Sandbox hamod: Difference between revisions

(83 intermediate revisions by 2 users not shown)

Line 1:

<~~Structure load~~='~~1gzx~~' ~~size~~='~~500~~' frame='true' align='right' caption='~~הימוגלובין~~' scene='~~Insert optional scene name here~~' />~~==This is a placeholder==~~

==המוגלובין==

~~This is a placeholder text to help you get started in~~

~~placing a Jmol applet on your page~~. ~~At any time, click~~

"~~Show Preview~~" ~~at the bottom of this page to see how it goes.~~

ההמוגלובין בנוי מ-4 תת יחידות:

שתי יחידות אלפא - בכל שרשרת אלפא 141 ח"א,

שתי יחידות בטא - בכל שרשרת בטא 146 ח"א.

בין תת היחידות קיימים קשרי מימן וקשרים יוניים, אך עיקר הייצוב הוא על ידי מגע בין אזורים הידרופוביים (20-30 ח"א מכל תת יחידה) שמקיימים ביניהם הצמדה הידרופובית.

סידור של 4 <scene name='Hemoglobin/Foursubunits/5'>תת יחידות</scene> ליחידה גדולה אחת משרת שתי מטרות:

(1) יציבות תרמודינמית של המולקולה בסביבה הידרופילות

(2) פעולת גומלין בין התת יחידות לקישור ושחרור החמצן

זיקת המוגלובין לחמצן עולה כשלחץ <scene name='Hemoglobin/Oxyheme_fe/7'>החמצן</scene> עולה ויורדת כשלחץ החמצן יורד.

המוגלובין נמצא בשתי צורות עיקריות:

1. רווי בחמצן "אוקסי-המוגלובין"

2. ללא חמצן "דיאוקסי-המוגלובין"

~~Replace the PDB id (use lowercase!) after the STRUCTURE_ and after PDB~~= ~~to load~~

בעת קשירת החמצן, יון הברזל נמצא במישור אחד עם טבעת <scene name='Hemoglobin/4heme/3'>ההם</scene> שבמרכז כל תת יחידה. כאשר מולקולת חמצן נקשרת לתת היחידה הראשונה <scene name='Hemoglobin/Oxysubunitsf/4'>טבעת ההם</scene>

~~and display another structure~~.

מתישרת, שינוי הקונפורמציה גורר בעקבותיו שינוי קונפורמציה דומה של תת היחידות הנותרות, וקישור מולקולות חמצן עד לרוויה. ההתהליך ההפוך מתרחש ברקמות בצורה דומה, שחרור המולקולה הראשונה דוחף את יון הברזל

בטבעת הראשונה וזה גורם לשינוי קונפרמציה בשאר תת היחידות ומולקולות החמצן נזרקות החוצה.

~~{{STRUCTURE_3cin | PDB=3cin | SCENE~~= }}

'''אנמיה חרמשית'''

אנמיה חרמשית נגרמת כתוצאה ממוטציה נקודתית בשרשרת של החלבון גלובין.

השוני בין המוגלובין זה והמוגלובין נורמלי הוא בחומצה אמינית אחת -

במקום <scene name='Hemoglobin/Hemoglobins_1hho/7'>חומצה גלוטמית</scene>

בעמדה 6 בשרשרת ביטא יש חומצה אמינית הידרופובית-ואלין (תמונה מימין).

במחלה זו הדיאוקסי-המוגלובין נוטה לשקוע בצורת סיבים כתוצאה מהתאמה של ואלין במולקולה ראשונה לשקע הידרופובי מתאים במולקולה שניה. הסיבים גורמים לכדורית הדם האדומה לקבל צורה של חרמש (תמונה משמאל).

