון בתהליך [https://he.wikipedia.org/wiki/%D7%A0%D7%A9%D7%99%D7%9E%D7%94_%D7%AA%D7%90%D7%99%D7%AA הנשימה התאית]. כזכור את הנשימה התאית ניתן לחלק לשלושה שלבים מרכזיים: [https://he.wikipedia.org/wiki/%D7%92%D7%9C%D7%99%D7%A7%D7%95%D7%9C%D7%99%D7%96%D7%94 גליקוליזה] (מתרחשת בציטופלזמה), [https://he.wikipedia.org/wiki/%D7%9E%D7%A2%D7%92%D7%9C_%D7%A7%D7%A8%D7%91%D7%A1 מעגל קרבס] (מתרחש בתוך המרחב הפנימי של המיטוכונדריה) ושרשרת הולכת האלקטרונים המתרחשת על-גבי הממברנה הפנימית של המיטוכונדריה. בתהליך שרשרת הולכת האלקטרונים מולקולות המחוזרות במעגל קרבס כמו FADH2 ו-NADH נוטות להעביר אלקטרונים למולקולות איתם הם נמצאות במגע. בכך נוצרת שרשרת של חלבונים נושאי אלקטרונים. האלקטרונים נקלטים בסופו של דבר על ידי אטומי חמצן אטמוספירי המתרכבים יחד ליצירת מים מטבוליים. כתוצאה מהולכת האלקטרונים בין הנשאים השונים, מועברים יוני מימן מהמרחב הפנימי של המיטוכונדריה לתוך המרווח הבין קרומי של המיטוכונדריה . באמצעות מפל ריכוזים של יוני המימן נוצרת האנרגיה הפוטנציאלית לייצור ATP על ידי החלבון ATP סינתאז. [https://he.wikipedia.org/wiki/ATP ATP] הינה מולקולה עתירת אנרגיה המאפשרת את פעילותם של אנזימים רבים ושל תהליכים רבים ומגוונים בתא. כדי לשמור על רמה גבוהה של ATP הגוף נדרש לייצר אותו כל העת במיטוכונדריה. לכן, מעבר האלקטרונים ויצירת מפל ריכוזים של יוני מימן הינו תהליך מפתח לקיום תקין של התא. <br />
<br><br />
<br><br />
תמונה 1 (על מנת לצפות בהסבר על התמונות בערך הניחו את העכבר על התמונה הרצויה וההסבר יצוף)<br />
</p><br />
[[Image:Electron_transport_chain_cytochrome_c.jpg|border|center|600px|בתמונה מוצגת שרשרת הולכת האלקטרונים - כתוצאה מהולכת האלקטרונים בין הנשאים השונים, מועברים יוני מימן מהמרחב הפנימי <br />
של המיטוכונדריה לתוך המרווח הבין קרומי של המיטוכונדריה. מעבר זה הינו אקטיבי וכנגד מפל הריכוזים. הצטברות יוני המימן במרווח הבין קרומי מאפשרת את כניסתם הפסיבית ליצירת מולקולת ATP.]]<br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
להלן שלושה סרטונים:<br />
<br><br />
[https://youtu.be/3YTPOIcj6lw סרטון] על תהליך מעבר האלקטרונים במיטוכונדריון.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/LQmTKxI4Wn4 סרטון] המסביר על התהליך בזווית רחבה יותר.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/YZsJ-8TenYw סרטון] על על מפלי ריכוזים בדגש על ATP סינטאז.<br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;">מבנה המולקולה </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
ציטוכרום C משתייך למשפחת חלבונים בשם all-α proteins, המאופיינים בליבה העשויה <scene name='89/898985/Secondary_structure/4'>מהמבנה השניוני</scene> <br />
<br />
אלפא הליקס (מקרא צבעים לסצנה מבנה שניוני: {{Template:ColorKey_Helix}})<br />
.כל חלבון במשפחת-על זו מכיל גם קבוצת הם אחת או יותר. <br />
<br><br />
<scene name='89/898985/Hem_c/2'>HEME C</scene> - קבוצת ההם הינה תרכובת אורגנית המיוצרת במח העצם ובכבד, קבוצה פרוסתטית - תרכובת קטנה המהווה חלק מחלבון. פעולותיה הפיזיולוגיות של קבוצת ההם נובעות מיכולתו של אטום הברזל לקשור מולקולות קטנות (מולקולה דו-אטומית של חמצן, למשל), וכן לחזר ולחמצן תרכובות אחרות (לתרום אלקטרונים ולקבל אלקטרונים, בהתאמה) . <br />
<br><br />
ציטוכרום C אנושי <scene name='89/898985/Amino_acids/4'>בנוי מרצף של 104 חומצות אמינו</scene>.שתי חומצות אמינו קושרות את אטום הברזל <scene name='89/898985/Bond_to_iron_18_80/2'>(היסטדין בעמדה 18 ומתיונין בעמדה 80)</scene><br />
,שתי חומצות אמינו נקשרות קוולנטית באמצעות אטום גופרית (S) לקבוצת ההם <scene name='89/898985/Bond_to_iron_14_17/2'>(ציסטאין בעמדה 17 וציסטאין בעמדה 14)</scene>.<br />
<br><br />
נמצא שיש מוטיב של מספר חומצות אמינו השמור מבחינה אבולוציונית. הכולל בתוכו את חומצות האמינו החשובות לקישור אטום הברזל וקבוצת ההם. <scene name='89/898985/Cxxch_motive/6'>CXXCH</scene> (ציסטאין,X,X,ציסטאין,היסטדין) כאשר X יכולה להיות כל חומצה אמינית שהיא איננה ציסטאין. ניתן לראות שגם בחלבון ציטוכרום C באדם ישנה את אותה התבנית.<br />
<br><br />
<br><br />
תמונה 2<br />
[[Image:Consurf key small.gif|center|300px|מקרא צבעים לייצוג שמירות אבולוציונית - <br />
סגול כהה מייצג חומצות אמינו השמורות באבולוציה וזהות באורגניזמים שונים,<br />
לבן מייצג חומצות אמינו עם שמירות ממוצעת <br />
כחול מייצג חומצות אמינו שאינן שמורות אבולוציונית ועמדות אלו מאופיינות במגוון של חומצות אמינו משתנות בין אורגניזמים שונים.<br />
<br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;">תפקוד </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
בשרשרת הולכת האלקטרונים ציטוכרום C מעביר אלקטרון בין קומפלקסי הנשימה III ו-IV; קומפלקס III נקרא ציטוכרום bc1 וקומפלקס-IV נקרא ציטוכרום C אוקסידאז. מעבר האלקטרונים מתאפשר עקב מצב חמצון משתנה של אטום הברזל. בתחילה, יון הברזל בקבוצת ההם בציטוכרום C נמצא במצב מופחת, Fe3+; זה מאפשר קליטה של אלקטרון אחד ומחזר את הברזל למצב Fe2+.<br />
<br> <br />
<br> <br />
תמונה 3<br />
</p><br />
[[Image:Cytochrome C Oxydoreductase.jpg|border|center|400px|בתמונה ניתן לראות את הקומפלקסים השונים בתהליך שרשרת הולכת האלקטרונים - ציטוכרום סי הינו חלבון קטן ביחס לקומפלקסים 2,3 ו- 4 ואיננו טראנסממברנלי. החלבון נע על גבי הממברנה הפנימית של המיטוכונדריה בין קומפלקס 3 לקומפלקס 4. ניתן לראות שלכל חלבוני הולכת האלקטרונים קשורות קבוצות הם.]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
לציטוכרום C תפקיד נוסף וחשוב בתהליך מוות מבוקר של התא (תהליך המכונה [https://he.wikipedia.org/wiki/%D7%90%D7%A4%D7%95%D7%A4%D7%98%D7%95%D7%96%D7%94 אפופטוזיס] ). תהליך זה מאפשר התפתחות איברים תקינה בשלב ההתפתחות העוברית, אחראי לסלקציה של תאי דם לבנים, להרג תאים סרטניים או חולים ולהרג של תאים זקנים. <br />
<br><br />
<br> <br />
ב [https://youtu.be/Od3pUsVdMhQ סרטון] הבא מתואר תהליך המוות המבוקר, ניתן לראות כיצד ציטוכרום C קשור לתהליך. <br />
<br><br />
כאשר ציטוכרום C מתפקד כנשא אלקטרונים הוא מעוגן לממברנה הפנימית של המיטוכונדריה באמצעות קשר הידרופובי לפוסופליפיד קרדיוליפין (מולקולה הידרופובית הבונה את הממברנה של המיטוכונדריה). <br />
<br><br />
<br><br />
תמונה 4<br />
</p><br />
[[Image:Cardiolipin.jpg|border|center|280px|באיור בצד שמאל ניתן לראות את החלבון ציטוכרום סי (אדום) מחובר לפוספוליפיד קרדיוליפין ומעוגן בממברנה הפנימית של המיטוכונדריה. באיור בצד ימין ניתן לראות את הפירוק של הקומפלקס קרדיוליפין + ציטוכרום סי כתוצאה מחימצון מולקולת קרדיוליפין. ציטוכרום סי מתנתק מהממברנה וחופשי לצאת לציטוזול.]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
תחילת תהליך המוות התאי מאופיינת בעלייה של רדיקלים חופשיים (ROS) במיטוכונדריה. כתוצאה מכך, קרדיוליפין מתחמצן והקומפלקס קרדיוליפין-ציטוכרום C נפרד. ציטוכרום C מנותק מהממברנה הפנימית של המיטוכונדריה ועובר דרך נקבוביות בממברנה החיצונית אל הציטופלזמה. בציטופלזמה ציטוכרום C נקשר לחלבון APAF1 וביחד עם dATP נוצר מכלול- מבנה האפופטוזום, הקושר ומבקע את החלבון פרוקספאז 9 לצורתו הבוגרת והפעילה. בכך מתאפשר חיבור עם קספאזות 3 ו- 7 והפעלתן. פעילות זו מובילה לפגיעה וקיטוע ה DNA המסתיים במוות מכוון של התא.<br />
<br><br />
<br> <br />
תמונה 5<br />
</p><br />
[[Image:Apoptosome.jpg|border|center|280px|באיור מתוארת תחילה ההשתחררות של ציטוכרום סי מהמיטוכונדריה אל הציטוזול. לאחר מכן ציטוכרום סי נקשר לחלבון ציטופלזמי היוצר את מכלול האפופטוזום, מכלול זה מהווה את אחד ממרכזי הבקרה החשובים ביותר של האפופטוזה - הוא קושר ומבקע את החלבון פרוקספאז 9, משחרר אותו בצורתו הבוגרת והפעילה, וכך מפעיל את המסלול האפופטוטי הפנימי המסתיים במוות מכוון של התא.]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
מניעת אפופטוזיס - <br />
<br><br />
מחקרים מראים שתאים יכולים לשלוט ולבקר על תהליך האפופטוזיס באמצעות מודיפיקציה לאחר תרגום בחלבון. חלבונים, כידוע, הם שרשרות ארוכות של חומצות אמיניות. השלב הראשון בבניית החלבון הוא סינתזת שרשרת החומצות האמיניות; אך על פי רוב, המבנה הראשוני הזה עובר שלבים נוספים של עיבוד, הנקראים מודיפיקציות (התאמות). אחד מסוגי המודיפיקציות הוא זרחון. תהליך הזרחון הינו הוספה של קבוצת זרחה (יון המכיל אטום זרחן אחד וארבעה אטומי חמצן). אנזימי קינאז מוסיפים קבוצות זרחה ואנזימי פוספטאז מסירים אותן. סימון מולקולות באמצעות זרחון משמש לבקרה על מגוון עצום של תהליכים בתאים חיים .בציטוכרום C התגלו מספר חומצות אמינו שמורות מאוד מבחינה אבולוציונית <scene name='89/898985/Phosphotyrosine_48_97/4'>העוברות זרחון</scene> (פוספורלציה) ובכך מקנות לחלבון פעילות מבוקרת המונעת יצירה מוגברת של רדיקלים חופשיים (ROS). <br />
<br><br />
<br><br />
תמונה 6<br />
</p><br />
[[Image:Apoptosome formation.jpg|border|center|בתרשים מוצגת פעילות החלבון במצב מזורחן (מבוקר) ובמצב לא מזורחן (לא מבוקר); במצב מבוקר ניתן לראות שקצב הנשימה מווסת ולכן נוצרים מעט רדיקלים חופשיים, פוטנציאל הממברנה חיובי וציטוכרום סי קשור לממברנה הפנימית של המיטוכונדריה באמצעות קרדיוליפין. <br />
