Se muestran aquí dos moléculas del péptido gramicidina (con 15 residuos aminoácidos cada una) tal como se cree que se disponen al formar un canal a través de la membrana de bicapa lipídica[1] (). La forma y el volumen de la proteína se muestran con una superficie punteada, y dentro de ella mediante un cordón y una cinta se representa la trayectoria del esqueleto peptídico, o línea que conecta los átomos de carbono alfa de cada aminoácido.
- Mostrar de las cadenas peptídicas de gramicidina. En este experimento las cadenas estaban unidas mediante una molécula de dioxolano (C, O).
- C, H, O, N, P
(Se ha omitido la mayoría de los átomos de hidrógeno.)
- Mostrar . Observa cómo las "colas" hidrófobas de los lípidos excluyen el agua.
- El agua pasa
.
- Mostrar .
- Mostrar sólo
.
C, H, O, N, P
Hay una explicación de su estructura en la guía detallada.