Ras-related protein Rab 3D structures

Updated on 23-September-2026 - For a general description of the protein see Ras-related protein Rab

{"openlevels":0}

• Rab-1A GTPase domain 1-178
  • 2fol – hRab-1A GTPase domain + GDP - human
    
  • 7eq2 – hRab-1A GTPase domain (mutant) + GDP
    
  • 4fmb – hRab-1A GTPase domain + VirA + GDP
    
  • 3tkl – hRab-1A GTPase domain + LidA + GTP
    
  • 3sfv – hRab-1A GTPase domain (mutant) + LidA + GDP
    
  • 3l0i – hRab-1A GTPase domain + DrrA
    
  • 4jvs – hRab-1A GTPase domain + protein + GDP
    
  • 4fmc – hRab-1A GTPase domain + Espg + GDP
    
  • 4fme – hRab-1A GTPase domain + Espg + Arf6 + GDP
    
  • 4fmc – hRab-1A GTPase domain + Espg + GDP
    
  • 4iru – hRab-1A GTPase domain + LepB + GDP
    
  • 9mhf, 9mhg, 9mhh – hRab-1A (mutant) + pi3k – Cryo EM
    
  • 9rx4 – hRab-1A (mutant) + pi3k – Cryo EM
    
• Rab-1B
  • 4hlq – hRab-1B + TBC1D20 + GDP
    
  • 8alk – hRab-1B (mutant) + phosphocholine hydrolase LEM3 + GDP
    
  • 6sku – hRab-1B + AnkX + GDP
    
  • 5szh, 5szk – hRab-1B + Mical-cL + GNP
    
  • 4i1o – hRab-1B + LepB + GDP
    
  • 3nkv – hRab-1B + GNP + AMP
    
  • 2wwx, 3jza – hRab-1B + DrrA
    
  • 5o74 – hRab-1B + DrrA + GDP
    
• Rab-2B
  • 2a5j – hRab-2B + GDP
    
• Rab-3A or rabphilin-3A
  • 1zbd – hRab-3A + GTP
    
  • 3rab – rRab-3A + GNP - rat
    
  • 4rkf – DmRab-3 + GDP - Drosophila melanogaster
    
• Rab-3B
  • 8a4b – hRab-3B + Rep-15 + GTP
    
  • 8a4c – hRab-3B + Rep-15 + GNP
    
• Rab-3C
  • 6y7g – hRab-3C + GDP
    
  • 8a4a – bRab-3C + Rep-15 + GNP - bovine
    
• Rab-3D
  • 2gf9 – hRab-3D + GDP
    
• Rab-4
  • 2o52 – hRab-4 + GDP
    
  • 1yu9 – hRab-4 + GNP
    
• Rab-5A GTase domain 15-184
  • 1n6h, 1n6r, 1r2q – hRab-5A + GNP
    
  • 1n6o, 1n6p – hRab-5A (mutant) + GNP
    
  • 1tu4 – hRab-5A + GDP
    
  • 1n6i – hRab-5A (mutant) + GDP
    
  • 1n6k, 1n6l – hRab-5A (mutant) + GTP
    
  • 1n6n – hRab-5A (mutant) + GPPNHP
    
  • 4q9u – hRab-5A + RABEX-5 + RAB5
    
  • 1tu3 – hRab-5A + Rabaptin 5 + GNP
    
  • 3mjh – hRab-5A + EEA1 + GTP
    
  • 7bl1 – hRab-5A (mutant) + pi3k + GTP – Cryo EM
    
  • 9s47 – hRab-5A (mutant) + pi3k + GTP + GDP – Cryo EM
    
  • 9rx5, 9rx6, 9rx9, 9rxa, 9rxb – hRab-5A (mutant) +VPS34-CII – Cryo EM
    
• Rab-5B
  • 2hei – hRab-5B + GDP
    
• Rab-5C
  • 4kyi – hRab-5C + VipD + GNP
    
  • 1z07 – mRab-5C (mutant) + GNP - mouse
    
  • 1z0a, 1z0d – mRab-5C + GDP
    
  • 1huq – mRab-5C + GNP
    
  • 2y8e – DmRab-5C + GNP
    
• Rab-6A
  • 4dkx – hRab-6A + GDP
    
  • 2gil – hRab-6A + GTP
    
  • 1yzq – hRab-6 + GNP
    
  • 3bbp – hRab-6A + GCC185 + GTP
    
  • 3cwz – mRab-6A + R6IP1 + GTP
    
  • 5lef – mRab-6A + KIF20A + GTP
    
• Rab-6B
  • 2e9s, 2fe4 – hRab-6B + GDP
    