במצב לא מבוקר קצב הנשימה התאית הינו קצב מקסימאלי המייצר פוטנציאל ממברנה שלילי, יש עלייה בייצור רדיקלים חופשיים וקומפלקס קרדיוליפין+ציטוכרום סי נפרד. <br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
תמונה 7<br />
</p><br />
[[Image:Cytochrome c alignment.jpg|border|center|עימוד ציטוכרום סי מאדם ומעכבר (מרקמה סומטית ומרקמת תאי מין) מאפשר לזהות עמדות שמורות אבולוציונית. ניתן לראות את עמדות 14 ו- 17 הקושרות קוולנטית את קבוצת ההם (חומצות אמינו ציסטאין המסומנות באות הגדולה סי). במיקום החיצים נמצאות עמדות שמורות העוברות מודיפיקציות לאחר תרגום, ביניהן גם עמדות 48 ו- 97 (חומצה אמינית טירוזין המסומנת באות וואי) המוזכרות בערך זה. ]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
פעילותו כנוגד חמצון (מפחית ROS) נעשית גם באופן ישיר על ידי הסרת סופראוקסיד (O2–) ומי חמצן (H2O2) מהמיטוכונדריה לפי התרשים הבא-<br />
<br><br />
<br><br />
תמונה 8<br />
</p><br />
[[Image:Antioxidante.png|center|]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
ציטוכרום C הינו חלבון המשחק תפקיד מרכזי בתהליכי יצור האנרגיה בתא וכמו גם שחקן מפתח בתהליכים של מוות תאי מבוקר.<br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;">גנטיקה </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
הגן CYCS המקודד לחלבון ציטוכרום C באדם נמצא בכרומוזום 7 ב DNA בגרעין התא . זאת בשונה מחלבונים אחרים המתפקדים באברון המיטוכונדריה המקודדים מ DNA מיטוכונדריאלי. ביחס ל-DNA הגרעיני, ה-DNA המיטוכונדריאלי הוא זעיר ממש, מורכב מכרומוזום אחד קטן וכולל פחות מ-17 אלף זוגות בסיסים, בהשוואה לכשלושה מיליארד הבסיסים ב-23 זוגות הכרומוזומים בגרעין. עם זאת, בכל תא יש רק גרעין אחד ומיטוכונדריה רבים: בחלק מהתאים מספר אברוני מיטוכונדריה מגיע לאלפים, ולכן יש בהם גם אלפי עותקים של ה-DNA המיטוכונדריאלי. הבדל נוסף בין סוגי ה-DNA הוא שאת ה-DNA המיטוכונדריאלי אנחנו מקבלים מהאם בלבד. בתא הזרע יש מיטוכונדריה, אך הם נמצאים ב"זנב" של התא, שנשאר בחוץ כאשר הוא מתאחד עם הביצית. ה-DNA המיטוכונדריאלי מקודד ל-13 חלבונים החיוניים לתפקוד המיטוכונדריה כ"תחנת הכוח של התא". <br />
<br><br />
בגנום האנושי נמצאו 49 פסאודוגנים לגן CYCS (גנים שאינם עוברים שעתוק ותרגום לחלבונים) . לגן שלושה אקסונים . <br />
<br><br />
כל חלבון נוצר בתא בעקבות תהליך הביטוי של הגן המקודד אותו. המידע הגנטי הטמון בגן בא לידי ביטוי כאשר ה-DNA מתועתק תחילה למולקולת RNA-שליח, ומולקולת ה-RNA-שליח מתורגמת לחלבון. בביטוי גן מעורבים אפוא תהליך התעתוק ותהליך התרגום. לא כל הגנים באורגניזם מתבטאים בו בזמן - כל תא מבטא רק חלק מסוים של המידע הטמון בו. חלק זה הכרחי לקיום התא ולתִפקודו. שאר הגנים, שאינם חיוניים לתִפקודו של התא – מדוכאים. <br />
ביטוי הגן CYCS נמדד לפי כמות RNA שליח ברקמות השונות. ניתן לראות שהביטוי משתנה מרקמה לרקמה. <br />
<br><br />
<br> <br />
תמונה 9<br />
[[Image:Expression cytochrome c.JPG|border|center|600px|]]<br />
</p><br />
<br> <br />
==<div style="text-align: right;">מחלות </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
מוטציה בגן CYCS המאופיינת בחילוף חומצה אמינית <scene name='89/898985/Gly__41/3'>גליצין בעמדה 41(עמדה שמורה) </scene> לחומצה אמינית סרין נמצאה אצל אנשים הלוקים בתסמונת טרומבוציטופניה אוטוזומלית דומיננטית - הפרעה המטולוגית המוגדרת על ידי ירידה במספר הטסיות בדם במחזור הדם, וכתוצאה מכך פוטנציאל לדימום מוגבר וירידה ביכולת הקרישה. נבחן הקשר בין איפיון זה להתפתחות המחלה. במחקרים שנערכו לאחרונה נמצא שמוטציה זו מגבירה את הפעילות הפרו-אפופטוטית על ידי הפעלת קספזה בצורה יעילה יותר מאשר החלבון התקין. מוטציה זו איננה משפיעה על פונקציית החיזור של החלבון.<br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;">דף עבודה לתלמיד </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
[https://proteopedia.org/wiki/images/d/d8/%D7%93%D7%A3_%D7%A2%D7%91%D7%95%D7%93%D7%94_%D7%9C%D7%AA%D7%9C%D7%9E%D7%99%D7%93_-_cytochrome_C.pdf דף עבודה לתלמיד]<br />
<br><br />
[https://proteopedia.org/wiki/images/0/08/%D7%A0%D7%A1%D7%A4%D7%97_FASTA_%D7%A9%D7%9C_%D7%94%D7%97%D7%9C%D7%91%D7%95%D7%A0%D7%99%D7%9D.doc נספח]<br />
</p><br />
<br><br />
==<div style="text-align: right;">מקורות מידע </div> ==<br />
<br><br />
[https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/compound/444125#section=3D-Conformer pubchem]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/NP_061820.1 ncbi - cytochrome c - homo sapiens]<br />
<br><br />
[https://ashpublications.org/blood/article/132/Supplement%201/3758/265249/A-Novel-Cycs-Missense-Mutation-in-the-Helix-of-the A Novel Cycs Missense Mutation in the α-Helix of the Cycs C-Terminal Domain Causes Non-Syndromic Thrombocytopenia]<br />
<br><br />
[https://davidson.weizmann.ac.il/online/sciencenews/%D7%9C%D7%A8%D7%90%D7%95%D7%AA-%D7%90%D7%AA-%D7%94%D7%9E%D7%95%D7%9C%D7%A7%D7%95%D7%9C%D7%95%D7%AA-%D7%A0%D7%98%D7%A2%D7%A0%D7%95%D7%AA לראות את המולקולות נטענות - מכון דוידסון]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/browser/gene/?id=54205 ncbi cics gene]<br />
<br><br />
[https://www.rcsb.org/structure/1gu2 pdb - 1GU2]<br />
<br><br />
[https://www.rcsb.org/structure/1AKK pdb - 1AKK]<br />
<br><br />
[https://chem.libretexts.org/Courses/Saint_Marys_College_Notre_Dame_IN/CHEM_342%3A_Bio-inorganic_Chemistry/Readings/Metals_in_Biological_Systems_(Saint_Mary's_College)/Cytochrome_C Cytochrome C. (2019, June 5).]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/54205 ncbi - CYCS cytochrome c - Homo sapiens]<br />
<br><br />
[https://www.nature.com/articles/nrm2434 nature - Cytochrome c: functions beyond respiration]</div>Fatima M Hameedhttps://proteopedia.org/index.php?title=Cytochrome_C_(Hebrew)&diff=3554771Cytochrome C (Hebrew)2022-05-01T06:28:03Z<p>Fatima M Hameed: </p>
<hr />
<div>==<center>'''אנושי C ציטוכרום'''</center>==<br />
<p dir='rtl'><br />
ציטוכרום C הוא חלבון קטן (משקלו המולקולרי כ-12,000 דלטון) שמור מאוד לאורך האבולוציה ומצוי בצמחים, בבעלי חיים ובאורגניזמים חד-תאיים רבים. לחלבון קשורה קבוצת [https://he.wikipedia.org/wiki/%D7%94%D7%9D הם] ובמרכזה אטום ברזל. חלבון מפתח בשרשרת הולכת האלקטרונים ובתהליך האפופטוזיס (מוות מבוקר של התא). <br />
</p><br />
<StructureSection load='1J3S' size='340' side='left' caption=' אנושי C ציטוכרום (PDB code [[1j3s]])' scene='89/898985/Cytochrome_c_basic/19'><br />
==<div style="text-align: right;">מבוא </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
<br />
ציטוכרום C הינו חלבון מפתח בשרשרת הולכת האלקטרונים. תהליך זה הינו השלב האחרון בתהליך [https://he.wikipedia.org/wiki/%D7%A0%D7%A9%D7%99%D7%9E%D7%94_%D7%AA%D7%90%D7%99%D7%AA הנשימה התאית]. כזכור את הנשימה התאית ניתן לחלק לשלושה שלבים מרכזיים: [https://he.wikipedia.org/wiki/%D7%92%D7%9C%D7%99%D7%A7%D7%95%D7%9C%D7%99%D7%96%D7%94 גליקוליזה] (מתרחשת בציטופלזמה), [https://he.wikipedia.org/wiki/%D7%9E%D7%A2%D7%92%D7%9C_%D7%A7%D7%A8%D7%91%D7%A1 מעגל קרבס] (מתרחש בתוך המרחב הפנימי של המיטוכונדריה) ושרשרת הולכת האלקטרונים המתרחשת על-גבי הממברנה הפנימית של המיטוכונדריה. בתהליך שרשרת הולכת האלקטרונים מולקולות המחוזרות במעגל קרבס כמו FADH2 ו-NADH נוטות להעביר אלקטרונים למולקולות איתם הם נמצאות במגע. בכך נוצרת שרשרת של חלבונים נושאי אלקטרונים. האלקטרונים נקלטים בסופו של דבר על ידי אטומי חמצן אטמוספירי המתרכבים יחד ליצירת מים מטבוליים. כתוצאה מהולכת האלקטרונים בין הנשאים השונים, מועברים יוני מימן מהמרחב הפנימי של המיטוכונדריה לתוך המרווח הבין קרומי של המיטוכונדריה . באמצעות מפל ריכוזים של יוני המימן נוצרת האנרגיה הפוטנציאלית לייצור ATP על ידי החלבון ATP סינתאז. [https://he.wikipedia.org/wiki/ATP ATP] הינה מולקולה עתירת אנרגיה המאפשרת את פעילותם של אנזימים רבים ושל תהליכים רבים ומגוונים בתא. כדי לשמור על רמה גבוהה של ATP הגוף נדרש לייצר אותו כל העת במיטוכונדריה. לכן, מעבר האלקטרונים ויצירת מפל ריכוזים של יוני מימן הינו תהליך מפתח לקיום תקין של התא. <br />
<br><br />
<br><br />
תמונה 1 (על מנת לצפות בהסבר על התמונות בערך הניחו את העכבר על התמונה הרצויה וההסבר יצוף)<br />
</p><br />
[[Image:Electron_transport_chain_cytochrome_c.jpg|border|center|600px|نرى في الصورة سلسلة نقل الالكترونات – نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا. هذا النقل فعال (يحتاج الى طاقة) وهو عكس منحدر التركيز. تراكم ايونات الهيدروجين في الفراغ بين غشائي الخلية يمكن من دخول الهيدروجين بشكل غير فعال من اجل انتاج جزيء ATP.]]<br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
להלן שלושה סרטונים:<br />
<br><br />
[https://youtu.be/3YTPOIcj6lw סרטון] על תהליך מעבר האלקטרונים במיטוכונדריון.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/LQmTKxI4Wn4 סרטון] המסביר על התהליך בזווית רחבה יותר.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/YZsJ-8TenYw סרטון] על על מפלי ריכוזים בדגש על ATP סינטאז.<br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;">מבנה המולקולה </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
