Sandbox K: Difference between revisions

From Proteopedia
Jump to navigationJump to search
Student (talk | contribs)
No edit summary
Student (talk | contribs)
No edit summary
Line 11: Line 11:
==משפחה של חלבונים מסוג קרטין==
==משפחה של חלבונים מסוג קרטין==


מקורו של השם קרטין מהמילה היוונית שמשמעותה "קרן". החלבונים העיקריים המרכיבים ציפורניים, קרניים, שערות נקראים "קרטינים". קביעת הרכב החלבונים במבנים אלה הראה שישנם שני סוגים של חלבונים מסוג קרטין: קרטינים הנקראים אלפא קרטינים ובטא קרטינים. שמות אלה ניתנו בהתאם למבנה השניוני העיקרי בחלבונים אלה.
ביונקים ישנה משפחה גדולה של חלבונים מסוג קרטין שמתבטאים באופן ספציפי בתאים שונים. חלבונים אלה מראים שונות בגודלם ומשקלם המולקולרי נע בטווח בין 40 עד לכ-70 קילודלטון.
אלפא קרטינים- המבנה השניוני העיקרי הוא סלילי אלפא.
בטא קרטינים- המבנה השניוני העיקרי הוא משטחי בטא.
אלפא קרטינים נמצאים לא רק בשערות אלא גם נמצאים בתוך תאי אפיתל, במיוחד בתאי אפידרמיס המרכיבים את העור.


ברוב התאים ישנו שלד תאי המורכב משלוש מערכות של סיבים:
קביעת רצף הגנום האנושי חשפה כי בבן אדם ישנם 54 גנים שמקודדים לקרטינים.<ref name="pmid16831889">{{Cite journal  | last1 = Schweizer | first1 = J. | last2 = Bowden | first2 = PE. | last3 = Coulombe | first3 = PA. | last4 = Langbein | first4 = L. | last5 = Lane | first5 = EB. | last6 = Magin | first6 = TM. | last7 = Maltais | first7 = L. | last8 = Omary | first8 = MB. | last9 = Parry | first9 = DA. | title = New consensus nomenclature for mammalian keratins. | journal = J Cell Biol | volume = 174 | issue = 2 | pages = 169-74 | month = Jul | year = 2006 | doi = 10.1083/jcb.200603161 | PMID = 16831889 }}</ref>


מיקרופילמנטים המורכבים מחלבון אקטין.


פילמנטים בינוניים המורכבים ממשפחה גדולה של חלבונים סיביים (fibrous proteins)  
למרות השונות במשקלם, קביעת רצף הגנים המקודדים לחלבונים אלה הביאה לגילוי כי החלבונים הללו הומולוגיים (דומים) ברצף השיירים (כלומר, המבנה הראשוני) בקטעים מסויימים. לכן, כל הקרטינים נחשבים כחלבונים ששייכים למשפחת אלפא קרטין.


מיקרוטובולים- המורכבים מחלבון מסוג טובולין.
המבנה הראשוני והשניוני של אלפא קרטין נקבע לראשונה ע"י חוקר ישראלי שעבד באוניברסיטת שיקגו.
<ref>PMID:6186381</ref> <ref>PMID:6191871</ref>


בעוד שמיקרופילמנטים ומיקרוטובולים מורכבים מחלבונים כדוריים (globular), פילמנטים בינוניים מורכבים מחלבונים סיביים (fibrous) בעלי מבנה סיבי ארוך שאינם כדוריים.  
רצפם של אלפא קרטינים רבים אחרים נקבעו על ידי קביעת רצף הגנים המקודדים לחלבונים אלה. הסיבה לכך היא שמבחינה טכנית יותר קל לנבא את רצף החלבון המקודד דרך קביעת רצף הגן, מאשר קביעת רצף החלבון עצמו.


ביונקים ישנם מספר רב של גנים שמקודדים לחלבונים שמרכיבים פילמנטים בינוניים. חלבונים שגנים אלה מקודדים מראים הומולוגיה ברצף שלהם. גנים אלה מתבטאים באופן ספציפי ברקמות מסוימות. חלבונים מסוג אלפא קרטין מתבטאים בעיקר בתאי אפיתל, במיוחד בשכבת האפידרמיס החיצונית של העור.
קביעת רצפם של אלפא קרטינים רבים הראתה כי ניתן לסווג את אלפא קרטינים לשתי קבוצות עיקריות בהתאם לדמיון (הומולוגיה) ברצף הראשוני שלהם. שני סוגים של אלפא קרטינים אלה נקראים סוג 1 (type-I) וסוג 2 (type-II). מינוח זה ניתן לראשונה גם כן ע"י חוקר ישראלי שקבע את הרצף הראשון של אלפא קרטין מסוג-II.




Line 36: Line 33:


<scene name='Sandbox_K/Hydrophobic_residues/1'>Hydrophobic residues</scene>
<scene name='Sandbox_K/Hydrophobic_residues/1'>Hydrophobic residues</scene>
==משפחה של אלפא קרטינים==
ביונקים ישנה משפחה גדולה של חלבונים מסוג אלפא קרטין שמתבטאים באופן ספציפי בתאים שונים. חלבונים אלה מראים שונות בגודלם ומשקלם המולקולרי נע בטווח בין 40 עד לכ-70 קילודלטון.
למרות השונות במשקלם, קביעת רצף הגנים המקודדים לחלבונים אלה הביאה לגילוי כי החלבונים הללו הומולוגיים (דומים) ברצף השיירים (כלומר, המבנה הראשוני) בקטעים מסויימים. לכן, כל הקרטינים נחשבים כחלבונים ששייכים למשפחת אלפא קרטין.
המבנה הראשוני והשניוני של אלפא קרטין נקבע לראשונה ע"י חוקר ישראלי שעבד באוניברסיטת שיקגו.
<ref>PMID:6186381</ref> <ref>PMID:6191871</ref>
רצפם של אלפא קרטינים רבים אחרים נקבעו על ידי קביעת רצף הגנים המקודדים לחלבונים אלה. הסיבה לכך היא שמבחינה טכנית יותר קל לנבא את רצף החלבון המקודד דרך קביעת רצף הגן, מאשר קביעת רצף החלבון עצמו.
קביעת רצפם של אלפא קרטינים רבים הראתה כי ניתן לסווג את אלפא קרטינים לשתי קבוצות עיקריות בהתאם לדמיון (הומולוגיה) ברצף הראשוני שלהם. שני סוגים של אלפא קרטינים אלה נקראים סוג 1 (type-I) וסוג 2 (type-II). מינוח זה ניתן לראשונה גם כן ע"י חוקר ישראלי שקבע את הרצף הראשון של אלפא קרטין מסוג-II.


==מבנה שניוני, שלישוני ורבעוני של אלפא קרטינים==
==מבנה שניוני, שלישוני ורבעוני של אלפא קרטינים==