3D Molecular Models: Difference between revisions
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En ocasiones puede resultar de interés que el modelo proporcione información acerca de la estructura secundaria que presentan distintos tramos de una cadena polipeptídica. Para ello se utiliza el <scene name='60/603296/Insulina/20'>modelo de cintas</scene>, que en este caso pone de manifiesto el predominio en la insulina de la estructura secundaria en hélice-α. Una alternativa interesante puede ser el modelo que resalta el <scene name='60/603296/Insulina/21'>esqueleto</scene> de las cadenas polipeptídicas obviando las cadenas laterales de los aminoácidos, o el que reprenta los tramos con estructura secundaria en hélice-α por medio de <scene name='60/603296/Insulina/22'>"cohetes"</scene>. | En ocasiones puede resultar de interés que el modelo proporcione información acerca de la estructura secundaria que presentan distintos tramos de una cadena polipeptídica. Para ello se utiliza el <scene name='60/603296/Insulina/20'>modelo de cintas</scene>, que en este caso pone de manifiesto el predominio en la insulina de la estructura secundaria en hélice-α. Una alternativa interesante puede ser el modelo que resalta el <scene name='60/603296/Insulina/21'>esqueleto</scene> de las cadenas polipeptídicas obviando las cadenas laterales de los aminoácidos, o el que reprenta los tramos con estructura secundaria en hélice-α por medio de <scene name='60/603296/Insulina/22'>"cohetes"</scene>. | ||
La molécula utilizada como ejemplo hasta ahora, la insulina, es una proteína relativamente pequeña y de estructura tridimensional no demasiado compleja. Los modelos moleculares virtuales pueden utilizarse para representar estructuras sensiblemente más grandes y complejas. Aquí podemos ver un modelo | La molécula utilizada como ejemplo hasta ahora, la insulina, es una proteína relativamente pequeña y de estructura tridimensional no demasiado compleja. Los modelos moleculares virtuales pueden utilizarse para representar estructuras sensiblemente más grandes y complejas. Aquí podemos ver un modelo espacial compacto del enzima <scene name='60/603296/Atcasa/1'>aspartato-transcarbamilasa</scene>, que cataliza una de las etapas iniciales en la síntesis de las pirimidinas. La unidad funcional de la '''aspartato-transcarbamilasa''' es un dodecámero que aquí vemos representado mediante un modelo espacial compacto en el que se resaltan por medio de distintos colores las 12 subunidades que lo forman. En el dodecámero podemos distinguir <scene name='60/603296/Atcasa/2'>dos trímeros catalíticos</scene> y <scene name='60/603296/Atcasa/3'>tres dímeros reguladores</scene>. Un <scene name='60/603296/Atcasa/5'>modelo de cintas</scene> nos da información acerca de la distribución de los distintos tipos de estructura secundaria en las distintas subunidades; vemos que la hélice-α (en púrpura) predomina en las subunidades catalíticas mientras que la hoja-β (en amarillo) lo hace en las reguladoras. Usando ahora un <scene name='60/603296/Atcasa/4'>modelo de bolas y varillas</scene> podemos apreciar la compleja estructura de esta gran macromolécula que está formada por 21.318 átomos. | ||
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