Sodium-potassium ATPase (Hebrew)

From Proteopedia

תצוגת החלבון המלא מעוגן בממברנת התא (צבע כחול - תת-יחידת אלפא, 10 סלילי-אלפא חוצי-ממברנה ממוספרים. צבע חול - תת-יחידה בטא. צבע אדום - תת-יחידה גמא )

משאבת נתרן אשלגן היא קומפלקס חלבוני המעוגן לקרום התא (ממברנה תאית) ומשמש להעברה פעילה של יוני נתרן ואשלגן אל מחוץ לתא ולתוכו. פעילות המשאבה יוצרת גרדיאנט אלקטרוכימי (מפל ריכוזים ומתח חשמלי) של נתרן ואשלגן בין שני צידי הקרום, שהינו חיוני לתאי בעלי חיים (ממלכת Animalia). גרדיאנט זה מאפשר העברת חומרים דרך ממברנת התא ומספק את האנרגיה הדרושה כדי להעביר חומרים גם נגד כיוון מפל הריכוזים הטבעי שלהם.


בסרטון הבא ניתן למצוא הסבר קצר על העברה פעילה (רלוונטי עד נקודת זמן 2:23).

משאבת נתרן-אשלגן היא החלבון שמאפשר לתאים של בעלי חיים, לשמר את מפל הריכוזים של יונים אלו ובנוסף פועלת ביעילות גבוהה.
כמו כן, הוכח כי משאבה זו משמשת גם כקולטן לסיגנלים סטרואידיים המעורבים בכיווץ הלב.
מפל הריכוזים שנוצר מפעילות המשאבה מספק אנרגיה למספר פעולות תאיות חשובות כגון: שליטה על פוטנציאל ממברנלי, שמירה על גודל תא, שמירה על הומיאוסטאזיס pH, קליטה של נוטריינטים, מים ועוד.

משאבת נתרן-אשלגן משפיעה על ריכוז יונים

שלבי פעילות המשאבה, לפי מצבי קונפורמציה

המשאבה מעבירה שלושה יוני נתרן (+Na) ושני יוני אשלגן (+K) דרך ממברנת התא. ריכוז יוני הנתרן בתוך התא נמוך יחסית לריכוזו מחוץ לתא. ריכוז יוני האשלגן בתוך התא גבוה יחסית לריכוזו מחוץ לתא. המשאבה פועלת כנגד מפל הריכוזים של יונים אלו ולכן התהליך צורך אנרגיה, בצורת פירוק (דה-פוספורילציה) של מולקולת ATP, שהיא "מטבע האנרגיה" העיקרי של הגוף.

המשאבה פועלת באופן רציף ומחזורי. שלבי פעולתה מכונים מצבים (states, ביחיד state).
במצב E1 מולקולת ATP קשורה לאתר הקישור ואתרי קישור לנתרן פתוחים לצידה התוך-תאי (ציטוזולי) של המשאבה. במצב זה נקשרים לחלבון 3 יוני נתרן ומתרחש שינוי במבנה המרחבי (שינוי קונפורמציה) במשאבה.
שינוי הקונפורמציה מקרב את מולקולת ה-ATP לאתר הקטליטי במשאבה. ATP עוברת פירוק (דה-פוספורילציה) וקבוצת הזרחה (פוספט) נקשרת לחלבון בקשר עתיר-אנרגיה, תגובה זו נקראת גם זירחון החלבון.

קישור קבוצת הפוספט לחלבון גורם לשינוי קונפורמציה נוסף וסגירה של השער הציטוזולי של המשאבה. במצב זה שלושת יוני הנתרן כלואים באופן זמני בחלק חוצה-הממברנה של המשאבה.
ADP שנותר מפירוק מולקולת ה-ATP, משוחרר מהחלבון לציטוזול. מצב זה נקרא E1-P.
זהו מצב אנרגטי מאוד של החלבון ולכן החלבון עובר שינוי קונפורמציה מהיר למצב E2-P, אשר פותח את השער החוץ-תאי של המשאבה.
הזיקה (אפיניות) של יוני הנתרן לחלבון במצב זה הינה נמוכה יותר והם משתחררים לסביבה החוץ-תאית. שני יוני אשלגן מהסביבה החוץ-תאית נקשרים בזיקה גבוהה לאתרים בתוך החלבון.

כאשר יוני האשלגן קשורים לצד החוץ-תאי, מתרחש שינוי קונפורמציה שסוגר את השער החוץ-תאי וכולא את יוני האשלגן בתוך המשאבה. שינוי זה גורם גם לדה-פוספורילציה (שחרור קבוצת זרחה) של החלבון.
כאשר קבוצת הזרחה משוחררת מהחלבון, החלבון נמצא במצב E2 ואתר הקישור למולקולת ATP זמין.
כש-ATP נקשר לאתר בחלבון, החלבון חוזר למצב E1 - השער הציטוזולי נפתח ויוני האשלגן משתחררים לתוך התא. האפיניות ליוני נתרן באתרי הקישור עולה ומחזור השאיבה ממשיך.

הסרטון הבא מציג את שינויי הקונפורמציות בפעילות המשאבה.

