Proteopedia - User contributions [en]

Sandbox Erice 14

2010-06-06T12:47:06Z

Fred Vellieux:

[[Image:3cl0.png]]

{{STRUCTURE_3cl0 | PDB=3cl0 | SCENE= }}

'''Influenza neuraminidase''' is a glycoprotein in the influenza virus membrane. Before an infected cell can release the virus into its surroundings to infect new cells, neuraminidase must cleave sialic acid from both virus and cellular glycoproteins. Neuraminidase is a homotetramer -- here we will examine only one monomer.

== Exploring the structure ==

Because of its important role in virus infectivity, several anti-viral drugs have been designed to target neuraminidase, including oseltamivir (Tamiflu) and zanamivir (Relenza). Oseltamavir binding to neuraminidase moves glutamate 276 towards histidine 274, making more room for oseltamavir to bind tightly (PDB entry 2hu4). But, in a common mutant (H274Y), a larger tyrosine replaces the smaller histidine 274, preventing glutamate 276 from moving to make room for oseltamavir binding, resulting in weaker drug binding and thus resistance (PDB entry 3cl0). Luckily the H274Y neuraminidase mutant is still susceptible to zanamivir, which is smaller than oseltamavir.


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Sandbox Erice 14

2010-06-06T11:50:14Z

Fred Vellieux: New page: {{STRUCTURE_3cl0 | PDB=3cl0 | SCENE= }} '''Influenza neuraminidase''' is a glycoprotein in the influenza virus membrane. Before an infected cell can release the virus into its surroun...

{{STRUCTURE_3cl0 | PDB=3cl0 | SCENE= }}

'''Influenza neuraminidase''' is a glycoprotein in the influenza virus membrane. Before an infected cell can release the virus into its surroundings to infect new cells, neuraminidase must cleave sialic acid from both virus and cellular glycoproteins. Neuraminidase is a homotetramer -- here we will examine only one monomer.

== Exploring the structure ==

Because of its important role in virus infectivity, several anti-viral drugs have been designed to target neuraminidase, including oseltamivir (Tamiflu) and zanamivir (Relenza). Oseltamavir binding to neuraminidase moves glutamate 276 towards histidine 274, making more room for oseltamavir to bind tightly (PDB entry 2hu4). But, in a common mutant (H274Y), a larger tyrosine replaces the smaller histidine 274, preventing glutamate 276 from moving to make room for oseltamavir binding, resulting in weaker drug binding and thus resistance (PDB entry 3cl0). Luckily the H274Y neuraminidase mutant is still susceptible to zanamivir, which is smaller than oseltamavir.


{{ABSTRACT_PUBMED_18480754}}

Aricept Complexed with Acetylcholinesterase (Turkish)

2010-02-03T17:34:34Z

Fred Vellieux:

[[Image:E2020_interactins_in_AChE_gorge.jpg|left|250px]] 

{{STRUCTURE_1eve| PDB=1eve | SCENE=Main_Page/E2020_in_ache_spinning/1 }}

'''Asetilkolinesteraz ile kompleks oluşturan, anti-Alzheimer ilacı, Aricept’in 3 boyutlu yapısı '''
(Ayrıca bakınız: [[AChE bivalent inhibitors (Part II)]] )
==Önbilgi==
Bazı kolinesteraz inhibitörleri, Alzheimer hastalığının semptomik tedavisinde veya ileri klinik çalışmalarda kullanılmaktadır. '''Aricept''' olarak pazarlanan, N-benzilpiperidin tabanlı [[Acetylcholinesterase |asetilkolinesteraz]] (AChE) inhibitörleri ailesinin bir üyesi olan '''E2020''', Japonya’da bulunan Eisai şirketi tarafından geliştirilmekte, sentezlenmekte ve değerlendirilmektedir. Bu inhibitörler, ''Torpedo californica'' AChE (''Tc''AChE) ([[1ea5]]) ‘nin 3 boyutlu yapısının izahından önce, QSAR çalışmaları temel alınarak dizayn edilmiştir. Bu inhibitör hayvan modellerinde kolinerjik hipofonksiyonun performansını anlamlı şekilde artırmaktadır ve AChE için yüksek afiniteye sahiptir; nanomolar düzeyde, elektrik yılan balığı ve fare AChElerinin her ikisine bağlanmaktadır.

{{Clear}}
<applet load='1eve.pdb' size='500' frame='true' align='right' scene='Main_Page/E2020_in_ache_spinning/1' />

==Bulgular==
E2020-''Tc''AChE kompleksinin X-ray yapısı, E2020’nin aktif bölge oluğu boyunca, aktif bölgenin aniyonik alt biriminden (<scene name='1eve/E2020_close_up_with_84lbld/7'>W84</scene>), alttaki periferal aniyonik bölgeye (<scene name='1eve/E2020_close_up_with_84_279lbld/5'>W279</scene>'un yanı) uzanan, tepede ,korunmuş aromatik asit rezidüleri ile aromatik kümelenme etkileşimleri üzerinden <scene name='1eve/E2020_close_up_with_84_279/13'>benzersiz bir uyuma</scene> sahip olduğunu gösterir. E2020, direkt olarak katalitik triad veya 'oksianyon boşluğu' ile etkileşime girmezken, ancak <scene name='1eve/E20_interactionshown/8'>indirekt olarak </scene>solvent moleküller üzerinden interaksiyona girer.

==Sonuçlar==
X-ray yapısı; deney sonucu elde edilen bilgilere göre, Bütürilkolinesteraz (BChE)’a karşı AChE için yüksek seçicilik ve afiniteye sahip bir ilaç üretmek için, E2020 tasarımının, AChE’nin aktif bölgesindeki bazı önemli özelliklerinden yararlandığını gösterir. Ayrıca oluk içindeki boşlukların, gelişmiş farmakolojik profillerde ilaçlar üretebilmek için, E2020 tarafından işgal edilmediklerini ve E2020'nin potansiyel modifikasyonları için bölge sağlayabildiğinide tanımlar.Ayrıca oluk içindeki boşlukların E2020 tarafından işgal edilmediklerini ve gelişmiş farmakolojik profillerde ilaçların üretimi için E2020'nin potansiyel modifikasyonlarına uygun bölge sağlayabildiğinide tanımlar.

==Bu Yapı Hakkında==
1EVE, NAG ve E20 [http://en.wikipedia.org/wiki/ligands ligandlarına] sahip dizisi [http://en.wikipedia.org/wiki/Torpedo_californica Torpedo californica]’ya ait bir [http://en.wikipedia.org/wiki/Protein protein] yapısıdır. Aktif olarak [[Acetylcholinesterase|Asetilkolinesteraz]], EC numarası [http://www.brenda-enzymes.info/php/result_flat.php4?ecno=3.1.1.7 3.1.1.7]dir. Tam kristalografik bilgi [http://ispc.weizmann.ac.il/oca-bin/ocashort?id=1EVE OCA]‘dan edinilebilir.

==Kaynak==
Structure of acetylcholinesterase complexed with E2020 (Aricept): implications for the design of new anti-Alzheimer drugs., Kryger G, Silman I, Sussman JL, Structure. 1999 Mar 15;7(3):297-307. PMID:[http://ispc.weizmann.ac.il//pmbin/getpm?pmid=10368299 10368299]

See [[1eve (Chinese)]], [[1eve (French)]], [[1eve (Italian)]], [[1eve (Arabic)]], [[1eve (Russian)]], [[1eve (Spanish)]], & [[1eve]] - in English.
[[Category: Acetylcholinesterase]]
[[Category: Single protein]]
[[Category: Torpedo californica]]
[[Category: Kryger, G.]]
[[Category: Silman, I.]]
[[Category: Sussman, J.L.]]
[[Category: E20]]
[[Category: NAG]]
[[Category: alpha/beta hydrolase]]
[[Category: alzheimer's disease]]
[[Category: catalytic triad]]
[[Category: drug]]
[[Category: glycosylated protein]]
[[Category: neurotransmitter cleavage]]
[[Category: serine hydrolase]]

Aricept Complexed with Acetylcholinesterase (Spanish)

2010-02-03T17:33:10Z

Fred Vellieux:

[[Image:E2020_interactins_in_AChE_gorge.jpg|left|250px]] 

{{STRUCTURE_1eve| PDB=1eve | SCENE=Main_Page/E2020_in_ache_spinning/1 }}

'''Estructura tridimensional de la droga contra la enfermedad de Alzheimer, Aricept, complejada con acetilcolinesterasa'''
(vea tambien [[AChE bivalent inhibitors (Part II)|Inhibidores bivalentes de AChE, Parte II]])

==Antecedentes==
Varios inhibidores de la colinesterasa se utilizan para el tratamiento sintomático de la enfermedad de Alzheimer o se encuentran en estado avanzado de ensayo clínico. '''E2020''', comercializado como '''Aricept''', es miembro de una familia numerosa de la N-benzylpiperidine basada en inhibidores de la [[acetylcholinesterase|acetilcholinesterasa]] (AChE), desarrollado, sintetizado y evaluado por la Compañía Eisai en el Japón. Estos inhibidores fueron diseñados sobre la base de estudios QSAR, antes de conocerse la estructura 3D de la AChE de ''Torpedo californica'' (''Tc''AChE) ([[1ea5]]). Con este inhibidor se mejora significativamente el rendimiento en animales de hipofunción colinérgica y tiene una alta afinidad por la AChE, vinculante para anguila eléctrica y el ratón en el rango nanomolar de AChE.

{{Clear}}
<applet load='1eve.pdb' size='500' frame='true' align='right' scene='Main_Page/E2020_in_ache_spinning/1' />

==Resultados==
La estructura de rayos X del complejo E2020-''Tc''AChE pone de manifiesto que el E2020 tiene una orientación <scene name='1eve/E2020_close_up_with_84_279/13'>unica</scene> a lo largo de la garganta del sitio activo, extendiéndose desde el sub-sitio anionico (<scene name='1eve/E2020_close_up_with_84lbld/7'>W84</scene>) del sitio activo, abajo, hacia el sitio periférico anionico (<scene name='1eve/E2020_close_up_with_84_279lbld/5'>cerca W279</scene>), arriba, a través de interacciones superpuestas con residuos aromáticos conservados. E2020, sin embargo, no interactúa directamente con la triada catalítica ni con el 'hueco oxyanion', solamente interactua <scene name='1eve/E20_interactionshown/8'>en forma indirecta</scene> a través de moléculas solventes.

==Conclusiones==
La estructura de Rayos X demostró posteriormente que el diseño de E2020 aprovecho varias caracteristicas importantes de la garganta del sitio activo de AChE, para producir una droga con alta afinidad y alta selectividad, comparada con butyrylcholinesterase (BChE). Asimismo, delimita los huecos dentro de la garganta que no están ocupados por E2020 y podría proporcionar sitios potenciales para la modificación de E2020 para producir drogas con mejores capacidades farmacológicas.

==Acerca de esta Estructura==
1EVE es una estructura de una [http://en.wikipedia.org/wiki/Protein Única proteína] de secuencia de [http://en.wikipedia.org/wiki/Torpedo_californica ''Torpedo californica''] con NAG y E20 como [http://en.wikipedia.org/wiki/ligands ligandos]. Es activa como [[Acetylcholinesterase | Acetilcolinesterasa]], con el número EC [http://www.brenda-enzymes.info/php/result_flat.php4?ecno=3.1.1.7 3.1.1.7]. Información cristalográfica completa esta disponible en [http://ispc.weizmann.ac.il/oca-bin/ocashort?id=1EVE OCA].

==Referencias==
<ref group=xtra>PMID:10368299</ref><references group=xtra/>
* Vea también [[1eve]] - in English, [[1eve (Chinese)]], [[1eve (French)]], [[1eve (Italian)]], [[1eve (Arabic)]], [[1eve (Russian)]], & [[1eve (Turkish)]].

[[Category: Acetylcholinesterase]]
[[Category: Single protein]]
[[Category: Torpedo californica]]
[[Category: Kryger, G.]]
[[Category: Silman, I.]]
[[Category: Sussman, J.L.]]
[[Category: E20]]
[[Category: NAG]]
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Aricept Complexed with Acetylcholinesterase (Russian)

2010-02-03T17:21:56Z

Fred Vellieux:

[[Image:E2020_interactins_in_AChE_gorge.jpg|left|250px]] 

{{STRUCTURE_1eve| PDB=1eve | SCENE=Main_Page/E2020_in_ache_spinning/1 }}

'''Трёхмерная структура Арицепта, лекарства против болезни Алцгеймера, в комплексе с ацетилхолинэстеразой'''
(см. также [[AChE bivalent inhibitors (Part II)|Бивалентные ингибиторы ацетилхолинэстеразы (Часть II)]])

==Введение==
Несколько ингибиторов ацетилхолинэстеразы применяются в симптоматическом лечении болезни Алцгеймера, либо находятся на завершающих этапах клинических исследований. '''E2020''', распространяемый под названием '''Арицепт''' ('''Aricept''') является представителем большой семьи ингибиторов фермента [[acetylcholinesterase|ацетилхолинэстеразы]] (АЦХэ, AChE). '''Арицепт''' был разработан и синтезирован японской фирмой Эйсай (Eisai Company). Этот ингибитор был создан с помощью исследований QSAR до того, как стала известна трёхмерная структура ацетилхолинэстеразы из электрического угря ''Torpedo californica'' (''Тк''АЦХэ) ([[1ea5]]). '''Арицепт''' значительно увеличивает холинергическую деятельность у лабораторных животных, активно соревнуясь с ацетилхолином (АЦХ) за связь с ацетилхолинэстеразой в наномолярных концентрациях. Это было продемонстрировано, и на электрических угрях, и на лабораторных мышах.

{{Clear}}
<applet load='1eve.pdb' size='500' frame='true' align='right' scene='Main_Page/E2020_in_ache_spinning/1' />

==Результаты==
Трёхмерная структура комплекса '''E2020''' с ''Тк''АЦХэ показала, что '''Арицепт''' имеет <scene name='1eve/E2020_close_up_with_84_279/13'>уникальную ориентацию</scene> относительно впадины активного центра, распространясь от анионного подцентра (<scene name='1eve/E2020_close_up_with_84lbld/7'>W84</scene>) внизу, к переферическому анионному центру (<scene name='1eve/E2020_close_up_with_84_279lbld/5'>возле W279</scene>) вверху, с помощью взаимодейстий с эволюционно сохранившимися (консервативными) ароматическими аминокислотами. Однако, '''E2020''' не взаимодействует напрямую с каталитической триадой, а только через <scene name='1eve/E20_interactionshown/8'>молекулы воды</scene>.

==Выводы==
Трёхмерная структура комплекса показала (''a posteriori''), что разработка '''E2020''' имеет ряд преимуществ во взаимодейстиях с впадиной активного центра. '''Арицепт''' имеет большее сродсво с ацетилхолинэстеразой и большую селективность, чем с бутирилхолинэстеразой. '''E2020''' может быть модифицирован в будущем для создания новых лекарств против болезни Алцгеймера.

==About this Structure==
1EVE is a [http://en.wikipedia.org/wiki/Protein Single protein] structure of sequence from [http://en.wikipedia.org/wiki/Torpedo_californica Torpedo californica] with NAG and E20 as [http://en.wikipedia.org/wiki/ligands ligands]. Active as [[Acetylcholinesterase]], with EC number [http://www.brenda-enzymes.info/php/result_flat.php4?ecno=3.1.1.7 3.1.1.7]. Full crystallographic information is available from [http://ispc.weizmann.ac.il/oca-bin/ocashort?id=1EVE OCA].

==Библиография==
Structure of acetylcholinesterase complexed with E2020 (Aricept): implications for the design of new anti-Alzheimer drugs., Kryger G, Silman I, Sussman JL, Structure. 1999 Mar 15;7(3):297-307. PMID:[http://ispc.weizmann.ac.il//pmbin/getpm?pmid=10368299 10368299]

См. также [[1eve]] in English, [[1eve (Chinese)]], [[1eve (French)]], [[1eve (Arabic)]], [[1eve (Spanish)]], [[1eve (Italian)]], & [[1eve (Turkish)]].
[[Category: Acetylcholinesterase]]
[[Category: Single protein]]
[[Category: Torpedo californica]]
[[Category: Kryger, G.]]
[[Category: Silman, I.]]
[[Category: Sussman, J.L.]]
[[Category: E20]]
[[Category: NAG]]
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[[Category: alzheimer's disease]]
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[[Category: drug]]
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Aricept Complexed with Acetylcholinesterase (Chinese)

2010-02-03T17:20:32Z

Fred Vellieux:

[[Image:E2020_interactins_in_AChE_gorge.jpg|left|250px]] 

{{STRUCTURE_1eve| PDB=1eve | SCENE=Main_Page/E2020_in_ache_spinning/1 }}

'''抗老年痴呆药物安理申（Aricept）与乙酰胆碱酯酶复合物的三维结构'''

==背景介绍==
部分乙酰胆碱酯酶的抑制剂已用于老年痴呆疾病的治疗或正处于临床研究阶段。 '''E2020''', 商品名为'''安理申''', 属于1-苄基-4-哌啶类乙酰胆碱酯酶（[[acetylcholinesterase]]）抑制剂。该抑制剂由日本的Eisai公司研发成功。此类抑制剂是在加利福尼亚电鳐乙酰胆碱酯酶三维结构([[1ea5]])的解析之前，基于定量构效关系研究而设计改造获得的。动物模型研究表明E2020能有效改善胆碱能功能减退。E2020与乙酰胆碱酯酶的结合力非常强，其与电鳐和老鼠乙酰胆碱酯酶的结合常数在纳摩尔级。

{{Clear}}
<applet load='1eve.pdb' size='500' frame='true' align='right' scene='Main_Page/E2020_in_ache_spinning/1' />

==结果==
E2020与乙酰胆碱酯酶复合物的晶体结构表明E2020采用了<scene name='1eve/E2020_close_up_with_84_279/13'>非常独特的取向</scene>结合于乙酰胆碱酯酶，其结合部位从乙酰胆碱酯酶活性口袋底部的阴离子结合位点的<scene name='1eve/E2020_close_up_with_84lbld/7'>残基W84</scene>一直延伸口袋顶部外周阴离子结合位点的<scene name='1eve/E2020_close_up_with_84_279lbld/5'>残基W279</scene>附近。但是，E2020并不直接与酶的催化三联体或者氧离子空穴相互作用，而是通过<scene name='1eve/E20_interactionshown/8'>溶剂水分子</scene>与其间接作用。

==结论==
晶体结构表明E2020的设计充分考虑了乙酰胆碱酯酶狭长活性口袋的多个重要特征，从而使该药物与乙酰胆碱酯酶的结合力非常强，同时对乙酰胆碱酯酶的选择性结合远远高于丁酰胆碱酯酶。此外，该复合物的晶体结构还提供了进一步改造E2020的信息，如从三维结构中看到活性口袋中仍有空隙，可以通过改造E2020从而使小分子与乙酰胆碱酯酶的结合更加充分。

==关于这个结构==
PBD编码1EVE是单个[http://en.wikipedia.org/wiki/Protein 蛋白质]（其序列来自加利福尼亚电鳐（[http://en.wikipedia.org/wiki/Torpedo_californica Torpedo_californica]）的乙酰胆碱酯酶）
与多糖和[http://en.wikipedia.org/wiki/ligands 配体]E20的复合物结构。乙酰胆碱酯酶（[[Acetylcholinesterase]]），其酶学命名号为[http://www.brenda-enzymes.info/php/result_flat.php4?ecno=3.1.1.7 EC 3.1.1.7]。所有关于这个结构的信息可以从[http://ispc.weizmann.ac.il/oca-bin/ocashort?id=1EVE OCA]获得。

==参考文献==
Structure of acetylcholinesterase complexed with E2020 (Aricept): implications for the design of new anti-Alzheimer drugs., Kryger G, Silman I, Sussman JL, Structure. 1999 Mar 15;7(3):297-307. PMID:[http://ispc.weizmann.ac.il//pmbin/getpm?pmid=10368299 10368299]

See [[1eve (French)]], [[1eve (Italian)]], [[1eve (Arabic)]], [[1eve (Russian)]], [[1eve (Spanish)]], [[1eve (Turkish)]], & [[1eve]] - in English.
[[Category: Acetylcholinesterase]]
[[Category: Single protein]]
[[Category: Torpedo californica]]
[[Category: Kryger, G.]]
[[Category: Silman, I.]]
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[[Category: E20]]
[[Category: NAG]]
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[[Category: alzheimer's disease]]
[[Category: catalytic triad]]
[[Category: drug]]
[[Category: glycosylated protein]]
[[Category: neurotransmitter cleavage]]
[[Category: serine hydrolase]]

Aricept Complexed with Acetylcholinesterase (French)

2010-02-03T17:18:35Z

Fred Vellieux:

[[Image:E2020_interactins_in_AChE_gorge.jpg|left|250px]] 

{{STRUCTURE_1eve| PDB=1eve | SCENE=Main_Page/E2020_in_ache_spinning/1 }}

'''Structure 3D du médicament anti-Alzheimer, Aricept, en complexe avec l'acétylcholinesterase'''
(voir aussi [[AChE bivalent inhibitors (Part II)]])
==Contexte==
Plusieurs inhibiteurs de la cholinesterase sont soit utilisés pour le traitement des symptomes de la maladie d'Alzheimer, soit sont au stage d'essais cliniques avancés. Le '''E2020''', commercialisé sous le nom de '''Aricept''', est un membre d'une grande famille d'inhibiteurs de l'acétylcholinesterase [[acetylcholinesterase]] (AChE) basés sur le N-benzylpiperidine, développé, synthétisé et évalué par la Société Eisai au Japon. Ces inhibiteurs ont été conçus sur la base des études de QSAR avant la résolution de la structure 3D de l'AChE de ''Torpedo californica'' (''Tc''AChE) ([[1ea5]]). Il améliore significativement la performance, dans des modèles animaux, de l'hypofonction cholinergique et a une affinité élevée pour l'AChE, se liant aussi bien à l'AChE de l'anguille électrique qu'à celle de la souris dans la gamme du nanomolaire.

{{Clear}}
<applet load='1eve.pdb' size='500' frame='true' align='right' scene='Main_Page/E2020_in_ache_spinning/1' />

==Résultats==
La structure par radio-cristallographie du complexe E2020-''Tc''AChE montre que le E2020 a une <scene name='1eve/E2020_close_up_with_84_279/13'>orientation unique</scene> le long de la gorge du site actif, s'étendant du sous-site anionique (<scene name='1eve/E2020_close_up_with_84lbld/7'>W84</scene>) du site actif en bas, au site anionique périphérique (<scene name='1eve/E2020_close_up_with_84_279lbld/5'>proche du W279</scene>) en haut, via des interactions d'empilement aromatiques avec des acides aminés aromatiques conservés. Cependant, le E2020 n'interagit pas directement avec la triade catalytique ou avec le 'trou oxyanion', mais seulement de manière <scene name='1eve/E20_interactionshown/8'>indirecte</scene> au travers de molécules du solvant.

==Conclusions==
La structure cristallographique montre, a posteriori, que le design de l'E2020 a utilisé plusieurs caractéristiques importantes de la gorge du site actif de l'AChE ainsi qu'un haut degré de sélectivité pour l'AChE comparée à celle pour la butyrylcholinesterase (BChE). Elle met aussi en évidence des zones de vide dans la gorge qui ne sont pas occupées par l'E2020 et pourraient fournir des sites pour des modifications potentielles de l'E2020 afin de produire des médicaments avec des profils pharmacologiques améliorés.

==Au sujet de cette structure==
1EVE est une structure de [http://en.wikipedia.org/wiki/Protein protéine seule] de séquence de [http://en.wikipedia.org/wiki/Torpedo_californica Torpedo californica] avec NAG et E20 comme [http://en.wikipedia.org/wiki/ligands ligands]. Active en tant qu'[[Acetylcholinesterase]], avec le numéro EC [http://www.brenda-enzymes.info/php/result_flat.php4?ecno=3.1.1.7 3.1.1.7]. Des informations cristallographiques complètes sont disponibles sur [http://ispc.weizmann.ac.il/oca-bin/ocashort?id=1EVE OCA].

==Référence==
Structure of acetylcholinesterase complexed with E2020 (Aricept): implications for the design of new anti-Alzheimer drugs., Kryger G, Silman I, Sussman JL, Structure. 1999 Mar 15;7(3):297-307. PMID:[http://ispc.weizmann.ac.il//pmbin/getpm?pmid=10368299 10368299]

See [[1eve]] in English, [[1eve (Chinese)]], [[1eve (Arabic)]], [[1eve (Russian)]], [[1eve (Spanish)]], [[1eve (Turkish)]] & [[1eve (Italian)]].
[[Category: Acetylcholinesterase]]
[[Category: Single protein]]
[[Category: Torpedo californica]]
[[Category: Kryger, G.]]
[[Category: Silman, I.]]
[[Category: Sussman, J.L.]]
[[Category: E20]]
[[Category: NAG]]
[[Category: alpha/beta hydrolase]]
[[Category: alzheimer's disease]]
[[Category: catalytic triad]]
[[Category: drug]]
[[Category: glycosylated protein]]
[[Category: neurotransmitter cleavage]]
[[Category: serine hydrolase]]

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Aricept Complexed with Acetylcholinesterase (Arabic)

2010-02-03T17:07:17Z

Fred Vellieux:

[[Image:E2020_interactins_in_AChE_gorge.jpg|left|250px]] 

{{STRUCTURE_1eve| PDB=1eve | SCENE=Main_Page/E2020_in_ache_spinning/1 }}

'''الشكل المركب الثلاثي الأبعاد للدواء المضاد للأزهايمر Aricept مرتبط مع acetylcholinesterase
(أنظر أيضا''' [[AChE bivalent inhibitors (Part II)]])


==مقدمة==

هنالك عدة مثبطات للكولين إما يجري استخدامها للعلاج من أعراض مرض الزهايمر أو هي في تجارب سريرية متقدمة. الدواء '''E2020''' ويسوق بإسم '''Aricept''' هو عضو في عائلة كبيرة من N-benzylpiperidine مثبطات أستيلكولينستراز (AChE) ،الذي تم تركيبه وتطويره وتقييمه من قبل شركة ايساي في اليابان. وقد صممت هذه المثبطات على أساس دراسات QSAR قبل الكشف عن الشكل الثلاثي الأبعاد لمثبط أستيلكولينستراز "( [[1ea5]] ) Torpedo californica AChE "TcAChE . ويعزز دواء ال Aricept إلى حد كبير في أداء حيوانات مخبرية تعاني من قصور وظيفي مرتبط بالكولين ولهذا الدواء قابلية عالية للربط مع الأستيلكولينستراز لكل من الانقليس الكهربائي والفأر في نطاق ضئيل "nanomolar".

