Sandbox-vp: Difference between revisions

From Proteopedia
Jump to navigationJump to search
Student (talk | contribs)
No edit summary
Student (talk | contribs)
No edit summary
 
(14 intermediate revisions by the same user not shown)
Line 2: Line 2:
<StructureSection load='2gu2' size='350' side='left' caption='Structure of HMG-CoA reductase (PDB entry [[1dq8]])' scene=''>
<StructureSection load='2gu2' size='350' side='left' caption='Structure of HMG-CoA reductase (PDB entry [[1dq8]])' scene=''>
<div dir='rtl'>
<div dir='rtl'>
[[Image:2gu2.png|right|260px|thumb]]
'''אנזים אספרטואצילאז מזרז הידרוליזה של N-acetyl-l-aspartate  לאספרטאט ואצטאט [http://he.wikipedia.org/wiki/%D7%97%D7%95%D7%9E%D7%A8_%D7%9C%D7%91%D7%9F בחומר הלבן]'''.
מחסור בפעילות זו מוביל לניוון של החומר הלבן של המוח והוא הגורם המוכח של מחלה  גנטית "[http://en.wikipedia.org/wiki/Canavan_disease קנוואן], ", שהיא מחלה סופנית אצל ילדים קטנים.


'''אנזים אספרטואצילאז מזרז הידרוליזה של N-acetyl-l-aspartate  לאספרטאט ואצטאט במוח הלבן| חומר לבן]][['''.
מחסור בפעילות זו מוביל לניוון של החומר הלבן של המוח והוא הגורם המוכח של מחלה  גנטית "קנוואן", שהיא מחלה סופנית אצל ילדים קטנים.
אנו מציגים מבנה גבישי של חלבון משוחלף של אדם ועכבר, ברזולוציה 2.8-1.8 אנגסטרם. החלבון בנוי משתי שרשראות.
המבנים חושפים שהדומיין של קצה N- טרמינלי של החלבון מאמץ כיפוף חלבוני(protein fold) הדומה לזה של הידרולאזות-תלויות-אבץ השייכות למשפחה של קרבוקסיפפטידזות (Caraboxypeptidases A). באתר הקטליטי של החלבון ניתן לצפות בדמיון מבני לזה של הקרבוקסיפפטידזות, למרות העובדה שהם זהים רק 10-13% ברצף הראשוני שלהם. כ-100 שיירים של חומצות אמיניות בקצה C-טרמינלי יוצרים דומיין גלובולרי עם לינקר הבנוי מ- 2 משטחי ביטא <scene name='Sandbox-vp/2gu2/2'>מבנה הלבון משטחי בטא</scene>
הכרוך סביב קצה N-טרמינלי של הדומיינים. התעלה הארוכה המובילה לאתר הפעיל נוצרה על ידי מגע בין דומיינים N-ו-C טרמינלי.
דומיין C טרמינלי ממוקדם בדרך שמונעת קישור יעיל של פוליפפטידים באתר הפעיל. המבנה חושף ששיירים 158-164 יכולים לעבור שינוי מרחבי שמתרחש עקב פתיחה וסגירה של פתח התעלה. לפי כך, קיימת היפוטיזה כי המנגנון הקטליטי של אספארטואצילאז קרוב למנגנון הקטליטי של קרבוקסיפפטידאזות.
    
    
==תפקיד של החלבון==
==תפקיד החלבון==
תפקיד של החלבון אספרטואצילאז הוא פירוק של חומצה אצטיל-אספרטית לאצטיל ואספרטט :
תפקיד החלבון אספרטואצילאז הוא פירוק של חומצה אצטיל-אספרטית לאצטיל ואספרטט <ref name="UniProt">http://www.uniprot.org/uniprot/Q9R1T5</ref> :
N-acyl-L-aspartate + H2O ⇄ a carboxylate + L-aspartate


  N-acyl-L-aspartate + H(2)O ⇄ a carboxylate + L-aspartate
כיצד מבנה האנזים מאפשר לו לזרז הידרוליזה של N-acetyl-l-aspartate ? 
 