[[Image:hbs.png]] [[Image:enemya.jpg]]

Sandbox hamod: Difference between revisions

Navigation menu

Page actions

Page actions

Personal tools

Navigation

Search

Tools

@@ Line 1: / Line 1: @@
-<Structure load='1gzx' size='500' frame='true' align='right' caption='הימוגלובין' scene='Insert optional scene name here' />==This is a placeholder==
+==המוגלובין==
-This is a placeholder text to help you get started in
+<div dir='rtl' align='right'>
-placing a Jmol applet on your page. At any time, click
+<p dir='rtl'>
-"Show Preview" at the bottom of this page to see how it goes.
+<structure load="1gzx" size="300" color="white" frame="true" align="right" caption="Hemoglobin" scene="Hemoglobin/1gzx/2" />
+ההמוגלובין בנוי מ-4 תת יחידות: <bR>
+שתי יחידות אלפא - בכל שרשרת אלפא 141 ח"א, <bR>
+שתי יחידות בטא  - בכל שרשרת בטא 146 ח"א.
+<bR>
+בין תת היחידות קיימים קשרי מימן וקשרים יוניים, אך עיקר הייצוב הוא על ידי מגע בין אזורים הידרופוביים (20-30 ח"א מכל תת יחידה) שמקיימים ביניהם הצמדה הידרופובית.<bR>
+סידור של 4  <scene name='Hemoglobin/Foursubunits/5'>תת יחידות</scene> ליחידה גדולה אחת משרת שתי מטרות:<bR>
+(1) יציבות תרמודינמית של המולקולה בסביבה הידרופילות
+<br>
+(2) פעולת גומלין בין התת יחידות לקישור ושחרור החמצן
+<bR>
+זיקת המוגלובין לחמצן עולה כשלחץ <scene name='Hemoglobin/Oxyheme_fe/7'>החמצן</scene> עולה ויורדת כשלחץ החמצן יורד.
+המוגלובין נמצא בשתי צורות עיקריות: <bR>
+. רווי בחמצן "אוקסי-המוגלובין"<bR>
+. ללא חמצן "דיאוקסי-המוגלובין"  <bR>
-Replace the PDB id (use lowercase!) after the STRUCTURE_ and after PDB= to load
+בעת קשירת החמצן, יון הברזל נמצא במישור אחד עם טבעת  <scene name='Hemoglobin/4heme/3'>ההם</scene> שבמרכז כל תת יחידה. כאשר מולקולת חמצן נקשרת לתת היחידה הראשונה <scene name='Hemoglobin/Oxysubunitsf/4'>טבעת ההם</scene>
-and display another structure.
+מתישרת, שינוי הקונפורמציה גורר בעקבותיו שינוי קונפורמציה דומה של תת היחידות הנותרות, וקישור מולקולות חמצן עד לרוויה. ההתהליך ההפוך מתרחש ברקמות בצורה דומה, שחרור המולקולה הראשונה דוחף את יון הברזל
+<scene name='Hemoglobin/Deoxyheme_fe/9'>2+Fe</scene>
+בטבעת הראשונה וזה גורם לשינוי קונפרמציה בשאר תת היחידות ומולקולות החמצן נזרקות החוצה.<bR>
-{{STRUCTURE_3cin |  PDB=3cin  |  SCENE=  }}
+<bR><bR><bR>
+'''אנמיה חרמשית'''
+<bR>
+אנמיה חרמשית נגרמת כתוצאה ממוטציה נקודתית בשרשרת של החלבון גלובין.
+השוני בין המוגלובין זה והמוגלובין נורמלי הוא בחומצה אמינית אחת -
+במקום <scene name='Hemoglobin/Hemoglobins_1hho/7'>חומצה גלוטמית</scene>
+בעמדה 6 בשרשרת ביטא יש חומצה אמינית הידרופובית-ואלין (תמונה מימין).<bR>
+במחלה זו הדיאוקסי-המוגלובין נוטה לשקוע בצורת סיבים כתוצאה מהתאמה של ואלין במולקולה ראשונה לשקע הידרופובי מתאים במולקולה שניה. הסיבים גורמים לכדורית הדם האדומה לקבל צורה של חרמש (תמונה משמאל).
+[[Image:hbs.png]]  [[Image:enemya.jpg]]