{{Clear}}
<applet load='1eve.pdb' size='500' frame='true' align='right' scene='Main_Page/E2020_in_ache_spinning/1' />
==نتائج==

تظهر الأشعة السينية لهيكلة المركب '''(E2020 – TcAChE)''' أن ال- '''E2020''' له <scene name='1eve/E2020_close_up_with_84_279/13'> توافق مميز </scene> على طول منطقة الموقع النشط في داخل الأستيلكولينستراز ، وبمتد هذا التوافق من موقع فرعي أنيوني <scene name='1eve/E2020_close_up_with_84lbld/7'> (W84) </scene> من الموقع النشط - في الجزء السفلي ، إلى موقع أنيوني خارجي <scene name='1eve/E2020_close_up_with_84_279lbld/5'> قرب W279 </scene>- في الجزء العلوي ،وذلك من خلال روابط aromatic stacking interactions مع أحماض نكيليوتيدية أروماتية. بالرغم من ذلك لا يتفاعل ال- '''E2020''' بشكل مباشر مع أي من ثالوث الحفاز أو ال-'oxyanion hole' ولكن فقط بشكل <scene name='1eve/E20_interactionshown/8'> غير مباشر عن طريق جزيئات المذيب </scene>.
==خاتمة==

مؤخرا أظهرت الأشعة السينية أن تصميم '''E2020''' استغل العديد من السمات الهامة للموقع النشط الحلقي لل- أستيلكولينستراز لإنتاج دواء يتميز بإنجذاب شديد لل - أستيلكولينستراز وعلى درجة عالية من الانتقائية لل- أستيلكولينستراز مقابل butyrylcholinesterase "BChE". كما أنه يحدد الفراغات داخل المنطقة الحلقية والتي لم يشغلها '''E2020''' ويمكن أن توفر مواقع لتعديل محتمل لل'''E2020''' لإنتاج عقاقير دوائية محسنة.

==معلومات عن الشكل==

1EVE هو[http://en.wikipedia.org/wiki/Protein Single protein] هيكلة بروتين مصدره [http://en.wikipedia.org/wiki/Torpedo_californica Torpedo californica] مع [http://en.wikipedia.org/wiki/ligands ligands].NAG and E20 as ligands. Active as [[Acetylcholinesterase]], with EC number [http://www.brenda-enzymes.info/php/result_flat.php4?ecno=3.1.1.7 3.1.1.7].. كامل المعلومات عن الشكل البلوري متوفر من خلال [http://ispc.weizmann.ac.il/oca-bin/ocashort?id=1EVE OCA].

==مراجع==
Structure of acetylcholinesterase complexed with E2020 (Aricept): implications for the design of new anti-Alzheimer drugs., Kryger G, Silman I, Sussman JL, Structure. 1999 Mar 15;7(3):297-307. PMID:[http://ispc.weizmann.ac.il//pmbin/getpm?pmid=10368299 10368299]

أنظر [[1 eve (Chinese)]], [[1eve (French)]], [[1eve (Russian)]], [[1eve (Spanish)]], [[1eve (Italian)]] & [[1eve (Turkish)]].
[[Category: Acetylcholinesterase]]
[[Category: Single protein]]
[[Category: Torpedo californica]]
[[Category: Kryger, G.]]
[[Category: Silman, I.]]
[[Category: Sussman, J.L.]]
[[Category: E20]]
[[Category: NAG]]
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Aricept Complexed with Acetylcholinesterase (French)

2010-02-03T17:02:27Z

Fred Vellieux:

[[Image:E2020_interactins_in_AChE_gorge.jpg|left|250px]] 

{{STRUCTURE_1eve| PDB=1eve | SCENE=Main_Page/E2020_in_ache_spinning/1 }}

'''Structure 3D du médicament anti-Alzheimer, Aricept, en complexe avec l'acétylcholinesterase'''
(voir aussi [[AChE bivalent inhibitors (Part II)]])
==Contexte==
Plusieurs inhibiteurs de la cholinesterase sont soit utilisés pour le traitement des symptomes de la maladie d'Alzheimer, soit sont au stage d'essais cliniques avancés. Le '''E2020''', commercialisé sous le nom de '''Aricept''', est un membre d'une grande famille d'inhibiteurs de l'acétylcholinesterase [[acetylcholinesterase]] (AChE) basés sur le N-benzylpiperidine, développé, synthétisé et évalué par la Société Eisai au Japon. Ces inhibiteurs ont été conçus sur la base des études de QSAR avant la résolution de la structure 3D de l'AChE de ''Torpedo californica'' (''Tc''AChE) ([[1ea5]]). Il améliore significativement la performance, dans des modèles animaux, de l'hypofonction cholinergique et a une affinité élevée pour l'AChE, se liant aussi bien à l'AChE de l'anguille électrique qu'à celle de la souris dans la gamme du nanomolaire.

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==Résultats==
La structure par radio-cristallographie du complexe E2020-''Tc''AChE montre que le E2020 a une <scene name='1eve/E2020_close_up_with_84_279/13'>orientation unique</scene> le long de la gorge du site actif, s'étendant du sous-site anionique (<scene name='1eve/E2020_close_up_with_84lbld/7'>W84</scene>) du site actif en bas, au site anionique périphérique (<scene name='1eve/E2020_close_up_with_84_279lbld/5'>proche du W279</scene>) en haut, via des interactions d'empilement aromatiques avec des acides aminés aromatiques conservés. Cependant, le E2020 n'interagit pas directement avec la triade catalytique ou avec le 'trou oxyanion', mais seulement de manière <scene name='1eve/E20_interactionshown/8'>indirecte</scene> au travers de molécules du solvant.

==Conclusions==
La structure cristallographique montre, a posteriori, que le design de l'E2020 a utilisé plusieurs caractéristiques importantes de la gorge du site actif de l'AChE ainsi qu'un haut degré de sélectivité pour l'AChE comparée à celle pour la butyrylcholinesterase (BChE). Elle met aussi en évidence des zones de vide dans la gorge qui ne sont pas occupées par l'E2020 et pourraient fournir des sites pour des modifications potentielles de l'E2020 afin de produire des médicaments avec des profils pharmacologiques améliorés.

==Au sujet de cette structure==
1EVE est une structure de [http://en.wikipedia.org/wiki/Protein protéine seule] de séquence de [http://en.wikipedia.org/wiki/Torpedo_californica Torpedo californica] avec NAG et E20 comme [http://en.wikipedia.org/wiki/ligands ligands]. Active en tant qu'[[Acetylcholinesterase]], avec le numéro EC [http://www.brenda-enzymes.info/php/result_flat.php4?ecno=3.1.1.7 3.1.1.7]. Des informations cristallographiques complètes sont disponibles sur [http://ispc.weizmann.ac.il/oca-bin/ocashort?id=1EVE OCA].

==Référence==
Structure of acetylcholinesterase complexed with E2020 (Aricept): implications for the design of new anti-Alzheimer drugs., Kryger G, Silman I, Sussman JL, Structure. 1999 Mar 15;7(3):297-307. PMID:[http://ispc.weizmann.ac.il//pmbin/getpm?pmid=10368299 10368299]

See [[1eve]] in English, [[1eve (Chinese)]], [[1eve (Arabic)]], [[1eve (Russian)]], [[1eve (Spanish)]], [[1eve (Turkish)]] & [[1eve_(Italian)]].
[[Category: Acetylcholinesterase]]
[[Category: Single protein]]
[[Category: Torpedo californica]]
[[Category: Kryger, G.]]
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[[Category: alpha/beta hydrolase]]
[[Category: alzheimer's disease]]
[[Category: catalytic triad]]
[[Category: drug]]
[[Category: glycosylated protein]]
[[Category: neurotransmitter cleavage]]
[[Category: serine hydrolase]]

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Aricept Complexed with Acetylcholinesterase (Italian)

2010-02-03T16:59:35Z

Fred Vellieux:

[[Image:E2020_interactins_in_AChE_gorge.jpg|left|250px]] 

{{STRUCTURE_1eve| PDB=1eve | SCENE=Main_Page/E2020_in_ache_spinning/1 }}

'''Struttura 3D del medicinale anti-Alzheimer, Aricept, in complesso con l'acetylcholinesterase,'''
(vedere anche [[AChE bivalent inhibitors (Part II)]])
==Contesto==
Parecchi inibitori della cholinesterase sono sia utilizzati per il trattamento dei sintomi della malattia di Alzheimer, o sono allo stage di prove cliniche avanzate. Il '''E2020''', commercializzato sotto il nome di '''Aricept''', è un membro di una grande famiglia di inibitori dell'[[acetylcholinesterase]] (AChE) basati sul N-benzylpiperidine, evoluto, sintetizzato ed evaluato dal Società Eisai in Giappone. Questi inibitori sono stati concepiti sulla base degli studi di QSAR prima della risoluzione della struttura 3D dell'AChE di '' Torpedo californica'' (''Tc''AChE) ([[1ea5]]). Migliora significativamente la prestazione, nei modelli animali, del ipofunzione cholinergica e ha un'affinità alzata per l'AChE, legandosi tanto bene all'AChE dell'anguilla elettrica che a quella del topo nella gamma del nanomolare.

==Risultati==
La struttura per radio-cristallografia del complesso E2020-''Tc''AChE mostra che l'E2020 ha un'<scene name='1eve/E2020_close_up_with_84_279/10'>orientamento unico</scene> lungo la gola del sito attivo, distendendosi del sotto-sito anionico (<scene name='1eve/E2020_close_up_with_84lbld/5'>W84</scene>) del sito attivo in basso, al sito anionico periferico (<scene name='1eve/E2020_close_up_with_84_279lbld/4'> vicino al W279</scene>) in alto, via le interazioni di accatastamento aromatico con gli aminoacidi aromatici conservati. L'E2020 non interagisce tuttavia, direttamente con la triade catalitica o col 'buco oxyanion', ma solamente <scene name='1eve/E20_interactionshown/7'> in modo indiretto mediante molecole del solvente</scene>.

==Conclusioni==
Lo struttura cristallografica mostra, a posteriori, che il design dell'E2020 ha utilizzato parecchie caratteristiche importanti della gola del sito attivo dell'AChE ed anche un alto grado di selettività per l'AChE paragonata a quella per la butyrylcholinesterase (BChE). Mette anche in evidenza delle zone di vuoto nella gola che non sono occupate dall'E2020 e potrebbe fornire dei siti per le modifiche potenziali dell'E2020 per produrre dei medicinali coi profili farmacologici migliorati.

==A proposito di questa Struttura==
1EVE è una struttura di [http://en.wikipedia.org/wiki/Protein proteina sola] di sequenza di [http://en.wikipedia.org/wiki/Torpedo_californica Torpedo californica] con NAG ed E20 come [http://en.wikipedia.org/wiki/ligands ligands]. Attiva come [[Acetylcholinesterase]] col numero EC [http://www.brenda-enzymes.info/php/result_flat.php4?ecno=3.1.1.7 3.1.1.7]. Dalle informazioni cristallografiche completi sono disponibili su [http://ispc.weizmann.ac.il/oca-bin/ocashort?id=1EVE OCA].

==Riferimento==
Structure of acetylcholinesterase complexed with E2020 (Aricept): implications for the design of new anti-Alzheimer drugs., Kryger G, Silman I, Sussman JL, Structure. 1999 Mar 15;7(3):297-307. PMID:[http://ispc.weizmann.ac.il//pmbin/getpm?pmid=10368299 10368299]

See [[1eve]], [[1eve (Chinese)]], [[1eve (Spanish)]], [[1eve (Russian)]], [[1eve (Turkish)]] & [[1eve (French)]].
[[Category: Acetylcholinesterase]]
[[Category: Single protein]]
[[Category: Torpedo californica]]
[[Category: Kryger, G.]]
[[Category: Silman, I.]]
[[Category: Sussman, J.L.]]
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[[Category: NAG]]
[[Category: alpha/beta hydrolase]]
[[Category: alzheimer's disease]]
[[Category: catalytic triad]]
[[Category: drug]]
[[Category: glycosylated protein]]
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Aricept Complexed with Acetylcholinesterase (Italian)

2010-02-03T16:58:45Z

Fred Vellieux:

[[Image:E2020_interactins_in_AChE_gorge.jpg|left|250px]] 

{{STRUCTURE_1eve| PDB=1eve | SCENE=Main_Page/E2020_in_ache_spinning/1 }}

'''Struttura 3D del medicinale anti-Alzheimer, Aricept, in complesso con l'acetylcholinesterase,'''
(vedere anche [[AChE bivalent inhibitors (Part II)]])
==Contesto==
Parecchi inibitori della cholinesterase sono sia utilizzati per il trattamento dei sintomi della malattia di Alzheimer, o sono allo stage di prove cliniche avanzate. Il '''E2020''', commercializzato sotto il nome di '''Aricept''', è un membro di una grande famiglia di inibitori dell'[[acetylcholinesterase]] (AChE) basati sul N-benzylpiperidine, evoluto, sintetizzato ed evaluato dal Società Eisai in Giappone. Questi inibitori sono stati concepiti sulla base degli studi di QSAR prima della risoluzione della struttura 3D dell'AChE di '' Torpedo californica'' (''Tc''AChE) ([[1ea5]]). Migliora significativamente la prestazione, nei modelli animali, del ipofunzione cholinergica e ha un'affinità alzata per l'AChE, legandosi tanto bene all'AChE dell'anguilla elettrica che a quella del topo nella gamma del nanomolare.

==Risultati==
La struttura per radio-cristallografia del complesso E2020-''Tc''AChE mostra che l'E2020 ha un'<scene name='1eve/E2020_close_up_with_84_279/10'>orientamento unico</scene> lungo la gola del sito attivo, distendendosi del sotto-sito anionico (<scene name='1eve/E2020_close_up_with_84lbld/5'>W84</scene>) del sito attivo in basso, al sito anionico periferico (<scene name='1eve/E2020_close_up_with_84_279lbld/4'> vicino al W279</scene>) in alto, via le interazioni di accatastamento aromatico con gli aminoacidi aromatici conservati. L'E2020 non interagisce tuttavia, direttamente con la triade catalitica o col 'buco oxyanion', ma solamente <scene name='1eve/E20_interactionshown/7'> in modo indiretto mediante molecole del solvente</scene>.

==Conclusioni==
Lo struttura cristallografica mostra, a posteriori, che il design dell'E2020 ha utilizzato parecchie caratteristiche importanti della gola del sito attivo dell'AChE ed anche un alto grado di selettività per l'AChE paragonata a quella per la butyrylcholinesterase (BChE). Mette anche in evidenza delle zone di vuoto nella gola che non sono occupate dall'E2020 e potrebbe fornire dei siti per le modifiche potenziali dell'E2020 per produrre dei medicinali coi profili farmacologici migliorati.

==A proposito di questa Struttura==
1EVE è una struttura di [http://en.wikipedia.org/wiki/Protein proteina sola] di sequenza di [http://en.wikipedia.org/wiki/Torpedo_californica Torpedo californica] con NAG ed E20 come [http://en.wikipedia.org/wiki/ligands ligands]. Attiva come [[Acetylcholinesterase]] col numero EC [http://www.brenda-enzymes.info/php/result_flat.php4?ecno=3.1.1.7 3.1.1.7]. Dalle informazioni cristallografiche completi sono disponibili su [http://ispc.weizmann.ac.il/oca-bin/ocashort?id=1EVE OCA].

==Riferimenti==
Structure of acetylcholinesterase complexed with E2020 (Aricept): implications for the design of new anti-Alzheimer drugs., Kryger G, Silman I, Sussman JL, Structure. 1999 Mar 15;7(3):297-307. PMID:[http://ispc.weizmann.ac.il//pmbin/getpm?pmid=10368299 10368299]

See [[1eve (Chinese)]], [[1eve (Spanish)]], [[1eve (Russian)]], [[1eve (Turkish)]] & [[1eve (French)]].
[[Category: Acetylcholinesterase]]
[[Category: Single protein]]
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[[Category: serine hydrolase]]

1ca1 (Italian)

2010-02-02T10:28:30Z

Fred Vellieux:

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{{STRUCTURE_1ca1| PDB=1ca1 | SCENE= }}

===ALPHA-TOSSINA DEL ''CLOSTRIDIUM PERFRINGENS''===

L'alfa-tossina del ''Clostridium perfringens'' è il fattore determinante di virulenza in cancrena gassosa ed è stata anche coinvolta nella patogenesi del sindrome della morte improvvisa in animali giovani. La tossina è un enzima a metallo (zinco) di 370-residui, che ha un'attività fosfolipase C, e può legarsi alle membrane in presenza di calcio. La struttura cristallina dell'enzima rivela una proteina di due domini. Il dominio N-terminale mostra una somiglianza strutturale prevista con la fosfatidilcolina-specifica fosfolipase C di ''Bacillus cereus'' (PC-PLC). Il dominio C-terminale mostra una forte analogia strutturale al dominio di legame al calcio C2 degli eucarioti. Crediamo che questo sia il primo esempio di un tale dominio in procarioti. Questo tipo di dominio è stato trovato ad agire come un fosfolipide e/o dominio di legame al calcio obbligatorio nelle proteine secondo messaggero intracellulari e, cosa molto interessante, queste vie sono perturbati in cellule trattate con l'alfa-tossina. Infine, un possibile meccanismo è descritto per l'attaco dell alfa-tossina sui fosfolipidi
imballati nelle membrane, che razionalizza la sua tossicità rispetto ad altre fosfolipasi C omologhe non-emolitiche.

Riassunto tradotto da MEDLINE®/PubMed®, una banca dati del U.S. National Library of Medicine.

===Contesto===

La tossina alpha è la prima tossina batterica, la cui attività enzimatica è stata scoperta nel 1940 (Songer, JG 1996; Titball, RW, 1993; Naylor, CE ''et al.'', 1998). Si tratta di un lecitinase (oppure fosfolipase di tipo C) e una sfingomielinase che idrolizza le fosfatidil colina, lecitina, fosfolipidi e sfingomielina (Popoff, MR, 2005; Billington, SJ ''et al.'', 1998, Lefevre, PC ''et al.'', 2003; Smith, BP, 1996; Titball, RW ''et al.'', 1999; Hirsh, DC ''et al.'', 2004). Possiede attività emolitica, necrotizzante e letale (Titball, RW ''et al.'', 1999, Hirsh, DC ''et al.'', 2004). L'alpha tossina viene secreta da tutti i tipi di ''Clostridium perfringens''ed è sintetizzata in fase di crescita esponenziale (Smith, BP, 1996, Songer, JG, 1996; Titball, RW ''et al.'', 1999). L'alpha tossina è una proteina di peso molecolare 43 kDa (Petit, L ''et al.'', 1999). La sua sintesi inizia da un precursore costituito con un peptide segnale (i primi 28 aminoacidi). La proteina matura è composta di 370 amino acidi e comprende due domini: il dominio N-terminale è composto da eliche alfa (residui 1-246, la parte attiva della tossina), mentre l'altro dominio C-terminale è costituito da due fogli beta (residui 256-370, coinvolto nel legame alla membrana (Popoff, MR, 2004)). Si tratta di un enzima a metallo che contiene ioni Zn2+ e Ca2+ (Naylor, CE ''et al.'', 1998). Questi ioni sono essenziali per l'attività biologica: lo zinco è coinvolto in nell attività enzimatica, e il calcio è coinvolto nel legame alla membrana (Titball, RW ''et al.'', 1999).
Il gene che coda per la tossina alfa è chiamato ''cpa'' (chiamato anche ''plc''). Si trova sul cromosoma vicino l'origine di replicazione e iniziazione (Daube, G ''et al.'', 1996; Songer, JG, 1996). Sua sequenza, costante in tutti i tipi individuati, pertanto, consente di utilizzarlo come marcatore genetico della specie (Petit, L ''et al.'', 1999). Il ruolo della tossina alfa è una destabilizzazione delle membrane delle cellule. Il diacilglicerolo prodotto dalla idrolisi di lecitina dalla tossina alfa, attiva la proteina chinasi quel che porta all'attivazione delle fosfolipasi C e D delle cellule eucariote e ad una cascata di reazioni causate dal acido arachidonico. Le fosfolipasi C e D delle cellule eucarioti portano alla sintesi e a l'attrazione delle molecole dell'infiammazione come i leucotrieni, i trombossani e i fattori di attivazione piastrinica. Queste reazioni risultato nella contrazione degli vasi sanguigni, l'aumento della permeabilità, l'aggregazione piastrinica e la disfunzione del muscolo (il miocardio in particolare). L'attività biologica della tossina alfa resulta nella lisi della membrana delle cellule mirate, come i leucociti e gli enterociti (Lefevre, PC ''et al.'', 2003; Petit L ''et al'', 1999; Smith, BP, 1996, Minor, L & Véron, M, 1989). Alcuni esperimenti hanno evidenziato gli effetti patogeni di questa tossina usando iniezioni endovenosa o intra-peritoneale (Bunting, M ''et al.'', 1997; Titball, RW ''et al.'', 1999). La tossina alfa ha un'azione emolitica. Questo la mette a parte dalla fosfolipase A, la cui azione emolitica si fa a partire da prodotti emolitici (Minor, L & Véron, M, 1989). Tuttavia, questi prodotti sono coinvolti nell'attivazione di multiple reazioni di alterazione del metabolismo cellulare, quel che porta alla destabilizzazione
delle cellule (Bunting, M ''et al.'', 1997).
La tossina alfa altera la permeabilità dell'endotelio e causa la necrosi dei villi intestinali (Smith, BP, 1996). Studi realizzati da
Songer suggeriscono che la piccola differenza nella sequenza di aminoacidi della tossina alfa, tra le tossi-infezioni cancrenose e le enterotossemie, dà alla tossina alfa la sua resistenza particolare rispetto alla chimotripsina permettendo l'accumulo nell'intestino (Songer, JG, 1996).

==A proposito di questa Struttura==
1CA1 è una struttura a 1 catena di sequenza di [http://en.wikipedia.org/wiki/Clostridium_perfringens Clostridium perfringens]. Dalle informazioni cristallografiche completi sono disponibili su [http://oca.weizmann.ac.il/oca-bin/ocashort?id=1CA1 OCA].

==Riferimenti==
<ref group="xtra">PMID:9699639</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:8964036</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:8336671</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">Popoff MR. Clostridial and Bacteroides Toxins: Structure and Mode of Action. In "Strict and Facultative Anaerobes Medical and Environmental Aspects" (Nakano, MM & Zuber, P eds), Horizon Bioscience, Norfolk, 2004, pp. 171-197.</ref>
<ref group="xtra">Smith, BP. Diseases caused by ''Clostridium perfringens'' toxins, in "Large animal internal medicine. Diseases of horses, cattle, sheep and goat" 2nd edition, Mosby, 1996, pp. 768-771</ref>
<ref group="xtra">Titball, RW, Naylor CE, Basak AK. The ''Clostridium perfringens'' alpha-toxin. Anaerobe 1999 Apr; 5(1):51-64</ref>
<ref group="xtra">Hirsh, DC, Biberstein, EL. ''Clostridium'', in "Veterinary microbiology" 2nd édition (Walker, RL, Hersh, DC, Maclachlan, NJ eds), Wiley-Blackwell, 2004, pp. 198-214</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">Petit, L, Gibert, M, Popoff, MR. ''Clostridium perfringens'': toxinotype and genotype. Trends Microbiol. 1999 Mar;
7(3):104-110</ref>
<ref group="xtra">PMID:8712513</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">Minor, L, Véron, M. ''Clostridium perfringens'' in "Bacteriologie médicale. Medicine et Sciences" 2nd edition, Flammarion, 1989, pp. 902-911</ref>
<ref group="xtra">PMID:9239403</ref><references group="xtra"/>
[[Category: Clostridium perfringens]]
[[Category: Phospholipase C]]
[[Category: Basak, A K.]]
[[Category: Naylor, C E.]]
[[Category: Titball, R W.]]
[[Category: C2 domain]]
[[Category: Ca and membrane binding]]
[[Category: Gangrene determinant]]
[[Category: Hydrolase]]
[[Category: Zinc phospholipase c]]

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1ca1 (French)

2010-02-02T10:19:30Z

Fred Vellieux:

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{{STRUCTURE_1ca1| PDB=1ca1 | SCENE= }}

===TOXINE ALPHA DE ''CLOSTRIDIUM PERFRINGENS''===

La toxine alpha de ''Clostridium perfringens'' est le facteur de virulence principal dans la gangrène gazeuse, et a aussi été impliquée dans la pathogenèse du syndrome de mort subite chez les jeunes animaux. La toxine est une zinc métalloenzyme de 370 résidus, qui possède une activité phospholipase C et peut se lier aux membranes en présence de calcium. La structure cristalline de l'enzyme révèle une protéine à deux domaines. Le domaine N-terminal montre une similitude structurale attendue avec la phospholipase C phosphatidylcholine-spécifique de ''Bacillus cereus'' (PC-PLC). Le domaine C-terminal montre une analogie structurale forte avec les domaines de liaison du calcium C2 eucaryotes. Nous pensons qu'il s'agit du premier exemple d'un tel domaine chez les procaryotes. Ce type de domaine peut agir comme phospholipide et/ou domaine de liaison du calcium dans les protéines second messager intracellulaires et, de manière intéressante, ces voies sont perturbées dans des cellules traitées à la toxine alpha. Finalement, un mécanisme pausible est décrit pour l'attaque de la toxine alpha sur les phospholipides empaquetés dans des membranes, ce qui rationalise sa toxicité comparée à d'autres phospholipases C homologues, non-hémolytiques.

Résumé traduit de MEDLINE®/PubMed®, une base de données de la U.S. National Library of Medicine.