  • 2ffq – hRab-6B + GSP
    
  • 8ij9 – mRab-6B (mutant) + ELKS1 + GTP
    
• Rab-7A
  • 1t91, 3law – hRab-7A (mutant) + GTP
    
  • 6wcw – hRab-7A + rubicon + GTP
    
  • 6iyb – hRab-7A (mutant) + OSBP-related protein + GTP
    
  • 1yhn – hRab-7A (mutant) + Rilp + GTP
    
  • 7f6j – hRab-7A (mutant) + PDZD8 + GTP
    
  • 8kb8 – hRab-7A (mutant) + WDRD91 + GTP
    
  • 8zq3 – hRab-7A (mutant) + ORP1L + GDP
    
  • 9l0d – hRab-7A (mutant) + Mon1A/CCZ1/C18ORF8 complex – Cryo EM
    
  • 9lol – hRab-7A (mutant) + Mon1A/CCZ1 complex – Cryo EM
    
  • 5z2m – mRab-7A (mutant) + OSBP-related protein + GTP
    
  • 1vg1 – rRab-7A + GDP
    
  • 1vg8 – rRab-7A + GPPNHP
    
  • 1vg0, 1vg9 – rRab-7A + Rep-1 + GDP
    
• Rab-7L1 or Rab-29
  • 6hh2 – hRab-7L1 + GDP
    
  • 8fo2, 8fo8, 8fo9 – hRab-7L1 + LRRK2 + GDP + ATP + GNP – Cryo EM
    
• Rab-8A or oncogene C-Mel
  • 4li0 – hRab-8A + GDP
    
  • 6sq2 – hRab-8A + GTP
    
  • 6whe – hRab-8A (mutant) + GTP
    
  • 4lhw, 6stg – hRab-8A + GNP
    
  • 4lhv, 6stf – hRab-8A + GDP
    
  • 4lhx, 4lhy – hRab-8A + Rabin-3
    
  • 4lhz – hRab-8A + Rabin-8 + GTP
    
  • 2fu5 – hRab-8A + MSS4
    
  • 6rir, 7lwb – hRab-8A (mutant) + RILP-like protein + GTP
    
  • 9ikq, 9m0o – hRab-8A (mutant) + optoneurin + GTP
    
  • 6zsi, 6zsj – hRab-8A + EH domain-binding protein + GNP
    
  • 7bwt – hRab-8A + SOPD + GDP
    
  • 6yx5 – hRab-8A + DrrA + GNP
    
  • 3tnf – hRab-8A + LidA + GNP
    
  • 3qbt – hRab-8A + Ocrl1 + GNP
    
• Rab-9A
  • 1wms – hRab-9A + GDP
    
  • 7e1t – hRab-9A (mutant) + NUDE + GTP
    
  • 1s8f – Rab-9A + GDP - dog
    
  • 1yzl – mRab-9A + GNP
    
  • 4qxa – mRab-9A + RUTBC2 + GTP
    
• Rab-9B
  • 2ocb – hRab-9B + GNP
    
• Rab-10
  • 5szj – hRab-10 + Mical-cL + GNP
    
  • 5lpn, 5szi, 9g0c, 9g0d – hRab-10 + Mical-1 + GNP
    
• Rab-11A complex with nucleotide
  • 1oiv, 6iy1 – hRab-11A + GDP
    
  • 1oix, 8vof – hRab-11A (mutant) + GDP
    
  • 5ez5 – vRab-11A (mutant) + GTP
    
  • 1yzk – hRab-11A + GppNHp
    
  • 1oiw – hRab-11A (mutant) + GTPγS
    
  • 3bfk – Rab-11A + GDP – Plasmodium falciparum
    
  • 5xr4 – AtRab-11A + GDP – Arabidopsis thaliana
    
  • 5xr7 – AtRab-11A (mutant) + GTP
    
  • 5xr6 – AtRab-11A + GppNHp
    
• Rab-11A other complexes
  • 4c4p – hRab-11A + Rab11 family-interacting protein 2
    
  • 2gzd, 2gzh – hRab-11A (mutant) + Rab11 family-interacting protein 2
    
  • 2d7c, 2hv8 – hRab-11A (mutant) + Rab11 family-interacting protein 3
    
  • 4d0m – hRab-11A (mutant) + Rab11 family-interacting protein 3 + PI4KB
    
  • 4uj5 – hRab-11A (mutant) + Rab-3A interacting protein 3
    
  • 4uj3, 4uj4 – hRab-11A (mutant) + Rab11 family-interacting protein 3 + Rab-3A interacting protein 3
    
