Sandbox-vp: Difference between revisions
From Proteopedia
Jump to navigationJump to search
No edit summary |
No edit summary |
||
| (4 intermediate revisions by the same user not shown) | |||
| Line 7: | Line 7: | ||
==תפקיד | ==תפקיד החלבון== | ||
תפקיד | תפקיד החלבון אספרטואצילאז הוא פירוק של חומצה אצטיל-אספרטית לאצטיל ואספרטט <ref name="UniProt">http://www.uniprot.org/uniprot/Q9R1T5</ref> : | ||
N-acyl-L-aspartate + H2O ⇄ a carboxylate + L-aspartate | N-acyl-L-aspartate + H2O ⇄ a carboxylate + L-aspartate | ||
כיצד מבנה האנזים מאפשר לו לזרז הידרוליזה של N-acetyl-l-aspartate ? | כיצד מבנה האנזים מאפשר לו לזרז הידרוליזה של N-acetyl-l-aspartate ? | ||
החלבון בנוי משתי שרשראות. המבנים חושפים [http://en.wikipedia.org/wiki/Protein_domain שהדומיין] של קצה N- טרמינלי של החלבון מאמץ כיפוף חלבוני([http://en.wikipedia.org/wiki/Protein_folding protein fold]) הדומה לזה של הידרולאזות-תלויות-אבץ השייכות למשפחה של קרבוקסיפפטידזות ([http://en.wikipedia.org/wiki/Carboxypeptidase_A Caraboxypeptidases A]). באתר הקטליטי של החלבון ניתן לצפות בדמיון מבני לזה של הקרבוקסיפפטידזות, למרות העובדה שהם זהים רק 10-13% ברצף הראשוני שלהם. כ-100 שיירים של חומצות אמיניות בקצה C-טרמינלי יוצרים דומיין גלובולרי עם לינקר הבנוי מ- 2 <scene name='Sandbox-vp/2gu2/2'>משטחי בטא</scene> (מסומנים בירוק) , שניתן לצפות בהם גם <scene name='Sandbox-vp/2gu2/3'>בגרף רמצ'נדרן</scene> הכרוך סביב קצה N-טרמינלי של הדומיינים. התעלה הארוכה המובילה לאתר הפעיל נוצרה על ידי מגע בין דומיינים N-ו-C טרמינלי. | |||
המבנים חושפים שהדומיין של קצה N- טרמינלי של החלבון מאמץ כיפוף חלבוני(protein fold) הדומה לזה של הידרולאזות-תלויות-אבץ השייכות למשפחה של קרבוקסיפפטידזות (Caraboxypeptidases A). באתר הקטליטי של החלבון ניתן לצפות בדמיון מבני לזה של הקרבוקסיפפטידזות, למרות העובדה שהם זהים רק 10-13% ברצף הראשוני שלהם. כ-100 שיירים של חומצות אמיניות בקצה C-טרמינלי יוצרים דומיין גלובולרי עם לינקר הבנוי מ- 2 <scene name='Sandbox-vp/2gu2/2'>משטחי בטא</scene> (מסומנים בירוק) , שניתן לצפות בהם גם <scene name='Sandbox-vp/2gu2/3'>בגרף רמצ'נדרן</scene> הכרוך סביב קצה N-טרמינלי של הדומיינים. התעלה הארוכה המובילה לאתר הפעיל נוצרה על ידי מגע בין דומיינים N-ו-C טרמינלי. | |||
דומיין C טרמינלי ממוקדם בדרך שמונעת קישור יעיל של פוליפפטידים באתר הפעיל. המבנה חושף ששיירים 158-164 יכולים לעבור שינוי מרחבי שמתרחש עקב פתיחה וסגירה של פתח התעלה. לפי כך, קיימת היפוטיזה כי המנגנון הקטליטי של אספארטואצילאז קרוב למנגנון הקטליטי של קרבוקסיפפטידאזות.<ref name="Abstract"> PMID: 17194761</ref> | דומיין C טרמינלי ממוקדם בדרך שמונעת קישור יעיל של פוליפפטידים באתר הפעיל. המבנה חושף ששיירים 158-164 יכולים לעבור שינוי מרחבי שמתרחש עקב פתיחה וסגירה של פתח התעלה. לפי כך, קיימת היפוטיזה כי המנגנון הקטליטי של אספארטואצילאז קרוב למנגנון הקטליטי של קרבוקסיפפטידאזות.<ref name="Abstract"> PMID: 17194761</ref> | ||
| Line 21: | Line 19: | ||
==אנזים אספרטואצילאז והקשר למחלת קנוואן== | ==אנזים אספרטואצילאז והקשר למחלת קנוואן== | ||
זו מחלה ניוונית מתקדמת וקשה של המוח. היא נגרמת הצטברות של חומצה אצטיל-אספרטית, אשר צרכיה להתפרק לאצטיל ואספרטט בעזרת אנזים אספרטואצילאז.אצל חולי קנוואן האנזים אינו פעיל עקב מוטציה בכרומוז 17. החומר המצטבר (חומצה אצטיל-אספרטית) כנראה רעיל ומפריע ביצירת המיאלין שעוטף את סיבי העצבים (חומר לבן)- כתוצאה מכך יש נפיחות בלתי תקינה של החומר הלבן. | זו מחלה ניוונית מתקדמת וקשה של המוח. היא נגרמת הצטברות של חומצה אצטיל-אספרטית, אשר צרכיה להתפרק לאצטיל ואספרטט בעזרת אנזים אספרטואצילאז.אצל חולי קנוואן האנזים אינו פעיל עקב מוטציה בכרומוז 17. החומר המצטבר (חומצה אצטיל-אספרטית) כנראה רעיל ומפריע ביצירת המיאלין שעוטף את סיבי העצבים (חומר לבן)- כתוצאה מכך יש נפיחות בלתי תקינה של החומר הלבן. | ||
המחלה מתחילה להתבטא כבר 2-4 חודשים לאחר הלידה. רוב החולים נפטרים עד גיל 3 שנים אך עם טיפול תומך ראו בשנים עליה בתוחלת החיים עד אפילו גיל ההתבגרות. | המחלה מתחילה להתבטא כבר 2-4 חודשים לאחר הלידה. רוב החולים נפטרים עד גיל 3 שנים אך עם טיפול תומך ראו בשנים עליה בתוחלת החיים עד אפילו גיל ההתבגרות. <ref name="canavan">http://genopedia.co.il/index.php/%D7%A7%D7%A0%D7%95%D7%95%D7%90%D7%9F</ref> | ||
==רפרנסים== | ==רפרנסים== | ||
<references /> | <references /> | ||
==לקריאה נוספת== | |||
[http://www.ynet.co.il/articles/0,7340,L-4319316,00.html ביה"ח טעה במי שפיר - התינוקת נולדה עם מחלה קטלנית] | |||
</div> | </div> | ||
</StructureSection> | </StructureSection> | ||
Latest revision as of 18:12, 27 February 2013
(Aspartoacylase) אספרטואצילאז
| ||||||||||||