==CONTEXTE==

La toxine alpha est la première toxine bactérienne dont l'activité enzymatique fut découverte en 1940 (Songer, JG, 1996; Titball, RW, 1993; Naylor, CE ''et al.'', 1998). Il s'agit d'une lécithinase (ou phospholipase de type C) et d'une sphyngomyélinase hydrolysant la phosphatydil-choline, la lécithine, les phospholipides et la sphyngomyéline (Popoff, MR, 2004; Billington, SJ ''et al.'', 1998; Lefevre, PC ''et al.'', 2003; Smith, BP, 1996; Titball, RW ''et al.'', 1999; Hirsh, DC ''et al.'', 2004). Elle possède une activité hémolytique, nécrosante et létale (Titball, RW ''et al.'', 1999; Hirsh, DC ''et al.'', 2004). La toxine alpha est sécrétée par tous les types de ''Clostridium perfringens'' et est synthétisée en phase de croissance exponentielle (Smith, BP, 1996; Songer, JG, 1996; Titball, RW ''et al.'', 1999). La toxine alpha est une protéine de poids moléculaire 43 kDa (Petit, L ''et al.'', 1999). Sa synthèse est réalisée à partir d'un précurseur comprenant un peptide signal (les premiers 28 acides aminés). La protéine mature est composée de 370 acides aminés et possède deux domaines; l'un est constitué d'hélices alpha en partie N-terminale (résidus 1-246), portion active de la toxine, l'autre est formé de deux feuillets beta, en partie C-terminale (résidus 256-370), impliqué dans la fixation membranaire (Popoff, MR, 2004). Il s'agit d'une métallo enzyme comprenant des ions Zn2+ et Ca2+ (Naylor, CE ''et al.'', 1998). Ces ions sont indispensables pour l'activité biologique: le zinc intervient dans l'activité enzymatique et le calcium intervient dans la fixation membranaire (Titball, RW ''et al.'', 1999).
Le gène qui code pour la toxine alpha est appelé ''cpa'' (encore appelé ''plc''). Il est situé sur le chromosome près de l'origine de réplication et d'initiation (Daube, G ''et al.'', 1996; Songer, JG, 1996). Sa séquence, constante dans toutes les souches identifiées, permet par conséquent de l'utiliser comme marqueur génétique de l'espèce (Petit, L ''et al.'', 1999). Le rôle de la toxine alpha consiste en une déstabilisation des membranes cellulaires. Le diacylglycérol, produit de l'hydrolyse de la lécithine par la toxine alpha, active la protéine kinase conduisant à l'activation des phospholipases C et D des cellules eucaryotes et à une cascade de réactions dues à l'acide arachidonique. Les phospholipases C et D des cellules eucaryotes engendrent la synthèse et l'attraction des molécules de l'inflammation comme les leucotriènes, les thromboxanes et les facteurs d'activation des plaquettes. Ces réactions entrainent la contraction des vaisseaux sanguins, une augmentation de la perméabilité, l'agrégation plaquettaire et un dysfonctionnement des muscles (le myocarde en particulier).
L'activité biologique de la toxine alpha se traduit par la lyse membranaires des cellules cibles comme les leucocytes ou les entérocytes (Lefevre, PC ''et al.'', 2003; Petit, L ''et al.'', 1999; Smith, BP, 1996; Minor, L & Véron, M, 1989). Des expériences ont permis de mettre en évidence ces effets pathogènes par injection intraveineuse ou intra-péritonéale de cette toxine (Bunting, M ''et al.'', 1997; Titball, RW ''et al.'', 1999). La toxine alpha possède une action hémolytique. Ceci la différencie des phospholipases A, dont l'action hémolytique s'effectue à partir de produits hémolytiques (Minor, L & Véron, M, 1989). Néanmoins ces produits interviennent dans l'activation de multiples
réactions altérant le métabolisme cellulaire conduisant à la déstabilisation des cellules (Bunting, M ''et al.'', 1997).
La toxine alpha modifie la perméabilité des endothéliums et provoque la nécrose des villosités intestinales (Smith, BP, 1996). Des études menées par Songer tendent à montrer que l'infime différence de la séquence en acides aminés de la toxine alpha, entre les toxi-infections gangréneuses et les entérotoxémies, confère à la toxine alpha une résistance particulière vis-à-vis de la chymotrypsine permettant son accumulation dans l'intestin (Songer, JG, 1996).

==Au sujet de cette Structure==
1CA1 est une structure à 1 chaîne de séquence de [http://en.wikipedia.org/wiki/Clostridium_perfringens Clostridium perfringens]. Des informations cristallographique complètes sont disponibles sur [http://oca.weizmann.ac.il/oca-bin/ocashort?id=1CA1 OCA].

==Références==
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<ref group="xtra">PMID:8964036</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:8336671</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">Popoff MR. Clostridial and Bacteroides Toxins: Structure and Mode of Action. In "Strict and Facultative Anaerobes Medical and Environmental Aspects" (Nakano, MM & Zuber, P eds), Horizon Bioscience, Norfolk, 2004, pp. 171-197.</ref>
<ref group="xtra">Smith, BP. Diseases caused by ''Clostridium perfringens'' toxins, in 'Large animal internal medicine. Diseases of horses, cattle, sheep and goat' 2nd edition, Mosby, 1996, pp. 768-771</ref>
<ref group="xtra">Titball, RW, Naylor CE, Basak AK. The ''Clostridium perfringens'' alpha-toxin. Anaerobe 1999 Apr; 5(1):51-64</ref>
<ref group="xtra">Hirsh, DC, Biberstein, EL. ''Clostridium'', in "Veterinary microbiology" 2nd édition (Walker, RL, Hersh, DC, Maclachlan, NJ eds), Wiley-Blackwell, 2004, pp. 198-214</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">Petit, L, Gibert, M, Popoff, MR. ''Clostridium perfringens'': toxinotype and genotype. Trends Microbiol. 1999 Mar;
7(3):104-110</ref>
<ref group="xtra">PMID:8712513</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">Minor, L, Véron, M. ''Clostridium perfringens'' in "Bacteriologie médicale. Medicine et Sciences" 2nd edition, Flammarion, 1989, pp. 902-911</ref>
<ref group="xtra">PMID:9239403</ref><references group="xtra"/>
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2x0j (Italian)

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===STRUTTURA A 2.8 A DI RISOLUZIONE DELLA MALATE DEHYDROGENASE DA ''ARCHAEOGLOBUS FULGIDUS'' IN COMPLESSO CON ETHENO-NAD===


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==A proposito di questa Struttura==
2X0J è una struttura a 1 catena di sequenza di [http://en.wikipedia.org/wiki/Archaeoglobus_fulgidus Archaeoglobus fulgidus]. Dalle informazioni cristallografiche completi sono disponibili su [http://oca.weizmann.ac.il/oca-bin/ocashort?id=2X0J OCA].

==Riferimenti==

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===STRUTTURA A 2.8 A DI RISOLUZIONE DELLA MALATE DEHYDROGENASE DA ''ARCHAEOGLOBUS FULGIDUS'' IN COMPLESSO CON ETHENO-NAD===


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==A proposito di questa Struttura==
2X0J è una struttura a 1 catena di sequenza di [http://en.wikipedia.org/wiki/Archaeoglobus_fulgidus Archaeoglobus fulgidus]. Dalle informazioni cristallografiche completi sono disponibili su [http://oca.weizmann.ac.il/oca-bin/ocashort?id=2X0J OCA].

==Riferimento==

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===STRUTTURA A 2.9 A DI RISOLUZIONE DELLA MALATE DEHYDROGENASE DA ''ARCHAEOGLOBUS FULGIDUS'' IN COMPLESSO CON ETHENO-NAD===


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==A proposito di questa Struttura==
2X0J è una struttura a 1 catena di sequenza di [http://en.wikipedia.org/wiki/Archaeoglobus_fulgidus Archaeoglobus fulgidus]. Dalle informazioni cristallografiche completi sono disponibili su [http://oca.weizmann.ac.il/oca-bin/ocashort?id=2X0J OCA].

==Riferimento==

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2x06 (Italian)

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===Sulfolactate Dehydrogenase di ''Methanocaldococcus jannaschii''===


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==A proposito di questa Struttura==
2X06 è una struttura a 8 catene di sequenza di [http://en.wikipedia.org/wiki/Methanocaldococcus_jannaschii Methanocaldococcus jannaschii]. Dalle informazioni cristallografiche completi sono disponibili su [http://oca.weizmann.ac.il/oca-bin/ocashort?id=2X06 OCA].

==Riferimento==
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2x0n (Italian)

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===STRUTTURA DELLA GLYCERALDEHYDE-3-PHOSPHATE DEYDROGENASE GLICOSOMALE DI ''TRYPANOSOMA BRUCEI'' DETERMINATA A PARTIRE DI DATI LAUE===

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===STRUTTURA DELLA GLYCERALDEHYDE PHOSPHATE DEHYDROGENASE GLICOSOMALE DI ''TRYPANOSOMA BRUCEI BRUCEI'' AFFINATA AD UNA RISOLUZIONE DI 3.2 A===

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==A proposito di questa Struttura==
2X0N è una struttura a 6 catene di sequenze di [http://en.wikipedia.org/wiki/Trypanosoma_brucei_brucei Trypanosoma brucei brucei]. Dalle informazioni cristallografiche completi sono disponibili su [http://oca.weizmann.ac.il/oca-bin/ocashort?id=2X0N OCA].

==Riferimenti==
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[[Category: Trypanosoma brucei brucei]]
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2x0n (French)

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===STRUCTURE DE LA GLYCERALDEHYDE-3-PHOSPHATE DESHYDROGENASE GLYCOSOMALE DE ''TRYPANOSOMA BRUCEI'' DETERMINEE A PARTIR DE DONNEES DE LAUE===

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===STRUCTURE DE LA GLYCERALDEHYDE PHOSPHATE DESHYDROGENASE GLYCOSOMALE DE ''TRYPANOSOMA BRUCEI BRUCEI'' AFFINEE A UNE RESOLUTION DE 3.2 A===

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==Au sujet de cette structure==
2X0N est une structure à 6 chaînes de séquences de [http://en.wikipedia.org/wiki/Trypanosoma_brucei_brucei Trypanosoma brucei brucei]. Des informations cristallographiques complètes sont disponibles sur [http://oca.weizmann.ac.il/oca-bin/ocashort?id=2X0N OCA].

==Références==
<ref group="xtra">PMID:8460146</ref><references group="xtra"/>
[[Category: Trypanosoma brucei brucei]]
[[Category: Hajdu, J.]]
[[Category: Hol, W G.J.]]
[[Category: Vellieux, F M.D.]]
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[[Category: Trypanosoma brucei brucei]]
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[[Category: Trypanosoma brucei brucei]]
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[[Category: Wierenga, R K.]]
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[[Category: Trypanosoma brucei brucei]]

2x0i (Italian)

2010-01-28T17:56:10Z

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===STRUTTURA A 2.9 A DI RISOLUZIONE DELLA MALATE DEHYDROGENASE DA ''ARCHAEOGLOBUS FULGIDUS'' IN COMPLESSO CON NADH===


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==A proposito di questa Struttura==
2X0I è una struttura a 1 catena di sequenza di [http://en.wikipedia.org/wiki/Archaeoglobus_fulgidus Archaeoglobus fulgidus]. Dalle informazioni cristallografiche completi sono disponibili su [http://oca.weizmann.ac.il/oca-bin/ocashort?id=2X0I OCA].

==Riferimento==

<ref group="xtra">PMID:14659762</ref><references group="xtra"/>
[[Category: Archaeoglobus fulgidus]]
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[[Category: Birkeland, N K.]]
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[[Category: Tibbelin, G.]]
[[Category: Vellieux, F M.D.]]
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2x0r (Italian)

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===R207S, R292S MUTANTE DELLA MALATE DEHYDROGENASE DEL ARCHAEON ALOFILO ''HALOARCULA MARISMORTUI'' (FORMA OLO)===


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==A proposito di questa Struttura==
2X0R è una struttura a 2 catene di sequenze di [http://en.wikipedia.org/wiki/Haloarcula_marismortui Haloarcula marismortui]. Dalle informazioni cristallografiche completi sono disponibili su [http://oca.weizmann.ac.il/oca-bin/ocashort?id=1GT2 OCA].

==Riferimento==

<ref group="xtra">PMID:12581646</ref><references group="xtra"/>
[[Category: Haloarcula marismortui]]
[[Category: Malate dehydrogenase]]
[[Category: Cosenza, L W.]]
[[Category: Ebel, C.]]
[[Category: Irimia, A.]]
[[Category: Madern, D.]]
[[Category: Richard, S B.]]
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[[Category: Ion-binding]]
[[Category: Malate dehydrogenase]]
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[[Category: Protein-solvent interaction]]

2x0n (Italian)

2010-01-28T17:38:51Z

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===STRUTTURA DELLA GLYCERALDEHYDE-3-PHOSPHATE DEYDROGENASE GLICOSOMALE DI ''TRYPANOSOMA BRUCEI'' DETERMINATA A PARTIRE DI DATI LAUE===

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===STRUTTURA DELLA GLYCERALDEHYDE PHOSPHATE DEHYDROGENASE GLICOSOMALE DI ''TRYPANOSOMA BRUCEI BRUCEI'' AFFINATA AD UNA RISOLUZIONE DI 3.2 A===

{{ABSTRACT_PUBMED_15299846_(Italian)}}

Riassunto tradotto da MEDLINE®/PubMed®, una banca dati del U.S. National Library of Medicine.

==A proposito di questa Struttura==
2X0N è una struttura a 6 catene di sequenze di [http://en.wikipedia.org/wiki/Trypanosoma_brucei_brucei Trypanosoma brucei brucei]. Dalle informazioni cristallografiche completi sono disponibili su [http://oca.weizmann.ac.il/oca-bin/ocashort?id=1GGA OCA].

==Riferimenti==
<ref group="xtra">PMID:8460146</ref><references group="xtra"/>
[[Category: Trypanosoma brucei brucei]]
[[Category: Hajdu, J.]]
[[Category: Hol, W G.J.]]
[[Category: Vellieux, F M.D.]]
<ref group="xtra">PMID:15299846</ref><references group="xtra"/>
[[Category: Trypanosoma brucei brucei]]
[[Category: Hajdu, J.]]
[[Category: Hol, W G.J.]]
[[Category: Vellieux, F M.D.]]
<ref group="xtra">PMID:3625777</ref><references group="xtra"/>
[[Category: Trypanosoma brucei brucei]]
[[Category: Read, R J.]]
[[Category: Wierenga, R K.]]
[[Category: Hol, W G.J.]]
<ref group="xtra">PMID:3013612</ref><references group="xtra"/>
[[Category: Trypanosoma brucei brucei]]

2x0n (French)

2010-01-28T17:38:04Z

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===STRUCTURE DE LA GLYCERALDEHYDE-3-PHOSPHATE DESHYDROGENASE GLYCOSOMALE DE ''TRYPANOSOMA BRUCEI'' DETERMINEE A PARTIR DE DONNEES DE LAUE===

{{ABSTRACT_PUBMED_8460146_(French)}}

Résumé traduit de MEDLINE®/PubMed®, une base de données de la U.S. National Library of Medicine.

===STRUCTURE DE LA GLYCERALDEHYDE PHOSPHATE DESHYDROGENASE GLYCOSOMALE DE ''TRYPANOSOMA BRUCEI BRUCEI'' AFFINEE A UNE RESOLUTION DE 3.2 A===

{{ABSTRACT_PUBMED_15299846_(French)}}

Résumé traduit de MEDLINE®/PubMed®, une base de données de la U.S. National Library of Medicine.

==Au sujet de cette structure==
2X0N est une structure à 6 chaînes de séquences de [http://en.wikipedia.org/wiki/Trypanosoma_brucei_brucei Trypanosoma brucei brucei]. Des informations cristallographiques complètes sont disponibles sur [http://oca.weizmann.ac.il/oca-bin/ocashort?id=1GGA OCA].

==Références==
<ref group="xtra">PMID:8460146</ref><references group="xtra"/>
[[Category: Trypanosoma brucei brucei]]
[[Category: Hajdu, J.]]
[[Category: Hol, W G.J.]]
[[Category: Vellieux, F M.D.]]
<ref group="xtra">PMID:15299846</ref><references group="xtra"/>
[[Category: Trypanosoma brucei brucei]]
[[Category: Hajdu, J.]]
[[Category: Hol, W G.J.]]
[[Category: Vellieux, F M.D.]]
<ref group="xtra">PMID:3625777</ref><references group="xtra"/>
[[Category: Trypanosoma brucei brucei]]
[[Category: Read, R J.]]
[[Category: Wierenga, R K.]]
[[Category: Hol, W G.J.]]
<ref group="xtra">PMID:3013612</ref><references group="xtra"/>
[[Category: Trypanosoma brucei brucei]]

2x0s (Italian)

2010-01-28T17:37:10Z

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===STRUTTURA CRISTALLOGRAFICA A 3.0 A DI RISOLUZIONE DELLA PYRUVATE PHOSPHATE DIKINASE GLICOSOMALE DI ''TRYPANOSOMA BRUCEI''===

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==A proposito di questa struttura==
2X0S è una struttura a 1 catena di sequenza di [http://en.wikipedia.org/wiki/Trypanosoma_brucei Trypanosoma brucei]. Dalle informazioni cristallografiche completi sono disponibili su [http://ispc.weizmann.ac.il/oca-bin/ocashort?id=1H6Z OCA]. Numeri biologici appropriati per questa proteina su [http://bionumbers.hms.harvard.edu/search.aspx?log=y&task=searchbytrmorg&trm=%22Pyruvate+Pi+dikinase%22&org=%25 B10NUMB3R5]

==Riferimenti==
<ref group="xtra">PMID:12083528</ref><ref group="xtra">PMID:11092947</ref>
<ref group="xtra">PMID:9653123</ref><references group="xtra"/>
[[Category: Pyruvate, phosphate dikinase]]
[[Category: Trypanosoma brucei]]
[[Category: Baltz, T.]]
[[Category: Bringaud, F.]]
[[Category: Cosenza, L W.]]
[[Category: Vellieux, F M.D.]]
[[Category: Kinase]]
[[Category: Transferase]]
[[Category: Tropical parasite]]
[[Category: Trypanosome]]

2x0s (French)

2010-01-28T17:29:01Z

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===STRUCTURE CRISTALLOGRAPHIQUE A 3.0 A DE RÉSOLUTION DE LA PYRUVATE PHOSPHATE DIKINASE GLYCOSOMALE DE ''TRYPANOSOMA BRUCEI''===

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Résumé traduit de MEDLINE®/PubMed®, une base de données de la U.S. National Library of Medicine.

==Au sujet de cette structure==
2X0S est une structure à 1 chaîne de séquence de [http://en.wikipedia.org/wiki/Trypanosoma_brucei Trypanosoma brucei]. Des informations cristallographiques complètes sont disponibles sur [http://oca.weizmann.ac.il/oca-bin/ocashort?id=1H6Z OCA]. Numéros biologiques appropriés pour cette protéine sur [http://bionumbers.hms.harvard.edu/search.aspx?log=y&task=searchbytrmorg&trm=%22Pyruvate+Pi+dikinase%22&org=%25 B10NUMB3R5]

==Références==

<ref group="xtra">PMID:12083528</ref><ref group="xtra">PMID:11092947</ref><ref group="xtra">PMID:9653123</ref><references group="xtra"/>
[[Category: Pyruvate, phosphate dikinase]]
[[Category: Trypanosoma brucei]]
[[Category: Baltz, T.]]
[[Category: Bringaud, F.]]
[[Category: Cosenza, L W.]]
[[Category: Vellieux, F M.D.]]
[[Category: Kinase]]
[[Category: Transferase]]
[[Category: Tropical parasite]]
[[Category: Trypanosome]]

2x0r (Italian)

2010-01-28T17:24:06Z

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===R207S, R292S MUTANTE DELLA MALATE DEHYDROGENASE DEL ARCHAEON ALOFILO ''HALOARCULA MARISMORTUI'' (FORMA OLO)===


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Riassunto tradotto da MEDLINE®/PubMed®, una banca dati del U.S. National Library of Medicine.

==A proposito di questa Struttura==
1GT2 è una struttura a 2 catene di sequenze di [http://en.wikipedia.org/wiki/Haloarcula_marismortui Haloarcula marismortui]. Dalle informazioni cristallografiche completi sono disponibili su [http://oca.weizmann.ac.il/oca-bin/ocashort?id=1GT2 OCA].

==Riferimento==

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[[Category: Haloarcula marismortui]]
[[Category: Malate dehydrogenase]]
[[Category: Cosenza, L W.]]
[[Category: Ebel, C.]]
[[Category: Irimia, A.]]
[[Category: Madern, D.]]
[[Category: Richard, S B.]]
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[[Category: Zaccai, G.]]
[[Category: Halophilic]]
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[[Category: Malate dehydrogenase]]
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2x0n (Italian)

2010-01-28T16:39:27Z

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===STRUTTURA DELLA GLYCERALDEHYDE-3-PHOSPHATE DEYDROGENASE GLICOSOMALE DI ''TRYPANOSOMA BRUCEI'' DETERMINATA A PARTIRE DI DATI LAUE===

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Riassunto tradotto da MEDLINE®/PubMed®, una banca dati del U.S. National Library of Medicine.

===STRUTTURA DELLA GLYCERALDEHYDE PHOSPHATE DEHYDROGENASE GLICOSOMALE DI ''TRYPANOSOMA BRUCEI BRUCEI'' AFFINATA AD UNA RISOLUZIONE DI 3.2 A===

{{ABSTRACT_PUBMED_15299846_(Italian)}}

Riassunto tradotto da MEDLINE®/PubMed®, una banca dati del U.S. National Library of Medicine.

==A proposito di questa Struttura==
1GGA è una struttura a 6 catene di sequenze di [http://en.wikipedia.org/wiki/Trypanosoma_brucei_brucei Trypanosoma brucei brucei]. Dalle informazioni cristallografiche completi sono disponibili su [http://oca.weizmann.ac.il/oca-bin/ocashort?id=1GGA OCA].

==Riferimenti==
<ref group="xtra">PMID:8460146</ref><references group="xtra"/>
[[Category: Trypanosoma brucei brucei]]
[[Category: Hajdu, J.]]
[[Category: Hol, W G.J.]]
[[Category: Vellieux, F M.D.]]
<ref group="xtra">PMID:15299846</ref><references group="xtra"/>
[[Category: Trypanosoma brucei brucei]]
[[Category: Hajdu, J.]]
[[Category: Hol, W G.J.]]
[[Category: Vellieux, F M.D.]]
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[[Category: Trypanosoma brucei brucei]]
[[Category: Read, R J.]]
[[Category: Wierenga, R K.]]
[[Category: Hol, W G.J.]]
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[[Category: Trypanosoma brucei brucei]]

2x0n (French)

2010-01-28T16:35:10Z

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===STRUCTURE DE LA GLYCERALDEHYDE-3-PHOSPHATE DESHYDROGENASE GLYCOSOMALE DE ''TRYPANOSOMA BRUCEI'' DETERMINEE A PARTIR DE DONNEES DE LAUE===

{{ABSTRACT_PUBMED_8460146_(French)}}

Résumé traduit de MEDLINE®/PubMed®, une base de données de la U.S. National Library of Medicine.

===STRUCTURE DE LA GLYCERALDEHYDE PHOSPHATE DESHYDROGENASE GLYCOSOMALE DE ''TRYPANOSOMA BRUCEI BRUCEI'' AFFINEE A UNE RESOLUTION DE 3.2 A===

{{ABSTRACT_PUBMED_15299846_(French)}}

Résumé traduit de MEDLINE®/PubMed®, une base de données de la U.S. National Library of Medicine.

==Au sujet de cette structure==
1GGA est une structure à 6 chaînes de séquences de [http://en.wikipedia.org/wiki/Trypanosoma_brucei_brucei Trypanosoma brucei brucei]. Des informations cristallographiques complètes sont disponibles sur [http://oca.weizmann.ac.il/oca-bin/ocashort?id=1GGA OCA].

==Références==
<ref group="xtra">PMID:8460146</ref><references group="xtra"/>
[[Category: Trypanosoma brucei brucei]]
[[Category: Hajdu, J.]]
[[Category: Hol, W G.J.]]
[[Category: Vellieux, F M.D.]]
<ref group="xtra">PMID:15299846</ref><references group="xtra"/>
[[Category: Trypanosoma brucei brucei]]
[[Category: Hajdu, J.]]
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[[Category: Vellieux, F M.D.]]
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[[Category: Trypanosoma brucei brucei]]
[[Category: Read, R J.]]
[[Category: Wierenga, R K.]]
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[[Category: Trypanosoma brucei brucei]]

1ca1 (French)

2010-01-15T17:11:20Z

Fred Vellieux:

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===TOXINE ALPHA DE ''CLOSTRIDIUM PERFRINGENS''===

La toxine alpha de ''Clostridium perfringens'' est le facteur de virulence principal dans la gangrène gazeuse, et a aussi été impliquée dans la pathogenèse du syndrome de mort subite chez les jeunes animaux. La toxine est une zinc métalloenzyme de 370 résidus, qui possède une activité phospholipase C et peut se lier aux membranes en présence de calcium. La structure cristalline de l'enzyme révèle une protéine à deux domaines. Le domaine N-terminal montre une similitude structurale attendue avec la phospholipase C phosphatidylcholine-spécifique de ''Bacillus cereus'' (PC-PLC). Le domaine C-terminal montre une analogie structurale forte avec les domaines de liaison du calcium C2 eucaryotes. Nous pensons qu'il s'agit du premier exemple d'un tel domaine chez les procaryotes. Ce type de domaine peut agir comme phospholipide et/ou domaine de liaison du calcium dans les protéines second messager intracellulaires et, de manière intéressante, ces voies sont perturbées dans des cellules traitées à la toxine alpha. Finalement, un mécanisme pausible est décrit pour l'attaque de la toxine alpha sur les phospholipides empaquetés dans des membranes, ce qui rationalise sa toxicité comparée à d'autres phospholipases C homologues, non-hémolytiques.

Résumé traduit de MEDLINE®/PubMed®, une base de données de la U.S. National Library of Medicine.