ציטוכרום C משתייך למשפחת חלבונים בשם all-α proteins, המאופיינים בליבה העשויה <scene name='89/898985/Secondary_structure/4'>מהמבנה השניוני</scene> <br />
<br />
אלפא הליקס (מקרא צבעים לסצנה מבנה שניוני: {{Template:ColorKey_Helix}})<br />
.כל חלבון במשפחת-על זו מכיל גם קבוצת הם אחת או יותר. <br />
<br><br />
<scene name='89/898985/Hem_c/2'>HEME C</scene> - קבוצת ההם הינה תרכובת אורגנית המיוצרת במח העצם ובכבד, קבוצה פרוסתטית - תרכובת קטנה המהווה חלק מחלבון. פעולותיה הפיזיולוגיות של קבוצת ההם נובעות מיכולתו של אטום הברזל לקשור מולקולות קטנות (מולקולה דו-אטומית של חמצן, למשל), וכן לחזר ולחמצן תרכובות אחרות (לתרום אלקטרונים ולקבל אלקטרונים, בהתאמה) . <br />
<br><br />
ציטוכרום C אנושי <scene name='89/898985/Amino_acids/4'>בנוי מרצף של 104 חומצות אמינו</scene>.שתי חומצות אמינו קושרות את אטום הברזל <scene name='89/898985/Bond_to_iron_18_80/2'>(היסטדין בעמדה 18 ומתיונין בעמדה 80)</scene><br />
,שתי חומצות אמינו נקשרות קוולנטית באמצעות אטום גופרית (S) לקבוצת ההם <scene name='89/898985/Bond_to_iron_14_17/2'>(ציסטאין בעמדה 17 וציסטאין בעמדה 14)</scene>.<br />
<br><br />
נמצא שיש מוטיב של מספר חומצות אמינו השמור מבחינה אבולוציונית. הכולל בתוכו את חומצות האמינו החשובות לקישור אטום הברזל וקבוצת ההם. <scene name='89/898985/Cxxch_motive/6'>CXXCH</scene> (ציסטאין,X,X,ציסטאין,היסטדין) כאשר X יכולה להיות כל חומצה אמינית שהיא איננה ציסטאין. ניתן לראות שגם בחלבון ציטוכרום C באדם ישנה את אותה התבנית.<br />
<br><br />
<br><br />
תמונה 2<br />
[[Image:Consurf key small.gif|center|300px|מקרא צבעים לייצוג שמירות אבולוציונית - <br />
סגול כהה מייצג חומצות אמינו השמורות באבולוציה וזהות באורגניזמים שונים,<br />
לבן מייצג חומצות אמינו עם שמירות ממוצעת <br />
כחול מייצג חומצות אמינו שאינן שמורות אבולוציונית ועמדות אלו מאופיינות במגוון של חומצות אמינו משתנות בין אורגניזמים שונים.<br />
<br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;">תפקוד </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
בשרשרת הולכת האלקטרונים ציטוכרום C מעביר אלקטרון בין קומפלקסי הנשימה III ו-IV; קומפלקס III נקרא ציטוכרום bc1 וקומפלקס-IV נקרא ציטוכרום C אוקסידאז. מעבר האלקטרונים מתאפשר עקב מצב חמצון משתנה של אטום הברזל. בתחילה, יון הברזל בקבוצת ההם בציטוכרום C נמצא במצב מופחת, Fe3+; זה מאפשר קליטה של אלקטרון אחד ומחזר את הברזל למצב Fe2+.<br />
<br> <br />
<br> <br />
תמונה 3<br />
</p><br />
[[Image:Cytochrome C Oxydoreductase.jpg|border|center|400px|בתמונה ניתן לראות את הקומפלקסים השונים בתהליך שרשרת הולכת האלקטרונים - ציטוכרום סי הינו חלבון קטן ביחס לקומפלקסים 2,3 ו- 4 ואיננו טראנסממברנלי. החלבון נע על גבי הממברנה הפנימית של המיטוכונדריה בין קומפלקס 3 לקומפלקס 4. ניתן לראות שלכל חלבוני הולכת האלקטרונים קשורות קבוצות הם.]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
לציטוכרום C תפקיד נוסף וחשוב בתהליך מוות מבוקר של התא (תהליך המכונה [https://he.wikipedia.org/wiki/%D7%90%D7%A4%D7%95%D7%A4%D7%98%D7%95%D7%96%D7%94 אפופטוזיס] ). תהליך זה מאפשר התפתחות איברים תקינה בשלב ההתפתחות העוברית, אחראי לסלקציה של תאי דם לבנים, להרג תאים סרטניים או חולים ולהרג של תאים זקנים. <br />
<br><br />
<br> <br />
ב [https://youtu.be/Od3pUsVdMhQ סרטון] הבא מתואר תהליך המוות המבוקר, ניתן לראות כיצד ציטוכרום C קשור לתהליך. <br />
<br><br />
כאשר ציטוכרום C מתפקד כנשא אלקטרונים הוא מעוגן לממברנה הפנימית של המיטוכונדריה באמצעות קשר הידרופובי לפוסופליפיד קרדיוליפין (מולקולה הידרופובית הבונה את הממברנה של המיטוכונדריה). <br />
<br><br />
<br><br />
תמונה 4<br />
</p><br />
[[Image:Cardiolipin.jpg|border|center|280px|באיור בצד שמאל ניתן לראות את החלבון ציטוכרום סי (אדום) מחובר לפוספוליפיד קרדיוליפין ומעוגן בממברנה הפנימית של המיטוכונדריה. באיור בצד ימין ניתן לראות את הפירוק של הקומפלקס קרדיוליפין + ציטוכרום סי כתוצאה מחימצון מולקולת קרדיוליפין. ציטוכרום סי מתנתק מהממברנה וחופשי לצאת לציטוזול.]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
תחילת תהליך המוות התאי מאופיינת בעלייה של רדיקלים חופשיים (ROS) במיטוכונדריה. כתוצאה מכך, קרדיוליפין מתחמצן והקומפלקס קרדיוליפין-ציטוכרום C נפרד. ציטוכרום C מנותק מהממברנה הפנימית של המיטוכונדריה ועובר דרך נקבוביות בממברנה החיצונית אל הציטופלזמה. בציטופלזמה ציטוכרום C נקשר לחלבון APAF1 וביחד עם dATP נוצר מכלול- מבנה האפופטוזום, הקושר ומבקע את החלבון פרוקספאז 9 לצורתו הבוגרת והפעילה. בכך מתאפשר חיבור עם קספאזות 3 ו- 7 והפעלתן. פעילות זו מובילה לפגיעה וקיטוע ה DNA המסתיים במוות מכוון של התא.<br />
<br><br />
<br> <br />
תמונה 5<br />
</p><br />
[[Image:Apoptosome.jpg|border|center|280px|באיור מתוארת תחילה ההשתחררות של ציטוכרום סי מהמיטוכונדריה אל הציטוזול. לאחר מכן ציטוכרום סי נקשר לחלבון ציטופלזמי היוצר את מכלול האפופטוזום, מכלול זה מהווה את אחד ממרכזי הבקרה החשובים ביותר של האפופטוזה - הוא קושר ומבקע את החלבון פרוקספאז 9, משחרר אותו בצורתו הבוגרת והפעילה, וכך מפעיל את המסלול האפופטוטי הפנימי המסתיים במוות מכוון של התא.]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
מניעת אפופטוזיס - <br />
<br><br />
מחקרים מראים שתאים יכולים לשלוט ולבקר על תהליך האפופטוזיס באמצעות מודיפיקציה לאחר תרגום בחלבון. חלבונים, כידוע, הם שרשרות ארוכות של חומצות אמיניות. השלב הראשון בבניית החלבון הוא סינתזת שרשרת החומצות האמיניות; אך על פי רוב, המבנה הראשוני הזה עובר שלבים נוספים של עיבוד, הנקראים מודיפיקציות (התאמות). אחד מסוגי המודיפיקציות הוא זרחון. תהליך הזרחון הינו הוספה של קבוצת זרחה (יון המכיל אטום זרחן אחד וארבעה אטומי חמצן). אנזימי קינאז מוסיפים קבוצות זרחה ואנזימי פוספטאז מסירים אותן. סימון מולקולות באמצעות זרחון משמש לבקרה על מגוון עצום של תהליכים בתאים חיים .בציטוכרום C התגלו מספר חומצות אמינו שמורות מאוד מבחינה אבולוציונית <scene name='89/898985/Phosphotyrosine_48_97/4'>העוברות זרחון</scene> (פוספורלציה) ובכך מקנות לחלבון פעילות מבוקרת המונעת יצירה מוגברת של רדיקלים חופשיים (ROS). <br />
<br><br />
<br><br />
תמונה 6<br />
</p><br />
[[Image:Apoptosome formation.jpg|border|center|בתרשים מוצגת פעילות החלבון במצב מזורחן (מבוקר) ובמצב לא מזורחן (לא מבוקר); במצב מבוקר ניתן לראות שקצב הנשימה מווסת ולכן נוצרים מעט רדיקלים חופשיים, פוטנציאל הממברנה חיובי וציטוכרום סי קשור לממברנה הפנימית של המיטוכונדריה באמצעות קרדיוליפין. <br />
במצב לא מבוקר קצב הנשימה התאית הינו קצב מקסימאלי המייצר פוטנציאל ממברנה שלילי, יש עלייה בייצור רדיקלים חופשיים וקומפלקס קרדיוליפין+ציטוכרום סי נפרד. <br />
]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
תמונה 7<br />
</p><br />
[[Image:Cytochrome c alignment.jpg|border|center|עימוד ציטוכרום סי מאדם ומעכבר (מרקמה סומטית ומרקמת תאי מין) מאפשר לזהות עמדות שמורות אבולוציונית. ניתן לראות את עמדות 14 ו- 17 הקושרות קוולנטית את קבוצת ההם (חומצות אמינו ציסטאין המסומנות באות הגדולה סי). במיקום החיצים נמצאות עמדות שמורות העוברות מודיפיקציות לאחר תרגום, ביניהן גם עמדות 48 ו- 97 (חומצה אמינית טירוזין המסומנת באות וואי) המוזכרות בערך זה. ]]<br />
<br><br />
<br> <br />
<p dir='rtl'><br />
פעילותו כנוגד חמצון (מפחית ROS) נעשית גם באופן ישיר על ידי הסרת סופראוקסיד (O2–) ומי חמצן (H2O2) מהמיטוכונדריה לפי התרשים הבא-<br />
<br><br />
<br><br />
תמונה 8<br />
</p><br />
[[Image:Antioxidante.png|center|]]<br />
<br><br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
ציטוכרום C הינו חלבון המשחק תפקיד מרכזי בתהליכי יצור האנרגיה בתא וכמו גם שחקן מפתח בתהליכים של מוות תאי מבוקר.<br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;">גנטיקה </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
הגן CYCS המקודד לחלבון ציטוכרום C באדם נמצא בכרומוזום 7 ב DNA בגרעין התא . זאת בשונה מחלבונים אחרים המתפקדים באברון המיטוכונדריה המקודדים מ DNA מיטוכונדריאלי. ביחס ל-DNA הגרעיני, ה-DNA המיטוכונדריאלי הוא זעיר ממש, מורכב מכרומוזום אחד קטן וכולל פחות מ-17 אלף זוגות בסיסים, בהשוואה לכשלושה מיליארד הבסיסים ב-23 זוגות הכרומוזומים בגרעין. עם זאת, בכל תא יש רק גרעין אחד ומיטוכונדריה רבים: בחלק מהתאים מספר אברוני מיטוכונדריה מגיע לאלפים, ולכן יש בהם גם אלפי עותקים של ה-DNA המיטוכונדריאלי. הבדל נוסף בין סוגי ה-DNA הוא שאת ה-DNA המיטוכונדריאלי אנחנו מקבלים מהאם בלבד. בתא הזרע יש מיטוכונדריה, אך הם נמצאים ב"זנב" של התא, שנשאר בחוץ כאשר הוא מתאחד עם הביצית. ה-DNA המיטוכונדריאלי מקודד ל-13 חלבונים החיוניים לתפקוד המיטוכונדריה כ"תחנת הכוח של התא". <br />
<br><br />
בגנום האנושי נמצאו 49 פסאודוגנים לגן CYCS (גנים שאינם עוברים שעתוק ותרגום לחלבונים) . לגן שלושה אקסונים . <br />
<br><br />
