Calculate structure: Difference between revisions

From Proteopedia
Jump to navigationJump to search
No edit summary
No edit summary
Line 9: Line 9:


After Jmol completes the 'Calculate structure' computation the results of the computation is printed in the upper box of the console. One part of that output is a summary of the different types of secondary structure and their location. Below is a copy of that summary for domain 2 of glycogen phosphorylase:
After Jmol completes the 'Calculate structure' computation the results of the computation is printed in the upper box of the console. One part of that output is a summary of the different types of secondary structure and their location. Below is a copy of that summary for domain 2 of glycogen phosphorylase:
SUMMARY:
SUMMARY:<br>
B : A:486_A:486
B : A:486_A:486<br>
T : A:488_A:488
T : A:488_A:488<br>
I : A:489_A:494
I : A:489_A:494<br>
T : A:495_A:495
T : A:495_A:495<br>
H : A:497_A:507
H : A:497_A:507<br>
G : A:510_A:513
G : A:510_A:513<br>
G : A:515_A:524
G : A:515_A:524<br>
T : A:525_A:526
T : A:525_A:526<br>
H : A:528_A:551
H : A:528_A:551<br>
E : A:562_A:567
E : A:562_A:567<br>
G : A:572_A:574
G : A:572_A:574<br>
H : A:576_A:592
H : A:576_A:592<br>
T : A:594_A:595
T : A:594_A:595<br>
E : A:601_A:606
E : A:601_A:606<br>
T : A:611_A:612
T : A:611_A:612<br>
H : A:614_A:632
H : A:614_A:632<br>
T : A:635_A:638
T : A:635_A:638<br>
E : A:640_A:644
E : A:640_A:644<br>
H : A:650_A:659
H : A:650_A:659<br>
E : A:662_A:665
E : A:662_A:665<br>
T : A:669_A:670
T : A:669_A:670<br>
T : A:676_A:677
T : A:676_A:677<br>
H : A:678_A:682
H : A:678_A:682<br>
T : A:683_A:685
T : A:683_A:685<br>
E : A:687_A:691
E : A:687_A:691<br>
T : A:694_A:695
T : A:694_A:695<br>
H : A:696_A:703
H : A:696_A:703<br>
G : A:705_A:707
G : A:705_A:707<br>
E : A:709_A:711
E : A:709_A:711<br>
H : A:715_A:724
H : A:715_A:724<br>
T : A:728_A:728
T : A:728_A:728<br>
H : A:729_A:734
H : A:729_A:734<br>
H : A:736_A:746
H : A:736_A:746<br>
T : A:747_A:750
T : A:747_A:750<br>
T : A:752_A:753
T : A:752_A:753<br>
G : A:755_A:758
G : A:755_A:758<br>
H : A:759_A:768
H : A:759_A:768<br>
T : A:773_A:773
T : A:773_A:773<br>
G : A:774_A:776
G : A:774_A:776<br>
T : A:777_A:777
T : A:777_A:777<br>
H : A:778_A:791
H : A:778_A:791<br>
H : A:794_A:806
H : A:794_A:806<br>
T : A:807_A:807
T : A:807_A:807<br>
G : A:808_A:811
G : A:808_A:811<br>
B : A:812_A:812
B : A:812_A:812<br>
H : A:813_A:821
H : A:813_A:821<br>
T : A:822_A:825
T : A:822_A:825<br>