==CONTEXTE==

La toxine alpha est la première toxine bactérienne dont l'activité enzymatique fut découverte en 1940 (Songer, JG, 1996; Titball, RW, 1993; Naylor, CE ''et al.'', 1998). Il s'agit d'une lécithinase (ou phospholipase de type C) et d'une sphyngomyélinase hydrolysant la phosphatydil-choline, la lécithine, les phospholipides et la sphyngomyéline (Popoff, MR, 2004; Billington, SJ ''et al.'', 1998; Lefevre, PC ''et al.'', 2003; Smith, BP, 1996; Titball, RW ''et al.'', 1999; Hirsh, DC ''et al.'', 2004). Elle possède une activité hémolytique, nécrosante et létale (Titball, RW ''et al.'', 1999; Hirsh, DC ''et al.'', 2004). La toxine alpha est sécrétée par tous les types de ''Clostridium perfringens'' et est synthétisée en phase de croissance exponentielle (Smith, BP, 1996; Songer, JG, 1996; Titball, RW ''et al.'', 1999). La toxine alpha est une protéine de poids moléculaire 43 kDa (Petit, L ''et al.'', 1999). Sa synthèse est réalisée à partir d'un précurseur comprenant un peptide signal (les premiers 28 acides aminés). La protéine mature est composée de 370 acides aminés et possède deux domaines; l'un est constitué d'hélices alpha en partie N-terminale (résidus 1-246), portion active de la toxine, l'autre est formé de deux feuillets beta, en partie C-terminale (résidus 256-370), impliqué dans la fixation membranaire (Popoff, MR, 2004). Il s'agit d'une métallo enzyme comprenant des ions Zn2+ et Ca2+ (Naylor, CE ''et al.'', 1998). Ces ions sont indispensables pour l'activité biologique: le zinc intervient dans l'activité enzymatique et le calcium intervient dans la fixation membranaire (Titball, RW ''et al.'', 1999).
Le gène qui code pour la toxine alpha est appelé ''cpa'' (encore appelé ''plc''). Il est situé sur le chromosome près de l'origine de réplication et d'initiation (Daube, G ''et al.'', 1996; Songer, JG, 1996). Sa séquence, constante dans toutes les souches identifiées, permet par conséquent de l'utiliser comme marqueur génétique de l'espèce (Petit, L ''et al.'', 1999). Le rôle de la toxine alpha consiste en une déstabilisation des membranes cellulaires. Le diacylglycérol, produit de l'hydrolyse de la lécithine par la toxine alpha, active la protéine kinase conduisant à l'activation des phospholipases C et D des cellules eucaryotes et à une cascade de réactions dues à l'acide arachidonique. Les phospholipases C et D des cellules eucaryotes engendrent la synthèse et l'attraction des molécules de l'inflammation comme les leucotriènes, les thromboxanes et les facteurs d'activation des plaquettes. Ces réactions entrainent la contraction des vaisseaux sanguins, une augmentation de la perméabilité, l'agrégation plaquettaire et un dysfonctionnement des muscles (le myocarde en particulier).
L'activité biologique de la toxine alpha se traduit par la lyse membranaires des cellules cibles comme les leucocytes ou les entérocytes (Lefevre, PC ''et al.'', 2003; Petit, L ''et al.'', 1999; Smith, BP, 1996; Minor, L & Véron, M, 1989). Des expériences ont permis de mettre en évidence ces effets pathogènes par injection intraveineuse ou intra-péritonéale de cette toxine (Bunting, M ''et al.'', 1997; Titball, RW ''et al.'', 1999). La toxine alpha possède une action hémolytique. Ceci la différencie des phospholipases A, dont l'action hémolytique s'effectue à partir de produits hémolytiques (Minor, L & Véron, M, 1989). Néanmoins ces produits interviennent dans l'activation de multiples
réactions altérant le métabolisme cellulaire conduisant à la déstabilisation des cellules (Bunting, M ''et al.'', 1997).
La toxine alpha modifie la perméabilité des endothéliums et provoque la nécrose des villosités intestinales (Smith, BP, 1996). Des études menées par Songer tendent à montrer que l'infime différence de la séquence en acides aminés de la toxine alpha, entre les toxi-infections gangréneuses et les entérotoxémies, confère à la toxine alpha une résistance particulière vis-à-vis de la chymotrypsine permettant son accumulation dans l'intestin (Songer, JG, 1996).

==Au sujet de cette Structure==
1CA1 est une structure à 1 chaîne de séquence de [http://en.wikipedia.org/wiki/Clostridium_perfringens Clostridium perfringens]. Des informations cristallographique complètes sont disponibles sur [http://oca.weizmann.ac.il/oca-bin/ocashort?id=1CA1 OCA].

==Références==
<ref group="xtra">PMID:9699639</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:8964036</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:8336671</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:9699639</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">Popoff MR. Clostridial and Bacteroides Toxins: Structure and Mode of Action. In "Strict and Facultative Anaerobes Medical and Environmental Aspects" (Nakano, MM & Zuber, P eds), Horizon Bioscience, Norfolk, 2004, pp. 171-197.</ref>
<ref group="xtra">Smith, BP. Diseases caused by ''Clostridium perfringens'' toxins, in 'Large animal internal medicine. Diseases of horses, cattle, sheep and goat' 2nd edition, Mosby, 1996, pp. 768-771</ref>
<ref group="xtra">Titball, RW, Naylor CE, Basak AK. The ''Clostridium perfringens'' alpha-toxin. Anaerobe 1999 Apr; 5(1):51-64</ref>
<ref group="xtra">Hirsh, DC, Biberstein, EL. ''Clostridium'', in "Veterinary microbiology" 2nd édition (Walker, RL, Hersh, DC, Maclachlan, NJ eds), Wiley-Blackwell, 2004, pp. 198-214</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">Petit, L, Gibert, M, Popoff, MR. ''Clostridium perfringens'': toxinotype and genotype. Trends Microbiol. 1999 Mar;
7(3):104-110</ref>
<ref group="xtra">PMID:8712513</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">Minor, L, Véron, M. ''Clostridium perfringens'' in "Bacteriologie médicale. Medicine et Sciences" 2nd edition, Flammarion, 1989, pp. 902-911</ref>
<ref group="xtra">PMID:9239403</ref><references group="xtra"/>
[[Category: Clostridium perfringens]]
[[Category: Phospholipase C]]
[[Category: Basak, A K.]]
[[Category: Naylor, C E.]]
[[Category: Titball, R W.]]
[[Category: C2 domain]]
[[Category: Ca and membrane binding]]
[[Category: Gangrene determinant]]
[[Category: Hydrolase]]
[[Category: Zinc phospholipase c]]

''Page seeded by [http://oca.weizmann.ac.il/oca OCA ] on Wed Feb 18 09:15:01 2009''

1ca1 (Italian)

2010-01-15T17:01:45Z

Fred Vellieux:

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===ALPHA-TOSSINA DEL ''CLOSTRIDIUM PERFRINGENS''===

L'alfa-tossina del ''Clostridium perfringens'' è il fattore determinante di virulenza in cancrena gassosa ed è stata anche coinvolta nella patogenesi del sindrome della morte improvvisa in animali giovani. La tossina è un enzima a metallo (zinco) di 370-residui, che ha un'attività fosfolipase C, e può legarsi alle membrane in presenza di calcio. La struttura cristallina dell'enzima rivela una proteina di due domini. Il dominio N-terminale mostra una somiglianza strutturale prevista con la fosfatidilcolina-specifica fosfolipase C di ''Bacillus cereus'' (PC-PLC). Il dominio C-terminale mostra una forte analogia strutturale al dominio di legame al calcio C2 degli eucarioti. Crediamo che questo sia il primo esempio di un tale dominio in procarioti. Questo tipo di dominio è stato trovato ad agire come un fosfolipide e/o dominio di legame al calcio obbligatorio nelle proteine secondo messaggero intracellulari e, cosa molto interessante, queste vie sono perturbati in cellule trattate con l'alfa-tossina. Infine, un possibile meccanismo è descritto per l'attaco dell alfa-tossina sui fosfolipidi
imballati nelle membrane, che razionalizza la sua tossicità rispetto ad altre fosfolipasi C omologhe non-emolitiche.

Riassunto tradotto da MEDLINE®/PubMed®, una banca dati del U.S. National Library of Medicine.

===Contesto===

La tossina alpha è la prima tossina batterica, la cui attività enzimatica è stata scoperta nel 1940 (Songer, JG 1996; Titball, RW, 1993; Naylor, CE ''et al.'', 1998). Si tratta di un lecitinase (oppure fosfolipase di tipo C) e una sfingomielinase che idrolizza le fosfatidil colina, lecitina, fosfolipidi e sfingomielina (Popoff, MR, 2005; Billington, SJ ''et al.'', 1998, Lefevre, PC ''et al.'', 2003; Smith, BP, 1996; Titball, RW ''et al.'', 1999; Hirsh, DC ''et al.'', 2004). Possiede attività emolitica, necrotizzante e letale (Titball, RW ''et al.'', 1999, Hirsh, DC ''et al.'', 2004). L'alpha tossina viene secreta da tutti i tipi di ''Clostridium perfringens''ed è sintetizzata in fase di crescita esponenziale (Smith, BP, 1996, Songer, JG, 1996; Titball, RW ''et al.'', 1999). L'alpha tossina è una proteina di peso molecolare 43 kDa (Petit, L ''et al.'', 1999). La sua sintesi inizia da un precursore costituito con un peptide segnale (i primi 28 aminoacidi). La proteina matura è composta di 370 amino acidi e comprende due domini: il dominio N-terminale è composto da eliche alfa (residui 1-246, la parte attiva della tossina), mentre l'altro dominio C-terminale è costituito da due fogli beta (residui 256-370, coinvolto nel legame alla membrana (Popoff, MR, 2004)). Si tratta di un enzima a metallo che contiene ioni Zn2+ e Ca2+ (Naylor, CE ''et al.'', 1998). Questi ioni sono essenziali per l'attività biologica: lo zinco è coinvolto in nell attività enzimatica, e il calcio è coinvolto nel legame alla membrana (Titball, RW ''et al.'', 1999).
Il gene che coda per la tossina alfa è chiamato ''cpa'' (chiamato anche ''plc''). Si trova sul cromosoma vicino l'origine di replicazione e iniziazione (Daube, G ''et al.'', 1996; Songer, JG, 1996). Sua sequenza, costante in tutti i tipi individuati, pertanto, consente di utilizzarlo come marcatore genetico della specie (Petit, L ''et al.'', 1999). Il ruolo della tossina alfa è una destabilizzazione delle membrane delle cellule. Il diacilglicerolo prodotto dalla idrolisi di lecitina dalla tossina alfa, attiva la proteina chinasi quel che porta all'attivazione delle fosfolipasi C e D delle cellule eucariote e ad una cascata di reazioni causate dal acido arachidonico. Le fosfolipasi C e D delle cellule eucarioti portano alla sintesi e a l'attrazione delle molecole dell'infiammazione come i leucotrieni, i trombossani e i fattori di attivazione piastrinica. Queste reazioni risultato nella contrazione degli vasi sanguigni, l'aumento della permeabilità, l'aggregazione piastrinica e la disfunzione del muscolo (il miocardio in particolare). L'attività biologica della tossina alfa resulta nella lisi della membrana delle cellule mirate, come i leucociti e gli enterociti (Lefevre, PC ''et al.'', 2003; Petit L ''et al'', 1999; Smith, BP, 1996, Minor, L & Véron, M, 1989). Alcuni esperimenti hanno evidenziato gli effetti patogeni di questa tossina usando iniezioni endovenosa o intra-peritoneale (Bunting, M ''et al.'', 1997; Titball, RW ''et al.'', 1999). La tossina alfa ha un'azione emolitica. Questo la mette a parte dalla fosfolipase A, la cui azione emolitica si fa a partire da prodotti emolitici (Minor, L & Véron, M, 1989). Tuttavia, questi prodotti sono coinvolti nell'attivazione di multiple reazioni di alterazione del metabolismo cellulare, quel che porta alla destabilizzazione
delle cellule (Bunting, M ''et al.'', 1997).
La tossina alfa altera la permeabilità dell'endotelio e causa la necrosi dei villi intestinali (Smith, BP, 1996). Studi realizzati da
Songer suggeriscono che la piccola differenza nella sequenza di aminoacidi della tossina alfa, tra le tossi-infezioni cancrenose e le enterotossemie, dà alla tossina alfa la sua resistenza particolare rispetto alla chimotripsina permettendo l'accumulo nell'intestino (Songer, JG, 1996).

==A proposito di questa Struttura==
1CA1 è una struttura a 1 catena di sequenza di [http://en.wikipedia.org/wiki/Clostridium_perfringens Clostridium perfringens]. Dalle informazioni cristallografiche completi sono disponibili su [http://oca.weizmann.ac.il/oca-bin/ocashort?id=1CA1 OCA].

==Riferimenti==
<ref group="xtra">PMID:9699639</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:8964036</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:8336671</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:9699639</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">Popoff MR. Clostridial and Bacteroides Toxins: Structure and Mode of Action. In "Strict and Facultative Anaerobes Medical and Environmental Aspects" (Nakano, MM & Zuber, P eds), Horizon Bioscience, Norfolk, 2004, pp. 171-197.</ref>
<ref group="xtra">Smith, BP. Diseases caused by ''Clostridium perfringens'' toxins, in "Large animal internal medicine. Diseases of horses, cattle, sheep and goat" 2nd edition, Mosby, 1996, pp. 768-771</ref>
<ref group="xtra">Titball, RW, Naylor CE, Basak AK. The ''Clostridium perfringens'' alpha-toxin. Anaerobe 1999 Apr; 5(1):51-64</ref>
<ref group="xtra">Hirsh, DC, Biberstein, EL. ''Clostridium'', in "Veterinary microbiology" 2nd édition (Walker, RL, Hersh, DC, Maclachlan, NJ eds), Wiley-Blackwell, 2004, pp. 198-214</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">Petit, L, Gibert, M, Popoff, MR. ''Clostridium perfringens'': toxinotype and genotype. Trends Microbiol. 1999 Mar;
7(3):104-110</ref>
<ref group="xtra">PMID:8712513</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">Minor, L, Véron, M. ''Clostridium perfringens'' in "Bacteriologie médicale. Medicine et Sciences" 2nd edition, Flammarion, 1989, pp. 902-911</ref>
<ref group="xtra">PMID:9239403</ref><references group="xtra"/>
[[Category: Clostridium perfringens]]
[[Category: Phospholipase C]]
[[Category: Basak, A K.]]
[[Category: Naylor, C E.]]
[[Category: Titball, R W.]]
[[Category: C2 domain]]
[[Category: Ca and membrane binding]]
[[Category: Gangrene determinant]]
[[Category: Hydrolase]]
[[Category: Zinc phospholipase c]]

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1ca1 (French)

2010-01-15T16:43:30Z

Fred Vellieux:

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===TOXINE ALPHA DE ''CLOSTRIDIUM PERFRINGENS''===

La toxine alpha de ''Clostridium perfringens'' est le facteur de virulence principal dans la gangrène gazeuse, et a aussi été impliquée dans la pathogenèse du syndrome de mort subite chez les jeunes animaux. La toxine est une zinc métalloenzyme de 370 résidus, qui possède une activité phospholipase C et peut se lier aux membranes en présence de calcium. La structure cristalline de l'enzyme révèle une protéine à deux domaines. Le domaine N-terminal montre une similitude structurale attendue avec la phospholipase C phosphatidylcholine-spécifique de ''Bacillus cereus'' (PC-PLC). Le domaine C-terminal montre une analogie structurale forte avec les domaines de liaison du calcium C2 eucaryotes. Nous pensons qu'il s'agit du premier exemple d'un tel domaine chez les procaryotes. Ce type de domaine peut agir comme phospholipide et/ou domaine de liaison du calcium dans les protéines second messager intracellulaires et, de manière intéressante, ces voies sont perturbées dans des cellules traitées à la toxine alpha. Finalement, un mécanisme pausible est décrit pour l'attaque de la toxine alpha sur les phospholipides empaquetés dans des membranes, ce qui rationalise sa toxicité comparée à d'autres phospholipases C homologues, non-hémolytiques.

Résumé traduit de MEDLINE®/PubMed®, une base de données de la U.S. National Library of Medicine.

==CONTEXTE==

La toxine alpha est la première toxine bactérienne dont l'activité enzymatique fut découverte en 1940 (Songer, JG, 1996; Titball, RW, 1993; Naylor, CE ''et al.'', 1998). Il s'agit d'une lécithinase (ou phospholipase de type C) et d'une sphyngomyélinase hydrolysant la phosphatydil-choline, la lécithine, les phospholipides et la sphyngomyéline (Popoff, MR, 2004; Billington, SJ ''et al.'', 1998; Lefevre, PC ''et al.'', 2003; Smith, BP, 1996; Titball, RW ''et al.'', 1999; Walker, RL ''et al.'', 2004). Elle possède une activité hémolytique, nécrosante et létale (Titball, RW ''et al.'', 1999; Walker, RL ''et al.'', 2004). La toxine alpha est sécrétée par tous les types de ''Clostridium perfringens'' et est synthétisée en phase de croissance exponentielle (Smith, BP, 1996; Songer, JG, 1996; Titball, RW ''et al.'', 1999). La toxine alpha est une protéine de poids moléculaire 43 kDa (Petit, L ''et al.'', 1999). Sa synthèse est réalisée à partir d'un précurseur comprenant un peptide signal (les premiers 28 acides aminés). La protéine mature est composée de 370 acides aminés et possède deux domaines; l'un est constitué d'hélices alpha en partie N-terminale (résidus 1-246), portion active de la toxine, l'autre est formé de deux feuillets beta, en partie C-terminale (résidus 256-370), impliqué dans la fixation membranaire (Popoff, MR, 2004). Il s'agit d'une métallo enzyme comprenant des ions Zn2+ et Ca2+ (Naylor, CE ''et al.'', 1998). Ces ions sont indispensables pour l'activité biologique: le zinc intervient dans l'activité enzymatique et le calcium intervient dans la fixation membranaire (Titball, RW ''et al.'', 1999).
Le gène qui code pour la toxine alpha est appelé ''cpa'' (encore appelé ''plc''). Il est situé sur le chromosome près de l'origine de réplication et d'initiation (Daube, G ''et al.'', 1996; Songer, JG, 1996). Sa séquence, constante dans toutes les souches identifiées, permet par conséquent de l'utiliser comme marqueur génétique de l'espèce (Petit, L ''et al.'', 1999). Le rôle de la toxine alpha consiste en une déstabilisation des membranes cellulaires. Le diacylglycérol, produit de l'hydrolyse de la lécithine par la toxine alpha, active la protéine kinase conduisant à l'activation des phospholipases C et D des cellules eucaryotes et à une cascade de réactions dues à l'acide arachidonique. Les phospholipases C et D des cellules eucaryotes engendrent la synthèse et l'attraction des molécules de l'inflammation comme les leucotriènes, les thromboxanes et les facteurs d'activation des plaquettes. Ces réactions entrainent la contraction des vaisseaux sanguins, une augmentation de la perméabilité, l'agrégation plaquettaire et un dysfonctionnement des muscles (le myocarde en particulier).
L'activité biologique de la toxine alpha se traduit par la lyse membranaires des cellules cibles comme les leucocytes ou les entérocytes (Lefevre, PC ''et al.'', 2003; Petit, L ''et al.'', 1999; Smith, BP, 1996; Minor, L & Véron, M, 1989). Des expériences ont permis de mettre en évidence ces effets pathogènes par injection intraveineuse ou intra-péritonéale de cette toxine (Bunting, M ''et al.'', 1997; Titball, RW ''et al.'', 1999). La toxine alpha possède une action hémolytique. Ceci la différencie des phospholipases A, dont l'action hémolytique s'effectue à partir de produits hémolytiques (Minor, L & Véron, M, 1989). Néanmoins ces produits interviennent dans l'activation de multiples
réactions altérant le métabolisme cellulaire conduisant à la déstabilisation des cellules (Bunting, M ''et al.'', 1997).
La toxine alpha modifie la perméabilité des endothéliums et provoque la nécrose des villosités intestinales (Smith, BP, 1996). Des études menées par Songer tendent à montrer que l'infime différence de la séquence en acides aminés de la toxine alpha, entre les toxi-infections gangréneuses et les entérotoxémies, confère à la toxine alpha une résistance particulière vis-à-vis de la chymotrypsine permettant son accumulation dans l'intestin (Songer, JG, 1996).

==Au sujet de cette Structure==
1CA1 est une structure à 1 chaîne de séquence de [http://en.wikipedia.org/wiki/Clostridium_perfringens Clostridium perfringens]. Des informations cristallographique complètes sont disponibles sur [http://oca.weizmann.ac.il/oca-bin/ocashort?id=1CA1 OCA].

==Références==
<ref group="xtra">PMID:9699639</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:8964036</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:8336671</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:9699639</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">Popoff MR. Clostridial and Bacteroides Toxins: Structure and Mode of Action. In "Strict and Facultative Anaerobes Medical and Environmental Aspects" (Nakano, MM & Zuber, P eds), Horizon Bioscience, Norfolk, 2004, pp. 171-197.</ref>
<ref group="xtra">Smith, BP. Diseases caused by ''Clostridium perfringens'' toxins, in 'Large animal internal medicine. Diseases of horses, cattle, sheep and goat' 2nd edition, Mosby, 1996, pp. 768-771</ref>
<ref group="xtra">Titball, RW, Naylor CE, Basak AK. The ''Clostridium perfringens'' alpha-toxin. Anaerobe 1999 Apr; 5(1):51-64</ref>
<ref group="xtra">Hirsh, DC, Biberstein, EL. ''Clostridium'', in "Veterinary microbiology" 2nd édition (Walker, RL, Hersh, DC, Maclachlan, NJ eds), Wiley-Blackwell, 2004, pp. 198-214</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">Petit, L, Gibert, M, Popoff, MR. ''Clostridium perfringens'': toxinotype and genotype. Trends Microbiol. 1999 Mar;
7(3):104-110</ref>
<ref group="xtra">PMID:8712513</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">Minor, L, Véron, M. ''Clostridium perfringens'' in "Bacteriologie médicale. Medicine et Sciences" 2nd edition, Flammarion, 1989, pp. 902-911</ref>
<ref group="xtra">PMID:9239403</ref><references group="xtra"/>
[[Category: Clostridium perfringens]]
[[Category: Phospholipase C]]
[[Category: Basak, A K.]]
[[Category: Naylor, C E.]]
[[Category: Titball, R W.]]
[[Category: C2 domain]]
[[Category: Ca and membrane binding]]
[[Category: Gangrene determinant]]
[[Category: Hydrolase]]
[[Category: Zinc phospholipase c]]

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1ca1 (French)

2010-01-15T14:07:05Z

Fred Vellieux:

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===TOXINE ALPHA DE ''CLOSTRIDIUM PERFRINGENS''===

La toxine alpha de ''Clostridium perfringens'' est le facteur de virulence principal dans la gangrène gazeuse, et a aussi été impliquée dans la pathogenèse du syndrome de mort subite chez les jeunes animaux. La toxine est une zinc métalloenzyme de 370 résidus, qui possède une activité phospholipase C et peut se lier aux membranes en présence de calcium. La structure cristalline de l'enzyme révèle une protéine à deux domaines. Le domaine N-terminal montre une similitude structurale attendue avec la phospholipase C phosphatidylcholine-spécifique de ''Bacillus cereus'' (PC-PLC). Le domaine C-terminal montre une analogie structurale forte avec les domaines de liaison du calcium C2 eucaryotes. Nous pensons qu'il s'agit du premier exemple d'un tel domaine chez les procaryotes. Ce type de domaine peut agir comme phospholipide et/ou domaine de liaison du calcium dans les protéines second messager intracellulaires et, de manière intéressante, ces voies sont perturbées dans des cellules traitées à la toxine alpha. Finalement, un mécanisme pausible est décrit pour l'attaque de la toxine alpha sur les phospholipides empaquetés dans des membranes, ce qui rationalise sa toxicité comparée à d'autres phospholipases C homologues, non-hémolytiques.

Résumé traduit de MEDLINE®/PubMed®, une base de données de la U.S. National Library of Medicine.

==CONTEXTE==

La toxine alpha est la première toxine bactérienne dont l'activité enzymatique fut découverte en 1940 (Songer JG, 1996; Titball, RW, 1993; Naylor, CE, 1998). Il s'agit d'une lécithinase (ou phospholipase de type C) et d'une sphyngomyélinase hydrolysant la phosphatydil-choline, la lécithine, les phospholipides et la sphyngomyéline (Popoff, 2005; Billington, SJ ''et al.'', 1998; Lefevre, PC ''et al.'', 2003; Smith, BP, 1996; Titball, RW ''et al.'', 1999; Walker, RL ''et al.'', 2004). Elle possède une activité hémolytique, nécrosante et létale (Titball, RW ''et al.'', 1999; Walker, RL ''et al.'', 2004). La toxine alpha est sécrétée par tous les types de ''Clostridium perfringens'' et est synthétisée en phase de croissance exponentielle (Smith, BP, 1996; Songer, JG, 1996; Titball, RW ''et al.'', 1999). La toxine alpha est une protéine de poids moléculaire 43 kDa (Petit ''et al.'', 1999). Sa synthèse est réalisée à partir d'un précurseur comprenant un peptide signal
(les premiers 28 acides aminés). La protéine mature est composée de 370 acides aminés et possède deux domaines; l'un est constitué d'hélices alpha en partie N-terminale (résidus 1-246), portion active de la toxine, l'autre est formé de deux feuillets beta, en partie C-terminale (résidus 256-370), impliqué dans la fixation membranaire (Popoff, M, 2005). Il s'agit d'une métallo enzyme comprenant des ions Zn2+ et Ca2+ (Naylor ''et al.'', 1998). Ces ions sont indispensables pour l'activité biologique: le zinc intervient dans l'activité enzymatique et le calcium intervient dans la fixation membranaire (Titball, RW ''et al.'', 1999).
Le gène qui code pour la toxine alpha est appelé ''cpa'' (encore appelé ''plc''). Il est situé sur le chromosome près de l'origine de réplication et d'initiation (Daube, G ''et al.'', 1996; Songer, JG, 1996). Sa séquence, constante dans toutes les souches identifiées, permet par conséquent de l'utiliser comme marqueur génétique de l'espèce (Petit, L ''et al.'', 1999). Le rôle de la toxine alpha consiste en une déstabilisation des membranes cellulaires. Le diacylglycérol, produit de l'hydrolyse de la lécithine par la toxine alpha, active la protéine kinase conduisant à l'activation des phospholipases C et D des cellules eucaryotes et à une cascade de réactions dues à l'acide arachidonique. Les phospholipases C et D des cellules eucaryotes engendrent la synthèse et l'attraction des molécules de l'inflammation comme les leucotriènes, les thromboxanes et les facteurs d'activation des plaquettes. Ces réactions entrainent la contraction des vaisseaux sanguins, une augmentation de la perméabilité, l'agrégation plaquettaire et un dysfonctionnement des muscles (le myocarde en particulier).
L'activité biologique de la toxine alpha se traduit par la lyse membranaires des cellules cibles comme les leucocytes ou les entérocytes (Lefevre, PC ''et al.'', 2003; Petit, L ''et al.'', 1999; Smith, BP, 1996; Minor & Véron, 1989). Des expériences ont permis de mettre en évidence ces effets pathogènes par injection intraveineuse ou intra-péritonéale de cette toxine (Bunting, M ''et al.'', 1997; Titball, RW ''et al.'', 1999). La toxine alpha possède une action hémolytique. Ceci la différencie des phospholipases A, dont l'action hémolytique s'effectue à partir de produits hémolytiques (Minor & Véron, 1989). Néanmoins ces produits interviennent dans l'activation de multiples
réactions altérant le métabolisme cellulaire conduisant à la déstabilisation des cellules (Bunting, M ''et al.'', 1997).
La toxine alpha modifie la perméabilité des endothéliums et provoque la nécrose des villosités intestinales (Smith, BP, 1996). Des études menées par Songer tendent à montrer que l'infime différence de la séquence en acides aminés de la toxine alpha, entre les toxi-infections gangréneuses et les entérotoxémies, confère à la toxine alpha une résistance particulière vis-à-vis de la chymotrypsine permettant son accumulation dans l'intestin (Songer, JG, 1996).