כל חלבון נוצר בתא בעקבות תהליך הביטוי של הגן המקודד אותו. המידע הגנטי הטמון בגן בא לידי ביטוי כאשר ה-DNA מתועתק תחילה למולקולת RNA-שליח, ומולקולת ה-RNA-שליח מתורגמת לחלבון. בביטוי גן מעורבים אפוא תהליך התעתוק ותהליך התרגום. לא כל הגנים באורגניזם מתבטאים בו בזמן - כל תא מבטא רק חלק מסוים של המידע הטמון בו. חלק זה הכרחי לקיום התא ולתִפקודו. שאר הגנים, שאינם חיוניים לתִפקודו של התא – מדוכאים. <br />
ביטוי הגן CYCS נמדד לפי כמות RNA שליח ברקמות השונות. ניתן לראות שהביטוי משתנה מרקמה לרקמה. <br />
<br><br />
<br> <br />
תמונה 9<br />
[[Image:Expression cytochrome c.JPG|border|center|600px|]]<br />
</p><br />
<br> <br />
==<div style="text-align: right;">מחלות </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
מוטציה בגן CYCS המאופיינת בחילוף חומצה אמינית <scene name='89/898985/Gly__41/3'>גליצין בעמדה 41(עמדה שמורה) </scene> לחומצה אמינית סרין נמצאה אצל אנשים הלוקים בתסמונת טרומבוציטופניה אוטוזומלית דומיננטית - הפרעה המטולוגית המוגדרת על ידי ירידה במספר הטסיות בדם במחזור הדם, וכתוצאה מכך פוטנציאל לדימום מוגבר וירידה ביכולת הקרישה. נבחן הקשר בין איפיון זה להתפתחות המחלה. במחקרים שנערכו לאחרונה נמצא שמוטציה זו מגבירה את הפעילות הפרו-אפופטוטית על ידי הפעלת קספזה בצורה יעילה יותר מאשר החלבון התקין. מוטציה זו איננה משפיעה על פונקציית החיזור של החלבון.<br />
</p><br />
==<div style="text-align: right;">דף עבודה לתלמיד </div> ==<br />
<p dir='rtl'><br />
[https://proteopedia.org/wiki/images/d/d8/%D7%93%D7%A3_%D7%A2%D7%91%D7%95%D7%93%D7%94_%D7%9C%D7%AA%D7%9C%D7%9E%D7%99%D7%93_-_cytochrome_C.pdf דף עבודה לתלמיד]<br />
<br><br />
[https://proteopedia.org/wiki/images/0/08/%D7%A0%D7%A1%D7%A4%D7%97_FASTA_%D7%A9%D7%9C_%D7%94%D7%97%D7%9C%D7%91%D7%95%D7%A0%D7%99%D7%9D.doc נספח]<br />
</p><br />
<br><br />
==<div style="text-align: right;">מקורות מידע </div> ==<br />
<br><br />
[https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/compound/444125#section=3D-Conformer pubchem]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/NP_061820.1 ncbi - cytochrome c - homo sapiens]<br />
<br><br />
[https://ashpublications.org/blood/article/132/Supplement%201/3758/265249/A-Novel-Cycs-Missense-Mutation-in-the-Helix-of-the A Novel Cycs Missense Mutation in the α-Helix of the Cycs C-Terminal Domain Causes Non-Syndromic Thrombocytopenia]<br />
<br><br />
[https://davidson.weizmann.ac.il/online/sciencenews/%D7%9C%D7%A8%D7%90%D7%95%D7%AA-%D7%90%D7%AA-%D7%94%D7%9E%D7%95%D7%9C%D7%A7%D7%95%D7%9C%D7%95%D7%AA-%D7%A0%D7%98%D7%A2%D7%A0%D7%95%D7%AA לראות את המולקולות נטענות - מכון דוידסון]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/browser/gene/?id=54205 ncbi cics gene]<br />
<br><br />
[https://www.rcsb.org/structure/1gu2 pdb - 1GU2]<br />
<br><br />
[https://www.rcsb.org/structure/1AKK pdb - 1AKK]<br />
<br><br />
[https://chem.libretexts.org/Courses/Saint_Marys_College_Notre_Dame_IN/CHEM_342%3A_Bio-inorganic_Chemistry/Readings/Metals_in_Biological_Systems_(Saint_Mary's_College)/Cytochrome_C Cytochrome C. (2019, June 5).]<br />
<br><br />
[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/54205 ncbi - CYCS cytochrome c - Homo sapiens]<br />
<br><br />
[https://www.nature.com/articles/nrm2434 nature - Cytochrome c: functions beyond respiration]</div>Fatima M Hameedhttps://proteopedia.org/index.php?title=Cytochrome_C_(arabic)&diff=3554770Cytochrome C (arabic)2022-05-01T06:20:05Z<p>Fatima M Hameed: </p>
<hr />
<div>==<center>'''سيتوكروم سي البشري '''</center>==<br />
<p dir='rtl'><br />
<br />
.سيتوكروم سي عبارة عن زلال صغير (الوزن الجزيئي حوالي 1200 دالتون ) وهو بروتين محفوظ للغاية عبر مجموعة من الأنواع ، موجود في النباتات والحيوانات والعديد من الكائنات أحادية الخلية<br />
<br />
يرتبط هذا البروتين بمجموعة [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D9%87%D9%8A%D9%85 هيم] وبمركزها توجد ذرة حديد، وهو بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات وبعملية الاستموات (موت الخلايا المبرمج)<br />
</p><br />
<StructureSection load='1J3S' size='340' side='left' caption=' سيتوكروم سي البشري (PDB code [[1j3s]])' scene='89/898985/Cytochrome_c_basic/19'><br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> مقدمة </div> ==<br />
<br />
سيتوكروم سي عبارة عن بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات، والتي هي العملية الأخيرة في عملية <br />
[https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D9%86%D9%81%D8%B3_%D8%AE%D9%84%D9%88%D9%8A التنفس الخلوي]<br />
. عملية التنفس الخلوي تقسم الى 3 أقسام مركزية: [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D8%AD%D9%84%D9%84_%D8%A7%D9%84%D8%AC%D9%84%D9%88%D9%83%D9%88%D8%B2 جليكوليزا ] (التي تحدث في السيتوبلازما)، [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AF%D9%88%D8%B1%D8%A9_%D8%AD%D9%85%D8%B6_%D8%A7%D9%84%D8%B3%D8%AA%D8%B1%D9%8A%D9%83 دورة كريبس] (تحدث في المساحة الداخلية للميتوكوندريا) وسلسلة نقل الالكترونات التي تحدث داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. <br />
<br />
.بنقل الالكترونات لجزيئات أخرى ملامسة لها، وهكذا يتم تشكيل سلسلة من البروتينات حاملة الإلكترونات FADH2 و NADH في سلسلة نقل الالكترونات تقوم الجزيئات المختزلة بدورة كريبس مثل<br />
.يتم استيعاب الإلكترونات في نهاية الأمر بواسطة الأكسجين ويؤدي هذا الاتحاد الى انتاج الماء<br />
نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة ، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا<br />
بواسطة منحدر التركيز الناتج في أيونات الهيدروجين يتم دفع عمل البروتين ATP سنتاز من أجل انتاج ATP. ATP هو جزيء غنيّ بالطّاقة، يحتوي على مجموعة من الأدينوساين وثلاث مجموعات من الفوسفور المرتبطة به. يؤدّي التحلّل المائيّ لمجموعة الفوسفور الثالثة إلى إطلاق طاقة تسمح للجسم بتنشيط العديد من الإنزيمات والعمليات الموجودة فيه. يقوم الجسم بإنتاج الATP في الميتوكوندريا في جميع الأوقات وذلك من الاجل الحفاظ على نسبة عالية من الATP داخل الخلية وبالتالي فان نقل الالكترونات وإنتاج منحدر تراكيز لأيونات الهيدروجين تعتبر عملية رئيسية من اجل وجود سليم للخلية.<br />
<br />
<br><br />
<br><br />
תמונה 1 (על מנת לצפות בהסבר על התמונות בערך הניחו את העכבר על התמונה הרצויה וההסבר יצוף)<br />
</p><br />
[[Image:Electron_transport_chain_cytochrome_c.jpg|border|center|600px|בתמונה מוצגת שרשרת הולכת האלקטרונים - כתוצאה מהולכת האלקטרונים בין הנשאים השונים, מועברים יוני מימן מהמרחב הפנימי <br />
של המיטוכונדריה לתוך המרווח הבין קרומי של המיטוכונדריה. מעבר זה הינו אקטיבי וכנגד מפל הריכוזים. הצטברות יוני המימן במרווח הבין קרומי מאפשרת את כניסתם הפסיבית ליצירת מולקולת ATP.]]<br />
<br><br />
<p dir='rtl'><br />
להלן שלושה סרטונים:<br />
<br><br />
[https://youtu.be/3YTPOIcj6lw סרטון] על תהליך מעבר האלקטרונים במיטוכונדריון.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/LQmTKxI4Wn4 סרטון] המסביר על התהליך בזווית רחבה יותר.<br />
<br><br />
[https://youtu.be/YZsJ-8TenYw סרטון] על על מפלי ריכוזים בדגש על ATP סינטאז.<br />
</p><br />
<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المبنى الجزيئي </div> ==<br />
<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> الوظيفة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> وراثة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> أمراض </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> ورقة عمل للطالب </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المصادر </div> ==</div>Fatima M Hameedhttps://proteopedia.org/index.php?title=Cytochrome_C_(arabic)&diff=3554769Cytochrome C (arabic)2022-05-01T06:07:20Z<p>Fatima M Hameed: </p>
<hr />
<div>==<center>'''سيتوكروم سي البشري '''</center>==<br />
<p dir='rtl'><br />
<br />
.سيتوكروم سي عبارة عن زلال صغير (الوزن الجزيئي حوالي 1200 دالتون ) وهو بروتين محفوظ للغاية عبر مجموعة من الأنواع ، موجود في النباتات والحيوانات والعديد من الكائنات أحادية الخلية<br />
<br />
يرتبط هذا البروتين بمجموعة [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D9%87%D9%8A%D9%85 هيم] وبمركزها توجد ذرة حديد، وهو بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات وبعملية الاستموات (موت الخلايا المبرمج)<br />
</p><br />
<StructureSection load='1J3S' size='340' side='left' caption=' سيتوكروم سي البشري (PDB code [[1j3s]])' scene='89/898985/Cytochrome_c_basic/19'><br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> مقدمة </div> ==<br />
<br />
سيتوكروم سي عبارة عن بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات، والتي هي العملية الأخيرة في عملية <br />
[https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D9%86%D9%81%D8%B3_%D8%AE%D9%84%D9%88%D9%8A التنفس الخلوي]<br />