  • 5jcz – hRab-11A + unconventional myosin-Va
    
  • 4lwz, 4lx0 – hRab-11A + unconventional myosin-Vb
    
  • 4fmd – hRab-11A + EspG + GDP
    
  • 6ixv – hRab-11A + SH3 domain-binding protein 5
    
  • 6djl – hRab-11A (mutant) + SH3 domain-binding protein 5
    
  • 5fbl, 5fbq, 5fbr, 5fbv, 5fbw – hRab-11A + PI4KB + inhibitor
    
  • 5c46 – hRab-11A (mutant) + PI4KB + GDPγS
    
  • 4d0l, 5c4g, 5euq – hRab-11A (mutant) + PI4KB + GDPγS + inhibitor
    
• Rab-11B
  • 2f9l – hRab-11B + GDP
    
  • 2f9m – hRab-11B + GNP
    
  • 4ojk – hRab-11B (mutant) + CGK2 + GDP
    
• Rab-12
  • 2il1 – hRab-12 + GDP
    
  • 8vh4, 8vh5 – hRab-12 + LRRK2 + GDP + ANP + GNP – Cryo EM
    
• Rab-14
  • 4d0g – hRab-14 (mutant) + Rab11 family-interacting protein 1
    
  • 1z0f, 4drz – hRab-14 + GDP
    
• Rab-18
  • 1x3s – hRab-18 + GNP
    
• Rab-21
  • 1z0i – hRab-21 + GDP
    
  • 1yzt, 1yzu – hRab-21 + GNP
    
  • 1z08 – hRab-21 (mutant) + GNP
    
  • 2ot3 – hRab-21 + Rabex-5
    
• Rab-22
  • 1yvd – mRab-22 + GNP
    
  • 1z0j – mRab-22 (mutant) + rabenosyn-5 + GTP
    
• Rab-23
  • 8yim, 8ynr – hRab-23 + GMPPNP
    
  • 8yp0 – hRab-23 (mutant) + GMPPNP
    
  • 8yl3 – hRab-23 + GDP
    
  • 8yo0 – hRab-23 (mutant) + GDP
    
  • 9rs9 – hRab-23 + fuzzy +_ inturned – Cryo Em
    
  • 1z22, 1z2a – mRab-23 + GDP
    
• Rab-25
  • 2oil – hRab-25 + GDP
    
  • 3tso – hRab-25 + Rab11 family-interacting protein 2
    
• Rab-26
  • 2g6b – hRab-26 + GNP
    
• Rab-27A
  • 6huf – hRab-27A + GNP
    
  • 3bc1 – hRab-27A + Slp2A + GNP
    
  • 7opp, 7opq, 7opr – hRab-27A/Slp2A + GNP
    
  • 8p3g, 8p3h, 8p3j, 8p3k, 8p3l – hRab-27A/Slp2A + inhibitor + GNP
    
  • 9gvu – hRab-27A + cyclic peptide
    
  • 9la9 – hRab-27A + Unc-13 + GPPNHP – Cryo Em
    
• Rab-27B
  • 2f7s – hRab-27B + GDP
    
  • 2iey, 2iez, 2if0 – mRab-27B + GDP
    
  • 2zet – mRab-27B + melanophilin + GDP
    
• Rab-28
  • 2hxs – hRab-28 + G3D
    
  • 3e5h – hRab-28 + GND
    
• Rab-30
  • 2ew1 – hRab-30 + GNP
    
• Rab-31
  • 2fg5 – hRab-31 + GNP
    
• Rab-32
  • 6ff8 – hRab-32 + GTP
    
  • 5oec, 5oed – hRab-32 + GtgE + GDP
    
  • 4cz2 – hRab-32 + Ankyrin repeat domain-containing protein 27 + GCP
    
  • 4cym – hRab-32 (mutant) + Ankyrin repeat domain-containing protein 27 + GCP
    
• Rab-33
  • 1z06 – mRab-33 + Gyp1 + GDP
    
  • 2g77 – mRab-33 + GNP
    
  • 6zay – mRab-33 + Atg16L + GDP
    
  • 6sur, 6y09 – mRab-33 + Atg16L + GTP
    
• Rab-35
  • 6if2 – hRab-35 + GTP
    
  • 6if3 – hRab-35 + ACAP2 + GTP
    
  • 6ekk – hRab-35 + DENDD 1A + GDP
    
  • 3tw8 – hRab-35 + DENDD 1B
    
• Rab-38
  • 6s5h – hRab-38 + GTP
    
  • 6hdu – hRab-38 GTPase domain + GTP
    
  • 3dz8 – hRab-38 GTPase domain + GDP
    
• Rab-39B
  • 6s5f – hRab-39B + GMPPNP
    
• Rab-43
  • 2hup – hRab-43 + GDP
    
  • 9ltp – hRab-43 GTPase domain + USPNL6 + GDP
    
  • 9ltq – hRab-43 GTPase domain + GPPNHP
    

Proteopedia Page Contributors and Editors (what is this?)

Michal Harel, Jaime Prilusky