==Au sujet de cette Structure==
1CA1 est une structure à 1 chaîne de séquence de [http://en.wikipedia.org/wiki/Clostridium_perfringens Clostridium perfringens]. Des informations cristallographique complètes sont disponibles sur [http://oca.weizmann.ac.il/oca-bin/ocashort?id=1CA1 OCA].
==Références==
<ref group="xtra">PMID:9699639</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:8964036</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:8336671</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:9699639</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">Popoff MR. Clostridial and Bacteroides Toxins: Structure and
Mode of Action. In "Strict and Facultative Anaerobes Medical and Environmental
Aspects" (Nakano, MM & Zuber, P eds), Horizon Bioscience, Norfolk, 2004, pp.
171-197.</ref>
<ref group="xtra">Smith, BP. Diseases caused by ''Clostridium perfringens''
toxins, in Large animal internal medicine. Diseases of horses, cattle, sheep
and goat 2nd edition, Mosby, 1996, pp. 768-771</ref>
<ref group="xtra">Titball, RW, Naylor CE, Basak AK. The ''Clostridium
perfringens'' alpha-toxin. Anaerobe 1999 Apr; 5(1):51-64</ref>
<ref group="xtra">Hirsh, DC, Biberstein, EL. ''Clostridium'', in Veterinary
microbiology 2nd édition (Walker, RL, Hersh, DC, Maclachlan, NJ eds),
Wiley-Blackwell, 2004, pp. 198-214</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">Petit, L, Gibert, M, Popoff, MR. ''Clostridium
perfringens'': toxinotype and genotype. Trends Microbiol. 1999 Mar;
7(3):104-110</ref>
<ref group="xtra">PMID:8712513</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">Le Minor, L, Véron, M. ''Clostridium perfringens'' in
Bacteriologie médicale. Medicine et Sciences 2nd edition, Flammarion, 1989,
pp. 902-911</ref>
<ref group="xtra">PMID:9239403</ref><references group="xtra"/>
[[Category: Clostridium perfringens]]
[[Category: Phospholipase C]]
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[[Category: Naylor, C E.]]
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[[Category: C2 domain]]
[[Category: Ca and membrane binding]]
[[Category: Gangrene determinant]]
[[Category: Hydrolase]]
[[Category: Zinc phospholipase c]]

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1ca1 (Italian)

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Fred Vellieux:

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===ALPHA-TOSSINA DEL ''CLOSTRIDIUM PERFRINGENS''===

L'alfa-tossina del ''Clostridium perfringens'' è il fattore determinante di virulenza in cancrena gassosa ed è stata anche coinvolta nella patogenesi del sindrome della morte improvvisa in animali giovani. La tossina è un enzima a metallo (zinco) di 370-residui, che ha un'attività fosfolipase C, e può legarsi alle membrane in presenza di calcio. La struttura cristallina dell'enzima rivela una proteina di due domini. Il dominio N-terminale mostra una somiglianza strutturale prevista con la fosfatidilcolina-specifica fosfolipase C di ''Bacillus cereus'' (PC-PLC). Il dominio C-terminale mostra una forte analogia strutturale al dominio di legame al calcio C2 degli eucarioti. Crediamo che questo sia il primo esempio di un tale dominio in procarioti. Questo tipo di dominio è stato trovato ad agire come un fosfolipide e/o dominio di legame al calcio obbligatorio nelle proteine secondo messaggero intracellulari e, cosa molto interessante, queste vie sono perturbati in cellule trattate con l'alfa-tossina. Infine, un possibile meccanismo è descritto per l'attaco dell alfa-tossina sui fosfolipidi
imballati nelle membrane, che razionalizza la sua tossicità rispetto ad altre fosfolipasi C omologhe non-emolitiche.

Riassunto tradotto da MEDLINE®/PubMed®, una banca dati del U.S. National Library of Medicine.

===Contesto===

La tossina alpha è la prima tossina batterica, la cui attività enzimatica è stata scoperta nel 1940 (Songer, JG 1996; Titball, RW, 1993; Naylor, CE, 1998). Si tratta di un lecitinase (oppure fosfolipase di tipo C) e una sfingomielinase che idrolizza le fosfatidil colina, lecitina, fosfolipidi e sfingomielina (Popoff, 2005; Billington, SJ ''et al.'', 1998, Lefevre, PC ''et al.'', 2003; Smith, BP, 1996; Titball, RW ''et al.'', 1999; Walker, RL ''et al.'', 2004). Possiede attività emolitica, necrotizzante e letale (Titball, RW ''et al.'', 1999, Walker, RL ''et al.'', 2004). L'alpha tossina viene secreta da tutti i tipi di ''Clostridium perfringens''ed è sintetizzata in fase di crescita esponenziale (Smith, BP, 1996, Songer, JG, 1996; Titball, RW ''et al.'', 1999). L'alpha tossina è una proteina di peso molecolare 43 kDa (Petit ''et al.'', 1999). La sua sintesi inizia da un precursore costituito con un peptide segnale (i primi 28 aminoacidi). La proteina matura è composta di 370 amino acidi e comprende due domini: il dominio N-terminale è composto da eliche alfa (residui 1-246, la parte attiva della tossina), mentre l'altro dominio C-terminale è costituito da due fogli beta (residui 256-370, coinvolto nel legame alla membrana (Popoff, M, 2005)). Si tratta di un enzima a metallo che contiene ioni Zn2+ e Ca2+ (Naylor ''et al.'', 1998). Questi ioni sono essenziali per l'attività biologica: lo zinco è coinvolto in nell attività enzimatica, e il calcio è coinvolto nel legame alla membrana (Titball, RW
''et al.'', 1999).
Il gene che coda per la tossina alfa è chiamato ''cpa''(chiamato anche ''plc''). Si trova sul cromosoma vicino l'origine di replicazione e iniziazione (Daube, G ''et al.''1996; Songer, JG, 1996). Sua sequenza, costante in tutti i tipi individuati, pertanto, consente di utilizzarlo come marcatore genetico della specie (Small, L ''et al.'', 1999). Il ruolo della tossina alfa è una destabilizzazione delle membrane delle cellule. Il diacilglicerolo prodotto dalla idrolisi di lecitina dalla tossina alfa, attiva la proteina chinasi quel che porta all'attivazione delle fosfolipasi C e D delle cellule eucariote e ad una cascata di reazioni causate dal acido arachidonico. Le fosfolipasi C e D delle cellule eucarioti portano alla sintesi e a l'attrazione delle molecole dell'infiammazione come i leucotrieni, i trombossani e i fattori di attivazione piastrinica. Queste reazioni risultato nella contrazione degli vasi sanguigni, l'aumento della permeabilità, l'aggregazione piastrinica e la disfunzione del muscolo (il miocardio in particolare). L'attività biologica della tossina alfa resulta nella lisi della membrana delle cellule mirate, come i leucociti e gli enterociti (Lefevre, PC ''et al.'', 2003; Petit L ''et al'', 1999; Smith, BP, 1996, Minor & Véron, 1989). Alcuni esperimenti hanno evidenziato gli effetti patogeni di questa tossina usando iniezioni endovenosa o intra-peritoneale (Bunting, M ''et al.'', 1997; Titball, RW ''et al.'', 1999). La tossina alfa ha un'azione emolitica. Questo la mette a parte dalla fosfolipase A, la cui azione emolitica si fa a partire da prodotti emolitici (Minor & Véron, 1989). Tuttavia, questi prodotti sono coinvolti nell'attivazione di multiple reazioni di alterazione del metabolismo cellulare, quel che porta alla destabilizzazione
delle cellule (Bunting, M ''et al.'', 1997).
La tossina alfa altera la permeabilità dell'endotelio e causa la necrosi dei villi intestinali (Smith, BP, 1996). Studi realizzati da
Songer suggeriscono che la piccola differenza nella sequenza di aminoacidi della tossina alfa, tra le tossi-infezioni cancrenose e le enterotossemie, dà alla tossina alfa la sua resistenza particolare rispetto alla chimotripsina permettendo l'accumulo nell'intestino (Songer, JG, 1996).

==A proposito di questa Struttura==
1CA1 è una struttura a 1 catena di sequenza di [http://en.wikipedia.org/wiki/Clostridium_perfringens Clostridium perfringens]. Dalle informazioni cristallografiche completi sono disponibili su [http://oca.weizmann.ac.il/oca-bin/ocashort?id=1CA1 OCA].

==Riferimenti==
<ref group="xtra">PMID:9699639</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:8964036</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:8336671</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:9699639</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">Popoff MR. Clostridial and Bacteroides Toxins: Structure and Mode of Action. In "Strict and Facultative Anaerobes Medical and Environmental Aspects" (Nakano, MM & Zuber, P eds), Horizon Bioscience, Norfolk, 2004, pp. 171-197.</ref>
<ref group="xtra">Smith, BP. Diseases caused by ''Clostridium perfringens'' toxins, in "Large animal internal medicine. Diseases of horses, cattle, sheep and goat" 2nd edition, Mosby, 1996, pp. 768-771</ref>
<ref group="xtra">Titball, RW, Naylor CE, Basak AK. The ''Clostridium perfringens'' alpha-toxin. Anaerobe 1999 Apr; 5(1):51-64</ref>
<ref group="xtra">Hirsh, DC, Biberstein, EL. ''Clostridium'', in "Veterinary microbiology" 2nd édition (Walker, RL, Hersh, DC, Maclachlan, NJ eds), Wiley-Blackwell, 2004, pp. 198-214</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">Petit, L, Gibert, M, Popoff, MR. ''Clostridium perfringens'': toxinotype and genotype. Trends Microbiol. 1999 Mar;
7(3):104-110</ref>
<ref group="xtra">PMID:8712513</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">Le Minor, L, Véron, M. ''Clostridium perfringens'' in "Bacteriologie médicale. Medicine et Sciences" 2nd edition, Flammarion, 1989, pp. 902-911</ref>
<ref group="xtra">PMID:9239403</ref><references group="xtra"/>
[[Category: Clostridium perfringens]]
[[Category: Phospholipase C]]
[[Category: Basak, A K.]]
[[Category: Naylor, C E.]]
[[Category: Titball, R W.]]
[[Category: C2 domain]]
[[Category: Ca and membrane binding]]
[[Category: Gangrene determinant]]
[[Category: Hydrolase]]
[[Category: Zinc phospholipase c]]

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1ca1 (Italian)

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===ALPHA-TOSSINA DEL ''CLOSTRIDIUM PERFRINGENS''===

L'alfa-tossina del ''Clostridium perfringens'' è il fattore determinante di virulenza in cancrena gassosa ed è stata anche coinvolta nella patogenesi del sindrome della morte improvvisa in animali giovani. La tossina è un enzima a metallo (zinco) di 370-residui, che ha un'attività fosfolipase C, e può legarsi alle membrane in presenza di calcio. La struttura cristallina dell'enzima rivela una proteina di due domini. Il dominio N-terminale mostra una somiglianza strutturale prevista con la fosfatidilcolina-specifica fosfolipase C di ''Bacillus cereus'' (PC-PLC). Il dominio C-terminale mostra una forte analogia strutturale al dominio di legame al calcio C2 degli eucarioti. Crediamo che questo sia il primo esempio di un tale dominio in procarioti. Questo tipo di dominio è stato trovato ad agire come un fosfolipide e/o dominio di legame al calcio obbligatorio nelle proteine secondo messaggero intracellulari e, cosa molto interessante, queste vie sono perturbati in cellule trattate con l'alfa-tossina. Infine, un possibile meccanismo è descritto per l'attaco dell alfa-tossina sui fosfolipidi
imballati nelle membrane, che razionalizza la sua tossicità rispetto ad altre fosfolipasi C omologhe non-emolitiche.

Riassunto tradotto da MEDLINE®/PubMed®, una banca dati del U.S. National Library of Medicine.

===Contesto===

La tossina alpha è la prima tossina batterica, la cui attività enzimatica è stata scoperta nel 1940 (Songer, JG 1996; Titball, RW, 1993, Naylor, CE, 1998). Si tratta di un lecitinase (oppure fosfolipase di tipo C) e una sfingomielinase che idrolizza le fosfatidil colina, lecitina, fosfolipidi e sfingomielina (Popoff, 2005; Billington, SJ ''et al.'', 1998, Lefevre, PC ''et al.'', 2003; Smith, BP, 1996; Titball, RW ''et al.'', 1999; Walker, RL ''et al.'', 2004). Possiede attività emolitica, necrotizzante e letale (Titball, RW ''et al.'', 1999, Walker, RL ''et al.'', 2004). L'alpha tossina viene secreta da tutti i tipi di ''Clostridium perfringens''ed è sintetizzata in fase di crescita esponenziale (Smith, BP, 1996, Songer, JG, 1996; Titball, RW ''et al.'', 1999). L'alpha tossina è una proteina di peso molecolare 43 kDa (Petit ''et al.'', 1999). La sua sintesi inizia da un precursore costituito con un peptide segnale (i primi 28 aminoacidi). La proteina matura è composta di 370 amino acidi e comprende due domini: il dominio N-terminale è composto da eliche alfa (residui 1-246, la parte attiva della tossina), mentre l'altro dominio C-terminale è costituito da due fogli beta (residui 256-370, coinvolto nel legame alla membrana (Popoff, M, 2005)). Si tratta di un enzima a metallo che contiene ioni Zn2+ e Ca2+ (Naylor ''et al.'', 1998). Questi ioni sono essenziali per l'attività biologica: lo zinco è coinvolto in nell attività enzimatica, e il calcio è coinvolto nel legame alla membrana (Titball, RW
''et al.'', 1999).
Il gene che coda per la tossina alfa è chiamato ''cpa''(chiamato anche ''plc''). Si trova sul cromosoma vicino l'origine di replicazione e iniziazione (Daube, G ''et al.''1996; Songer, JG, 1996). Sua sequenza, costante in tutti i tipi individuati, pertanto, consente di utilizzarlo come marcatore genetico della specie (Small, L ''et al.'', 1999). Il ruolo della tossina alfa è una destabilizzazione delle membrane delle cellule. Il diacilglicerolo prodotto dalla idrolisi di lecitina dalla tossina alfa, attiva la proteina chinasi quel che porta all'attivazione delle fosfolipasi C e D delle cellule eucariote e ad una cascata di reazioni causate dal acido arachidonico. Le fosfolipasi C e D delle cellule eucarioti portano alla sintesi e a l'attrazione delle molecole dell'infiammazione come i leucotrieni, i trombossani e i fattori di attivazione piastrinica. Queste reazioni risultato nella contrazione degli vasi sanguigni, l'aumento della permeabilità, l'aggregazione piastrinica e la disfunzione del muscolo (il miocardio in particolare). L'attività biologica della tossina alfa resulta nella lisi della membrana delle cellule mirate, come i leucociti e gli enterociti (Lefevre, PC ''et al.'', 2003; Petit L ''et al'', 1999; Smith, BP, 1996, Minor & Véron, 1989). Alcuni esperimenti hanno evidenziato gli effetti patogeni di questa tossina usando iniezioni endovenosa o intra-peritoneale (Bunting, M ''et al.'', 1997; Titball, RW ''et al.'', 1999). La tossina alfa ha un'azione emolitica. Questo la mette a parte dalla fosfolipase A, la cui azione emolitica si fa a partire da prodotti emolitici (Minor & Véron, 1989). Tuttavia, questi prodotti sono coinvolti nell'attivazione di multiple reazioni di alterazione del metabolismo cellulare, quel che porta alla destabilizzazione
delle cellule (Bunting, M ''et al.'', 1997).
La tossina alfa altera la permeabilità dell'endotelio e causa la necrosi dei villi intestinali (Smith, BP, 1996). Studi realizzati da
Songer suggeriscono che la piccola differenza nella sequenza di aminoacidi della tossina alfa, tra le tossi-infezioni cancrenose e le enterotossemie, dà alla tossina alfa la sua resistenza particolare rispetto alla chimotripsina permettendo l'accumulo nell'intestino (Songer, JG, 1996).

==A proposito di questa Struttura==
1CA1 è una struttura a 1 catena di sequenza di [http://en.wikipedia.org/wiki/Clostridium_perfringens Clostridium perfringens]. Dalle informazioni cristallografiche completi sono disponibili su [http://oca.weizmann.ac.il/oca-bin/ocashort?id=1CA1 OCA].

==Riferimenti==
<ref group="xtra">PMID:9699639</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:8964036</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:8336671</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:9699639</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">Popoff MR. Clostridial and Bacteroides Toxins: Structure and Mode of Action. In "Strict and Facultative Anaerobes Medical and Environmental Aspects" (Nakano, MM & Zuber, P eds), Horizon Bioscience, Norfolk, 2004, pp. 171-197.</ref>
<ref group="xtra">Smith, BP. Diseases caused by ''Clostridium perfringens'' toxins, in "Large animal internal medicine. Diseases of horses, cattle, sheep and goat" 2nd edition, Mosby, 1996, pp. 768-771</ref>
<ref group="xtra">Titball, RW, Naylor CE, Basak AK. The ''Clostridium perfringens'' alpha-toxin. Anaerobe 1999 Apr; 5(1):51-64</ref>
<ref group="xtra">Hirsh, DC, Biberstein, EL. ''Clostridium'', in "Veterinary microbiology" 2nd édition (Walker, RL, Hersh, DC, Maclachlan, NJ eds), Wiley-Blackwell, 2004, pp. 198-214</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">Petit, L, Gibert, M, Popoff, MR. ''Clostridium perfringens'': toxinotype and genotype. Trends Microbiol. 1999 Mar;
7(3):104-110</ref>
<ref group="xtra">PMID:8712513</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">Le Minor, L, Véron, M. ''Clostridium perfringens'' in "Bacteriologie médicale. Medicine et Sciences" 2nd edition, Flammarion, 1989, pp. 902-911</ref>
<ref group="xtra">PMID:9239403</ref><references group="xtra"/>
[[Category: Clostridium perfringens]]
[[Category: Phospholipase C]]
[[Category: Basak, A K.]]
[[Category: Naylor, C E.]]
[[Category: Titball, R W.]]
[[Category: C2 domain]]
[[Category: Ca and membrane binding]]
[[Category: Gangrene determinant]]
[[Category: Hydrolase]]
[[Category: Zinc phospholipase c]]

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{{STRUCTURE_1ca1| PDB=1ca1 | SCENE= }}

===ALPHA-TOSSINA DEL ''CLOSTRIDIUM PERFRINGENS''===

L'alfa-tossina del ''Clostridium perfringens'' è il fattore determinante di virulenza in cancrena gassosa ed è stata anche coinvolta nella patogenesi del sindrome della morte improvvisa in animali giovani. La tossina è un enzima a metallo (zinco) di 370-residui, che ha un'attività fosfolipase C, e può legarsi alle membrane in presenza di calcio. La struttura cristallina dell'enzima rivela una proteina di due domini. Il dominio N-terminale mostra una somiglianza strutturale prevista con la fosfatidilcolina-specifica fosfolipase C di ''Bacillus cereus'' (PC-PLC). Il dominio C-terminale mostra una forte analogia strutturale al dominio di legame al calcio C2 degli eucarioti. Crediamo che questo sia il primo esempio di un tale dominio in procarioti. Questo tipo di dominio è stato trovato ad agire come un fosfolipide e/o dominio di legame al calcio obbligatorio nelle proteine secondo messaggero intracellulari e, cosa molto interessante, queste vie sono perturbati in cellule trattate con l'alfa-tossina. Infine, un possibile meccanismo è descritto per l'attaco dell alfa-tossina sui fosfolipidi
imballati nelle membrane, che razionalizza la sua tossicità rispetto ad altre fosfolipasi C omologhe non-emolitiche.

Riassunto tradotto da MEDLINE®/PubMed®, una banca dati del U.S. National Library of Medicine.

===Contesto===

La tossina alpha è la prima tossina batterica, la cui attività enzimatica è stata scoperta nel 1940 (Songer, JG 1996; Titball, RW, 1993, Naylor, CE, 1998). Si tratta di un lecitinase (oppure fosfolipase di tipo C) e una sfingomielinase che idrolizza le fosfatidil colina, lecitina, fosfolipidi e sfingomielina (Popoff, 2005; Billington, SJ ''et al.'', 1998, Lefevre, PC ''et al.'', 2003; Smith, BP, 1996; Titball, RW ''et al.'', 1999 Walker, RL ''et al.'', 2004). Possiede attività emolitica, necrotizzante e letale (Titball, RW ''et al.'', 1999, Walker, RL ''et al.'', 2004). L'alpha tossina viene secreta da tutti i tipi di ''Clostridium perfringens''ed è sintetizzata in fase di crescita esponenziale (Smith, BP, 1996, Songer, JG, 1996; Titball, RW ''et al.'', 1999). L'alpha tossina è una proteina di peso molecolare 43 kDa (Petit ''et al.'', 1999). La sua sintesi inizia da un precursore costituito con un peptide segnale (i primi 28 aminoacidi). La proteina matura è composta di 370 amino acidi e comprende due domini: il dominio N-terminale è composto da eliche alfa (residui 1-246, la parte attiva della tossina), mentre l'altro dominio C-terminale è costituito da due fogli beta (residui 256-370, coinvolto nel legame alla membrana (Popoff, M, 2005)). Si tratta di un enzima a metallo che contiene ioni Zn2+ e Ca2+ (Naylor ''et al.'', 1998). Questi ioni sono essenziali per l'attività biologica: lo zinco è coinvolto in nell attività enzimatica, e il calcio è coinvolto nel legame alla membrana (Titball, RW
''et al.'', 1999).
Il gene che coda per la tossina alfa è chiamato ''cpa''(chiamato anche ''plc''). Si trova sul cromosoma vicino l'origine di replicazione e iniziazione (Daube, G ''et al.''1996; Songer, JG, 1996). Sua sequenza, costante in tutti i tipi individuati, pertanto, consente di utilizzarlo come marcatore genetico della specie (Small, L ''et al.'', 1999). Il ruolo della tossina alfa è una destabilizzazione delle membrane delle cellule. Il diacilglicerolo prodotto dalla idrolisi di lecitina dalla tossina alfa, attiva la proteina chinasi quel che porta all'attivazione delle fosfolipasi C e D delle cellule eucariote e ad una cascata di reazioni causate dal acido arachidonico. Le fosfolipasi C e D delle cellule eucarioti portano alla sintesi e a l'attrazione delle molecole dell'infiammazione come i leucotrieni, i trombossani e i fattori di attivazione piastrinica. Queste reazioni risultato nella contrazione degli vasi sanguigni, l'aumento della permeabilità, l'aggregazione piastrinica e la disfunzione del muscolo (il miocardio in particolare). L'attività biologica della tossina alfa resulta nella lisi della membrana delle cellule mirate, come i leucociti e gli enterociti (Lefevre, PC ''et al.'', 2003; Petit L ''et al'', 1999; Smith, BP, 1996, Minor & Véron, 1989). Alcuni esperimenti hanno evidenziato gli effetti patogeni di questa tossina usando iniezioni endovenosa o intra-peritoneale (Bunting, M ''et al.'', 1997; Titball, RW ''et al.'', 1999). La tossina alfa ha un'azione emolitica. Questo la mette a parte dalla fosfolipase A, la cui azione emolitica si fa a partire da prodotti emolitici (Minor & Véron, 1989). Tuttavia, questi prodotti sono coinvolti nell'attivazione di multiple reazioni di alterazione del metabolismo cellulare, quel che porta alla destabilizzazione
delle cellule (Bunting, M ''et al.'', 1997).
La tossina alfa altera la permeabilità dell'endotelio e causa la necrosi dei villi intestinali (Smith, BP, 1996). Studi realizzati da
Songer suggeriscono che la piccola differenza nella sequenza di aminoacidi della tossina alfa, tra le tossi-infezioni cancrenose e le enterotossemie, dà alla tossina alfa la sua resistenza particolare rispetto alla chimotripsina permettendo l'accumulo nell'intestino (Songer, JG, 1996).

==A proposito di questa Struttura==
1CA1 è una struttura a 1 catena di sequenza di [http://en.wikipedia.org/wiki/Clostridium_perfringens Clostridium perfringens]. Dalle informazioni cristallografiche completi sono disponibili su [http://oca.weizmann.ac.il/oca-bin/ocashort?id=1CA1 OCA].