. عملية التنفس الخلوي تقسم الى 3 أقسام مركزية: [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D8%AD%D9%84%D9%84_%D8%A7%D9%84%D8%AC%D9%84%D9%88%D9%83%D9%88%D8%B2 جليكوليزا ] (التي تحدث في السيتوبلازما)، [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AF%D9%88%D8%B1%D8%A9_%D8%AD%D9%85%D8%B6_%D8%A7%D9%84%D8%B3%D8%AA%D8%B1%D9%8A%D9%83 دورة كريبس] (تحدث في المساحة الداخلية للميتوكوندريا) وسلسلة نقل الالكترونات التي تحدث داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. <br />
<br />
.بنقل الالكترونات لجزيئات أخرى ملامسة لها، وهكذا يتم تشكيل سلسلة من البروتينات حاملة الإلكترونات FADH2 و NADH في سلسلة نقل الالكترونات تقوم الجزيئات المختزلة بدورة كريبس مثل<br />
.يتم استيعاب الإلكترونات في نهاية الأمر بواسطة الأكسجين ويؤدي هذا الاتحاد الى انتاج الماء<br />
نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة ، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا<br />
بواسطة منحدر التركيز الناتج في أيونات الهيدروجين يتم دفع عمل البروتين ATP سنتاز من أجل انتاج ATP. ATP هو جزيء غنيّ بالطّاقة، يحتوي على مجموعة من الأدينوساين وثلاث مجموعات من الفوسفور المرتبطة به. يؤدّي التحلّل المائيّ لمجموعة الفوسفور الثالثة إلى إطلاق طاقة تسمح للجسم بتنشيط العديد من الإنزيمات والعمليات الموجودة فيه. يقوم الجسم بإنتاج الATP في الميتوكوندريا في جميع الأوقات وذلك من الاجل الحفاظ على نسبة عالية من الATP داخل الخلية وبالتالي فان نقل الالكترونات وإنتاج منحدر تراكيز لأيونات الهيدروجين تعتبر عملية رئيسية من اجل وجود سليم للخلية.<br />
<br />
صورة1 (قوموا بالوقف على الصورة بالفأرة من أجل اظهار الشرح)<br />
[[Image:600px-Electron_transport_chain_cytochrome_c.jpg]]<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المبنى الجزيئي </div> ==<br />
<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> الوظيفة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> وراثة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> أمراض </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> ورقة عمل للطالب </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المصادر </div> ==</div>Fatima M Hameedhttps://proteopedia.org/index.php?title=Cytochrome_C_(arabic)&diff=3554768Cytochrome C (arabic)2022-05-01T06:03:19Z<p>Fatima M Hameed: </p>
<hr />
<div>==<center>'''سيتوكروم سي البشري '''</center>==<br />
<p dir='rtl'><br />
<br />
.سيتوكروم سي عبارة عن زلال صغير (الوزن الجزيئي حوالي 1200 دالتون ) وهو بروتين محفوظ للغاية عبر مجموعة من الأنواع ، موجود في النباتات والحيوانات والعديد من الكائنات أحادية الخلية<br />
<br />
يرتبط هذا البروتين بمجموعة [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D9%87%D9%8A%D9%85 هيم] وبمركزها توجد ذرة حديد، وهو بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات وبعملية الاستموات (موت الخلايا المبرمج)<br />
</p><br />
<StructureSection load='1J3S' size='340' side='left' caption=' سيتوكروم سي البشري (PDB code [[1j3s]])' scene='89/898985/Cytochrome_c_basic/19'><br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> مقدمة </div> ==<br />
<br />
سيتوكروم سي عبارة عن بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات، والتي هي العملية الأخيرة في عملية <br />
[https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D9%86%D9%81%D8%B3_%D8%AE%D9%84%D9%88%D9%8A التنفس الخلوي]<br />
. عملية التنفس الخلوي تقسم الى 3 أقسام مركزية: [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D8%AD%D9%84%D9%84_%D8%A7%D9%84%D8%AC%D9%84%D9%88%D9%83%D9%88%D8%B2 جليكوليزا ] (التي تحدث في السيتوبلازما)، [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AF%D9%88%D8%B1%D8%A9_%D8%AD%D9%85%D8%B6_%D8%A7%D9%84%D8%B3%D8%AA%D8%B1%D9%8A%D9%83 دورة كريبس] (تحدث في المساحة الداخلية للميتوكوندريا) وسلسلة نقل الالكترونات التي تحدث داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. <br />
<br />
.بنقل الالكترونات لجزيئات أخرى ملامسة لها، وهكذا يتم تشكيل سلسلة من البروتينات حاملة الإلكترونات FADH2 و NADH في سلسلة نقل الالكترونات تقوم الجزيئات المختزلة بدورة كريبس مثل<br />
.يتم استيعاب الإلكترونات في نهاية الأمر بواسطة الأكسجين ويؤدي هذا الاتحاد الى انتاج الماء<br />
نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة ، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا<br />
بواسطة منحدر التركيز الناتج في أيونات الهيدروجين يتم دفع عمل البروتين ATP سنتاز من أجل انتاج ATP. ATP هو جزيء غنيّ بالطّاقة، يحتوي على مجموعة من الأدينوساين وثلاث مجموعات من الفوسفور المرتبطة به. يؤدّي التحلّل المائيّ لمجموعة الفوسفور الثالثة إلى إطلاق طاقة تسمح للجسم بتنشيط العديد من الإنزيمات والعمليات الموجودة فيه. يقوم الجسم بإنتاج الATP في الميتوكوندريا في جميع الأوقات وذلك من الاجل الحفاظ على نسبة عالية من الATP داخل الخلية وبالتالي فان نقل الالكترونات وإنتاج منحدر تراكيز لأيونات الهيدروجين تعتبر عملية رئيسية من اجل وجود سليم للخلية.<br />
<br />
صورة1 (قوموا بالوقف على الصورة بالفأرة من أجل اظهار الشرح)<br />
[[Image:Example.jpg]]<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المبنى الجزيئي </div> ==<br />
<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> الوظيفة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> وراثة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> أمراض </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> ورقة عمل للطالب </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المصادر </div> ==</div>Fatima M Hameedhttps://proteopedia.org/index.php?title=Cytochrome_C_(arabic)&diff=3554759Cytochrome C (arabic)2022-05-01T00:41:43Z<p>Fatima M Hameed: </p>
<hr />
<div>==<center>'''سيتوكروم سي البشري '''</center>==<br />
<p dir='rtl'><br />
<br />
.سيتوكروم سي عبارة عن زلال صغير (الوزن الجزيئي حوالي 1200 دالتون ) وهو بروتين محفوظ للغاية عبر مجموعة من الأنواع ، موجود في النباتات والحيوانات والعديد من الكائنات أحادية الخلية<br />
<br />
يرتبط هذا البروتين بمجموعة [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D9%87%D9%8A%D9%85 هيم] وبمركزها توجد ذرة حديد، وهو بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات وبعملية الاستموات (موت الخلايا المبرمج)<br />
</p><br />
<StructureSection load='1J3S' size='340' side='left' caption=' سيتوكروم سي البشري (PDB code [[1j3s]])' scene='89/898985/Cytochrome_c_basic/19'><br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> مقدمة </div> ==<br />
<br />
سيتوكروم سي عبارة عن بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات، والتي هي العملية الأخيرة في عملية <br />
[https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D9%86%D9%81%D8%B3_%D8%AE%D9%84%D9%88%D9%8A التنفس الخلوي]<br />
. عملية التنفس الخلوي تقسم الى 3 أقسام مركزية: [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D8%AD%D9%84%D9%84_%D8%A7%D9%84%D8%AC%D9%84%D9%88%D9%83%D9%88%D8%B2 جليكوليزا ] (التي تحدث في السيتوبلازما)، [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AF%D9%88%D8%B1%D8%A9_%D8%AD%D9%85%D8%B6_%D8%A7%D9%84%D8%B3%D8%AA%D8%B1%D9%8A%D9%83 دورة كريبس] (تحدث في المساحة الداخلية للميتوكوندريا) وسلسلة نقل الالكترونات التي تحدث داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. <br />
<br />
.بنقل الالكترونات لجزيئات أخرى ملامسة لها، وهكذا يتم تشكيل سلسلة من البروتينات حاملة الإلكترونات FADH2 و NADH في سلسلة نقل الالكترونات تقوم الجزيئات المختزلة بدورة كريبس مثل<br />
.يتم استيعاب الإلكترونات في نهاية الأمر بواسطة الأكسجين ويؤدي هذا الاتحاد الى انتاج الماء<br />
نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة ، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا<br />
بواسطة منحدر التركيز الناتج في أيونات الهيدروجين يتم دفع عمل البروتين ATP سنتاز من أجل انتاج ATP. ATP هو جزيء غنيّ بالطّاقة، يحتوي على مجموعة من الأدينوساين وثلاث مجموعات من الفوسفور المرتبطة به. يؤدّي التحلّل المائيّ لمجموعة الفوسفور الثالثة إلى إطلاق طاقة تسمح للجسم بتنشيط العديد من الإنزيمات والعمليات الموجودة فيه. يقوم الجسم بإنتاج الATP في الميتوكوندريا في جميع الأوقات وذلك من الاجل الحفاظ على نسبة عالية من الATP داخل الخلية وبالتالي فان نقل الالكترونات وإنتاج منحدر تراكيز لأيونات الهيدروجين تعتبر عملية رئيسية من اجل وجود سليم للخلية.<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المبنى الجزيئي </div> ==<br />
<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> الوظيفة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> وراثة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> أمراض </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> ورقة عمل للطالب </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المصادر </div> ==</div>Fatima M Hameedhttps://proteopedia.org/index.php?title=Cytochrome_C_(arabic)&diff=3554758Cytochrome C (arabic)2022-05-01T00:38:59Z<p>Fatima M Hameed: </p>
<hr />
<div>==<center>'''سيتوكروم سي البشري '''</center>==<br />
<p dir='rtl'><br />
<br />