החלבון המוצג גובש מרקמת כליה של חזיר-בר (Sus scrofa) ומוצג כאן עם 2 יוני רובידיום (כאנלוגים ליוני האשלגן), מולקולת ATP, ליגנד מגנזיום-4-פלואור (כאנלוג לקבוצת הזרחה) וליגנד מגנזיום. קומפלקס המשאבה בנוי משלוש תת-יחידות (אלפא - כחול, בטא - ירוק בהיר, גמא - ורוד. יונים מוצגים בסגול, ATP מוצג באפור-אדום, ליגנדים מוצגים בירוק). גודל קומפלקס החלבון המלא הינו 2146 חומצות אמינו (כל כדור בצבע שונה מייצג חומצה אמינית), בשלושת תתי-היחידות יחד. תת-יחידה אלפא הינה תת-היחידה המרכזית מבחינת תפקוד המשאבה, בה נמצא האתר הפעיל (מכיל בתוכו אתר קישור סובסטרט ואת האתר הקטליטי) שבו ATP עובר פירוק (הידרוליזה). בתת-יחידה זו נמצאים גם אתרי הקישור ליוני הנתרן והאשלגן, בתוך הסלילים חוצי-הממברנה (טרנס-ממברנליים). האזור חוצה-הממברנה של תת-היחידה מורכב מעשרה סלילי אלפא (המסומנים 1-10 בתמונה במבוא). בנוסף, קיימים בתת-היחידה שני אזורים פונקציונליים (תיפקודיים) הממוקמים בצד הציטוזולי: אתר הקישור של מולקולת ATP והאתר הקטליטי בו מתרחשת העברת קבוצת הזרחה מ-ATP לחלבון עצמו. תת-יחידה זו היא הגדולה ביותר בקומפלקס המשאבה, מורכבת מ-1021 חומצות אמינו (מתוכן גובשו ומוצגות במודל 998 חומצות). תת-יחידה בטא הינה תת-יחידה שאינה פעילה מבחינת השאיבה. אך ביצירת ההטרודימר עם יחידה אלפא, יחידה בטא מייעדת את המשאבה אל קרום התא ומייצבת את המשאבה באופן מבני בתוך הקרום. תת-יחידה גמא גם היא אינה מעורבת בפעילות המשאבה, אלא בעלת תפקיד בקרתי על מספר משאבות הנתרן שמגיעות לקרום. ב-2007 (Morth ושות') הוכח כי פעילות הבקרה של תת-יחידה זו הינה שונה בין רקמות ובין איזופורמים שונים של המשאבה.

Jmol._Canvas2D (Jmol) "jmolApplet1"[x] loadScript /wiki/extensions/jsmol/j2s/core/package.js loadScript /wiki/extensions/jsmol/j2s/core/corejmol.z.js loadScript /wiki/extensions/jsmol/j2s/J/translation/PO.js loadScript /wiki/extensions/jsmol/j2s/core/corescript.z.js JSmol exec jmolApplet1 start applet null Jmol JavaScript applet jmolApplet1__167177124716853__ initializing Jmol getValue debug null Jmol getValue logLevel null Jmol getValue allowjavascript null AppletRegistry.checkIn(jmolApplet1__167177124716853__) vwrOptions: { "name":"jmolApplet1","applet":true,"documentBase":"https://proteopedia.org/wiki/index.php/Sodium-potassium_ATPase_%28Hebrew%29","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet1__167177124716853__","language":"he","codePath":"https:/wiki/extensions/jsmol/j2s/","display":"jmolApplet1_canvas2d","signedApplet":"true","loadStructCallback":"manageLoadStructCallback","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"167177124716853","messageCallback":"msgCb","bgcolor":"white" } setting document base to "https://proteopedia.org/wiki/index.php/Sodium-potassium_ATPase_%28Hebrew%29" en not supported -- using en (C) 2015 Jmol Development Jmol Version: 14.31.8 2020-09-26 10:04 java.vendor: Java2Script (HTML5) java.version: 2019-06-08 00:17:46 (JSmol/j2s) os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com) Access: ALL memory: 0.0/0.0 processors available: 1 useCommandThread: false appletId:jmolApplet1 (signed) Jmol getValue emulate null defaults = "Jmol" Jmol getValue boxbgcolor null Jmol getValue bgcolor white backgroundColor = "white" Jmol getValue ANIMFRAMECallback null Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback" StatusManager callback set for APPLETREADYCallback f=Jmol._readyCallback cb=APPLETREADY Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null Jmol getValue AUDIOCallback null Jmol getValue CLICKCallback null Jmol getValue DRAGDROPCallback null Jmol getValue ECHOCallback null Jmol getValue ERRORCallback null Jmol getValue EVALCallback null Jmol getValue HOVERCallback null Jmol getValue IMAGECallback null Jmol getValue LOADSTRUCTCallback manageLoadStructCallback LOADSTRUCTCallback = "manageLoadStructCallback" StatusManager callback set for LOADSTRUCTCallback f=manageLoadStructCallback cb=LOADSTRUCT Jmol getValue MEASURECallback null Jmol getValue MESSAGECallback msgCb MESSAGECallback = "msgCb" StatusManager callback set for MESSAGECallback f=msgCb cb=MESSAGE Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null Jmol getValue SERVICECallback null Jmol getValue PICKCallback null Jmol getValue RESIZECallback null Jmol getValue SCRIPTCallback null Jmol getValue SYNCCallback null Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null requested language=he; Jmol getValue doTranslate null language=en Jmol getValue doTranslate null Note -- Presence of message callback disables disable translation; to enable message translation use jmolSetTranslation(true) prior to jmolApplet() Note -- language translation disabled Jmol getValue popupMenu null Jmol getValue script null Jmol getValue loadInline null Jmol getValue load null Jmol applet jmolApplet1__167177124716853__ ready script 1 started pdbGetHeader = true FileManager opening url https://proteopedia.org/wiki/extensions/Proteopedia/spt/functions.spt?1733933141 loadScript /wiki/extensions/jsmol/j2s/core/coretext.z.js Loading, please wait ... platformSpeed = 8 loadScript /wiki/extensions/jsmol/j2s/core/corescriptmath.z.js loadScript /wiki/extensions/jsmol/j2s/J/bspt/PointIterator.js FileManager opening url https://proteopedia.org/cgi-bin/infopdb?3B8E loadScript /wiki/extensions/jsmol/j2s/JU/JSJSONParser.js loadScript /wiki/extensions/jsmol/j2s/JU/JSONException.js JSON parser cannot parse NetworkError Data for 3B8E could not be found.- Using defaults. Data for 3B8E could not be found.- Using defaults. cache cleared [Step 1] pdb_features.ca_p_only is: integer 0 [Step 1] pdb_features.ca_p_only is: integer 0 Loading, please wait ... spinqualitylabelsall models (PDB code 3b8e) משאבת נתרן-אשלגן Show:Asymmetric Unit Biological Assembly Drag the structure with the mouse to rotate   Export Animated Image