==Riferimenti==
<ref group="xtra">PMID:9699639</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:8964036</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:8336671</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:9699639</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">Popoff MR. Clostridial and Bacteroides Toxins: Structure and Mode of Action. In "Strict and Facultative Anaerobes Medical and Environmental Aspects" (Nakano, MM & Zuber, P eds), Horizon Bioscience, Norfolk, 2004, pp. 171-197.</ref>
<ref group="xtra">Smith, BP. Diseases caused by ''Clostridium perfringens'' toxins, in Large animal internal medicine. Diseases of horses, cattle, sheep and goat 2nd edition, Mosby, 1996, pp. 768-771</ref>
<ref group="xtra">Titball, RW, Naylor CE, Basak AK. The ''Clostridium perfringens'' alpha-toxin. Anaerobe 1999 Apr; 5(1):51-64</ref>
<ref group="xtra">Hirsh, DC, Biberstein, EL. ''Clostridium'', in Veterinary microbiology 2nd édition (Walker, RL, Hersh, DC, Maclachlan, NJ eds), Wiley-Blackwell, 2004, pp. 198-214</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">Petit, L, Gibert, M, Popoff, MR. ''Clostridium perfringens'': toxinotype and genotype. Trends Microbiol. 1999 Mar;
7(3):104-110</ref>
<ref group="xtra">PMID:8712513</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">Le Minor, L, Véron, M. ''Clostridium perfringens'' in Bacteriologie médicale. Medicine et Sciences 2nd edition, Flammarion, 1989, pp. 902-911</ref>
<ref group="xtra">PMID:9239403</ref><references group="xtra"/>
[[Category: Clostridium perfringens]]
[[Category: Phospholipase C]]
[[Category: Basak, A K.]]
[[Category: Naylor, C E.]]
[[Category: Titball, R W.]]
[[Category: C2 domain]]
[[Category: Ca and membrane binding]]
[[Category: Gangrene determinant]]
[[Category: Hydrolase]]
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===ALPHA-TOSSINA DEL ''CLOSTRIDIUM PERFRINGENS''===

L'alfa-tossina del ''Clostridium perfringens'' è il fattore determinante di virulenza in
cancrena gassosa ed è stata anche coinvolta nella patogenesi del sindrome
della morte improvvisa in animali giovani. La tossina è un enzima a metallo
(zinco) di 370-residui, che ha un'attività fosfolipase C, e può legarsi alle
membrane in presenza di calcio. La struttura cristallina dell'enzima rivela
una proteina di due domini. Il dominio N-terminale mostra una somiglianza
strutturale prevista con la fosfatidilcolina-specifica fosfolipase C
di ''Bacillus cereus'' (PC-PLC). Il dominio C-terminale mostra una forte analogia
strutturale al dominio di legame al calcio C2 degli eucarioti. Crediamo che questo
sia il primo esempio di un tale dominio in procarioti. Questo tipo di dominio
è stato trovato ad agire come un fosfolipide e/o dominio di legame al calcio obbligatorio
nelle proteine secondo messaggero intracellulari e, cosa molto interessante,
queste vie sono perturbati in cellule trattate con l'alfa-tossina. Infine, un
possibile meccanismo è descritto per l'attaco dell alfa-tossina sui fosfolipidi
imballati nelle membrane, che razionalizza la sua tossicità rispetto ad altre
fosfolipasi C omologhe non-emolitiche.

Riassunto tradotto da MEDLINE®/PubMed®, una banca dati del U.S. National
Library of Medicine.

===Contesto===

La tossina alpha è la prima tossina batterica, la cui attività enzimatica
è stata scoperta nel 1940 (JG Songer, 1996; Titball, RW, 1993, Naylor, CE,
1998). Si tratta di un lecitinase (oppure fosfolipase di tipo C) e una
sfingomielinase che idrolizza le fosfatidil colina, lecitina,
fosfolipidi e sfingomielina (Popoff, 2005; Billington, SJ ''et al.'',
1998, Lefevre, PC ''et al.'', 2003; Smith, BP, 1996; Titball, RW ''et al.'',
1999 Walker, RL ''et al.'', 2004). Possiede attività emolitica, necrotizzante
e letale (Titball, RW ''et al.'', 1999, Walker, RL ''et al.'',
2004). L'alpha tossina viene secreta da tutti i tipi di ''Clostridium
perfringens''and è sintetizzata in fase di crescita esponenziale (Smith,
BP, 1996, Songer, JG, 1996; Titball, RW ''et al.'', 1999). L'alpha tossina
è una proteina di peso molecolare 43 kDa (Petit ''et al.'', 1999). La sua
sintesi inizia da un precursore costituito con un peptide segnale
(i primi 28 aminoacidi). La proteina matura è composta di 370 amino
acidi e comprende due domini: il dominio N-terminale è composto da eliche alfa
(residui 1-246, la parte attiva della tossina), mentre l'altro dominio
C-terminale è costituito da due fogli beta (residui 256-370, coinvolto
nel legame alla membrana (Popoff, M, 2005)). Si tratta di un enzima a metallo
che contiene ioni Zn2+ e Ca2+ (Naylor ''et al.'', 1998). Questi ioni sono
essenziali per l'attività biologica: lo zinco è coinvolto in nell attività
enzimatica, e il calcio è coinvolto nel legame alla membrana (Titball, RW
''et al.'', 1999).
Il gene che coda per la tossina alfa è chiamato ''cpa''(chiamato anche
''plc''). Si trova sul cromosoma vicino l'origine di replicazione e
iniziazione (Daube, G ''et al.''1996; Songer, JG, 1996). Sua sequenza,
costante in tutti i tipi individuati, pertanto, consente di
utilizzarlo come marcatore genetico della specie (Small, L ''et al.'', 1999).
Il ruolo della tossina alfa è una destabilizzazione delle membrane delle
cellule. Il diacilglicerolo prodotto dalla idrolisi di lecitina dalla
tossina alfa, attiva la proteina chinasi quel che porta all'attivazione delle
fosfolipasi C e D delle cellule eucariote e ad una cascata di reazioni
causate dal acido arachidonico. Le fosfolipasi C e D delle cellule
eucarioti portano alla sintesi e a l'attrazione delle molecole
dell'infiammazione come i leucotrieni, i trombossani e i fattori di
attivazione piastrinica. Queste reazioni risultato nella contrazione
degli vasi sanguigni, l'aumento della permeabilità, l'aggregazione
piastrinica e la disfunzione del muscolo (il miocardio in particolare).
L'attività biologica della tossina alfa resulta nella lisi della membrana
delle cellule mirate, come i leucociti e gli enterociti (Lefevre, PC ''et
al.'', 2003; Petit L ''et al'', 1999; Smith, BP, 1996, Minor & Véron, 1989).
Alcuni esperimenti hanno evidenziato gli effetti patogeni di questa tossina
usando iniezioni endovenosa o intra-peritoneale (Bunting, M ''et al.'',
1997; Titball, RW ''et al.'', 1999). La tossina alfa ha un'azione
emolitica. Questo la mette a parte dalla fosfolipase A, la cui azione
emolitica si fa a partire da prodotti emolitici (Minor & Véron,
1989). Tuttavia, questi prodotti sono coinvolti nell'attivazione di multiple
reazioni di alterazione del metabolismo cellulare, quel che porta alla destabilizzazione
delle cellule (Bunting, M ''et al.'', 1997).
La tossina alfa altera la permeabilità dell'endotelio e causa la
necrosi dei villi intestinali (Smith, BP, 1996). Studi realizzati da
Songer suggeriscono che la piccola differenza nella sequenza di aminoacidi
della tossina alfa, tra le tossi-infezioni cancrenose e le
enterotossemie, dà alla tossina alfa la sua resistenza particolare
rispetto alla chimotripsina permettendo l'accumulo nell'intestino
(Songer, JG, 1996).

==A proposito di questa Struttura==
1CA1 è una struttura a 1 catena di sequenza di [http://en.wikipedia.org/wiki/Clostridium_perfringens Clostridium perfringens]. Dalle informazioni cristallografiche completi sono disponibili su [http://oca.weizmann.ac.il/oca-bin/ocashort?id=1CA1 OCA].

==Riferimenti==
<ref group="xtra">PMID:9699639</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:8964036</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:8336671</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:9699639</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">Popoff MR. Clostridial and Bacteroides Toxins: Structure and Mode of Action. In "Strict and Facultative Anaerobes Medical and Environmental Aspects" (Nakano, MM & Zuber, P eds), Horizon Bioscience, Norfolk, 2004, pp. 171-197.</ref>
<ref group="xtra">Smith, BP. Diseases caused by ''Clostridium perfringens'' toxins, in Large animal internal medicine. Diseases of horses, cattle, sheep and goat 2nd edition, Mosby, 1996, pp. 768-771</ref>
<ref group="xtra">Titball, RW, Naylor CE, Basak AK. The ''Clostridium perfringens'' alpha-toxin. Anaerobe 1999 Apr; 5(1):51-64</ref>
<ref group="xtra">Hirsh, DC, Biberstein, EL. ''Clostridium'', in Veterinary microbiology 2nd édition (Walker, RL, Hersh, DC, Maclachlan, NJ eds), Wiley-Blackwell, 2004, pp. 198-214</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">Petit, L, Gibert, M, Popoff, MR. ''Clostridium perfringens'': toxinotype and genotype. Trends Microbiol. 1999 Mar;
7(3):104-110</ref>
<ref group="xtra">PMID:8712513</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">Le Minor, L, Véron, M. ''Clostridium perfringens'' in Bacteriologie médicale. Medicine et Sciences 2nd edition, Flammarion, 1989, pp. 902-911</ref>
<ref group="xtra">PMID:9239403</ref><references group="xtra"/>
[[Category: Clostridium perfringens]]
[[Category: Phospholipase C]]
[[Category: Basak, A K.]]
[[Category: Naylor, C E.]]
[[Category: Titball, R W.]]
[[Category: C2 domain]]
[[Category: Ca and membrane binding]]
[[Category: Gangrene determinant]]
[[Category: Hydrolase]]
[[Category: Zinc phospholipase c]]

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===TOXINE ALPHA DE ''CLOSTRIDIUM PERFRINGENS''===

La toxine alpha de ''Clostridium perfringens'' est le facteur de virulence
principal dans la gangrène gazeuse, et a aussi été impliquée dans la
pathogenèse du syndrome de mort subite chez les jeunes animaux. La toxine est
une zinc métalloenzyme de 370 résidus, qui possède une activité phospholipase
C et peut se lier aux membranes en présence de calcium. La structure
cristalline de l'enzyme révèle une protéine à deux domaines. Le domaine
N-terminal montre une similitude structurale attendue avec la phospholipase C
phosphatidylcholine-spécifique de ''Bacillus cereus'' (PC-PLC). Le domaine
C-terminal montre une analogie structurale forte avec les domaines de liaison
du calcium C2 eucaryotes. Nous pensons qu'il s'agit du premier exemple d'un
tel domaine chez les procaryotes. Ce type de domaine peut agir comme
phospholipide et/ou domaine de liaison du calcium dans les protéines second
messager intracellulaires et, de manière intéressante, ces voies sont
perturbées dans des cellules traitées à la toxine alpha. Finalement, un
mécanisme plausible est décrit pour l'attaque de la toxine alpha sur les
phospholipides empaquetés dans des membranes, ce qui rationalise sa toxicité
comparée à d'autres phospholipases C homologues, non-hémolytiques.

Résumé traduit de MEDLINE®/PubMed®, une base de données de la U.S. National
Library of Medicine.

==CONTEXTE==

La toxine alpha est la première toxine bactérienne dont l'activité enzymatique
fut découverte en 1940 (Songer JG, 1996; Titball, RW, 1993; Naylor, CE, 1998).
Il s'agit d'une lécithinase (ou phospholipase de type C) et d'une
sphyngomyélinase hydrolysant la phosphatydil-choline, la lécithine, les
phospholipides et la sphyngomyéline (Popoff, 2005; Billington, SJ ''et al.'',
1998; Lefevre, PC ''et al.'', 2003; Smith, BP, 1996; Titball, RW ''et al.'',
1999; Walker, RL ''et al.'', 2004). Elle possède une activité hémolytique,
nécrosante et létale (Titball, RW ''et al.'', 1999; Walker, RL ''et al.'',
2004). La toxine alpha est sécrétée par tous les types de ''Clostridium
perfringens'' et est synthétisée en phase de croissance exponentielle (Smith,
BP, 1996; Songer, JG, 1996; Titball, RW ''et al.'', 1999). La toxine alpha
est une protéine de poids moléculaire 43 kDa (Petit ''et al.'', 1999). Sa
synthèse est réalisée à partir d'un précurseur comprenant un peptide signal
(les premiers 28 acides aminés). La protéine mature est composée de 370 acides
aminés et possède deux domaines; l'un est constitué d'hélices alpha en
partie N-terminale (résidus 1-246), portion active de la toxine, l'autre est
formé de deux feuillets beta, en partie C-terminale (résidus 256-370), impliqué
dans la fixation membranaire (Popoff, M, 2005). Il s'agit d'une métallo enzyme
comprenant des ions Zn2+ et Ca2+ (Naylor ''et al.'', 1998). Ces ions sont
indispensables pour l'activité biologique: le zinc intervient dans l'activité
enzymatique et le calcium intervient dans la fixation membranaire (Titball, RW
''et al.'', 1999).
Le gène qui code pour la toxine alpha est appelé ''cpa'' (encore appelé
''plc''). Il est situé sur le chromosome près de l'origine de réplication et
d'initiation (Daube, G ''et al.'', 1996; Songer, JG, 1996). Sa séquence,
constante dans toutes les souches identifiées, permet par conséquent de
l'utiliser comme marqueur génétique de l'espèce (Petit, L ''et al.'', 1999).
Le rôle de la toxine alpha consiste en une déstabilisation des membranes
cellulaires. Le diacylglycérol, produit de l'hydrolyse de la lécithine par la
toxine alpha, active la protéine kinase conduisant à l'activation des
phospholipases C et D des cellules eucaryotes et à une cascade de réactions
dues à l'acide arachidonique. Les phospholipases C et D des cellules
eucaryotes engendrent la synthèse et l'attraction des molécules de
l'inflammation comme les leucotriènes, les thromboxanes et les facteurs
d'activation des plaquettes. Ces réactions entrainent la contraction des
vaisseaux sanguins, une augmentation de la perméabilité, l'agrégation
plaquettaire et un dysfonctionnement des muscles (le myocarde en particulier).
L'activité biologique de la toxine alpha se traduit par la lyse membranaires
des cellules cibles comme les leucocytes ou les entérocytes (Lefevre, PC ''et al.'', 2003; Petit, L ''et al.'', 1999; Smith, BP, 1996; Minor & Véron, 1989). Des expériences ont permis de mettre en évidence ces effets pathogènes par
injection intraveineuse ou intra-péritonéale de cette toxine (Bunting, M ''et
al.'', 1997; Titball, RW ''et al.'', 1999). La toxine alpha possède une action
hémolytique. Ceci la différencie des phospholipases A, dont l'action
hémolytique s'effectue à partir de produits hémolytiques (Minor & Véron,
1989). Néanmoins ces produits interviennent dans l'activation de multiples
réactions altérant le métabolisme cellulaire conduisant à la déstabilisation
des cellules (Bunting, M ''et al.'', 1997).
La toxine alpha modifie la perméabilité des endothéliums et provoque la
nécrose des villosités intestinales (Smith, BP, 1996). Des études menées par
Songer tendent à montrer que l'infime différence de la séquence en acides
aminés de la toxine alpha, entre les toxi-infections gangréneuses et les
entérotoxémies, confère à la toxine alpha une résistance particulière
vis-à-vis de la chymotrypsine permettant son accumulation dans l'intestin
(Songer, JG, 1996).

==Au sujet de cette Structure==
1CA1 est une structure à 1 chaîne de séquence de [http://en.wikipedia.org/wiki/Clostridium_perfringens Clostridium perfringens]. Des informations cristallographique complètes sont disponibles sur [http://oca.weizmann.ac.il/oca-bin/ocashort?id=1CA1 OCA].
==Références==
<ref group="xtra">PMID:9699639</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:8964036</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:8336671</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:9699639</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">Popoff MR. Clostridial and Bacteroides Toxins: Structure and
Mode of Action. In "Strict and Facultative Anaerobes Medical and Environmental
Aspects" (Nakano, MM & Zuber, P eds), Horizon Bioscience, Norfolk, 2004, pp.
171-197.</ref>
<ref group="xtra">Smith, BP. Diseases caused by ''Clostridium perfringens''
toxins, in Large animal internal medicine. Diseases of horses, cattle, sheep
and goat 2nd edition, Mosby, 1996, pp. 768-771</ref>
<ref group="xtra">Titball, RW, Naylor CE, Basak AK. The ''Clostridium
perfringens'' alpha-toxin. Anaerobe 1999 Apr; 5(1):51-64</ref>
<ref group="xtra">Hirsh, DC, Biberstein, EL. ''Clostridium'', in Veterinary
microbiology 2nd édition (Walker, RL, Hersh, DC, Maclachlan, NJ eds),
Wiley-Blackwell, 2004, pp. 198-214</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">Petit, L, Gibert, M, Popoff, MR. ''Clostridium
perfringens'': toxinotype and genotype. Trends Microbiol. 1999 Mar;
7(3):104-110</ref>
<ref group="xtra">PMID:8712513</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">Le Minor, L, Véron, M. ''Clostridium perfringens'' in
Bacteriologie médicale. Medicine et Sciences 2nd edition, Flammarion, 1989,
pp. 902-911</ref>
<ref group="xtra">PMID:9239403</ref><references group="xtra"/>
[[Category: Clostridium perfringens]]
[[Category: Phospholipase C]]
[[Category: Basak, A K.]]
[[Category: Naylor, C E.]]
[[Category: Titball, R W.]]
[[Category: C2 domain]]
[[Category: Ca and membrane binding]]
[[Category: Gangrene determinant]]
[[Category: Hydrolase]]
[[Category: Zinc phospholipase c]]

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1uyj (French)

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Fred Vellieux:

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{{STRUCTURE_1uyj | PDB=1uyj | SCENE= }}
=== LA TOXINE EPSILON DE ''CLOSTRIDIUM PERFRINGENS'' MONTRE UNE SIMILARITE STRUCTURELLE AVEC LA TOXINE FORMEUSE DE PORE AEROLYSINE ===

{{ABSTRACT_PUBMED_15258571_(French)}}

Résumé traduit de MEDLINE®/PubMed®, une base de données de la U.S. National Library of Medicine.

==CONTEXTE==

La toxine epsilon est produite par ''Clostridium perfringens'' de types B et D (Hunter, SE ''et al.'' 1992; Goswami, PP ''et al.'' 1996). Elle est sécrétée sous une forme de prototoxine inactive de 331 acides aminés, de poids moléculaire 33 kDa (Hunter, SE ''et al.'' 1992).

L’activation de la prototoxine peut être réalisée, soit par les protéases synthétisées par la bactérie elle-même comme l’alpha-chymotrypsine et la protéase lambda, soit par certaines enzymes protéolytiques du tube digestif, telles que la trypsine. La protéase lambda agit du coté N-terminal en libérant un peptide de 11 acides aminés et un résidu de 29 acides aminés du coté C-terminal, tandis que la trypsine et l’alpha-chymotrypsine libèrent un résidu de 13 acides aminés de l’extrémité N-terminale et un résidu de 29 acides aminés de l’extrémité C-terminale (Popoff, MR 2004). Cette digestion protéolytique donne la forme active de la toxine epsilon qui est une forme létale, de poids moléculaire 29 KDa. Cette activation s’accompagne d’une légère modification des conformation et point isoélectrique (pI) de la toxine. La prototoxine et la toxine epsilon sont antigénétiquement identiques (Habeeb, AF 1969, 1975; Habeeb, AF ''et al.'' 1973), ce qui confirme que le peptide perdu n’est pas un déterminant antigénique de la molécule. La structure tridimensionnelle de la prototoxine est formée essentiellement de feuillets beta, alors que celle de la toxine est légèrement transformée en hélice alpha mais avec prédominance de la conformation beta (Habeeb, AF ''et al.'' 1973). Il a été démontré que la structure de la toxine epsilon possède une structure similaire à celle de l’aerolysine d’''Aeromonas hydrophila'' (Cole, AR ''et al.'' 2004).

La toxine epsilon est codée par le gène etx, porté par un plasmide (de taille supérieure à 100 Kb, Hunter, SE ''et al.'' 1992) transférable horizontalement d’une souche à une autre (Frey J, 2003; Songer, JG 1996; Walker, RL ''et al.'' 2004). C’est un gène transposon (Daube, G ''et al.'', 1996). Ce gène a été séquencé chez les deux types B et D (Havard, HL ''et al.'' 1992; Hunter, SE ''et al.'' 1992). La comparaison entre les deux séquences des gènes etxB et etxD montre une différence de deux nucléotides dans la partie codante ce qui a provoqué la substitution d’un acide aminé (Havard, HL ''et al.'' 1992).

La toxine epsilon est le facteur le plus virulent chez ''Clostridium perfringens'' de type D; elle interagit avec les cellules vasculaires endothéliales, provoquant une augmentation de la perméabilité des vaisseaux en endommageant directement l’endothélium ce qui amène à une perte de fluide et l’apparition d’oedème notamment du poumon, coeur, reins et cerveau (Lefevre, PC ''et al.'' 2003 ; Walker, RL ''et al.'' 2004). La toxine epsilon est une toxine puissante qui est responsable de l'entérotoxémie ovine fatale, de la maladie du rein pulpeux et de la dysenterie de l’agneau.

==Au sujet de cette structure==
1UYJ est une structure à 3 chaînes de séquences de [http://en.wikipedia.org/wiki/Clostridium_perfringens Clostridium perfringens]. Des informations cristallographique complètes sont disponibles sur [http://oca.weizmann.ac.il/oca-bin/ocashort?Id=1UYJ OCA].

==Références==
<ref group="xtra">PMID:15258571</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:1729175</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:8831683</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">Popoff MR. Clostridial and Bacteroides Toxins: Structure and Mode of Action. In "Strict and Facultative
Anaerobes Medical and Environmental Aspects" (Nakano, MM & Zuber, P eds), Horizon Bioscience, Norfolk 2004, pp. 171-197.</ref>
<ref group="xtra">PMID:4305163</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:4358084</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:172146</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">Frey J. Toxines clostridiennes : pathogénie, implications cliniques, diagnostiques et preventives. Cycle de réunions des entérotoxémies. 2003.</ref>
<ref group="xtra">PMID:8964036</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">Walker RL, Hirsh DC, Maclachlan NJ. Clostridium. In "Veterinary microbiology" 2nd edition 2004, pp. 535.</ref>
<ref group="xtra">PMID:8712513</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:1427007</ref><references group="xtra"/>
[[Category: Clostridium perfringens]]
[[Category: Basak, A K.]]
[[Category: Cole, A R.]]
[[Category: Gibert, M.]]
[[Category: Moss, D S.]]
[[Category: Poppoff, M.]]
[[Category: Titball, R W.]]
[[Category: Beta pore forming toxin]]

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1uyj (Italian)

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Fred Vellieux:

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===LA TOSSINA EPSILON DI ''CLOSTRIDIUM PERFRINGENS'' MOSTRA SOMIGLIANZA STRUTTURALE CON LA TOSSINA AEROLYSIN CHE FORMA PORI===

{{ABSTRACT_PUBMED_15258571_(Italian)}}

==CONTESTO==

La tossina epsilon è prodotta dai ''Clostridium perfringens '' di tipi B e D, (Hunter, SE ''et al.'', 1992; Goswami, PP ''et al.'', 1996). È prodottta sotto una forma di prototossina inattiva di 331 aminoacidi e di peso molecolare 33 kDa (Hunter, SE ''et al.'', 1992).
L'attivazione della prototossina può essere realizzata sia da proteasi sintetizzati dal batterio stesso come l'alfa-chimotripsina e la protease lambda, o da certe enzime proteolitiche del tubo digestivo, come la tripsina. La protease lambda agisce sul lato N-terminale liberando un peptide di 11 aminoacidi ed un residuo di 29 aminoacidi dal lato C-terminale, mentre la tripsina e l'alfa-chimotripsina liberano un residuo di 13 aminoacidi dall'estremità N-terminale ed un residuo di 29 aminoacidi dall'estremità C-terminale (Popoff, MR, 2004). Questa digestione proteolitica produce la forma attiva della tossina epsilon che rappresenta un forma letale, di peso molecolare 29 kDa. Questa attivazione è accompagnata di una leggera modifica di conformazione e del punto isoelettrico (pI) della tossina. La prototossina e la tossina epsilon sono antigeneticamente identiche (Habeeb, AF, 1969, 1975; Habeeb, AF ''et al.'', 1973), ciò che conferma che il peptide perso non è un determinante antigenico della molecola. La struttura tridimensionale della prototossina è formata essenzialmente di fogli beta, mentre quella della tossina è trasformata leggermente in elica alfa ma con predominanza della conformazione beta (Habeeb, AF ''et al.'', 1973). È stato dimostrato che la struttura della tossina epsilon possiede una struttura similare a quella dell'aerolysin di ''Aeromonas hydrophila'' (Cole, AR ''et al.'', 2004).
La tossina epsilon è codificata dal gene etx, portato da un plasmide, di taglia superiora a 100 Kb, (Hunter, SE ''et al.'', 1992), trasferibile orizzontalmente di un 'strain' ad un altro (Frey J, 2003; Songer, JG 1996; Walker RL ''et al.'', 2004). È un gene transposon (Daube, G ''et al.'', 1996). Questo gene è stato sequenzato per i due tipi B e D (Havard, HL ''et al.'', 1992; Hunter, SE ''et al.'', 1992). Il paragone tra le due sequenze dei geni etxB ed etxD mostra una differenza di due nucleotidi nella parte codificante, che ha provocato la sostituzione di un aminoacido (Havard, HL ''et al.'', 1992).

La tossina epsilon è il fattore più virulente di ''Clostridium perfringens'' di tipo D; interagisce con le cellule vascolari endoteliali, provocando un aumento della permeabilità dei vascelli danneggiando direttamente l'endotelium che porta ad una perdita di fluido e l'apparizione di edema particolarmente nei polmone, cuore, reni e cervello (Lefevre, PC ''et al.'', 2003; Walker, RL ''et al.'', 2004). La tossina epsilon è una tossina potente che è responsabile dell'enterotossemia ovina fatale, della malattia del rene polposo e della dissenteria dell'agnello.

==A proposito di questa Struttura==
1UYJ è una struttura a 3 catene di sequenze di [http://en.wikipedia.org/wiki/Clostridium_perfringens Clostridium perfringens]. Dalle informazioni cristallografiche completi sono disponibili su [http://oca.weizmann.ac.il/oca-bin/ocashort?Id=1UYJ OCA].

==Riferimenti==
<ref group="xtra">PMID:15258571</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:1729175</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:8831683</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">Popoff MR. Clostridial and Bacteroides Toxins: Structure and Mode of Action. In "Strict and Facultative
Anaerobes Medical and Environmental Aspects" (Nakano, MM & Zuber, P eds), Horizon Bioscience, Norfolk 2004, pp. 171-197.</ref>
<ref group="xtra">PMID:4305163</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:4358084</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:172146</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">Frey J. Toxines clostridiennes : pathogénie, implications cliniques, diagnostiques et preventives. Cycle de réunions des entérotoxémies. 2003.</ref>
<ref group="xtra">PMID:8964036</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">Walker RL, Hirsh DC, Maclachlan NJ. Clostridium. In "Veterinary microbiology" 2nd edition 2004, pp. 535.</ref>
<ref group="xtra">PMID:1427007</ref><references group="xtra"/>
[[Category: Clostridium perfringens]]
[[Category: Basak, A K.]]
[[Category: Cole, A R.]]
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[[Category: Poppoff, M.]]
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1uyj (French)

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Fred Vellieux:

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=== LA TOXINE EPSILON DE ''CLOSTRIDIUM PERFRINGENS'' MONTRE UNE SIMILARITE STRUCTURELLE AVEC LA TOXINE FORMEUSE DE PORE AEROLYSINE ===

{{ABSTRACT_PUBMED_15258571_(French)}}

Résumé traduit de MEDLINE®/PubMed®, une base de données de la U.S. National Library of Medicine.