.سيتوكروم سي عبارة عن زلال صغير (الوزن الجزيئي حوالي 1200 دالتون ) وهو بروتين محفوظ للغاية عبر مجموعة من الأنواع ، موجود في النباتات والحيوانات والعديد من الكائنات أحادية الخلية<br />
<br />
يرتبط هذا البروتين بمجموعة [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D9%87%D9%8A%D9%85 هيم] وبمركزها توجد ذرة حديد، وهو بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات وبعملية الاستموات (موت الخلايا المبرمج)<br />
</p><br />
<StructureSection load='1J3S' size='340' side='left' caption=' سيتوكروم سي البشري (PDB code [[1j3s]])' scene='89/898985/Cytochrome_c_basic/19'><br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> مقدمة </div> ==<br />
<br />
سيتوكروم سي عبارة عن بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات، والتي هي العملية الأخيرة في عملية <br />
[https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D9%86%D9%81%D8%B3_%D8%AE%D9%84%D9%88%D9%8A التنفس الخلوي]<br />
. عملية التنفس الخلوي تقسم الى 3 أقسام مركزية: [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D8%AD%D9%84%D9%84_%D8%A7%D9%84%D8%AC%D9%84%D9%88%D9%83%D9%88%D8%B2 جليكوليزا ] (التي تحدث في السيتوبلازما)، [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AF%D9%88%D8%B1%D8%A9_%D8%AD%D9%85%D8%B6_%D8%A7%D9%84%D8%B3%D8%AA%D8%B1%D9%8A%D9%83 دورة كريبس] (تحدث في المساحة الداخلية للميتوكوندريا) وسلسلة نقل الالكترونات التي تحدث داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. <br />
<br />
.بنقل الالكترونات لجزيئات أخرى ملامسة لها، وهكذا يتم تشكيل سلسلة من البروتينات حاملة الإلكترونات FADH2 و NADH في سلسلة نقل الالكترونات تقوم الجزيئات المختزلة بدورة كريبس مثل .<br />
يتم استيعاب الإلكترونات في نهاية الأمر بواسطة الأكسجين ويؤدي هذا الاتحاد الى انتاج الماء.<br />
نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة ، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا.<br />
بواسطة منحدر التركيز الناتج في أيونات الهيدروجين يتم دفع عمل البروتين ATP سنتاز من أجل انتاج ATP. ATP هو جزيء غنيّ بالطّاقة، يحتوي على مجموعة من الأدينوساين وثلاث مجموعات من الفوسفور المرتبطة به. يؤدّي التحلّل المائيّ لمجموعة الفوسفور الثالثة إلى إطلاق طاقة تسمح للجسم بتنشيط العديد من الإنزيمات والعمليات الموجودة فيه. يقوم الجسم بإنتاج الATP في الميتوكوندريا في جميع الأوقات وذلك من الاجل الحفاظ على نسبة عالية من الATP داخل الخلية وبالتالي فان نقل الالكترونات وإنتاج منحدر تراكيز لأيونات الهيدروجين تعتبر عملية رئيسية من اجل وجود سليم للخلية.<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المبنى الجزيئي </div> ==<br />
<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> الوظيفة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> وراثة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> أمراض </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> ورقة عمل للطالب </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المصادر </div> ==</div>Fatima M Hameedhttps://proteopedia.org/index.php?title=Cytochrome_C_(arabic)&diff=3554757Cytochrome C (arabic)2022-05-01T00:37:57Z<p>Fatima M Hameed: </p>
<hr />
<div>==<center>'''سيتوكروم سي البشري '''</center>==<br />
<p dir='rtl'><br />
<br />
.سيتوكروم سي عبارة عن زلال صغير (الوزن الجزيئي حوالي 1200 دالتون ) وهو بروتين محفوظ للغاية عبر مجموعة من الأنواع ، موجود في النباتات والحيوانات والعديد من الكائنات أحادية الخلية<br />
<br />
يرتبط هذا البروتين بمجموعة [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D9%87%D9%8A%D9%85 هيم] وبمركزها توجد ذرة حديد، وهو بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات وبعملية الاستموات (موت الخلايا المبرمج)<br />
</p><br />
<StructureSection load='1J3S' size='340' side='left' caption=' سيتوكروم سي البشري (PDB code [[1j3s]])' scene='89/898985/Cytochrome_c_basic/19'><br />
<br />
سيتوكروم سي عبارة عن بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات، والتي هي العملية الأخيرة في عملية <br />
[https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D9%86%D9%81%D8%B3_%D8%AE%D9%84%D9%88%D9%8A التنفس الخلوي]<br />
. عملية التنفس الخلوي تقسم الى 3 أقسام مركزية: [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D8%AD%D9%84%D9%84_%D8%A7%D9%84%D8%AC%D9%84%D9%88%D9%83%D9%88%D8%B2 جليكوليزا ] (التي تحدث في السيتوبلازما)، [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AF%D9%88%D8%B1%D8%A9_%D8%AD%D9%85%D8%B6_%D8%A7%D9%84%D8%B3%D8%AA%D8%B1%D9%8A%D9%83 دورة كريبس] (تحدث في المساحة الداخلية للميتوكوندريا) وسلسلة نقل الالكترونات التي تحدث داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. <br />
<br />
.بنقل الالكترونات لجزيئات أخرى ملامسة لها، وهكذا يتم تشكيل سلسلة من البروتينات حاملة الإلكترونات FADH2 و NADH في سلسلة نقل الالكترونات تقوم الجزيئات المختزلة بدورة كريبس مثل .<br />
يتم استيعاب الإلكترونات في نهاية الأمر بواسطة الأكسجين ويؤدي هذا الاتحاد الى انتاج الماء.<br />
نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة ، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا.<br />
بواسطة منحدر التركيز الناتج في أيونات الهيدروجين يتم دفع عمل البروتين ATP سنتاز من أجل انتاج ATP. ATP هو جزيء غنيّ بالطّاقة، يحتوي على مجموعة من الأدينوساين وثلاث مجموعات من الفوسفور المرتبطة به. يؤدّي التحلّل المائيّ لمجموعة الفوسفور الثالثة إلى إطلاق طاقة تسمح للجسم بتنشيط العديد من الإنزيمات والعمليات الموجودة فيه. يقوم الجسم بإنتاج الATP في الميتوكوندريا في جميع الأوقات وذلك من الاجل الحفاظ على نسبة عالية من الATP داخل الخلية وبالتالي فان نقل الالكترونات وإنتاج منحدر تراكيز لأيونات الهيدروجين تعتبر عملية رئيسية من اجل وجود سليم للخلية.<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المبنى الجزيئي </div> ==<br />
<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> الوظيفة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> وراثة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> أمراض </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> ورقة عمل للطالب </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المصادر </div> ==</div>Fatima M Hameedhttps://proteopedia.org/index.php?title=Cytochrome_C_(arabic)&diff=3554756Cytochrome C (arabic)2022-05-01T00:36:57Z<p>Fatima M Hameed: </p>
<hr />
<div>==<center>'''سيتوكروم سي البشري '''</center>==<br />
<p dir='rtl'><br />
<br />
.سيتوكروم سي عبارة عن زلال صغير (الوزن الجزيئي حوالي 1200 دالتون ) وهو بروتين محفوظ للغاية عبر مجموعة من الأنواع ، موجود في النباتات والحيوانات والعديد من الكائنات أحادية الخلية<br />
<br />
يرتبط هذا البروتين بمجموعة [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D9%87%D9%8A%D9%85 هيم] وبمركزها توجد ذرة حديد، وهو بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات وبعملية الاستموات (موت الخلايا المبرمج)<br />
</p><br />
<StructureSection load='1J3S' size='340' side='left' caption=' سيتوكروم سي البشري (PDB code [[1j3s]])' scene='89/898985/Cytochrome_c_basic/19'><br />
==<div style="text-align: right;"> مقدمة </div> ==<br />
سيتوكروم سي عبارة عن بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات، والتي هي العملية الأخيرة في عملية <br />
[https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D9%86%D9%81%D8%B3_%D8%AE%D9%84%D9%88%D9%8A التنفس الخلوي]<br />
. عملية التنفس الخلوي تقسم الى 3 أقسام مركزية: [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D8%AD%D9%84%D9%84_%D8%A7%D9%84%D8%AC%D9%84%D9%88%D9%83%D9%88%D8%B2 جليكوليزا ] (التي تحدث في السيتوبلازما)، [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AF%D9%88%D8%B1%D8%A9_%D8%AD%D9%85%D8%B6_%D8%A7%D9%84%D8%B3%D8%AA%D8%B1%D9%8A%D9%83 دورة كريبس] (تحدث في المساحة الداخلية للميتوكوندريا) وسلسلة نقل الالكترونات التي تحدث داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. <br />
<br />
.بنقل الالكترونات لجزيئات أخرى ملامسة لها، وهكذا يتم تشكيل سلسلة من البروتينات حاملة الإلكترونات FADH2 و NADH في سلسلة نقل الالكترونات تقوم الجزيئات المختزلة بدورة كريبس مثل .<br />
يتم استيعاب الإلكترونات في نهاية الأمر بواسطة الأكسجين ويؤدي هذا الاتحاد الى انتاج الماء.<br />
نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة ، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا.<br />
بواسطة منحدر التركيز الناتج في أيونات الهيدروجين يتم دفع عمل البروتين ATP سنتاز من أجل انتاج ATP. ATP هو جزيء غنيّ بالطّاقة، يحتوي على مجموعة من الأدينوساين وثلاث مجموعات من الفوسفور المرتبطة به. يؤدّي التحلّل المائيّ لمجموعة الفوسفور الثالثة إلى إطلاق طاقة تسمح للجسم بتنشيط العديد من الإنزيمات والعمليات الموجودة فيه. يقوم الجسم بإنتاج الATP في الميتوكوندريا في جميع الأوقات وذلك من الاجل الحفاظ على نسبة عالية من الATP داخل الخلية وبالتالي فان نقل الالكترونات وإنتاج منحدر تراكيز لأيونات الهيدروجين تعتبر عملية رئيسية من اجل وجود سليم للخلية.<br />
