Sandbox-vp: Difference between revisions

From Proteopedia
Jump to navigationJump to search
Student (talk | contribs)
No edit summary
Student (talk | contribs)
No edit summary
Line 5: Line 5:
'''אנזים אספרטואצילאז מזרז הידרוליזה של N-acetyl-l-aspartate  לאספרטאט ואצטאט [http://he.wikipedia.org/wiki/%D7%97%D7%95%D7%9E%D7%A8_%D7%9C%D7%91%D7%9F בחומר הלבן]'''.  
'''אנזים אספרטואצילאז מזרז הידרוליזה של N-acetyl-l-aspartate  לאספרטאט ואצטאט [http://he.wikipedia.org/wiki/%D7%97%D7%95%D7%9E%D7%A8_%D7%9C%D7%91%D7%9F בחומר הלבן]'''.  
מחסור בפעילות זו מוביל לניוון של החומר הלבן של המוח והוא הגורם המוכח של מחלה  גנטית "[http://en.wikipedia.org/wiki/Canavan_disease קנוואן], ", שהיא מחלה סופנית אצל ילדים קטנים.
מחסור בפעילות זו מוביל לניוון של החומר הלבן של המוח והוא הגורם המוכח של מחלה  גנטית "[http://en.wikipedia.org/wiki/Canavan_disease קנוואן], ", שהיא מחלה סופנית אצל ילדים קטנים.
 
==תפקיד של החלבון==
תפקיד של החלבון אספרטואצילאז הוא פירוק של חומצה אצטיל-אספרטית לאצטיל ואספרטט :
N-acyl-L-aspartate + H2O ⇄ a carboxylate + L-aspartate
כיצד מבנה האנזים מאפשר לו לזרז הידרוליזה ? N-acetyl-l-aspartate של




Line 10: Line 17:
המבנים חושפים שהדומיין של קצה N- טרמינלי של החלבון מאמץ כיפוף חלבוני(protein fold) הדומה לזה של הידרולאזות-תלויות-אבץ השייכות למשפחה של קרבוקסיפפטידזות (Caraboxypeptidases A). באתר הקטליטי של החלבון ניתן לצפות בדמיון מבני לזה של הקרבוקסיפפטידזות, למרות העובדה שהם זהים רק 10-13% ברצף הראשוני שלהם. כ-100 שיירים של חומצות אמיניות בקצה C-טרמינלי יוצרים דומיין גלובולרי עם לינקר הבנוי מ- 2  <scene name='Sandbox-vp/2gu2/2'>משטחי  בטא</scene>  (מסומנים בירוק)  , שניתן לצפות בהם גם  <scene name='Sandbox-vp/2gu2/3'>בגרף רמצ'נדרן</scene>  הכרוך סביב קצה N-טרמינלי של הדומיינים. התעלה הארוכה המובילה לאתר הפעיל נוצרה על ידי מגע בין דומיינים N-ו-C טרמינלי.
המבנים חושפים שהדומיין של קצה N- טרמינלי של החלבון מאמץ כיפוף חלבוני(protein fold) הדומה לזה של הידרולאזות-תלויות-אבץ השייכות למשפחה של קרבוקסיפפטידזות (Caraboxypeptidases A). באתר הקטליטי של החלבון ניתן לצפות בדמיון מבני לזה של הקרבוקסיפפטידזות, למרות העובדה שהם זהים רק 10-13% ברצף הראשוני שלהם. כ-100 שיירים של חומצות אמיניות בקצה C-טרמינלי יוצרים דומיין גלובולרי עם לינקר הבנוי מ- 2  <scene name='Sandbox-vp/2gu2/2'>משטחי  בטא</scene>  (מסומנים בירוק)  , שניתן לצפות בהם גם  <scene name='Sandbox-vp/2gu2/3'>בגרף רמצ'נדרן</scene>  הכרוך סביב קצה N-טרמינלי של הדומיינים. התעלה הארוכה המובילה לאתר הפעיל נוצרה על ידי מגע בין דומיינים N-ו-C טרמינלי.
דומיין C טרמינלי ממוקדם בדרך שמונעת קישור יעיל של פוליפפטידים באתר הפעיל. המבנה חושף ששיירים 158-164 יכולים לעבור שינוי מרחבי שמתרחש עקב פתיחה וסגירה של פתח התעלה. לפי כך, קיימת היפוטיזה כי המנגנון הקטליטי של אספארטואצילאז קרוב למנגנון הקטליטי של קרבוקסיפפטידאזות.
דומיין C טרמינלי ממוקדם בדרך שמונעת קישור יעיל של פוליפפטידים באתר הפעיל. המבנה חושף ששיירים 158-164 יכולים לעבור שינוי מרחבי שמתרחש עקב פתיחה וסגירה של פתח התעלה. לפי כך, קיימת היפוטיזה כי המנגנון הקטליטי של אספארטואצילאז קרוב למנגנון הקטליטי של קרבוקסיפפטידאזות.
 
==תפקיד של החלבון==
תפקיד של החלבון אספרטואצילאז הוא פירוק של חומצה אצטיל-אספרטית לאצטיל ואספרטט :
N-acyl-L-aspartate + H(2)O ⇄ a carboxylate + L-aspartate





Revision as of 16:55, 27 February 2013

(Aspartoacylase) אספרטואצילאז

Structure of HMG-CoA reductase (PDB entry 1dq8)

Drag the structure with the mouse to rotate