==CONTEXTE==

La toxine epsilon est produite par ''Clostridium perfringens'' de types B et D (Hunter, SE ''et al.'' 1992; Goswami, PP ''et al.'' 1996). Elle est sécrétée sous une forme de prototoxine inactive de 331 acides aminés, de poids moléculaire 33 kDa (Hunter, SE ''et al.'' 1992).

L’activation de la prototoxine peut être réalisée, soit par les protéases synthétisées par la bactérie elle-même comme l’alpha-chymotrypsine et la protéase lambda, soit par certaines enzymes protéolytiques du tube digestif, telles que la trypsine. La protéase lambda agit du coté N-terminal en libérant un peptide de 11 acides aminés et un résidu de 29 acides aminés du coté C-terminal, tandis que la trypsine et l’alpha-chymotrypsine libèrent un résidu de 13 acides aminés de l’extrémité N-terminale et un résidu de 29 acides aminés de l’extrémité C-terminale (Popoff, MR 2004). Cette digestion protéolytique donne la forme active de la toxine epsilon qui est une forme létale, de poids moléculaire 29 KDa. Cette activation s’accompagne d’une légère modification des conformation et point isoélectrique (pI) de la toxine. La prototoxine et la toxine epsilon sont antigénétiquement identiques (Habeeb, AF 1969, 1975; Habeeb, AF ''et al.'' 1973), ce qui confirme que le peptide perdu n’est pas un déterminant antigénique de la molécule. La structure tridimensionnelle de la prototoxine est formée essentiellement de feuillets beta, alors que celle de la toxine est légèrement transformée en hélice alpha mais avec prédominance de la conformation beta (Habeeb, AF ''et al.'' 1973). Il a été démontré que la structure de la toxine epsilon possède une structure similaire à celle de l’aerolysine d’''Aeromonas hydrophila'' (Cole, AR ''et al.'' 2004).

La toxine epsilon est codée par le gène etx, porté par un plasmide (de taille supérieure à 100 Kb, Hunter, SE ''et al.'' 1992) transférable horizontalement d’une souche à une autre (Frey J, 2003; Songer, JG 1996; Walker, RL ''et al.'' 2004). C’est un gène transposon (Daube, G ''et al.'', 1996). Ce gène a été séquencé chez les deux types B et D (Havard, HL ''et al.'' 1992; Hunter, SE ''et al.'' 1992). La comparaison entre les deux séquences des gènes etxB et etxD montre une différence de deux nucléotides dans la partie codante ce qui a provoqué la substitution d’un acide aminé (Havard, HL ''et al.'' 1992).

La toxine epsilon est le facteur le plus virulent chez ''Clostridium perfringens'' de type D; elle interagit avec les cellules vasculaires endothéliales, provoquant une augmentation de la perméabilité des vaisseaux en endommageant directement l’endothélium ce qui amène à une perte de fluide et l’apparition d’oedème notamment du poumon, coeur, reins et cerveau (Lefevre, PC ''et al.'' 2003 ; Walker, RL ''et al.'' 2004). La toxine epsilon est une toxine puissante qui est responsable de l'entérotoxémie ovine fatale, de la maladie du rein pulpeux et de la dysenterie de l’agneau.

==Au sujet de cette structure==
1UYJ est une structure à 3 chaînes de séquences de [http://en.wikipedia.org/wiki/Clostridium_perfringens Clostridium perfringens]. Des informations crystallographique complètes sont disponibles sur [http://oca.weizmann.ac.il/oca-bin/ocashort?Id=1UYJ OCA].

==Références==
<ref group="xtra">PMID:15258571</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:1729175</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:8831683</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">Popoff MR. Clostridial and Bacteroides Toxins: Structure and Mode of Action. In "Strict and Facultative
Anaerobes Medical and Environmental Aspects" (Nakano, MM & Zuber, P eds), Horizon Bioscience, Norfolk 2004, pp. 171-197.</ref>
<ref group="xtra">PMID:4305163</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:4358084</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:172146</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">Frey J. Toxines clostridiennes : pathogénie, implications cliniques, diagnostiques et preventives. Cycle de réunions des entérotoxémies. 2003.</ref>
<ref group="xtra">PMID:8964036</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">Walker RL, Hirsh DC, Maclachlan NJ. Clostridium. In "Veterinary microbiology" 2nd edition 2004, pp. 535.</ref>
<ref group="xtra">PMID:8712513</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:1427007</ref><references group="xtra"/>
[[Category: Clostridium perfringens]]
[[Category: Basak, A K.]]
[[Category: Cole, A R.]]
[[Category: Gibert, M.]]
[[Category: Moss, D S.]]
[[Category: Poppoff, M.]]
[[Category: Titball, R W.]]
[[Category: Beta pore forming toxin]]

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1uyj (Italian)

2010-01-12T16:08:02Z

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===LA TOSSINA EPSILON DI ''CLOSTRIDIUM PERFRINGENS'' MOSTRA SOMIGLIANZA STRUTTURALE CON LA TOSSINA AEROLYSIN CHE FORMA PORI===

{{ABSTRACT_PUBMED_15258571_(Italian)}}

==CONTESTO==

La tossina epsilon è prodotta dai ''Clostridium perfringens '' di tipi B e D, (Hunter, SE ''et al.'', 1992; Goswami, PP ''et al.'', 1996). È prodottta sotto una forma di prototossina inattiva di 331 aminoacidi e di peso molecolare 33 kDa (Hunter, SE ''et al.'', 1992).
L'attivazione della prototossina può essere realizzata sia da proteasi sintetizzati dal batterio stesso come l'alfa-chimotripsina e la protease lambda, o da certe enzime proteolitiche del tubo digestivo, come la tripsina. La protease lambda agisce sul lato N-terminale liberando un peptide di 11 aminoacidi ed un residuo di 29 aminoacidi dal lato C-terminale, mentre la tripsina e l'alfa-chimotripsina liberano un residuo di 13 aminoacidi dall'estremità N-terminale ed un residuo di 29 aminoacidi dall'estremità C-terminale (Popoff, MR, 2004). Questa digestione proteolitica produce la forma attiva della tossina epsilon che rappresenta un forma letale, di peso molecolare 29 kDa. Questa attivazione è accompagnata di una leggera modifica di conformazione e del punto isoelettrico (pI) della tossina. La prototossina e la tossina epsilon sono antigeneticamente identiche (Habeeb, AF, 1969, 1975; Habeeb, AF ''et al.'', 1973), ciò che conferma che il peptide perso non è un determinante antigenico della molecola. La struttura tridimensionale della prototossina è formata essenzialmente di fogli beta, mentre quella della tossina è trasformata leggermente in elica alfa ma con predominanza della conformazione beta (Habeeb, AF ''et al.'', 1973). È stato dimostrato che la struttura della tossina epsilon possiede una struttura similare a quella dell'aerolysin di ''Aeromonas hydrophila'' (Cole, AR ''et al.'', 2004).
La tossina epsilon è codificata dal gene etx, portato da un plasmide, di taglia superiora a 100 Kb, (Hunter, SE ''et al.'', 1992), trasferibile orizzontalmente di un 'strain' ad un altro (Frey J, 2003; Songer, JG 1996; Walker RL ''et al.'', 2004). È un gene transposon (Daube, G ''et al.'', 1996). Questo gene è stato sequenzato per i due tipi B e D (Havard, HL ''et al.'', 1992; Hunter, SE ''et al.'', 1992). Il paragone tra le due sequenze dei geni etxB ed etxD mostra una differenza di due nucleotidi nella parte codificante, che ha provocato la sostituzione di un aminoacido (Havard, HL ''et al.'', 1992).

La tossina epsilon è il fattore più virulente di ''Clostridium perfringens'' di tipo D; interagisce con le cellule vascolari endoteliali, provocando un aumento della permeabilità dei vascelli danneggiando direttamente l'endotelium che porta ad una perdita di fluido e l'apparizione di edema particolarmente nei polmone, cuore, reni e cervello (Lefevre, PC ''et al.'', 2003; Walker, RL ''et al.'', 2004). La tossina epsilon è una tossina potente che è responsabile dell'enterotossemia ovina fatale, della malattia del rene polposo e della dissenteria dell'agnello.

==A proposito di questa Struttura==
1UYJ è una struttura a 3 catene di sequenze di [http://en.wikipedia.org/wiki/Clostridium_perfringens Clostridium perfringens]. Dalle informazioni cristallografiche completi sono disponibili su [http://oca.weizmann.ac.il/oca-bin/ocashort?Id=1UYJ OCA].

==Riferimenti==
<ref group="xtra">PMID:15258571</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:1729175</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:8831683</ref><references group="xtra"/>
Popoff MR. Clostridial and Bacteroides Toxins: Structure and Mode of Action. In "Strict and Facultative
Anaerobes Medical and Environmental Aspects" (Nakano, MM & Zuber, P eds), Horizon Bioscience, Norfolk 2004, pp. 171-197.
<ref group="xtra">PMID:4305163</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:4358084</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:172146</ref><references group="xtra"/>
Frey J. Toxines clostridiennes : pathogénie, implications cliniques, diagnostiques et preventives. Cycle de réunions des entérotoxémies. 2003.

<ref group="xtra">PMID:8964036</ref><references group="xtra"/>

Walker RL, Hirsh DC, Maclachlan NJ. Clostridium. In "Veterinary microbiology" 2nd edition 2004, pp. 535.

<ref group="xtra">PMID:1427007</ref><references group="xtra"/>
[[Category: Clostridium perfringens]]
[[Category: Basak, A K.]]
[[Category: Cole, A R.]]
[[Category: Gibert, M.]]
[[Category: Moss, D S.]]
[[Category: Poppoff, M.]]
[[Category: Titball, R W.]]
[[Category: Beta pore forming toxin]]

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Fred Vellieux:

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=== LA TOXINE EPSILON DE ''CLOSTRIDIUM PERFRINGENS'' MONTRE UNE SIMILARITE STRUCTURELLE AVEC LA TOXINE FORMEUSE DE PORE AEROLYSINE ===

{{ABSTRACT_PUBMED_15258571_(French)}}

Résumé traduit de MEDLINE®/PubMed®, une base de données de la U.S. National Library of Medicine.

==CONTEXTE==

La toxine epsilon est produite par ''Clostridium perfringens'' de types B et D (Hunter, SE ''et al.'' 1992; Goswami, PP ''et al.'' 1996). Elle est sécrétée sous une forme de prototoxine inactive de 331 acides aminés, de poids moléculaire 33 kDa (Hunter, SE ''et al.'' 1992).

L’activation de la prototoxine peut être réalisée, soit par les protéases synthétisées par la bactérie elle-même comme l’alpha-chymotrypsine et la protéase lambda, soit par certaines enzymes protéolytiques du tube digestif, telles que la trypsine. La protéase lambda agit du coté N-terminal en libérant un peptide de 11 acides aminés et un résidu de 29 acides aminés du coté C-terminal, tandis que la trypsine et l’alpha-chymotrypsine libèrent un résidu de 13 acides aminés de l’extrémité N-terminale et un résidu de 29 acides aminés de l’extrémité C-terminale (Popoff, MR 2004). Cette digestion protéolytique donne la forme active de la toxine epsilon qui est une forme létale, de poids moléculaire 29 KDa. Cette activation s’accompagne d’une légère modification des conformation et point isoélectrique (pI) de la toxine. La prototoxine et la toxine epsilon sont antigénétiquement identiques (Habeeb, AF 1969, 1975; Habeeb, AF ''et al.'' 1973), ce qui confirme que le peptide perdu n’est pas un déterminant antigénique de la molécule. La structure tridimensionnelle de la prototoxine est formée essentiellement de feuillets beta, alors que celle de la toxine est légèrement transformée en hélice alpha mais avec prédominance de la conformation beta (Habeeb, AF ''et al.'' 1973). Il a été démontré que la structure de la toxine epsilon possède une structure similaire à celle de l’aerolysine d’''Aeromonas hydrophila'' (Cole, AR ''et al.'' 2004).

La toxine epsilon est codée par le gène etx, porté par un plasmide (de taille supérieure à 100 Kb, Hunter, SE ''et al.'' 1992) transférable horizontalement d’une souche à une autre (Frey J, 2003; Songer, JG 1996; Walker, RL ''et al.'' 2004). C’est un gène transposon (Daube, G ''et al.'', 1996). Ce gène a été séquencé chez les deux types B et D (Havard, HL ''et al.'' 1992; Hunter, SE ''et al.'' 1992). La comparaison entre les deux séquences des gènes etxB et etxD montre une différence de deux nucléotides dans la partie codante ce qui a provoqué la substitution d’un acide aminé (Havard, HL ''et al.'' 1992).

La toxine epsilon est le facteur le plus virulent chez ''Clostridium perfringens'' de type D; elle interagit avec les cellules vasculaires endothéliales, provoquant une augmentation de la perméabilité des vaisseaux en endommageant directement l’endothélium ce qui amène à une perte de fluide et l’apparition d’oedème notamment du poumon, coeur, reins et cerveau (Lefevre, PC ''et al.'' 2003 ; Walker, RL ''et al.'' 2004). La toxine epsilon est une toxine puissante qui est responsable de l'entérotoxémie ovine fatale, de la maladie du rein pulpeux et de la dysenterie de l’agneau.

==Au sujet de cette structure==
1UYJ est une structure à 3 chaînes de séquences de [http://en.wikipedia.org/wiki/Clostridium_perfringens Clostridium perfringens]. Des informations crystallographique complètes sont disponibles sur [http://oca.weizmann.ac.il/oca-bin/ocashort?Id=1UYJ OCA].

==Références==
<ref group="xtra">PMID:15258571</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:1729175</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:8831683</ref><references group="xtra"/>
Popoff MR. Clostridial and Bacteroides Toxins: Structure and Mode of Action. In "Strict and Facultative
Anaerobes Medical and Environmental Aspects" (Nakano, MM & Zuber, P eds), Horizon Bioscience, Norfolk 2004, pp. 171-197.
<ref group="xtra">PMID:4305163</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:4358084</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:172146</ref><references group="xtra"/>
Frey J. Toxines clostridiennes : pathogénie, implications cliniques, diagnostiques et preventives. Cycle de réunions des entérotoxémies. 2003.
<ref group="xtra">PMID:8964036</ref><references group="xtra"/>
Walker RL, Hirsh DC, Maclachlan NJ. Clostridium. In "Veterinary microbiology" 2nd edition 2004, pp. 535.
<ref group="xtra">PMID:8712513</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:1427007</ref><references group="xtra"/>
[[Category: Clostridium perfringens]]
[[Category: Basak, A K.]]
[[Category: Cole, A R.]]
[[Category: Gibert, M.]]
[[Category: Moss, D S.]]
[[Category: Poppoff, M.]]
[[Category: Titball, R W.]]
[[Category: Beta pore forming toxin]]

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1uyj (Italian)

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Fred Vellieux:

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===LA TOSSINA EPSILON DI ''CLOSTRIDIUM PERFRINGENS'' MOSTRA SOMIGLIANZA STRUTTURALE CON LA TOSSINA AEROLYSIN CHE FORMA PORI===

{{ABSTRACT_PUBMED_15258571_(Italian)}}

==CONTESTO==

La tossina epsilon è prodotta dai ''Clostridium perfringens '' di tipi B e D, (Hunter, SE ''et al.'', 1992; Goswami, PP ''et al.'', 1996). È prodottta sotto una forma di prototossina inattiva di 331 aminoacidi e di peso molecolare 33 kDa (Hunter, SE ''et al.'', 1992).
L'attivazione della prototossina può essere realizzata sia da proteasi sintetizzati dal batterio stesso come l'alfa-chimotripsina e la protease lambda, o da certe enzime proteolitiche del tubo digestivo, come la tripsina. La protease lambda agisce sul lato N-terminale liberando un peptide di 11 aminoacidi ed un residuo di 29 aminoacidi dal lato C-terminale, mentre la tripsina e l'alfa-chimotripsina liberano un residuo di 13 aminoacidi dall'estremità N-terminale ed un residuo di 29 aminoacidi dall'estremità C-terminale (Popoff, MR, 2005). Questa digestione proteolitica produce la forma attiva della tossina epsilon che rappresenta un forma letale, di peso molecolare 29 kDa. Questa attivazione è accompagnata di una leggera modifica di conformazione e del punto isoelettrico (pI) della tossina. La prototossina e la tossina epsilon sono antigeneticamente identiche (Habeeb, AF, 1969, 1975; Habeeb, AF ''et al.'', 1973), ciò che conferma che il peptide perso non è un determinante antigenico della molecola. La struttura tridimensionale della prototossina è formata essenzialmente di fogli beta, mentre quella della tossina è trasformata leggermente in elica alfa ma con predominanza della conformazione beta (Habeeb, AF ''et al.'', 1973). È stato dimostrato che la struttura della tossina epsilon possiede una struttura similare a quella dell'aerolysin di ''Aeromonas hydrophila'' (Cole, AR ''et al.'', 2004).
La tossina epsilon è codificata dal gene etx, portato da un plasmide, di taglia superiora a 100 Kb, (Hunter, SE ''et al.'', 1992), trasferibile orizzontalmente di un 'strain' ad un altro (Frey J, 2003; Songer, JG 1996; Walker RL ''et al.'', 2004). È un gene transposon (Daube, G ''et al.'', 1996). Questo gene è stato sequenzato per i due tipi B e D (Havard, HL ''et al.'', 1992; Hunter, SE ''et al.'', 1992). Il paragone tra le due sequenze dei geni etxB ed etxD mostra una differenza di due nucleotidi nella parte codificante, che ha provocato la sostituzione di un aminoacido (Havard, HL ''et al.'', 1992).

La tossina epsilon è il fattore più virulente di ''Clostridium perfringens'' di tipo D; interagisce con le cellule vascolari endoteliali, provocando un aumento della permeabilità dei vascelli danneggiando direttamente l'endotelium che porta ad una perdita di fluido e l'apparizione di edema particolarmente nei polmone, cuore, reni e cervello (Lefevre, PC ''et al.'', 2003; Walker, RL ''et al.'', 2004). La tossina epsilon è una tossina potente che è responsabile dell'enterotossemia ovina fatale, della malattia del rene polposo e della dissenteria dell'agnello.

==A proposito di questa Struttura==
1UYJ è una struttura a 3 catene di sequenze di [http://en.wikipedia.org/wiki/Clostridium_perfringens Clostridium perfringens]. Dalle informazioni cristallografiche completi sono disponibili su [http://oca.weizmann.ac.il/oca-bin/ocashort?Id=1UYJ OCA].

==Riferimenti==
<ref group="xtra">PMID:15258571</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:1729175</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:8831683</ref><references group="xtra"/>
Popoff MR. Clostridial and Bacteroides Toxins: Structure and Mode of Action. In "Strict and Facultative
Anaerobes Medical and Environmental Aspects" (Nakano, MM & Zuber, P eds), Horizon Bioscience, Norfolk 2004, pp. 171-197.
<ref group="xtra">PMID:4305163</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:4358084</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:172146</ref><references group="xtra"/>
Frey J. Toxines clostridiennes : pathogénie, implications cliniques, diagnostiques et preventives. Cycle de réunions des entérotoxémies. 2003.

<ref group="xtra">PMID:8964036</ref><references group="xtra"/>

Walker RL, Hirsh DC, Maclachlan NJ. Clostridium. In "Veterinary microbiology" 2nd edition 2004, pp. 535.

<ref group="xtra">PMID:1427007</ref><references group="xtra"/>
[[Category: Clostridium perfringens]]
[[Category: Basak, A K.]]
[[Category: Cole, A R.]]
[[Category: Gibert, M.]]
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[[Category: Beta pore forming toxin]]

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===LA TOSSINA EPSILON DI ''CLOSTRIDIUM PERFRINGENS'' MOSTRA SOMIGLIANZA STRUTTURALE CON LA TOSSINA AEROLYSIN CHE FORMA PORI===

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==CONTESTO==

La tossina epsilon è prodotta dai ''Clostridium perfringens '' di tipi B e D, (Hunter, SE ''et al.'', 1992; Goswami, PP ''et al.'', 1996). È prodottta sotto una forma di prototossina inattiva di 331 aminoacidi e di peso molecolare 33 kDa (Hunter, SE ''et al.'', 1992).

L'attivazione della prototossina può essere realizzata sia da proteasi sintetizzati dal batterio stesso come l'alfa-chimotripsina e la protease lambda, o da certe enzime proteolitiche del tubo digestivo, come la tripsina. La protease lambda agisce sul lato N-terminale liberando un peptide di 11 aminoacidi ed un residuo di 29 aminoacidi dal lato C-terminale, mentre la tripsina e l'alfa-chimotripsina liberano un residuo di 13 aminoacidi dall'estremità N-terminale ed un residuo di 29 aminoacidi dall'estremità C-terminale (Popoff, MR, 2005). Questa digestione proteolitica produce la forma attiva della tossina epsilon che rappresenta un forma letale, di peso molecolare 29 kDa. Questa attivazione è accompagnata di una leggera modifica di conformazione e del punto isoelettrico (pI) della tossina. La prototossina e la tossina epsilon sono antigeneticamente identiche (Habeeb, AF, 1969, 1975; Habeeb, AF ''et al.'', 1973), ciò che conferma che il peptide perso non è un determinante antigenico della molecola. La struttura tridimensionale della prototossina è formata essenzialmente di fogli beta, mentre quella della tossina è trasformata leggermente in elica alfa ma con predominanza della conformazione beta (Habeeb, AF ''et al.'', 1973). È stato dimostrato che la struttura della tossina epsilon possiede una struttura similare a quella dell'aerolysin di ''Aeromonas hydrophila'' (Cole, AR ''et al.'', 2004).

La tossina epsilon è codificata dal gene etx, portato da un plasmide, di taglia superiora a 100 Kb, (Hunter, SE ''et al.'', 1992), trasferibile orizzontalmente di un 'strain' ad un altro (Frey J, 2003; Songer, JG 1996; Walker RL ''et al.'', 2004). È un gene transposon (Daube, G ''et al.'', 1996). Questo gene è stato sequenzato per i due tipi B e D (Havard, HL ''et al.'', 1992; Hunter, SE ''et al.'', 1992). Il paragone tra le due sequenze dei geni etxB ed etxD mostra una differenza di due nucleotidi nella parte codificante, che ha provocato la sostituzione di un aminoacido (Havard, HL ''et al.'', 1992).

La tossina epsilon è il fattore più virulente di ''Clostridium perfringens'' di tipo D; interagisce con le cellule vascolari endoteliali, provocando un aumento della permeabilità dei vascelli danneggiando direttamente l'endotelium che porta ad una perdita di fluido e l'apparizione di edema particolarmente nei polmone, cuore, reni e cervello (Lefevre, PC ''et al.'', 2003; Walker, RL ''et al.'', 2004). La tossina epsilon è una tossina potente che è responsabile dell'enterotossemia ovina fatale, della malattia del rene polposo e della dissenteria dell'agnello.

==A proposito di questa Struttura==
1UYJ è una struttura a 3 catene di sequenze di [http://en.wikipedia.org/wiki/Clostridium_perfringens Clostridium perfringens]. Dalle informazioni cristallografiche completi sono disponibili su [http://oca.weizmann.ac.il/oca-bin/ocashort?Id=1UYJ OCA].

==Riferimenti==
<ref group="xtra">PMID:15258571</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:1729175</ref><references group="xtra"/>

<ref group="xtra">PMID:8831683</ref><references group="xtra"/>

Popoff MR. Clostridial and Bacteroides Toxins: Structure and Mode of Action. In "Strict and Facultative

Anaerobes Medical and Environmental Aspects" (Michiko, M, Nakano & Zuber, P eds) 2005, pp. 171-197.

<ref group="xtra">PMID:4305163</ref><references group="xtra"/>

<ref group="xtra">PMID:4358084</ref><references group="xtra"/>

<ref group="xtra">PMID:172146</ref><references group="xtra"/>

Frey J. Toxines clostridiennes : pathogénie, implications cliniques, diagnostiques et preventives. Cycle de réunions des entérotoxémies. 2003.

<ref group="xtra">PMID:8964036</ref><references group="xtra"/>

Walker RL, Hirsh DC, Maclachlan NJ. Clostridium. In "Veterinary microbiology" 2nd edition 2004, pp. 535.

<ref group="xtra">PMID:1427007</ref><references group="xtra"/>
[[Category: Clostridium perfringens]]
[[Category: Basak, A K.]]
[[Category: Cole, A R.]]
[[Category: Gibert, M.]]
[[Category: Moss, D S.]]
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=== LA TOXINE EPSILON DE ''CLOSTRIDIUM PERFRINGENS'' MONTRE UNE SIMILARITE STRUCTURELLE AVEC LA TOXINE FORMEUSE DE PORE AEROLYSINE ===

{{ABSTRACT_PUBMED_15258571_(French)}}

Résumé traduit de MEDLINE®/PubMed®, une base de données de la U.S. National Library of Medicine.

==CONTEXTE==

La toxine epsilon est produite par ''Clostridium perfringens'' de types B et D (Hunter, SE ''et al.'' 1992; Goswami, PP ''et al.'' 1996). Elle est sécrétée sous une forme de prototoxine inactive de 331 acides aminés, de poids moléculaire 33 kDa (Hunter, SE ''et al.'' 1992).

L’activation de la prototoxine peut être réalisée, soit par les protéases synthétisées par la bactérie elle-même comme l’alpha-chymotrypsine et la protéase lambda, soit par certaines enzymes protéolytiques du tube digestif, telles que la trypsine. La protéase lambda agit du coté N-terminal en libérant un peptide de 11 acides aminés et un résidu de 29 acides aminés du coté C-terminal, tandis que la trypsine et l’alpha-chymotrypsine libèrent un résidu de 13 acides aminés de l’extrémité N-terminale et un résidu de 29 acides aminés de l’extrémité C-terminale (Popoff, MR 2005). Cette digestion protéolytique donne la forme active de la toxine epsilon qui est une forme létale, de poids moléculaire 29 KDa. Cette activation s’accompagne d’une légère modification des conformation et point isoélectrique (pI) de la toxine. La prototoxine et la toxine epsilon sont antigénétiquement identiques (Habeeb, AF 1969, 1975; Habeeb, AF ''et al.'' 1973), ce qui confirme que le peptide perdu n’est pas un déterminant antigénique de la molécule. La structure tridimensionnelle de la prototoxine est formée essentiellement de feuillets beta, alors que celle de la toxine est légèrement transformée en hélice alpha mais avec prédominance de la conformation beta (Habeeb, AF ''et al.'' 1973). Il a été démontré que la structure de la toxine epsilon possède une structure similaire à celle de l’aerolysine d’''Aeromonas hydrophila'' (Cole, AR ''et al.'' 2004).