<br><br />
<br><br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المبنى الجزيئي </div> ==<br />
<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> الوظيفة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> وراثة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> أمراض </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> ورقة عمل للطالب </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المصادر </div> ==</div>Fatima M Hameedhttps://proteopedia.org/index.php?title=Cytochrome_C_(arabic)&diff=3554574Cytochrome C (arabic)2022-04-30T15:16:31Z<p>Fatima M Hameed: </p>
<hr />
<div>==<center>'''سيتوكروم سي البشري '''</center>==<br />
<p dir='rtl'><br />
<br />
.سيتوكروم سي عبارة عن زلال صغير (الوزن الجزيئي حوالي 1200 دالتون ) وهو بروتين محفوظ للغاية عبر مجموعة من الأنواع ، موجود في النباتات والحيوانات والعديد من الكائنات أحادية الخلية<br />
<br />
يرتبط هذا البروتين بمجموعة [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D9%87%D9%8A%D9%85 هيم] وبمركزها توجد ذرة حديد، وهو بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات وبعملية الاستموات (موت الخلايا المبرمج)<br />
</p><br />
<StructureSection load='1J3S' size='340' side='left' caption=' سيتوكروم سي البشري (PDB code [[1j3s]])' scene='89/898985/Cytochrome_c_basic/19'><br />
==<div style="text-align: right;"> مقدمة </div> ==<br />
سيتوكروم سي عبارة عن بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات، والتي هي العملية الأخيرة في عملية <br />
[https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D9%86%D9%81%D8%B3_%D8%AE%D9%84%D9%88%D9%8A التنفس الخلوي]<br />
. عملية التنفس الخلوي تقسم الى 3 أقسام مركزية: [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D8%AD%D9%84%D9%84_%D8%A7%D9%84%D8%AC%D9%84%D9%88%D9%83%D9%88%D8%B2 جليكوليزا ] (التي تحدث في السيتوبلازما)، [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AF%D9%88%D8%B1%D8%A9_%D8%AD%D9%85%D8%B6_%D8%A7%D9%84%D8%B3%D8%AA%D8%B1%D9%8A%D9%83 دورة كريبس] (تحدث في المساحة الداخلية للميتوكوندريا) وسلسلة نقل الالكترونات التي تحدث داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. <br />
<br />
.بنقل الالكترونات لجزيئات أخرى ملامسة لها، وهكذا يتم تشكيل سلسلة من البروتينات حاملة الإلكترونات FADH2 و NADH في سلسلة نقل الالكترونات تقوم الجزيئات المختزلة بدورة كريبس مثل .<br />
يتم استيعاب الإلكترونات في نهاية الأمر بواسطة الأكسجين ويؤدي هذا الاتحاد الى انتاج الماء.<br />
نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة ، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا.<br />
بواسطة منحدر التركيز الناتج في أيونات الهيدروجين يتم دفع عمل البروتين ATP سنتاز من أجل انتاج ATP. ATP هو جزيء غنيّ بالطّاقة، يحتوي على مجموعة من الأدينوساين وثلاث مجموعات من الفوسفور المرتبطة به. يؤدّي التحلّل المائيّ لمجموعة الفوسفور الثالثة إلى إطلاق طاقة تسمح للجسم بتنشيط العديد من الإنزيمات والعمليات الموجودة فيه. يقوم الجسم بإنتاج الATP في الميتوكوندريا في جميع الأوقات وذلك من الاجل الحفاظ على نسبة عالية من الATP داخل الخلية وبالتالي فان نقل الالكترونات وإنتاج منحدر تراكيز لأيونات الهيدروجين تعتبر عملية رئيسية من اجل وجود سليم للخلية.<br />
<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المبنى الجزيئي </div> ==<br />
<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> الوظيفة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> وراثة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> أمراض </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> ورقة عمل للطالب </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المصادر </div> ==</div>Fatima M Hameedhttps://proteopedia.org/index.php?title=Cytochrome_C_(arabic)&diff=3554573Cytochrome C (arabic)2022-04-30T15:16:06Z<p>Fatima M Hameed: </p>
<hr />
<div>==<center>'''سيتوكروم سي البشري '''</center>==<br />
<p dir='rtl'><br />
<br />
.سيتوكروم سي عبارة عن زلال صغير (الوزن الجزيئي حوالي 1200 دالتون ) وهو بروتين محفوظ للغاية عبر مجموعة من الأنواع ، موجود في النباتات والحيوانات والعديد من الكائنات أحادية الخلية<br />
<br />
يرتبط هذا البروتين بمجموعة [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D9%87%D9%8A%D9%85 هيم] وبمركزها توجد ذرة حديد، وهو بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات وبعملية الاستموات (موت الخلايا المبرمج)<br />
</p><br />
<StructureSection load='1J3S' size='340' side='left' caption=' سيتوكروم سي البشري (PDB code [[1j3s]])' scene='89/898985/Cytochrome_c_basic/19'><br />
==<div style="text-align: right;"> مقدمة </div> ==<br />
سيتوكروم سي عبارة عن بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات، والتي هي العملية الأخيرة في عملية <br />
[https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D9%86%D9%81%D8%B3_%D8%AE%D9%84%D9%88%D9%8A التنفس الخلوي]<br />
. عملية التنفس الخلوي تقسم الى 3 أقسام مركزية: [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D8%AD%D9%84%D9%84_%D8%A7%D9%84%D8%AC%D9%84%D9%88%D9%83%D9%88%D8%B2 جليكوليزا ] (التي تحدث في السيتوبلازما)، [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AF%D9%88%D8%B1%D8%A9_%D8%AD%D9%85%D8%B6_%D8%A7%D9%84%D8%B3%D8%AA%D8%B1%D9%8A%D9%83 دورة كريبس] (تحدث في المساحة الداخلية للميتوكوندريا) وسلسلة نقل الالكترونات التي تحدث داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. <br />
<br />
.بنقل الالكترونات لجزيئات أخرى ملامسة لها، وهكذا يتم تشكيل سلسلة من البروتينات حاملة الإلكترونات FADH2 و NADH في سلسلة نقل الالكترونات تقوم الجزيئات المختزلة بدورة كريبس مثل .<br />
يتم استيعاب الإلكترونات في نهاية الأمر بواسطة الأكسجين ويؤدي هذا الاتحاد الى انتاج الماء.<br />
نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة ، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا.<br />
بواسطة منحدر التركيز الناتج في أيونات الهيدروجين يتم دفع عمل البروتين ATP سنتاز من أجل انتاج ATP. ATP هو جزيء غنيّ بالطّاقة، يحتوي على مجموعة من الأدينوساين وثلاث مجموعات من الفوسفور المرتبطة به. يؤدّي التحلّل المائيّ لمجموعة الفوسفور الثالثة إلى إطلاق طاقة تسمح للجسم بتنشيط العديد من الإنزيمات والعمليات الموجودة فيه. يقوم الجسم بإنتاج الATP في الميتوكوندريا في جميع الأوقات وذلك من الاجل الحفاظ على نسبة عالية من الATP داخل الخلية وبالتالي فان نقل الالكترونات وإنتاج منحدر تراكيز لأيونات الهيدروجين تعتبر عملية رئيسية من اجل وجود سليم للخلية.<br />
<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المبنى الجزيئي </div> ==<br />
<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> الوظيفة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> وراثة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> أمراض </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> ورقة عمل للطالب </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المصادر </div> ==</div>Fatima M Hameedhttps://proteopedia.org/index.php?title=Cytochrome_C_(arabic)&diff=3554571Cytochrome C (arabic)2022-04-30T15:11:31Z<p>Fatima M Hameed: </p>
<hr />
<div>==<center>'''سيتوكروم سي البشري '''</center>==<br />
<p dir='rtl'><br />
<br />
.سيتوكروم سي عبارة عن زلال صغير (الوزن الجزيئي حوالي 1200 دالتون ) وهو بروتين محفوظ للغاية عبر مجموعة من الأنواع ، موجود في النباتات والحيوانات والعديد من الكائنات أحادية الخلية<br />
<br />
يرتبط هذا البروتين بمجموعة [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D9%87%D9%8A%D9%85 هيم] وبمركزها توجد ذرة حديد، وهو بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات وبعملية الاستموات (موت الخلايا المبرمج)<br />
</p><br />
<StructureSection load='1J3S' size='340' side='left' caption=' سيتوكروم سي البشري (PDB code [[1j3s]])' scene='89/898985/Cytochrome_c_basic/19'><br />
==<div style="text-align: right;"> مقدمة </div> ==<br />
سيتوكروم سي عبارة عن بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات، والتي هي العملية الأخيرة في عملية <br />
[https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D9%86%D9%81%D8%B3_%D8%AE%D9%84%D9%88%D9%8A التنفس الخلوي]<br />
. عملية التنفس الخلوي تقسم الى 3 أقسام مركزية: [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D8%AD%D9%84%D9%84_%D8%A7%D9%84%D8%AC%D9%84%D9%88%D9%83%D9%88%D8%B2 جليكوليزا ] (التي تحدث في السيتوبلازما)، [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AF%D9%88%D8%B1%D8%A9_%D8%AD%D9%85%D8%B6_%D8%A7%D9%84%D8%B3%D8%AA%D8%B1%D9%8A%D9%83 دورة كريبس] (تحدث في المساحة الداخلية للميتوكوندريا) وسلسلة نقل الالكترونات التي تحدث داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. <br />
<br />
في سلسلة نقل الالكترونات تقوم الجزيئات المختزلة بدورة كريبس مثل<br />
FADH2 و NADH<br />