פעילות המשאבה יכולה להתקיים עם יחידת אלפא ויחידת בטא, אחת מכל סוג. ביונקים ישנם 4 איזופורמים של יחידת אלפא, המקודדים על ידי הגנים ATP1A1 עד ATP1A4 בהתאמה: איזופורם אלפא-1 מתבטא בעיקר במערכת העצבים המרכזית של בוגרים, איזופורם אלפא-2 מתבטא בעיקר באסטרוציטים, איזופורם אלפא-3 מתבטא בעיקר בנוירונים.
יוני נתרן ואשלגן הינם היונים המרכזיים המעורבים בהתקדמות פוטנציאל הממברנה במהלך הדה-פולריזציה של נוירון. לכן איזופורמים 1 עד 3 של תת-היחידה אלפא הם המועמדים העיקריים לשיחזור פוטנציאל ממברנלי בנוירונים לאחר הדה-פולריזציה ולשימור היכולת של תא הנוירון לעבור עירור נוירונאלי.

מחקר שביצעו Holm ושות' ב-2016 הציע שהאיזופורם אלפא-3 משתתף במיחזור הנוירוטרנסמיטורים, פעילות חשובה לתפקוד תקין של מערכת העצבים.
כבר ב-2007 Morth ושות' הציעו כי איזופורם אלפא-3 תומך בתהליכי ספיגה/קליטה-מחדש של נוירוטרנסמיטורים. תהליכים אלו נחוצים לפעילות מוחית תקינה, ולמעשה מוטציות אוטוזומליות דומיננטיות בגן ATP1A3 (המקודד לאיזופורם זה) נמצאו[1] כגורמות לשלוש מחלות נוירולוגיות:
Rapid Onset Dystonia Parkinsonism (RDP)
Alternating Hemiplegia of Childhood (AHC)
Cerebellar ataxia, areflexia, pes cavus, optic atrophy and sensorineural hearing loss (CAPOS)

1) משאבת נתרן-אשלגן - מנוע מפלי ריכוזים, מאת ד"ר ארז גרטי, אתר מכון דוידסון. פורסם ב-30 ביולי, 2009[2].

2) Morth JP, Pedersen BP, Toustrup-Jensen MS, et al. Crystal structure of the sodium-potassium pump. Nature. 2007; 450(7172); pages 1043-1049. [3]
3) Holm, T. H., & Lykke-Hartmann, K. (2016). Insights into the Pathology of the α3 Na(+)/K(+)-ATPase Ion Pump in Neurological Disorders; Lessons from Animal Models. Frontiers in physiology, volume 7, article 209. [4]
4) Brashear A, Sweadner KJ, Cook JF, et al. ATP1A3-Related Neurologic Disorders. Updated 2018 Feb 22. In: Adam MP, Ardinger HH, Pagon RA, et al., editors. GeneReviews® [Internet]. University of Washington, Seattle; 1993-2020. [5]
5) Pilotelle-Bunner, A., Cornelius, F., Sebban, P., Kuchel, P. W., & Clarke, R. J. (2009). Mechanism of Mg2+ binding in the Na+,K+-ATPase. Biophysical journal, 96(9), pages 3753–3761. [6]