|
|
| Line 10: |
Line 10: |
| 2. בתא יש ריכוז גבוהה של חלבונים שמפריע לקיפול ולא תמיד הרכב התמיסה בתא מתאים לכל חלבון . | | 2. בתא יש ריכוז גבוהה של חלבונים שמפריע לקיפול ולא תמיד הרכב התמיסה בתא מתאים לכל חלבון . |
|
| |
|
| מבנה השפירון GROEL: | | מבנה החלבון |
| החלבון נוצר מ- 14 תת יחדות (מונומרים), 2 טבעות שכל טבעת מורכבת מ- 7 מונומרים. | | החלבון נוצר מ- 14 תת יחדות (מונומרים) מסודרות במבנה של 2 טבעות. |
| | כל טבעת מורכבת מ- 7 מונומרים. |
| ה-GROEL יוצר חלל שהחלבון יכול להתקפל בו בתנאים אופטימלים. | | ה-GROEL יוצר חלל שהחלבון יכול להתקפל בו בתנאים אופטימלים. |
| יש חלבון נוסף המסייע הנקרא GROES הסוגר את החלל ואז בתוך החלל יכול ליצור את האינטראקציות האופטימליות מבלי שיעשה אינטראקציות עם מולקולות אחרות. | | יש חלבון נוסף המסייע הנקרא GROES הסוגר את החלל מהווה מעין מכסה ל"מבחנה". |
| מנגנון הפעולה :
| | כך בתוך החלל יכול ליצור את האינטראקציות האופטימליות מבלי שיעשה אינטראקציות עם מולקולות אחרות. |
| אלוסטריה ב- GROEL - שינויי קונפורמציה בעקבות קישור
| |
| 1. ל-GROEL במצב R יש אפיניות גדולה ל- ATP .
| |
| 2. ATP נקשר לטבעת אחת של GROEL והקונפורמציה של הטבעת עוברת ממצב R למצב T.
| |
| 3. במצב T יש אפיניות גדולה יותר לפוליפפטידים. נקשר לאזורים הידרופוביים של החלבונים הלא מקופלים (או שמקופלים לא טוב).
| |
| ה-GROES נקשר ל-GROEL ומכסה את החלל. מקבלים מבנה שדומה למבחנה עם מכסה (שהחלבון לכוד בפנים). הGroES מבודד את החלבון מהסביבה ונותן לו סביבה הידרופובית. בשלב זה הטבעת השניה לא קושרת בהעדר קונפורמציה מתאימה.
| |
| 4. החלבון מתקפל בתוך החלל וה-ATP מתפרק ל-ADP+P ואז חוזרים למצב R . החלבון המקופל יוצא החוצה וכמו כן ה- GROES , לא לפני שהטבעת השניה מתחילה לקשור ATP וחוזר חלילה.
| |
| | |
| לסיכום:
| |
| • קיימת התאמה בין 2 הטבעות. קואופרטיביות שלילת : כשהאחת קשרה ATP השניה לא יכולה לקשור.
| |
| • הקישור לחלבון תלוי במצב הטבעת T/R
| |
| • בחלבון לא מקופל / לא מקופל היטב, האזורים ההידרופובים חשופים ועשויים להתקשר לטבעת GroEL במצב T. במצב Rהחלבון המקופל מתנתק.
| |
| • GroEL אינו מראה ספציפיות רבה – כלומר נקשר לחלבונים רבים, שונים זה מזה. המוטיב המשותף היחיד לכל החלבונים הוא היותם פרושים, ולכן צפויים להמצא אזורים הידרופוביים החשופים לתמיסה החיצונית. לכן, האנטראקציה של GroEL עם החלבונים היא בעיקר באמצעות אנטראקציות הידרופוביות לא ספציפיות.
| |