بنقل الالكترونات لجزيئات أخرى ملامسة لها، وهكذا يتم تشكيل سلسلة من البروتينات حاملة الإلكترونات. يتم استيعاب الإلكترونات في نهاية الأمر بواسطة الأكسجين ويؤدي هذا الاتحاد الى انتاج الماء.<br />
نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة ، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا.<br />
بواسطة منحدر التركيز الناتج في أيونات الهيدروجين يتم دفع عمل البروتين ATP سنتاز من أجل انتاج ATP. ATP هو جزيء غنيّ بالطّاقة، يحتوي على مجموعة من الأدينوساين وثلاث مجموعات من الفوسفور المرتبطة به. يؤدّي التحلّل المائيّ لمجموعة الفوسفور الثالثة إلى إطلاق طاقة تسمح للجسم بتنشيط العديد من الإنزيمات والعمليات الموجودة فيه. يقوم الجسم بإنتاج الATP في الميتوكوندريا في جميع الأوقات وذلك من الاجل الحفاظ على نسبة عالية من الATP داخل الخلية وبالتالي فان نقل الالكترونات وإنتاج منحدر تراكيز لأيونات الهيدروجين تعتبر عملية رئيسية من اجل وجود سليم للخلية.<br />
<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المبنى الجزيئي </div> ==<br />
<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> الوظيفة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> وراثة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> أمراض </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> ورقة عمل للطالب </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المصادر </div> ==</div>Fatima M Hameedhttps://proteopedia.org/index.php?title=Cytochrome_C_(arabic)&diff=3554570Cytochrome C (arabic)2022-04-30T15:09:51Z<p>Fatima M Hameed: </p>
<hr />
<div>==<center>'''سيتوكروم سي البشري '''</center>==<br />
<p dir='rtl'><br />
<br />
.سيتوكروم سي عبارة عن زلال صغير (الوزن الجزيئي حوالي 1200 دالتون ) وهو بروتين محفوظ للغاية عبر مجموعة من الأنواع ، موجود في النباتات والحيوانات والعديد من الكائنات أحادية الخلية<br />
<br />
يرتبط هذا البروتين بمجموعة [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D9%87%D9%8A%D9%85 هيم] وبمركزها توجد ذرة حديد، وهو بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات وبعملية الاستموات (موت الخلايا المبرمج)<br />
</p><br />
<StructureSection load='1J3S' size='340' side='left' caption=' سيتوكروم سي البشري (PDB code [[1j3s]])' scene='89/898985/Cytochrome_c_basic/19'><br />
==<div style="text-align: right;"> مقدمة </div> ==<br />
سيتوكروم سي عبارة عن بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات، والتي هي العملية الأخيرة في عملية <br />
[https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D9%86%D9%81%D8%B3_%D8%AE%D9%84%D9%88%D9%8A التنفس الخلوي]<br />
. عملية التنفس الخلوي تقسم الى 3 أقسام مركزية: [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D8%AD%D9%84%D9%84_%D8%A7%D9%84%D8%AC%D9%84%D9%88%D9%83%D9%88%D8%B2 جليكوليزا ] (التي تحدث في السيتوبلازما)، [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AF%D9%88%D8%B1%D8%A9_%D8%AD%D9%85%D8%B6_%D8%A7%D9%84%D8%B3%D8%AA%D8%B1%D9%8A%D9%83 دورة كريبس] (تحدث في المساحة الداخلية للميتوكوندريا) وسلسلة نقل الالكترونات التي تحدث داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. <br />
<br />
في سلسلة نقل الالكترونات تقوم الجزيئات المختزلة بدورة كريبس مثل ( FADH2 و NADH)بنقل الالكترونات لجزيئات أخرى ملامسة لها، وهكذا يتم تشكيل سلسلة من البروتينات حاملة الإلكترونات. يتم استيعاب الإلكترونات في نهاية الأمر بواسطة الأكسجين ويؤدي هذا الاتحاد الى انتاج الماء.<br />
نتيجة لحركة الإلكترونات بين الناقلات المختلفة ، يتم نقل ايونات الهيدروجين من المساحة الداخلية للميتوكوندريا الى المساحة بين غشائي الميتوكوندريا.<br />
بواسطة منحدر التركيز الناتج في أيونات الهيدروجين يتم دفع عمل البروتين ATP سنتاز من أجل انتاج ATP. ATP هو جزيء غنيّ بالطّاقة، يحتوي على مجموعة من الأدينوساين وثلاث مجموعات من الفوسفور المرتبطة به. يؤدّي التحلّل المائيّ لمجموعة الفوسفور الثالثة إلى إطلاق طاقة تسمح للجسم بتنشيط العديد من الإنزيمات والعمليات الموجودة فيه. يقوم الجسم بإنتاج الATP في الميتوكوندريا في جميع الأوقات وذلك من الاجل الحفاظ على نسبة عالية من الATP داخل الخلية وبالتالي فان نقل الالكترونات وإنتاج منحدر تراكيز لأيونات الهيدروجين تعتبر عملية رئيسية من اجل وجود سليم للخلية.<br />
<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المبنى الجزيئي </div> ==<br />
<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> الوظيفة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> وراثة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> أمراض </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> ورقة عمل للطالب </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المصادر </div> ==</div>Fatima M Hameedhttps://proteopedia.org/index.php?title=Cytochrome_C_(arabic)&diff=3554568Cytochrome C (arabic)2022-04-30T15:06:43Z<p>Fatima M Hameed: </p>
<hr />
<div>==<center>'''سيتوكروم سي البشري '''</center>==<br />
<p dir='rtl'><br />
<br />
.سيتوكروم سي عبارة عن زلال صغير (الوزن الجزيئي حوالي 1200 دالتون ) وهو بروتين محفوظ للغاية عبر مجموعة من الأنواع ، موجود في النباتات والحيوانات والعديد من الكائنات أحادية الخلية<br />
<br />
يرتبط هذا البروتين بمجموعة [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D9%87%D9%8A%D9%85 هيم] وبمركزها توجد ذرة حديد، وهو بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات وبعملية الاستموات (موت الخلايا المبرمج)<br />
</p><br />
<StructureSection load='1J3S' size='340' side='left' caption=' سيتوكروم سي البشري (PDB code [[1j3s]])' scene='89/898985/Cytochrome_c_basic/19'><br />
==<div style="text-align: right;"> مقدمة </div> ==<br />
سيتوكروم سي عبارة عن بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات، والتي هي العملية الأخيرة في عملية <br />
[https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D9%86%D9%81%D8%B3_%D8%AE%D9%84%D9%88%D9%8A التنفس الخلوي]<br />
. عملية التنفس الخلوي تقسم الى 3 أقسام مركزية: [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D8%AD%D9%84%D9%84_%D8%A7%D9%84%D8%AC%D9%84%D9%88%D9%83%D9%88%D8%B2 جليكوليزا ] (التي تحدث في السيتوبلازما)، [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AF%D9%88%D8%B1%D8%A9_%D8%AD%D9%85%D8%B6_%D8%A7%D9%84%D8%B3%D8%AA%D8%B1%D9%8A%D9%83 دورة كريبس] (تحدث في المساحة الداخلية للميتوكوندريا) وسلسلة نقل الالكترونات التي تحدث داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. <br />
<br><br />
<br><br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المبنى الجزيئي </div> ==<br />
<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> الوظيفة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> وراثة </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> أمراض </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> ورقة عمل للطالب </div> ==<br />
<br />
<br />
==<div style="text-align: right;"> المصادر </div> ==</div>Fatima M Hameedhttps://proteopedia.org/index.php?title=Cytochrome_C_(arabic)&diff=3554567Cytochrome C (arabic)2022-04-30T15:05:52Z<p>Fatima M Hameed: </p>
<hr />
<div>==<center>'''سيتوكروم سي البشري '''</center>==<br />
<p dir='rtl'><br />
<br />
.سيتوكروم سي عبارة عن زلال صغير (الوزن الجزيئي حوالي 1200 دالتون ) وهو بروتين محفوظ للغاية عبر مجموعة من الأنواع ، موجود في النباتات والحيوانات والعديد من الكائنات أحادية الخلية<br />
<br />
يرتبط هذا البروتين بمجموعة [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D9%87%D9%8A%D9%85 هيم] وبمركزها توجد ذرة حديد، وهو بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات وبعملية الاستموات (موت الخلايا المبرمج)<br />
</p><br />
<StructureSection load='1J3S' size='340' side='left' caption=' سيتوكروم سي البشري (PDB code [[1j3s]])' scene='89/898985/Cytochrome_c_basic/19'><br />
==<div style="text-align: right;"> مقدمة </div> ==<br />
سيتوكروم سي عبارة عن بروتين رئيسي في سلسلة نقل الالكترونات، والتي هي العملية الأخيرة في عملية <br />
[https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D9%86%D9%81%D8%B3_%D8%AE%D9%84%D9%88%D9%8A التنفس الخلوي]<br />
. عملية التنفس الخلوي تقسم الى 3 أقسام مركزية: [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AA%D8%AD%D9%84%D9%84_%D8%A7%D9%84%D8%AC%D9%84%D9%88%D9%83%D9%88%D8%B2 جليكوليزا ] (التي تحدث في السيتوبلازما)، [https://ar.wikipedia.org/wiki/%D8%AF%D9%88%D8%B1%D8%A9_%D8%AD%D9%85%D8%B6_%D8%A7%D9%84%D8%B3%D8%AA%D8%B1%D9%8A%D9%83 دورة كريبس] (تحدث في المساحة الداخلية للميتوكوندريا) وسلسلة نقل الالكترونات التي تحدث داخل الغشاء الداخلي للميتوكوندريا. <br />
<br><br />
<br></div>Fatima M Hameedhttps://proteopedia.org/index.php?title=File:Consurf_key_small.gif&diff=3554566File:Consurf key small.gif2022-04-30T14:59:36Z<p>Fatima M Hameed: uploaded a new version of "Image:Consurf key small.gif"</p>
<hr />
<div>Color key for the ConSurf server, consurf.tau.ac.il</div>Fatima M Hameed