החלבון בנוי משתי שרשראות. המבנים חושפים  [http://en.wikipedia.org/wiki/Protein_domain שהדומיין] של קצה N- טרמינלי של החלבון מאמץ כיפוף חלבוני([http://en.wikipedia.org/wiki/Protein_folding protein fold]) הדומה לזה של הידרולאזות-תלויות-אבץ השייכות למשפחה של קרבוקסיפפטידזות ([http://en.wikipedia.org/wiki/Carboxypeptidase_A Caraboxypeptidases A]). באתר הקטליטי של החלבון ניתן לצפות בדמיון מבני לזה של הקרבוקסיפפטידזות, למרות העובדה שהם זהים רק 10-13% ברצף הראשוני שלהם. כ-100 שיירים של חומצות אמיניות בקצה C-טרמינלי יוצרים דומיין גלובולרי עם לינקר הבנוי מ- 2  <scene name='Sandbox-vp/2gu2/2'>משטחי  בטא</scene>  (מסומנים בירוק) , שניתן לצפות בהם גם  <scene name='Sandbox-vp/2gu2/3'>בגרף רמצ'נדרן</scene>  הכרוך סביב קצה N-טרמינלי של הדומיינים. התעלה הארוכה המובילה לאתר הפעיל נוצרה על ידי מגע בין דומיינים N-ו-C טרמינלי.
דומיין C טרמינלי ממוקדם בדרך שמונעת קישור יעיל של פוליפפטידים באתר הפעיל. המבנה חושף ששיירים 158-164 יכולים לעבור שינוי מרחבי שמתרחש עקב פתיחה וסגירה של פתח התעלה. לפי כך, קיימת היפוטיזה כי המנגנון הקטליטי של אספארטואצילאז קרוב למנגנון הקטליטי של קרבוקסיפפטידאזות.<ref name="Abstract"> PMID: 17194761</ref>




==אנזים אספרטואצילאז והקשר למחלת קנוואן==
==אנזים אספרטואצילאז והקשר למחלת קנוואן==
זו מחלה ניוונית מתקדמת וקשה של המוח. היא נגרמת הצטברות של חומצה אצטיל-אספרטית, אשר צרכיה להתפרק לאצטיל ואספרטט בעזרת אנזים אספרטואצילאז.אצל חולי קנוואן האנזים אינו פעיל עקב מוטציה בכרומוז 17. החומר  המצטבר (חומצה אצטיל-אספרטית) כנראה רעיל ומפריע ביצירת המיאלין שעוטף את סיבי העצבים (חומר לבן)- כתוצאה מכך יש נפיחות בלתי תקינה של החומר הלבן.  
זו מחלה ניוונית מתקדמת וקשה של המוח. היא נגרמת הצטברות של חומצה אצטיל-אספרטית, אשר צרכיה להתפרק לאצטיל ואספרטט בעזרת אנזים אספרטואצילאז.אצל חולי קנוואן האנזים אינו פעיל עקב מוטציה בכרומוז 17. החומר  המצטבר (חומצה אצטיל-אספרטית) כנראה רעיל ומפריע ביצירת המיאלין שעוטף את סיבי העצבים (חומר לבן)- כתוצאה מכך יש נפיחות בלתי תקינה של החומר הלבן.  
המחלה מתחילה להתבטא כבר 2-4 חודשים לאחר הלידה. רוב החולים נפטרים עד גיל 3 שנים אך עם טיפול תומך ראו בשנים עליה בתוחלת החיים עד אפילו גיל ההתבגרות.
המחלה מתחילה להתבטא כבר 2-4 חודשים לאחר הלידה. רוב החולים נפטרים עד גיל 3 שנים אך עם טיפול תומך ראו בשנים עליה בתוחלת החיים עד אפילו גיל ההתבגרות. <ref name="canavan">http://genopedia.co.il/index.php/%D7%A7%D7%A0%D7%95%D7%95%D7%90%D7%9F</ref>
 
==רפרנסים==
<references />
 
 
==לקריאה נוספת==
[http://www.ynet.co.il/articles/0,7340,L-4319316,00.html ביה"ח טעה במי שפיר - התינוקת נולדה עם מחלה קטלנית]
 
 


</div>
</div>


</StructureSection>
</StructureSection>

Latest revision as of 18:12, 27 February 2013

(Aspartoacylase) אספרטואצילאז

Structure of HMG-CoA reductase (PDB entry 1dq8)

Drag the structure with the mouse to rotate