La toxine epsilon est codée par le gène etx, porté par un plasmide (de taille supérieure à 100 Kb, Hunter, SE ''et al.'' 1992) transférable horizontalement d’une souche à une autre (Frey J, 2003; Songer, JG 1996; Walker, RL ''et al.'' 2004). C’est un gène transposon (Daube, G ''et al.'', 1996). Ce gène a été séquencé chez les deux types B et D (Havard, HL ''et al.'' 1992; Hunter, SE ''et al.'' 1992). La comparaison entre les deux séquences des gènes etxB et etxD montre une différence de deux nucléotides dans la partie codante ce qui a provoqué la substitution d’un acide aminé (Havard, HL ''et al.'' 1992).

La toxine epsilon est le facteur le plus virulent chez ''Clostridium perfringens'' de type D; elle interagit avec les cellules vasculaires endothéliales, provoquant une augmentation de la perméabilité des vaisseaux en endommageant directement l’endothélium ce qui amène à une perte de fluide et l’apparition d’oedème notamment du poumon, coeur, reins et cerveau (Lefevre, PC ''et al.'' 2003 ; Walker, RL ''et al.'' 2004). La toxine epsilon est une toxine puissante qui est responsable de l'entérotoxémie ovine fatale, de la maladie du rein pulpeux et de la dysenterie de l’agneau.

==Au sujet de cette structure==
1UYJ est une structure à 3 chaînes de séquences de [http://en.wikipedia.org/wiki/Clostridium_perfringens Clostridium perfringens]. Des informations crystallographique complètes sont disponibles sur [http://oca.weizmann.ac.il/oca-bin/ocashort?Id=1UYJ OCA].

==Références==
<ref group="xtra">PMID:15258571</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:1729175</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:8831683</ref><references group="xtra"/>
Popoff MR. Clostridial and Bacteroides Toxins: Structure and Mode of Action. In "Strict and Facultative
Anaerobes Medical and Environmental Aspects" (Michiko, M, Nakano & Zuber, P eds) 2005, pp. 171-197.
<ref group="xtra">PMID:4305163</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:4358084</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:172146</ref><references group="xtra"/>
Frey J. Toxines clostridiennes : pathogénie, implications cliniques, diagnostiques et preventives. Cycle de réunions des entérotoxémies. 2003.
<ref group="xtra">PMID:8964036</ref><references group="xtra"/>
Walker RL, Hirsh DC, Maclachlan NJ. Clostridium. In "Veterinary microbiology" 2nd edition 2004, pp. 535.
<ref group="xtra">PMID:8712513</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:1427007</ref><references group="xtra"/>
[[Category: Clostridium perfringens]]
[[Category: Basak, A K.]]
[[Category: Cole, A R.]]
[[Category: Gibert, M.]]
[[Category: Moss, D S.]]
[[Category: Poppoff, M.]]
[[Category: Titball, R W.]]
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=== LA TOXINE EPSILON DE ''CLOSTRIDIUM PERFRINGENS'' MONTRE UNE SIMILARITE STRUCTURELLE AVEC LA TOXINE FORMEUSE DE PORE AEROLYSINE ===

{{ABSTRACT_PUBMED_15258571_(French)}}

Résumé traduit de MEDLINE®/PubMed®, une base de données de la U.S. National Library of Medicine.

==CONTEXTE==

La toxine epsilon est produite par ''Clostridium perfringens'' de types B et D (Hunter, SE ''et al.'' 1992; Goswami, PP ''et al.'' 1996). Elle est sécrétée sous une forme de prototoxine inactive de 331 acides aminés, de poids moléculaire 33 kDa (Hunter, SE ''et al.'' 1992).

L’activation de la prototoxine peut être réalisée, soit par les protéases synthétisées par la bactérie elle-même comme l’alpha-chymotrypsine et la protéase lambda, soit par certaines enzymes protéolytiques du tube digestif, telles que la trypsine. La protéase lambda agit du coté N-terminal en libérant un peptide de 11 acides aminés et un résidu de 29 acides aminés du coté C-terminal, tandis que la trypsine et l’alpha-chymotrypsine libèrent un résidu de 13 acides aminés de l’extrémité N-terminale et un résidu de 29 acides aminés de l’extrémité C-terminale (Popoff, MR 2005). Cette digestion protéolytique donne la forme active de la toxine epsilon qui est une forme létale, de poids moléculaire 29 KDa. Cette activation s’accompagne d’une légère modification des conformation et point isoélectrique (pI) de la toxine. La prototoxine et la toxine epsilon sont antigénétiquement identiques (Habeeb, AF 1969, 1975; Habeeb, AF ''et al.'' 1973), ce qui confirme que le peptide perdu n’est pas un déterminant antigénique de la molécule. La structure tridimensionnelle de la prototoxine est formée essentiellement de feuillets beta, alors que celle de la toxine est légèrement transformée en hélice alpha mais avec prédominance de la conformation beta (Habeeb, AF ''et al.'' 1973). Il a été démontré que la structure de la toxine epsilon possède une structure similaire à celle de l’aerolysine d’''Aeromonas hydrophila'' (Cole, AR ''et al.'' 2004).

La toxine epsilon est codée par le gène etx, porté par un plasmide (de taille supérieure à 100 Kb, Hunter, SE ''et al.'' 1992) transférable horizontalement d’une souche à une autre (Frey J, 2003; Songer, JG 1996; Walker, RL ''et al.'' 2004). C’est un gène transposon (Daube, G & Simon, P 1992). Ce gène a été séquencé chez les deux types B et D (Havard, HL ''et al.'' 1992; Hunter, SE ''et al.'' 1992). La comparaison entre les deux séquences des gènes etxB et etxD montre une différence de deux nucléotides dans la partie codante ce qui a provoqué la substitution d’un acide aminé (Havard, HL ''et al.'' 1992).

La toxine epsilon est le facteur le plus virulent chez ''Clostridium perfringens'' de type D; elle interagit avec les cellules vasculaires endothéliales, provoquant une augmentation de la perméabilité des vaisseaux en endommageant directement l’endothélium ce qui amène à une perte de fluide et l’apparition d’oedème notamment du poumon, coeur, reins et cerveau (Lefevre, PC ''et al.'' 2003 ; Walker, RL ''et al.'' 2004). La toxine epsilon est une toxine puissante qui est responsable de l'entérotoxémie ovine fatale, de la maladie du rein pulpeux et de la dysenterie de l’agneau.

==Au sujet de cette structure==
1UYJ est une structure à 3 chaînes de séquences de [http://en.wikipedia.org/wiki/Clostridium_perfringens Clostridium perfringens]. Des informations crystallographique complètes sont disponibles sur [http://oca.weizmann.ac.il/oca-bin/ocashort?Id=1UYJ OCA].

==Références==
<ref group="xtra">PMID:15258571</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:1729175</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:8831683</ref><references group="xtra"/>
Popoff MR. Clostridial and Bacteroides Toxins: Structure and Mode of Action. In "Strict and Facultative
Anaerobes Medical and Environmental Aspects" (Michiko, M, Nakano & Zuber, P eds) 2005, pp. 171-197.
<ref group="xtra">PMID:4305163</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:4358084</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:172146</ref><references group="xtra"/>
Frey J. Toxines clostridiennes : pathogénie, implications cliniques, diagnostiques et preventives. Cycle de réunions des entérotoxémies. 2003.
<ref group="xtra">PMID:8964036</ref><references group="xtra"/>
Walker RL, Hirsh DC, Maclachlan NJ. Clostridium. In "Veterinary microbiology" 2nd edition 2004, pp. 535.
<ref group="xtra">PMID:1427007</ref><references group="xtra"/>
[[Category: Clostridium perfringens]]
[[Category: Basak, A K.]]
[[Category: Cole, A R.]]
[[Category: Gibert, M.]]
[[Category: Moss, D S.]]
[[Category: Poppoff, M.]]
[[Category: Titball, R W.]]
[[Category: Beta pore forming toxin]]

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1uyj (Italian)

2010-01-12T14:22:16Z

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===LA TOSSINA EPSILON DI ''CLOSTRIDIUM PERFRINGENS'' MOSTRA SOMIGLIANZA STRUTTURALE CON LA TOSSINA AEROLYSIN CHE FORMA PORI===

{{ABSTRACT_PUBMED_15258571_(Italian)}}

==CONTESTO==

La tossina epsilon è prodotta dai ''Clostridium perfringens '' di tipi B e D, (Hunter, SE ''et al.'', 1992; Goswami, PP ''et al.'', 1996). È prodottta sotto una forma di prototossina inattiva di 331 aminoacidi e di peso molecolare 33 kDa (Hunter, SE ''et al.'', 1992).

L'attivazione della prototossina può essere realizzata sia da proteasi sintetizzati dal batterio stesso come l'alfa-chimotripsina e la protease lambda, o da certe enzime proteolitiche del tubo digestivo, come la tripsina. La protease lambda agisce sul lato N-terminale liberando un peptide di 11 aminoacidi ed un residuo di 29 aminoacidi dal lato C-terminale, mentre la tripsina e l'alfa-chimotripsina liberano un residuo di 13 aminoacidi dall'estremità N-terminale ed un residuo di 29 aminoacidi dall'estremità C-terminale (Popoff, MR, 2005). Questa digestione proteolitica produce la forma attiva della tossina epsilon che rappresenta un forma letale, di peso molecolare 29 kDa. Questa attivazione è accompagnata di una leggera modifica di conformazione e del punto isoelettrico (pI) della tossina. La prototossina e la tossina epsilon sono antigeneticamente identiche (Habeeb, AF, 1969, 1975; Habeeb, AF ''et al.'', 1973), ciò che conferma che il peptide perso non è un determinante antigenico della molecola. La struttura tridimensionale della prototossina è formata essenzialmente di fogli beta, mentre quella della tossina è trasformata leggermente in elica alfa ma con predominanza della conformazione beta (Habeeb, AF ''et al.'', 1973). È stato dimostrato che la struttura della tossina epsilon possiede una struttura similare a quella dell'aerolysin di ''Aeromonas hydrophila'' (Cole, AR ''et al.'', 2004).

La tossina epsilon è codificata dal gene etx, portato da un plasmide, di taglia superiora a 100 Kb, (Hunter, SE ''et al.'', 1992), trasferibile orizzontalmente di un 'strain' ad un altro (Frey J, 2003; Songer, JG 1996; Walker RL ''et al.'', 2004). È un gene transposon (Daube, G & Simon, P, 1992). Questo gene è stato sequenzato per i due tipi B e D (Havard, HL ''et al.'', 1992; Hunter, SE ''et al.'', 1992). Il paragone tra le due sequenze dei geni etxB ed etxD mostra una differenza di due nucleotidi nella parte codificante, che ha provocato la sostituzione di un aminoacido (Havard, HL ''et al.'', 1992).

La tossina epsilon è il fattore più virulente di ''Clostridium perfringens'' di tipo D; interagisce con le cellule vascolari endoteliali, provocando un aumento della permeabilità dei vascelli danneggiando direttamente l'endotelium che porta ad una perdita di fluido e l'apparizione di edema particolarmente nei polmone, cuore, reni e cervello (Lefevre, PC ''et al.'', 2003; Walker, RL ''et al.'', 2004). La tossina epsilon è una tossina potente che è responsabile dell'enterotossemia ovina fatale, della malattia del rene polposo e della dissenteria dell'agnello.

==A proposito di questa Struttura==
1UYJ è una struttura a 3 catene di sequenze di [http://en.wikipedia.org/wiki/Clostridium_perfringens Clostridium perfringens]. Dalle informazioni cristallografiche completi sono disponibili su [http://oca.weizmann.ac.il/oca-bin/ocashort?Id=1UYJ OCA].

==Riferimenti==
<ref group="xtra">PMID:15258571</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:1729175</ref><references group="xtra"/>

<ref group="xtra">PMID:8831683</ref><references group="xtra"/>

Popoff MR. Clostridial and Bacteroides Toxins: Structure and Mode of Action. In "Strict and Facultative

Anaerobes Medical and Environmental Aspects" (Michiko, M, Nakano & Zuber, P eds) 2005, pp. 171-197.

<ref group="xtra">PMID:4305163</ref><references group="xtra"/>

<ref group="xtra">PMID:4358084</ref><references group="xtra"/>

<ref group="xtra">PMID:172146</ref><references group="xtra"/>

Frey J. Toxines clostridiennes : pathogénie, implications cliniques, diagnostiques et preventives. Cycle de réunions des entérotoxémies. 2003.

<ref group="xtra">PMID:8964036</ref><references group="xtra"/>

Walker RL, Hirsh DC, Maclachlan NJ. Clostridium. In "Veterinary microbiology" 2nd edition 2004, pp. 535.

<ref group="xtra">PMID:1427007</ref><references group="xtra"/>
[[Category: Clostridium perfringens]]
[[Category: Basak, A K.]]
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[[Category: Gibert, M.]]
[[Category: Moss, D S.]]
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1uyj (French)

2010-01-12T14:04:11Z

Fred Vellieux:

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=== LA TOXINE EPSILON DE ''CLOSTRIDIUM PERFRINGENS'' MONTRE UNE SIMILARITE STRUCTURELLE AVEC LA TOXINE FORMEUSE DE PORE AEROLYSINE ===

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Résumé traduit de MEDLINE®/PubMed®, une base de données de la U.S. National Library of Medicine.

==CONTEXTE==

La toxine epsilon est produite par ''Clostridium perfringens'' de types B et D (Hunter, SE ''et al.'' 1992; Goswami, PP ''et al.'' 1996). Elle est sécrétée sous une forme de prototoxine inactive de 331 acides aminés, de poids moléculaire 33 kDa (Hunter, SE ''et al.'' 1992).

L’activation de la prototoxine peut être réalisée, soit par les protéases synthétisées par la bactérie elle-même comme l’alpha-chymotrypsine et la protéase lambda, soit par certaines enzymes protéolytiques du tube digestif, telles que la trypsine. La protéase lambda agit du coté N-terminal en libérant un peptide de 11 acides aminés et un résidu de 29 acides aminés du coté C-terminal, tandis que la trypsine et l’alpha-chymotrypsine libèrent un résidu de 13 acides aminés de l’extrémité N-terminale et un résidu de 29 acides aminés de l’extrémité C-terminale (Popoff, MR 2005). Cette digestion protéolytique donne la forme active de la toxine epsilon qui est une forme létale, de poids moléculaire 29 KDa. Cette activation s’accompagne d’une légère modification des conformation et point isoélectrique (pI) de la toxine. La prototoxine et la toxine epsilon sont antigénétiquement identiques (Habeeb, AF 1969, 1975; Habeeb, AF ''et al.'' 1973), ce qui confirme que le peptide perdu n’est pas un déterminant antigénique de la molécule. La structure tridimensionnelle de la prototoxine est formée essentiellement de feuillets beta, alors que celle de la toxine est légèrement transformée en hélice alpha mais avec prédominance de la conformation beta (Habeeb, AF ''et al.'' 1973). Il a été démontré que la structure de la toxine epsilon possède une structure similaire à celle de l’aerolysine d’''Aeromonas hydrophila'' (Cole, AR ''et al.'' 2004).

La toxine epsilon est codée par le gène etx, porté par un plasmide (de taille supérieure à 100 Kb, Hunter, SE ''et al.'' 1992) transférable horizontalement d’une souche à une autre (Frey J, 2003; Songer, JG 1996; Walker, RL ''et al.'' 2004). C’est un gène transposon (Daube, G & Simon, P 1992). Ce gène a été séquencé chez les deux types B et D (Havard, HL ''et al.'' 1992; Hunter, SE ''et al.'' 1992). La comparaison entre les deux séquences des gènes etxB et etxD montre une différence de deux nucléotides dans la partie codante ce qui a provoqué la substitution d’un acide aminé (Havard, HL ''et al.'' 1992).

La toxine epsilon est le facteur le plus virulent chez ''Clostridium perfringens'' de type D; elle interagit avec les cellules vasculaires endothéliales, provoquant une augmentation de la perméabilité des vaisseaux en endommageant directement l’endothélium ce qui amène à une perte de fluide et l’apparition d’oedème notamment du poumon, coeur, reins et cerveau (Lefevre, PC ''et al.'' 2003 ; Walker, RL ''et al.'' 2004). La toxine epsilon est une toxine puissante qui est responsable de l'entérotoxémie ovine fatale, de la maladie du rein pulpeux et de la dysenterie de l’agneau.

==Au sujet de cette structure==
1UYJ est une structure à 3 chaînes de séquences de [http://en.wikipedia.org/wiki/Clostridium_perfringens Clostridium perfringens]. Des informations crystallographique complètes sont disponibles sur [http://oca.weizmann.ac.il/oca-bin/ocashort?Id=1UYJ OCA].

==Référence==
<ref group="xtra">PMID:15258571</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:1729175</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:8831683</ref><references group="xtra"/>
Popoff MR. Clostridial and Bacteroides Toxins: Structure and Mode of Action. In "Strict and Facultative
Anaerobes Medical and Environmental Aspects" (Michiko, M, Nakano & Zuber, P eds) 2005, pp. 171-197.
<ref group="xtra">PMID:4305163</ref><references group="xtra"/>
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<ref group="xtra">PMID:172146</ref><references group="xtra"/>
Frey J. Toxines clostridiennes : pathogénie, implications cliniques, diagnostiques et preventives. Cycle de réunions des entérotoxémies. 2003.
<ref group="xtra">PMID:8964036</ref><references group="xtra"/>
Walker RL, Hirsh DC, Maclachlan NJ. Clostridium. In "Veterinary microbiology" 2nd edition 2004, pp. 535.
<ref group="xtra">PMID:1427007</ref><references group="xtra"/>
[[Category: Clostridium perfringens]]
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1uyj (French)

2010-01-12T13:57:52Z

Fred Vellieux:

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=== LA TOXINE EPSILON DE ''CLOSTRIDIUM PERFRINGENS'' MONTRE UNE SIMILARITE STRUCTURELLE AVEC LA TOXINE FORMEUSE DE PORE AEROLYSINE ===

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Résumé traduit de MEDLINE®/PubMed®, une base de données de la U.S. National Library of Medicine.

==CONTEXTE==

La toxine epsilon est produite par ''Clostridium perfringens'' de types B et D (Hunter SE ''et al.'', 1992; Goswami PP ''et al.'', 1996). Elle est sécrétée sous une forme de prototoxine inactive de 331 acides aminés, de poids moléculaire 33 kDa (Hunter SE ''et al.'', 1992).

L’activation de la prototoxine peut être réalisée, soit par les protéases synthétisées par la bactérie elle-même comme l’alpha-chymotrypsine et la protéase lambda, soit par certaines enzymes protéolytiques du tube digestif, telles que la trypsine. La protéase lambda agit du coté N-terminal en libérant un peptide de 11 acides aminés et un résidu de 29 acides aminés du coté C-terminal, tandis que la trypsine et l’alpha-chymotrypsine libèrent un résidu de 13 acides aminés de l’extrémité N-terminale et un résidu de 29 acides aminés de l’extrémité C-terminale (Popoff, MR 2005). Cette digestion protéolytique donne la forme active de la toxine epsilon qui est une forme létale, de poids moléculaire 29 KDa. Cette activation s’accompagne d’une légère modification des conformation et point isoélectrique (pI) de la toxine. La prototoxine et la toxine epsilon sont antigénétiquement identiques (Habeeb, AF 1969, 1975; Habeeb, AF ''et al.'', 1973), ce qui confirme que le peptide perdu n’est pas un déterminant antigénique de la molécule. La structure tridimensionnelle de la prototoxine est formée essentiellement de feuillets beta, alors que celle de la toxine est légèrement transformée en hélice alpha mais avec prédominance de la conformation beta (Habeeb, AF 1973). Il a été démontré que la structure de la toxine epsilon possède une structure similaire à celle de l’aerolysine d’''Aeromonas hydrophila'' (Cole, AR ''et al.'', 2004).

La toxine epsilon est codée par le gène etx, porté par un plasmide (de taille supérieure à 100 Kb, Hunter, SE ''et al.'', 1992) transférable horizontalement d’une souche à une autre (Frey J, 2003; Songer, JG 1996 ; Walker, RL ''et al.'', 2004). C’est un gène transposon (Daube, G & Simon, P 1992). Ce gène a été séquencé chez les deux types B et D (Havard, HL ''et al.'', 1992; Hunter, SE ''et al.'', 1992). La comparaison entre les deux séquences des gènes etxB et etxD montre une différence de deux nucléotides dans la partie codante ce qui a provoqué la substitution d’un acide aminé (Havard, HL ''et al.'', 1992).

La toxine epsilon est le facteur le plus virulent chez ''Clostridium perfringens'' de type D; elle interagit avec les cellules vasculaires endothéliales, provoquant une augmentation de la perméabilité des vaisseaux en endommageant directement l’endothélium ce qui amène à une perte de fluide et l’apparition d’oedème notamment du poumon, coeur, reins et cerveau (Lefevre, PC ''et al.'', 2003 ; Walker, RL ''et al.'', 2004). La toxine epsilon est une toxine puissante qui est responsable de l'entérotoxémie ovine fatale, de la maladie du rein pulpeux et de la dysenterie de l’agneau.

==Au sujet de cette structure==
1UYJ est une structure à 3 chaînes de séquences de [http://en.wikipedia.org/wiki/Clostridium_perfringens Clostridium perfringens]. Des informations crystallographique complètes sont disponibles sur [http://oca.weizmann.ac.il/oca-bin/ocashort?Id=1UYJ OCA].

==Référence==
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Popoff MR. Clostridial and Bacteroides Toxins: Structure and Mode of Action. In "Strict and Facultative
Anaerobes Medical and Environmental Aspects" (Michiko, M, Nakano & Zuber, P eds) 2005, pp. 171-197.
<ref group="xtra">PMID:4305163</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:4358084</ref><references group="xtra"/>
<ref group="xtra">PMID:172146</ref><references group="xtra"/>
Frey J. Toxines clostridiennes : pathogénie, implications cliniques, diagnostiques et preventives. Cycle de réunions des entérotoxémies. 2003.
<ref group="xtra">PMID:8964036</ref><references group="xtra"/>
Walker RL, Hirsh DC, Maclachlan NJ. Clostridium. In "Veterinary microbiology" 2nd edition 2004, pp. 535.
<ref group="xtra">PMID:1427007</ref><references group="xtra"/>
[[Category: Clostridium perfringens]]
[[Category: Basak, A K.]]
[[Category: Cole, A R.]]
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[[Category: Beta pore forming toxin]]

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1h6z (French)

2009-11-23T22:57:35Z

Fred Vellieux:

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===STRUCTURE CRISTALLOGRAPHIQUE A 3.0 A DE RÉSOLUTION DE LA PYRUVATE PHOSPHATE DIKINASE GLYCOSOMALE DE ''TRYPANOSOMA BRUCEI''===

La structure cristallographique de l'enzyme glycosomale pyruvate phosphate dikinase du parasite protozoaire africain ''Trypanosoma brucei'' a été résolue à 3.0 A de résolution par remplacement moléculaire. Le modèle de recherche était la structure à 2.3 A de résolution de l'enzyme de ''Clostridium symbiosum''. En raison des orientations relatives différentes des domaines et des sous-domaines dans les deux structures, le remplacement moléculaire n'a pu être réalisé qu' en positionnant ces éléments (quatre corps en tout) séquentiellement dans l'unité asymétrique du cristal de groupe d'espace P2(1)2(1)2, qui contient une sous-unité de phosphate pyruvate dikinase (PPDK). Le modèle affiné, comprenant 898 résidus et 188 molécules de solvant par sous-unité, a un résiduel crystallographique Rf = 0.245 (facteur R libre Rfree = 0.291) et montre une stéreochimie satisfaisante. Huit régions, comprenant un total de 69 résidus à la surface de la molécule, sont désordonnées dans cette forme cristalline. Les sous-unités de PPDK sont arrangées autour de l'axe cristallographique d'ordre comme un dimère, analogue à celui observé dans l'enzyme de ''C. symbiosum''. La comparaison des deux structures a été effectuée par superposition des deux modèles. Bien que le repliement de chaque domaine ou sous-domaine soit semblable, les orientations relatives de ces éléments constitutifs sont différentes dans les deux structures. L'enzyme trypanosomale est plus "recourbée" que l'enzyme bactérienne, avec la courbure s'accroissant depuis le centre de la molécule (proche de l'axe d'ordre 2 moléculaire) vers la périphérie où le domaine N-terminal est situé. En conséquence de cette courbure accrue et des différentes positions relatives des sous-domaines, la fente de liaison du nucléotide dans le domaine amino-terminal est plus large dans la PPDK de ''T. brucei'': le fragment N-terminal du domaine amino-terminal est situé à distance de l'histidine catalytique 482, compétente pour la réaction de phospho-transfert (à peu près à 10 A de distance). Nos observations suggèrent que les exigences de mouvements de domaines pendant la catalyse par l'enzyme pourraient inclure l'élargissement de la fente de liaison du nucléotide, pour permettre l'accès et le départ des ligands AMP ou ATP.

Résumé traduit de MEDLINE®/PubMed®, une base de données de la U.S. National Library of Medicine.

==Au sujet de cette structure==
1H6Z est une structure à 1 chaîne de séquence de [http://en.wikipedia.org/wiki/Trypanosoma_brucei Trypanosoma brucei]. Des informations cristallographiques complètes sont disponibles sur [http://oca.weizmann.ac.il/oca-bin/ocashort?id=1H6Z OCA]. Numéros biologiques appropriés pour cette protéine sur [http://bionumbers.hms.harvard.edu/search.aspx?log=y&task=searchbytrmorg&trm=%22Pyruvate+Pi+dikinase%22&org=%25 B10NUMB3R5]

==Références==
<ref group="xtra">PMID:12083528</ref><ref group="xtra">PMID:11092947</ref><ref group="xtra">PMID:9653123</ref><references group="xtra"/>
[[Category: Pyruvate, phosphate dikinase]]
[[Category: Trypanosoma brucei]]
[[Category: Baltz, T.]]
[[Category: Bringaud, F.]]
[[Category: Cosenza, L W.]]
[[Category: Vellieux, F M.D.]]
[[Category: Kinase]]
[[Category: Transferase]]
[[Category: Tropical parasite]]
[[Category: Trypanosome]]

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